5AQYA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
AKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKSTRAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqyA04
4WQ4A 2FSNA 3RSEA 4BRMA 4BC3A 1NGIA 4IZ9A 3D2FA 4JNEA 4H0XB 3KZBA 5AQQA 5AQFA 5AFUH 5AFUA 2IIRA 1NGBA 3GBTA 4XEIA 5AQMA 3LDLA 5AQWA 4M63C 4Y0WA 3EN9A 3D7EO 2ZWHA 3WXLA 2UYTA 1NGJA 5KQDA 1T6CA 5FPDA 4CD1A 4BRPA 2AA4A 4H03B 2HF3A 4B1YB 4RCHA 5JMVA 4BRLA 1XQSC 1QZ5A 2VWBA 2A40A 2YHYA 3O1WA 3P4IA 3H1QA 1DGKN 2ZF5O 1LCUA 4XH5A 3C0BA 3CJCA 4BQLA 2QXLA 4FWPA 3CIPA 5B8HA 1Z05A 1RGIA 4F9OA 3VPZA 5EVZA 3O08A 4K42A 4CI6A 1OKJA 2Q2RA 2FF3B 2YHXA 3KVGA 4XH4A 2D0OA 2P9KB 1BO5O 1BWFO 3MDQA 4FWLA 1D4XA 3UE5A 3DXMA 2BUPA 5BN9A 5AQOA 1YUWA 3SMPA 3H6EA 3CI5A 4BRDA 2QWOA 5AQIA 4IJAA 3R6MA 2QWMA 3D2EB 1WOQA 5AQLA 2W40A 2E88A 3HM8A 2W41A 3U9ZA 4EHUA 5AQNA 2Q31A 4BC4A 3GG4A 4B9QA 2FLOA 3MCPA 2QWPA 4EIAA 3SLCA 3FE1A 2PBDA 1NGAA 3FZMA 4DB3A 3ATVA 4FL9A 1LOTB 3QFPA 4BREA 3O1BA 5AQKA 1G99A 3EKUA 4M7XA 3QFUA 1NGCA 1BDGA 4JD2B 3FZHA 3BF3A 2IVOA 1HPMA 1YVNA 5BPLA 4FWKA 2ASPA 2E8AA 1NGGA 3QDKA 4BC2A 1XUPO 1Q18A 5KPRA 2HF4A 3B8AX 4B1XB 5AQSA 5AQZA 4FWNA 4IWVA 4BRHA 1TYQB 4MO5A 3ZX2A 1DEJA 2YHWA 1HUXA 3R9PA 3O8MA 1EQYA 3BEXA 1KXPA 1C0FA 3FZFA 2Q36A 1DKGD 4B1UB 4BR9A 3LDNA 2Q0UA 3MK6A 1NGEA 1T6DA 1CZAN 4CZKA 3UB5A 2GWKA 4DQ8A 1TYQA 3H1VX 3UKUB 2P9SA 4WQ5A 1X3NA 2ASMA 1NWKA 2CGJA 2QWRA 3VEOA 3AY9A 4NO7A 3CJAA 2P9UA 3HI0A 2ITMA 1JCFA 4BR5A 5JLFA 1QQOA 3ZEUB 2VCPA 4YDUC 2E2OA 3EO3A 2CH5A 4MLEA 3ZX0A 4CBUA 3UKUA 2A41A 1P8ZA 4DCHA 2P9PB 5E26A 2FF6A 4BQZA 4XH1A 3LDPA 2EWSA 2QWLA 1V4TA 4EFHA 3WXIA 4ISFA 2YCHA 3HZ6A 4H0PA 4H5WA 4ISGA 3ZEUA 1SQKA 3A5NC 2H3GX 2P9PA 2QM1A 4ISEA 5LJWA 2V51B 3FGUA 2CH6A 3WQTA 4O8KA 4I6MB 3EZWA 