5AQTA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqtA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqtA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqtA04
1BDGA 5AZJB 3JXUA 2KHOA 4A61A 4CZFA 1NGIA 3D2EB 5BRDA 2OANA 3F9MA 3BEXA 3VF2A 2Q2RA 2QWPA 1GLLO 2ZF5O 3R6MA 3UKRB 5KQ8A 3WXIA 2F9TA 2ZGYA 1HKBA 4BR5A 3U4LA 4CBWA 4B1WB 5AQJA 3MN5A 4K41A 1KAXA 1V4SA 3O08A 1SZ2A 4BRNA 2YI1A 5FPEA 2FLOA 2P9KB 1TUUA 4WYBA 1X3NA 1NGHA 3LL3A 1HJOA 5BPNA 5AR0A 4I6MB 2P9SB 4B1XB 5BN8A 1CZAN 3GL1A 3L0QA 3SMSA 4CJ7A 3ID8A 1U2VB 3TPQA 3HI0A 1Z6RA 4B1YB 3O8MA 2V7ZA 5EXWA 3VGMA 4CI6A 4FOEA 3MMVA 2UYTA 2YJEA 5E26A 3JS6A 2V7YA 1EQYA 3RSEA 2A42A 5BRHA 1QQOA 4WQ4C 4GNIA 2QWNA 4FWOA 2V51B 5CE3A 5KQDA 3VENA 4EHTA 3B8AX 1NBWA 4EHUA 2GWKA 2V52B 2AP1A 3FLCO 3QICA 5LJVA 5ADXA 4FO0A 4BRGA 1NGCA 2PBDA 5E84A 1JCGA 4BVPA 1HPMA 5AQHA 2QWRA 2A41A 4WQ5C 2IVNA 4A2AA 2QWLA 3GDQA 2H3GX 3HZ6A 3MN6A 1U6ZA 3CERA 3ENOA 4PKHA 4CZEA 1D4XA 3S41A 1BO5O 2GEMA 2P9UA 4DQ8A 5AQTA 3GE1A 4C23A 3VEWA 4K42A 5LJWA 4B1ZA 4JNEA 1KXPA 4NB4A 3ZX3A 1ATRA 5EY4A 1GLAG 2VYPA 3DAWA 3MCPA 3ENHA 3WXLA 3A0IX 3R8EA 1KAYA 2Q1NA 2WUSA 3MK6A 5BPMA 3AY9A 4PL8A 3D2EA 3ZETB 3HTVA 5AQXA 3WQUA 2HF3A 4A2BA 2AA4A 4H5NA 1BA0A 3C7NA 3BF3A 1XUPO 2CH6A 4FWLA 3A5LC 3GG4A 4BRAA 2ITMA 1BUPA 1BG3A 4FWRA 1DGKN 1ZBSA 2Q0UA 5TKYA 4H0TB 3QBXA 2E1YA 2IVPA 2P9UB 4AM6A 2P9KA 4BR9A 5I9EB 2HF4A 1NGGA 2ASMA 1ATSA 3CETA 4MLHA 2P9SA 1GLEG 3ZEUA 5JLHA 2Q97A 4H5RA 2A40A 1ZC6A 1U2VA 2D4WA 3ZX2A 1QQNA 2ASOA 1ESVA 3HBTA 2CGKA 1C0FA 3EZWA 5BPLA 5AQZA 3FZKA 2F9WA 3VF6A 1LOTB 1YVNA 5BRFA 4H5WA 5AQRA 5AQIA 3WEEA 3OHRA 4BGBA 3P4IA 5KPRA 4KBOA 3LDQA 5AQUA 4H0XB 4ISGA 3A5MC 1T6CA 3EO3A 4BC4A 3C7NB 2IIRA 4FWQA 4BRDA 1H1VA 1QZ6A 2FXUA 3LDPA 1NGBA 3CI5A 