5AQHA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqhA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqhA04
3UKRA 1EQYA 3ZX2A 4FWOA 3R9PA 2QXLA 3ATUA 2QWPA 1GLAG 1TUYA 3FLCO 4BRHA 2HOEA 5AQQA 3CJBA 3FZMA 2E20A 3A5MC 1ZC6A 3GE1A 4FL9A 4RWTA 4EFHA 5EY4A 4BG8A 4JD2A 2GWJA 1K8KB 2E8AA 2E1YA 4FWRA 1QZ6A 3MK6A 2Q1NA 3QBWA 4BR0A 2V7YA 3F9MA 3TU5A 1JCGA 4EHUA 1TYQA 3IUCA 1S3XA 3FZLA 2A40A 1X9JA 2A5XA 2ZWHA 2CH6A 1NGHA 4PKGA 5JLHA 4O5FA 4JN4A 4XEIA 3IMXA 4CZIA 3VOVA 3SJHA 5AQJA 5BR9A 1KAZA 3MDQA 4A2AA 1KXPA 1YAGA 1MWKA 3BEXA 3HSCA 3FGUA 3L4IA 3VEWA 4BC2A 1NGGA 1HKGA 3BP8A 3ZEUB 1LOTB 2QWQA 2P9PB 1HKBA 5I9EB 2CH5A 4BRNA 4CZJA 2ASOA 4H5WA 3AY9A 2H3GX 5AQTA 4ISGA 4BROA 3H1VX 5EX5A 4FWLA 4PKHA 1Z05A 3U8XA 2DPNA 3BF3A 3RSEB 2QM1A 3ENHA 4CD1A 4FWNA 3SK3A 1ZBSA 3W3DA 3AAQA 3UB5A 3DXKB 4BRGA 1BO5O 2YI1A 1NM1A 3HBTA 5AQNA 5TKYA 4BR5A 2GELA 1HX1A 3H3NO 2AP1A 4YDUC 1S22A 3A5LC 4GNIA 4IZ9A 2P9UA 4K43A 4L3QA 3H46O 3R8EA 3CJ9A 5FPMA 4H0XB 3VETA 1IG8A 4EHTA 1QQNA 5BRFA 3A8YA 4B1YB 4BRQA 3B8AX 3U4LA 3CJ1A 2HF3A 4K41A 3W0LA 2CGKA 2GTDA 4MO5A 4XH5A 1QHAA 2D0OA 4B1VA 3GL1A 3LM2A 2HMPA 2YHYA 3VGLA 3CQYA 2BTFA 5E84A 5ELZA 3M6GA 2FLOA 3UE5A 3A0IX 2PAVA 4XH1A 1ESVA 4BC5A 1XQSC 3J8AA 5EVZA 1NWKA 4FPBA 1KAYA 5BPMA 2QWRA 4RTFD 2P9SB 3VPZA 4E1JA 1K8KA 3WXKA 4MLHA 3ULEA 4NB4A 4MLEA 4HWIA 3LL3A 4FWQA 3WXIA 2YCHA 2I7NA 5AQGA 1MWMA 2QWNA 3GG4A 4BR4A 2A42A 3GDQA 4RCHA 3LDLA 1IJJA 4H5NA 1XC3A 1BUPA 1XUPO 2P9IB 3JXUA 2F9TA 3WXLA 4H0YB 2P9LB 1ZXOA 3AAPA 2ZGZA 1WUAA 5ADXH 3C0BA 4AM7A 5AQPA 5AQRA 2ITMA 4CZGA 4CD3A 4AM6A 4H0TB 3EL2A 5LY3A 1NMDA 3ZX0A 3LDQA 5BRHA 4KBOA 2Q0UA 3U9DA 2Q36A 1HJOA 2E2PA 1QZ5A 2P9PA 4FWKA 5AQFA 3VEXA 4BQZA 1ATNA 5BPNA 4M63C 1NGCA 3FZFA 3WQUA 5JLFA 