5AQFA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqfA04
3MN6A 4CZEA 4WYBA 1C0GA 2AA4A 1HKCA 5AR0A 2P9KA 2YHYA 3WT0A 4K43A 4BG8A 4EHUA 1ZXOA 4WQ4C 1JCGA 3ZEUB 4XH1A 4FSVA 2E88A 3ULEA 3A5OC 3WXIA 3VEOA 2EWSA 4K41A 3EKUA 5KPRA 2D1KA 5AZIB 3LDQA 2ITMA 3CJ1A 2PBDA 2YI1A 1GLEG 1QQMA 2CGLA 1ATRA 1YAGA 1G99A 4FWSA 4H5RA 3RSEB 1JCFA 4DHYA 3H6EA 2E2NA 5JMVA 4ISFA 4I6MA 1C0FA 1Z6RA 3WQTA 2FLOA 4CD3A 2H3GX 3H1QA 4CZMA 4B1VA 4H5TA 3F9MA 1XUPO 4FO0A 4RCHA 1T6CA 4QS8A 4CZKA 5AQQA 3S41A 2P9IA 4JN4A 3AAQA 3UKRA 4EIAA 1ZC6A 2W41A 4BC3A 5KPZA 2A42A 3JS6A 3R6MA 2YHWA 1NGCA 2ZGYA 3UB5A 3VEVA 2E1YA 4GNIA 1NGAA 3ZETB 1S22A 1D4XA 1BO5O 4JD2B 5ADXA 3H3OB 2QWRA 3MN7A 3CI5A 3VF4A 2P9LB 3CHWA 3CJBA 3O6WA 2GELA 3LDLA 2IVPA 3A5NC 4MO5A 3CJCA 3LL3A 3VETA 3R8EA 4FWPA 2QWPA 1GLCG 3UE5A 4BR9A 4H0PA 2F9TA 5FPNA 2V52B 3IDHA 1KAYA 1EQYA 4XH4A 2PAVA 1QZ5A 5KQ8A 3EKSA 1DKGD 5AQJA 4BGBA 3O1WA 2CH6A 3H45C 3I33A 4HTLA 4O8KA 3FE1A 4H5NA 2HMPA 1TYQA 2A41A 5AQSA 4BR0A 3FZHA 2F9WA 3DAWA 3VEYA 1NGEA 4FOIA 4CD1A 3QICA 1BOTO 4BRQA 3VEWA 1K8KA 3CETA 5AQMA 5I9EB 4FL9A 3ZX3A 1E4FT 1T6DA 1HKBA 3D2FB 3CJAA 4M7YA 3C7NA 3M6GA 4M7XA 4PKHA 1NLVA 4BRKA 1SQKA 1YVNA 3LDPA 2D0OA 3O8MA 3D2EB 3VEXA 3GL1A 1BWFO 3H46O 3WXJA 2OANA 4CBWA 3VF6A 3HBTA 4CZIA 5BRDA 3SMPA 3MMVA 1U6ZA 1SAZA 5AZJB 1MA9B 4CZLA 4IZ9A 1WOQA 4H0TB 5JICA 1NGIA 2E20A 2IIRA 5B8HA 1IJJA 5AQUA 2ASOA 3GG4A 1YUWA 2D4WA 3M3ZA 3CQXA 1X9JA 2GWKA 4B9QA 4BREA 4BRNA 2IVOA 4DB3A 3DXMA 5EX5A 4H0VB 1GLFO 2P9PB 1ESVA 2I7NA 3FGUA 2D0PA 2P9NB 4FPBA 4PL8A 3O1BA 4CBUA 1X3NA 3TU5A 1GLLO 4Y0WA 1QQNA 1V4TA 4FWMA 2QWOA 5F1XA 2WUSA 1R59O 5AQGA 5AQYA 2ASPA 4QS9A 3DJCA 4BRFA 3WEEB 2P9UA 1RGIA 4C23A 4IO8A 3VGKA 3FLCO 5E84A 3VPZA 3BF1A 1XQSC 1ZBSA 4AM7A 3MN9A 