5AQMA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLFSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqmA04
3H1VX 4BRCA 3W3DA 1Q18A 3CJBA 2CH5A 3M1FA 4CZGA 1ESVA 4WQ4A 4FWMA 2Q1NA 3HSCA 3GDQA 3VOVA 3A8YA 2Q0UA 4ISFA 4JD2A 1BUPA 3VEYA 1BA1A 1NM1A 4MO4A 4C23A 5AQWA 2UYTA 3VPZA 4BRQA 3QFUA 2Q36A 1YVNA 3WEEB 3DXKB 1BWFO 1RFQA 4H0PA 4BRNA 3ZX3A 2Q31A 2PAVA 4QS7A 2I7NA 1QQOA 3FZHA 1ZXOA 2YHXA 3ZEUB 2QWNA 4A61A 2FSKA 5AZJB 3ULEA 2AP1A 4BREA 2E2NA 4CZKA 3AAQA 3LDQA 1HKBA 3M3ZA 4H5TA 2IVNA 3AAPA 4BR9A 3WXLA 3IFRA 1CZAN 4CBUA 3ULEB 4BROA 1GLLO 3GBTA 2E8AA 1TYQA 5TKYA 3EN9A 3L4IA 3WT0A 2ZF5O 1ATRA 1U2VA 4BRFA 2D1KA 5E84A 3BEXA 1JCFA 5AZIB 3VGMA 4K42A 4WQ5C 2GTDA 5AFUH 1S22A 4BR0A 3ENOA 2A42A 1Z05A 1BO5O 1HLUA 3BF1A 2ITMA 3ENHA 2A40A 2ZGZA 4JHDA 3OHRA 1NBWA 3QFPA 3ATUA 4BR7A 1C0GA 4JHDB 1BG3A 2DPNA 4A2AA 3FGUA 3HM8A 2E2QA 2V7YA 3UKUB 4CZHA 2GUPA 5AQXA 4BRGA 4BVOA 3EO3A 2GELA 1TUYA 5E26A 1GLEG 4NB4A 3MN5A 3I33A 1NMDA 5BPLA 1XC3A 2GWJA 2E1ZA 2HF4A 2H3GX 4BGBA 3EZWA 3MK6A 4B9QA 4FPAA 2CH6A 1SQKA 2A5XA 4K25A 3SK3A 4H5NA 1Z6RA 5BRDA 3FZMA 4H5RA 3VF4A 3HZ6A 3ATVA 4H0OA 2D0PA 1BDGA 2CGLA 3G25A 2P9LB 3ZETA 4CJ7A 1MDUB 4FWKA 2V51B 5EOYA 3WUHA 2QWOA 1X3MA 1IG8A 1MA9B 3WXJA 3MN9A 4K43A 3VEXA 1R59O 3A5LC 2QXLA 2F9TA 4XH5A 1H1VA 3U9DA 4H0VB 5JICA 2QWMA 5KQDA 3VEVA 4H0XB 4H0TB 3IUCA 1T6DA 2YJFA 4PKHA 4DB3A 2Q0RA 4FL9A 5AQUA 3LDNA 5LJWA 2FF3B 5LJVA 4EAHD 4BC4A 3DXMA 5BN8A 4Z94A 3VEZA 2IVOA 3FZKA 2P9IA 3MCPA 4BC2A 3HBTA 4HWIA 3A5MC 2F9WA 3H46O 4FWPA 4YDUA 3O8MA 5AQFA 5AQOA 1ATNA 4M7YA 2P9IB 1D4XA 4Y0WA 3A5NC 1C0FA 4EHUA 3D2EA 5AQYA 1MWMA 5CE3A 4LC9B 3KZBA 1NLVA 2ZGYA 3D2EB 3CQXA 4EHTA 5AQKA 5ADXA 4XH4A 4JD2B 1BA0A 4QS9A 3VEWA 3EL2A 4A62A 3QICA 4ISEA 3ID8A 1IJJA 3CJCA 