5AQLA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLWSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqlA04
1ZC6A 4CJ7A 3GOIA 4I6MB 4CZEA 2GEMA 5AQLA 5EXWA 5ELZA 5B8HA 5BN8A 2HOEA 3CI5A 4FSVA 4WQ4C 5AQKA 4NB4A 1SAZA 5BR9A 5AQYA 2FF3B 4MLEA 5AZIA 4PKGA 5JMVA 1TYQA 2GWKA 4BRFA 3GDQA 2Q0UA 4M7YA 5AQJA 3DXMA 4IJAA 3JXUA 3AAQA 3EN9A 4BQZA 4DCHA 5AZJA 4BRMA 5AQZA 2FSJA 2P9LB 3O80A 1HX1A 5AR0A 1MWMA 5I9EB 3AY9A 1KAZA 2D0PA 3TPQA 3ZEUA 4HTLA 3W3DA 2NZTA 2QWPA 1BA0A 3LDPA 3A5LC 3W0LA 4BC2A 4EIAA 1NMDA 1TUUA 1YUWA 1BU6O 2QWMA 5TKYA 3CJAA 3QDKA 1BO5O 1HKGA 1HKCA 4WQ5A 1KAXA 2AA4A 2E2NA 5AQVA 2ZGZA 4H5NA 3HM8A 3QBXA 3HSCA 1U2VB 2YJFA 3VOVA 2FXUA 2A6AA 4FWQA 2V7ZA 1C0FA 3CJCA 1GLAG 4H5VA 3I33A 3ZX3A 5F0XA 3DAWA 3MK6A 4BRNA 3B8AX 1T44A 3AAPA 4B1VA 1S3XA 2IVPA 3FR0A 4PKHA 3UKUB 3ZETA 4CZHA 1QZ6A 3WUHA 4JN4A 1KAYA 5JLHA 1X3MA 3GG4A 4NO7A 3ATVA 3SLCA 5KQDA 4LC9B 3IFRA 1NGIA 2Q97A 4H5TA 2FSNA 2CGJA 1EQYA 4BVPA 4BRCA 5BPNA 3A8YA 4BGAA 1RFQA 1ATSA 1U6ZA 2UYTA 3LDQA 1JCGA 3H3NO 3FFKB 2NLXA 4JAXA 5FPEA 3O1BA 1HPMA 3LDLA 2GELA 3TU5A 3VEWA 5AQRA 2CH5A 1NBWA 2PBDA 3QICA 1G99A 3A0IX 4H0PA 3SMSA 1BA1A 2YJEA 1Z6RA 3DWLA 3CJ7A 1QQMA 3HBTA 5KPRA 4FWKA 1LOTB 2A40A 2A41A 4CI6A 4CZGA 2E1YA 4Y0WA 4A61A 1WOQA 2BTFA 3ULEB 3CJBA 2P9LA 4BR0A 3LDNA 4BROA 3UKRB 5FPNA 1P8ZA 3A5MC 1BWFO 2D0OA 3C7NB 5AQNA 1HLUA 4BRHA 4H0XB 4JD2A 3FZHA 2HF4A 4FWPA 4FWMA 1IJJA 2E2QA 4A2AA 3H45C 5JICA 3ENOA 1NGFA 3EKSA 1HUXA 1DEJA 1T6CA 1J6ZA 3O6WA 3VEZA 4AM7A 3L6QA 4M63C 5AQOA 4XEIA 2A42A 1GLBG 2F9TA 4BRPA 3QB0A 3P4IA 3FZFA 1U2VA 1NWKA 4WQ5C 2QM1A 4BRQA 2IIRA 2P9NA 5LJVA 1RGIA 1YVNA 2YHWA 1RDWX 3IDHA 5LY3A 3RSEA 4ISGA 3H46O 2Q2RA 4JNEA 5EOYA 2BUPA 3CJ1A 1GLCG 3BUZB 2V7YA 3D2EA 3CJ9A 3EZWA 