4IO8A

Crystal structure of human hsp70 complexed with 4-{(2r,3s,4r)-5-[(r)-6-amino-8-(3,4-dichloro-benzylamino)-purin-9-yl]-3,4-dihydroxy-tetrahydro-furan-2-ylmethoxymethyl}-benzonitrile
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGDTKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A variant
publication title Functional analysis of hsp70 inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 117
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4io8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4io8A04
1K8KB 5KQ8A 2E2QA 5AZIA 4BRHA 1DEJA 3D2EA 3U9ZA 5JLFA 2FLOA 3RSEB 3W0LA 4A2AA 3O1WA 3GL1A 5AQOA 2PAVA 1NGAA 2V7YA 5I9EB 4H5NA 4Y0WA 3FR0A 5AQYA 1X3MA 1NGFA 3DXKA 2GTDA 4HTLA 4M7YA 3VGMA 1RFQA 3VEWA 4I6MB 3LDOA 3A5OC 3HM8A 2ZGYA 3CI5A 3ZEUB 1NMDA 4HWIA 1EQYA 1NGJA 2P9PA 3O1BA 3BF1A 4H0VB 2D0OA 2Q0RA 4JD2B 1IG8A 4FWSA 4JHDB 1QZ5A 3WQTA 1KXPA 4RWTA 5BR9A 1Z6RA 2Q1NA 1U2VB 4FPBA 4CD1A 1TYQB 2ASPA 2P9SA 3CJ1A 4PL8A 5BRFA 1JCEA 2AA4A 3R8EA 4NB4A 4JNEA 3UB5A 4QS9A 1E4GT 1V4SA 2A41A 3O8MA 3ULEA 5AQLA 3CIPA 3LDQA 4EHUA 4BR7A 3MN5A 4XH5A 3CJCA 3A5NC 3QBWA 1K8KA 5B8HA 1NWKA 4GNIA 3FZFA 4PL7A 4K25A 1ZBSA 4CBXA 1YVNA 3G25A 4FWQA 1GLCG 3EKSA 3RSEA 1S22A 3S41A 1NGCA 3EN9A 4RTFD 4BR9A 2D0PA 3MMVA 5AFUH 3VOVA 4BRNA 5ELZA 1NGBA 3DWLA 5BPNA 4PKIA 5JMVA 1GLLO 5AZIB 4BRPA 3D2EB 1YXQA 4B1VA 5FPNA 5AQSA 3IMXA 4FWNA 2YJEA 2AP1A 2A5XA 4YDUA 4I6MA 3WXLA 3IFRA 4AM7A 1NGEA 4ISFA 1S3XA 3OHRA 4K42A 2HOEA 2ZF5O 4BREA 3L0QA 2P9KB 2Q2RA 2E88A 3DXKB 3P4IA 1Q18A 3VEZA 2V7ZA 3ZETB 2A3ZA 1HPMA 4JHDA 3UKRB 5AQJA 1JCGA 4BRLA 1V4TA 3LL3A 3SLCA 5EVZA 1U2VA 1TYQA 2CGJA 3VEOA 5BREA 5AQQA 4BR2A 2CH5A 2VYPA 3M1FA 3KVGA 3BP8A 2E2OA 1GLEG 3ATVA 1GLFO 2CGLA 4H5RA 3L4IA 2W41A 4BR5A 2PBDA 1LCUA 2P9SB 1DKGD 1DGKN 3SMSA 1BWFO 3VERA 1KAYA 2W40A 4KBOA 