5AQPA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqpA04
1GLAG 2CGLA 1MDUB 3O4WA 4BR7A 3VEXA 5AQSA 3FZHA 4M7YA 4JAXA 4E1JA 1DKGD 2YI1A 1YUWA 4BRIA 3MCPA 2GUPA 5KPZA 3MK6A 2W41A 2DPNA 3JXUA 3UKUA 4EFHA 5AQLA 3QICA 2D1KA 5BRDA 5JLFA 4CZFA 5AQRA 4A2AA 2FF6A 2E2PA 4FWLA 1Z05A 5JLHA 3H3OB 4K43A 4HWIA 3S41A 1TYQB 4JNEA 2YCHA 4B1VA 4BRMA 1U6ZA 1YXQA 1ATRA 1NGCA 1U2VA 2A6AA 3ZX0A 4FPAA 3CJCA 4JD2B 4WQ4C 3VPZA 2ASMA 5LJVA 4K41A 3VETA 5KPRA 3H45C 2H3GX 3O8MA 2P9NA 2VCPA 1JCGA 2IVPA 2GWKA 3ULEB 4EAHD 1QZ5A 4FPBA 4RCHA 3VF6A 1MA9B 4BGBA 2PAVA 3ZETA 2ZGZA 3L4IA 4IJNA 1HJOA 4BR5A 2P9KA 3VGLA 1R59O 2IIRA 5AFUH 1HX1A 3FZKA 2E1ZA 3BUZB 4BGAA 5BPLA 1NBWA 3WQTA 2P9LB 4ISEA 3KZBA 5AQVA 5AQNA 3D2FA 2A40A 1DEJA 3DXKB 3WXJA 4IO8A 1BA1A 2QWNA 1XC3A 3L0QA 2Q36A 3U9ZA 3CQXA 1BG3A 2I7PA 2ASPA 2E2OA 4M7XA 5FPDA 4IJAA 3RSEA 3WEEA 3O1WA 4PKHA 3CJ7A 3H3NO 4BRCA 2YHWA 3AAPA 2QWPA 3UKRA 1BO5O 2A5XA 1KXPA 4WQ5A 5ADXA 5KQ8A 5AQGA 5EY4A 3CJAA 1C0GA 4A62A 1EQYA 4BRAA 3VOVA 3CHWA 3IMXA 4FSVA 2QW9A 4HTLA 3C7NA 3D7EO 1X9JA 4BRDA 1T6CA 2FSNA 2GEMA 1QZ6A 2P9SB 1H1VA 3A5NC 3G25A 2A41A 5AQIA 4H0VB 4PKGA 3O80A 2E2NA 3H6EA 1J6ZA 3EO3A 3MDQA 3QBXA 1MWKA 3VEOA 4GNIA 1WUAA 4BR2A 3GOIA 3O1BA 2P9PB 5AZIA 4IXCA 2GWJA 4CBUA 2CGKA 4A2BA 4FWOA 2E20A 5F2RA 3ATVA 4H5WA 5BREA 4K42A 1D4XA 1TUUA 3GG4A 4H03B 4CD1A 1HKGA 2YJEA 4PL8A 3VENA 3WQUA 4M63C 1RFQA 4DCHA 1OKJA 4I6MB 4CZKA 3DAWA 2BUPA 3VF4A 2ASOA 2UYTA 1WOQA 3CI5A 3WXLA 3C0BA 3J8AA 2P9UB 3ZX3A 5AQPA 3HZ6A 4BRQA 4BRHA 1QQOA 5ELZA 3ZEUB 4BG9A 3O6WA 4WQ4A 3EKUA 5F1XA 1T44A 1HUXA 4BQLA 1NGGA 1TYQA 3UE5A 4LC9B 5EXWA 4JD2A 3ENHA 4FL9A 4BG8A 5AR0A 3IDHA 3CJ9A 1E4GT 4QS8A 3R6MA 3R9PA 3LDQA 1JCFA 4BRLA 5BN9A 1GLDG 2W40A 1C0FA 1NGIA 3ULEA 3HBTA 3FFKB 3FE1A 1ESVA 2Q97A 3O08A 1NGHA 2HMPA 4ISGA 3UKUB 2F9TA 2Q31A 1ZC6A 5BR9A 3MN5A 5E84A 2V7ZA 4BVPA 1G99A 2E88A 3QMLA 2P9LA 2ITMA 4FOIA 4H5TA 4CZJA 3DXKA 1ATSA 5AQXA 2CGJA 5AQHA 3H46O 4BROA 2A42A 2FXUA 4DB3A 1RDWX 