4RTFD 1LCUA 3IFRA 4BRDA 5AQIA 3KZBA 4A61A 3HZ6A 3UKUB 4K42A 2ASMA 1Y64A 1BA0A 2VYPA 4E1JA 1GLDG 4DQ8A 3I8BA 4FWQA 2NRHA 1ATSA 3A5LC 4RWTA 1U2VB 3ZEUA 4H0XB 5BPLA 1BDGA 4BC5A 2ZWHA 3M1FA 3H1VX 5BRFA 1QHAA 1H1VA 3MCPA 4B1WB 5AZIA 3A8YA 3AY9A 5AQNA 3GOIA 3P4IA 4WQ5C 2A40A 4MLEA 1HX1A 3VGLA 2ZGZA 4PKIA 5E26A 4A2AA 3MN5A 3FZMA 2FF6A 5EXWA 3RSEA 1Z05A 4NO7A 4BC2A 3C0BA 4ISGA 2E8AA 5CE3A 2YJEA 2E2PA 2HF4A 4EAHD 5ADXH 4JAXA 2YHXA 4BR2A 1KAXA 3QFPA 1BU6O 2FXUA 3C7NB 3ATVA 1RFQA 2Q0RA 3GE1A 4WQ4A 3VOVA 3ATUA 2Q0UA 3AARA 5AQWA 3SMSA 4BGAA 1Q18A 3D7EO 3A5MC 4BC4A 1ATNA 2BUPA 5FPDA 2E1ZA 3ENOA 4JHDA 5BN8A 1MDUB 3LM9A 2P9SB 3ZETA 3BF3A 4BRCA 4FOEA 1HKGA 4IJNA 4H03B 3DXKB 4JD2A 4BVPA 3ZX0A 3LM2A 2Q1NA 1NGGA 3U9DA 4KBOA 3QDKA 1GLJO 3HI0A 3CIPA 3HM8A 2P9LA 3BEXA 2P9KB 1TUUA 1SZ2A 3HSCA 4H5VA 5F0XA 4EHTA 5AQTA 4H0YB 3ULEB 1NGJA 4NB4A 1LOTB 3OHRA 4ISEA 4FWOA 3AAPA 4M63C 3FZFA 3TPQA 4BRPA 1TUYA 4FWKA 4IXCA 1NGHA 2QWMA 4A62A 3VF2A 5JLHA 2A5XA 1QZ6A 4MLHA 5FPEA 1GLBG 4BVOA 2A6AA 2VWBA 4I6MB 2I7PA 2QM1A 2FSNA 3EO3A 5BR9A 4CBXA 5BN9A 1MWMA 4B1XB 4BRMA 4CJ7A 2QWQA 1NBWA 3U4LA 5AFUA 3G25A 4IJAA 1GLAG 3VERA 4CZHA 2P9IB 4YDUA 3UKRB 3SK3A 4BR7A 5KPTA 3FZLA 3BUZB 5AQPA 3W3DA 5EVZA 3D2FA 2GTDA 5JLFA 4BR5A 2V7ZA 4IWVA 3LDOA 2QWLA 5EOYA 4BQLA 3O08A 4K25A 3D2EA 3SJHA 4FWNA 3WXKA 4Z94A 5AQHA 2J4RA 3EL2A 3O4WA 5AQZA 5AFUH 2VCPA 5LJVA 4EFHA 4PL7A 4GY2B 3ENHA 4BROA 1JCEA 1V4SA 3DWLA 4FPAA 3CQYA 5AZJA 3ZX2A 4HWIA 1S3XA 3QMLA 3VGMA 3W0LA 3O80A 2QW9A 3WUHA 3WXLA 4CZFA 1NGBA 1DGKN 3IMXA 4CI6A 1YXQA 1X3MA 2P9PA 1P8ZA 1BG3A 2AP1A 2Q2RA 3VENA 3EZWA 2P9NA 3CERA 3QB0A 3H3NO 4FWLA 4O5FA 3GBTA 1NMDA 2DPNA 1IG8A 5AQOA 3L6QA 1TYQB 1XC3A 5EY4A 5BPNA 3KHYA 3QBWA 4B1ZA 3L4IA 3GDQA 4JHDB 4QS7A 