4CJ7A 4L3QA 5BRDA 5ADXH 2QWOA 4ISEA 4B1UB 4QS8A 2IVOA 3DJCA 2KHOA 2P9UB 2FF3B 3VEXA 3AY9A 3WEEB 1IJJA 5AQIA 1T6DA 3VF2A 4BRCA 1ATRA 3VEVA 3O4WA 2P9IA 4JN4A 3A0IX 5AQZA 3ZX2A 4EIAA 4BC4A 5AQNA 3HZ6A 4FL9A 1G99A 1OKJA 1QZ6A 3O6WA 5AZJB 5KPZA 3B8AX 1XUPO 3QB0A 3ENHA 3VF4A 5LJWA 3KZBA 4CBUA 3A5LC 3J8AA 5AFUA 2IVPA 3D7EO 1MWMA 2P9KA 3GE1A 1BO5O 4XH4A 3ZETA 3FZKA 3M6GA 1ESVA 2A40A 4FSVA 4IZ9A 3HTVA 3UKRA 5BPLA 2GEMA 4CI6A 4H0PA 3DXMB 2P9LB 2Q0UA 3MN6A 4GY2B 4WYBA 3O5BA 4CBWA 1D4XA 3H3OB 5FPEA 4M7XA 3VETA 3H1QA 3O80A 2QWQA 3IUCA 3IDHA 2P9NA 1ATNA 1Z05A 3GBTA 3MCPA 4K41A 3VGKA 4BRMA 3FE1A 2HF4A 5F2RA 5AQWA 1E4FT 4IJNA 3EL2A 4MO4A 3M3ZA 2Q97A 2NRHA 1ZXOA 4PKGA 4BR0A 4MLHA 4H5WA 2GWJA 4BRDA 3CQXA 2P9UA 4WQ5C 3WEEA 4O5FA 4K43A 5EY4A 3EZWA 2HMPA 4BQLA 4PKHA 4BRAA 1LOTB 2E1YA 1NLVA 3MDQA 2GWKA 4BROA 3A8YA 5ADXA 4B1ZA 4Z94A 3FGUA 5AZJA 1C0GA 3CHWA 2YI1A 2F9WA 5F0XA 3U9DA 2P9IB 2QWRA 4NO7A 2QXLA 3QFUA 4EHTA 4FO0A 3HBTA 3I8BA 5AQPA 4O8KA 3GOIA 4CZMA 3VGLA 2E1ZA 4ISGA 3QFPA 2QWLA 4H5VA 2ITMA 1U6ZA 2CH6A 3DXMA 1P8ZA 4FWPA 2P9LA 3MK6A 2EWSA 1ZC6A 1Y64A 2I7NA 2QWMA 4BG9A 1H1VA 1GLDG 1HUXA 3GG4A 2GELA 3WQUA 4CZLA 3LDPA 5AQMA 4BVOA 5KPRA 2FF6A 1BG3A 3BF3A 1HX1A 1MA9B 1NGGA 3HI0A 3VEYA 3VESA 2E8AA 2FSKA 2ZWHA 3H45C 3KHYA 1YAGA 2YCHA 2QW9A 4B1XB 4DQ8A 2P9NB 1QQOA 1J6ZA 1T44A 3CJ9A 1WOQA 4H0YB 2ASOA 2IIRA 3AAPA 3CETA 1BU6O 3WXIA 3JS6A 5AQXA 2A6AA 2BTFA 5AQVA 5LJVA 2V51B 4BC2A 1WUAA 3LDLA 3HSCA 3QMLA 2IVNA 2NZTA 4XH1A 3C7NB 4IO8A 1XC3A 2YHYA 4BC5A 4FWMA 4BGBA 3ATUA 3JXUA 4B9QA 4QS7A 3VPZA 4A62A 4M63C 3FZLA 4WQ4C 2OANA 1XQSC 4B1WB 4CD3A 4BRGA 3WXJA 5AQKA 3FZMA 5AQRA 1MWKA 4H0TB 4FWKA 2D4WA 1HLUA 1KAZA 4IXCA 4FOIA 1QQMA 3U4LA 4CZIA 5BN9A 1SQKA 4CZEA 2Q31A 2HF3A 3H3NO 3QICA 5BPMA 3I33A 2E2PA 4WQ5A 4AM6A 2ZGZA 5E84A 2FSJA 4MO5A 1KAXA 4DHYA 1BUPA 5KPTA 2VCPA 