5AQRA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqrA04
3M1FA 3ULEA 2P9UA 3A8YA 3WQTA 1KAZA 4BVPA 2QXLA 4I6MB 2YI1A 1WUAA 2BTFA 3QFPA 4FWPA 2GUPA 2KHOA 3TU5A 3RSEB 5EXWA 2CH6A 4PL8A 3O1BA 3LM2A 2D0OA 1RGIA 3MK6A 5AZIB 1NGFA 3HZ6A 5LY3A 1NBWA 3ATUA 2P9LB 4MO5A 5JLHA 3U8XA 2Q1NA 2QWQA 2P9PA 5AQLA 2E2QA 4JHDB 1NGCA 4Y0WA 2NRHA 3ZEUB 3U4LA 4GY2B 3MN9A 4H0XB 3VGLA 1LCUA 1GLLO 5AQMA 1TYQA 1NGDA 5FPDA 5CE3A 1OKJA 4YDUC 1QQOA 4JD2A 3VENA 1MWKA 4BRCA 1HPMA 4FO0A 4IZ9A 3ULEB 2DPNA 2P9UB 2EWSA 5JLFA 1SQKA 3QICA 1QQNA 4ISEA 5AR0A 4FWLA 2Q0UA 1BOTO 2VYPA 2CGLA 1K8KA 3QMLA 4MO4A 4H0VB 5AQRA 2WUSA 1NGEA 4B1YB 2A40A 5AZJA 4BG8A 3AARA 3U9DA 4BGBA 3DXKA 3MN6A 5AQUA 5F1XA 3GOIA 2QWPA 2Q2RA 4M7YA 3W0LA 1SAZA 1J6ZA 4EFHA 1U2VB 3MN5A 1HJOA 1HX1A 3FR0A 5I9EB 2IVNA 2FLOA 1U6ZA 1YAGA 4EHTA 3WXKA 3AY9A 1QZ5A 1TYQB 3GDQA 2ZGYA 3ENOA 3SMPA 3CHWA 4CD3A 1GLCG 4JD2B 1NGBA 2GWKA 4A2AA 3R8EA 4ISGA 4JAXA 1IG8A 2CGKA 4FWRA 2E2PA 1NMDA 3VGMA 3R6MA 3MMVA 4BR5A 4BRFA 3L0QA 1ATSA 4BC5A 1K8KB 1Y64A 2PBDA 4AM7A 3WXLA 1KAYA 5AZJB 2FSJA 4B1UB 2IVPA 3EO3A 3VEWA 3EZWA 1BU6O 3LDPA 3DXKB 3HI0A 3JS6A 2FXUA 3MDQA 1Z05A 3GE1A 5JICA 4FPAA 2V52B 3H45C 2P9KA 4B1ZA 4J8FA 4DCHA 3OHRA 3FFKB 3CJ7A 3EKUA 1DEJA 4H5TA 3O4WA 3AAPA 2CGJA 3ZX0A 3VESA 3U9ZA 5EY4A 2J4RA 1ZXOA 1JCFA 2ASPA 3WT0A 4WQ4C 3QBXA 5BN8A 3O6WA 4K42A 4PKIA 3GL1A 5BPMA 3A5NC 2E20A 3H1QA 3R9PA 2FSNA 4FWNA 2P9IB 1JCEA 4BRQA 1V4TA 3UB5A 2UYTA 3HSCA 2E8AA 2HF4A 2VCPA 2QWNA 2W41A 4CI6A 4BREA 3BEXA 4A61A 1ZC6A 5BPLA 4CBWA 4NB4A 1GLEG 1BDGA 1ESVA 4FWMA 1XUPO 5E84A 1LOTB 4IXCA 4K43A 1NLVA 4IJNA 3VF4A 4YDUA 4FSVA 4AM6A 3S41A 4GNIA 3H3NO 1YUWA 5FPNA 4H5RA 2QWRA 5AQSA 1T44A 3MN7A 3W3DA 1DKGD 4CBUA 4PKHA 4IO8A 1RDWX 3QDKA 3WEEA 4CZJA 4A62A 