3VEXA 1YXQA 1OKJA 2P9PB 3UB5A 2NRHA 1X9JA 1XC3A 2FF3B 3R9PA 3H1VX 3A5NC 5KPTA 3VEVA 2QM1A 4CZHA 2I7PA 4H5TA 2YHXA 3DJCA 4MLEA 2D0OA 3ZEUB 4FWSA 4BROA 4JN4A 1XQSC 4ISEA 3LDOA 4Z94A 3SK3A 3G25A 1HKCA 2QXLA 2QWOA 3FZMA 4MO5A 3ZX0A 4B9QA 3DXKB 3GOIA 3VEOA 3VEYA 2D0PA 3GBTA 4CZLA 1NLVA 1LCUA 3U8XA 3ATUA 3WEEB 4DCHA 3A8YA 4H0YB 4GY2B 5EOYA 1HX1A 1HLUA 4CD1A 4RCHA 2Q31A 3O80A 4QS9A 2VCPA 3AAQA 3IMXA 4XEIA 1IG8A 2P9IB 3ZETA 2BUPA 4JHDB 5AFUA 5BR9A 5AZIA 1MDUB 4FWPA 4BRMA 1IJJA 1J6ZA 2Q0RA 4FL9A 3BF1A 4BRIA 3H3NO 5LY3A 1MWKA 3H45C 3U9ZA 4PL7A 4H0OA 4EAHD 3WXKA 1YAGA 3C0BA 4QS7A 1S3XA 1MWMA 2GUPA 4FSVA 5AQMA 4BR2A 1NGJA 3H46O 1NWKA 3O5BA 4M7YA 4QS8A 4BRFA 3VGLA 3SMPA 2E2QA 4K43A 5AQNA 2CGJA 2FSJA 3CJCA 3O6WA 4FPAA 1NMDA 3D2FA 1MA9B 2VWBA 4BRKA 1V4TA 4BR4A 5KPZA 4JD2A 2E1ZA 3IDHA 4FWMA 2P9NB 3LDNA 4IXCA 1NM1A 3O1BA 1RGIA 5AQSA 2E2OA 4XH1A 1NGEA 5AZIB 2ZWHA 3BP8A 1GLCG 3I8BA 3FGUA 4YDUA 3LM9A 2CH5A 4BRPA 4XH5A 3VESA 4IZ9A 4CZKA 2P9PA 4BRQA 1JCFA 3CIPA 1YUWA 3KVGA 3QMLA 2YHWA 3H1QA 4E1JA 3CQXA 4BRHA 3H3OB 2CGLA 4BQZA 5ADXH 5AQPA 4XH4A 3M3ZA 4EIAA 5F0XA 2ASPA 1C0GA 1T6DA 3EN9A 3WQTA 4JAXA 1RDWX 4L3QA 4F9OA 5FPNA 2YJFA 3QB0A 1BWFO 4H5VA 1GLBG 2Q36A 3L4IA 3D2FB 3ULEA 3DXKA 1P8ZA 3IFRA 3KZBA 1WOQA 2PAVA 4JD2B 2GTDA 3W0LA 4CBUA 3IUCA 4BC2A 3TU5A 4BRCA 3FZHA 4ISFA 1G99A 3MN7A 3O1WA 5AQKA 5BN9A 1Z05A 1NGFA 3VPZA 3AARA 1R59O 4BG8A 2P9IA 4DHYA 4JHDA 3CJAA 3A5OC 4IWVA 3LDLA 4CBXA 3VERA 3EKSA 4CZJA 2E88A 4BC5A 2YCHA 1ZXOA 1TYQA 1RFQA 3CJ7A 4M63C 3QFUA 1BU6O 3M6GA 1WUAA 4MO4A 5FPDA 2QW9A 4HWIA 4BQLA 1ATNA 3WXJA 4AM7A 1QQMA 2EWSA 1GLJO 1JCEA 3QDKA 5JLFA 3W3DA 1E4GT 3UKUA 4BG9A 3ULEB 2P9LA 4CZMA 3CHWA 5F1XA 3L6QA 4CD3A 1GLFO 1NGDA 5AQFA 2E8AA 1GLDG 1NGAA 2J4RA 4O5FA 3D7EO 5AQLA 