5CE3A 3CJ1A 3SJHA 3GBTA 4QS9A 4B1XB 4NO7A 2V7YA 4CZEA 3AARA 1QHAA 2FSKA 4ISFA 4MLHA 3HTVA 1RGIA 4FWKA 3DXMB 1NM1A 2ZF5O 2QWQA 2Q0UA 2P9KB 3DWLA 4O5FA 4BC3A 1IG8A 3A0IX 3M1FA 3GL1A 4MLEA 5JICA 5BPNA 2CH6A 4MO5A 5AQMA 1LCUA 1XQSC 3VERA 3GDQA 3AAQA 1NWKA 2YJFA 4PKIA 4AM6A 3SK3A 4H0OA 1TUYA 5LY3A 2GELA 3UB5A 2OANA 4BR0A 3H1QA 3H1VX 2FLOA 3ATUA 2P9SA 3DJCA 2E8AA 1S3XA 3W3DA 5AZJA 4EIAA 1BOTO 2ZGYA 4FOEA 1GLJO 2PBDA 4RWTA 1BUPA 1HKBA 2EWSA 3LDPA 2QWMA 1K8KB 3R8EA 4IWVA 4CBXA 4CZHA 5FPMA 1GLCG 1KAZA 3BF3A 3CETA 1ZXOA 1GLFO 3ZX2A 1SAZA 3A5OC 4CBWA 3W0LA 1LOTB 2P9IB 3F9MA 1ATNA 1KAYA 1NGJA 4H5NA 3MN6A 2IVOA 4AM7A 1XUPO 5AQJA 4RTFD 5AQZA 4FWSA 4I6MA 5AQTA 4DHYA 2D0PA 4BRNA 3A5LC 3FR0A 5AQQA 3D2EB 1Q18A 5AFUA 4B1YB 2Q0RA 1MWMA 3OHRA 2NZTA 4BQZA 1T6DA 2I7NA 4BREA 2P9UA 3QB0A 1NGAA 3FZFA 1JCEA 3WXIA 4BC4A 3ZEUA 4BVOA 4BC5A 2Q2RA 4YDUC 1HLUA 4C23A 4L3QA 5AZIB 4JHDB 4K25A 4H5VA 4FWNA 5FPEA 1QQNA 1Y64A 4BRGA 2J4RA 1V4TA 3JS6A 3VGMA 3QDKA 4Z94A 3M3ZA 4IZ9A 4JN4A 3O5BA 3A8YA 3VEWA 5BN8A 2CH5A 3CERA 3WT0A 5ADXH 3VEVA 1YAGA 4FWRA 3BEXA 1X3NA 1X3MA 4MO4A 4XEIA 3LM2A 5BRHA 1IJJA 5KQDA 2A3ZA 4XH5A 3FGUA 2E1YA 1NLVA 4B1ZA 3HSCA 4FO0A 4B1WB 3L6QA 5BRFA 4H0YB 3KHYA 5EVZA 3VEYA 4CZIA 3LDNA 1GLLO 4O8KA 3P4IA 2GTDA 1NGBA 4F9OA 2QXLA 4BR9A 4BRKA 4CZMA 3MMVA 4BRPA 4B9QA 4A61A 2NRHA 1NGFA 3QFUA 4EHTA 3TU5A 1GLEG 3I33A 1U2VB 1GLBG 2BTFA 3FLCO 5FPNA 1SQKA 3WUHA 3MN9A 4GY2B 4CZLA 3FZLA 2YHXA 4J8FA 3U9DA 5AQUA 2IVNA 3BF1A 2P9NB 3DXMA 2WUSA 2AA4A 3CJBA 2D0OA 5B8HA 1KAXA 3AY9A 3ZETB 3U4LA 5AQOA 4KBOA 2D4WA 3ID8A 4NB4A 3HI0A 1BWFO 3QBWA 4CI6A 3VEZA 2ZWHA 2KHOA 5LJWA 5EX5A 3CQYA 1ZBSA 2VWBA 2E2QA 5TKYA 5AQKA 2VYPA 3D2FB 3I8BA 1SZ2A 2HOEA 4FWQA 3U8XA 1BU6O 2V51B 1S22A 5JMVA 1BDGA 3RSEB 1V4SA 1QQMA 4QS7A 3WEEB 2F9WA 3KVGA 3CIPA 4CZGA 5AQFA 1K8KA 1DGKN 4BC2A 2QWOA 4H0TB 3UKRB 1NGEA 4PL7A 2QM1A 4B1UB 2P9PA 2P9IA 4Y0WA 5AQWA 5AQYA 3MN7A 5E26A 3SLCA 3EKSA 4BR4A 3LDOA 2FSJA 3LDLA 3M6GA 3SMSA 