3GL1A 4BGAA 4BR0A 2GEMA 4DHYA 3VGMA 3L0QA 4CD3A 2ZGYA 2FSJA 3VF4A 3F9MA 2F9WA 3MMVA 2P9LB 1YAGA 4PKGA 2YJEA 4BROA 3DXMB 4PL7A 2GELA 2ZGZA 3WUHA 2BTFA 4PKIA 2GWJA 2DPNA 4I6MA 5BRDA 4FO0A 4BRKA 5BR9A 5KPZA 5ELZA 1GLFO 2PAVA 4E1JA 1V4SA 3DWLA 2Q97A 3HTVA 1GLLO 2P9LA 5BPMA 4H5RA 2GTDA 3EL2A 1IJJA 1RDWX 2D4WA 4IJNA 3QICA 4GY2B 5TKYA 3O6WA 3WXJA 2NZTA 4B1ZA 3ULEB 2CGLA 3FFKB 3FR0A 3H45C 3SK3A 5I9EB 3MN7A 1K8KB 5AQVA 2V7ZA 5JICA 3CJ1A 1HKBA 4NB4A 3UKRB 4FWOA 4CZIA 1QZ6A 4JHDA 4H0YB 4CZGA 3S41A 5F1XA 3WT0A 5ADXH 5ADXA 4A61A 1X9JA 4BRNA 4EAHD 2VYPA 3AAPA 5AQGA 3ULEA 1MWKA 1Y64A 1HLUA 5AQYA 5CE3A 5AQPA 1K8KA 3L6QA 4IXCA 2QWQA 3L4IA 3LDQA 2V52B 5LJVA 3UKRA 2IVNA 3M1FA 4BR7A 2YJFA 1BUPA 1XC3A 1NGDA 2V7YA 4MLHA 1KAXA 1NBWA 3A5OC 1RFQA 4WQ4C 3LM2A 3ZX3A 1MA9B 4H5TA 4QS7A 3WQUA 3QBWA 4BVOA 2CGKA 5E84A 3CQYA 3CJBA 3FZKA 3DAWA 3LDOA 3CERA 4JN4A 2P9SB 5KPTA 3O80A 3ID8A 4BRQA 1BA1A 2E2NA 1GLEG 3OHRA 3U8XA 1H1VA 1NM1A 2P9UB 2E1ZA 3M6GA 4M7YA 4CZJA 5AZJA 4BRFA 1GLAG 1NLVA 4GNIA 2AP1A 3BUZB 2P9IB 3CJ7A 2A5XA 4FWQA 5EOYA 1T44A 2HMPA 4CBWA 1TUUA 4BG9A 4AM7A 1YXQA 5AR0A 4BC5A 1ZC6A 3BP8A 5F0XA 2A42A 2YI1A 3BF1A 4A2AA 1GLBG 4H0TB 5BN8A 5AZIA 4A2BA 1MDUB 2E2PA 4CZEA 3CJ9A 5AQXA 2P9IA 4BR2A 3VF6A 5FPMA 4FPBA 2FSKA 3LM9A 1S22A 4PL8A 3GDQA 5AQUA 1HX1A 1ATSA 4FPAA 3A0IX 4Z94A 5BREA 5FPNA 3DJCA 4WYBA 3CQXA 2OANA 3U9DA 3FZLA 3WEEB 4EHTA 5EY4A 3I33A 2A3ZA 3O4WA 3SJHA 2F9TA 4RTFD 2QWNA 2NLXA 4CZMA 2FXUA 4J8FA 4K41A 1HJOA 1HKCA 2I7PA 4BRIA 1QHAA 3A5MC 2Q1NA 4H5NA 2P9NB 5EXWA 1GLDG 3U4LA 4CZHA 3HSCA 4MO4A 3VGKA 3HBTA 3G25A 3CETA 3VEWA 1ATRA 3TPQA 1SAZA 4QS8A 3WEEA 3AAQA 5AQRA 3IUCA 3JXUA 3A5LC 3DXKA 1BA0A 1Z6RA 1JCGA 1NGFA 2P9NA 4A62A 1IG8A 3VEZA 4BVPA 2E20A 3QBXA 3VGLA 3IFRA 5EX5A 4JAXA 