5LJVA 3JXUA 3D2EB 2YCHA 3LL3A 5KQDA 2GELA 3CETA 1NWKA 1MA9B 1T6CA 3UKRA 4PKGA 3FGUA 4BC3A 5KQ8A 5BRDA 2A41A 3VEXA 2ZGZA 4FPBA 2QW9A 1JCGA 4B1WB 1GLDG 1GLFO 3D2FA 3A5LC 2V51B 4JNEA 3VEZA 3FZLA 4FWOA 3ZX3A 4L3QA 4H0PA 5AQJA 4BRKA 2FF3B 3DAWA 1EQYA 2P9PB 3VETA 4RTFD 1XC3A 2YHYA 3FZKA 4BVOA 2HMPA 1H1VA 5ADXH 2QWOA 4BROA 5FPEA 2GTDA 2A5XA 5ADXA 5FPMA 2A3ZA 3FE1A 5F0XA 3ZETA 1S3XA 4H0YB 4BR0A 5AQZA 3EN9A 3H3OB 4BRPA 1HKGA 2GWJA 4CZFA 4CJ7A 3HM8A 3KZBA 3D2FB 3WUHA 5KPRA 4HTLA 1KXPA 3B8AX 3ID8A 3QB0A 2A42A 3FZFA 3CJCA 2D4WA 4IWVA 3EL2A 2F9TA 2YJEA 3QBWA 4CZLA 3CIPA 2QM1A 4BRHA 1ATNA 4WQ4A 4ISFA 3LDQA 3SK3A 2QWLA 1KAXA 2NLXA 3BF1A 3CQXA 2OANA 1TUUA 5JMVA 4K41A 1NGGA 1C0FA 3O5BA 1X3NA 4IJAA 5EOYA 4DHYA 4CZEA 3M3ZA 2P9NA 3WXIA 3HBTA 4BRNA 4H5WA 3CQYA 5AQWA 1XQSC 3H46O 3IFRA 3CI5A 3L6QA 2ZWHA 4FOIA 5AQHA 3HTVA 4I6MA 3I8BA 3WXJA 2E88A 4BQLA 1GLAG 4BGAA 4CD1A 3CERA 3H6EA 4QS9A 5B8HA 2HF3A 3VPZA 1G99A 4HWIA 3DXMA 1BG3A 1QZ6A 3BUZB 5AZIA 1BWFO 4XH4A 2IIRA 3MCPA 2E2NA 2AA4A 2ZF5O 3UKUA 3C0BA 2F9WA 3F9MA 4CZIA 4K25A 2I7PA 3SJHA 3TPQA 3ZEUA 5EX5A 3IMXA 4Z94A 1YXQA 3SLCA 5AQKA 3A5MC 4QS7A 3LDNA 3CJ9A 2P9KB 3VF6A 5E26A 1P8ZA 3CJAA 3J8AA 4CZMA 4C23A 4BR9A 3KHYA 4BC4A 4F9OA 2E1ZA 1GLBG 3VEVA 4BG9A 3ATVA 1IJJA 1D4XA 4XH5A 4BR2A 3DJCA 1WOQA 4BR7A 3DXMB 2YHXA 4BC2A 3IDHA 5TKYA 2GEMA 1HUXA 4JN4A 5AQQA 5BRFA 5AQYA 4BR4A 2YJFA 1BA0A 2IVOA 2P9SA 4WYBA 5AQFA 3UKUB 4H5NA 4QS8A 4CZHA 1DGKN 3L4IA 1HKCA 1U2VA 4RWTA 3SMSA 4H0OA 3LDLA 4PL7A 4H5VA 3LM9A 3LDOA 4BRMA 1NGHA 2D0PA 1T6DA 3P4IA 1NGAA 1Z6RA 4XEIA 4B9QA 1TUYA 5AQVA 5BPNA 3FLCO 4WQ5A 3VOVA 4BRGA 2W40A 4B1XB 4FL9A 1MDUB 1Q18A 3WQUA 1S22A 4FWQA 3WEEB 1V4SA 2QWMA 5BREA 5ELZA 4E1JA 3DWLA 4RCHA 3KVGA 2AP1A 4M7XA 4DQ8A 3UE5A 