3ZX0A 5AQFA 3FLCO 5TKYA 4MLEA 2QWPA 3FZHA 5AQUA 1NGIA 4EFHA 2FSNA 2BUPA 3D2FA 4FOEA 5BN8A 1TUYA 4F9OA 4CZHA 3F9MA 1HKGA 3C7NA 5EOYA 1QQNA 2E20A 4BVPA 4BRKA 3O08A 3LDNA 2H3GX 3UKUB 1JCFA 2ASMA 2J4RA 4IWVA 3CJAA 5AQTA 4BRFA 4BQZA 3WUHA 4A61A 3BUZB 2YJFA 3MN7A 3L6QA 3MN9A 5JICA 4H0XB 4LC9B 1RGIA 3SJHA 1HKCA 1GLAG 1NGHA 1X3NA 3ID8A 3QBXA 1RDWX 3QDKA 1MDUB 3SK3A 1NM1A 1R59O 4B1YB 2D1KA 2UYTA 3VF6A 1GLBG 3CJBA 1BDGA 2V52B 3LM9A 4BRIA 4H5TA 2A42A 4BC3A 4IJAA 3SMPA 1NBWA 2VWBA 3UE5A 2WUSA 1T6CA 4JAXA 3H46O 4XEIA 5BRHA 3WT0A 2QM1A 1BA0A 5AR0A 3LM2A 4EAHD 4C23A 3AAQA 5EXWA 3TPQA 1GLJO 5FPDA 1QHAA 2E2NA 3ZEUA 4CZJA 1CZAN 3CQYA 4BG8A 1SAZA 2GUPA 3AARA 5E26A 4BGAA 2CGKA 5CE3A 4JD2A 1BOTO 5FPMA 4WQ4A 2YHWA 4BR4A 1C0FA 1BA1A 2FXUA 3FFKB 3GDQA 2I7PA 3EO3A 3CJ7A 3ZX3A 4CZKA 1HKBA 1YUWA 1TUUA 5AQHA 2P9PB 3D2FB 3A5MC 3EKUA 4J8FA 4RCHA 4CZGA 2YHXA 4H0OA 4YDUC 3R6MA 3UKUA 5KQDA 3VENA 1SZ2A 4H03B 5JLHA 3DAWA 4DCHA 3ENOA 3H6EA 3WXKA 2QWNA 5LY3A 4E1JA 4BRQA 2F9TA 2NLXA 5AQGA 1ATSA 4FWLA 5EX5A 3W3DA 2Q36A 4FWRA 3R9PA 3C0BA 3U8XA 4FWOA 4DB3A 4FPAA 3ULEB 3CERA 1X9JA 1HJOA 5F1XA 1NGDA 4A2BA 3BEXA 3H1VX 4CZFA 3TU5A 2DPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K8KB 4PY5A 3PV8A 1RT4A 4KREA 5KQ8A 3D2EA 3NDKA 5JLFA 2FLOA 2HVIA 4YORA 3LP3A 1X9WA 1WSGA 1FH3A 5C15A 5DM6L 1LWCA 1OVQA 3T1YK 1WWNA 3ASMA 3GL1A 5AQOA 4AEIA 4EZ9A 4CJ3A 1KFDA 1S6QA 4N41A 2V7YA 1RILA 2IC3A 3FR0A 5AQYA 1JJ2M 3VGMA 4DTUA 3DLRA 2E4LA 1Q7YO 2XY7A 4ICLA 3ZEUB 4HWIA 1NGJA 3KD1E 3THXB 2P9PA 2Q0RA 4PA1A 4K0KK 1KXPA 4IFEA 2Q1NA 2KSKA 1IKVA 4FPBA 4CD1A 4DTXA 4JS5A 4K8ZA 3LWLA 2AA4A 3E9OA 4JNEA 1L3VA 2ZD1A 5KRTA 3O8MA 5AQLA 3J80O 4ILJA 2MN5A 3LDQA 3THYA 3MN5A 3SBTA 2B4JA 4LH4A 4CFDA 1NWKA 4GNIA 4PL7A 4I7FA 4CBXA 3KP0A 1VRTA 2GX9A 3RVCA 3HVRA 1IV0A 3VQ6A 1NGCA 4BR9A 3MMVA 4BRNA 1NJWA 