5ELZA 4IJAA 4JNEA 4CD3A 3RSEA 1NGCA 3UKRA 5FPDA 2GWKA 4DQ8A 3SJHA 4FOIA 2BUPA 3FZFA 5EXWA 3RSEB 5AQSA 4FSVA 5FPMA 2P9KA 4JN4A 5AQIA 3SMSA 1QQMA 5AQMA 5AQQA 3O1WA 3R9PA 3C7NA 5AQJA 3J8AA 4CZFA 2V52B 1QZ6A 5KQ8A 1GLBG 3VGKA 3QBXA 5AQTA 4CZMA 3L6QA 1TYQB 2ZWHA 1YXQA 3LM9A 3FLCO 3P4IA 2QWRA 1U2VB 3U4LA 4I6MA 4GNIA 4FWSA 3SMPA 4CI6A 2HF3A 3UB5A 3D2FA 4FWNA 4YDUC 4EIAA 4EFHA 4B1WB 3BUZB 5BRFA 5EX5A 3I8BA 1ATSA 5KPRA 2V7ZA 5BN9A 5AQNA 4BRPA 2QM1A 3R8EA 4CZJA 3MN7A 4K41A 3SLCA 5AQVA 1NGJA 3VENA 1HKCA 5BPNA 5AR0A 3ZX2A 4DHYA 3VETA 2CGJA 3WQTA 4CD1A 4CZLA 3O1BA 3L0QA 3H3NO 5KPTA 5BRHA 2ASPA 2HOEA 4FPBA 2P9NA 1RGIA 3QBWA 4IXCA 4BQZA 2E20A 5ADXH 4DCHA 1ZC6A 5FPNA 3QDKA 2QWLA 3VF2A 2KHOA 4HTLA 4BGAA 1J6ZA 3UE5A 2P9NB 4PKIA 3H6EA 3VERA 1HJOA 1HUXA 2WUSA 1TUUA 3ZETB 2IVPA 2CGKA 3CIPA 3WQUA 4BRLA 1DGKN 2OANA 2IIRA 1X9JA 1NGDA 1NGEA 4FWOA 4MO5A 4H0YB 2P9SA 3D7EO 3M6GA 3AY9A 1Y64A 1WOQA 4O5FA 3B8AX 3O80A 4BVPA 4IJNA 3VEOA 2P9SB 4B1VA 3LDPA 2D0OA 2HMPA 4CBWA 4BG9A 5JLFA 2FF6A 4FWLA 4F9OA 2FXUA 1SZ2A 4FWRA 4BRIA 3TPQA 4BRAA 2Q2RA 2VYPA 3DXMB 2P9UA 1GLAG 3W0LA 3HI0A 5JMVA 3CJ9A 5AQPA 3HTVA 4RCHA 5AQGA 3MN6A 1U6ZA 1NGIA 1NGGA 4AM6A 1X3NA 4BRHA 3FFKB 4KBOA 1P8ZA 2W41A 4BR2A 4BRDA 3KVGA 2VWBA 2NRHA 1KXPA 2YCHA 4BQLA 4B1ZA 2FSJA 1T6CA 3MMVA 4NO7A 3WXKA 5BREA 5B8HA 4FO0A 3GL1A 2NZTA 1V4TA 1ZBSA 2EWSA 4RTFD 1DEJA 3WEEA 3DXKA 2E2PA 3U8XA 5F1XA 3UKRB 2E88A 4BG8A 2BTFA 1NGBA 3FZLA 3U9ZA 1HKGA 5FPEA 4J8FA 4XH1A 3VESA 3ZEUA 1E4GT 3KHYA 2A3ZA 4A2BA 4IWVA 2P9KB 3A5OC 5AZJA 3H45C 4B1XB 4BRKA 3C7NB 1NWKA 2ASOA 3TU5A 1QZ5A 5BR9A 4BR5A 1WUAA 2NLXA 1KAYA 5EVZA 5AQRA 1KAXA 2YI1A 2ASMA 1OKJA 2YHYA 1LCUA 3CERA 2Q97A 3CJ1A 4FOEA 2AA4A 4I6MB 2FSNA 4B1YB 5AZIA 3D2FB 4B1UB 4H5WA 5AQZA 2PBDA 1HX1A 