3WEEA 4BR4A 1K8KB 1T44A 2QXLA 5FPMA 3VESA 1J6ZA 1NGDA 2KHOA 5AQFA 5AQKA 2UYTA 3O5BA 3SLCA 4BRIA 4BRLA 1HLUA 3CJ9A 4BG9A 3FR0A 2FF3B 1MWKA 1NGFA 1NM1A 2CH5A 4YDUC 4BRHA 5LJWA 4CZGA 3BP8A 3B8AX 4B1UB 1NWKA 4XH5A 3KVGA 3UKUA 1DEJA 3FZKA 1CZAN 2IVNA 4LC9B 3L0QA 2CGKA 2Q97A 1HJOA 2HOEA 4MO4A 4CZJA 2HF3A 3U8XA 4PKGA 1HPMA 2W40A 3VEZA 2NLXA 5AQXA 1U2VA 3U9ZA 2CGJA 1BUPA 3WQUA 2V7YA 3EN9A 4L3QA 4A2BA 5TKYA 2QWNA 1KXPA 3MDQA 2A3ZA 5BPMA 4XEIA 1QQOA 4H5WA 1RDWX 4BQZA 2BTFA 2Q36A 3ID8A 5ELZA 2YCHA 3DXMB 4F9OA 3A0IX 4BRGA 2Q31A 3CJ7A 4AM6A 1E4GT 3FFKB 4JNEA 1KAZA 3JXUA 2E2QA 5AQLA 2GWJA 5BREA 5AQRA 2ZF5O 4FWRA 2NZTA 2GEMA 3IUCA 1WUAA 3QBXA 2E2OA 3HTVA 4B1YB 5F2RA 1OKJA 4J8FA 3QFUA 2V51B 3MK6A 3J8AA 2FSKA 4BRAA 2GUPA 2P9UB 4DCHA 5AQVA 5LY3A 2P9SA 5KQDA 2YJFA 1HUXA 5BRHA 4WQ5A 1BA1A 4H0OA 3DXKA 3R9PA 3LDNA 2FSJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MN6A 1M1KO 1C0GA 4FJ7A 2O8EB 3ZCMA 4WFNL 4F4KA 2P9KA 3VTHA 1ZBIA 3MX5A 1ZXOA 1OH7A 5FROA 1T7PA 3ZEUB 3LP0A 1A5VA 1HPZA 2KZZA 3WXIA 1UWBA 5AZIB 4YOUA 1QQMA 1NU0A 4G1QA 1TKTA 1ATRA 1YAGA 4L8RB 4AHVA 4CW7B 1ASWA 2XY7A 3SAFA 1NJXA 2PZSA 1YI2N 4I6MA 4NCBA 1KVBA 3PIPL 1OVYA 1Z6RA 1HYZA 1T03A 1QVFM 2H3GX 1O1WA 4E3SA 1O13A 4J2EA 2YV0X 1WN7A 3AVCA 4KAZA 1I94K 4RCHA 4FCYA 3OS1A 3NVMA 1XC9A 4BC3A 1DTQA 4FJHA 3JS6A 5FRMA 1RBTA 2YHWA 1SN1A 5AJ3K 4DV3K 2E3FA 4EP5A 1JLFA 2LJ7A 2ATQA 3OYJA 2ZGYA 2E1YA 3KOZA 2YIPA 3F73A 1BI4B 3K2PA 2NY9X 3M8QA 4GV6A 2QWRA 3MN7A 3ZLJA 3CI5A 1NG9A 3CHWA 1VQMN 3O6WA 1M90O 4CFDA 3TI0A 5KI6A 4FJXA 2Y1JA 4MO5A 4CK3A 3LL3A 3BK3C 4YORA 1JL1A 4FWPA 2NUBA 3SZ2A 3ZSYA 4FZXC 1EQYA 3TTDA 1W2BM 3EKSA 1Q7YO 4LFCK 2YBRC 5JENA 5AQJA 4KHNA 1VSHA 4HCBA 3KWIA 2VY6A 4O8KA 2A41A 2NRRA 4BR0A 2E5LK 2F9WA 