5BPLA

Crystal structure of adp and pi bound human hsp70 nbd mutant r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bplA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bplA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bplA04
3CIPA 1BOTO 5BPMA 1E4FT 4FWMA 4CZMA 1BWFO 3UB5A 3UKUA 3EN9A 3QICA 3I33A 5E84A 4FWRA 4FL9A 3VESA 3MN9A 2KHOA 5AQFA 5KPTA 3DJCA 1X3NA 5EVZA 1BU6O 2NRHA 3ENHA 1TYQB 3DWLA 4CZLA 3ATVA 4FO0A 2W40A 4BC5A 5AQOA 2P9LB 1JCGA 1T44A 1DGKN 3D7EO 4WQ5C 1NGFA 3GBTA 3IUCA 3O8MA 5BR9A 2P9SA 4H5TA 4B1UB 3LM2A 4YDUC 5LJVA 1QQOA 1E4GT 2A6AA 2NZTA 3WXKA 3ZX0A 2ZF5O 4XH1A 3A8YA 3CQXA 1J6ZA 3M1FA 5LJWA 5FPEA 3LM9A 1SAZA 4K43A 3H46O 4BRHA 3KHYA 2E2NA 2Q0RA 2J4RA 3H45C 5B8HA 2P9IB 5FPMA 5FPDA 4BGBA 1GLLO 4AM7A 1XUPO 5AQLA 1HUXA 1K8KB 3MN7A 3IMXA 4IXCA 4B9QA 5JMVA 3VF6A 4M7XA 5KQDA 1OKJA 2CH5A 4BRQA 4H0TB 4B1YB 1NMDA 5AQVA 4H03B 3BF1A 3DXKB 1BG3A 2BUPA 4A2BA 1YUWA 1GLBG 3GL1A 1QZ5A 2W41A 1ATRA 1NM1A 4EFHA 2FF3B 2P9KA 3VEXA 5AQPA 4MO4A 4DHYA 1YAGA 1KXPA 2QWMA 3L0QA 4BRIA 1HKCA 3VEYA 4BRAA 2IVNA 5AFUH 1XQSC 1NGIA 3ULEB 3GOIA 5BRDA 2QWOA 3D2EB 3D2FB 3O1BA 2QM1A 4ISGA 2AP1A 4BRLA 4JD2A 1HJOA 2P9PA 3C7NB 2Q36A 4WYBA 1QHAA 1NGDA 2OANA 2P9NB 3EO3A 5F0XA 3A5NC 3FGUA 3WUHA 3SLCA 3VGLA 5EOYA 1BUPA 4CD1A 3WEEA 4DQ8A 3UKRA 3CHWA 4NO7A 3UE5A 4FWLA 2UYTA 1NBWA 2VYPA 3FZHA 1MA9B 1T6DA 2GELA 3FLCO 1ZBSA 3LDNA 3KZBA 3L6QA 4ISEA 4IZ9A 1NGJA 4BQLA 2F9TA 5BPLA 2VCPA 3WXJA 2CGLA 5KPRA 1S22A 3GG4A 3BP8A 4BVPA 4BRNA 5AZJA 1BO5O 4JHDB 4CD3A 1MWKA 4QS9A 3CJ1A 3H3NO 4BRDA 5I9EB 4WQ4C 2EWSA 4FPBA 3J8AA 4IJAA 4DB3A 1NLVA 3EKUA 4H5VA 4BR7A 3OHRA 5AQYA 1QQNA 5AQWA 1U2VA 1NGCA 2ZGZA 2QWNA 3ZX3A 2YI1A 3CJ7A 3HI0A 3I8BA 3BUZB 3QBXA 1XC3A 1LCUA 4MO5A 3JS6A 4JAXA 3HZ6A 4FWPA 4IWVA 2IIRA 