4JAXA 1QHAA 2QWPA 1NGFA 3ZX0A 3CQYA 2A41A 4PL7A 3R6MA 4ISGA 3WXIA 5F0XA 5AQHA 4BRMA 3CJAA 4PL8A 2I7PA 4H03B 3LM2A 4AM7A 5JLHA 1NGHA 2E2OA 2YHWA 3BP8A 1GLJO 4WYBA 3FE1A 1BOTO 1YAGA 4E1JA 2GEMA 3UKUA 4RWTA 4H5VA 1KAZA 3FR0A 4WQ4C 3LL3A 3MDQA 3S41A 4CZIA 2E1YA 1BU6O 4BC3A 1XUPO 4MLHA 3C0BA 3JS6A 3O4WA 4M63C 1MWKA 3EKSA 5LY3A 3CI5A 3DJCA 2D4WA 3VF6A 1S3XA 1GLDG 1GLFO 3GOIA 1RDWX 4FWQA 2P9LA 4CBXA 1EQYA 3CHWA 1HPMA 3AARA 5BPMA 2VCPA 4CZEA 4MLEA 1XQSC 2YJEA 1T44A 3F9MA 2QWQA 4BR4A 1LOTB 3DAWA 4QS8A 5EY4A 2J4RA 3IDHA 4IZ9A 1K8KA 1V4SA 5KPZA 1JCEA 1QQNA 3QB0A 4IO8A 4GY2B 2FLOA 5I9EB 1K8KB 4XEIA 3H1QA 3CJ7A 1JCGA 3EKUA 3GG4A 2A6AA 2P9PA 1GLCG 2QW9A 4L3QA 3IMXA 1SAZA 1DKGD 1YUWA 5AQLA 5AFUA 1E4FT 3O6WA 2P9UB 3LDOA 3A0IX 1NGAA 5F2RA 3LDLA 3QMLA 2P9PB 3JXUA 3VGLA 3BF3A 3CETA 4WQ5A 3GE1A 4O8KA 3O5BA 3DWLA 1G99A 4BC5A 3O08A 3H3OB 4PKGA 2W40A 4M7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HRGA 3TSQA 1MYNA 2MN5A 3C65A 4OPAA 4F3OA 3W3DA 1Q18A 4ID5A 2CH5A 4DV5K 4FM0A 4DFMA 4C8NA 1ESVA 3RTVA 3E7UX 2Q1NA 1JXEA 3BDPA 3OYHA 3A8YA 3HXMA 4IFEA 4JD2A 3VEYA 2G8WA 1JLAA 1KCFA 1WNSA 4BRQA 3QFUA 2Q36A 2OZMA 4YOVA 2OA8A 3I0RA 3DXKB 4H0PA 4BRNA 4DFKA 2VQFK 2YNFA 3LWMA 2O8BB 2HHSA 2I7NA 4DTNA 1WSJA 1QSYA 3FZHA 3KP1A 1GOCA 3IG1A 1SKWA 1VQLN 3G10A 3DLKA 5AZJB 1M1KO 4JI0K 2Z1HA 1BMRA 3AO4A 3WNHA 3AAPA 1Q9YA 1S1UA 2FBTA 1CZAN 4MDAA 1GLLO 3ITHA 4PHTX 3CG7A 5E84A 1T7AA 5CZ2A 1HPZA 3VGMA 2EX3A 2F7TA 4K42A 4WQ5C 1NK9A 5JS1A 1BCGA 4BR0A 4YOXA 3GKUA 3QIPA 5GAHP 3BF1A 1HLUA 1N36K 1VSDA 2VG5A 2ZGZA 3V1QA 4BEBA 3D0PA 1C0GA 1FK9A 4CJ3A 3U3GA 3UKUB 5M1FA 1LWEA 4DU4A 4KRFA 3M8PA 2ATBA 4K8XA 2ZJQL 1TUYA 5E26A 1A5WA 5BPLA 1NJYA 2HB5A 2HF4A 1NMNA 1LQIA 3EZWA 1RDCA 1SQKA 4NCBA 1EWQA 4E89A 5BRDA 