4H03B 4LC9B 4EIAA 3UKRB 1SZ2A 5AQGA 3EKSA 1GLJO 2P9SB 3M6GA 4WQ5C 2Q36A 3O8MA 3VGKA 3A5OC 4O5FA 1E4FT 2NZTA 5AQIA 3A0IX 4B1VA 2A6AA 2HOEA 2FSKA 3H1VX 4O8KA 1BO5O 2E2OA 1R59O 2ITMA 4BRDA 3CJBA 2YHWA 4M63C 3CJ1A 4FWSA 3ENHA 1HKBA 2ASOA 1C0GA 2CH5A 1ATRA 5BN9A 1HLUA 4BRAA 1X9JA 3GBTA 3C7NA 1QQMA 3VF2A 4MLEA 3VEYA 3FZMA 3ZX2A 3VEOA 1ZBSA 5AQNA 2PAVA 4H0TB 2VWBA 2P9IA 2ASMA 1NGIA 5BR9A 4KBOA 3D7EO 5AFUH 3ZETB 4CBXA 2FF6A 5AFUA 5AQTA 4EHUA 4EAHD 4CZKA 1YVNA 3RSEA 3BP8A 3O08A 3BF3A 4XH1A 4MLHA 2E1YA 5KPTA 4A2BA 5BRHA 3GG4A 5F2RA 1QHAA 2V7YA 5KPZA 2P9LA 5LJWA 5AQOA 4FWKA 1BA1A 2D1KA 2Q97A 2BUPA 1BUPA 4BRLA 4NO7A 5AQPA 5AQXA 4JHDA 3I33A 5EVZA 4BRIA 4DB3A 1MWMA 3C7NB 2Q31A 1RFQA 2V7ZA 3AAQA 4BQZA 2H3GX 4FOEA 3G25A 3D2EA 1CZAN 3IUCA 3O80A 4CZGA 2P9NB 1NGJA 1NM1A 2I7NA 2Q0RA 3O1WA 3QFUA 3VERA 3FZHA 1X3MA 1E4GT
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KAZA 4BVPA 2UUAK 4I6MB 1WUAA 4BECA 2X6NA 1I2VA 4W5NA 1BISA 4FW1A 3OW2M 3CC2N 3RSEB 5EXWA 4PL8A 3VQQA 4CGGA 4OJRA 3PY8A 4YORA 3HPHA 3ATUA 2G2KA 3KLHA 4JRQA 2GMOA 4MO5A 3NE6A 3CC4N 4DV4K 1ZVGA 1HYVA 2F8SA 2XY7A 2P9PA 2E2QA 4Y0WA 2VWKA 3T69A 3ZEUB 1QTMA 4IO9L 2LKBA 1SKSA 4AAZA 3WNEA 2G8HA 4H0XB 3VGLA 1LCUA 3PLAA 3MCAB 5C0YA 1OKJA 1TV6A 1ZBFA 2UUBK 4M3XA 4O8UA 4H4OA 4FO0A 3ULEB 3DOLA 4Z4CA 4AH9A 3QICA 3TAMA 2XRIA 3OYKA 4ISEA 1S1WA 1UA0A 4ELTA 2Q0UA 1BOTO 4C8MA 2CGLA 4NLCA 4DV2K 4BDPA 4DFMA 4IBNA 1QSSA 3U9DA 1NRBA 1X9MA 5JS1A 3DXKA 3OYFA 3UIQA 3L4QA 2QWPA 2Q2RA 4O55A 3NGYA 3CCVN 1L3VA 1J6ZA 1LW2A 1U2VB 1RDAA 1HX1A 3CCUN 2OA8A 3LAMA 4CHOA 2W6LA 3O9RA 3AY9A 1JLCA 1GLCG 1QVFM 3F5TA 1BQMA 5C15A 3O3FA 2N2QA 1NJYA 1RBTA 2ITGA 4ISGA 4E7JA 2YNFA 2ATBA 4BR5A 1RTDA 3M5RA 4AHUA 4CJWA 4R79A 3KK1A 1ATSA 1UGLA 1K8KB 