1TUYA 5AQHA 4JHDB 1BG3A 3ENOA 1ATNA 1BU6O 2I7NA 3H3OB 1R59O 3EKSA 2A6AA 5AQJA 4O5FA 3VETA 4FOIA 1ZBSA 3SMSA 3VEYA 3VEXA 3M3ZA 3R8EA 2Q0RA 4YDUA 4CZLA 2D0PA 2KHOA 5FPEA 3VENA 4WQ5C 1NGHA 4LC9B 3MN9A 4B1WB 4CZFA 1ESVA 3VERA 1ZXOA 3LL3A 4C23A 4QS9A 4BG8A 4IO8A 4CBXA 1HKGA 4H5VA 5BPNA 4RWTA 3QMLA 1QQMA 3ENHA 4HTLA 3FLCO 2NRHA 1X3MA 3ZETB 3W3DA 4FSVA 2P9KA 2E2QA 2WUSA 5AZJB 3WXKA 2D1KA 2E1YA 3AARA 4AM6A 2GUPA 1NMDA 4FOEA 1J6ZA 3C7NB 2J4RA 1KAYA 3D2EA 2HOEA 4PKHA 1SZ2A 4K43A 3VF2A 1GLJO 3ZETA 3JS6A 1S3XA 5BRFA 3H46O 2ASOA 4FWRA 4FWMA 3W0LA 3MN5A 4FWSA 5AZIB 2IVPA 1E4FT 3IMXA 4B1VA 3A8YA 3C7NA 4KBOA 3O5BA 3J8AA 1U6ZA 1E4GT 1QQNA 1KAZA 5KQ8A 4BRCA 3VOVA 1GLCG 3GOIA 4JD2A 1JCEA 4BGBA 4BRGA 3VESA 3GE1A 4L3QA 1BOTO 1U2VB 2QW9A 3VEVA 3ATUA 1C0GA 4BR4A 4BRAA 3TU5A 5LY3A 5JLHA 4K25A 1WUAA 3CHWA 4H0VB 3RSEB 3D2FB 1MWMA 4H0OA 4CJ7A 5F2RA 3IDHA 3H3NO 3QB0A 5AQTA 1U2VA 3I8BA 3DXKB 3KHYA 3MN6A 5BRHA 4HWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TAGA 3FFIA 3EE8A 4JNEA 4H0XB 4KHUA 3KZBA 1FXXA 4YY3K 3GBTA 2D0BA 3VQ8A 4C8KA 5AQMA 4Y0WA 4M63C 4CHPA 3EN9A 1N32K 3AA2A 3D7EO 4HE7A 1NGJA 5KQDA 2GMOA 5FRMA 4CD1A 4J2DA 1I39A 1VSLA 3DOLA 4H03B 4CVNE 2E6MA 3OVNA 3ZSXA 2VWBA 3OYNA 3OYBA 2OYQA 2OTLN 2YEOA 1NPIA 5FROA 3VQEA 3H1QA 3PLAA 3LAMA 4KHPK 3B6OA 3QETA 2E2FA 1OH7A 3TSQA 4BWJA 2UU9K 1LQIA 1P00A 3CMEN 5B8HA 4U7BA 5EVZA 3O08A 3HJFA 3ZLJA 4LSNA 1LQHA 3KWIA 1OKJA 2FF3B 3OYGA 4KH6A 1VSEA 4FWLA 1BWFO 3CFPA 2I5JA 1GOCA 2IDOA 3UE5A 1I3AA 4LF8K 3NF9A 5BN9A 5AQOA 3SMPA 3O4NA 3R6MA 4IFYA 3E1YA 4I2QA 2UUAK 1TKTA 3D2EB 4RG8A 1ZFUA 3QEWA 1HQUA 1RT7A 4HVJA 1JLEA 5AQNA 3CFRA 3GG4A 3MCPA 1NOZA 2QWPA 3SLCA 1NGAA 1S1WA 5CR4A 4B3RK 3C6AA 3QFPA 3G71N 4KTWA 4BREA 5AQKA 1QHTA 3MEDA 3V81A 3MCAB 