1VQKN 3HZ6A 4DV3K 3CPEA 3AGKA 3OYNA 3KD5E 4NCAA 2IC3A 4JI4K 3AVHA 1JLCA 2Z1GA 4NYNA 3AVKA 4HUGA 3J7ZO 2F9TA 1LWCA 3KK2A 3QI7A 4XH5A 4H0VB 2VG6A 4FJMA 4YNQA 1RT1A 2PYJA 3OW2M 2HHUA 1WMTA 2YJFA 3SBGA 4LFBK 2Q0RA 1JLEA 4B9LA 1IKYA 5LJWA 3OS0A 3OY9A 3SQ4A 2JDQD 3PLAA 3D6RA 1FKPA 3MCPA 1ZYWA 2F9WA 3H46O 3ZT1A 1WSFA 5AQFA 3TWHA 4B3SK 4KAZA 4E19A 4ICLA 3OS1A 4KHYA 1HR0K 2O8CA 2LI7A 1BCMA 5ADXA 3SQ1A 3OVNA 4JD2B 3ISNC 4QS9A 4G9ZA 3E9OA 5C42A 1NK7A 3E01A 5I42A 1VQ5N 4Z4CA 3V9XA 3AV9A 4GKJK 4BE0A 3OBYA 1NGCA 3UKRA 4UAEF 3S9HA 5FPDA 2GWKA 2GL1A 3SJHA 4C8MA 3M5RA 4J2DA 4EP5A 2WTUA 1OH5A 4CJ5A 4CHZA 5TKWA 2NRXA 3E1YA 5AQMA 5HRRA 1S6QA 3SQ2A 3O1WA 2QXFA 5DK5A 2LKBA 3WNGA 4CZFA 2MZ0A 1P90A 3C94A 4M3XA 4M3ZA 4CZMA 4CHPA 4KB0A 3L6QA 1KFSA 3T3FA 2P51A 4B9TA 1NKCA 4CGDA 2C1IA 1SKRA 4FZXC 3SMPA 4FJ7A 4CI6A 3G4SN 4FZZA 3UB5A 3B6OA 4YDUC 4EIAA 3V9WA 4B1WB 1YTUA 1WT7A 5EX5A 4OPKA 4IG0A 3KP0A 2E5LK 3JSMA 4Q0BA 1UOCA 2ZD1A 5BN9A 3KKRA 4BDPA 4U7BA 1LAWA 3R8EA 4H4OA 2E0HA 5HRSA 2ETJA 3IAYA 1VRTA 2YNIA 1NGJA 4DHYA 1HKCA 1CZ9A 2CGJA 3WQTA 1RDUA 4E7KA 2KSKA 5BRHA 3S3MA 4NLCA 2BRZA 4FPBA 2P9NA 3OYGA 3IKMA 1IBLK 4DCHA 1ZC6A 1NU0A 5FPNA 4HTLA 4XIUA 1J6ZA 3SV3A 3NDKA 3AA4A 1S72N 1VQPN 4MFBA 1LW0A 1HNZK 3ZCMA 1W2BM 3VERA 3VA0A 3RR7A 4DR2K 5M1NA 4CF0A 3FFIA 3QEVA 2ITGA 1O13A 3TR8A 2WBNA 4LF6K 4M3YA 4CJPA 1NGEA 1CXUA 4FWOA 4OKEA 2OPQA 2LY5A 1HYVA 1KQSM 4DUYK 4UY8O 4IJNA 1BHLA 1LWFA 2P9SB 2HSTA 3LDPA 2KFNA 2P5GA 3CD6N 2FF6A 2KJAA 3DLGA 1ZBFA 2VYPA 5C24A 1GLAG 3T7ZA 4CVNE 1VQMN 1D5AA 4F3TA 4UQGA 4XJXA 3OJUA 5HROA 4DF4A 1RT5A 1IG9A 1S5JA 3ZSZA 3K59A 4HHFA 3G71N 3EEQA 4O55A 1GPTA 1TVRA 4X65K 1YJWN 3OYIA 1EKEA 2W41A 4BR2A 4HCBA 2UUAK 3KVGA 4DTPA 3J80O 2ZE2A 2O8CB 2EHGA 3LANA 4BQLA 2KPYA 4NO7A 