4H0PA 3ENOA 4BRFA 3LL3A 2QWLA 2V52B 3EL2A 4WQ5C 3VF2A 4FWPA 3WXKA 3QFPA 3GE1A 3HM8A 5EOYA 5F0XA 3TPQA 3IFRA 5BPMA 3C7NB 5KPTA 3A5MC 1BA0A 3D2EA 3FZMA 4WYBA 2HF4A 4YDUA 3IUCA 2Q1NA 5AZJB 1HKCA 4FWMA 5I9EB 3LM9A 2FF3B 4CD3A 1NMDA 1HPMA 4XH1A 2HF3A 3B8AX 1Z6RA 4H0XB 3EZWA 4H5RA 3VGKA 4JHDA 1P8ZA 3BP8A 4CJ7A 2NLXA 2AP1A 2YHYA 1E4FT 1NGDA 2QWRA 3EN9A 1YVNA 3SMPA 4DQ8A 4EHUA 4XH4A 3VESA 1CZAN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TR8A 2CGLA 2FBTA 5KRSA 3VEXA 5AQSA 2LJ7A 3KLGA 1XMQK 3FZHA 2VQFK 3T69A 3OW2M 3ZSVA 3MCPA 2NRWA 1WSEA 4KHSA 3I56N 2W41A 1NK5A 4LFAK 4DS4A 3CG7A 4CF9A 2IDOA 1VSLA 2KKZA 2FF6A 1TAQA 2E2PA 1FKPA 2O8DA 3VA3A 1WLJA 4FW1A 4JNEA 4DU1A 2YCHA 4B1VA 1SN1A 3J7YP 1U45A 1WSHA 3E01A 1N33K 3CJCA 4JD2B 4FVUA 1ILYA 1XWLA 2QKBA 2LSNA 1YF5L 1XHXA 3EE8A 1M90O 5GINA 1MA9B 5FLXO 4BACA 1T7BA 1UAXA 4YORA 1XNRK 2P9KA 5EU7A 3VGLA 5AFUH 5DMRA 1LQIA 2E1ZA 4CF1A 2PZSA 3WQTA 2P9LB 3E1YA 4FLXA 2PY5A 1ASVA 3T19A 1DEJA 2D0BA 2QWNA 3L0QA 4Z4FA 3TABA 1BG3A 2ASPA 3RSEA 3WEEA 1NJIO 3O1WA 1NPIA 4PKHA 3CJ7A 1GPTA 1T1TA 3OY9A 1TKDA 3LPUA 2A5XA 3KJVA 3PIPL 1RT3A 3AO1A 1RDCA 4CGFA 3RVCA 4O0JA 3DOKA 1T0ZA 1JLAA 3SV3A 3CHWA 3NVKA 3PUFA 1LAWA 2NRTA 3PSFA 1NNEA 1ZUTA 2QW9A 2E0HA 1RBVA 1Q86O 4OKEA 4JKDA 3J81O 4BRDA 3PX0A 4G1QA 3T1YK 3OYLA 4Z0UA 4H0VB 1FK9A 3A5NC 4BWJA 4PKGA 2O8FA 3NF9A 2AJQA 2OA8A 1J6ZA 3EO3A 3QBXA 4B9UA 5DM7L 4ID1A 1UGLA 4GNIA 4BR2A 1VSJA 1NRAA 3O1BA 2P9PB 5AZIA 3C94A 3OYKA 1B92A 2GWJA 4CGGA 3L2WA 3L2QA 1VSIA 1GOCA 3C6UA 3ATVA 4AHCA 5BREA 4AILC 3KLIA 5M1QA 1J54A 4DFKA 4PL8A 4YOTA 3KKRA 2UU9K 4M3ZA 4DCHA 4OKKA 3L3VA 3HSTB 4KTWA 1WB9A 3KTQA 3DAWA 2HBJA 1VQ8N 3OA9A 3KOWA 2F7TA 2QI2A 3SAHA 2P9UB 1YJWN 5AQPA 3F73A 1KD1O 1VQ6N 4BRHA 1ZVGA 3AVLA 5ELZA 4BG9A 1QSSA 2O8EA 3O6WA 3EKUA 4C8OA 1HUXA 1VQPN 5EXWA 4V19S 4JKFA 3V81A 2D56A 4I2QA 5AR0A 3E66A 3R9PA 1JCFA 3G10A 5BN9A 4JI7K 3TSUA 3AA4A 1OH8A 1T05A 5MLCQ 3FFKB 1POIA 3G71N 2UUBK 4YOXA 4DTRA 2O8BB 5BR9A 