4EHTA 4K42A 3L0QA 3WEEB 2P9IA 1X3NA 2HMPA 2OANA 4RCHA 5AQSA 2VWBA 3QFUA 3H3OB 3UB5A 1ESVA 1XC3A 3VGMA 1NGBA 3CERA 5BRDA 5AQQA 3VF4A 4GY2B 3M3ZA 2P9KB 3WT0A 3WXJA 2Q1NA 1V4SA 1BUPA 2A5XA 5AQXA 4HWIA 3SJHA 4FOIA 1NGHA 3D2FB 2E2OA 4IO8A 2ZGYA 4CZIA 1E4FT 3ULEA 2P9UA 3WQUA 1JCEA 1Y64A 4K43A 5E26A 4BC4A 1NGCA 2V52B 4CD3A 2E20A 3UKRA 4GNIA 3MN7A 5AQTA 2ASMA 4E1JA 4FWLA 3C7NA 2QXLA 1NGGA 4H0VB 1TYQB 1MDUB 1ATNA 2GUPA 1X9JA 4CZMA 1NLVA 2W40A 3ZX0A 3LM9A 3J8AA 3DXMB 3FZMA 3FE1A 4ISFA 1GLLO 4H03B 1NM1A 5AZJB 2ITMA 1XUPO 2CGLA 4I6MA 2HF3A 3FGUA 5AQMA 4MO5A 2Q31A 1GLFO 4IWVA 3U9DA 3S41A 3ZEUB 3VEXA 3CQXA 2GWJA 4PL8A 1ATRA 1XQSC 3M1FA 3O5BA 5AQHA 4BRDA 4A2BA 4BRLA 4FOEA 3ZX2A 3U9ZA 5LJWA 2A3ZA 5AQWA 4DHYA 3CQYA 4CZFA 2FF6A 1IG8A 2PAVA 3A5NC 5E84A 1S22A 5BRFA 2J4RA 3U8XA 3JS6A 2EWSA 3LM2A 2WUSA 4WYBA 2H3GX 1YAGA 5CE3A 2QWRA 5AQGA 4H0OA 2ASPA 4B1XB 1NGDA 2I7PA 4B1WB 1CZAN 3VGLA 3SK3A 3WXKA 3FZLA 3VERA 2FSKA 4L3QA 5BN9A 4BRAA 1YXQA 3VGKA 1BDGA 3ZETB 1TUYA 3QFPA 1R59O 4H0TB 3UE5A 3KVGA 2P9PB 3F9MA 4H5WA 5BRHA 3M6GA 3R9PA 4H0YB 5BPMA 1QHAA 1ZBSA 4FWOA 4CBXA 4BVOA 3MDQA 4BRIA 4KBOA 3CHWA 1NGEA 2I7NA 1Z05A 4B1ZA 1HJOA 1GLDG 3D2FA 3FZKA 3UKUA 4BG8A 3IUCA 2F9WA 4BC3A 3CETA 4QS9A 4BR9A 1ZXOA 4XH1A 4BR4A 3WQTA 1NGJA 3CIPA 3QBWA 5KQ8A 4EAHD 5KPZA 4CZKA 3FLCO 4MO4A 1DGKN 3DXKB 2YCHA 2YHYA 4IZ9A 4YDUA 2P9SB 1LCUA 1SQKA 4B1UB 5AFUH 4JHDB 1MA9B 3VF6A 4PKIA 3BEXA 4MLHA 3MN9A 5JLFA 4FL9A 5ADXA 3MN6A 4XH4A 1QQOA 4CZLA 4FWRA 4C23A 1JCFA 1OKJA 5F1XA 1K8KB 4BREA 1H1VA 4AM6A 3EO3A 3O4WA 2AP1A 1SZ2A 3SMPA 4F9OA 3GE1A 3R6MA 5FPDA 1E4GT 3MCPA 4J8FA 4DB3A 4K41A 4JD2B 5EVZA 3AARA 2E8AA 4BGBA 5F2RA 5KPTA 1D4XA 4WQ4A 3VEVA 4ISEA 5AQIA 3H6EA 2Q36A 4BR2A 3L4IA 1T6DA 2V51B 3H1QA 4XH5A 1Q18A 