5BN9A

Crystal structure of adp bound human hsp70 nbd mutant r272k.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn9A04
4BRNA 3CJCA 3CETA 5B8HA 5AZIB 1TYQA 1KAXA 4JHDA 4PKHA 4BROA 4BRHA 4RWTA 3GL1A 1GLDG 1NGCA 1WUAA 4IXCA 4BVOA 1D4XA 2Q0UA 4YDUA 1T6DA 2NZTA 3A5LC 3ENOA 3MN6A 1BO5O 3U9DA 4JNEA 4CZJA 3R8EA 4H0XB 5AQSA 1OKJA 5JICA 4CI6A 1H1VA 1MA9B 3C7NA 5AZJB 2P9UB 1NGHA 4IJNA 4A2AA 1DGKN 3HBTA 5LJVA 3UB5A 3ZEUB 2CGJA 4F9OA 4FWQA 4H03B 1S3XA 3KVGA 3MN5A 3KHYA 3WEEB 3ULEB 5EXWA 3ZETB 5KQDA 4BGAA 4H5RA 4FOEA 3I8BA 3QBXA 2A3ZA 4BRQA 5AQKA 3CHWA 5FPEA 1Z05A 1RGIA 3VEYA 4CBWA 4QS8A 4JD2B 1YAGA 4WQ5A 3SK3A 4FPBA 3UKUB 2I7NA 5JMVA 3MN9A 1LOTB 3EZWA 4I6MA 2IIRA 5AZIA 3VOVA 3RSEA 1HX1A 1CZAN 1RDWX 2J4RA 3ZX0A 3ZX2A 1XUPO 3SLCA 3GDQA 4BRIA 2VWBA 5BPNA 4AM6A 3W0LA 4H5VA 3FGUA 3IMXA 2F9TA 2I7PA 3VGKA 4BR7A 3M3ZA 4DQ8A 2P9PA 4HWIA 2P9UA 3BF1A 4JN4A 3A5OC 1NLVA 1DEJA 4PKIA 3CERA 4B1WB 1C0GA 1RFQA 2D0PA 4H5TA 2GUPA 3WEEA 3ULEA 2FSJA 1BA0A 4FL9A 2Q31A 4HTLA 2Q0RA 5EY4A 3A5MC 3F9MA 3O4WA 4CZGA 4O5FA 4CZIA 1NGEA 2ZF5O 3SJHA 1GLBG 2A6AA 4JD2A 1MWMA 3U9ZA 3VF2A 4CD3A 3CQXA 1K8KA 3EKUA 3BF3A 3LDLA 3L4IA 1J6ZA 4H0TB 1TUUA 2FXUA 1HUXA 2GWKA 3DAWA 1T6CA 1P8ZA 3LDOA 4BQLA 3BP8A 3QICA 3LDNA 3OHRA 4BRAA 1X3NA 1XQSC 3JS6A 5KPRA 5AQZA 5KPZA 5AQFA 1X3MA 4BR0A 3QFPA 2QWRA 3U8XA 3J8AA 1Y64A 1QZ6A 4MLEA 3QMLA 1QQNA 3M1FA 3HTVA 5BREA 5EX5A 2QWLA 3VEWA 3FZFA 4I6MB 5EOYA 3RSEB 4CZMA 3VPZA 4WQ4C 4K42A 4H0PA 5LY3A 5BRHA 3GE1A 1SAZA 2V52B 4H0VB 1ZXOA 2WUSA 2F9WA 4FWNA 1NMDA 4BR5A 1HJOA 3FZKA 4GNIA 3O5BA 5AQJA 3CI5A 1X9JA 4B1UB 2D0OA 5AQRA 5AQLA 4BC4A 4BRKA 3D7EO 1IG8A 3R6MA 2VYPA 3G25A 3FZLA 4FWLA 4PL7A 1QZ5A 2P9PB 2YCHA 3MN7A 5ELZA 3U4LA 1ESVA 3A0IX 2P9IB 3H3NO 1GLCG 2VCPA 3QBWA 