2P1JA 3OS0A 5J2MA 4BVPA 4CJUA 3AVIA 2E88A 3SUOA 1HNXK 3SPYA 4M3TA 5AQXA 1KLNA 5AQHA 4DB3A 2A42A 4CIEA 5CE3A 1R0AA 3SJHA 4Z4CA 3NGIA 4CEEA 1DJTA 3AO3A 3AVMA 1QHAA 2RPIA 4B3SK 3AVHA 4CHOA 3VQDA 3DXMB 2PYLA 1S9GA 3PSIA 4CJTA 1IG8A 3A0IX 1W97L 3M1FA 3LWLA 3GL1A 4MO5A 2O8CA 5AQMA 5K14A 3O4QA 2QTDA 2GELA 4CGDA 4W5OA 1YJ9N 2P9SA 3C6HA 3TARA 3DJCA 2E8AA 4DMNA 1S3XA 1I39A 1BOTO 1SKRA 1B9DA 1RT5A 2ZGYA 1B9FA 1N36K 1ZBLA 4FOEA 3BZKA 4KPYA 3AVAA 1RTJA 1GLCG 3BF3A 4CFDA 2KBJA 1GLFO 4DS5A 1KAYA 3LZJA 1XMOK 1Q8IA 1X9SA 3C6TA 2BANA 5JS1A 4RTFD 2YNIA 5AQQA 1Q18A 3OHRA 1GOAA 2NZTA 4BQZA 3ITHA 3SQ0A 3QEWA 5FROA 4BDZA 3SQ2A 3PY8A 1NGAA 1N32K 1JCEA 3R2VA 3WXIA 2E5LK 5CZ2A 3ZEUA 2E3FA 4NXMK 4BVOA 1NK4A 2Z1HA 3GKUA 4L3QA 3LALA 1E3MA 3UIQA 2HNDA 3OTOK 1JLEA 3OS1A 1Y64A 4BRGA 2F4VK 1JL2A 1JLFA 2QK9A 1V4TA 1JKZA 1K8AO 2HVHA 4GV6A 2OCEA 4Z94A 3M3ZA 4B8AB 4XIUA 4CJKA 4AHVA 3A8YA 3ZCMA 4JI0K 1NRBA 4DFJA 4CGHA 1RTHA 4CERA 1N34K 3BEXA 1JXEA 1X3NA 5HRRA 4FLVA 3DLEA 3LM2A 4BEBA 4B3TK 4JKCA 3A2FA 5BRHA 3J7ZO 4H8KA 3QEVA 3KHWA 2YHAA 2A3ZA 4XH5A 5JVGL 2LKBA 2E1YA 5IWAK 3RWUA 4FO0A 3NGZA 4N5SA 1JLQA 3VEYA 4CZIA 4F2RA 3LPTA 1KTQA 3THWA 3SUNA 1O13A 1NGBA 3E7UX 4BRKA 3JSMA 1VQKN 4M42A 3SAFA 3ZT1A 2NY8X 1VQON 1HNWK 4EHTA 4UAFE 3C65A 4HE7A 3NVMA 3HOSA 1HQUA 3HVTA 3AVCA 4I9LA 4LF6K 3MN9A 4OGEA 2VGNA 4FJJA 1NE5A 3BF1A 3IG1A 2AA4A 2GX9A 3CJBA 3PX4A 4CJWA 3QEPA 1TKTA 2D0OA 3KOYA 4FJLA 3WNGA 2N2QA 1L3TA 5H1SQ 3PLAA 1U49A 1HJRA 4X66K 1D5AA 2D4WA 1RBSA 2G2KA 3HI0A 3VEZA 4F4KA 1P0AA 3VQEA 4CEQA 1CN2A 4CIGA 1ITGA 4BE2A 2Z1JA 4GW6A 3D2FB 2OZMA 1SZ2A 4FWQA 1LV5A 1YI2N 1ZBHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2KHO A;  5LJW A;  5EX5 A;  3CQY A;  1ZBS A;  2VWB A;  2E2Q A;  5TKY A;  5AQK A;  2VYP A;  3D2F B;  3I8B A;  1SZ2 A;  2HOE A;  4FWQ A;  3U8X A;  1BU6 O;  2V51 B;  1S22 A;  5JMV A;  1BDG A;  3RSE B;  1V4S A;  1QQM A;  4QS7 A;  3WEE B;  2F9W A;  3KVG A;  3CIP A;  4CZG A;  5AQF A;  1K8K