5AQJA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqjA04
2P9UB 1GLCG 5EVZA 3ENOA 3ULEA 3WT0A 2A5XA 3LDNA 4FWLA 2NRHA 5BPLA 4EFHA 3AAQA 5BN9A 4H5TA 5BPMA 2P9NB 3W0LA 4BRAA 4AM7A 1NGJA 2P9KB 3EL2A 3U8XA 4BG9A 2A3ZA 4FWKA 5AQLA 2W41A 3WQUA 4CZIA 3GDQA 4BRIA 3I8BA 5BPNA 3MN5A 3MN9A 2QWRA 1HUXA 2H3GX 1TUUA 1QZ6A 1T44A 3C7NA 4BGBA 4RCHA 1YAGA 4K41A 3U9ZA 1RGIA 1X9JA 1NM1A 4ISGA 1YXQA 4GNIA 4PL7A 1SAZA 3U4LA 5ELZA 2V7ZA 4XH4A 4LC9B 3O1BA 3SLCA 2FXUA 3MCPA 4CJ7A 4BQZA 4H0OA 1QQNA 1G99A 3A8YA 2CGLA 3G25A 3HM8A 3UE5A 2KHOA 4B1YB 4XEIA 4JD2A 4H0YB 2HF4A 1GLJO 3UKRA 1S22A 3MN6A 1HKBA 2PAVA 4CZGA 4FOIA 4FPAA 2E2PA 3FZHA 1ZXOA 3CERA 2CH5A 3EN9A 2F9TA 3KZBA 3IDHA 1ATNA 3H45C 3H46O 3FE1A 4XH5A 3TPQA 3VEXA 2IVPA 1H1VA 3H1VX 1KAYA 1TYQA 3MK6A 4IO8A 2GELA 2YI1A 1D4XA 4JHDA 3BUZB 4CZMA 4K25A 3L4IA 1V4TA 3BEXA 5E84A 1LOTB 2GWJA 2Q0RA 1BDGA 3ZEUA 2QWNA 2P9SA 2D0OA 3H3NO 3CI5A 1IJJA 4A2BA 4CZKA 2FF6A 3EZWA 3TU5A 4F9OA 3BF1A 3EKSA 3FFKB 4BC4A 3O4WA 4EAHD 3SJHA 5FPEA 1QQOA 4IJAA 4RTFD 3H3OB 3ENHA 2E8AA 1ATRA 5LY3A 4XH1A 1BUPA 2EWSA 4FOEA 3W3DA 3QDKA 4I6MA 2BTFA 3UKRB 5AQNA 3QBXA 1NMDA 4CZJA 1NGGA 1RFQA 3AARA 5AQSA 2P9LB 3VGKA 5AR0A 5AQOA 4CBXA 2A6AA 1Z6RA 4MO4A 2HMPA 3LDLA 2ZWHA 5E26A 5TKYA 2CGKA 5FPDA 4JHDB 4BR2A 5BRFA 5EX5A 3D2FA 4Y0WA 1QHAA 4MLHA 2IVOA 4PL8A 5AQFA 2Q2RA 2ASPA 4H0PA 2QXLA 3CJBA 3ZX2A 3VERA 4JAXA 3CJAA 2P9IB 4EHTA 5LJWA 4BRHA 4BREA 2YHXA 4H5RA 2D1KA 1U2VA 3CJ9A 4K43A 3CETA 2E88A 1MA9B 1K8KA 2E2NA 4WQ5A 2QWQA 4K42A 3M3ZA 1SZ2A 1S3XA 5AQYA 2DPNA 2HOEA 4QS9A 5AQPA 2D4WA 1YUWA 3KVGA 4A61A 3FR0A 1DGKN 1BO5O 3UB5A 4NB4A 5AZJA 3DXMA 4FWQA 5BREA 3QFPA 4KBOA 5F1XA 3WXLA 2I7NA 5AQUA 4CI6A 4JNEA 2AA4A 5AQWA 2V51B 3LL3A 3CJ7A 2D0PA 3ZETA 5AFUA 5CE3A 1X3NA 