1DEJA 3LDOA 3IDHA 1D4XA 2I7PA 5AQMA 1NGAA 4IJNA 4BR9A 3SMPA 3WXJA 1SQKA 4CZHA 4QS9A 1NGFA 5AZJB 5BN9A 2W40A 3CHWA 4H0VB 3RSEA 1CZAN 3M3ZA 3A5OC 1DKGD 3DJCA 4FWPA 3ID8A 3UKUB 3DXKA 3WQTA 1NGIA 1BOTO 3MN7A 3VEYA 5AZIA 4ISEA 2PBDA 1T6DA 1HUXA 4F9OA 2VCPA 5LJVA 5AQIA 1RDWX 4J8FA 2V51B 3H3OB 1WOQA 4CBUA 5BPLA 3EN9A 4DCHA 2V7ZA 4B1ZA 4CZMA 4BQLA 3DXMB 3UKRB 3H1QA 4H0PA 4WQ5A 5KPTA 3KHYA 4A62A 3FZHA 3H6EA 5EOYA 4B9QA 3QDKA 2OANA 4JAXA 3D2EB 2IIRA 3QMLA 5FPEA 2D0PA 3DAWA 1DGKN 3P4IA 2IVNA 5KQ8A 4PKIA 3O6WA 5AQOA 3OHRA 4JNEA 3O5BA 2CGLA 4WYBA 5LJWA 5FPDA 3VF2A 4EIAA 1ATSA 1TYQB 2FF6A 4O8KA 3CERA 4Z94A 2A41A 2P9SA 1Z6RA 1GLBG 3D2FA 3VGMA 3CJ7A 3QBXA 5KQDA 4Y0WA 1BU6O 3AARA 2CGJA 4A2BA 4XH4A 2D1KA 1C0GA 3ZX3A 2P9IA 1OKJA 3WEEA 2W41A 2P9LA 2YHXA 3G25A 4B1XB 1X3NA 2NLXA 3DWLA 4M7YA 3MMVA 2EWSA 1MDUB 4LC9B 4PL8A 5F0XA 4ISFA 4BR7A 1RFQA 3VF6A 3EO3A 3CIPA 2ZF5O 3QB0A 4IXCA 1YXQA 5ADXA 4H03B 4H5RA 4CJ7A 1JCEA 3VEZA 4IO8A 3O80A 1HKCA 4FOEA 4BREA 4DB3A 5AQLA 1Q18A 4BVPA 4YDUA 4BC3A 4CBXA 2P9NB 1BA0A 5AQSA 4IJAA 2IVOA 5AZJA 4JHDB 2A6AA 2FF3B 1BDGA 1TUUA 3O1BA 3SLCA 5KPZA 1H1VA 2P9KB 1NGEA 3UKUA 3TPQA 5AQWA 4PL7A 4CZKA 1QQMA 3VEOA 3HM8A 1GLDG 4I6MB 3ZEUA 5F1XA 3VGKA 1NGJA 2ASMA 3MN9A 3ZETB 3CQXA 5JICA 4CZEA 1ATRA 2Q0RA 1BA1A 3KVGA 5EXWA 4K42A 3DXMA 3FFKB 4BG9A 4B1UB 1JCFA 3D2EA 3M1FA 4EAHD 4BVOA 3EKUA 4WQ5C 1GLCG 1BG3A 1NBWA 4BGBA 2V52B 4BRIA 4FPAA 4WQ4A 1LCUA 2D4WA 5AFUH 3ULEB 2ASPA 2NZTA 3U9ZA 3H45C 1RGIA 5JMVA 3O8MA 5AQZA 3D7EO 1E4GT 2UYTA 2ZGYA 5AQVA 2IVPA 1NGDA 5BN8A 1U6ZA 3R6MA 1SZ2A 1U2VB 4DHYA 3C7NB 3LM9A 4H5VA 1C0FA 4CZLA 1BWFO 5AQHA 3HZ6A 3ATVA 4C23A 2YJFA 2VYPA 5AQKA 5KPRA 1HLUA 1R59O 1X3MA 3EZWA 4BR2A 1GLEG 4BRMA 2QWMA 4HTLA 4K25A 4QS8A 5B8HA 4JD2B 4H5TA 