4BG9A 2QW9A 4CBWA 3KZBA 2QWOA 4IXCA 1BG3A 4B9QA 2ZF5O 4H5RA 5FPMA 2E2PA 3HI0A 5AZIB 2P9NB 2W41A 3MN5A 4IJNA 3GBTA 4BRGA 5EY4A 3OHRA 3RSEB 3ENHA 5BREA 2KHOA 4RTFD 2D1KA 4RWTA 1C0GA 3DJCA 3I8BA 2YHXA 4B1YB 3BP8A 3MMVA 4M7XA 2CH6A 4BR5A 5AQUA 2VYPA 4CD1A 2P9PA 3D2EB 3C0BA 5AFUA 4BRKA 2DPNA 4BQLA 4Z94A 3ID8A 2ZWHA 4CZJA 3H1VX 2Q0RA 3EKUA 2QWNA 2GTDA 3KHYA 4PL7A 3ATUA 4FO0A 5AQFA 3A5OC 1QQNA 3GL1A 2VCPA 2P9IB 4FWSA 4DQ8A 2QWQA 4A62A 3O1WA 2YI1A 5BPLA 3VESA 4K25A 1MWKA 3D7EO 1KXPA 4O5FA 2FLOA 1BOTO 3VEOA 3U4LA 3WXLA 1GLEG 3LDOA 4O8KA 3IMXA 2IVOA 2E88A 1GLJO 4QS8A 4EHUA 3VETA 3DXKA 1QZ5A 1WUAA 3BF1A 2D4WA 5ADXH 2P9SA 4EFHA 2CGKA 3WEEA 2E1ZA 4JHDA 1DKGD 3O8MA 4FPBA 2P9UB 4FWNA 3WXIA 4BR7A 5AQPA 3LL3A 1V4TA 3QMLA 3HZ6A 4BC5A 3EL2A 4QS7A 4YDUC 3VPZA 4CBUA 3G25A 4FPAA 3VEYA 1K8KA 3R8EA 2P9KA 2ASOA 2QWLA 3VENA 3HTVA 3O08A 3BF3A 3VF2A 2IVNA 1NGAA 2NRHA 5EX5A 1HKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BDPA 3VQQA 3VQDA 4CZEA 4X65K 2GEMA 5AQLA 5B8HA 4F2RA 3O9SA 4MDBA 4NCAA 4PUOA 2HOEA 2NNWA 4FSVA 3HP6A 2N2RA 3OS1A 2FF3B 2OZMA 4WFNL 2E6MA 3OYLA 4BDZA 3GDQA 3LPUA 4LF8K 4ZHRA 4M7YA 4UAFE 1Q9XA 3OBYA 3B6OA 3B6PA 3EN9A 4DQQA 5AZJA 3OW2M 3OYGA 1IBMK 1WWNA 5AR0A 4EP5A 5I9EB 4O0JA 1VQ7N 1T7EA 1YT3A 2D0PA 3TPQA 4HTLA 4KV8A 1RT6A 2QWPA 4EIAA 4KREA 1BU6O 1S5JA 3QNOA 3KOXA 3CCRN 2NY9X 2NRRA 3LALA 5HBMA 1HKGA 2AA4A 2QEXN 2RF2A 4W5OA 4MQ3A 4H5NA 4CHPA 1ICAA 1RDAA 5TKWA 3S3OA 3VOVA 3HSTB 1TKZA 2I5JA 5DMRA 3PV8A 4XIUA 3I33A 1VSKA 3DAWA 1T44A 2XY7A 3HK2A 1RT3A 5JS2A 1SS6A 3ZETA 3VQ9A 3HPHA 1AYJA 4JN4A 1KAYA 2O8FB 2HHQA 1VSIA 3SLCA 1HYZA 4M41A 5KQDA 3IG1A 1NGIA 2Q97A 4NLCA 4H5TA 4AEIA 2FSNA 1EQYA 5M1FA 5IWAK 4BGAA 4B9MA 1RFQA 2UYTA 1S9GA 1JCGA 1PTXA 4X66K 1SL0A 