1EQYA 3O80A 1ESVA 1LCUA 4BVPA 3M1FA 2W40A 5AQMA 4HTLA 4BG8A 3D2EB 3ZX0A 5KPZA 4WQ5C 4CZHA 4H5WA 2Q36A 1BG3A 4IXCA 5KQ8A 3ID8A 4FWRA 5ADXA 5AFUH 1ATSA 5LJVA 4YDUA 4QS7A 3U9DA 4ISFA 3SMSA 1NLVA 3A5LC 1RDWX 3CJCA 4BRNA 1BA0A 5AQTA 1XC3A 4FWNA 3VEYA 3FLCO 3WXKA 4B1VA 2UYTA 3A5NC 3RSEA 2E2QA 3LDPA 3DXMB 3ATVA 2HF3A 3ULEB 3VETA 3GE1A 2P9PA 3ATUA 4IWVA 5AZIA 5ADXH 5BRDA 2WUSA 2FLOA 3WUHA 4MO5A 5JMVA 3JS6A 3ZETB 2IIRA 2CGJA 3F9MA 3R6MA 1TUYA 3VEZA 3O6WA 4DCHA 4BC3A 4YDUC 4A62A 3P4IA 1HLUA 1NGIA 5KPRA 2QWMA 4BR7A 5AQIA 4ISEA 1C0FA 3VENA 4BR0A 2GUPA 3C7NB 3WXJA 2E20A 3DJCA 1BWFO 3R9PA 1NGEA 2VCPA 1C0GA 1NGDA 2Q0UA 1NWKA 5F2RA 4B9QA 4M7YA 4H0XB 2FF3B 3I33A 5F0XA 3VGMA 2Q97A 3GBTA 1KXPA 1MWMA 4JD2B 5JLHA 1T6CA 2YJFA 2P9PB 4BR4A 4BRFA 1HX1A 1BU6O 4WQ4A 3EKUA 3J8AA 3WXIA 3VF6A 4BC5A 1Y64A 1TYQB 1NGAA 5I9EB 4CZFA 4BR5A 3KHYA 2IVNA 1GLAG 4FWMA 3FGUA 4IJNA 3O08A 2AP1A 3UKUA 2QWOA 3ZEUB 3HBTA 4E1JA 2P9SB 5AQHA 2P9UA 3VPZA 3CJ1A 3LDOA 5BN8A 4FSVA 5JLFA 3FZKA 1NGBA 1NGHA 2P9NA 4GY2B 1HKGA 4PKGA 1ZC6A 3R8EA 1OKJA 3VEOA 4WQ4C 4B1ZA 1E4FT 3VF4A 2A41A 3VEVA 3JXUA 1MWKA 2V7YA 3QBWA 4I6MB 3HTVA 4BRDA 4BRMA 3FZMA 1JCFA 1ZBSA 4BRGA 4AM6A 4H0VB 4B1UB 3HI0A 3SK3A 2V52B 1GLLO 1HPMA 4M63C 5KPTA 3O8MA 1HJOA 2OANA 3IUCA 3D2FB 3EO3A 4EIAA 3B8AX 5AQVA 2ASMA 4NO7A 4JN4A 2F9WA 4FWSA 3GG4A 4CD1A 4CZEA 5BR9A 4RWTA 4QS8A 3VGLA 1U2VB 1X3MA 3WEEA 1T6DA 5EY4A 1K8KB 2VWBA 3M6GA 3WQTA 4Z94A 2I7PA 5KQDA 3ZX3A 1WUAA 4A2AA 4O5FA 3HSCA 5FPMA 4FWPA 1GLBG 4HWIA 5EXWA 4L3QA 4H0TB 4BRPA 1YVNA 5AZJB 3GOIA 2YJEA 3HZ6A 3OHRA 5BRHA 1BOTO 2ZGZA 2FSNA 3BF3A 2GTDA 3DXKA 2YHWA 3FZFA 5AQQA 4BRLA 1XQSC 2FSKA 3MDQA 3CQXA 1MDUB 3BP8A 3D7EO 5FPNA 2QW9A 2E1YA 1JCGA 1BA1A 2VYPA 4CD3A 1P8ZA 2P9LA 3CQYA 2ZGYA 