5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
3CJCA 2FSKA 4BRDA 4IO8A 3GE1A 3FZFA 4WQ4C 3ZX2A 2QWRA 1MWMA 1RGIA 1ESVA 3VGKA 3KZBA 5BPMA 2GEMA 3ZETB 3L6QA 3WXJA 1CZAN 1Y64A 2NZTA 3WQUA 4E1JA 4BQLA 1S22A 4CZIA 1BA1A 1TUUA 3ATUA 3BF3A 3FZHA 3J8AA 3JXUA 2E2OA 4FWKA 3LDLA 4CZJA 1BWFO 5AQJA 2NLXA 2FXUA 2A42A 3WEEA 2AA4A 2E2NA 2E2QA 4FWRA 1P8ZA 2ASOA 4H5VA 5AQVA 1T44A 2ASPA 2P9PB 3BP8A 3H1QA 2OANA 3O5BA 4CZFA 3LDPA 5F2RA 3H45C 2A5XA 2GTDA 3A5LC 2HF3A 1XQSC 3O4WA 1WUAA 3ZX3A 3HZ6A 3SLCA 3WUHA 3CQXA 1H1VA 2F9WA 4WQ4A 1HJOA 4M7XA 4BRMA 5AZIB 4M7YA 4CZGA 3LDQA 4IXCA 3H6EA 5AQSA 2ZWHA 3VENA 2Q0RA 2BUPA 4A2AA 4AM6A 4H0XB 4DB3A 4H5RA 3ENHA 1SAZA 3VEWA 2HF4A 2FSJA 3HBTA 2ZGYA 2AP1A 3O80A 3WQTA 4JN4A 3ATVA 1Z6RA 2YHYA 4BR4A 3HSCA 3KVGA 4KBOA 2ZGZA 1GLDG 1Z05A 4O8KA 3C0BA 4FOEA 4AM7A 1X3NA 2E1ZA 3GBTA 3WXKA 3FFKB 4K41A 3TPQA 2YI1A 1OKJA 2FLOA 3FZMA 2QWOA 2QWMA 4PKIA 3L4IA 5FPEA 2IIRA 5KPTA 4BC3A 5JICA 2QWQA 5AQWA 3VEOA 3M1FA 3EL2A 1K8KA 5EOYA 4BRQA 1ZBSA 5CE3A 5BREA 3A0IX 4BRHA 4NO7A 1NMDA 4BC5A 3HI0A 1XC3A 5AQYA 3TU5A 4JHDA 4BRLA 3U9DA 3BEXA 4CBWA 1SQKA 4H0OA 4LC9B 4B1WB 2VYPA 1DKGD 3L0QA 3MDQA 4FWNA 4CBXA 1R59O 2Q0UA 4B1UB 2P9SB 2IVNA 3EN9A 1NLVA 5FPMA 1NBWA 5AQIA 4L3QA 1LOTB 5AQUA 4BRKA 2V7ZA 1GLAG 4FL9A 5AQPA 1GLFO 1NGGA 2V52B 2CGKA 4FWSA 2FF3B 2QXLA 4BG9A 4CBUA 3MN9A 4H5NA 5AQFA 3VPZA 3H3NO 1ATNA 1NGAA 2YHWA 1RDWX 2EWSA 1NGIA 4JNEA 3UE5A 3A8YA 4FWQA 3D2EB 3UKUB 3IUCA 2E2PA 4FWLA 1BU6O 1C0FA 4FWPA 4DHYA 3CQYA 5BRDA 1QQMA 3D2EA 2P9IB 4FO0A 3UKUA 3MMVA 3UKRB 4HTLA 1T6DA 2WUSA 5AQKA 2QWLA 1MWKA 2P9IA 3EO3A 3CIPA 2DPNA 1JCGA 4CZMA 3UKRA 2P9UB 1T6CA 4H0TB 4B1XB 3ZETA 4XH4A 3AAPA 1BO5O 4B1YB 3LM2A 2P9UA 5BR9A 4H0VB 5F0XA 3MN6A 1QHAA 4WYBA 