4NCGA 4JAXA 3C95A 3TAGA 4KHNA 3LDLA 4CQKA 4CF9A 1I6FA 4YFUA 1NBWA 2PBDA 4LF6K 1G99A 1HNZK 3KD5E 1VSDA 1QQMA 1RBUA 1O1WA 1K6YA 3CPWM 4B08A 1S1TA 4KTZA 2HHXA 5FRNA 4EZ6A 4YORA 2BTFA 2E3GA 3BZKA 1TL1A 3UKRB 1P8ZA 3A5MC 3HO1A 1HLUA 5KTQA 4PY5A 4N47A 3AVNA 2HF4A 4FWPA 3P5JA 3AVLA 1EXQA 3S9HA 3VN5A 3ENOA 3EKSA 3SPYA 4E1MA 3E7UX 2JLEA 3KWGA 4M63C 4XEIA 3QB0A 3P4IA 4M3WA 4OVLA 4WQ5C 4ILHA 2E6LA 1YTAA 3TAEA 4KFBA 5C12A 5LY3A 1K73O 2Q2RA 4LSLA 1YJNN 1GLCG 1RTHA 4N5SA 1WMTA 1VNAA 3NH2A 3HP9A 3CJ9A 1M1KO 4C8OA 4K8ZA 3OJSA 4OKEA 2XY6A 3OYNA 3VQAA 2QKKA 5D3GA 2G8KA 1A5XA 4MDAA 3L2WA 3DOKA 3ZT0A 2WTUA 1TV6A 4K0KK 1P00A 4DTOA 1NGBA 3V9ZA 4CJQA 4DSLA 4GKJK 4AH9A 3ID6A 4DTMA 4I9LA 4Y1DA 2Q1NA 4CEFA 5M1PA 1FK9A 4DWIA 1J5EK 1WSFA 2ZGYA 4DR4K 5GAHP 5CZ1A 1GOAA 4GV3A 3K57A 1JCEA 1MR4A 4LFBK 1HR0K 1ZBHA 3NDKA 3LAMA 4GNIA 3UKRA 4DS4A 1BISA 1GPSA 5AQTA 4E1JA 3EE8A 2IAJA 4FWLA 1REVA 5C42A 2KBJA 3CM6A 3AGRA 3ZX0A 3MAQA 4FK2A 2P5OA 3M8RA 3FE1A 3ZSVA 3J80O 2CGLA 3T69A 5E41A 3FGUA 3VQ5A 4MO5A 1GLFO 3C6UA 3ZEUB 2GWJA 1ZYVA 1F21A 5BR8K 5AQHA 4A2BA 1SKRA 3U9ZA 5LJWA 3KK2A 5AQWA 1VNBA 1TI5A 3BGRA 1T05A 3ASMA 5E84A 5BRFA 1I39A 4JEPA 1D8YA 3NGIA 3U8XA 3JS6A 3E7RL 5CY0A 3OS2A 4UY8O 3LM2A 5CE3A 2QWRA 2ASPA 4HCBA 1FW6A 4QOZB 4CJLA 3DM2A 3VQEA 2HHTA 2HSTA 4BRAA 4CFBA 3VGKA 1TUYA 3QFPA 4H0TB 4ILGB 4CW7B 3SPZA 2C1GA 2OPPA 3F9MA 4KTWA 1B92A 3KOWA 5BRHA 1K8AO 3DOLA 2KGQA 4M3UA 3L3UA 2YIOA 4AHSA 1ZBSA 5FLXO 1SN1A 3DLEA 4BRIA 1NGEA 2VWJA 2I7NA 2G8VA 1HJOA 1GLDG 1KD1O 2O8DA 3IUCA 3K5NA 1WBDA 2G8WA 2X6NA 4QS9A 2BANA 3TSUA 4BR9A 4KHYA 4E89A 1LWCA 1XNQK 2KJAA 1NGJA 3K59A 1J9AA 5KQ8A 4CJPA 4EAHD 5KPZA 3FLCO 1RBRA 1IKVA 4XJXA 4Y1CA 3KLIA 1VRTA 1LCUA 3BZCA 4DLEA 2YV0X 1BI4A 4E1NA 3GKUA 4CGJA 4JHDB 