5AQGA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqgA04
2P9KA 3FZLA 3U9DA 3DJCA 2GTDA 1P8ZA 4FOIA 3G25A 3L4IA 4FOEA 2V7ZA 2YI1A 3QBXA 5I9EB 3TPQA 3RSEB 5AQRA 2FLOA 4BRNA 3MK6A 3QICA 3O08A 5AQHA 4PKIA 4WYBA 2GWJA 1NGJA 3CETA 1MWMA 3AAQA 3QFPA 1H1VA 3A8YA 1MWKA 3VEVA 3WQTA 3EL2A 4H5WA 5AQUA 3I8BA 1TUYA 2ZGYA 3EKSA 5KPZA 3F9MA 2Q36A 2Q0RA 3KHYA 3HI0A 2E2OA 3JXUA 2P9UA 4HWIA 3SJHA 5LJWA 1TYQA 5JMVA 3WEEB 1NGFA 1IG8A 3H3NO 5JLHA 1HKCA 2FSKA 4JAXA 4GNIA 1NGDA 4JHDA 3FZFA 1BU6O 5ADXH 3EKUA 2FF3B 5LY3A 1U2VA 4JD2A 4BGBA 3LM9A 1SQKA 3LDOA 4IO8A 5AQSA 4FWOA 1K8KB 3H1VX 1ZBSA 4B9QA 4FWRA 2W40A 3GOIA 4FWPA 1YVNA 3O80A 4KBOA 3D2FB 5FPMA 3AY9A 1BWFO 3FR0A 3H6EA 3HBTA 3CERA 2VCPA 3CJCA 2E20A 4BRCA 1HX1A 4BR0A 4B1YB 5BRHA 5AQNA 4HTLA 3I33A 2BTFA 4BC2A 3C7NB 1X3MA 3W3DA 5FPDA 4PKGA 3W0LA 1XQSC 3D7EO 4YDUA 1ATNA 2NLXA 4DB3A 4M7XA 4IWVA 2HF3A 4FWKA 1HKBA 4QS8A 1MA9B 3UKRA 4IZ9A 1C0FA 3LDQA 5AQYA 1BA0A 3MN5A 3FZMA 1T6CA 1NGBA 1NM1A 4BROA 3C0BA 5TKYA 1RDWX 4O5FA 4PL8A 3VF4A 2D1KA 5AZIA 2F9TA 2NRHA 1ZC6A 3CJ9A 3VOVA 5F2RA 3DXMB 5AR0A 5EY4A 2Q31A 3VENA 2FSJA 3M3ZA 1JCEA 3MN6A 2DPNA 3VERA 2P9PA 4H5RA 3WQUA 3CI5A 1NGIA 1MDUB 3MN7A 3R6MA 5BRDA 3QFUA 1K8KA 3VF2A 5ADXA 3EO3A 3ZETA 4EHTA 3U8XA 1NGCA 1QZ6A 2E88A 4BG9A 2CGJA 4BR2A 3MDQA 1S22A 1KXPA 2VYPA 2E1ZA 4JN4A 3D2FA 5AZJA 2E2PA 2VWBA 1EQYA 4XH4A 1JCGA 3FE1A 3A5NC 3ID8A 4NB4A 1NWKA 4BR4A 3ZX0A 3LDPA 5BPNA 2QWQA 1BOTO 4BRKA 4CD3A 1E4GT 3SMPA 3GBTA 2J4RA 4BQLA 3FZHA 3P4IA 5KQ8A 1LCUA 4QS7A 5EXWA 3QB0A 3HSCA 3O1BA 2CGLA 4IJAA 1NMDA 1BDGA 2Q0UA 3WXIA 4A2BA 2D0OA 4M63C 5AFUH 2P9SA 3CJ1A 4ISEA 1DEJA 3DXKA 3FFKB 1E4FT 1T44A 4M7YA 4Y0WA 3VESA 4H0VB 1IJJA 2H3GX 3ZEUB 1Y64A 2ZGZA 3HM8A 5E84A 3EZWA 3FZKA 2OANA 2IVPA 1KAZA 