2J4RA 4O8KA 3WEEB 1E4GT 2Q1NA 4BRCA 5B8HA 3AY9A 5AQGA 2QWLA 4FL9A 3VEWA 4IZ9A 2ZF5O 2YHYA 4B1WB 2PBDA 3LM2A 3RSEB 3DWLA 4BVOA 2CH6A 3CIPA 4EHUA 2NZTA 2GWKA 2ITMA 3MN7A 5AZIB 3QFUA 5AQJA 1DEJA 4WYBA 2P9IA 3DXKB 1GLFO 3O5BA 1XUPO 5AQXA 2QWPA 2E2OA 3SMPA 1NGFA 3IMXA 4CBWA 3FZLA 3A5MC 4PKHA 4FPBA 2A42A 1WOQA 4PKIA 2GEMA 4BC2A 4H5VA 5AQRA 4FO0A 2Q31A 2E1ZA 3CHWA 4CZLA 1KAXA 1IG8A 1Q18A 1NGCA 3H6EA 4CBUA 1QZ5A 1DKGD 3S41A 3O1WA 3MMVA 3VF2A 1U6ZA 3QB0A 3QICA 1NBWA 4J8FA 2P9KA 1V4SA 3D2EA 3C0BA 1HKCA 4BRKA 4DB3A 4DHYA 2QM1A 1KAZA 3VESA 2NLXA 3AAPA 2ASOA 4DQ8A 4BROA 4FWOA 5JICA 1QQMA 1GLEG 3L0QA 3GL1A 1GLDG 3H1QA 3VOVA 4BRQA 4BQLA 3IFRA 3DAWA 1R59O 2A40A 5AQZA 4H5NA 5AQKA 2FSJA 3L6QA 5EOYA 2BUPA 4C23A 4BR9A 2YCHA 4M7XA 4BGAA 3A0IX 1JCEA 3LDQA 1J6ZA 1CZAN 3A5OC 4B1XB 3UKUB 4MLEA 1SQKA 3LM9A 4H03B 3QMLA 1Z05A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RWUA 3ENOA 1GLCG 3VQ9A 3TAGA 3DRRA 3V9UA 3ZT4A 1BMRA 2NRHA 4IKFA 1EO1A 2LSNA 3NH2A 3THXA 1I94K 2NRZA 4FJNA 5BN9A 4H5TA 4JS5A 4AM7A 1NGJA 1YJWN 1ASWA 4FWKA 1K8BA 3ID6A 4CZIA 3T69A 4FZXC 3MN5A 4E7JA 3HPGA 1TUUA 4DSKA 1ICAA 1T44A 1RBVA 1RDDA 1ASUA 3U9ZA 4DV0K 3THVA 1X9JA 4JKDA 2MBKA 1ZBIA 4K0KK 4DQSA 3ITHA 1SAZA 5ELZA 3O1BA 3SLCA 4EZ9A 4CJ7A 4H0OA 1WSJA 5HRRA 1T7AA 4XEIA 2NUBA 4H0YB 2HHUA 4BEBA 2Z1JA 3NF9A 3ZSQA 2E2PA 3FZHA 1ZXOA 3LANA 3CERA 3WNHA 3KZBA 4FZZA 1NOYA 3C94A 3IDHA 1ATNA 3TTDA 1Z05A 3H46O 4XH5A 3DLHA 2W00A 3TPQA 1TAUA 3S3MA 1K8AO 1BHLA 5C10A 1WLJA 3ZYYX 1SS6A 1WSGA 2YI1A 3A2FA 3K58A 3VQBA 2JDQD 1ZVEA 4CZMA 3BEXA 5E84A 3RVCA 1LOTB 4NLBA 4KH6A 1BDGA 3ZEUA 2QWNA 2D0OA 2RPIA 5HP1A 3TR8A 1Q8IA 4FJLA 3DOKA 4EZ6A 1XMQK 2FF6A 3TU5A 1SKRA 4CFAA 3BF1A 3RR8A 4B8CA 3P83D 2NY8X 1UOCA 4FJ8A 4DTJA 4B9MA 