1BDGA 4O5FA 2F9TA 3SMPA 4EAHD 3DJCA 5AQMA 1HKBA 4A2BA 3GL1A 5I9EB 1E4FT 3LDNA 5AFUH 1BOTO 4BR0A 1IJJA 3I33A 2P9PA 3QFUA 4F9OA 4BRAA 3RSEB 2E20A 3QMLA 4B1ZA 2GELA 1XUPO 2YCHA 5BPLA 2IVPA 1JCFA 3RSEA 1IG8A 3P4IA 4BGBA 2V7YA 1KAZA 4EFHA 3D7EO 5BN9A 3MN7A 3FZKA 3O1WA 1RFQA 4ISGA 1NGEA 1V4SA 5AZIA 1NM1A 1MDUB 1U6ZA 1NGJA 3QBWA 3OHRA 3VEVA 4CI6A 1GLCG 3A5OC 5EX5A 4FWMA 3A5MC 3QBXA 4C23A 1HPMA 3W3DA 5AQXA 2UYTA 1C0GA 4BREA 3VOVA 5ADXH 5E84A 4FSVA 3MK6A 1G99A 4JD2B 5AQZA 1KAYA 2PAVA 4YDUC 1D4XA 4CZLA 4JD2A 1QQNA 5TKYA 3DXKB 3EKSA 1BA0A 1ATSA 5JLHA 4GNIA 5EVZA 3SJHA 3VF2A 4EHTA 3DXKA 3FE1A 1V4TA 3GDQA 2V51B 5AQHA 4BRGA 4BRNA 3FLCO 3CERA 2ZF5O 1DGKN 3EZWA 4HWIA 3R6MA 2CGJA 3H3OB 5AR0A 3QICA 4XH1A 1KAXA 4H0PA 1GLLO 2FSNA 4DCHA 2P9SA 2Q36A 2P9KB 4GY2B 3DXMB 4FWOA 2P9KA 2A41A 2HOEA 3U9ZA 3EKUA 3CETA 4MO4A 4BR7A 2D0PA 5AQGA 2A40A 4YDUA 3AAQA 3ZX0A 1BG3A 2YJFA 4FPAA 4BR9A 4CZKA 5BRHA 4PL7A 3M3ZA 4Y0WA 5AQNA 3IDHA 3CI5A 1TYQB 4RTFD 3C7NB 1TUYA 2QWPA 1TYQA 2W40A 4IWVA 3C7NA 2I7NA 2GWKA 3MCPA 4IJNA 3W0LA 1KXPA 2CH5A 3GG4A 2ASMA 1GLJO 1S3XA 3CJ1A 2VWBA 3ENOA 3M6GA 2GWJA 4I6MB 2P9LB 2E8AA 5FPNA 2NRHA 3VEXA 4QS7A 1HLUA 4FPBA 1SZ2A 2P9LA 3ZEUB 5F1XA 3ID8A 3IMXA 2QW9A 5KPZA 2A6AA 4K43A 3CJ9A 3U4LA 3ZEUA 1ZC6A 1NGBA 2PBDA 2Q31A 2YJEA 4BRIA 2D0OA 2D1KA 5BN8A 3LL3A 4BG8A 4BVPA 5EY4A 1QQOA 2E88A 1NWKA 1YVNA 3CJAA 5BRFA 2Q1NA 4FOIA 2IVOA 5KQDA 3MN5A 4WQ5C 5JMVA 3O6WA 3BUZB 4CD3A 4PL8A 3A5NC 4CZHA 3WEEB 1QZ6A 1GLBG 2D4WA 3WXIA 1YUWA 2CH6A 3BF1A 3R9PA 4BRPA 3R8EA 4BVOA 4K25A 2BTFA 4Z94A 4ISFA 1EQYA 4EHUA 3CHWA 1J6ZA 3JS6A 4A62A 3VERA 4J8FA 3LM9A 5AQRA 1X9JA 4DQ8A 3H46O 3VEYA 1BUPA 1JCEA 2CGLA 2J4RA 4BROA 4B1VA 2I7PA 3F9MA 4MLEA 2FF6A 4MLHA 4M63C 4H5WA 3IFRA 