3DAWA 3DWLA 3ENHA 3VEZA 2WUSA 3O1WA 5BR9A 3H45C 2AA4A 3O4WA 2NZTA 2QWOA 3ZX2A 2CH5A 2QWPA 4H0YB 2P9LA 4H0TB 1YAGA 2P9IB 4AM7A 5AQZA 3LL3A 4DHYA 1NBWA 4I6MB 3ZX3A 4GY2B 3VEWA 1KAYA 1R59O 2I7PA 3MCPA 3KVGA 3ULEA 3U4LA 1BUPA 3L0QA 1LOTB 2HMPA 4AM6A 5JLFA 2EWSA 2QXLA 4H0PA 4EIAA 1BG3A 3AARA 4CJ7A 5E26A 5EX5A 1NGHA 3HTVA 3GE1A 4BC4A 1ATRA 3VEXA 5BN9A 4CZGA 3IUCA 3OHRA 3GG4A 4MLEA 1ZXOA 1YXQA 4FWLA 4CZLA 4K25A 5AQQA 3ATVA 4BREA 4BR5A 1HLUA 1V4SA 4BC3A 4MO4A 1DKGD 4FL9A 2KHOA 1BO5O 1XUPO 2QWNA 4IXCA 4H0OA 4CZJA 3RSEA 5EVZA 4FWQA 4H03B 4CBWA 4FPBA 4FSVA 1T6DA 5AQJA 3EN9A 4K43A 1Z05A 5AQXA 1GLLO 3GL1A 4B1ZA 2GUPA 2FSNA 1C0GA 3R8EA 4EAHD 2PBDA 3SMSA 3UKUB 1S3XA 2A5XA 3VGMA 3A5LC 3CJBA 5AQOA 4BRAA 1NGAA 2QM1A 4MO5A 5AFUA 3ZEUA 5FPEA 4WQ5C 3FGUA 2I7NA 2A40A 5KPTA 5BN8A 4BR7A 4XH1A 2E8AA 2CH6A 3R9PA 1QQOA 3S41A 3WEEA 5KPRA 2ZWHA 2P9UB 1TYQB 1ESVA 3UE5A 4RCHA 2D0PA 1GLEG 4QS9A 2PAVA 5LJVA 3A0IX 4O8KA 2FXUA 2ZF5O 1D4XA 1RFQA 1YUWA 5BPMA 2HOEA 3MMVA 1HKGA 2Q2RA 4BRHA 3SLCA 4CZKA 4JD2B 4ISFA 2P9NB 4K41A 4BC5A 4BRFA 1G99A 4CZMA 4RWTA 2YCHA 2V7YA 3U9ZA 1QHAA 1SAZA 1NLVA 1QQMA 2HF4A 3H46O 2V51B 2ASMA 2QWRA 3QDKA 1KAXA 1ATSA 3A5MC 4L3QA 4C23A 4PKHA 5CE3A 2A41A 3C7NA 3IMXA 2ASOA 2AP1A 3H3OB 3VF6A 4WQ4C 1BA1A 3VETA 2QWMA 3LDNA 2GEMA 2IVNA 3B8AX 3FLCO 3O6WA 2QW9A 1JCFA 2IVOA 4BGAA 3BF3A 1Z6RA 3WUHA 2D4WA 3UKRB 1GLDG 4CZIA 2Q1NA 3UKUA 3LDLA 3M6GA 3WXLA 5AQVA 5BREA 3GDQA 5JICA 1HPMA 4A61A 4A2AA 2E2QA 4FWMA 4B1XB 4CI6A 4CZHA 4FWSA 3VEYA 3DXMA 5EOYA 5AZIB 3CHWA 1SZ2A 2ASPA 1HJOA 5KQDA 4BRQA 3CJAA 2ITMA 2IIRA 2A6AA 3UB5A 5AQFA 4B1WB 3L6QA 2P9PB 3VGKA 1GLJO 1NGGA 1V4TA 5AQWA 1X3NA 4FWNA 2P9NA 2BUPA 3CQXA 4XH5A 3M1FA 1XC3A 3ZETB 4H5TA 2YJFA 3TU5A 4IJNA 3D2EB 4BRDA 4EFHA 