5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
3O1BA 4JHDA 2D4WA 3WT0A 2UYTA 3O8MA 1K8KB 3D2EA 2WUSA 3CJ7A 3GG4A 3H1QA 4YDUC 1D4XA 1YUWA 4AM6A 1ATRA 5AFUA 5BN9A 4A61A 2V52B 3CERA 4BRPA 1QQMA 3ID8A 3KZBA 2D0OA 1BOTO 3MN5A 2GUPA 2FSKA 5LJVA 3LL3A 5BN8A 1ATNA 3CHWA 3CJBA 3MMVA 5KQ8A 3FE1A 2A3ZA 3VEXA 3L4IA 3ZETA 1NBWA 2FSJA 3OHRA 4CZHA 2VYPA 3W3DA 3QMLA 4QS7A 3GL1A 1X3NA 2QWQA 5JICA 4CZFA 4C23A 1LCUA 3CIPA 4BR0A 3M6GA 3VPZA 4O8KA 3ZX3A 3WEEA 4KBOA 4BGAA 2GEMA 4BC2A 2Q31A 2A6AA 3ZETB 4BRQA 1YAGA 4H0PA 1JCEA 2BUPA 2P9IA 3QDKA 2V51B 3CI5A 3BF1A 2P9NA 3UB5A 1BA0A 4RTFD 4BRCA 1SZ2A 4CBUA 1X3MA 3GOIA 1KAXA 3FZLA 4A2AA 5BRFA 1JCFA 1HUXA 4CZIA 3CJCA 3QICA 1SQKA 3GDQA 1ZC6A 3EO3A 4CBXA 1NGCA 3G25A 3IDHA 1BO5O 1U2VA 3C0BA 3VERA 2P9IB 3EKUA 4B1XB 2VCPA 1NGHA 2E20A 3VGMA 3IMXA 1QHAA 3EN9A 2QWRA 2D1KA 4A62A 3O80A 3W0LA 3F9MA 3JXUA 3GE1A 3QB0A 1Q18A 5AQXA 4HTLA 1BDGA 4PKGA 4IJAA 3VF2A 1R59O 4GNIA 4BG8A 1NGDA 5AZJA 1Y64A 4FWNA 3RSEA 3H45C 1KAYA 1Z05A 1U6ZA 3J8AA 3WXIA 1BUPA 2VWBA 4J8FA 3U9DA 4B1VA 1OKJA 2DPNA 4H0VB 3ZEUB 4JNEA 2FXUA 3U9ZA 2V7YA 2W40A 3MN6A 4BRLA 1GLBG 5B8HA 1HJOA 2NZTA 1NGAA 5AQKA 4WQ5A 2F9WA 4BVOA 4L3QA 5BR9A 2QXLA 3HZ6A 3LDPA 2ZF5O 3EKSA 5AQFA 1T6CA 4FOEA 3SMPA 2GTDA 3O6WA 4BRGA 2CGKA 3GBTA 2QWMA 2F9TA 4CD1A 4Y0WA 2QWPA 3SJHA 3TPQA 3WXLA 5AQPA 2W41A 3TU5A 3M3ZA 1TUUA 4B9QA 1HPMA 2FF3B 1RFQA 5ELZA 3MN7A 3DJCA 1ATSA 2P9UB 4DB3A 3UKUB 2YHWA 4RCHA 1HKGA 3AAPA 3FZFA 4IWVA 4DHYA 4BR5A 3JS6A 1GLJO 5AFUH 4QS9A 5AQYA 2P9KB 2E2NA 3VEVA 2NRHA 2Q1NA 5AQSA 5BRDA 4ISFA 3A5NC 5AZIB 3QFUA 1E4GT 4B1YB 4BR4A 1TYQA 4JHDB 4H0TB 2HF4A 4ISGA 4CZLA 3D2EB 1WUAA 4BRHA 2CH5A 3MCPA 5BREA 4HWIA 2GELA 5KPTA 3O5BA 1JCGA 5BPMA 3U4LA 4CZMA 4M7XA 3MN9A 