5FPNA 3ZETA 1RGIA 3FZKA 3U9ZA 5JICA 2NLXA 4IO8A 3R9PA 4B1XB 5KPZA 1RFQA 3U8XA 3WQTA 4B1ZA 2BTFA 3FZFA 1JCFA 1NGGA 1KAZA 5AR0A 2E88A 1NGAA 1NGHA 2V7ZA 3DXMA 4E1JA 5JLHA 3RSEA 1WOQA 3C0BA 2A41A 4A61A 2HF3A 5AQTA 1SZ2A 1DEJA 4DCHA 2A42A 3O80A 5JLFA 3MCPA 5AQGA 1S3XA 4MLEA 5BREA 3MK6A 3AAPA 4A62A 4CBUA 1Z6RA 3MDQA 3SJHA 4JNEA 5AQZA 4WQ4A 4CZKA 1BA0A 5BRHA 2D0OA 5AQSA 4BC4A 1ATNA 1ESVA 3LL3A 1H1VA 1G99A 3QFUA 5AZIB 3H1VX 4BR4A 3AAQA 1TYQA 4BRKA 4CZFA 4BR9A 3WXIA 2P9LA 3QFPA 3LDLA 2WUSA 5EY4A 3EL2A 2E1ZA 4J8FA 1IJJA 1SQKA 4FWQA 4PL8A 1GLJO 3HM8A 3WT0A 4BC2A 2VWBA 1JCEA 1U6ZA 2E20A 3IFRA 2YHXA 4EHUA 2QWQA 3G25A 5F2RA 3EKSA 4BG8A 3DAWA 4BRCA 3R8EA 3B8AX 3SMPA 5AQKA 3U4LA 3O4WA 4RTFD 3CJBA 2P9IA 3ENOA 2ASOA 4FOIA 4B1VA 3VETA 1K8KA 2A40A 3FE1A 3S41A 3H1QA 4CZHA 3DXKA 3ZX2A 4O8KA 4I6MB 3CERA 2Q31A 4BRFA 2GWJA 2FSNA 1TUUA 1YVNA 5AQUA 3ZEUB 3VF2A 2ZWHA 1HLUA 4BGAA 2P9UB 5AQQA 2GEMA 2ZGYA 3VEWA 4CZJA 3A0IX 1T6CA 2GWKA 2YJFA 2QWPA 5BN9A 2GTDA 4MLHA 3FR0A 4FPAA 2QWLA 3R6MA 1YXQA 1C0FA 1MWMA 1HPMA 4XH5A 3VEZA 1Z05A 1GLEG 4CZIA 5AQIA 4ISFA 4BQZA 3GE1A 5AQMA 3ULEA 5BRFA 3D2EA 3MMVA 3QB0A 4CBXA 3D2FA 3UKUB 3C7NA 3HTVA 1BDGA 4H0PA 4H5WA 2D1KA 2H3GX 4BRMA 2P9NA 2IVOA 2CGJA 2F9WA 4PKIA 2DPNA 3QBWA 4FOEA 4GY2B 1GLFO 4EAHD 3VEVA 4NB4A 2E1YA 3TPQA 3VF4A 4HWIA 4Z94A 1NGEA 4PKGA 5AQXA 2Q2RA 3QDKA 3VGMA 4BC3A 5AQRA 4KBOA 1C0GA 4CJ7A 1ZXOA 4JHDA 3P4IA 4BR0A 2P9SB 3CJ9A 4H5RA 2D4WA 2E2OA 1D4XA 2E8AA 1Y64A 3A5MC 2A3ZA 3MN5A 3KVGA 1NWKA 1RDWX 1P8ZA 3EZWA 4BR2A 1GLDG 4RWTA 3CJCA 5E26A 1Q18A 2Q97A 3VOVA 2HMPA 2V51B 2GUPA 3VEOA 2CH6A 3CQYA 3F9MA 1X9JA 2FF6A 3ID8A 3ATUA 2HF4A 1R59O 1WUAA 2E2QA 1V4TA 3O5BA 2Q1NA 5BN8A 4M7YA 2I7PA 3W3DA 3M3ZA 3A5LC 3BF3A 3M6GA 5ELZA 2I7NA 3VPZA 4XH4A 2FLOA 3QMLA 4CBWA 1DKGD 