3O4WA 4GVEA 3SJHA 4XIUA 4V19S 2E8AA 1LWEA 2HNZA 1T7BA 2F8TA 2ZJRL 1TGOA 3K5MA 3QDKA 3AA5X 3QBXA 1UA1A 1NGGA 1ZU3A 5AR0A 2NRWA 1JL2A 4GV6A 3AVIA 2QEXN 1S1VA 2VGMA 2HMPA 4FLXA 2ZWHA 5E26A 1VAZA 1NU0A 1WBBA 4H4OA 3RRHA 1LQQA 1RTIA 1MR4A 4CEQA 4MQ3A 5BRFA 1NH5A 3OY9A 1KFSA 1QHAA 2Z1IA 4FJMA 2QXLA 2WC9A 4JAXA 3HSTB 2I5JA 5IT9O 1U2VA 3PLAA 4UQGA 4K42A 3M3ZA 4Y1CA 2HOEA 4CIEA 3DLRA 5AQPA 4A61A 3FR0A 1DGKN 1S6PA 2QK9A 3KK2A 4W5NA 1RBSA 4NB4A 1IBMK 5AZJA 3AVGA 1DTQA 1TAQA 4FWQA 3M8QA 4YOWA 3O4NA 4DG1A 5AQUA 4OO1J 3AVFA 2AA4A 5AQWA 2YNIA 3AVMA 3ZETA 2D0PA 4DSLA 1TL1A 3MEEA 4ID1A 4BVPA 4YFUA 1EP4A 3D2EB 1QHTA 1LV5A 1NG9A 2RE2A 3RRGA 2HHIA 2Q36A 1BG3A 4IXCA 4DR5K 1YJNN 4CJSA 5FRNA 1B3CA 3ASMA 4Z4CA 2HHSA 2NRXA 1BL3A 4NYFA 1T0ZA 3HM9A 4E7LA 1O1WA 4KH5A 4KV8A 4DQIA 3NGYA 1JL1A 4IG3A 4OPAA 3CM5A 2W42A 5AQTA 4FWNA 2BANA 4B1VA 4C8NA 3AGKA 1FK9A 1VSLA 2D0AA 3ULEB 2HF3A 3VETA 1U47A 1U48A 3AO3A 3GE1A 5AZIA 2FLOA 3IS9A 4MO5A 1RTJA 2GMOA 3ZETB 2C1IA 2XY8A 3R6MA 2XY6A 4AHTA 3O6WA 4DCHA 4BC3A 3G6EN 4A62A 4Y1DA 3D45A 1HLUA 3Q7CA 3CCJN 2VG7A 4BR7A 4ZTJA 4B9SA 3DMJA 1K6YA 4DV7K 3SV3A 3S3OA 1EXQA 2E20A 4DV2K 1NGEA 4OKKA 1ZYWA 3I8DA 1I2UA 1EX4A 1K73O 4C1NI 2FF3B 3GBTA 1KXPA 1AHOA 2LKBA 5C24A 3OS1A 1UWBA 3L2UA 3SAFA 1HX1A 2KFNA 3OYDA 3EKUA 3J8AA 3WXIA 1RNHA 4Z4HA 3VF6A 4TSXA 1Y64A 3MWPA 4CJQA 3AVAA 4WCEL 3CYMA 2IVNA 1QTMA 3ISNC 5LL6Z 1CXUA 3HJFA 2GL1A 3UKUA 3V81A 3RR7A 2QWOA 3HBTA 2P9SB 2F8SA 5KI6A 3CJ1A 4JI6K 5M1PA 5JLFA 1OH7A 4J2BA 3BZKA 1TKDA 4CHQA 4GV3A 1OZZA 3VEOA 4WQ4C 4EP5A 3R2VA 4NLCA 4B1ZA 1I2VA 4DR4K 4O55A 1ITGA 1MWKA 5CR4A 4I6MB 4DLGA 4A57A 3IRXA 4BRDA 2RN2A 3R1XA 5HBMA 2FBXA 3LPUA 1WSFA 1IKXA 1QSLA 1J5EK 4H0VB 1JLCA 1HR0K 4M3UA 4B1UB 3KLGA 5CY0A 2PYJA 2HHVA 