3B6PA 3WXKA 3QEWA 5B8HA 4JI2K 4FO0A 3GL1A 1RCHA 3VQCA 3V9SA 5GIPA 3F73A 2ZJRL 3UKRB 4I9QA 1S6PA 2E88A 4RW6A 1LQHA 4YFUA 1NGBA 5JS2A 3U9ZA 5KRTA 1HKGA 3QINA 3MCAB 4XH1A 1HQUA 3CCUN 3F5TA 3ZEUA 3NGYA 2A3ZA 1AYJA 3ZT4A 2NNWA 4B1XB 4BRKA 3THWA 3LAMA 1NWKA 2A1SA 4H4MA 4BR5A 1PTXA 2HBKA 4LH4A 4R79A 5AQRA 1KAXA 1XMOK 4DV1K 2YI1A 1PX9A 3NBPA 3TTCA 4FLWA 3O9SA 1U49A 3CERA 2Q97A 3CJ1A 3OYCA 1ASUA 4KI6A 2DY4A 4OKKA 5AZIA 1X9WA 3HYFA 4O0JA 4JEPA 2FBVA 4YOTA 4IEEA 2C1GA 3ZX0A 2GUIA 4JI1K 2YBRC 2F96A 4G1QA 2XY5A 3WXIA 5CYQA 4CJKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HRG A;  3TSQ A;  1MYN A;  2MN5 A;  3C65 A;  4OPA A;  4F3O A;  3W3D A;  1Q18 A;  4ID5 A;  2CH5 A;  4DV5 K;  4FM0 A;  4DFM A;  4C8N A;  1ESV A;  3RTV A;  3E7U X;  2Q1N A;  1JXE A;  3BDP A;  3OYH A;  3A8Y A;  3HXM A;  4IFE A;  4JD2 A;  3VEY A;  2G8W A;  1JLA A;  1KCF A;  1WNS A;  4BRQ A;  3QFU A;  2Q36 A;  2OZM A;  4YOV A;  2OA8 A;  3I0R A;  3DXK B;  4H0P A;  4BRN A;  4DFK A;  2VQF K;  2YNF A;  3LWM A;  2O8B B;  2HHS A;  2I7N A;  4DTN A;  1WSJ A;  1QSY A;  3FZH A;  3KP1 A;  1GOC A;  3IG1 A;  1SKW A;  1VQL N;  3G10 A;  3DLK A;  5AZJ B;  1M1K O;  4JI0 K;  2Z1H A;  1BMR A;  3AO4 A;  3WNH A;  3AAP A;  1Q9Y A;  1S1U A;  2FBT A;  1CZA N;  4MDA A;  1GLL O;  3ITH A;  4PHT X;  3CG7 A;  5E84 A;  1T7A A;  5CZ2 A;  1HPZ A;  3VGM A;  2EX3 A;  2F7T A;  4K42 A;  4WQ5 C;  1NK9 A;  5JS1 A;  1BCG A;  4BR0 A;  4YOX A;  3GKU A;  3QIP A;  5GAH P;  3BF1 A;  1HLU A;  1N36 K;  1VSD A;  2VG5 A;  2ZGZ A;  3V1Q A;  4BEB A;  3D0P A;  1C0G A;  1FK9 A;  4CJ3 A;  3U3G A;  3UKU B;  5M1F A;  1LWE A;  4DU4 A;  4KRF A;  3M8P A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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