3L8BA 1SNBA 3WXLA 3ALYA 3R3LA 4AHTA 4JI1K 1KFSA 4G1QA 4ICLA 1TKDA 4LFAK 1NKEA 3WXMB 2KPYA 1BMRA 2FXUA 4DTOA 3GE1A 4PA1A 1J5EK 2OZMA 3OYHA 2V52B 5CHIA 2DFHA 1WWNA 3H45C 4DCHA 4FJ5A 4H5TA 3U9ZA 2O8BB 5EY4A 2A1RA 4CJ3A 1ZXOA 2MBKA 2YKNA 2HVIA 1VSJA 3WT0A 4DSIA 1CXUA 1WB9A 1S9EA 4FJJA 5BPMA 3R9PA 1V4TA 3UB5A 2E8AA 2LSNA 4CJ5A 4CI6A 5KRTA 1VNAA 3I0RA 2XY6A 3O4NA 3ZLJA 5BPLA 4B3MK 1WSGA 1QHTA 1ESVA 3DRPA 1JLQA 5E84A 1T0ZA 2WTUA 1ILYA 1LOTB 2RPIA 4IXCA 4JKFA 3K58A 2X78A 3VF4A 5E41A 1TK0A 3OBYA 3S41A 3ZSZA 5KGXA 5FPNA 4JKAA 4CHQA 3OYAA 1T44A 3QEXA 3O9QA 1IO2A 4C8KA 4IO8A 1RDWX 3VQPA 2WFBA 4A62A 2KKZA 4DR7K 3LL3A 4U7BA 3KLGA 4BDYA 3CC7N 2YNHA 4CFCA 4OKEA 2MZ0A 4CJKA 1LQIA 4HHTA 4CF9A 1JCGA 1GLFO 4Q0BA 1DTTA 3A5LC 5KRSA 1U48A 2V51B 3VEZA 3FZLA 1BI4A 4CE9A 3OS0A 3SUPA 1VSMA 2XHBA 5DK5A 4NCBA 5IT9O 3KLFA 5AQJA 3P83D 4MQ3A 1FK9A 4BRKA 2FF3B 3RRGA 3HPGA 2LR3A 3WNFA 4FVMA 1XC9A 4BVOA 3B6PA 4FK2A 1S5JA 1H1VA 5ADXH 4IEIA 5FPEA 4F8RA 1HNXK 3VQ4A 1CHZA 4Z0UA 3E9PA 5HRNA 3KD1E 4DSKA 3EN9A 3FFIA 4O44A 3O4QA 4B8AB 3OYDA 3C6TA 1HKGA 4CEDA 4CZFA 1DQ7A 4CJ7A 1VSEA 3QEPA 1WSHA 3G0ZA 3CCQN 4HTLA 4GMJB 1K9MO 1C1AA 3CFOA 4CVNE 3NF9A 2UU9K 2D4WA 4CJPA 2F9TA 3K9KA 2YJEA 1BHLA 4UJ0A 4BWJA 4DV6K 2QM1A 2G8VA 3V4IA 1RCHA 2F7TA 3BZCA 3CG7A 3THWA 2M8BB 2QWLA 2NLXA 3I0SA 2OANA 1JLGA 3VN5A 2PY5A 2NY8X 4DHYA 5A2QO 3WXIA 4V1DC 4FOIA 1NKBA 5AQHA 4I6MA 4CJSA 3I8BA 1MYNA 3WXJA 1KQSM 4N41A 1GLAG 3TSUA 4CD1A 1JL2A 3AVGA 1T03A 4HWIA 1MR4A 1BG3A 1QZ6A 4RW4A 1ZVEA 1FJGK 4M42A 1RTIA 2ZF5O 3C0BA 1ZBHA 3F9MA 4CZIA 4K25A 3ZEUA 3RMCA 3IMXA 4KRFA 4FM2A 4X62K 1YXQA 3LP1A 3SLCA 4I7FA 5FRNA 4UQGA 1KVCA 1KVAA 2W00A 1JXCA 3AVLA 4ELVA 4IDHA 4BR9A 4F9OA 2Q3SA 4DUZK 2FBXA 3VEVA 4B8CA 1NK4A 2NY9X 4XH5A 1QVGM 