3O8MA 3R3LA 1ASVA 2OANA 4BECA 3BGRA 3AO4A 3OW2M 3D2FB 1RT6A 1IBKK 2NRTA 3AGRA 3AVLA 5AQVA 3HP6A 2F96A 2F9WA 4B9NA 5BR9A 4RWTA 4DKWA 4KTWA 4DS5A 1OVYA 1T6DA 2VWBA 3M6GA 2I7PA 3NFAA 2K35A 4A2AA 4C1NK 2OTJN 4O44A 1NRBA 5FPMA 2YKNA 4BRPA 3HVRA 2O8FA 4DU4A 4KKOA 1HNXK 1BOTO 4BY9C 3BF3A 4O4GA 3OS2A 3AA3A 5AQQA 1VSEA 4O0JA 3HRGA 4LY7A 1XQSC 1JXEA 1DLOA 1X9WA 5FPNA 2I61A 1AYJA 2IDOA 2E1YA 1JCGA 2FBYA 3TWHA 3U3GA 2P9LA 2NY9X 2R7YA 3P1GA 2Q3SA 2ZGYA 3PSMA 2J4RA 1VSDA 2HHWA 3GKUA 4BRCA 5B8HA 4JRQA 3V6DA 3CQ8A 4B1WB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RWU A;  3ENO A;  1GLC G;  3VQ9 A;  3TAG A;  3DRR A;  3V9U A;  3ZT4 A;  1BMR A;  2NRH A;  4IKF A;  1EO1 A;  2LSN A;  3NH2 A;  3THX A;  1I94 K;  2NRZ A;  4FJN A;  5BN9 A;  4H5T A;  4JS5 A;  4AM7 A;  1NGJ A;  1YJW N;  1ASW A;  4FWK A;  1K8B A;  3ID6 A;  4CZI A;  3T69 A;  4FZX C;  3MN5 A;  4E7J A;  3HPG A;  1TUU A;  4DSK A;  1ICA A;  1T44 A;  1RBV A;  1RDD A;  1ASU A;  3U9Z A;  4DV0 K;  3THV A;  1X9J A;  4JKD A;  2MBK A;  1ZBI A;  4K0K K;  4DQS A;  3ITH A;  1SAZ A;  5ELZ A;  3O1B A;  3SLC A;  4EZ9 A;  4CJ7 A;  4H0O A;  1WSJ A;  5HRR A;  1T7A A;  4XEI A;  2NUB A;  4H0Y B;  2HHU A;  4BEB A;  2Z1J A;  3NF9 A;  3ZSQ A;  2E2P A;  3FZH A;  1ZXO A;  3LAN A;  3CER A;  3WNH A;  3KZB A;  4FZZ A;  1NOY A;  3C94 A;  3IDH A;  1ATN A;  3TTD A;  1Z05 A;  3H46 O;  4XH5 A;  3DLH A;  2W00 A;  3TPQ A;  1TAU A;  3S3M A;  1K8A O;  1BHL A;  5C10 A;  1WLJ A;  3ZYY X;  1SS6 A;  1WSG A;  2YI1 A;  3A2F A;  3K58 A;  3VQB A;  2JDQ D;  1ZVE A;  4CZM A;  3BEX A;  5E84 A;  3RVC A;  1LOT B;  4NLB A;  4KH6 A;  1BDG A;  3ZEU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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