4C8LA 1NGEA 4CEAA 4CF9A 4HVJA 3V9SA 4CHPA 4FOIA 4BRQA 3J81O 3QNOA 2QKBA 5GINA 4DSFA 4FL9A 4MQ3A 1ITGA 4CVNE 1E4FT 4BEBA 3P38A 3D2FB 4KFBA 3C7NA 4M7XA 1L3TA 1NLVA 1N8RO 1CN2A 3TR8A 4H8KA 3V1RA 3K5MA 4DV1K 3D2EB 3VMFB 3GL1A 1HJRA 3CD6N 3T3FA 3WXJA 2OANA 3PUFA 4CBWA 1KFDA 4E72A 3MMVA 1U6ZA 1SAZA 1VQPN 4CZLA 2NRVA 4IZ9A 5CZ2A 3OYKA 3RR8A 1NGIA 3V6DA 2B4JA 2A1SA 3HL8A 3AVJA 4FM1A 3C95A 2D4WA 4CF1A 5C24A 3OTOK 2I5JA 3HK2A 4CEBA 4KHSA 4H0VB 1XI1A 3Q7CA 1ICAA 4KV8A 2YNGA 3ZT4A 1S1UA 2GBZA 4FPBA 4PL8A 3TU5A 4LFAK 2X78A 4BWMA 4UJ0A 4CHYA 4IG0A 3NE6A 1R59O 5AQGA 3NH1A 1VRTA 2HVHA 2P9UA 3T1YK 2X74A 3IKMA 4C23A 4IO8A 2EHGA 3VPZA 2ASCA 4OLBA 1I39A 1RTHA 4BRDA 4F3OA 1RBVA 5AQIA 1C0UA 1NKCA 3THYA 4O0JA 3TAEA 1UA1A 1VQKN 4ZHRA 1SL0A 3IS9A 3NVKA 2KTQA 2VYPA 1GLDG 2A7TA 3KK7A 1BHLA 4DQ8A 1HNXK 2P1JA 3H08A 4RWTA 4K8ZA 3GKUA 3KOWA 4M3RA 1T3VA 5BRFA 2E2FA 2VQEK 2LJMA 3RMBA 1YT3A 4IKFA 1P0AA 4PUOA 3GOIA 2KYQA 1F21A 3SQ4A 4MLEA 4XIUA 1HX1A 1Z25A 3VGLA 2ZJRL 3FZMA 3V9XA 5EXWA 1Z05A 3NCIA 2D0AA 5CR4A 1FKOA 4ISGA 4A5BA 2GX9A 2FBXA 2YJEA 3TAGA 1RT1A 2E2PA 1ZBLA 4B08A 2HF4A 4JAXA 2OZMA 3HOSA 2YNIA 4KTZA 2F7TA 1GOCA 2Q0RA 5JVHL 2YIOA 3U3GA 1C6VA 1TL3A 2LN8A 3ATUA 1RDUA 1QE1A 1NMNA 3AGRA 4CJLA 1EO1A 4JHDA 4W5RA 4HUGA 3ZETA 4DQRA 2KBHA 4IJNA 4GW6A 4OGCA 3U9DA 1QTMA 3DYAA 2IOCA 1OH5A 4QCLA 4N47A 4DS5A 3LP3A 2HHTA 3HSCA 2Q3SA 3ZSWA 4FJIA 4JKHA 2KFNA 3THWB 5AQTA 1AYJA 4NB4A 1OVQA 3OHRA 1WT7A 1EP4A 4FWOA 3AAPA 4E7HA 4CGJA 3NHGA 1NJZA 5I42A 2NRXA 3VF2A 4CE9A 3PLAA 3NF7A 4KHUA 3I0SA 3HO1A 5FPEA 1GLBG 4DKWA 1LWCA 2I7PA 2QM1A 1NJYA 3TTCA 4CJ5A 5BN9A 4AB0A 1OMYA 2WFBA 4B1XB 4CJ7A 1NBWA 3T69A 3K57A 1L3SA 5CY0A 4FK2A 1Q9XA 4CZHA 2P9IB 1HNVA 3UKRB 1WSIA 2JWLA 2E3GA 4E19A 4BE2A 3BUZB 