1KAYA 1GLCG 1HX1A 1HKBA 3H6EA 3W0LA 4HTLA 4PL7A 2FSJA 5AQNA 1IG8A 4RCHA 3CJAA 1BA1A 2YHWA 3O1WA 2YJEA 4CZGA 2P9KB 4QS8A 3U9DA 3AARA 5LY3A 3FFKB 2IVPA 4H5NA 4JN4A 4H0OA 5F1XA 1EQYA 3AY9A 3WXLA 4FWSA 4C23A 1ATSA 5AFUA 1QQMA 2Q0UA 3VGKA 4BRPA 1MDUB 4JD2B 2P9PB 4BREA 2ASPA 1ZC6A 5AZIA 4CZEA 3IDHA 3VENA 3SMSA 4FWKA 5AQHA 2FXUA 4BROA 3WEEB 3UKRB 4M63C 4BG9A 2AA4A 3JXUA 2V52B 2ITMA 3FZMA 3BEXA 2QW9A 4FSVA 4GNIA 2FSKA 4B1WB 4WQ5A 1QZ6A 3FZLA 5EX5A 4A2AA 5ADXA 4IJNA 1NGBA 5KQ8A 3LDOA 4PKHA 2V7YA 4YDUA 2HOEA 1GLAG 5AZJB 5TKYA 3H3OB 4H0VB 4BRGA 4EIAA 2QXLA 4H0YB 4L3QA 4O5FA 2E2PA 2YCHA 5AQJA 1HKGA 2PAVA 4XEIA 4BR5A 2QWRA 2CGKA 2ASMA 4Y0WA 4EHTA 5CE3A 2A5XA 4CI6A 1U2VB 4K42A 3LDPA 4AM6A 3SK3A 3LDQA 4I6MA 5EXWA 5ADXH 4H0XB 3L4IA 1V4SA 2D0PA 3ZEUA 3TU5A 4K41A 1KAXA 5BPNA 3CETA 3ZETB 4LC9B 2P9UA 4FWNA 4BVOA 3O08A 1CZAN 1TUYA 2YHYA 1X3MA 3HSCA 4K25A 4F9OA 4FWOA 3HBTA 3GDQA 2PBDA 3VERA 3MN6A 4QS7A 3CI5A 3WQUA 3A5OC 3DXMB 3RSEB 1LOTB 3O6WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KFZA 1VNBA 5BPMA 3T1AA 1BWFO 3QICA 4N56A 1C1BA 3I33A 2BRZA 5J2PA 4RG8A 4KAZA 1RT4A 3CPEA 1IBLK 4DSKA 5AQFA 3KLFA 3B6PA 4OLAA 1KFSA 3S3MA 3PIPL 3U3GA 3OYBA 1X3NA 5EVZA 1XWLA 4Z4HA 3DWLA 4FM0A 4CZLA 1IG9A 2W40A 4FK4A 5AQOA 3C6UA 1ITGA 1ZBLA 2GL1A 1JLGA 3K5NA 4WQ5C 3ZSQA 3GBTA 3O8MA 3KC6A 1JZBA 1CZ9A 4B1UB 4YDUC 5LJVA 3P5JA 3M8SA 3ZX0A 3CQXA 1XHZA 4GKKK 3M1FA 2E4LA 1R0AA 4E7JA 4NCBA 2WFBA 4BRHA 4IEIA 2E2NA 3HVTA 2Q0RA 4GV6A 3H45C 4CF8A 3CC4N 2HBKA 3L2RA 3MXJA 1J9AA 1HQEA 4IXCA 3TTDA 1VSJA 4M7XA 4CFAA 1OKJA 2B4JA 3QEWA 2E6LA 1NMDA 3T7ZA 1RNHA 5K14A 3BF1A 5T7BA 1CXUA 1YUWA 1GLBG 3GL1A 3VTIA 2FF3B 4A59A 1IKWA 1BQNA 5AQPA 1RT2A 1X9WA 3U6FA 5H1SQ 2Y1JA 4DHYA 3M8PA 1OH7A 1EWRA 1XMQK 3CF5L 4KHWA 3VEYA 4Y1CA 