5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
3O6WA 1V4SA 4BVPA 2E2PA 2HOEA 2HF4A 1U2VB 3H1VX 1OKJA 4FWOA 1JCGA 5TKYA 4FWSA 4A61A 5F0XA 2GUPA 4QS9A 4CD3A 3B8AX 1K8KA 4Z94A 5AQWA 5AQHA 3W0LA 2FF3B 4BRHA 4KBOA 2YI1A 3ZEUB 2EWSA 2GEMA 4XH5A 5E84A 2ZWHA 3UE5A 4F9OA 2AP1A 3O80A 4H5RA 5LJWA 4J8FA 3VEYA 3BF3A 4BRKA 1Y64A 2YJEA 4EAHD 2QWQA 3C7NB 3DXMB 2E8AA 2ZGZA 2ZF5O 2Q31A 3AAQA 4BR4A 1C0GA 3MMVA 4A2BA 2CGJA 2VWBA 1C0FA 4MO5A 4XH4A 5FPDA 4FO0A 4B9QA 4CZFA 4XEIA 4HWIA 2J4RA 3O08A 2DPNA 3RSEA 3VPZA 1QZ5A 1KAYA 1T44A 3SMPA 5KPZA 4BRCA 1QQMA 4BRGA 1GLJO 2D0OA 1MWKA 4IJAA 4PKGA 5EXWA 5AQGA 2QWLA 3HI0A 3L6QA 4BC5A 2NZTA 2P9PA 5AZJB 3KHYA 5AZJA 3O4WA 3QBXA 4BR0A 1NGAA 3M6GA 5FPEA 4FWQA 3H1QA 1QQOA 2KHOA 5ELZA 4CZJA 3VETA 5AQOA 4GNIA 4QS8A 2A40A 3VF6A 3BEXA 3FLCO 4BRNA 4BC4A 1XC3A 5BN9A 5EOYA 3VGLA 3OHRA 4WQ4C 4FWKA 4BR7A 3D2FA 2D0PA 1NWKA 4BGAA 3S41A 3WXIA 5AQQA 4A62A 2P9KB 2P9SB 1DKGD 5AQJA 1Q18A 1YAGA 1QQNA 2Q0RA 1RGIA 4A2AA 4BQZA 3MN6A 4LC9B 4EIAA 3CQXA 4JD2A 1ESVA 3P4IA 3AARA 3VF4A 4BRDA 4MO4A 1X9JA 2ASPA 5AFUA 3UKRA 5AQTA 3VGMA 3GG4A 1NLVA 1ATSA 1NGBA 3ATVA 4BRAA 1S3XA 2V51B 3MN9A 4Y0WA 4BR5A 4YDUA 2E2NA 3HTVA 4FWRA 5F2RA 2CH6A 4M7YA 3HBTA 5EVZA 1HKGA 4BREA 3GOIA 2FXUA 1Z6RA 3WEEA 2VYPA 1DGKN 4K41A 4H0OA 4H03B 3DXKA 2P9IB 4JHDA 4WQ5A 3R6MA 2CH5A 1HPMA 3WXLA 4B1XB 3SJHA 1WOQA 4BR9A 4E1JA 2QWMA 3LL3A 3O1WA 2E1YA 3EZWA 5LY3A 3CIPA 5KQDA 4C23A 4AM7A 3UKUA 3D7EO 3JS6A 5AZIA 2V52B 4FOEA 4BROA 5AQXA 4K43A 3FZHA 1MWMA 2P9UA 5I9EB 4H0XB 1MA9B 4BRQA 2GELA 3EO3A 4IO8A 2A5XA 1K8KB 5JMVA 2Q2RA 4H0PA 2PAVA 1T6CA 1ZC6A 3ENOA 4MLHA 1GLCG 1LOTB 5JLHA 4B1ZA 4BC2A 2E88A 3H6EA 3U9ZA 3LDNA 5BRFA 4CZHA 3WUHA 2QXLA 1JCFA 1SAZA 3EN9A 3O8MA 1H1VA 1SZ2A 3U8XA 2GWJA 4WYBA 4BG9A 5BRDA 2W41A 2IVOA 2BUPA 4RCHA 1JCEA 4CI6A 1GLDG 2QWPA 4JNEA 2W40A 1XUPO 3CJ9A 3VEZA 1QHAA 4PKIA 3RSEB 2OANA 2YCHA 1BA1A 3HM8A 3CERA 3EL2A 3IMXA 4BRIA 2WUSA 1NGJA 2QW9A 4B1UB 3D2EA 3SMSA 3CJ7A 3H45C 