5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
2HF4A 4WQ4C 1YXQA 4B1YB 2ITMA 4FWKA 3D2FA 2IVNA 1NLVA 2HMPA 4JHDA 2E2QA 3DXMB 3VGMA 1GLBG 2H3GX 3HBTA 2ASOA 5BREA 2E1YA 3QDKA 3DAWA 3WQTA 4BC2A 4MO5A 3M1FA 4JD2A 3LDQA 2YHWA 4IZ9A 5BR9A 1KAXA 1IJJA 2P9UA 3O1BA 3VGLA 2GWKA 4L3QA 2D1KA 4JNEA 4WQ5C 4Y0WA 3ZX3A 1NGDA 3ENHA 2E8AA 3H1QA 2YJFA 4BRHA 1HPMA 2ZGZA 3AAPA 3DWLA 4AM6A 5BPMA 1K8KB 3KHYA 5AQWA 1HKGA 3CJ1A 5LY3A 4H5WA 4BRCA 1WOQA 2HOEA 5FPEA 3MN5A 5BN8A 3FZFA 5AFUA 3FZHA 3HTVA 4ISEA 1SZ2A 3FZLA 1BA0A 2V51B 3J8AA 2FSNA 3LDOA 3VETA 1ZXOA 2GELA 3BF1A 3TPQA 1TYQB 3I8BA 3GBTA 3H6EA 4QS8A 4FWNA 4YDUC 1TUUA 2ASPA 4IWVA 5E26A 4BRQA 4H0PA 3AAQA 3DXKA 1YVNA 3WUHA 4H0OA 4CZHA 3ZEUA 1T6DA 4M7XA 4IJNA 3S41A 2P9PB 1P8ZA 4BRKA 4H5NA 4BG9A 2P9KA 4CZFA 5E84A 3FZMA 4CD3A 3WXLA 4CZGA 3LDLA 5EX5A 3P4IA 4LC9B 4PL8A 3GE1A 2FF3B 5AQFA 5JLFA 3TU5A 3A0IX 3UE5A 2P9NA 4BR2A 1X3NA 3LL3A 4A62A 3HZ6A 4M63C 3EN9A 1BO5O 3LDNA 2F9WA 2ZGYA 3VF2A 4BR0A 3GG4A 3HM8A 3CHWA 3MCPA 5KPRA 4BC4A 5AQTA 5AZJB 4BRIA 2PBDA 4DCHA 1BUPA 4CZEA 4WQ5A 4EHUA 4NO7A 4BC3A 1QQMA 4K25A 3QBWA 2BTFA 4ISFA 3UKUB 2Q1NA 2ZWHA 3VEZA 2FSJA 4QS7A 4H0YB 1V4TA 2A3ZA 3BP8A 4HTLA 3ZX2A 1NGHA 1YUWA 4I6MB 2FSKA 1KAYA 3O6WA 3ENOA 1MWMA 4HWIA 3FR0A 4YDUA 1DEJA 5TKYA 3VF4A 3FLCO 2CH6A 1U2VA 5AQGA 3UKRB 4BR7A 2A41A 3OHRA 3CQYA 4CZMA 3CERA 3U4LA 2PAVA 3CETA 4FWOA 1BWFO 2P9PA 3FGUA 3ZETB 1NM1A 4RTFD 2FXUA 5FPDA 5BPNA 4B9QA 2A42A 1E4FT 3GL1A 3U9DA 4BREA 1XQSC 2NZTA 3AARA 3ATVA 3KZBA 2UYTA 2HF3A 3A5MC 4BR4A 2NRHA 3WXIA 3F9MA 1QQOA 2Q36A 4MLHA 3RSEB 2P9LB 4BRGA 3QFPA 1NGBA 1ESVA 5AQHA 4BR5A 5KPTA 3O4WA 3CI5A 1BOTO 3VPZA 4FOIA 4CBUA 1D4XA 3DJCA 4CZIA 3D2EA 4BR9A 3IUCA 1BG3A 1MWKA 1NGFA 1NGIA 5EY4A 4F9OA 