1C6VA 1PX9A 1RT5A 1BDGA 3FZHA 3K0SA 4XJXA 3WNFA 4CEQA 4J2BA 3CCRN 3QDKA 4B1XB 5AQSA 2N2RA 3ZT0A 2HB5A 2NUBA 1CXUA 1EETA 4AHVA 1VNBA 3ZX2A 1L3VA 2YHWA 3O8MA 3HOTA 4DFJA 4IFVA 4DR3K 1NH5A 1KXPA 2B68A 2WFBA 2Q0UA 2QEXN 3ULDA 4CF2A 1CZAN 4DSJA 1L4VA 3UB5A 4DQ8A 5H1SQ 1NJWA 2A1RA 4EZ9A 1CZBA 4FLUA 3M8PA 3VEOA 4NO7A 3KK1A 1XNRK 4DR5K 4BR5A 5JLFA 3J7YP 1QQOA 5KGXA 2A1SA 2E2OA 3EO3A 1SL2A 1P8ZA 3TTCA 4DCHA 5E26A 2HBMA 5HOOA 2EWSA 2QWLA 4LSLA 3V6DA 4EFHA 3AVMA 3CYGA 3HZ6A 3K9JA 1QE1A 1Q7YO 1I2VA 1NKCA 1SQKA 1BIZA 4CHYA 1NG9A 1WSIA 1IKWA 2V51B 4I2PA 3FGUA 2CH6A 3M8QA 1OH8A 1VNAA 2FBVA 4PQUA 1VSMA 2GEMA 1RT6A 4DV0K 4DHYA 4W5RA 1FJGK 2SN3A 5T7BA 4B9TA 4Z4GA 2F9WA 3HPGA 1YAGA 4KHQA 3ZYYX 1C0MA 3DXMB 1JXBA 1VQ8N 2GELA 2ZGZA 3KLEA 3SV3A 4NYFA 5HROA 2BTFA 3CCJN 5DK5A 1CZ9A 2DPNA 5DMRA 5KPZA 4AEIA 1V4SA 3K59A 2O8CA 5BPMA 4H5RA 1TK8A 3RMDA 4FJ8A 5SWMA 1J9AA 3ULEB 2CGLA 2YNHA 4HTUA 1ILYA 5GAGP 1W2BM 5JICA 4DSLA 4ILJA 3SV4A 4NB4A 4FWOA 3S5TA 3OBWA 1T7EA 2YC1C 4JHDA 1NMNA 1EX4A 4H0YB 3S41A 3THWB 4DV5K 3SPYA 2OZSA 4BRNA 4DWIA 4OPHA 4C8NA 5C25A 3ULEA 1HLUA 1T0ZA 3L4IA 4FZXC 1FH3A 2G8VA 1NOYA 2VG7A 3M1FA 2VG5A 2YJFA 1SKRA 4K8XA 1BUPA 4MLHA 4WQ4C 3ZX3A 2O4GA 1P0AA 4QS7A 2Z1HA 4BVOA 3KK7A 1WT7A 2ZM6K 2O8EB 3NFAA 2O8BA 1A5VA 4JS5A 4DR1K 4F2RA 4OO1J 3QINA 4JI1K 4BRQA 1BA1A 4I9LA 3DLLL 1R0AA 1H1VA 4CZJA 4Y1CA 1VSHA 3T3FA 2LY6A 4BRFA 1XWLA 2OPQA 3F2KA 1TKXA 4JKCA 2AP1A 1DT9A 3BUZB 4FJMA 5C12A 1JLFA 3HM9A 3RMCA 4DR2K 3CJ7A 4A5BA 4J2AA 2IS3A 5EOYA 2HMPA 4CGDA 3WNGA 4CBWA 4HHFA 3CM6A 4CHNA 1IO2A 4NXMK 4BC5A 3O9QA 4HUGA 2RKIA 1C0UA 3PO5A 2D56A 3K57A 3EZ5A 1Q82O 1UA0A 1MDUB 3HP9A 4DR4K 3CJ9A 4FYDA 1LW2A 3PX6A 4FPBA 4OPKA 3GDQA 4UQGA 4BACA 4DFKA 3A0IX 3I0SA 5FPNA 5CYMA 2LKBA 2OANA 5MLCQ 3FZLA 