1DEJA 4IO8A 4BR7A 4FWKA 3SJHA 5AQVA 3WUHA 3ATVA 3EKUA 3QBWA 2FF6A 3VOVA 2P9NA 4K25A 1K8KA 5EX5A 1TUYA 2A5XA 1Y64A 3MN9A 3UE5A 3FZFA 2E2PA 4YDUC 3HSCA 5AQGA 1BOTO 2NLXA 1TYQB 4H0VB 3BUZB 5B8HA 2IVOA 2GELA 4RWTA 5FPMA 4H0PA 5AQWA 1X3MA 2I7NA 3DWLA 4FWNA 4EFHA 3HM8A 5F2RA 4FPBA 4BREA 4BVOA 2HMPA 3UKUB 4IJNA 2BTFA 4H03B 2P9LB 3DXMA 1E4FT 2YHYA 4BRLA 4LC9B 3H6EA 1SQKA 2A3ZA 1SAZA 3LM2A 3KHYA 2W41A 3WT0A 5JICA 1HUXA 4PKGA 2FSNA 3VETA 1K8KB 1QHAA 3O4WA 3VEZA 5AQOA 4DB3A 4A62A 4BC3A 2E2NA 5AQQA 4RTFD 4Y0WA 3AAPA 3M1FA 4HTLA 4NO7A 3CJBA 3RSEB 4BGAA 5AZJA 1DKGD 4PKIA 2NZTA 4BR0A 5JMVA 4WQ4A 5AFUH 3J8AA 3FR0A 3CJ1A 3VGKA 4J8FA 4M7XA 4CZGA 1S22A 1KAZA 1Q18A 2DPNA 3CQYA 4IJAA 3DXMB 3SLCA 3FZLA 1HKGA 5AQYA 3I33A 3EL2A 5BREA 3UKRA 4B1UB 1BA1A 4O8KA 3FE1A 5ELZA 2ZGZA 3MDQA 2A6AA 2D1KA 2QWQA 3FFKB 4WQ5A 3U9DA 2W40A 3VF4A 4FOIA 1T44A 2QWMA 4CZIA 4B1VA 5EVZA 2GWJA 3QFPA 1QZ5A 4I6MA 2FSKA 3CJ9A 2HOEA 2E20A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KTZA 3CFOA 3AVBA 4YORA 5AZJB 4LF7K 3E9OA 3K58A 1TAQA 1NGIA 4CVNE 1L3SA 1N5YA 2ZQBA 4NCAA 4B9SA 3OYEA 5BRDA 2GV9A 4IG3A 3F9MA 3TI0A 3BEXA 3PO4A 3Q7CA 4CJLA 3QEPA 3WXIA 2F9TA 1C0TA 1S5JA 3U4LA 4B1WB 4X66K 4WCEL 4JKDA 3ZSXA 1CZBA 4JS5A 1JXBA 3K5OA 4KPYA 4A59A 4XJXA 4GV3A 1B3CA 1BI4B 4GVMA 3V1QA 4EZ9A 1XHXA 5AR0A 4E7JA 4YOXA 4DV5K 3KD1E 2KQ2A 1CZAN 1HYSA 1QHTA 3ID8A 4CJ7A 2NNWA 4B9LA 4FJNA 4OPKA 3S3MA 3HI0A 3G4SN 2R7YA 4F4KA 3VGMA 1NE5A 2WOMA 1QS4A 1L4VA 4CI6A 3MMVA 2UYTA 4K8ZA 2YJEA 3JS6A 2FC0A 1EQYA 3DRRA 2A42A 5LL6Z 3RSEA 3B6PA 5BRHA 3OYAA 1ZBLA 2OYQA 4FWOA 2XY7A 2V51B 5KQDA 1RDDA 4EHTA 5HRNA 4CHOA 4FLXA 1I2UA 3LDSA 5SWMA 4L8RB 3MWPA 2F96A 5GINA 4FO0A 3PV8A 3VTIA 4CE9A 5HROA 2PBDA 4CF9A 1HPMA 3HPHA 1YTAA 1VK0A 3NGYA 2QWLA 