2D4WA 5BPNA 1BUPA 4FPBA 1BO5O 1GLLO 1ZBSA 4B1VA 4FWNA 3F9MA 3QDKA 4BGBA 1NGEA 2P9PB 3QBWA 4H5TA 5BPMA 3ULEA 1TYQA 2Q97A 4BRLA 1NGDA 1G99A 3ID8A 5BR9A 4EFHA 2NLXA 3R8EA 1NGIA 3UB5A 1KAXA 3EKUA 5AQVA 4DCHA 4I6MA 1GLBG 1E4GT 5AFUH 4GY2B 2P9NA 4WQ4A 1NGFA 2IIRA 3MCPA 2QM1A 3WQTA 1ATRA 4K42A 3CQYA 3D2FB 3FZMA 5F1XA 5AQNA 4JAXA 3R9PA 3G25A 4O5FA 4ISGA 3A5MC 2Q1NA 4FWMA 2YJFA 1Z05A 1LCUA 3A5OC 4JD2B 3SLCA 4HTLA 4RTFD 3VEOA 3BP8A 4ISFA 3UKRB 5AQKA 3BUZB 3A0IX 4BR2A 1U6ZA 1BDGA 2FSNA 3WXJA 2P9LA 4PKHA 1MDUB 1HKCA 1X3NA 3WEEB 4NO7A 2F9WA 3C0BA 3DXKB 1V4TA 4JHDB 2ZGYA 3QB0A 5AR0A 2ASMA 3KZBA 1KXPA 5JICA 4FL9A 4M63C 2FSJA 3J8AA 2FLOA 3LM2A 4FWPA 4CZMA 3UKUB 3ZETA 5AZIB 1BA0A 3IDHA 5AQLA 5KPTA 2P9UB 1GLFO 4BRPA 3VOVA 3H3NO 1RDWX 3I33A 2IVNA 3GE1A 5BPLA 1HX1A 3U9DA 1HLUA 5AQRA 4CZGA 2A42A 2A3ZA 1SQKA 4CJ7A 5EY4A 3I8BA 4B1YB 1YUWA 3DJCA 2AA4A 4WQ5C 4FOIA 3MN7A 2H3GX 1QZ6A 2HMPA 3GBTA 5CE3A 3SK3A 2NRHA 3W3DA 1NMDA 1T6DA 2E20A 1S22A 5AQSA 2UYTA 1X3MA 3AY9A 2BTFA 3AAPA 3O1BA 4MLEA 5E26A 1J6ZA 1U2VA 3MN5A 2E2OA 3CHWA 3CJCA 1BG3A 3WQUA 5ADXA 1IJJA 3MK6A 3M1FA 3FZFA 4PL8A 3MDQA 1HJOA 1GLAG 4H0VB 3ZEUA 2I7NA 1HUXA 1RFQA 4FPAA 3CJAA 3LM9A 4CBUA 3D2EB 3A8YA 1R59O 3VENA 3TU5A 3LDQA 3GL1A 1NM1A 2V7YA 5KQ8A 3C7NA 1YXQA 3DXMA 4EHTA 3ZX3A 1KAZA 2FSKA 2CGLA 2FF6A 3ULEB 1TYQB 5AQFA 4CZEA 3FE1A 3QMLA 2E2QA 4NB4A 1ZXOA 3GDQA 5EX5A 1D4XA 2A41A 4I6MB 4BQLA 4IJNA 4DQ8A 2P9NB 2F9TA 3H3OB 4O8KA 3QFUA 4BVOA 3L0QA 3LDOA 1E4FT 3KVGA 1NGGA 1BOTO 1GLEG 4B1WB 2VCPA 3QFPA 4H5NA 4M7XA 1DEJA 4K25A 5FPMA 3ENHA 4BRMA 3JXUA 4AM6A 3QICA 3LDPA 4CZIA 2CGKA 5AQIA 3DWLA 3VESA 4CBWA 1NBWA 3WXKA 3VF2A 2QWOA 3ATUA 5JLFA 3CJBA 3U4LA 4IZ9A 2QWNA 1P8ZA 4H0YB 5AQPA 3DAWA 4ISEA 4CD1A 5B8HA 5BRHA 5BN8A 3IUCA 4FWLA 4H0TB 2I7PA 3WT0A 2P9LB 1BU6O 5AQYA 4IWVA 3TPQA 4CZLA 4QS7A 3FFKB 3ZX0A 3ZX2A 4DB3A 2P9KA 2P9SA 3H46O 5AQMA 4BC3A 2YHXA 2V7ZA 3VGKA 3BF1A 3O5BA 3HZ6A 4H5WA 1IG8A 1ATNA 3FZLA 3IFRA 4BRFA 4H5VA 3A5LC 