4BRLA 1YVNA 5BRDA 1QQOA 5CE3A 4MO4A 4IWVA 1T6CA 2Q97A 3S41A 3I33A 5AQXA 1E4FT 1V4TA 3FR0A 3O1WA 3O4WA 3VESA 4BRCA 3I8BA 3BF1A 3JS6A 2A3ZA 5AQYA 5AQUA 5E26A 4FO0A 2E2OA 1GLFO 1NLVA 3HI0A 4BRDA 2QW9A 3CETA 3WUHA 1V4SA 2P9NA 4FSVA 4B1WB 3L6QA 5AZIB 2Q31A 3GOIA 1G99A 3ENOA 2FSNA 4JHDA 2BUPA 2FSJA 3KZBA 2E88A 2NRHA 4CZFA 3QFUA 4FWSA 3GBTA 1P8ZA 3L0QA 4M7XA 1T44A 3LDNA 2P9KA 2YHWA 3O08A 3MCPA 2AA4A 1YUWA 2E2QA 2VWBA 2F9WA 1J6ZA 3MN5A 2QWLA 4I6MA 1Y64A 4BGAA 4BRPA 1SAZA 4BRKA 3WT0A 3EKSA 3ZETA 2GWKA 3SMSA 4GY2B 2HF4A 4DQ8A 3FE1A 5FPNA 5F2RA 4BRAA 2FSKA 1MA9B 3QFPA 2FXUA 1NGBA 2WUSA 2Q2RA 4CBWA 3IFRA 5BREA 1KAXA 3HTVA 4QS7A 3BUZB 3VF4A 3CI5A 4BRFA 3FZKA 1HPMA 3VERA 2GEMA 1GLJO 2P9UB 3CJAA 3D2FB 2KHOA 4NO7A 2QWOA 4FWMA 5AR0A 2E1ZA 3LDPA 4WQ4C 2GUPA 2E2NA 4FOIA 3CJCA 3MN6A 3VENA 3VEVA 1U2VA 3WEEB 4CI6A 2J4RA 4A61A 3QICA 3C7NA 3A5NC 2YJEA 5AFUA 4BC4A 4H0OA 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PIOL 3R9PA 3TSQA 1GLAG 4Q0BA 1PTXA 1BHLA 1QE1A 1YJWN 3HVTA 4DS4A 3GE1A 3L2QA 3HP9A 4CHYA 3VQ7A 4FL9A 4RWTA 4EFHA 1M90O 2G8UA 4BG8A 1TKTA 3AGKA 4JD2A 2GL1A 4JK7A 3V9UA 4CJTA 3OTOK 1X9SA 2O8BB 2Q1NA 2ZJRL 2V7YA 2E0HA 2VY6A 3F9MA 4EHUA 5J2NA 4DKWA 5FLXO 3DLRA 3FZLA 2ZWHA 3ASMA 3VOVA 4I7FA 3E7RL 1F21A 4RG8A 3L2UA 2ATQA 5BR9A 5HROA 1KAZA 3KP0A 3KKRA 1YAGA 1MWKA 1JLGA 5JS1A 3VEWA 1ASVA 1MYNA 3TSUA 2ZM6K 3MEEA 1GOAA 1JXEA 1BGXT 5GAGP 2E5LK 1NGGA 3BP8A 1DQ7A 1I94K 3OYJA 2IS3A 4GMJB 5JS2A 1R0AA 4NCAA 3SV4A 2HVIA 3SUOA 4DWIA 4FJ8A 3RMDA 5AQTA 2JWLA 4A5AA 1QTMA 1REVA 5CZ2A 1S6QA 5EX5A 2MN5A 4CVNE 5DMRA 2N66A 1TL1A 3RSEB 3VA0A 1D9DA 2FC0A 4FWNA 4LFBK 3SK3A 4HE7A 3HBTA 1C56A 4BR5A 2GELA 5C24A 2O8FB 3PLAA 2AP1A 1XMQK 3HVRA 4CHPA 3DRSA 2EHGA 2P9UA 1WB9A 4L3QA 