5AQXA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqxA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqxA04
2HF3A 2CH6A 1NGHA 4PKGA 1LOTB 4C23A 4B1VA 5FPNA 5AQHA 3M3ZA 1KAZA 1XUPO 3DJCA 1GLFO 4O5FA 5AQVA 4WQ5C 3R9PA 1TYQA 2Q0RA 3R6MA 3WXIA 5AZJB 3D2FA 2NRHA 1K8KB 2QWQA 5AQGA 4FWKA 5AZIA 3HI0A 3GBTA 3ZETB 2NLXA 4MO4A 3O1BA 5CE3A 2FF3B 1SAZA 2P9NB 3QFUA 1H1VA 3VGLA 3VF6A 2QW9A 3OHRA 2E2OA 3HSCA 4M7YA 5JICA 3L4IA 5AQLA 1IG8A 3ATVA 4BG8A 2QWOA 2V51B 4JHDA 3B8AX 4J8FA 4BQZA 3FFKB 3QBXA 3LDOA 4FPBA 3CQXA 3VGKA 4BREA 1NBWA 3CI5A 5F2RA 3MN7A 3D2EA 1E4GT 3GOIA 3J8AA 4IJNA 3QDKA 3VF2A 2CH5A 4L3QA 4H0PA 4PKHA 2J4RA 4H0TB 3UB5A 5LJWA 1XQSC 2A5XA 5AZJA 3UKRB 3DWLA 2BUPA 3MMVA 2FSKA 3H3OB 4CZHA 3MK6A 1NGEA 3VESA 3VERA 1X3NA 3CJAA 5EX5A 4ISGA 3TU5A 1CZAN 5AQPA 4CD3A 5FPMA 1QHAA 4EHUA 1NWKA 3IUCA 1BG3A 4XH4A 5BREA 3FZFA 3EO3A 4CBXA 2P9NA 4WQ4A 4CI6A 2IVOA 4IXCA 5BRHA 3H1VX 4K42A 1C0GA 2PAVA 1YVNA 5AQMA 4BGBA 3A5LC 4BRPA 2Q36A 1BDGA 3WUHA 4H5TA 5AQTA 1NGFA 3RSEA 1SZ2A 3DAWA 4HWIA 4BR5A 5AQSA 4IJAA 5EXWA 4WQ5A 3GE1A 4H0XB 3VEWA 1BO5O 1GLEG 4XEIA 2I7NA 3MN9A 3UKRA 3M1FA 3LDQA 2E1ZA 1QQMA 2GWJA 3LDNA 4IZ9A 4A2BA 2DPNA 2P9LB 3SMPA 4BR9A 4BRLA 2F9WA 3ZEUA 4JAXA 3QICA 3EKUA 1MWMA 3WXJA 3EKSA 3KVGA 4H5RA 2P9KA 4JD2A 1EQYA 5EY4A 3MDQA 1HJOA 1ATRA 3C7NA 3ZX2A 4DB3A 3I8BA 3CHWA 2FSJA 2VCPA 1V4SA 4NB4A 3VEOA 3D2FB 3VETA 3EN9A 3P4IA 4ISEA 3BF3A 1QZ6A 1HLUA 1WOQA 4CZKA 5AZIB 3ENOA 2NZTA 1HX1A 5AQFA 1KAXA 2GELA 3WEEB 2UYTA 1DKGD 3CERA 2A41A 1NGBA 2PBDA 1DEJA 3TPQA 1QQOA 1JCFA 3LM2A 3FGUA 2P9LA 2YJFA 4E1JA 2GTDA 2IIRA 3WQTA 5JLHA 2QXLA 1QQNA 4CBWA 4JHDB 4FL9A 3O8MA 3LDPA 4JN4A 3L6QA 4MLHA 4DQ8A 5I9EB 4Y0WA 4K43A 2E88A 3FE1A 4BG9A 3D2EB 4RTFD 3DXKA 3I33A 3AY9A 3KZBA 2YJEA 