4BRAA 4RWTA 4E1JA 4BRNA 5AZIB 3O8MA 5JLHA 1JCFA 1QQNA 2Q97A 4K41A 4FWSA 1DKGD 1ZC6A 1KXPA 3IMXA 2OANA 2ZF5O 3BUZB 2QWNA 2CGJA 2Q0UA 3LM2A 1C0FA 1OKJA 5AR0A 2CH5A 3VENA 5AQSA 5BPLA 5F1XA 1GLLO 4H0VB 3WEEA 4BRFA 4CBXA 1EQYA 4EHTA 4BRPA 5AQIA 5AQYA 3ULEB 4FWMA 4KBOA 2P9SB 5LJVA 3H45C 3QB0A 3UKRA 1NGAA 4A2AA 3A8YA 2A40A 1HLUA 5BRHA 4BVOA 3O5BA 3VF6A 1U6ZA 3C7NA 5F0XA 1XC3A 2V52B 4BGAA 3QICA 1GLFO 4XEIA 2P9IA 3FZKA 1GLDG 2GEMA 2Q0RA 3EKSA 2QM1A 1HUXA 4H0XB 3DXMA 2W41A 3R9PA 4CZLA 2QXLA 3CJ9A 2VWBA 5ELZA 2E1ZA 2P9LA 4CZJA 3I33A 1BA1A 3ID8A 4Z94A 4CBWA 2QWOA 3D2FB 1MA9B 4B1VA 4JHDB 2IVOA 2FF6A 1LOTB 5F2RA 5AQXA 5I9EB 2AP1A 3L6QA 4H0TB 2QWPA 3JS6A 3BF3A 1GLEG 4BC5A 2QWQA 3VERA 5AQZA 1V4SA 1QZ5A 1K8KA 5ADXH 3EL2A 3O1WA 1S3XA 1HX1A 5AQPA 2P9UB 2IIRA 3W3DA 2E2PA 4B1WB 5AQLA 1C0GA 3VGKA 1TUYA 3MMVA 2BUPA 3R8EA 3A5LC 1SAZA 3MDQA 1G99A 5AQJA 1NBWA 1YAGA 1JCEA 1Y64A 5B8HA 2QWMA 1TYQA 3CJAA 4FOEA 4BGBA 3HI0A 1BDGA 3D7EO 3LDPA 1GLAG 3L4IA 4IJAA 1S22A 2YHYA 4PKGA 3CJBA 4A61A 1HJOA 5AQKA 2EWSA 3CJ7A 5EOYA 4BG8A 2E2NA 3B8AX 5FPNA 3GOIA 1BU6O 4GNIA 1NGEA 5KQDA 4RCHA 1T6CA 1JCGA 3VEOA 2VYPA 3WT0A 2GWJA 5AQNA 1XUPO 3ZEUB 4BRDA 3A5NC 1WUAA 4CI6A 2WUSA 2P9KB 3MN6A 4H5RA 3IDHA 5KQ8A 4FSVA 3ZX0A 3A5OC 1RDWX 5ADXA 4FWPA 4CZKA 3SLCA 4FL9A 3U8XA 3SJHA 2FLOA 4XH5A 3O08A 5KPZA 5BRDA 4K42A 1ATSA 5BRFA 2D0OA 4XH1A 4EAHD 5AZJA 5LJWA 4WYBA 1LCUA 1GLCG 2P9NB 4J8FA 2D0PA 3H3OB 4MLEA 3SMPA 2Q2RA 4BROA 3O80A 4DB3A 3WXKA 3UKUA 2QWRA 1ATRA 2E88A 3QMLA 3W0LA 1Q18A 2Q31A 3IFRA 4I6MA 3G25A 3VEXA 2V7ZA 3EO3A 5AQQA 4EIAA 4H5VA 4IO8A 3H1VX 2A6AA 4JAXA 3H46O 4CJ7A 4A2BA 4B1UB 1X3MA 3WXJA 1ATNA 3M6GA 1NGCA 2VCPA 4FPAA 4B1XB 3EKUA 3HSCA 3ZETA 5JMVA 4M7YA 3VEYA 3GDQA 5AQMA 5AQVA 