5AQUA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aquA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aquA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aquA04
3KHYA 3DXMB 1P8ZA 4K41A 1IG8A 1GLDG 3CJ1A 3EZWA 2QWNA 5KQDA 2GWJA 4RWTA 2A3ZA 2HF4A 2YI1A 3CERA 1MA9B 1YUWA 3ATUA 4HWIA 4BC5A 4MLHA 5BPNA 4CZIA 3BF1A 2QW9A 5BPLA 4BVOA 3O5BA 3M6GA 4DB3A 3FGUA 4QS7A 2ZWHA 4BRAA 4BR9A 2E8AA 1EQYA 3VEOA 4CBUA 3C0BA 3VEYA 4AM6A 1NBWA 3MN7A 2PAVA 4E1JA 5AQUA 2V7ZA 1NGHA 1ZBSA 1BU6O 4FPAA 3C7NB 4PKHA 5I9EB 1ATNA 3QFPA 2P9LA 3UKRA 1Z05A 3SJHA 5AQTA 1ZXOA 2NZTA 2QM1A 4B9QA 5BN9A 4M7XA 5AQVA 4FWSA 2V7YA 4WYBA 5F1XA 5JICA 3ULEA 2E2OA 3WQUA 2IVOA 3MK6A 1HKCA 4PKGA 2YHWA 4CZGA 1IJJA 4XH4A 5KPRA 2IVPA 1HKBA 5BREA 5AQKA 4BGBA 3DJCA 4A61A 3G25A 3ZETA 2PBDA 3FR0A 2BUPA 4O8KA 5B8HA 4BRHA 1TYQB 3CHWA 1BUPA 3D2FA 3R6MA 2D0OA 2H3GX 1QZ5A 4I6MB 3CQYA 2E1YA 2FSNA 1Y64A 4RCHA 4H0PA 3BUZB 1RFQA 3CIPA 3GDQA 3LDNA 1MWKA 4BGAA 4BC4A 1LCUA 3D7EO 4FO0A 4M7YA 3L6QA 2Q0RA 5KPTA 2IVNA 2P9PA 4L3QA 2P9SA 4BRKA 2CGLA 4CBXA 2FF3B 1TUUA 4BRCA 4FWRA 1T6CA 3VPZA 2J4RA 3VGKA 5AQXA 3IFRA 4H0VB 4NB4A 4H0YB 1BA1A 3LM9A 3VEWA 5CE3A 2V52B 5FPEA 3SMPA 5AFUA 3UKUA 3VF2A 4A62A 2AP1A 2YJEA 3VENA 4B1ZA 4BRMA 4YDUA 3FLCO 1NGBA 3FE1A 2ASPA 4QS9A 1YXQA 1Q18A 3DXKA 2P9NB 1S3XA 3VEVA 1ESVA 3WXKA 3O8MA 3RSEB 3TU5A 3HI0A 2P9IB 4CZKA 3VEXA 5AQMA 1E4GT 4CD1A 4H5VA 4JN4A 3SK3A 3I8BA 4MLEA 5EXWA 3QMLA 2A6AA 2HMPA 5AQGA 5E26A 3H46O 4FL9A 2P9KA 5ADXH 3ZEUA 4O5FA 3QDKA 5E84A 2ASOA 4IJAA 3ZX3A 1WUAA 3W0LA 3EN9A 3SMSA 3VGLA 1NWKA 4H0TB 1SAZA 1QHAA 4B1XB 3LM2A 4BRDA 2A5XA 3H3OB 3QBWA 4BREA 2CGJA 3VERA 2OANA 1BO5O 4EHTA 2Q97A 4B1YB 2VCPA 3WXIA 4B1WB 3TPQA 4JD2B 2D4WA 2GEMA 5AQNA 5FPMA 2QWLA 3H1QA 4ISEA 4BR5A 3MCPA 