2YHXA 2V7YA 3H6EA 2YHWA 5KPTA 4NO7A 3FZLA 4YDUC 3ZX0A 3L0QA 4BVPA 2QWNA 1Z05A 4IO8A 3VEYA 3VOVA 5BN8A 2ZWHA 3WEEA 4EHTA 1ATNA 3SJHA 3AARA 1BU6O 5AQNA 3VPZA 4BC5A 1QZ5A 3A5NC 1V4TA 2Q31A 4O8KA 5AQXA 3AAPA 1ESVA 2HOEA 4CZIA 5AQIA 4FSVA 4LC9B 1LCUA 3ID8A 5BRDA 1E4FT 1U2VA 3C0BA 2GWKA 4BR4A 3RSEB 3QFPA 3CJBA 4BRFA 3A5MC 3W0LA 4BROA 4CZEA 3CJCA 4CZFA 2A6AA 1MDUB 5LJVA 1GLBG 4RWTA 3SLCA 1JCGA 1C0FA 4FO0A 4HTLA 5AR0A 4DCHA 1P8ZA 2CGLA 4RCHA 5AFUA 3HBTA 3ZEUB 3S41A 3LDLA 4K25A 5JLFA 2YCHA 3BF1A 4FWRA 4CZGA 4ISFA 4BRAA 1TUUA 3CQYA 2P9SB 2P9KB 3SMSA 3FZMA 4JD2B 1WUAA 3O08A 4Z94A 2HF4A 3C7NB 5AFUH 3LL3A 5EOYA 4BRGA 3ATUA 3FZKA 2ITMA 1DGKN 3O4WA 3WXLA 3MCPA 4XH5A 4M7XA 2QWMA 3JXUA 1GLLO 3ENHA 3A5OC 3FLCO 1NGCA 4BVOA 3VENA 1Y64A 5E26A 3G25A 4BC4A 2D1KA 3IFRA 5BN9A 3O5BA 1YXQA 3O6WA 1NLVA 1X3MA 4CZLA 4YDUA 1OKJA 1GLAG 4GY2B 5AQYA 3BUZB 4B9QA 1HKBA 3VEZA 5JMVA 5KQDA 4H5VA 1KXPA 1GLJO 2ASMA 4EIAA 5BPNA 3H46O 2W40A 3W3DA 1RGIA 3U8XA 2E20A 2P9UA 1G99A 5B8HA 2A3ZA 2GEMA 2P9SA 5TKYA 5AQJA 4A62A 3DXKB 4H0OA 4FWQA 4QS7A 3SK3A 3QMLA 4BRDA 1Z6RA 1HKGA 3LM9A 2E1YA 2QWLA 3M6GA 4FWSA 1YUWA 4BRIA 2FXUA 5EVZA 4H0YB 5BR9A 1HUXA 2IVPA 4FWOA 4CJ7A 4BR7A 3GDQA 2Q97A 4JNEA 3QB0A 5F0XA 1NM1A 3U9ZA 3GG4A 2D0PA 1NMDA 1U2VB 3UE5A 3MN5A 3DXMA 5KPRA 1Q18A 2P9IA 2QWPA 1RDWX 1BA0A 4CBUA 3U4LA 2IVNA 3WXKA 4H5NA 4XH1A 1BWFO 1XC3A 4BC2A 4B1UB 3CJ9A 5BPLA 1BOTO 1NGGA 3H45C 1MA9B 3A8YA 3JS6A 1T6CA 4MO5A 4FOEA 4I6MA 2KHOA 2CGJA 5AQUA 3H1QA 2YHYA 1MWKA 4K41A 1JCEA 3IMXA 4PL7A 1NGDA 1NGAA 1TUYA 4M63C 2V52B 1J6ZA 2A42A 4FWLA 1NGIA 2GUPA 2YI1A 2Q2RA 1NGJA 3QBWA 2ASPA 2D4WA 1GLDG 3U9DA 1T44A 3HM8A 4BR0A 4H0VB 3WT0A 1ATSA 3EZWA 1BA1A 3ZX3A 3CJ7A 2P9PA 1U6ZA 1IJJA 2ZGZA 3WQUA 5AQZA 3MN6A 3HTVA 2Q1NA 1S3XA 