3KTQA 4EHTA 4W5TA 4B9VA 4KPYA 1UOCA 4RW4A 4RTFD 4BE0A 2FXUA 1HJOA 3Q7BA 2I7PA 4BRIA 4DU3A 3PY8A 4CJSA 4Z4IA 5JENA 2P9NB 3J81O 4FJGA 4MO4A 4DSKA 4AILC 1I6GA 3TPQA 4C1NK 4CK3A 3AGKA 2ZE2A 3A5LC 4DG1A 1JJ2M 3N4QA 2LT8A 4DLEA 4UJ0A 3NF8A 1YT3A 1JZAA 1KFDA 1SNBA 1Z6RA 3RVCA 1NGFA 5IWAK 2EX3A 2P9NA 1VQKN 4FJIA 3IRXA 3VEZA 2E20A 3T69A 1HNVA 4BDZA 4DUYK 1JLAA 4BE2A 5EX5A 4JAXA 1JXCA 2LN8A 3NMUA 4FLYA 4OGCA 5M1QA 2KFZA 3ENOA 4B3MK 4GV3A 1BQNA 4JEPA 3TTFA 4CJVA 2VGNA 3SMSA 2GX9A 2W6KA 3VQ7A 1CXQA 4DQIA 5FPEA 3LDSA 1NGHA 3MAQA 3F73A 3OYJA 3L56A 3AVAA 3OYFA 4CF0A 1VK0A 4BG8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TAG A;  3FFI A;  3EE8 A;  4JNE A;  4H0X B;  4KHU A;  3KZB A;  1FXX A;  4YY3 K;  3GBT A;  2D0B A;  3VQ8 A;  4C8K A;  5AQM A;  4Y0W A;  4M63 C;  4CHP A;  3EN9 A;  1N32 K;  3AA2 A;  3D7E O;  4HE7 A;  1NGJ A;  5KQD A;  2GMO A;  5FRM A;  4CD1 A;  4J2D A;  1I39 A;  1VSL A;  3DOL A;  4H03 B;  4CVN E;  2E6M A;  3OVN A;  3ZSX A;  2VWB A;  3OYN A;  3OYB A;  2OYQ A;  2OTL N;  2YEO A;  1NPI A;  5FRO A;  3VQE A;  3H1Q A;  3PLA A;  3LAM A;  4KHP K;  3B6O A;  3QET A;  2E2F A;  1OH7 A;  3TSQ A;  4BWJ A;  2UU9 K;  1LQI A;  1P00 A;  3CME N;  5B8H A;  4U7B A;  5EVZ A;  3O08 A;  3HJF A;  3ZLJ A;  4LSN A;  1LQH A;  3KWI A;  1OKJ A;  2FF3 B;  3OYG A;  4KH6 A;  1VSE A;  4FWL A;  1BWF O;  3CFP A;  2I5J A;  1GOC A;  2IDO A;  3UE5 A;  1I3A A;  4LF8 K;  3NF9 A;  5BN9 A;  5AQO A;  3SMP A;  3O4N A;  3R6M A;  4IFY A;  3E1Y A;  4I2Q A;  2UUA K;  1TKT A;  3D2E B;  4RG8 A;  1ZFU A;  3QEW A;  1HQU A;  1RT7 A;  4HVJ A;  1JLE A;  5AQN A;  3CFR A;  3GG4 A;  3MCP A;  1NOZ A;  2QWP A;  3SLC A;  1NGA A;  1S1W A;  5CR4 A;  4B3R K; 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