1GLBG 3U9ZA 3U9DA 4K43A 3AAQA 3DAWA 4AM7A 4KBOA 3CJAA 3BEXA 1BDGA 2FSJA 3D2EB 1J6ZA 3DXMA 3WT0A 3VETA 4EAHD 4ISGA 4XH1A 5AQQA 1NGAA 2QWRA 1Z6RA 2ASMA 2GELA 4WQ4C 4M63C 4BRNA 5FPNA 2Q0UA 1GLAG 3CJBA 4WQ5C 2P9UB 4JNEA 5AQWA 5AZJB 1K8KB 3EKSA 4BR0A 4CZMA 4FWPA 5LJWA 4HTLA 4FSVA 3EO3A 3QFUA 3L0QA 2QWOA 1KXPA 1CZAN 3P4IA 2CGKA 2D1KA 4FPBA 2Q31A 2E1ZA 1HUXA 3HBTA 4H0OA 4H0XB 4FOIA 1NGIA 1NGGA 4B1VA 4ISFA 5JLFA 4H5RA 3C7NA 3MN9A 2A41A 5KPZA 4BC2A 1NGEA 4DCHA 1GLCG 5JMVA 4A2BA 3WEEB 1S22A 3QICA 1X3NA 2CH5A 3FZKA 2F9TA 2GWKA 2WUSA 3I33A 4BRFA 1DGKN 2V51B 4XEIA 1BOTO 2D0PA 3LDOA 1GLJO 3UB5A 2W40A 4QS8A 5BN8A 4H5WA 1DEJA 5AQHA 1OKJA 1YAGA 5AR0A 1RGIA 5BRDA 3CETA 2VYPA 4CJ7A 2NLXA 3DXKB 1V4TA 2E2PA 4BVPA 3O6WA 1TYQA 4BR7A 1ATRA 3VEZA 2E88A 3W3DA 3H3NO 4I6MA 5AQFA 5EVZA 4C23A 2NRHA 1HKGA 2E2NA 4JHDB 2Q1NA 1BG3A 2FXUA 2YHXA 3IUCA 3VF4A 3HTVA 1LOTB 4CBWA 2KHOA 2E20A 1JCGA 4EHUA 3GOIA 4Z94A 1U2VA 4DHYA 5EY4A 1R59O 5AQJA 1NGJA 3O80A 5AQOA 2ZGZA 3MMVA 4CZEA 1U6ZA 4BRPA 3WXJA 1H1VA 3CI5A 3O4WA 3OHRA 4GY2B 1MWMA 4B1UB 3O08A 1X3MA 4BQZA 1GLLO 1NGFA 4K42A 3LL3A 1DKGD 3IDHA 3O1BA 4CZLA 2QWPA 1T44A 3AY9A 1XQSC 2E2QA 2Q2RA 3M1FA 3H6EA 1JCEA 1E4FT 2P9NA 3RSEA 5JLHA 3CJCA 3A8YA 5AZIA 1KAZA 2P9IA 4FWMA 5AFUH 2FF6A 4CZJA 2UYTA 4EFHA 2QWMA 3JS6A 4EIAA 1NM1A 2P9LB 3MN5A 3JXUA 1BWFO 4H5NA 3UKRB 2AA4A 4K25A 4PL8A 3ZX2A 3QB0A 5LJVA 5EOYA 3SLCA 4LC9B 3UE5A 4BC3A 5BR9A 3FFKB 3FZLA 4FOEA 5AQPA 3WUHA 4FWLA 2EWSA 3ULEB 2W41A 5FPDA 4BRGA 3AAPA 4F9OA 3VOVA 1TUYA 3BP8A 5AQIA 2YJFA 5AQYA 4IWVA 3WQTA 1KAXA 3U8XA 4FWKA 4BRQA 3IMXA 4BG9A 2IIRA 3FZMA 2FLOA 4CD3A 4BRLA 4MO4A 1T6DA 1ZC6A 5BRFA 3ATVA 2YCHA 1NLVA 4JD2A 4RTFD 3ZETB 2BTFA 4CI6A 2FSKA 4BG8A 3A5MC 3D2FB 2A42A 3DWLA 4FWQA 3EKUA 4A2AA 1RDWX 