5HLFA 4DQIA 1I2UA 4CFBA 2OZSA 3CCMN 4E89A 2HBJA 4BEBA 3DXMB 4LF8K 3IDHA 3KOXA 2D0BA 2GEMA 1HUXA 5AQQA 5BRFA 5AQYA 4BE7B 1POIA 2P9SA 1YVUA 3C95A 4JV5K 2N2RA 2G8IA 4CZHA 3CW4A 3L4IA 1HKCA 1U2VA 4RWTA 1C56A 2JGUA 3LM9A 3LDOA 3HYFA 4B9SA 1NGHA 1T6DA 3P4IA 3ZSWA 3QEIA 3E66A 1BCOA 1FKPA 2O8FA 4WQ5A 4YOYA 2XO7A 3LWLA 1MDUB 1ASWA 3PIPL 4DKWA 1LW0A 1T7BA 3S9HA 4IDKA 2DFEA 4E1JA 4A59A 1LAWA 3KVGA 1J9AA 2HHIA 3QI7A 1SZ2A 3OYEA 5AQGA 3EKSA 2HHSA 3M6GA 4WQ5C 3R1XA 4LF9K 4F2SA 2NZTA 3A0IX 4CESA 4O0IA 1QSLA 5DM6L 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KAZ A;  4BVP A;  2UUA K;  4I6M B;  1WUA A;  4BEC A;  2X6N A;  1I2V A;  4W5N A;  1BIS A;  4FW1 A;  3OW2 M;  3CC2 N;  3RSE B;  5EXW A;  4PL8 A;  3VQQ A;  4CGG A;  4OJR A;  3PY8 A;  4YOR A;  3HPH A;  3ATU A;  2G2K A;  3KLH A;  4JRQ A;  2GMO A;  4MO5 A;  3NE6 A;  3CC4 N;  4DV4 K;  1ZVG A;  1HYV A;  2F8S A;  2XY7 A;  2P9P A;  2E2Q A;  4Y0W A;  2VWK A;  3T69 A;  3ZEU B;  1QTM A;  4IO9 L;  2LKB A;  1SKS A;  4AAZ A;  3WNE A;  2G8H A;  4H0X B;  3VGL A;  1LCU A;  3PLA A;  3MCA B;  5C0Y A;  1OKJ A;  1TV6 A;  1ZBF A;  2UUB K;  4M3X A;  4O8U A;  4H4O A;  4FO0 A;  3ULE B;  3DOL A;  4Z4C A;  4AH9 A;  3QIC A;  3TAM A;  2XRI A;  3OYK A;  4ISE A;  1S1W A;  1UA0 A;  4ELT A;  2Q0U A;  1BOT O;  4C8M A;  2CGL A;  4NLC A;  4DV2 K;  4BDP A;  4DFM A;  4IBN A;  1QSS A;  3U9D A;  1NRB A;  1X9M A;  5JS1 A;  3DXK A;  3OYF A;  3UIQ A;  3L4Q A;  2QWP A;  2Q2R A;  4O55 A;  3NGY A;  3CCV N;  1L3V A;  1J6Z A;  1LW2 A;  1U2V B;  1RDA A;  1HX1 A;  3CCU N;  2OA8 A;  3LAM A;  4CHO A;  2W6L A;  3O9R A;  3AY9 A;  1JLC A;  1GLC G; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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