4FWQA 3CQXA 4FPBA 1T44A 2DPNA 1U2VB 4NB4A 4FWLA 1CZAN 3ATUA 2I7NA 3QFUA 3M3ZA 1IG8A 2QW9A 1RGIA 1MDUB 1R59O 3VEWA 3VEVA 3SK3A 4DHYA 2YCHA 2KHOA 3EZWA 3RSEA 3UB5A 3JXUA 4C23A 1NWKA 3H3NO 4QS9A 5EXWA 2QWLA 4AM7A 3WQUA 2GUPA 4H5TA 4BVPA 3LM9A 4IXCA 4WQ4A 3SMSA 3CJCA 4GY2B 1NGJA 2CGLA 2E20A 4JD2B 5FPMA 1E4GT 4H03B 2CGKA 4JN4A 5AQUA 4B1ZA 2AA4A 2I7PA 2YHXA 4MO4A 5AZIA 4FWRA 3U9ZA 3D2EB 4BRMA 1QZ6A 3AY9A 3KVGA 3BEXA 3VOVA 3QBXA 4DQ8A 5AQOA 3MK6A 4XH4A 1SQKA 3L0QA 1HKBA 1NMDA 2YI1A 2V7YA 3VESA 4O8KA 1X9JA 3R6MA 4PKIA 1QHAA 4FO0A 3FE1A 5BN9A 1Z05A 2NLXA 1NGGA 2F9TA 3ULEA 2GTDA 1HKCA 2P9SA 1GLJO 2J4RA 4BQLA 3MN7A 3MN9A 2A5XA 3DXKB 4PKHA 5EVZA 5CE3A 2D4WA 3C0BA 4K43A 4ISGA 3WEEB 2YJEA 4PL7A 1H1VA 4BQZA 5AFUH 2W40A 4CD1A 1KAZA 2ASMA 4EFHA 5AQRA 2E2OA 1DGKN 4BRLA 2IVPA 3FFKB 5JICA 1Z6RA 1J6ZA 4O5FA 3C7NB 1RFQA 3CIPA 1ZBSA 2P9IB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DV7K 1JL1A 4FWKA 1T1TA 2IVNA 1NK8A 2HMPA 2Z1IA 4JHDA 2E2QA 1VQON 2XY8A 3VQCA 3VGMA 3SAGA 2RHKA 4Q0BA 1L4VA 2ETJA 4Z4FA 4JD2A 2YHWA 4CHYA 5BR9A 3O1BA 1NK5A 4UQGA 2PYLA 5MLCQ 1JXEA 4JNEA 4Y0WA 2KFZA 2Z1JA 3ZX3A 3ENHA 3SUNA 4OLAA 1IO2A 1ASWA 4DF4A 2ZGZA 3AAPA 4KAZA 3DWLA 2LT8A 3SQ4A 3KHYA 3CJ1A 4CHQA 5DM6L 5FPEA 1IKXA 1I3AA 5BN8A 3I56N 2UUAK 4DTRA 2D0BA 3HTVA 3BZKA 4ISEA 1WBBA 4J2AA 1SZ2A 2V51B 4K8XA 3AVCA 4E89A 2ZJQL 2GELA 4LFBK 1B9FA 4QS8A 5JVHL 5E26A 2KFNA 4BRQA 1NRBA 3DOLA 3WUHA 2ZD1A 1J53A 4H0OA 2HNYA 1YIJN 3ZEUA 1T6DA 3ZSXA 2P9PB 3TAMA 1P8ZA 1S1WA 3RMBA 4WFAL 3KHWA 2P9KA 1ZUTA 4CEFA 5H1SQ 3FZMA 4AILC 4CD3A 3ZSOA 5M1PA 3AA5X 4J2EA 3QNNA 1R0AA 3P4IA 1TAUA 3GE1A 4M3XA 2FF3B 1IBMK 4DMNA 1TVRA 4Y1CA 3Q7CA 3UE5A 2P9NA 4LY7A 4JKAA 4JI1K 2N2QA 3K5OA 3LDNA 2F9WA 4BR0A 3LZJA 