3VQ5A 4DR7K 3W3DA 5JS2A 2GTDA 4BR5A 4FVMA 4JI2K 2O8CB 4IFYA 3LDOA 1BCOA 3MCAB 4N76A 1JXEA 4OPJA 3SPYA 4K25A 3WNEA 3ZSZA 4FWNA 4Z94A 2UUAK 5AQHA 1EX4A 5AFUH 2VCPA 2GL1A 4EFHA 4M3TA 4E89A 3KP1A 4GY2B 3ENHA 2OA8A 1RT4A 4AHCA 4GKJK 3CCLN 3Q7BA 4NXNK 3ZX2A 1L5UA 1BQNA 3QMLA 3CXCM 5C10A 3CFPA 3VGMA 3O80A 3O9RA 3WUHA 1IKXA 3WXLA 4CZFA 3CYMA 3NH2A 3D0PA 3SUOA 1KCFA 2OZSA 4E1NA 1RDDA 1X3MA 1C0TA 4CEEA 2P9PA 1BG3A 2AP1A 3KJVA 3VQ7A 2Z1JA 4DF8A 3J7AP 2P9NA 3H3NO 2W42A 4JKGB 4FJ5A 1NPIA 3GBTA 3CCVN 2DPNA 5FRNA 4BACA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MN6 A;  1M1K O;  1C0G A;  4FJ7 A;  2O8E B;  3ZCM A;  4WFN L;  4F4K A;  2P9K A;  3VTH A;  1ZBI A;  3MX5 A;  1ZXO A;  1OH7 A;  5FRO A;  1T7P A;  3ZEU B;  3LP0 A;  1A5V A;  1HPZ A;  2KZZ A;  3WXI A;  1UWB A;  5AZI B;  4YOU A;  1QQM A;  1NU0 A;  4G1Q A;  1TKT A;  1ATR A;  1YAG A;  4L8R B;  4AHV A;  4CW7 B;  1ASW A;  2XY7 A;  3SAF A;  1NJX A;  2PZS A;  1YI2 N;  4I6M A;  4NCB A;  1KVB A;  3PIP L;  1OVY A;  1Z6R A;  1HYZ A;  1T03 A;  1QVF M;  2H3G X;  1O1W A;  4E3S A;  1O13 A;  4J2E A;  2YV0 X;  1WN7 A;  3AVC A;  4KAZ A;  1I94 K;  4RCH A;  4FCY A;  3OS1 A;  3NVM A;  1XC9 A;  4BC3 A;  1DTQ A;  4FJH A;  3JS6 A;  5FRM A;  1RBT A;  2YHW A;  1SN1 A;  5AJ3 K;  4DV3 K;  2E3F A;  4EP5 A;  1JLF A;  2LJ7 A;  2ATQ A;  3OYJ A;  2ZGY A;  2E1Y A;  3KOZ A;  2YIP A;  3F73 A;  1BI4 B;  3K2P A;  2NY9 X;  3M8Q A;  4GV6 A;  2QWR A;  3MN7 A;  3ZLJ A;  3CI5 A;  1NG9 A;  3CHW A;  1VQM N;  3O6W A;  1M90 O;  4CFD A;  3TI0 A;  5KI6 A;  4FJX A;  2Y1J A;  4MO5 A;  4CK3 A;  3LL3 A;  3BK3 C;  4YOR A;  1JL1 A;  4FWP A;  2NUB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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