5FPNA 1RGIA 4B1UB 2W41A 3SK3A 1Q18A 2E1YA 5AZJB 2A3ZA 2P9KB 3A5OC 1X9JA 3IFRA 3J8AA 2YHYA 4Z94A 2V52B 5B8HA 3VPZA 4BRLA 3WT0A 4WQ5A 3CQYA 4LC9B 3LM2A 3VGLA 3CJ7A 1WOQA 2UYTA 3QMLA 2GWKA 3IDHA 1QQNA 4H5VA 5AQMA 3CIPA 2GELA 1GLAG 2A42A 4BG8A 3JS6A 2P9SB 1U6ZA 2YJEA 3HZ6A 3DXKB 4BVOA 4B1VA 3BEXA 3KZBA 5AQTA 3O5BA 4BRGA 1NGEA 1DGKN 4CZFA 2F9WA 5AQPA 4J8FA 4YDUC 4H5NA 4BQZA 2FF6A 4FPAA 2P9IA 3ATUA 4NO7A 3AAPA 4XEIA 3BUZB 5AQLA 4EHUA 2YHXA 3WXJA 4I6MA 4CBUA 1QZ5A 2Q97A 4JHDB 5BRFA 2P9LB 5AQGA 4MLHA 1J6ZA 1GLCG 4BRIA 5BPLA 4JNEA 1U2VB 3H1QA 5ELZA 4H0XB 4DQ8A 4CBXA 3BF1A 5AQIA 2E2NA 2QWLA 3ULEB 4BRPA 3ENOA 4BRMA 1CZAN 1WUAA 3VEOA 5AQKA 3QBWA 4FO0A 1TUUA 2YHWA 4WQ4A 4A62A 4F9OA 1HUXA 3O8MA 4BVPA 4CZEA 4ISGA 3BP8A 1OKJA 4K42A 5F0XA 4DCHA 3MN9A 4RTFD 3WXKA 4E1JA 5F1XA 1GLBG 4PL7A 3D2EA 2CGKA 4BR9A 1GLFO 4CD1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCSN 4FOIA 3ZSQA 3KD5E 4I9LA 3RWUA 4FJ7A 3WNHA 4ELTA 2UU9K 4BRNA 3HJFA 3MK6A 2DFEA 4LH5A 1YI2N 4JEPA 3ALYA 2GWJA 1NGJA 1VSKA 4CGGA 3CETA 3D0PA 3VQ7A 3AAQA 1YITN 3SZ2A 3WQTA 2HMIA 3EL2A 2ZJPL 3TAPA 2LI7A 3E01A 3EKSA 1HYZA 1PE4A 2Q36A 3V4IA 1SUQA 1C6VA 3ZT1A 3RMBA 3SJHA 4RW7A 1HNWK 5JMVA 1NGFA 4YOWA 4CEEA 4WFAL 2HHUA 3H3NO 3NE6A 4BE7B 4JAXA 4W5RA 4JI1K 1SNBA 3NAEA 1A5XA 3CMEN 2FF3B 1POIA 4EP5A 1QTMA 3ZT0A 1PX9A 1I6FA 3K5OA 1HMVA 4FWOA 5GAEP 2W42A 1K8KB 3H1VX 1ZBSA 5J2PA 4YFUA 3GOIA 1ZUTA 5JS2A 5AJ3K 2ZM6K 1TVRA 1I2UA 4IBNA 4AHSA 3H6EA 2HHIA 3O9TA 1NG9A 1QHTA 3HP9A 1NE5A 5CY4A 2RN2A 3CC7N 1HX1A 4B1YB 5AQNA 2BTFA 4BC2A 2F4VK 3C7NB 4OLBA 3ZSXA 4KYPA 4CJFA 5FPDA 4DQPA 1WSFA 1XQSC 3D7EO 3R3LA 4FZYA 4K8ZA 2E4LA 4CJRA 4M7XA 3VA3A 2HF3A 4OPKA 4KHQA 4V19S 4QS8A 3L2WA 2W6KA 4CGJA 2HHWA 3LDQA 3JAMO 3VA0A 3MEDA 