4CERA 3GDQA 3HZ6A 1EX4A 1GOAA 1ZU3A 1WN7A 3CERA 4CZEA 5HL7L 1D4XA 1A5WA 2RF2A 3S41A 3OTOK 1BO5O 1CXUA 1K8AO 5AQTA 1UGLA 3VN5A 1NK0A 3GE1A 4UJ0A 4C23A 1HR0K 3T3FA 4K42A 5LJWA 2YV0X 3TWHA 2O8DA 4UADE 1KXPA 2HBLA 1ATRA 3QERA 3SYZA 1NRAA 1T7EA 1RDAA 3MCPA 3ENHA 1WMTA 3VA0A 4DU3A 1VQ7N 3R8EA 3MK6A 3AVAA 4O8UA 5DM7L 1RILA 3MCAB 4HHFA 4CEQA 2B3CA 3WQUA 2HF3A 3TAQA 1HQUA 2QK9A 3BF3A 3K2PA 5CR4A 1OH5A 1D9DA 4GW6A 3CCUN 1NNEA 3QINA 4BRAA 4CECA 1BUPA 4YOUA 5JVGL 3N4PA 3L2RA 1BI4A 2EHGA 2HF4A 4U7BA 1Q81O 2ASMA 4MLHA 4FVUA 4CJEA 2Q97A 4H5RA 3R3LA 4DS4A 3HBTA 1QQNA 1ESVA 4JKAA 1UA0A 2CGKA 3EZWA 4JLHA 1EWRA 1X9MA 1FKPA 1ASVA 4FJ9A 2NRXA 3VF6A 1YVNA 2B5JA 1LQHA 4FJ7A 3NMUA 1NOYA 3MEEA 4JRQA 3SQ1A 1WT7A 4H0XB 3KIOA 4ISGA 3HVRA 3CG7A 4ELVA 3C7NB 2LR3A 4UQGA 5C10A 3CC4N 3D6RA 1QZ6A 1NGBA 1RTJA 3TTFA 1YXQA 3L3VA 1ZBHA 1OKJA 2P9PB 4DFPA 2P51A 2NRHA 1YI2N 1IBLK 1XC3A 4IDHA 3R9PA 2PZSA 3OYGA 3BDPA 1WAJA 4JKFA 2FBXA 4DR7K 4FLYA 1QSSA 3AVMA 1T7AA 3IRXA 4H5TA 1SEGA 1NOZA 4MLEA 3DLKA 3SNNA 4BWMA 2YIOA 3LDOA 4Z94A 3OVNA 1NK6A 2QXLA 2QWOA 4MO5A 4ELUA 3VEOA 2G8IA 3VEYA 1NLVA 1LCUA 1OMYA 3PLAA 4CEDA 5C2DA 3KOYA 4Q5VA 4W5TA 1DT9A 1HLUA 2D56A 3NH0A 3CCLN 4E1MA 3AAQA 3CFRA 3QI7A 4XEIA 3J81O 5AFUA 4JHDB 1LAVA 3KD5E 1MDUB 4FWPA 4OKKA 1RT7A 3CM5A 1X9SA 4FL9A 4CHPA 4BRIA 4B3RK 5LY3A 3V9SA 1MWKA 1NK7A 4F2SA 3H45C 1D9FA 1IBMK 1RBSA 4EAHD 4DSFA 1S3XA 1KVAA 1MWMA 2GUPA 1BCGA 4CK3A 1HQEA 2HHVA 3H46O 3KP1A 4QS8A 4KAZA 3OYDA 2G8WA 2E2QA 3SUPA 4K43A 3RMAA 3O9QA 3O3GA 3AVJA 4H8KA 1BQMA 3CJCA 3O6WA 3NAEA 1TKZA 3DLRA 1RBVA 4KREA 3IDHA 1D8YA 5JENA 3QO9A 4IXCA 1NM1A 4EP4A 2E2OA 1IKYA 4C8KA 1NGEA 1J9AA 5CYQA 3FGUA 3KLGA 4OJRA 3AVIA 5KRSA 4IZ9A 2P9PA 2YNGA 3CQXA 3QIOA 5AQPA 3PSFA 2ASPA 4JYAK 3T1HK 5KTQA 3CCVN 