1X3MA 4BR2A 1LCUA 2Q2RA 3VETA 4ISEA 4PKHA 4JAXA 5AQQA 3FGUA 3HM8A 5KQ8A 2QM1A 1WOQA 4BR5A 5AQLA 3QDKA 2VCPA 4XH5A 5AZJB 4WQ5A 1Q18A 3LDOA 3U8XA 4EIAA 5AFUA 5AZJA 1HX1A 3UB5A 4QS8A 1U2VB 2P9NB 4IZ9A 5AQOA 3SK3A 5AQTA 2ITMA 5LJWA 1U2VA 4BQZA 3O08A 2P9NA 2HMPA 1HKGA 4CD1A 3VGLA 4IJAA 1HKCA 2YHXA 3FR0A 1ATRA 3VF4A 1YXQA 3VGMA 4BC4A 4BC2A 4PKGA 2H3GX 3O1BA 3S41A 4A61A 1K8KB 3DAWA 3O8MA 5B8HA 3G25A 3CJ7A 2Q97A 3AARA 1DEJA 3QB0A 3ULEB 2A3ZA 1YAGA 4RWTA 4CJ7A 4JHDB 3VEZA 5JLFA 3ULEA 3WXLA 2E1YA 4B9QA 1NGHA 3KHYA 5EXWA 4BRFA 3DXMA 5E26A 4MO5A 3B8AX 5LJVA 5ADXA 4H5TA 1NGDA 3HTVA 2QWNA 4QS9A 5KPRA 2KHOA 1NGFA 2W41A 4NB4A 4H0YB 5FPDA 1NGCA 1E4GT 3I8BA 3WT0A 2GUPA 4BRCA 3VESA 4CZEA 4K42A 3VF6A 3D2FB 5LY3A 3QFPA 3H1VX 3D2FA 1MA9B 3CJBA 4XEIA 1QZ5A 3DWLA 3SMSA 4RCHA 5BPNA 3GOIA 4BGAA 5ELZA 4H03B 1ZXOA 4I6MA 3AY9A 1GLEG 3FZLA 1HUXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E01A 1JJ2M 1U47A 4IO8A 2YNFA 3LZJA 3ZX2A 4MDAA 1SL0A 1HMVA 4CHOA 5BPMA 4HHFA 3WXJA 2WC9A 1Y64A 3WQUA 3TARA 1N5YA 4U67L 3VA3A 3KJVA 4CZIA 4FJIA 1XRSB 3ATUA 3CMEN 4ICLA 4CZJA 2W6KA 2NLXA 4OLBA 2VWKA 3WEEA 1VNBA 2AA4A 2E2QA 2P9PB 3OW2M 1D9FA 3H1QA 1DT9A 4AHUA 1ZUTA 3LDPA 5F2RA 2A5XA 3WXMB 2GTDA 3A5LC 3QEPA 2FBYA 4DTPA 4YFUA 3ZX3A 4CEAA 4N41A 1H1VA 4XJXA 4ID1A 4I2QA 4WFBL 1SEGA 4NYFA 4M7YA 4LF6K 4DU3A 4F2SA 1JXBA 3TAQA 3NDKA 4X64K 4B08A 4CJTA 2BUPA 1BMRA 1CN2A 3M8RA 2FSJA 1KFDA 1J53A 4NCAA 3ZT1A 3WQTA 3QEXA 2C1GA 1JKHA 3MXJA 1XWLA 3ATVA 2YHYA 2WONA 1K73O 3KLEA 2YEOA 1Z05A 2VG6A 1VSEA 3V9WA 1UOCA 1X3NA 1LQQA 2MN5A 2HNDA 4BACA 2YI1A 2NRXA 3V9UA 3KD5E 4CHPA 4BE2A 1S1XA 1VSJA 2QWOA 2QWMA 5KPTA 2O8BA 2GMOA 3DLHA 3EL2A 2QKBA 1WMTA 1RBVA 1NU0A 1RDCA 2HBJA 4K8XA 2VY6A 3KLFA 1XC3A 