3P31A 3KTQA 3V1OA 3G71N 4LFCK 4GV9A 4FJ7A 2NRTA 4X62K 4XH4A 1QQOA 4OX9K 5F1XA 1XRSB 1H1VA 3EO3A 3O4WA 2AP1A 3SMPA 4DSEA 3GE1A 2YX6A 3R6MA 1UA0A 2UXCK 1KFSA 1XWLA 3MCPA 4DB3A 4CK3A 3N4PA 3KKRA 1KVBA 1Z26A 2RHKA 4BGBA 3TABA 4WCEL 1VSLA 4GW6A 4KHSA 3V4IA 4LD0A 5AQIA 1XC9A 1FJGK 4BR2A 4YHHK 2G8IA 3EY1A 1Q18A 1NK4A 5FRMA 4CIGA 1XNRK 5KRTA 2ZF5O 4H5RA 2JDQD 3MXJA 5GAEP 2P9NB 2W41A 3GBTA 1U4BA 2M8BB 3PSIA 1N32K 4FLZA 2D1KA 4ZTFA 4DR1K 1C0GA 3AO3A 1WB9A 1G15A 4B3SK 3I8BA 2HNDA 3NHGA 2C1IA 1LV5A 5LMUK 4AB0A 1EWQA 3ID8A 1JJ2M 2ZWHA 3H1VX 1RBVA 3BDPA 1BCOA 3EKUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BDP A;  3VQQ A;  3VQD A;  4CZE A;  4X65 K;  2GEM A;  5AQL A;  5B8H A;  4F2R A;  3O9S A;  4MDB A;  4NCA A;  4PUO A;  2HOE A;  2NNW A;  4FSV A;  3HP6 A;  2N2R A;  3OS1 A;  2FF3 B;  2OZM A;  4WFN L;  2E6M A;  3OYL A;  4BDZ A;  3GDQ A;  3LPU A;  4LF8 K;  4ZHR A;  4M7Y A;  4UAF E;  1Q9X A;  3OBY A;  3B6O A;  3B6P A;  3EN9 A;  4DQQ A;  5AZJ A;  3OW2 M;  3OYG A;  1IBM K;  1WWN A;  5AR0 A;  4EP5 A;  5I9E B;  4O0J A;  1VQ7 N;  1T7E A;  1YT3 A;  2D0P A;  3TPQ A;  4HTL A;  4KV8 A;  1RT6 A;  2QWP A;  4EIA A;  4KRE A;  1BU6 O;  1S5J A;  3QNO A;  3KOX A;  3CCR N;  2NY9 X;  2NRR A;  3LAL A;  5HBM A;  1HKG A;  2AA4 A;  2QEX N;  2RF2 A;  4W5O A;  4MQ3 A;  4H5N A;  4CHP A;  1ICA A;  1RDA A;  5TKW A;  3S3O A;  3VOV A;  3HST B;  1TKZ A;  2I5J A;  5DMR A;  3PV8 A;  4XIU A;  3I33 A;  1VSK A;  3DAW A;  1T44 A;  2XY7 A;  3HK2 A;  1RT3 A;  5JS2 A;  1SS6 A;  3ZET A;  3VQ9 A;  3HPH A;  1AYJ A;  4JN4 A;  1KAY A;  2O8F B;  2HHQ A;  1VSI A;  3SLC A;  1HYZ A;  4M41 A;  5KQD A;  3IG1 A;  1NGI A;  2Q97 A;  4NLC A;  4H5T A; 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