4BG8A 4IXCA 3ZETB 5AQZA 3CJ1A 2E1ZA 1NGCA 2PBDA 4DHYA 5AQUA 3VEWA 2Q0UA 4CZKA 4YDUC 3FGUA 3A5NC 3L4IA 1YVNA 5LJVA 4JN4A 3VERA 4RWTA 1EQYA 3FZKA 1BWFO 2A6AA 2YHYA 5ADXH 1NGHA 1CZAN 1TUYA 2YHWA 3CETA 2Q36A 3VEXA 3FR0A 4L3QA 4XH1A 2ITMA 3M3ZA 3LDLA 5KPRA 4FSVA 1HKBA 2P9IA 1XQSC 4CBXA 2GTDA 2GWKA 4PL7A 2QWRA 3CI5A 2HF3A 3VEVA 1TUUA 4EHUA 5FPNA 2D1KA 2IVPA 2ASOA 3HSCA 3EKSA 1WUAA 5BREA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJGA 1V4SA 1IBKK 1MR4A 1VQKN 2HF4A 1OKJA 1JCGA 4A61A 4QS9A 4CFAA 3L3VA 1B3CA 4CE9A 2OTLN 2QEXN 3AO4A 3DI6A 3IRXA 4OPJA 1T7BA 2GEMA 4KHNA 1HQUA 2AP1A 1IV0A 1FKPA 1S1WA 3HJFA 1JLQA 4J8FA 3BF3A 3RWUA 1QTMA 4LF7K 1S9GA 1W9HA 3DXMB 2E8AA 4HUGA 3AAQA 2HBJA 3LWMA 1C0GA 1KVBA 4XIUA 3TSUA 2CGJA 2VWBA 4AILC 4MO5A 2OCEA 3OW2M 3EYZA 1HPZA 2UXDK 4WFBL 3VQEA 3TAFA 4FZYA 2J4RA 3O08A 2Z1JA 1T44A 3J80O 5KPZA 4BRCA 4B3MK 1HYVA 1QQMA 4IJAA 1MWKA 3KP1A 2HNYA 1UA1A 4YY3K 4KH6A 1SKSA 2KSKA 4DR3K 3NVKA 5JS1A 3OYDA 4CJ5A 4YOYA 1C56A 3O4WA 3QBXA 1NGAA 4CESA 1KLMA 4FJNA 1RDAA 5ELZA 4CEZA 1TKXA 3VETA 2A40A 4FM1A 5M1FA 3FLCO 4BRNA 1XC3A 2G8VA 3SAGA 1HNIA 1U4BA 2VGNA 2D0PA 2OTJN 4FLVA 3DRPA 4AHRA 3QEIA 3M8QA 2P9SB 1ZBHA 1Q18A 1L3TA 2QK9A 3QEXA 1RGIA 4A2AA 3SUQA 2G8UA 3VMFB 3MN6A 3M8PA 1ZBLA 1RBVA 2GBZA 4E7JA 2G8FA 2UUAK 3KLFA 3QNOA 1NLVA 1ATSA 4QOZB 1BI4B 2IS3A 4GVEA 2ASCA 5M1OA 3HSTB 4LSNA 3OTOK 5F2RA 3HBTA 4QAGA 3RMCA 5EVZA 5I42A 1HKGA 2LKBA 3KKRA 4KKOA 3WEEA 4H0OA 5HLFA 4H03B 1TK5A 4WQ5A 3WXLA 3RTVA 1NK9A 3E1YA 4BR9A 4E1JA 3NH1A 2UU9K 2QWMA 3EZWA 5LY3A 3CIPA 1YIJN 1WSFA 4GV9A 3THXA 3D7EO 1WWNA 4BE7B 3O3FA 3ISNC 3O9UA 3VQ7A 1YI2N 3P38A 3KJVA 1SL1A 3QO9A 2KBHA 4E0DA 3KLGA 1D9FA 3QI7A 3K57A 2E4LA 1MU2A 3E9LA 1RCHA 1S5JA 4UAEF 1NKCA 2Q2RA 4JI2K 4E7HA 4DSJA 1EXQA 4BC2A 4KPYA 4IEIA 5BRFA 1JCFA 1VSEA 4JK7A 1VSHA 3U8XA 1GOBA 1RTIA 1AHOA 3SAHA 4JKDA 2X74A 2BRZA 1YF5L 1ZBFA 1BCMA 5C10A 3J7ZO 1GPSA 4KB0A 2QWPA 4JNEA 3CJ9A 5HROA 1N36K 1Q7YO 5J1EA 3TABA 2YCHA 