5AQYA 1WBBA 4JHDA 1SL2A 4CBWA 4GW6A 4B1WB 1N36K 4JS4A 3NGZA 1S72N 4O5BA 4B3TK 4CGGA 4M3ZA 3VQDA 3LAMA 3EN9A 3VQBA 2Z1JA 5FPMA 3BDPA 2Q3SA 4BRKA 2V7ZA 4CVNE 3AVBA 4H4MA 4LF7K 2VQFK 5AQPA 2VQEK 3DLEA 1NGGA 1HYVA 2CGKA 4DR5K 4BEBA 1VQ7N 4FLZA 2XRIA 3S9HA 1QVFM 4KH5A 1OZZA 4LY7A 3G6EN 1WBDA 3KOXA 4CEEA 1RDWX 1K9MO 3SCXA 3KLIA 4JNEA 3UE5A 1TK5A 2B68A 3IUCA 4OKJA 4FWLA 1BU6O 1L5UA 4FWPA 4DHYA 2HSTA 2DY4A 1LAVA 2P9IB 3BK3C 2IDOA 3OYKA 1KD1O 3V1QA 4FK4A 4JI7K 4CEZA 5C10A 3NVKA 2QWLA 2P9IA 3OVNA 4FJHA 1RT1A 2ATBA 3MEDA 4H0TB 4J2EA 4LSLA 3M5RA 1BO5O 3F9KA 4J2AA 3PO5A 1NK0A 1GOBA 3CCLN 4O5FA 2QK9A 5AQMA 3IAYA 2I5JA 3GL1A 3VQ5A 5I9EB 1L3VA 1U45A 4M3UA 1VK0A 4B9SA 2ZQBA 4CJKA 4B8AB 3SNNA 3I33A 1BI4B 2QA4N 4IOAL 5BR8K 3CC4N 1BI4A 4BRAA 3RSEB 3AVNA 4M41A 4PA1A 4KB1A 4B1ZA 1XUPO 2JLEA 3KWGA 4DV0K 3OA9A 4ILGB 3RSEA 1N8RO 1KAZA 1K8AO 3RTVA 4ISGA 1NGEA 4YY3K 4KI6A 3PO4A 2ITGA 5KK4A 3VEVA 3PUFA 1T3VA 2OCEA 3VTHA 3A5OC 5EX5A 4DTJA 2QKKA 5C25A 2XY8A 3K9KA 2YNHA 3F73A 3DRSA 3PSMA 1HPMA 4JKHA 1RCHA 4JKGB 1CZ9A 2UYTA 2KSKA 4KAZA 1REVA 2VG7A 3VOVA 4JKGA 5ADXH 2HHUA 4X65K 5HBMA 2A1SA 2A7TA 3LPUA 3MK6A 4E7KA 4FZZA 3I8DA 1HQUA 3C94A 5J2PA 1Z26A 4CZLA 2DFHA 1QQNA 1CZBA 5TKYA 3Q7BA 5EVZA 3SJHA 4FJGA 3HYFA 2DFEA 2UUBK 2V51B 2KFNA 4CEBA 2X6NA 3FLCO 3TTCA 5KTQA 3CERA 3AVMA 3SQ2A 4V1DC 4JKCA 1PX9A 3QLHA 5AR0A 1NJIO 4DTNA 4XH1A 1RBRA 4H0PA 4AAZA 3LP1A 3VQCA 1R0AA 3CG7A 1GLLO 4DCHA 3OYIA 2P9SA 3KOWA 2Q36A 1G15A 3U3GA 1UA1A 1VQON 1FKOA 3QINA 5IWAK 3CMAN 4GY2B 4OPKA 4FWOA 4N5SA 3G4SN 2A41A 2HNYA 3AV9A 3EKUA 2D0PA 4AF1A 2HBLA 1NH5A 4FPAA 5BRHA 4DQRA 3QIOA 1TYQB 2RE2A 4YOWA 4CESA 3C7NB 5CYMA 1I39A 4CJUA 1TYQA 3OY9A 3EEQA 4GKJK 3C7NA 2GBZA 2O8EA 3IRXA 4CGIA 4GV6A 3C6TA 3QEIA 