4K43A 2P9LB 2Q1NA 1C0FA 2V7YA 1QHAA 3HI0A 3VESA 3CIPA 4B1ZA 3IFRA 5LJWA 1KAYA 2W41A 5AFUH 4XH5A 3L6QA 1ATSA 2QM1A 3SMPA 1NGDA 1NGAA 3LM9A 2P9NB 3ATUA 1K8KB 3EN9A 4PL8A 3UE5A 3H6EA 3AAQA 5JLHA 4BC2A 1U2VB 5KQ8A 2QWMA 4EHTA 4A62A 1SQKA 1HPMA 3ZX3A 4J8FA 5BRFA 2V51B 4BVPA 3FR0A 4B1VA 5AQHA 1NGBA 5F1XA 2W40A 2ZWHA 3VF4A 1E4GT 1EQYA 5EVZA 1NGJA 3VERA 3IUCA 4BRCA 1NM1A 5F2RA 3WT0A 2A40A 5BPMA 4B1XB 4CJ7A 5AFUA 1KAZA 3B8AX 2UYTA 4ISFA 3SMSA 2P9IA 2E1ZA 1GLJO 2P9LA 2ZGYA 4CZFA 2E2QA 3H3OB 2GWJA 5FPDA 1G99A 3BEXA 2QWNA 5AQMA 3JXUA 3VEVA 4XH4A 5BR9A 4LC9B 2Q97A 2HF4A 1YVNA 3WUHA 2P9SB 3DJCA 3QB0A 2FF6A 2P9NA 1BU6O 1ZC6A 4YDUC 2YHYA 3O1BA 3VEZA 1DKGD 1U2VA 3GG4A 3D2EA 3EKSA 1QQMA 2HOEA 4M7XA 4Z94A 4DHYA 3D2FA 4PKGA 3MK6A 5F0XA 3FZHA 2QWOA 1TUYA 3L0QA 4FOIA 3VENA 2QWPA 4BC3A 5FPNA 5FPMA 3ID8A 3QDKA 4FWMA 3WXJA 2P9KA 1V4TA 1V4SA 1JCFA 2GEMA 4DB3A 2D1KA 2ZGZA 3TPQA 3GOIA 4DCHA 2FLOA 3ENHA 2KHOA 3WQTA 4QS7A 1IJJA 2EWSA 4EFHA 2A41A 4FPAA 1GLAG 1BG3A 2DPNA 1NGIA 2BUPA 1BOTO 1HKGA 2PBDA 4B9QA 4CZHA 2ITMA 2FSNA 3GBTA 1NGFA 2PAVA 4WQ5C 2IVNA 3HZ6A 3FFKB 4CZKA 5AQTA 2YHXA 4CZEA 2AP1A 2QXLA 3TU5A 2E2OA 2D4WA 2P9SA 1U6ZA 2YJFA 4A61A 3O1WA 4H0YB 4O8KA 3AY9A 3CQYA 4FO0A 4EIAA 1YUWA 3VETA 2YI1A 4MO4A 4JAXA 3VEXA 2ASMA 5AQVA 5JLFA 1BA1A 4XH1A 1NBWA 1JCGA 4FWRA 5ADXH 3C0BA 4A2BA 4GY2B 1T44A 1NGGA 3LM2A 3VGMA 3CJBA 1QQOA 4BQZA 2GELA 3CJAA 3WQUA 2E1YA 2YJEA 3FLCO 5AQXA 4RTFD 4ISEA 3HSCA 1ZBSA 1Z6RA 2OANA 3I33A 3EO3A 4E1JA 5AQWA 3LDQA 2E8AA 5BN9A 4BG9A 2CGKA 5BN8A 4FWSA 2HF3A 1R59O 1LCUA 3AARA 2ASOA 1HKCA 3VGLA 4BG8A 3H1QA 3EL2A 3DWLA 4BRGA 5AQNA 3D2EB 4C23A 1GLEG 4RCHA 1ATNA 5ADXA 3VEOA 4H5WA 3O08A 4BGBA 4FSVA 4IJAA 3D2FB 5AQYA 2CGLA 1SZ2A 4NO7A 3M6GA 2A42A 5AQPA 4BC5A 