3CCRN 1WLJA 3GG4A 3CHWA 3MCPA 1D9DA 1POIA 5AZJB 4DCHA 3CC4N 1C1BA 1RBUA 4ILJA 4OX9K 4JV5K 3VQ9A 1GPTA 3THYA 4CIEA 3HK2A 3QBWA 3NE6A 4BECA 3UKUB 3SQ2A 2SN3A 2HBJA 3VEZA 1YI2N 5DM7L 2DY4A 2GV9A 4L8RB 3U6FA 3C94A 3ZSZA 2EHGA 4I6MB 1YJNN 2F4VK 2FSKA 3O6WA 3ENOA 2Y1JA 3VF4A 3FR0A 5TKYA 1DEJA 3I55N 3QESA 2YNFA 5GAGP 3KD1E 2OPRA 3D6RA 5AQGA 3UKRB 3KWIA 4BR7A 2UXDK 4CZMA 3AGKA 3U4LA 3NH1A 1S9GA 5M1OA 1NM1A 2HB5A 1E4FT 4BREA 1XQSC 4X64K 3PY8A 3KZBA 5M1FA 4Z4GA 1NOZA 3B6OA 3A5MC 1VAZA 3RR8A 1RNHA 1S6PA 4BRGA 2KLAA 2JDQD 4Y1DA 1NJXA 1RDAA 5CZ1A 5AQHA 4DQSA 3V9UA 3BDPA 1ZBUA 3IKMA 3CI5A 2C1IA 2N66A 3NH2A 2KQ2A 1JJ2M 1WSJA 1WMTA 4OKJA 1BG3A 1MWKA 2W6KA 3ASMA 4F9OA 3SQ0A 1RBSA 1PTXA 4E1JA 3QINA 1ITGA 5DK5A 2Q97A 4CHNA 3PSIA 4FLWA 3ZSRA 3ZCMA 4FWSA 2ZF5O 3BUZB 3V9WA 1TK0A 3LM2A 1YT3A 1OKJA 1NRAA 3AV9A 4JRQA 1BK8A 2IDOA 3VENA 1T7EA 1GLLO 4H0VB 3WEEA 4CBXA 2E5LK 1K8AO 4BRPA 1VSIA 3CYGA 1PE4A 2O8BB 1TKDA 2VG6A 3ULEB 2FBVA 4FWMA 2P9SB 3VQDA 5LJVA 1BQMA 3IS9A 4FJ8A 1HYZA 1NKBA 4AEIA 1LAWA 3HVRA 3CCUN 3NF7A 3AA2A 1BHLA 4CJQA 1VSHA 3VF6A 1DJTA 4BGAA 5GIOA 1VSMA 3DYAA 3PX6A 2Z1HA 3AO2A 1LV5A 4E7JA 1HUXA 1BL3A 4FZXC 4H0XB 2W41A 3T1AA 4JEPA 2KZZA 2QXLA 1OH7A 1VRUA 3DLGA 3AVFA 2E1ZA 1SKRA 4CZJA 1D5AA 3ID8A 2QWOA 3MX2A 4B1VA 3NAEA 3M8RA 2O8DB 1RT1A 4JHDB 2YIPA 4GKJK 5AQXA 4AAZA 2ATBA 4AHCA 4ID1A 2AP1A 4UAEF 4BC5A 2D56A 1V4SA 1WSHA 3KK7A 1K8KA 5ADXH 2BDPA 3O1WA 1HX1A 4OVLA 3W3DA 4CGIA 3ISNC 1WWNA 3AA4A 5CY4A 3VGKA 4WFNL 3D45A 4DTSA 1SAZA 3TAGA 4OPKA 4B9LA 1QSSA 3NBPA 5B8HA 4YHHK 1W0HA 4JI8K 3CJAA 3CFRA 3AVIA 4DSFA 1ZYVA 3D7EO 4O0JA 4IDKA 3T1YK 2PFUA 1JLCA 2YHYA 4A61A 1ASVA 2EWSA 4E1MA 5TKWA 4BG8A 4DR7K 4RW6A 1BIZA 1BU6O 1NGEA 5KQDA 1T6CA 3ID6A 1JCGA 3WT0A 3ZEUB 