3M6GA 4FLVA 2GWJA 3TSUA 2NRHA 1HPZA 4XIUA 3PX0A 3QETA 4QS7A 2YIOA 4FPBA 1SZ2A 3ZEUB 3KIOA 3K5OA 4JS5A 3SUQA 3TAGA 1JZAA 3ZEUA 3RR7A 1NGBA 4FW2A 4X66K 1IKYA 4BRIA 3D6RA 2D1KA 5BN8A 3KP1A 5EY4A 4KI4A 1T03A 4DTXA 1BIZA 1YVNA 5BRFA 4QOZB 4CF9A 1WSIA 4DF8A 2WBNA 1IG9A 2KZZA 4PL8A 2YBRC 1RDUA 4CJSA 4DR7K 3WXIA 2E2FA 1CHZA 4KB0A 4JLHA 3P5JA 4K25A 4JI4K 2LT8A 3SV4A 3CHWA 2NUBA 4ELTA 3JS6A 1U4BA 1Y97A 3LM9A 5AQRA 4E0DA 3PV8A 4EZ6A 2JGUA 2CGLA 3KK3A 4HTUA 2KJAA 3F9MA 1SNBA 4HE7A 4C8LA 3E7UX 4DG1A 3OBYA 1Q7YO 5AQQA 3VA0A 4E1MA 2G8HA 1EX4A 4W5QA 3NFAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3E01 A;  1JJ2 M;  1U47 A;  4IO8 A;  2YNF A;  3LZJ A;  3ZX2 A;  4MDA A;  1SL0 A;  1HMV A;  4CHO A;  5BPM A;  4HHF A;  3WXJ A;  2WC9 A;  1Y64 A;  3WQU A;  3TAR A;  1N5Y A;  4U67 L;  3VA3 A;  3KJV A;  4CZI A;  4FJI A;  1XRS B;  3ATU A;  3CME N;  4ICL A;  4CZJ A;  2W6K A;  2NLX A;  4OLB A;  2VWK A;  3WEE A;  1VNB A;  2AA4 A;  2E2Q A;  2P9P B;  3OW2 M;  1D9F A;  3H1Q A;  1DT9 A;  4AHU A;  1ZUT A;  3LDP A;  5F2R A;  2A5X A;  3WXM B;  2GTD A;  3A5L C;  3QEP A;  2FBY A;  4DTP A;  4YFU A;  3ZX3 A;  4CEA A;  4N41 A;  1H1V A;  4XJX A;  4ID1 A;  4I2Q A;  4WFB L;  1SEG A;  4NYF A;  4M7Y A;  4LF6 K;  4DU3 A;  4F2S A;  1JXB A;  3TAQ A;  3NDK A;  4X64 K;  4B08 A;  4CJT A;  2BUP A;  1BMR A;  1CN2 A;  3M8R A;  2FSJ A;  1KFD A;  1J53 A;  4NCA A;  3ZT1 A;  3WQT A;  3QEX A;  2C1G A;  1JKH A;  3MXJ A;  1XWL A;  3ATV A;  2YHY A;  2WON A;  1K73 O;  3KLE A;  2YEO A;  1Z05 A;  2VG6 A;  1VSE A;  3V9W A;  1UOC A;  1X3N A;  1LQQ A;  2MN5 A;  2HND A;  4BAC A;  2YI1 A;  2NRX A;  3V9U A;  3KD5 E;  4CHP A;  4BE2 A;  1S1X A; 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