2FSKA 3LDPA 5AQOA 4AM7A 2H3GX 2AA4A 3QFUA 3DXMA 1HKBA 2P9KB 2HMPA 3P4IA 5BRDA 4WQ4A 2E2NA 3KZBA 4NB4A 3VF6A 1HLUA 4ISGA 3IDHA 4XEIA 3H45C 1Q18A 5I9EB 3FE1A 1MDUB 2Q2RA 3DXKB 4IWVA 4EAHD 4FWOA 5AQUA 3ATVA 2FF3B 3AAPA 3CJ9A 2CH5A 5BPLA 3H46O 5E26A 1GLFO 4BRFA 2Q36A 3A5NC 2GTDA 4CBUA 5AZJA 5CE3A 4KBOA 2V7ZA 1GLLO 1BUPA 1NWKA 3UKRB 4CBXA 3H1VX 4MO5A 2CH6A 2QW9A 3ZEUA 4H5NA 4K25A 3ZETA 3WXLA 4BRLA 5AQGA 1MWKA 4BR2A 1TYQB 2E88A 4JHDB 4WYBA 2ASPA 3R9PA 5KPTA 2E2PA 3WXIA 2BTFA 2QWQA 2A5XA 1ATRA 5TKYA 4FWPA 3UKUA 3WXKA 4BREA 4M63C 4EHUA 3O80A 1S22A 3CJ7A 5AR0A 3FZMA 4IZ9A 3DXKA 3C7NB 3HM8A 3MCPA 1YXQA 3MMVA 2YHWA 4FWKA 4BRDA 4CZLA 1JCEA 4BRMA 2E20A 4K41A 5AQIA 3W3DA 3A8YA 3O8MA 4M7YA 4MLHA 4H0OA 4BR4A 1KXPA 5AQQA 2NRHA 3CJ1A 1BWFO 3S41A 4QS9A 3MDQA 4BRPA 3LL3A 2IVOA 4IO8A 2IVPA 3UKRA 4BR9A 4CD1A 1WOQA 3BUZB 3DXMB 3O6WA 1XC3A 4Y0WA 5E84A 4B1YB 1E4FT 1BDGA 4L3QA 2NLXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T19A 3IG1A 4BRHA 2KLAA 4F2SA 1QVFM 4KHYA 3GL1A 1NGCA 1WUAA 4F3OA 4CW7B 4KI4A 4YDUA 2NRWA 4CHOA 4Y1CA 4DTSA 4OKKA 4CFDA 3ENOA 3KHWA 3MN6A 4E7JA 4CJVA 3HYFA 3NAEA 4CZJA 1FKPA 4B9TA 1OKJA 4OKJA 1L3UA 1N32K 3I0RA 2Z1HA 3C7NA 2P9UB 3HVRA 1NGHA 4UJ0A 3FFIA 4CJUA 1W2BM 3NDKA 4LF8K 4DF8A 5LJVA 3MEDA 4QOZB 1A5XA 1NK4A 3VMFB 4RW9A 3KVGA 3MWTA 5HOOA 4KREA 4JI7K 4OPKA 3ULEB 4BGAA 4H5RA 4R79A 3TARA 3THWB 2F4VK 2YNFA 1Z05A 4QS8A 4IEEA 3O9QA 4CJ5A 4E3SA 3CCRN 4Z4GA 5M1NA 1UWBA 4L8RB 4B9LA 1NK9A 4E1MA 1RDWX 1VHXA 2NY8X 3ZX2A 1XUPO 3KLHA 4GV9A 3CCEN 2O8DA 2VWBA 1YJ9N 2K35A 1ZVGA 3L8BA 3FGUA 2I7PA 2QA4N 4AQYK 4DQ8A 1VSFA 3TAEA 2XHBA 4E7LA 4JN4A 3ZSOA 4FJ5A 2O8CB 1DEJA 1QTMA 3CERA 3CQ8A 4CEAA 3DOKA 2QTDA 4DU1A 2NRVA 4CJPA 4FL9A 2Q31A 1JL1A 4BACA 1XMOK 3AVBA 2HHWA 