2Q0RA 1S3XA 5F0XA 5FPMA 3HI0A 2P9SA 1IJJA 4A2BA 1QQOA 2PAVA 5JLHA 1T6DA 2E2QA 3R6MA 5AQVA 2QWLA 1TYQB 2H3GX 4CI6A 4B1WB 3AARA 4BRNA 4BROA 4PKIA 4DQ8A 1V4SA 1NGJA 4CZJA 4XH1A 2ZWHA 5EVZA 4FWOA 5AQGA 4IXCA 3EL2A 3ATUA 3AAQA 3VF6A 3ULEA 1NGIA 1Z6RA 5AQRA 3KHYA 4ISEA 2FSNA 3WEEB 3M1FA 4MO4A 1HKCA 4WQ4A 3VEWA 4CZKA 3H3OB 3U8XA 1NGEA 3CQYA 1WOQA 1BA1A 2P9PA 2ZGZA 4H0XB 4O5FA 3BUZB 3ATVA 4PKHA 1NWKA 2CGLA 2P9NB 3L6QA 5KQDA 5AR0A 4FPBA 4BC5A 4FWLA 3VEYA 3UE5A 1XC3A 2YHYA 1QZ6A 3WUHA 2A40A 4RWTA 4NB4A 3QFPA 5JMVA 4E1JA 3P4IA 1CZAN 2J4RA 1HLUA 4JD2A 3WXJA 3R9PA 1H1VA 3VENA 4BGBA 1U2VB 3UKRA 5AQWA 1EQYA 2FF6A 5AQMA 1ZBSA 2GWKA 3CQXA 1GLDG 2E88A 3VEZA 3LDOA 4BVPA 1YVNA 2E8AA 4M7YA 4CBWA 3O4WA 2OANA 3A5LC 1NGBA 1V4TA 4QS8A 2IIRA 3VESA 3SLCA 3O1WA 4BREA 4GY2B 2IVPA 3D2FA 2PBDA 3D7EO 3IUCA 2D0PA 3A5OC 2QWNA 5AZJB 3VEOA 3RSEB 5KPZA 2IVNA 4JN4A 4FWMA 1C0FA 1GLCG 3C7NA 3ZX0A 2A42A 5BPLA 3FLCO 4PL8A 3S41A 2BTFA 4Z94A 2KHOA 3MDQA 3B8AX 2I7NA 4FOIA 5LJWA 3FZKA 4WQ4C 3VETA 1RDWX 2YI1A 3QBXA 5F2RA 1J6ZA 1K8KA 1ZXOA 5EOYA 2FLOA 1MWMA 4EHUA 1G99A 5AQLA 1BG3A 1MDUB 4BRMA 3DXKA 3FR0A 4IO8A 5ADXA 2YCHA 3DAWA 1HX1A 1NMDA 3LM2A 4B1UB 1GLFO 4FO0A 5JLFA 2P9LA 4FWSA 4WYBA 4NO7A 3VOVA 1P8ZA 1DKGD 4CZGA 3DWLA 4K41A 4FSVA 1NM1A 2YHXA 4LC9B 4H5RA 3LDLA 4PL7A 2ASMA 1IG8A 1QQNA 5E26A 5TKYA 3FFKB 1XQSC 2QWOA 1ESVA 2Q97A 5AQOA 3DXKB 5EX5A 1KXPA 3HBTA 4BRIA 3WQTA 4WQ5C 5CE3A 2A5XA 4H5VA 3R8EA 1GLLO 3FZMA 2P9LB 2E1YA 4BC3A 3HM8A 4IZ9A 3AY9A 2ASOA 3CJAA 1SAZA 2GWJA 4FWPA 3ENHA 4MLEA 4H5NA 3VGLA 2I7PA 3I8BA 5FPNA 1KAZA 4BR2A 3VF4A 4BRKA 5BRHA 5BPNA 3SMSA 2AA4A 4K43A 2HF3A 4BRFA 1RGIA 4I6MA 3I33A 2ASPA 2IVOA 5AQTA 2YJFA 3IFRA 1LOTB 2P9SB 3H3NO 5AQIA 3BF3A 4EHTA 3SK3A 3EZWA 