5AQRA 1V4SA 3GBTA 1D4XA 3B8AX 4FWOA 3VF6A 1NGDA 2A40A 5BRHA 2QWQA 4IZ9A 4BR2A 3VGMA 2ZGYA 4PKIA 3WXLA 3H1VX 4BROA 1QQOA 3CQXA 4FWNA 5AQLA 4IXCA 4MO5A 5BPMA 3LDPA 3HM8A 3D2EA 5LY3A 2P9PB 2P9SB 2QXLA 2HF3A 4IO8A 5F0XA 2VWBA 3MN6A 2GTDA 1ATSA 1HX1A 1C0FA 3A5LC 3A5OC 1HJOA 1HPMA 5TKYA 2P9UA 3M3ZA 1SZ2A 5AZJA 5F2RA 4YDUC 1K8KA 1JCFA 4WQ4A 3U4LA 3KVGA 3LDLA 3O1WA 1HLUA 4Y0WA 2ITMA 1WOQA 1XUPO 4JAXA 2ZF5O 3UKUB 1NGCA 5AQSA 3HSCA 1QZ6A 4WQ5A 1BA0A 3ID8A 3R8EA 3CJ7A 4IJNA 1MDUB 3KZBA 5ADXA 4XH5A 3S41A 3EL2A 3L4IA 1GLEG 4BQLA 1KAYA 2Q36A 2I7PA 1U2VB 1XC3A 3R9PA 2F9WA 3WEEA 3F9MA 3FZHA 2P9KB 4PL7A 3ZEUB 1X9JA 1NMDA 3GG4A 5KQ8A 4BRIA 3CJ9A 2HOEA 3MDQA 3LDQA 3A5NC 2YHYA 3ZX0A 3AARA 1YVNA 2I7NA 5EX5A 1SQKA 4CZHA 1GLFO 5ELZA 4H03B 4NO7A 3VESA 2GUPA 3A0IX 3GL1A 3J8AA 1C0GA 3GE1A 3ENHA 3ENOA 5AZIB 3H45C 4H5TA 4GNIA 4J8FA 4DQ8A 2DPNA 3QBXA 5AQZA 2CH6A 1QQMA 1QQNA 4JHDA 3BF3A 1G99A 3FZFA 3HZ6A 4CZFA 4BR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S6QA 2QWNA 3KLEA 1JXEA 5KQDA 2GWJA 3O9UA 2KQ2A 2YNFA 3O9RA 1YUWA 5JVHL 4KB0A 3MWTA 4NYFA 4CZIA 1WAJA 1Z25A 2QW9A 4BVOA 4Z4CA 4DB3A 3ZSYA 1CHZA 3FGUA 2ZWHA 4IG0A 4BRAA 1JLBA 1EQYA 4CF9A 4KRFA 4J2DA 4F3OA 1NBWA 1I2VA 1SS6A 4I9QA 5AQUA 4YOXA 3N4QA 1NGHA 1BU6O 4FPAA 2HSTA 4JI0K 2UUBK 3S3MA 5FROA 4I2QA 2ETJA 5AQTA 1XMOK 1KVBA 2RN2A 3OYGA 3VN5A 5J2QA 5BN9A 1UOCA 4WFAL 3THXB 2NRRA 3SCXA 1KRPA 4BE2A 3UIQA 5F1XA 3RR8A 3J80O 3ULEA 3ZSXA 3AVMA 2E2OA 3V9WA 4YNQA 3MAQA 4OPAA 4QOZB 1P90A 1HKCA 4FJ7A 4FXDA 4DTOA 3OA9A 4PWDA 1HKBA 4DV7K 1NRAA 5BREA 3G25A 1WBDA 3R3LA 3JSMA 4DV6K 3CHWA 4AHUA 4KO0A 3C6AA 3D2FA 1QVGM 1ZVGA 4IEEA 1QZ5A 4RCHA 5HRSA 4DR7K 4H0PA 3BUZB 1PX9A 1RFQA 3PIOL 4YFUA 4UAFE 4FM2A 4FO0A 4M7YA 1VSIA 2Q0RA 2KZMA 4CJRA 2P9SA 