1BQMA 4O5FA 1N6QA 1NGEA 1BRZA 2UXDK 4GW6A 1I39A 1MWMA 2PY5A 1UOCA 1U45A 2B68A 1N34K 3EKUA 4N56A 2JLEA 5C42A 1JLGA 1J6ZA 2OYQA 1Q82O 3KD1E 1TUUA 3NGIA 1HUXA 1T6CA 1P8ZA 1WSEA 3LDOA 1TKZA 3ZSVA 3BP8A 3QICA 3LDNA 4YOUA 3OHRA 5GADP 2ETJA 3S3MA 2DTUA 4GMJB 1BQNA 3JS6A 5AQZA 3HO1A 3V4IA 4M3ZA 4BEBA 3QFPA 2QWRA 5KRSA 2O8FA 1NJXA 1QQNA 5HRRA 2YHBA 1OMYA 4KH5A 5EOYA 5CR4A 4CZMA 5JENA 1NK7A 4H0PA 1RT4A 1SAZA 3GE1A 4H0VB 1M90O 3EE9A 2F9WA 4FWNA 3V9SA 1NMDA 5CYMA 1DTTA 1HJOA 3RMDA 3DRPA 4F3TA 5FDLA 2ZJQL 3CI5A 4B1UB 2D0OA 5AQLA 1VQON 3CW4A 2VYPA 3G25A 3FZLA 3N4QA 2E3FA 2P9PB 3S9HA 1TAQA 3VQ8A 1TVRA 4E19A 4B9SA 4AILC 5ELZA 4CJEA 2BH1A 1HQEA 2VCPA 2KFZA 4PUOA 3O4NA 2Q1NA 2YKNA 1POIA 1HNXK 1BCMA 4CF2A 1C1AA 1ICAA 5C10A 3DLGA 5LJWA 4FJHA 2BANA 3SMPA 1SL0A 1JZBA 1J54A 1WSFA 1HYZA 1NGDA 3QIPA 4DV1K 3R1XA 3QETA 1NGAA 1SS6A 1JL2A 4HHTA 3TAFA 3H6EA 5JLHA 3KKSA 3TR8A 1U2VB 2QWMA 4EHTA 4J8FA 5DMRA 1GOBA 1S6PA 4BVPA 2KTQA 4NCGA 3QESA 4B1VA 4CQKA 3I55N 4FLVA 4EZ6A 4FJ8A 4V19S 2E3GA 2IGIA 2KBJA 3VF4A 1E4GT 2A1SA 5EVZA 4O8UA 3L56A 3ZT3A 4B8CA 2A40A 2UXCK 3EE8A 4KPYA 4CJ7A 1BCOA 4A5AA 1KAZA 5AJ3K 4J2AA 3MWPA 2ZGYA 4CHNA 1NJWA 3PIPL 3PSIA 3TWHA 2G8KA 1G99A 3E7UX 3BEXA 1J5OA 3VEVA 1NNEA 2MN5A 3DLBA 1RDUA 3SI6A 4LFCK 4LC9B 1L5UA 2Q97A 2HF4A 2NRTA 2P9SB 3QB0A 2FF6A 2X74A 1U47A 3O1BA 3MAQA 3GG4A 3NBPA 3EKSA 3OYHA 1VQ6N 1KCFA 4YFUA 3HL8A 1JLFA 2IAJA 2VG5A 1T3VA 4JI6K 2QWOA 2P5GA 3K5MA 4NCAA 5FPNA 3TAGA 2P9KA 1XNRK 2ZGZA 4CEZA 2KYQA 3HVTA 3GOIA 2OTJN 4DCHA 1RT5A 2NRXA 4QS7A 2A41A 1I2UA 4ILHA 2HBJA 1T7AA 1GLAG 1BG3A 2DPNA 2BUPA 4JS5A 1NJZA 1HKGA 5HRSA 4XIUA 4B9QA 4N5SA 1ASWA 3V1RA 2HW3A 2PYLA 1VSHA 1ZUTA 4KKOA 2HBKA 2VWJA 1HYVA 3VTHA 3TU5A 2E2OA 3HT3A 3K5NA 2YJFA 3O1WA 4H0YB 3WNGA 