1BU6O 3H6EA 5AQQA 3LM9A 2Q0UA 1C0GA 3A0IX 4BC4A 2CH6A 4FWQA 5KPRA 3FZHA 1NGGA 4H5TA 5I9EB 3CETA 1YXQA 3L0QA 4XH5A 1GLEG 4AM7A 5E84A 2AP1A 2NLXA 1QZ5A 2CGJA 3ULEB 4DCHA 3LDQA 1GLAG 4I6MB 1NGFA 1XUPO 4FWKA 3FGUA 4BQZA 5FPDA 4XEIA 3DXMA 4EAHD 2Q36A 4H5WA 2HMPA 2QW9A 4F9OA 1E4FT 1TUYA 4H0OA 2Q2RA 4YDUA 4FL9A 2P9PB 5FPEA 3ZEUA 4BR9A 4BRDA 3BEXA 4EFHA 2ITMA 3H46O 2E2OA 4FPAA 3HSCA 4H0YB 3WXKA 5F1XA 2EWSA 5AQZA 4BQLA 3DXMB 2V7ZA 5EXWA 4JD2B 2HOEA 2E2PA 4CJ7A 4M63C 2E1ZA 2ZGYA 3UKRB 5EY4A 5LY3A 4CD3A 1NLVA 3QBWA 2A41A 3H1VX 1DEJA 4MLHA 4MO5A 4XH4A 4JAXA 4FWRA 4H03B 5AQJA 5AQNA 1MA9B 1S22A 3VGKA 4K25A 3O08A 2QM1A 3D2FB 1BWFO 2P9UA 3WQUA 3HTVA 3UKUA 3CJ1A 3KVGA 1MWKA 4B1ZA 1HKBA 3CJ9A 5AQHA 3ZX2A 3BP8A 4BG9A 3A8YA 4EIAA 1T44A 4BRAA 4CZEA 3C7NB 2YJEA 3A5MC 2P9KA 3MK6A 1DGKN 4IJNA 4K42A 3LDNA 5ADXH 5AZIA 1X9JA 4BR7A 3ENOA 5AQUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQ9A 3WT0A 5HOOA 5CHIA 3GG4A 5KRTA 2HBMA 4YDUC 4YOYA 5M1KA 4KHQA 1JLQA 3VQ8A 3ZLJA 1T7PA 1KLMA 1RT4A 3CERA 4BRPA 1QQMA 4FK4A 4YOTA 3ID8A 3KZBA 4FJKA 4DF4A 5J1EA 1B9DA 5DMRA 4QCLA 3LL3A 3MMVA 2F96A 3HL8A 4OKJA 3FE1A 4DS5A 5M1NA 3W3DA 3CCVN 3T19A 3QMLA 4WE1A 2KTQA 3UIQA 2W00A 4C23A 1YIJN 1HNXK 1VQ7N 1RNHA 3VPZA 4O8KA 2QEXN 2F7TA 1FKOA 4FJMA 4M41A 5TKWA 3QLHA 4BGAA 2BANA 3OYLA 3P5JA 2UUBK 2Q31A 2A6AA 3T1YK 3VA3A 3E66A 1JCEA 3CFPA 1DTQA 3TSQA 2V51B 3BF1A 2P9NA 2IC3A 3UB5A 2LR3A 1BL3A 3SAFA 4YOUA 3ITHA 4B9VA 5JS2A 5BRFA 1JKHA 4CZIA 2OTJN 4OX9K 1TAQA 1HYSA 3NF7A 3G25A 4FYDA 3IDHA 4F2SA 3C0BA 2W6KA 4B8AB 2E6MA 1ZUTA 2P9IB 1TKZA 1OVQA 2E20A 1QHAA 1WSJA 3EN9A 2QWRA 1T7BA 3OJSA 3W0LA 3F9MA 3V9WA 3RMBA 1ZU3A 4HTLA 4AILC 1YITN 3CYMA 1R59O 4GNIA 1VSHA 3TAFA 1P90A 1DLOA 1K73O 1K8BA 1C1CA 