2HMPA 5F1XA 1KAYA 4CD1A 1HPMA 2P9UB 3F9MA 3VF4A 4CZMA 2E8AA 4BRQA 5AQWA 3VEVA 4B1WB 3ULEB 5AQOA 3EL2A 2AA4A 1GLCG 4BRMA 3O80A 4BRHA 1R59O 2AP1A 2QM1A 3UKUB 1K8KA 4FWNA 4EAHD 3AAQA 4AM6A 1RFQA 2FLOA 1X9JA 5BPMA 3FR0A 2VYPA 3IDHA 2VWBA 4FPAA 3ZETA 4A2AA 3HZ6A 5BRFA 4WYBA 2ZF5O 5ADXA 4BR2A 4GNIA 1T6DA 4PKIA 5AQRA 1ZBSA 4H03B 2V7ZA 5E84A 5KPZA 3H3NO 3DXMB 2Q0UA 5ADXH 3CIPA 2E2PA 4BGAA 2P9IB 2E2QA 4PL8A 3CETA 3ULEA 4QS8A 3O1WA 2D0OA 4BRNA 5ELZA 2FF6A 2QWRA 4EFHA 2F9TA 5KQ8A 3UKUA 4FOIA 1D4XA 5AQKA 4BC3A 2H3GX 4B1ZA 1SQKA 4I6MB 2EWSA 4F9OA 1ZC6A 3R8EA 2FSNA 2I7PA 5LY3A 4B1XB 4BRCA 1YAGA 4FWMA 2W41A 2A40A 3VGMA 4BQLA 4B1YB 1HKCA 4A61A 1TYQB 4BRKA 4KBOA 4QS9A 4H5WA 5FPDA 3FZHA 5FPEA 4MLEA 4DHYA 1ZXOA 2ZGYA 4FWPA 3A0IX 3BP8A 2WUSA 1BUPA 3CJ1A 4AM7A 2ASOA 4CZJA 2P9PB 1S22A 2OANA 4WQ4C 3GL1A 2BTFA 2E2NA 3KHYA 2CGKA 3D7EO 3VEXA 5AQQA 4IWVA 3BEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8DA 2HF3A 3SUOA 4HHTA 4W5QA 2NRVA 1LOTB 3OTOK 3HM9A 3CCEN 4C23A 4B1VA 4CIGA 5FPNA 3THYA 5AQHA 4H4OA 1XUPO 3AVCA 1CXUA 4WQ5C 3R9PA 2FBYA 1B9DA 3CW4A 3ZSWA 5AQGA 1O13A 1DT9A 4JI2K 3HI0A 2O8EA 3SV3A 4CW7B 3LPUA 2LY5A 2NLXA 3ZETB 4JKAA 3OYJA 4E7LA 4CGGA 2ZJRL 3VQ7A 5M1KA 2P9NB 1H1VA 2HHTA 3OHRA 1SN1A 1RBTA 3QNOA 2A1SA 2JLEA 4BG8A 2QWOA 3SAFA 4GVEA 3B8AX 4CGDA 3E01A 3LDOA 3KK7A 2HB5A 3OS1A 5J1EA 4FYDA 3CI5A 5F2RA 1NK4A 1E4GT 3GOIA 3AVJA 1XI1A 3O3HA 3VF2A 3UB5A 3E9OA 1POIA 3LZIA 3RR8A 3MK6A 4JYAK 1WSJA 1S72N 2W00A 2Z1HA 4DFMA 4RG8A 1CZAN 5AQPA 1NK8A 4XIUA 4B3SK 1IKWA 5EU7A 4CBXA 4WQ4A 1BQNA 4F8RA 4IXCA 4FM0A 1BIUA 4CF9A 3A2FA 1TKXA 5FRMA 4DTXA 1HJRA 4JKGB 1C0GA 4HVJA 3OBYA 3CXCM 1VNBA 1YVNA 1VQNN 2OPQA 3PO5A 4EP4A 3DMJA 1OH5A 2QK9A 2PY5A 5AQTA 1VQ5N 3PX0A 1Q82O 3R1XA 4W5OA 4CEZA 