3PSIA 2FF3B 3FFIA 2YC1C 3VQAA 3L4QA 1XRSB 1RT3A 1YHQN 4N47A 3F73A 1FJGK 3VQDA 4AH9A 2JDQD 5FPEA 2HB5A 1Q81O 3SMPA 3JAMO 4A62A 3L2WA 4BRMA 4YDUA 3OJSA 1NGBA 4CIGA 4QS9A 1U45A 4JK7A 2P9NB 4OGEA 1M1KO 2HHXA 1IV0A 1XI1A 1FKPA 3O8MA 3RSEB 3NGYA 4K8ZA 4GW6A 1VQ5N 4CK3A 1E4GT 3QO9A 3CXCM 1NK8A 4JN4A 4E7IA 3I8BA 4MLEA 4DFKA 5E26A 4NLCA 4DKWA 4CEAA 2PFUA 4O5FA 1OVQA 1C6VA 1WUAA 1RBVA 4KH6A 4A5BA 3EN9A 3VGLA 3TAQA 4CEOA 3HO1A 1WLJA 4B1XB 2YIOA 4IG3A 3OYHA 1KFDA 4M41A 1S5JA 4JKGB 2CGJA 4JI1K 1WSJA 3EZ5A 4CFAA 4J2AA 2Q97A 3KP1A 2VCPA 4DTSA 4B1WB 4R5PA 3TPQA 4KAZA 1I6FA 4OPHA 3V9ZA 4XIUA 4ISEA 1L3SA 1ZBUA 3U9ZA 3U9DA 1FXXA 1DT9A 1BMRA 4K43A 1QTMA 3AA2A 1KTQA 3NBPA 3VQ7A 4AM7A 4KBOA 3HJFA 1HYSA 4E1MA 3BEXA 3KOZA 1BDGA 3SAFA 2FSJA 4CFBA 3QINA 2HNDA 4ISGA 3K0SA 3I55N 2ASMA 1VSHA 3PX0A 5CY0A 4BRNA 4JI6K 2Y1IA 4YOUA 3P1GA 4CGDA 4WQ5C 2P9UB 5AQWA 5AZJB 3V9SA 3DRSA 4BR0A 4FWPA 3QEIA 2HHSA 4OPKA 4FSVA 3NMUA 3EO3A 1LAVA 1OH5A 3OS2A 3SYZA 1BK8A 1TK0A 1VQON 4GKKK 4JRPA 3TTCA 4BWMA 2QWOA 2VQEK 1DLOA 4CHNA 2CGKA 4O0JA 2Q31A 3KTQA 1HUXA 4H0OA 3VQPA 4CIFA 4FOIA 1NGGA 4ISFA 4N41A 3MN9A 1NGEA 4DTNA 1GLCG 1HRHA 2VGMA 1IKWA 3QICA 2WUSA 3FZKA 1ZYVA 2GWKA 3LP0A 2V51B 1BOTO 4CGHA 2D0PA 1QSSA 3H08A 3TTDA 4H5WA 3AA5X 3TARA 2F7TA 3C65A 5M1NA 3DM2A 2QKKA 5AR0A 2HBLA 3V6DA 1NK7A 1IKXA 3DXKB 4N5SA 1NKEA 2GX9A 3CCJN 2VWJA 4FJ8A 4DU4A 1TYQA 4M45A 4BR7A 2HHHK 1ATRA 1I39A 4YORA 3HPOA 3LP3A 3W3DA 4B9SA 2X6SA 4I6MA 1BQNA 5AQFA 3KLFA 4QAGA 3QETA 1HKGA 4RG8A 2E2NA 1BCMA 1C0TA 1VSDA 2YHXA 1WSFA 5C15A 4KTZA 2E20A 2SN3A 1DJTA 2JWLA 4DHYA 5EY4A 2KYQA 4B8AB 1XC9A 4DMNA 5AQOA 1X9MA 3NVKA 3MEEA 4BRPA 3L56A 1CLQA 2YKNA 4KH4A 3CI5A 3OHRA 4BE1A 3LAKA 2QEXN 4QCLA 4BQZA 2W6LA 1BGXT 1NGFA 1DKGD 3O1BA 4FM1A 1VQKN 3DLHA 