4AILC 5J2NA 2PY5A 1W7AA 2QEXN 4JI3K 4FLZA 1WN7A 3D2EB 5KRTA 2G8IA 1NG9A 3V9UA 2QM1A 4JI0K 4ISGA 3OYFA 4JD2A 3OYHA 1QHAA 2G8WA 2P9NB 4RW8A 3NH2A 3EO3A 1ASUA 4EP4A 4NXMK 3A5NC 3V6DA 3FGUA 3WUHA 3SLCA 5C2FA 5J1EA 3DLLL 4X64K 1W0HA 4CCHA 3PUFA 2I5JA 4GVEA 4DSEA 3UE5A 4FWLA 3FZHA 2GELA 3KZBA 3L6QA 1NGJA 5BPLA 3HM9A 5IWAK 4HUFA 5DM7L 1I2UA 1ZBUA 4KPYA 5AZJA 4CJEA 4PQUA 4CIGA 4CJRA 4DFPA 4LF4K 3CJ1A 3H3NO 3ZSXA 4BECA 4CHQA 1NJXA 2WC9A 2QXFA 2G8KA 2O8FA 4DB3A 4CJTA 4H5VA 4IOCL 4DLGA 4NYNA 1QQNA 3HYFA 1WSHA 5CZ2A 3QNNA 2KQ2A 1J5OA 4CHPA 3ZX3A 2YI1A 2JGUA 3E7RL 1B9DA 3HI0A 3BUZB 3QBXA 2NRZA 1XC3A 3JS6A 4FWPA 2IIRA 3R9PA 4IO8A 4KFBA 2BTFA 4LY7A 4OKEA 4CHNA 2BGGA 1WB9A 2E88A 3L3UA 1YITN 2V7ZA 3BZCA 3VQQA 1WOQA 3E9LA 4B9MA 2HF3A 1T7PA 4J2DA 4DCHA 4ZTJA 3OYEA 2N66A 3SAGA 3VA0A 3CCQN 4CBUA 3I0SA 4O4GA 4F2SA 1E3MA 2R7YA 3L56A 2DFEA 2VWKA 3RR7A 4CZKA 1BA0A 2D0OA 1ZVGA 1SKRA 4FJMA 5AQSA 4L8RB 1SUQA 4CHOA 3QESA 1W97L 1N33K 1ESVA 3K9KA 1H1VA 2GMOA 3QIPA 4YFUA 3OW2M 3AAQA 1TYQA 1EKEA 4BR9A 2P51A 4AQYK 3WXIA 4CEFA 2P9LA 3QFPA 4H8KA 5E41A 2HHQA 4B9UA 1QQCA 1RDUA 2WUSA 1I6GA 3K57A 5HROA 1ILYA 2E1ZA 1D8YA 1U49A 3SV4A 1SQKA 4E1MA 3NGYA 4PL8A 3KLGA 1GLJO 2FBVA 2MBKA 2GUIA 4NYFA 3CM5A 2VWBA 4DTNA 3O3HA 3G25A 4O5BA 1S1TA 5F2RA 3DYAA 3KP1A 3WNHA 4OPHA 3E1YA 3M8QA 4KV8A 3HP6A 1CN2A 1BI4A 4CESA 4GV3A 2LJMA 2P9IA 3ENOA 2ASOA 1RBUA 1VSFA 4FOIA 1QVFM 1K8KA 4E3SA 3FE1A 1RILA 4AH9A 3BGRA 4B9SA 1IKYA 2HNDA 1MYNA 3PSMA 3CERA 3LP2A 3JYTA 2HHVA 3OYLA 3PO5A 1TUUA 1NK9A 4JRPA 4DR6K 3WXMB 3P83D 1U45A 5AQQA 2GEMA 2XY5A 4DLEA 1IKXA 4CFCA 3S9HA 2KBHA 4YOXA 4DFMA 1VQ6N 5CYQA 4B08A 2YNHA 2F8SA 4XH5A 3R1XA 1XHXA 4V19S 5AQIA 4FJHA 1OH6A 4ID1A 5BRFA 3L2WA 3MMVA 4KKOA 4FK2A 4CF2A 2VG5A 4CBXA 5HOOA 1VSHA 3HOTA 3PO4A 4CEOA 