5AQNA 4CEBA 4NYFA 4E3SA 1VQ8N 4RW7A 2P9KB 1WSEA 2HHUA 3A5OC 4GW6A 1WAFA 5ADXA 4E7KA 3SLCA 3NHGA 4RW8A 3U8XA 3TSUA 4M45A 3CMEN 1HNIA 3ENBA 2OCEA 1X1PA 3O3FA 2JLEA 3KTQA 2D0OA 4EAHD 4YY3K 4WYBA 1LCUA 2P9NB 2O8CA 3H3OB 4DB3A 2GBZA 1QHTA 3P1GA 2HHIA 3WXKA 4DTJA 4FM0A 1CHZA 2E88A 3L2UA 1C56A 3QMLA 3VA3A 2VY6A 3O9QA 2FC0A 3THYB 3CCSN 1LWFA 1KFDA 1TK5A 3HJFA 1NH5A 4AHVA 2YNIA 1IBLK 1B7DA 4CJRA 4H5VA 3H1VX 1EO1A 1U49A 4JAXA 4F3OA 4ID5A 2F8SA 1VSKA 4ZTFA 4LFCK 1FH3A 4CJKA 4B1XB 2BRZA 3EKUA 4OGCA 2VG5A 4ILGB 1S6QA 1EX4A 3QI7A 1LW2A 2RN2A 3CCVN 1RDCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DV7 K;  1JL1 A;  4FWK A;  1T1T A;  2IVN A;  1NK8 A;  2HMP A;  2Z1I A;  4JHD A;  2E2Q A;  1VQO N;  2XY8 A;  3VQC A;  3VGM A;  3SAG A;  2RHK A;  4Q0B A;  1L4V A;  2ETJ A;  4Z4F A;  4JD2 A;  2YHW A;  4CHY A;  5BR9 A;  3O1B A;  1NK5 A;  4UQG A;  2PYL A;  5MLC Q;  1JXE A;  4JNE A;  4Y0W A;  2KFZ A;  2Z1J A;  3ZX3 A;  3ENH A;  3SUN A;  4OLA A;  1IO2 A;  1ASW A;  4DF4 A;  2ZGZ A;  3AAP A;  4KAZ A;  3DWL A;  2LT8 A;  3SQ4 A;  3KHY A;  3CJ1 A;  4CHQ A;  5DM6 L;  5FPE A;  1IKX A;  1I3A A;  5BN8 A;  3I56 N;  2UUA K;  4DTR A;  2D0B A;  3HTV A;  3BZK A;  4ISE A;  1WBB A;  4J2A A;  1SZ2 A;  2V51 B;  4K8X A;  3AVC A;  4E89 A;  2ZJQ L;  2GEL A;  4LFB K;  1B9F A;  4QS8 A;  5JVH L;  5E26 A;  2KFN A;  4BRQ A;  1NRB A;  3DOL A;  3WUH A;  2ZD1 A;  1J53 A;  4H0O A;  2HNY A;  1YIJ N;  3ZEU A;  1T6D A;  3ZSX A;  2P9P B;  3TAM A;  1P8Z A;  1S1W A;  3RMB A;  4WFA L;  3KHW A;  2P9K A;  1ZUT A;  4CEF A;  5H1S Q;  3FZM A;  4AIL C;  4CD3 A;  3ZSO A;  5M1P A;  3AA5 X;  4J2E A;  3QNN A;  1R0A A;  3P4I A;  1TAU A;  3GE1 A; 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