A;  1DGK N;  4BC2 A;  2QWO A;  4H0T B;  3UKR B;  1NGE A;  4PL7 A;  2QM1 A;  4B1U B;  2P9P A;  2P9I A;  4Y0W A;  5AQW A;  5AQY A;  3MN7 A;  5E26 A;  3SLC A;  3EKS A;  4BR4 A;  3LDO A;  2FSJ A;  3LDL A;  3M6G A;  3SMS A;  4H0P A;  3ENO A;  4BRF A;  3LL3 A;  2QWL A;  2V52 B;  3EL2 A;  4WQ5 C;  3VF2 A;  4FWP A;  3WXK A;  3QFP A;  3GE1 A;  3HM8 A;  5EOY A;  5F0X A;  3TPQ A;  3IFR A;  5BPM A;  3C7N B;  5KPT A;  3A5M C;  1BA0 A;  3D2E A;  3FZM A;  4WYB A;  2HF4 A;  4YDU A;  3IUC A;  2Q1N A;  5AZJ B;  1HKC A;  4FWM A;  5I9E B;  3LM9 A;  2FF3 B;  4CD3 A;  1NMD A;  1HPM A;  4XH1 A;  2HF3 A;  3B8A X;  1Z6R A;  4H0X B;  3EZW A;  4H5R A;  3VGK A;  4JHD A;  1P8Z A;  3BP8 A;  4CJ7 A;  2NLX A;  2AP1 A;  2YHY A;  1E4F T;  1NGD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TR8 A;  2CGL A;  2FBT A;  5KRS A;  3VEX A;  5AQS A;  2LJ7 A;  3KLG A;  1XMQ K;  3FZH A;  2VQF K;  3T69 A;  3OW2 M;  3ZSV A;  3MCP A;  2NRW A;  1WSE A;  4KHS A;  3I56 N;  2W41 A;  1NK5 A;  4LFA K;  4DS4 A;  3CG7 A;  4CF9 A;  2IDO A;  1VSL A;  2KKZ A;  2FF6 A;  1TAQ A;  2E2P A;  1FKP A;  2O8D A;  3VA3 A;  1WLJ A;  4FW1 A;  4JNE A;  4DU1 A;  2YCH A;  4B1V A;  1SN1 A;  3J7Y P;  1U45 A;  1WSH A;  3E01 A;  1N33 K;  3CJC A;  4JD2 B;  4FVU A;  1ILY A;  1XWL A;  2QKB A;  2LSN A;  1YF5 L;  1XHX A;  3EE8 A;  1M90 O;  5GIN A;  1MA9 B;  5FLX O;  4BAC A;  1T7B A;  1UAX A;  4YOR A;  1XNR K;  2P9K A;  5EU7 A;  3VGL A;  5AFU H;  5DMR A;  1LQI A;  2E1Z A;  4CF1 A;  2PZS A;  3WQT A;  2P9L B;  3E1Y A;  4FLX A;  2PY5 A;  1ASV A;  3T19 A;  1DEJ A;  2D0B A;  2QWN A;  3L0Q A;  4Z4F A;  3TAB A;  1BG3 A;  2ASP A;  3RSE A;  3WEE A;  1NJI O;  3O1W A;  1NPI A;  4PKH A;  3CJ7 A;  1GPT A;  1T1T A;  3OY9 A;  1TKD A;  3LPU A;  2A5X A;  3KJV A;  3PIP L;  1RT3 A;  3AO1 A;  1RDC A;  4CGF A;  3RVC A;  4O0J A;  3DOK A;  1T0Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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