4CK2A 3T69A 3ISNC 4IOCL 4CK1A 1L5UA 4M3TA 1LAVA 3ZEUB 4JNEA 3U9ZA 1D8YA 2V7YA 1QTMA 4FK0A 2W6LA 5B8HA 5E41A 3OS2A 1NGAA 3SV4A 5AQKA 4CEBA 3OYBA 4B3MK 2E3GA 1LQQA 1T6CA 1RT5A 1WMTA 3SMPA 3MX5A 3L2WA 2CGKA 3QERA 4CD1A 3PX0A 1X9WA 4LFCK 1N4NA 2X6SA 4B9MA 2QWPA 3TPQA 3WXLA 4IFEA 5M1OA 3LZJA 2ZD1A 5ELZA 4GVMA 2FBTA 1QSLA 3DJCA 4NXNK 1P00A 1PTXA 2P9UB 5MLCQ 5DM6L 1JLBA 1VQ8N 4CGDA 2YHWA 4DQPA 3AAPA 3SCXA 4BR5A 4DLGA 3JS6A 1LWFA 5AQYA 3B6PA 4CFCA 4KI6A 1L3TA 3O3FA 4LF5K 2P51A 4ISFA 3QFUA 3J7ZO 3TSPA 2DTUA 1ZFUA 3L2VA 3LWLA 5GINA 2XY5A 1S1VA 4ISGA 4CZLA 3D2EB 4O8UA 1NK4A 3OYKA 3MCPA 3LP3A 3KLEA 4FZXC 2BGGA 3VQ4A 4M7XA 3OYAA 2G8IA 4MQ3A 3BZKA 4C1NK 1QQOA 2HHQA 1T6DA 2E2QA 1SL0A 1TYQB 2B4JA 2VG7A 2KBKA 1X9SA 1L3VA 3JSMA 3AARA 3M8PA 4LF4K 3CCRN 2HNYA 1NGJA 1RDAA 4MDAA 5FDLA 3EL2A 1NRAA 3K0SA 4CF2A 1R0AA 1EWRA 3DLHA 3VEWA 2MN5A 4BWJA 4LH5A 3U8XA 4FLTA 2YHBA 1WSEA 1BA1A 4O5FA 2P9PA 4NXMK 2XRIA 1BQNA 1NWKA 5AR0A 4BC5A 4AEIA 4AHRA 3VEYA 2OA8A 3UE5A 4AH9A 3CW4A 2A40A 2HSTA 2IS3A 3HSTB 4OKEA 5JS1A 1DTTA 3L8BA 4BDYA 2NRZA 3P4IA 2J4RA 1VK0A 3L2UA 4ZTFA 2LI7A 4G9ZA 2ZJPL 3DOKA 1CHZA 5CYMA 1VQMN 2FF6A 2HNDA 1RTIA 3CQXA 1GLDG 4CK3A 1QE1A 4HVJA 4FJ8A 4EZ6A 3A5LC 3PV8A 4DUYK 2IIRA 1B3CA 3SLCA 4IDKA 3I0RA 3D2FA 3LP2A 3D7EO 3EEQA 3Q7BA 2QWNA 5AZJB 3VEOA 5KPZA 2NY9X 1RDUA 2OZMA 3ZX0A 3C7NA 1I3AA 3S41A 2ITGA 4M3WA 1DT9A 2LN8A 1S1WA 5LJWA 4RW4A 1KD1O 1J5OA 3KOWA 5SWMA 1ZXOA 1OH8A 2NRXA 1TL3A 3HM9A 1SL1A 3OYEA 1TKDA 4ILJA 4EHUA 2X74A 3SUQA 1VQ5N 1VNAA 4OVLA 3I55N 1SL2A 3E7UX 4IO8A 2OTLN 4PWDA 1FJGK 4B1UB 1IG9A 3NGZA 3QNOA 3K2PA 4NO7A 4FM2A 3VOVA 4CEAA 1P8ZA 4FJLA 3QIPA 4LF7K 2YHXA 4H5RA 4GVEA 4PL7A 4DMNA 1L3UA 3TI0A 4CEEA 5TKYA 4KHPK 3FFKB 4DV7K 3HRGA 3AVNA 