4NCBA 3OYNA 5EXWA 2OZSA 3H08A 4QAGA 2I7NA 1B92A 3HPGA 1QQMA 4IZ9A 3SPZA 3SBGA 2C1GA 2P9LB 3NF6A 3ZSRA 3G4SN 1EWRA 2YKMA 1JXBA 3SMPA 1ZVEA 5GAEP 4KTZA 5JS1A 4JKHA 4F3OA 3EKSA 3KVGA 4JD2A 3K0SA 3C7NA 1ATRA 3ZX2A 3O3GA 3I8BA 4KI4A 3CHWA 4C1NI 3SF4D 4WF9L 2HHSA 3VETA 2RF2A 3EN9A 1X9SA 3BF3A 1WOQA 1HX1A 3TTFA 3WEEB 2NUBA 3OS2A 1DQ7A 1GPTA 1HNIA 2PBDA 2OYQA 1Z26A 1I6GA 1QQOA 1JCFA 3NHGA 2KBHA 2VGNA 4E1JA 4DTSA 2GTDA 3K57A 2QXLA 4CFCA 3O8MA 2W6KA 3PV8A 1DTQA 4MLHA 2D56A 2O4GA 4JLHA 4KREA 4BG9A 3DXKA 3AY9A 4AHVA 3V4IA 3H6EA 4CHZA 4FJ7A 3FZLA 2D0AA 4DLGA 4IO8A 2B4JA 3OYMA 4PA1A 1RT7A 4EHTA 4CK1A 4AHRA 4WFNL 1BU6O 4BC5A 5HL7L 5J2MA 1Q9YA 2Q31A 4DQQA 2KZMA 3TSUA 4FJHA 4DSLA 1NPIA 4FSVA 1E4FT 3DI6A 1FKPA 1OMYA 4O8UA 2RKIA 3V1QA 3OYCA 3RSEB 2GBZA 3OYEA 3CJBA 1VRUA 5SZTA 4ELTA 1JXCA 3MEGA 3E9LA 3ASMA 1SL0A 1MU2A 4PQUA 1P90A 2A6AA 4WCEL 1SKRA 3DRSA 4DU1A 2YIOA 4O55A 3SLCA 1JCGA 3TAFA 3WNHA 4HTLA 4JRPA 2HW3A 4DTPA 2LR3A 5AFUA 1I6FA 5JLFA 4Y1DA 4CZGA 4DV2K 4FJ5A 5IWAK 1JLAA 4BRAA 1TUUA 4HUEA 5JENA 2HBLA 3O08A 4B9MA 3O9RA 4DV7K 2WOMA 2B3CA 2A1RA 1DGKN 1TKTA 3L2RA 3WXLA 4E7IA 4DUYK 1EXQA 4ILJA 2KFZA 3ENHA 4CEEA 3PSIA 4BVOA 1Y64A 3DLBA 1YXQA 3QEIA 1ASWA 1BMRA 1NMNA 3P83D 1RCHA 2NRXA 3C6UA 4UADE 4OPHA 4OPJA 3ISNC 4YDUA 4GY2B 3VQBA 2PZSA 1GLJO 2KBKA 4PUOA 1RBRA 3H46O 2W6LA 2W40A 4CJQA 3W3DA 1C0TA 3VQPA 1G99A 4I2QA 5B8HA 2A3ZA 1TKDA 4Z4GA 1T1TA 3C6TA 3U3YA 3VQ6A 2DFHA 4W5TA 1RTDA 3G6EN 2F96A 1YJWN 2ITGA 3CCSN 4LSLA 3JSMA 2R7YA 1HKGA 3U6FA 1U4BA 1VQ4N 4IEIA 4FWSA 1HYVA 5EVZA 4H0YB 3DLKA 1UA0A 3QNNA 1KRPA 3QB0A 1T3VA 4W5RA 1SL2A 3SZ2A 1VSHA 4DR2K 2FC0A 4J2DA 1NMDA 2BDPA 1WAFA 2HHUA 4X64K 1RDWX 4CBUA 2VWJA 4OLBA 3NAEA 1TK8A 2KFNA 2IVNA 3V9WA 4BC2A 1BWFO 1XC3A 1SKWA 4A5AA 4Z4HA 