4JI0K 1BA1A 3TARA 4K8ZA 4HVJA 2W6LA 1NGJA 4B1UB 3CJ7A 2DY4A 3BY5A 4FPBA 1ZBSA 3AVAA 4WCEL 4BGBA 1NGEA 1IKYA 3QBWA 4OJRA 2KZZA 1NGDA 2G8HA 3VQBA 4EFHA 3P31A 3CCQN 2NLXA 3R8EA 1NGIA 4MDAA 5KTQA 3CFOA 5KRTA 3TANA 1C55A 1XHXA 3MCPA 1T1TA 3VQQA 2PFUA 4DWIA 4AB0A 4Q0BA 4IOCL 2OPPA 5AQNA 4FJIA 4O5FA 2OZSA 1SS6A 3CYMA 3MXMA 1BISA 1KV0A 1NRBA 1Z05A 4UY8O 3A5OC 2D56A 3SLCA 3ID6A 4RTFD 4J2AA 3DMJA 3VEOA 2LJMA 3VA0A 3KK1A 3BP8A 4M3XA 3UKRB 3PIOL 4B9SA 1DLOA 3A0IX 1JXCA 1S1UA 2O8BA 4B08A 3NCIA 1U6ZA 2YKMA 2FSNA 4RW7A 2A1SA 5C2DA 1JZBA 1P90A 3PO4A 5HBMA 3LPTA 4I2QA 2HSTA 3OYCA 3P1GA 2OZMA 2F9WA 2BDPA 4FLZA 4JI4K 4CVNE 4CJPA 1V4TA 4CEBA 5AR0A 4LF8K 2ASMA 5JICA 4FL9A 3J8AA 2FLOA 3MCAB 1NK8A 3UKUB 3ZETA 1WSEA 1TK0A 4Z4GA 1BA0A 5FROA 1QSLA 1T0ZA 3OYFA 4JKHA 4CEDA 4KH5A 4BRPA 3HYFA 3CCEN 1NPIA 2NRRA 1U45A 2G2KA 1WBDA 4OPAA 3C6HA 4CZGA 1LWFA 2O4IA 1SQKA 4FW2A 4CJ7A 1BIZA 3OY9A 4FLTA 3O3GA 3I8BA 3V9UA 1VQNN 1YUWA 1KVCA 2LI7A 4CQKA 3MN7A 1QZ6A 4JLHA 3GBTA 2C1IA 4CGFA 4FJKA 4GKJK 3LALA 4OLAA 2UYTA 1X3MA 4UAFE 1I3AA 3AAPA 1YTAA 1VSKA 1U2VA 4DV5K 2WONA 3MN5A 5J2QA 3CHWA 3G6EN 1HNZK 2ATQA 5GIPA 1WSHA 4HCCA 3QNNA 1OH8A 4CEQA 4JK8A 3F2KA 1RT4A 3MDQA 1ZVGA 4OPKA 4DV3K 1L5UA 3CC2N 1RBSA 4Z4HA 1K8BA 1HUXA 5K14A 4E89A 1RFQA 4FPAA 4KRFA 3L3UA 3VENA 1XI1A 1JLCA 4G9ZA 3R2VA 3AA4A 3WNHA 1YXQA 1JXEA 2CGLA 2C1GA 2HHQA 5AQFA 4E19A 2P5OA 4FLXA 4C8LA 4YOWA 3G0ZA 3CPEA 4H4OA 4NB4A 2O8DB 1CLQA 2WBNA 3NVMA 1ZXOA 4BQLA 1D4XA 3MEGA 3CCSN 4IJNA 4JS5A 2F9TA 4CEEA 1RBRA 4N76A 3H3OB 4CJEA 3QERA 3HL8A 1NGGA 1BOTO 1CZ9A 1GLEG 3SPYA 2VCPA 4M7XA 3SBTA 5FPMA 3LDSA 4BWMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3O6W A;  1V4S A;  4BVP A;  2E2P A;  2HOE A;  2HF4 A;  1U2V B;  3H1V X;  1OKJ A;  4FWO A;  1JCG A;  5TKY A;  4FWS A;  4A61 A;  5F0X A;  2GUP A;  4QS9 A;  4CD3 A;  3B8A X;  1K8K A;  4Z94 A;  5AQW A;  5AQH A;  3W0L A;  2FF3 B;  4BRH A;  4KBO A;  2YI1 A;  3ZEU B;  2EWS A;  2GEM A;  4XH5 A;  