4FM0A 1BI4A 1GLLO 2PYJA 3KTQA 4JKGA 1IBLK 4Y1CA 4N56A 3NBPA 3U3GA 2D56A 4CJWA 4YDUA 1EETA 3I8DA 4KH6A 1L4VA 3OYJA 1BIZA 3OHRA 1Q86O 1WSEA 4FVUA 2P9KB 2E88A 3DXKB 1Q18A 1TV6A 5I42A 1HPMA 4JHDA 3RMAA 3UKRB 4ZHRA 4GKJK 2YEOA 2IGIA 3SLCA 2JWLA 5BREA 4NYNA 2I5JA 3M1FA 3KVGA 2NY8X 1TK5A 1OH6A 4CHQA 1GLEG 3ATVA 2CGLA 3C94A 3LP0A 4JKDA 3M8QA 2W41A 4KHWA 3K2PA 2P9SB 3MWPA 3R2VA 4KBOA 4L3QA 2LKBA 5TKWA 4QS8A 1N33K 2HHXA 3TAGA 2KHOA 5KI6A 2LR3A 4AHTA 1CXQA 3AY9A 3WEEB 4JK8A 1ATRA 3HM9A 3KD5E 2QTDA 3H08A 4JN4A 4CJSA 2P51A 3ZX2A 2YILA 3SF4D 3SZ2A 1REVA 4KH5A 3VQBA 4OKEA 5AZJB 5KPZA 3RTVA 2VQEK 2QEXN 4FZXC 4WE1A 3VF4A 1NH5A 3ENHA 4LH5A 4BECA 2O8CA 3J8AA 3RWUA 1I2VA 4X62K 3OYGA 3VMFB 3KOZA 4FJHA 2QI2A 3KLFA 3C6TA 4DV1K 4CECA 3M6GA 4IZ9A 1CZBA 2C1GA 1HYZA 4OLAA 3VTIA 3WNHA 5C0YA 1B7DA 3CM5A 3MN6A 4ILHA 3MAQA 4GY2B 2KZZA 1VNAA 4EP5A 3KKRA 4OVLA 1S1UA 2KJAA 4FYDA 5FPEA 4M7XA 3VQPA 3O80A 1D5AA 3O4NA 1FW6A 3GBTA 3RRGA 3SAHA 1YTAA 1PX9A 3KLEA 3MX2A 2HF4A 3CFPA 5F2RA 5AQWA 1E4FT 1HYSA 2E6LA 4B9MA 4E19A 3M3ZA 2NRHA 3TAEA 4JI0K 2SN3A 3OS0A 1CN2A 5EY4A 4FM2A 2HMPA 2UUCK 1ZBLA 4BROA 4CERA 4CJQA 4X65K 3A8YA 4RW6A 1TKDA 5HROA 5HRRA 1R0AA 1C0GA 2F9WA 3AVFA 4HUFA 2XY8A 2KPYA 2VGMA 4CEQA 5CYQA 4KI4A 3QIPA 3S3NA 3ZSVA 1KC8O 4DV4K 1VAZA 1UAXA 3VGLA 4W5OA 1I6GA 3SQ4A 2ITMA 3DLGA 3LPTA 1U6ZA 4DF8A 3OYDA 1W0HA 1YIJN 4CVNE 3PX4A 3KOXA 2UXCK 1ZC6A 3T1AA 4AHUA 4JYAK 2E3FA 3GG4A 2X6SA 3P38A 1UA0A 3L8BA 2G8KA 4GW6A 1LAVA 1OMYA 5KPRA 4DTNA 2FF6A 1BG3A 1HX1A 4FLVA 1E3MA 1HQUA 4FZYA 3WNEA 3SNNA 2YCHA 2QW9A 2YHAA 3ID6A 4F4KA 1P90A 3CJ9A 5J1EA 4H0YB 4LSNA 1W2BM 1BU6O 2KW4A 2HSTA 3VQ8A 4DKWA 4DV6K 4CCHA 5JENA 2DFFA 2FBYA 1UA1A 1PE4A 2HBMA 3PLAA 5FROA 4E1NA 3LDLA 2IVNA 2FC0A 3KLGA 3O4QA 2VWKA 1WT7A 3F9KA 4DUZK 1SNBA 3HPGA 1NMNA 1DT9A 2VWJA 1TKZA 4JK7A 1XQSC 1EX4A 4CD3A 