3KD5E 4GVEA 3U3GA 4LFAK 4DV5K 4FLWA 1TL3A 1NG9A 4CJSA 2UUCK 1JCGA 5ADXH 2HHVA 2E6MA 3ZSRA 3K9JA 3CPEA 2A7TA 1S1TA 1Z26A 3SQ4A 3WNEA 5HRNA 1VQKN 4KAZA 1BCGA 4H8KA 1QQOA 1FH3A 5LMNK 2GELA 3CJAA 2E1YA 4A59A 1SKWA 2YX6A 3CC7N 1Z6RA 1D5AA 1KVBA 2GX9A 4JYAK 2OTLN 1A5VA 3AVGA 2E8AA 4HHFA 2CGKA 3KWGA 1LCUA 1R59O 3CF5L 2ASOA 3H1QA 3T1YK 4IG3A 4DFPA 3THYA 1ATNA 3C65A 2A1RA 3VEOA 4BGBA 4O4GA 2WTUA 2NUBA 4IJAA 3D2FB 3SPZA 2CGLA 1RILA 4NO7A 2ITGA 4AM7A 3BZCA 3ENBA 1ZBLA 4DTMA 2HBMA 4DR2K 1HLUA 1CZ9A 4DS4A 4FJ7A 4RW4A 1RNHA 3PSFA 1RT6A 1N33K 1VQ8N 3H45C 4ELTA 5I9EB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3T19 A;  3IG1 A;  4BRH A;  2KLA A;  4F2S A;  1QVF M;  4KHY A;  3GL1 A;  1NGC A;  1WUA A;  4F3O A;  4CW7 B;  4KI4 A;  4YDU A;  2NRW A;  4CHO A;  4Y1C A;  4DTS A;  4OKK A;  4CFD A;  3ENO A;  3KHW A;  3MN6 A;  4E7J A;  4CJV A;  3HYF A;  3NAE A;  4CZJ A;  1FKP A;  4B9T A;  1OKJ A;  4OKJ A;  1L3U A;  1N32 K;  3I0R A;  2Z1H A;  3C7N A;  2P9U B;  3HVR A;  1NGH A;  4UJ0 A;  3FFI A;  4CJU A;  1W2B M;  3NDK A;  4LF8 K;  4DF8 A;  5LJV A;  3MED A;  4QOZ B;  1A5X A;  1NK4 A;  3VMF B;  4RW9 A;  3KVG A;  3MWT A;  5HOO A;  4KRE A;  4JI7 K;  4OPK A;  3ULE B;  4BGA A;  4H5R A;  4R79 A;  3TAR A;  3THW B;  2F4V K;  2YNF A;  1Z05 A;  4QS8 A;  4IEE A;  3O9Q A;  4CJ5 A;  4E3S A;  3CCR N;  4Z4G A;  5M1N A;  1UWB A;  4L8R B;  4B9L A;  1NK9 A;  4E1M A;  1RDW X;  1VHX A;  2NY8 X;  3ZX2 A;  1XUP O;  3KLH A;  4GV9 A;  3CCE N;  2O8D A;  2VWB A;  1YJ9 N;  2K35 A;  1ZVG A;  3L8B A;  3FGU A;  2I7P A;  2QA4 N;  4AQY K;  4DQ8 A;  1VSF A;  3TAE A;  2XHB A;  4E7L A;  4JN4 A;  3ZSO A;  4FJ5 A;  2O8C B;  1DEJ A;  1QTM A;  3CER A; 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