2D0BA 2QWOA 2VGMA 1N36K 3LPUA 5C10A 4CJFA 1KXPA 2KQ2A 3VQQA 1XMOK 3TAQA 1QSYA 2A5XA 4H5VA 4FM1A 1GLLO 1BCGA 2P9LB 1M1KO 4BC3A 4NLBA 4DR2K 2KZZA 5EU7A 3AY9A 5JVHL 3CJAA 2GWJA 3DLGA 4Z4IA 4KAZA 5FPNA 1KAZA 4RW6A 3VQ5A 3OW2M 4Z4GA 2ZE2A 4XJXA 2IOCA 2O8CA 3ZYYX 3SUPA 1BMRA 1ASVA 2KGQA 2QK9A 3WNFA 2KKZA 3K5LA 4W5NA 1ZYQA 3VQAA 5AQQA 4JKGA 3LM9A 4KB0A 4E1NA 4E7KA 4DFKA 4FZYA 2HVIA 4BC4A 1C6VA 4KHNA 4IDHA 1NGGA 4KHUA 3I0SA 3OBYA 1DQ7A 1GLEG 3AA2A 3LAMA 3KJVA 5E84A 3VMFB 2AP1A 2NY8X 1S9EA 3LDQA 4O44A 4FWKA 3FGUA 4BQZA 1Q9YA 5DK5A 3KC6A 1ZBHA 2X6NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3VQ9 A;  3WT0 A;  5HOO A;  5CHI A;  3GG4 A;  5KRT A;  2HBM A;  4YDU C;  4YOY A;  5M1K A;  4KHQ A;  1JLQ A;  3VQ8 A;  3ZLJ A;  1T7P A;  1KLM A;  1RT4 A;  3CER A;  4BRP A;  1QQM A;  4FK4 A;  4YOT A;  3ID8 A;  3KZB A;  4FJK A;  4DF4 A;  5J1E A;  1B9D A;  5DMR A;  4QCL A;  3LL3 A;  3MMV A;  2F96 A;  3HL8 A;  4OKJ A;  3FE1 A;  4DS5 A;  5M1N A;  3W3D A;  3CCV N;  3T19 A;  3QML A;  4WE1 A;  2KTQ A;  3UIQ A;  2W00 A;  4C23 A;  1YIJ N;  1HNX K;  1VQ7 N;  1RNH A;  3VPZ A;  4O8K A;  2QEX N;  2F7T A;  1FKO A;  4FJM A;  4M41 A;  5TKW A;  3QLH A;  4BGA A;  2BAN A;  3OYL A;  3P5J A;  2UUB K;  2Q31 A;  2A6A A;  3T1Y K;  3VA3 A;  3E66 A;  1JCE A;  3CFP A;  1DTQ A;  3TSQ A;  2V51 B;  3BF1 A;  2P9N A;  2IC3 A;  3UB5 A;  2LR3 A;  1BL3 A;  3SAF A;  4YOU A;  3ITH A;  4B9V A;  5JS2 A;  5BRF A;  1JKH A;  4CZI A;  2OTJ N;  4OX9 K;  1TAQ A;  1HYS A;  3NF7 A;  3G25 A;  4FYD A;  3IDH A;  4F2S A;  3C0B A;  2W6K A;  4B8A B;  2E6M A;  1ZUT A;  2P9I B;  1TKZ A;  1OVQ A;  2E20 A;  1QHA A;  1WSJ A;  3EN9 A;  2QWR A;  1T7B A; 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