4DV3K 4KYPA 3L3UA 4E0DA 2XHBA 2DTUA 1U45A 3NVKA 3QNOA 2G8IA 5FRNA 4E7IA 2D4WA 4B9SA 1NPIA 3FFIA 4BEBA 3U4LA 4DU1A 4CZIA 3CQ8A 2LJMA 4Z4HA 2XY6A 3ZSOA 3TI0A 3L2RA 3U3YA 3H3NO 4KHPK 4C8LA 4W5NA 2KQ2A 3HJFA 4CF2A 4AHRA 2OTJN 3L2VA 1KRPA 2VCPA 1JXBA 3SQ1A 3ZX0A 4J2EA 4BY9C 3MECA 5TKYA 1J5EK 2O8DA 3NGYA 4EFHA 2GMOA 2FSNA 1LWEA 1VHXA 2JDQD 3NH2A 2BUPA 3WXMB 3D2FA 2ETJA 4N76A 3LZJA 5HLFA 4KB1A 5CR4A 3ZT2A 3HT3A 1BIUA 2VG6A 1NNEA 1QS4A 3LDNA 2NRWA 2YNIA 3QEVA 3KKSA 4GV3A 4IWVA 3ZSYA 4N5SA 1LW2A 4AHVA 3L3VA 4LC9B 1YITN 1RGIA 3SJHA 2D0CA 1ZUTA 1GLAG 1NGHA 1X3NA 4YOTA 1IG9A 1IBKK 4UY8O 4O4GA 1NM1A 2HHSA 3THWA 2BRZA 2D1KA 4GV9A 1RBUA 2UYTA 4DF4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1K8K B;  4PY5 A;  3PV8 A;  1RT4 A;  4KRE A;  5KQ8 A;  3D2E A;  3NDK A;  5JLF A;  2FLO A;  2HVI A;  4YOR A;  3LP3 A;  1X9W A;  1WSG A;  1FH3 A;  5C15 A;  5DM6 L;  1LWC A;  1OVQ A;  3T1Y K;  1WWN A;  3ASM A;  3GL1 A;  5AQO A;  4AEI A;  4EZ9 A;  4CJ3 A;  1KFD A;  1S6Q A;  4N41 A;  2V7Y A;  1RIL A;  2IC3 A;  3FR0 A;  5AQY A;  1JJ2 M;  3VGM A;  4DTU A;  3DLR A;  2E4L A;  1Q7Y O;  2XY7 A;  4ICL A;  3ZEU B;  4HWI A;  1NGJ A;  3KD1 E;  3THX B;  2P9P A;  2Q0R A;  4PA1 A;  4K0K K;  1KXP A;  4IFE A;  2Q1N A;  2KSK A;  1IKV A;  4FPB A;  4CD1 A;  4DTX A;  4JS5 A;  4K8Z A;  3LWL A;  2AA4 A;  3E9O A;  4JNE A;  1L3V A;  2ZD1 A;  5KRT A;  3O8M A;  5AQL A;  3J80 O;  4ILJ A;  2MN5 A;  3LDQ A;  3THY A;  3MN5 A;  3SBT A;  2B4J A;  4LH4 A;  4CFD A;  1NWK A;  4GNI A;  4PL7 A;  4I7F A;  4CBX A;  3KP0 A;  1VRT A;  2GX9 A;  3RVC A;  3HVR A;  1IV0 A;  3VQ6 A;  1NGC A;  4BR9 A;  3MMV A;  4BRN A;  1NJW A;  4FM0 A;  1BI4 A;  1GLL O;  2PYJ A;  3KTQ A;  4JKG A;  1IBL K;  4Y1C A;  4N56 A;  3NBP A;  3U3G A;  2D56 A;  4CJW A; 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