3FZMA 4KTQA 4C1NK 4ZTFA 4FK4A 1WNSA 4DTXA 2XO7A 1RDWX 3ZT4A 4YOYA 4B3SK 3KJVA 1VSHA 4PL8A 3VF4A 1YJNN 1VQPN 5AZIA 1Q81O 2QKBA 4CJ3A 4KTZA 3TSUA 3A2FA 4Q5VA 2D0BA 2KBJA 3CC4N 1N34K 4B9UA 3CJ9A 3VOVA 1C1CA 3D6RA 2Q31A 1B3CA 3DI6A 4BDZA 1W7AA 1JCEA 1EP4A 2EX3A 3MN6A 4I7FA 2NY8X 3VTHA 3VQDA 3VERA 2HNDA 3OA9A 3HYFA 5C12A 4OVLA 4CHOA 4F4KA 1K8KA 4DSKA 5CZ1A 4DFKA 4KO0A 3ZETA 2O8EA 2KJAA 4EHTA 3U8XA 2E88A 4LF8K 1T7AA 2VYPA 2C1IA 4CERA 2HBMA 1TKZA 4KAZA 2E2PA 5GAHP 4CCHA 2VWBA 4JS4A 3AVAA 4CGFA 3NDKA 5BPNA 4AAZA 3AVGA 3SNNA 2WC9A 5JS1A 3FZHA 4JI4K 5GADP 4E0DA 4DTRA 4CF9A 1BRZA 2CGLA 2XY7A 1NMDA 1RDCA 2D0OA 4M63C 5C42A 2ETJA 4DR7K 4RW6A 3CCLN 2YNGA 1T44A 4Y0WA 4H0VB 3NF8A 4EZ6A 4PHTX 3FZKA 3ENHA 3DWLA 3EEQA 3T3FA 3TAGA 1P0AA 5BR9A 3PY8A 4X66K 3O4WA 5IT9O 3ZX2A 1ZBIA 4CGDA 2QWPA 2P9LA 4AM7A 5AQZA 3ULDA 4IEEA 3PLAA 2NRXA 3P1GA 4DHYA 1NBWA 4IOCL 1R59O 2KLAA 4CHPA 1KFDA 4B9MA 4LY7A 3L0QA 2KYQA 1LOTB 2HMPA 2NUBA 3RMAA 1U04A 4CGHA 1ZYQA 4AILC 4E7KA 3J81O 2BH1A 3E9OA 4CJ7A 5E26A 5EX5A 3GE1A 2E0HA 2VG7A 3IUCA 3OHRA 4KI6A 4MLEA 4DMNA 3TARA 3MEEA 3EE8A 5AQQA 4DV6K 1EWRA 4BR5A 1HLUA 1V4SA 1TK8A 1BO5O 1XUPO 5HL7L 4DV1K 3LP3A 4CHZA 1X9MA 3OYJA 4FWQA 4H03B 4B9NA 1HNVA 2F8TA 1Z05A 5AQXA 1LW2A 3C65A 4LFAK 2GUIA 4BECA 1LW0A 1RDAA 5DM7L 5D3GA 2I5JA 3KOXA 3A5LC 3K0SA 3RRGA 5AQOA 1NGAA 2LR3A 5FPEA 1TI5A 2A40A 4DV7K 3NF7A 1VHXA 4CIFA 3WEEA 1VQMN 1G15A 3G4SN 3H08A 3HPGA 3UE5A 3CCJN 4RCHA 1TL3A 1K73O 3A0IX 3MWTA 1O13A 2MBKA 4N56A 3PX4A 3JYTA 2Q2RA 4FJJA 4KHWA 4JD2B 4DTJA 4FJNA 2WOMA 3DMJA 1RTHA 3KD1E 4FW2A 4BRFA 2BDPA 3EZ5A 3HK2A 4A59A 2Z1HA 3SQ0A 4BE2A 4GV3A 4IFYA 4PWDA 1QQMA 3CM6A 2V51B 3DLBA 4RW8A 3SUQA 3K5MA 4L3QA 1ILYA 2KZMA 5HRSA 2ASOA 2AP1A 1KQSM 2VG6A 4CJPA 5CYMA 