4FZYA 5FPMA 3VETA 1LWEA 1NJYA 5M1NA 3U4LA 3TAEA 2OTJN 3U6FA 4KHSA 2CGKA 4EP4A 4MO5A 4MFBA 5C10A 1OMYA 3U3YA 2A1SA 3OYKA 2HNYA 3UIQA 1IV0A 3UE5A 2HMIA 3CFOA 2PAVA 3VA3A 1XQSC 4PQUA 3J8AA 3SBGA 1IBMK 4F2RA 4OPHA 3V9XA 4M3UA 1SS6A 3VPZA 4E1JA 1NK8A 4YY3K 4NB4A 4MLEA 2UU9K 1T3VA 3GG4A 3MX2A 2A42A 5H1SQ 2WTUA 1QVGM 3HPOA 3G0ZA 4CHNA 1NJIO 1VRUA 1RTHA 2RKIA 2ZGZA 1U47A 4CGIA 5KK4A 3AVLA 1EKEA 1ZYVA 4HCCA 1J53A 4CZGA 5A2QO 4HTUA 2NY8X 4E7LA 4JKGB 3E9PA 5KI6A 3EL2A 1NMDA 3K2PA 4OKEA 3EE8A 3LANA 3AVNA 1Q81O 2KBKA 3VQ4A 3L8BA 1NGCA 3FZFA 1NNEA 4CK3A 1WSGA 3ID6A 3KLFA 1NJXA 4FJLA 4IJNA 2XY5A 2HBLA 4FJMA 1DJTA 1YI2N 4QS9A 1NGFA 3LDSA 4DTMA 4H0VB 4IFEA 3A2FA 1BQMA 3WQTA 5GAEP 3TTFA 3VQDA 1BOTO 1OH6A 1Q82O 4OGCA 2G2KA 1YVUA 3R1XA 1T6DA 4HUEA 5LJVA 3SI6A 5FRMA 3H3OB 4DSEA 4FJNA 4CBUA 2G8KA 3EN9A 3K9JA 3ZT0A 3L3VA 4WQ5A 3QEWA 4GV3A 3FZHA 3H6EA 3OS0A 3HJFA 4CJ4A 2OANA 3D2EB 2IIRA 2OTLN 2D0PA 2OPPA 1ZYWA 1WT7A 4E7HA 3P4IA 2IVNA 4YOTA 5KQ8A 4DTRA 1A5VA 3O6WA 3V9SA 4M3TA 1WSEA 2CGLA 1W0HA 1JL2A 4Y1DA 5LJWA 2HHIA 3NH0A 2VGMA 2X6NA 5FPDA 3QEVA 1ATSA 1TYQB 4J2EA 1VSHA 1LV5A 1LW0A 2A41A 2P9SA 1Z6RA 3FFIA 3AV9A 3ULDA 4CEBA 4NXNK 4JI1K 5KQDA 1VNAA 4B3OA 4BE7B 1BCMA 1MU2A 1IG9A 4LFCK 4I2PA 3O9UA 4B9UA 1C0GA 3ZX3A 3WEEA 2W41A 3AO2A 3P5JA 2YHXA 3G25A 3K0SA 4DUYK 3LAMA 2P5OA 2NLXA 4CJRA 3CQ8A 4M3XA 2BH1A 1L5UA 5M1OA 4CEFA 4QCLA 1ITGA 4ISFA 3O3HA 4BR7A 1RFQA 3CPEA 3Q7BA 3ZT4A 4CFDA 1YXQA 2O8BA 4H03B 1CLQA 4CJWA 4CJ7A 1JCEA 4FZZA 4IO8A 1O13A 1HKCA 2QTDA 2PFUA 3E66A 1Q18A 3P1GA 3SQ0A 1BA0A 2LR3A 5AQSA 4IJAA 4FM1A 4LY7A 4BE0A 1SN1A 1J9AA 4C8KA 2IVOA 1VSIA 5CZ1A 4YOWA 2FF3B 4JKHA 1BDGA 4N56A 3O9TA 2HHTA 4H4MA 3OJSA 4C8OA 3AVGA 1TUUA 1Q9XA 4OO1J 3L2WA 2P9KB 3UKUA 1NG9A 4KHYA 1DTQA 