5E84 A;  2ZWH A;  3UE5 A;  4F9O A;  2AP1 A;  3O80 A;  4H5R A;  5LJW A;  4J8F A;  3VEY A;  3BF3 A;  4BRK A;  1Y64 A;  2YJE A;  4EAH D;  2QWQ A;  3C7N B;  3DXM B;  2E8A A;  2ZGZ A;  2ZF5 O;  2Q31 A;  3AAQ A;  4BR4 A;  1C0G A;  3MMV A;  4A2B A;  2CGJ A;  2VWB A;  1C0F A;  4MO5 A;  4XH4 A;  5FPD A;  4FO0 A;  4B9Q A;  4CZF A;  4XEI A;  4HWI A;  2J4R A;  3O08 A;  2DPN A;  3RSE A;  3VPZ A;  1QZ5 A;  1KAY A;  1T44 A;  3SMP A;  5KPZ A;  4BRC A;  1QQM A;  4BRG A;  1GLJ O;  2D0O A;  1MWK A;  4IJA A;  4PKG A;  5EXW A;  5AQG A;  2QWL A;  3HI0 A;  3L6Q A;  4BC5 A;  2NZT A;  2P9P A;  5AZJ B;  3KHY A;  5AZJ A;  3O4W A;  3QBX A;  4BR0 A;  1NGA A;  3M6G A;  5FPE A;  4FWQ A;  3H1Q A;  1QQO A;  2KHO A;  5ELZ A;  4CZJ A;  3VET A; 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 4FJG A;  1V4S A;  1IBK K;  1MR4 A;  1VQK N;  2HF4 A;  1OKJ A;  1JCG A;  4A61 A;  4QS9 A;  4CFA A;  3L3V A;  1B3C A;  4CE9 A;  2OTL N;  2QEX N;  3AO4 A;  3DI6 A;  3IRX A;  4OPJ A;  1T7B A;  2GEM A;  4KHN A;  1HQU A;  2AP1 A;  1IV0 A;  1FKP A;  1S1W A;  3HJF A;  1JLQ A;  4J8F A;  3BF3 A;  3RWU A;  1QTM A;  4LF7 K;  1S9G A;  1W9H A;  3DXM B;  2E8A A;  4HUG A;  3AAQ A;  2HBJ A;  3LWM A;  1C0G A;  1KVB A;  4XIU A;  3TSU A;  2CGJ A;  2VWB A;  4AIL C;  4MO5 A;  2OCE A;  3OW2 M;  3EYZ A;  1HPZ A;  2UXD K;  4WFB L;  3VQE A;  3TAF A;  4FZY A;  2J4R A;  3O08 A;  2Z1J A;  1T44 A;  3J80 O;  5KPZ A;  4BRC A;  4B3M K;  1HYV A;  1QQM A;  4IJA A;  1MWK A;  3KP1 A;  2HNY A;  1UA1 A;  4YY3 K;  4KH6 A;  1SKS A;  2KSK A;  4DR3 K;  3NVK A;  5JS1 A;  3OYD A;  4CJ5 A;  4YOY A;  1C56 A;  3O4W A;  3QBX A;  1NGA A;  4CES A;  1KLM A;  4FJN A;  1RDA A;  5ELZ A;  4CEZ A;  1TKX A;  3VET A;  2A40 A;  4FM1 A;  5M1F A;  3FLC O;  4BRN A;  1XC3 A;  2G8V A;  3SAG A;  1HNI A;  1U4B A;  2VGN A;  2D0P A;  2OTJ N;  4FLV A;  3DRP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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