1T44A 2N66A 1XQSC 2Q2RA 3TAMA 4E0DA 2HHTA 4AF1A 4CW7B 1W9HA 4PQUA 3CJCA 5AZIA 2JLEA 4DV4K 1Y97A 3WNHA 2D56A 1K73O 3QB0A 4BC3A 3FFKB 4FOEA 4FWLA 3ULEB 1VK0A 2F4VK 2DTUA 2UXBK 3VOVA 3BP8A 5AQIA 3OYDA 1T1TA 1HPZA 4FWKA 5TKWA 4BG9A 1L3TA 2KBHA 4C8OA 3T3FA 3KD1E 1X9WA 1C55A 1T6DA 4MO4A 4FJ5A 4Y1DA 4KHYA 4YY3K 2WBNA 4NCGA 1S9EA 1ITGA 3A5MC 3CCMN 3D2FB 2QTDA 3DI6A 3TSQA 4FJNA 1RDWX 4HUEA 1CXUA 4EZ6A 1Q82O 2O8CB 1NGDA 4NYNA 4GV9A 2NRXA 1VQPN 4M3UA 2ZGYA 3HOSA 3H1VX 2LSNA 4FWNA 4IXCA 3V1QA 2P9SB 1T7BA 4AEIA 3AVJA 4IO8A 1WAFA 4JI5K 4DQPA 3N4PA 3THXA 1NJWA 3OTOK 4CJTA 3SQ1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1S6Q A;  2QWN A;  3KLE A;  1JXE A;  5KQD A;  2GWJ A;  3O9U A;  2KQ2 A;  2YNF A;  3O9R A;  1YUW A;  5JVH L;  4KB0 A;  3MWT A;  4NYF A;  4CZI A;  1WAJ A;  1Z25 A;  2QW9 A;  4BVO A;  4Z4C A;  4DB3 A;  3ZSY A;  1CHZ A;  3FGU A;  2ZWH A;  4IG0 A;  4BRA A;  1JLB A;  1EQY A;  4CF9 A;  4KRF A;  4J2D A;  4F3O A;  1NBW A;  1I2V A;  1SS6 A;  4I9Q A;  5AQU A;  4YOX A;  3N4Q A;  1NGH A;  1BU6 O;  4FPA A;  2HST A;  4JI0 K;  2UUB K;  3S3M A;  5FRO A;  4I2Q A;  2ETJ A;  5AQT A;  1XMO K;  1KVB A;  2RN2 A;  3OYG A;  3VN5 A;  5J2Q A;  5BN9 A;  1UOC A;  4WFA L;  3THX B;  2NRR A;  3SCX A;  1KRP A;  4BE2 A;  3UIQ A;  5F1X A;  3RR8 A;  3J80 O;  3ULE A;  3ZSX A;  3AVM A;  2E2O A;  3V9W A;  4YNQ A;  3MAQ A;  4OPA A;  4QOZ B;  1P90 A;  1HKC A;  4FJ7 A;  4FXD A;  4DTO A;  3OA9 A;  4PWD A;  1HKB A;  4DV7 K;  1NRA A;  5BRE A;  3G25 A;  1WBD A;  3R3L A;  3JSM A;  4DV6 K;  3CHW A;  4AHU A;  4KO0 A;  3C6A A;  3D2F A;  1QVG M;  1ZVG A;  4IEE A;  1QZ5 A;  4RCH A;  5HRS A;  4DR7 K;  4H0P A;  3BUZ B;  1PX9 A;  1RFQ A;  3PIO L; 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