4FXDA 4K8XA 3VETA 2QWMA 2MN5A 3B8AX 2Z1JA 1JCFA 4BGAA 1S9EA 3BF3A 2D4WA 1IG9A 4JI0K 5SWMA 1HJRA 5DM6L 5C2DA 5H1SQ 5AQVA 1FW6A 5BREA 4DR5K 3O3GA 3GDQA 5C25A 3NH2A 1NJIO 2E2QA 1LQHA 5KK4A 4DV3K 1FKOA 3CHWA 5KQDA 3CJAA 2ITMA 3L2RA 1GOBA 4DSIA 4B3OA 2QTDA 2O8DA 3LP2A 3AVNA 4CEOA 1NH5A 3QESA 1SKRA 1N6QA 4CK2A 3TR8A 1S9GA 1KLNA 1WAFA 2E5LK 1XI1A 3SBGA 5AQFA 2E2FA 3KK2A 3KP1A 3L6QA 2P9PB 5J2MA 1GLJO 4CHQA 1MR4A 1JLFA 1XC3A 1YJ9N 4FLVA 4CJWA 4IJNA 4O55A 2SN3A 3J7AP 1XRSB 1S1TA 4EFHA 2ASCA 5FPNA 4JLHA 3K5NA 4E7HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CCS N;  4FOI A;  3ZSQ A;  3KD5 E;  4I9L A;  3RWU A;  4FJ7 A;  3WNH A;  4ELT A;  2UU9 K;  4BRN A;  3HJF A;  3MK6 A;  2DFE A;  4LH5 A;  1YI2 N;  4JEP A;  3ALY A;  2GWJ A;  1NGJ A;  1VSK A;  4CGG A;  3CET A;  3D0P A;  3VQ7 A;  3AAQ A;  1YIT N;  3SZ2 A;  3WQT A;  2HMI A;  3EL2 A;  2ZJP L;  3TAP A;  2LI7 A;  3E01 A;  3EKS A;  1HYZ A;  1PE4 A;  2Q36 A;  3V4I A;  1SUQ A;  1C6V A;  3ZT1 A;  3RMB A;  3SJH A;  4RW7 A;  1HNW K;  5JMV A;  1NGF A;  4YOW A;  4CEE A;  4WFA L;  2HHU A;  3H3N O;  3NE6 A;  4BE7 B;  4JAX A;  4W5R A;  4JI1 K;  1SNB A;  3NAE A;  1A5X A;  3CME N;  2FF3 B;  1POI A;  4EP5 A;  1QTM A;  3ZT0 A;  1PX9 A;  1I6F A;  3K5O A;  1HMV A;  4FWO A;  5GAE P;  2W42 A;  1K8K B;  3H1V X;  1ZBS A;  5J2P A;  4YFU A;  3GOI A;  1ZUT A;  5JS2 A;  5AJ3 K;  2ZM6 K;  1TVR A;  1I2U A;  4IBN A;  4AHS A;  3H6E A;  2HHI A;  3O9T A;  1NG9 A;  1QHT A;  3HP9 A;  1NE5 A;  5CY4 A;  2RN2 A;  3CC7 N;  1HX1 A;  4B1Y B;  5AQN A;  2BTF A;  4BC2 A;  2F4V K;  3C7N B;  4OLB A;  3ZSX A;  4KYP A;  4CJF A;  5FPD A;  4DQP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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