5BPLA 4ICLA 3H45C 1MA9B 1SS6A 3A8YA 1VQ7N 1JLFA 1S1TA 4I6MA 2LJMA 4I9QA 1HQUA 3IMXA 3THXA 4PL7A 2F4VK 4CIFA 3KLFA 1ITGA 2HBMA 4AEIA 1IV0A 2IGIA 3AVHA 4V1DC 3RMDA 1GLDG 5SWMA 4FM2A 2OPPA 4KB0A 4DR4K 3HM8A 4BR0A 3SNNA 1XNRK 3ZX3A 2P9PA 5I42A 4CEDA 1A5VA 2YNGA 1JL1A 1IJJA 2RPIA 1NKEA 1WLJA 5AQZA 3R3LA 1KAYA 4CIEA 1HPMA 3VF4A 4BRQA 4N41A 4CESA 5AQWA 3VEVA 3MWPA 3ULEB 1VQ9N 4DR7K 3PO4A 5CR4A 1RT1A 2AA4A 1GLCG 3CG7A 4N5SA 1R59O 3CD6N 3SUPA 2AP1A 4FW1A 3TAMA 3SPYA 3S9HA 3IDHA 3CM6A 2XY6A 3LP3A 3ZETA 4WYBA 3IS9A 5KTQA 5CYMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2O8D A;  2HF3 A;  3SUO A;  4HHT A;  4W5Q A;  2NRV A;  1LOT B;  3OTO K;  3HM9 A;  3CCE N;  4C23 A;  4B1V A;  4CIG A;  5FPN A;  3THY A;  5AQH A;  4H4O A;  1XUP O;  3AVC A;  1CXU A;  4WQ5 C;  3R9P A;  2FBY A;  1B9D A;  3CW4 A;  3ZSW A;  5AQG A;  1O13 A;  1DT9 A;  4JI2 K;  3HI0 A;  2O8E A;  3SV3 A;  4CW7 B;  3LPU A;  2LY5 A;  2NLX A;  3ZET B;  4JKA A;  3OYJ A;  4E7L A;  4CGG A;  2ZJR L;  3VQ7 A;  5M1K A;  2P9N B;  1H1V A;  2HHT A;  3OHR A;  1SN1 A;  1RBT A;  3QNO A;  2A1S A;  2JLE A;  4BG8 A;  2QWO A;  3SAF A;  4GVE A;  3B8A X;  4CGD A;  3E01 A;  3LDO A;  3KK7 A;  2HB5 A;  3OS1 A;  5J1E A;  4FYD A;  3CI5 A;  5F2R A;  1NK4 A;  1E4G T;  3GOI A;  3AVJ A;  1XI1 A;  3O3H A;  3VF2 A;  3UB5 A;  3E9O A;  1POI A;  3LZI A;  3RR8 A;  3MK6 A;  4JYA K;  1WSJ A;  1S72 N;  2W00 A;  2Z1H A;  4DFM A;  4RG8 A;  1CZA N;  5AQP A;  1NK8 A;  4XIU A;  4B3S K;  1IKW A;  5EU7 A;  4CBX A;  4WQ4 A;  1BQN A;  4F8R A;  4IXC A;  4FM0 A;  1BIU A;  4CF9 A;  3A2F A;  1TKX A;  5FRM A;  4DTX A;  1HJR A;  4JKG B;  1C0G A;  4HVJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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