4OLAA 1C0GA 4JAXA 4CHYA 4JK8A 4DFKA 4F9OA 3THXB 4I9LA 5FPNA 3TAFA 1XMQK 3S3NA 3QB0A 3ZSWA 1TL3A 2Q36A 1GLBG 3L4IA 3VQEA 4FVMA 1NJIO 3IFRA 1YJNN 4JD2B 1F21A 3CCSN 3IUCA 4JS4A 1VQNN 2I61A 3EEQA 4BRCA 3TAMA 1WSEA 3ZCMA 1IKVA 1WWNA 3MN7A 2QXFA 5BN9A 1NGFA 1X9WA 4JHDA 2KBHA 1T05A 4C1NK 4CGIA 4CZJA 1ZBFA 4BC5A 4CGJA 4ZHRA 3LAKA 3THYA 4M63C 2MN5A 3QFUA 2WC9A 5FPDA 3PIPL 1GLJO 5JLFA 1E4GT 3KK2A 1XWLA 3U6FA 1Q9XA 3ULEB 2P9LA 2HHXA 4BWJA 4WFNL 1HNIA 4IEIA 1GLFO 2J4RA 4O5FA 2YBRC 5AQLA 1DEJA 4BR7A 4W5QA 3NE6A 1L3UA 2QEXN 5AQVA 1WBBA 3WUHA 4X64K 3EKUA 2VWJA 1SL0A 4AAZA 3PO5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KTZ A;  3CFO A;  3AVB A;  4YOR A;  5AZJ B;  4LF7 K;  3E9O A;  3K58 A;  1TAQ A;  1NGI A;  4CVN E;  1L3S A;  1N5Y A;  2ZQB A;  4NCA A;  4B9S A;  3OYE A;  5BRD A;  2GV9 A;  4IG3 A;  3F9M A;  3TI0 A;  3BEX A;  3PO4 A;  3Q7C A;  4CJL A;  3QEP A;  3WXI A;  2F9T A;  1C0T A;  1S5J A;  3U4L A;  4B1W B;  4X66 K;  4WCE L;  4JKD A;  3ZSX A;  1CZB A;  4JS5 A;  1JXB A;  3K5O A;  4KPY A;  4A59 A;  4XJX A;  4GV3 A;  1B3C A;  1BI4 B;  4GVM A;  3V1Q A;  4EZ9 A;  1XHX A;  5AR0 A;  4E7J A;  4YOX A;  4DV5 K;  3KD1 E;  2KQ2 A;  1CZA N;  1HYS A;  1QHT A;  3ID8 A;  4CJ7 A;  2NNW A;  4B9L A;  4FJN A;  4OPK A;  3S3M A;  3HI0 A;  3G4S N;  2R7Y A;  4F4K A;  3VGM A;  1NE5 A;  2WOM A;  1QS4 A;  1L4V A;  4CI6 A;  3MMV A;  2UYT A;  4K8Z A;  2YJE A;  3JS6 A;  2FC0 A;  1EQY A;  3DRR A;  2A42 A;  5LL6 Z;  3RSE A;  3B6P A;  5BRH A;  3OYA A;  1ZBL A;  2OYQ A;  4FWO A;  2XY7 A;  2V51 B;  5KQD A;  1RDD A;  4EHT A;  5HRN A;  4CHO A;  4FLX A;  1I2U A;  3LDS A;  5SWM A;  4L8R B;  3MWP A;  2F96 A;  5GIN A;  4FO0 A;  3PV8 A;  3VTI A; 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