5JENA 5FROA 3MCAB 4BRMA 4UY8O 2F9WA 2UUBK 4PKIA 4LF6K 2UUAK 1O1WA 3EYZA 2UU9K 4NB4A 4B9TA 1HJRA 3VF4A 3MX5A 4Z94A 4YORA 3OJSA 4BE0A 4W5OA 1JLBA 4DSLA 2YILA 1WBBA 4KBOA 3KLHA 2OA8A 2KKZA 1Q81O 3L4QA 4KHSA 3CJ9A 1YIJN 1GPTA 2EX3A 2E8AA 3ZSOA 1BQMA 3MN5A 4CF0A 5GIOA 1S1UA 1P8ZA 3OYAA 4E7LA 4DTJA 2VY6A 1F21A 1Q18A 2N2QA 3CFOA 2Q97A 3LP0A 3AVKA 2V51B 2GUPA 4DWIA 4GMJB 3RRHA 4JI1K 1X9JA 4JK9A 2FF6A 3ID8A 3TSUA 1R59O 1V4TA 4M7YA 2AJQA 2Q3SA 4B3SK 3A5LC 1HYVA 3DM2A 3M6GA 3J80O 4WCEL 4KTWA 3NH1A 4XH4A 4DV3K 2NRTA 2HHWA 3QMLA 1TK8A 4JKDA 1GLCG 1HX1A 4KI6A 4AAZA 5I42A 5AQNA 4G9ZA 4OPKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2KFZ A;  1VNB A;  5BPM A;  3T1A A;  1BWF O;  3QIC A;  4N56 A;  1C1B A;  3I33 A;  2BRZ A;  5J2P A;  4RG8 A;  4KAZ A;  1RT4 A;  3CPE A;  1IBL K;  4DSK A;  5AQF A;  3KLF A;  3B6P A;  4OLA A;  1KFS A;  3S3M A;  3PIP L;  3U3G A;  3OYB A;  1X3N A;  5EVZ A;  1XWL A;  4Z4H A;  3DWL A;  4FM0 A;  4CZL A;  1IG9 A;  2W40 A;  4FK4 A;  5AQO A;  3C6U A;  1ITG A;  1ZBL A;  2GL1 A;  1JLG A;  3K5N A;  4WQ5 C;  3ZSQ A;  3GBT A;  3O8M A;  3KC6 A;  1JZB A;  1CZ9 A;  4B1U B;  4YDU C;  5LJV A;  3P5J A;  3M8S A;  3ZX0 A;  3CQX A;  1XHZ A;  4GKK K;  3M1F A;  2E4L A;  1R0A A;  4E7J A;  4NCB A;  2WFB A;  4BRH A;  4IEI A;  2E2N A;  3HVT A;  2Q0R A;  4GV6 A;  3H45 C;  4CF8 A;  3CC4 N;  2HBK A;  3L2R A;  3MXJ A;  1J9A A;  1HQE A;  4IXC A;  3TTD A;  1VSJ A;  4M7X A;  4CFA A;  1OKJ A;  2B4J A;  3QEW A;  2E6L A;  1NMD A;  3T7Z A;  1RNH A;  5K14 A;  3BF1 A;  5T7B A;  1CXU A;  1YUW A;  1GLB G;  3GL1 A;  3VTI A;  2FF3 B;  4A59 A;  1IKW A;  1BQN A;  5AQP A;  1RT2 A;  1X9W A;  3U6F A;  5H1S Q;  2Y1J A;  4DHY A;  3M8P A;  1OH7 A; 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