3HM8A 3CC7N 1EX4A 1JKHA 4B9TA 3NBPA 4LF6K 5F1XA 3P83D 3ISNC 2HHUA 3L3UA 2YNFA 1QS4A 3VN5A 3BK3C 4CZEA 3I55N 3B6OA 3M8SA 4M45A 2XY8A 4B1UB 2HBJA 4HCBA 4EAHD 4BVOA 4JI3K 4LFAK 4PUOA 2QXFA 4IFYA 4NXMK 4AB0A 2D4WA 1QSSA 1VSDA 1U48A 2ASPA 4DQRA 1RT2A 3D7EO 1E4GT 1IKYA 2O8CB 1IH7A 2JLEA 3QEXA 2HBMA 4B9SA 1YITN 4DFJA 2KW4A 3CM6A 1C0FA 3V1RA 1BWFO 5AQHA 3HZ6A 4J2BA 3D0PA 1RTIA 2YJFA 5KPRA 5AQKA 2NRVA 1HLUA 4CIGA 1RDUA 1N34K 3OS1A 1X1PA 2QWMA 5BR8K 4U7BA 2GMOA 4JD2B 1KVAA 1QQOA 1ZBFA 3ZSYA 1IKXA 1T7BA 4M3RA 1NU0A 4MO4A 4YHHK 3QETA 1C1BA 3QLHA 3ENBA 2WBNA 4FJHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3PIO L;  3R9P A;  3TSQ A;  1GLA G;  4Q0B A;  1PTX A;  1BHL A;  1QE1 A;  1YJW N;  3HVT A;  4DS4 A;  3GE1 A;  3L2Q A;  3HP9 A;  4CHY A;  3VQ7 A;  4FL9 A;  4RWT A;  4EFH A;  1M90 O;  2G8U A;  4BG8 A;  1TKT A;  3AGK A;  4JD2 A;  2GL1 A;  4JK7 A;  3V9U A;  4CJT A;  3OTO K;  1X9S A;  2O8B B;  2Q1N A;  2ZJR L;  2V7Y A;  2E0H A;  2VY6 A;  3F9M A;  4EHU A;  5J2N A;  4DKW A;  5FLX O;  3DLR A;  3FZL A;  2ZWH A;  3ASM A;  3VOV A;  4I7F A;  3E7R L;  1F21 A;  4RG8 A;  3L2U A;  2ATQ A;  5BR9 A;  5HRO A;  1KAZ A;  3KP0 A;  3KKR A;  1YAG A;  1MWK A;  1JLG A;  5JS1 A;  3VEW A;  1ASV A;  1MYN A;  3TSU A;  2ZM6 K;  3MEE A;  1GOA A;  1JXE A;  1BGX T;  5GAG P;  2E5L K;  1NGG A;  3BP8 A;  1DQ7 A;  1I94 K;  3OYJ A;  2IS3 A;  4GMJ B;  5JS2 A;  1R0A A;  4NCA A;  3SV4 A;  2HVI A;  3SUO A;  4DWI A;  4FJ8 A;  3RMD A;  5AQT A;  2JWL A;  4A5A A;  1QTM A;  1REV A;  5CZ2 A;  1S6Q A;  5EX5 A;  2MN5 A;  4CVN E;  5DMR A;  2N66 A;  1TL1 A;  3RSE B;  3VA0 A;  1D9D A;  2FC0 A;  4FWN A;  4LFB K;  3SK3 A;  4HE7 A;  3HBT A;  1C56 A; 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