5BPNA

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
376
structure length
372
Chain Sequence
AIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVLNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 372
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpnA04
4CZKA 2FSNA 3WXKA 2V7YA 2ZWHA 1ZC6A 4A2BA 3A5NC 3W0LA 2YJFA 5TKYA 4JNEA 1SQKA 5E26A 1E4GT 3ZETA 3FZLA 3WEEA 1NLVA 1YUWA 3ATUA 4FWPA 2WUSA 2ASMA 1NGCA 1KAXA 1BU6O 1SZ2A 3DWLA 3VENA 5B8HA 1BG3A 3H3NO 2NRHA 4BRGA 4IJNA 3LM9A 4FSVA 1YVNA 5KPRA 4I6MB 3GL1A 3LDPA 1LOTB 4BG8A 3VEYA 5AQLA 3A5OC 3GOIA 3GDQA 5AZIA 4B1ZA 2HOEA 4FO0A 2D4WA 3GBTA 4B1WB 3O80A 1NGEA 2P9PA 4BRMA 4IJAA 5EXWA 2P9KA 3P4IA 3ULEA 5BREA 4H5NA 2GEMA 1HX1A 3VGKA 4JHDB 5AQKA 4B1XB 4BRKA 1TYQB 3VETA 1T6CA 3W3DA 4EAHD 5LY3A 1X3MA 3LL3A 3SMPA 1IG8A 1X3NA 2P9LB 4FL9A 1TUYA 1K8KB 4QS7A 4M63C 2V7ZA 4EIAA 5KQ8A 4CJ7A 5AQNA 4RWTA 3WQUA 2GWJA 2E8AA 5AFUA 3HZ6A 3CI5A 4FPBA 2V51B 4H0VB 3QMLA 4CD1A 2F9WA 3KZBA 3D2FB 5AQRA 3G25A 3MMVA 3H1QA 3EKSA 1HKGA 2P9UB 3CJAA 3IUCA 3I33A 4BRFA 3MDQA 4YDUC 3DAWA 4NB4A 2A6AA 4QS8A 3BF3A 5AQJA 4QS9A 3FZMA 5EVZA 3HBTA 1GLEG 4H0OA 4CBWA 4O5FA 2AA4A 5AQYA 4A61A 1D4XA 5JLFA 2HF4A 3UKUA 4NO7A 4B1YB 4FWQA 2BUPA 4CZEA 4DB3A 3EL2A 3ZEUB 1Q18A 1NMDA 5EY4A 3VOVA 4BGBA 3U9DA 3BP8A 4H5TA 2P9IB 3L4IA 2E2QA 1C0FA 5ADXH 1WOQA 3VGLA 4BRLA 3MN7A 4H0TB 3I8BA 1KAYA 4O8KA 4PKIA 4F9OA 2GELA 3LM2A 4BQZA 4CZMA 1QZ6A 4PL7A 1Z6RA 3CQYA 4M7YA 3MCPA 1BUPA 2Q36A 1NGHA 5KPTA 1HJOA 1ESVA 3CJBA 4H03B 1GLCG 4CZIA 4I6MA 3VEVA 1QZ5A 3F9MA 3VPZA 1KXPA 1LCUA 3EZWA 1GLAG 4FWRA 5BRFA 5BN8A 2GUPA 5FPEA 4BC4A 1Y64A 4Z94A 1TUUA 2HMPA 3O08A 4WQ4C 4FOEA 1NM1A 1ZBSA 4FWSA 1BDGA 2DPNA 3WXLA 3IDHA 3WUHA 3L6QA 4JHDA 3GE1A 3S41A 1S22A 3RSEB 1TYQA 2Q2RA 4RTFD 5ADXA 2AP1A 3CJ9A 1NGGA 3O1BA 3VESA 1XUPO 2D0PA 3HM8A 3QFUA 2QM1A 5I9EB 2QWNA 1T6DA 1V4SA 2P9LA 3UKRB 2FXUA 1K8KA 1R59O 4BRIA 5AQPA 3H6EA 3VERA 3SLCA 3IFRA 4BR2A 3EKUA 2IIRA 3M3ZA 2H3GX 4H0PA 3HI0A 4M7XA 1CZAN 4GY2B 4H0YB 3LDQA 4BRAA 4DQ8A 4GNIA 1DEJA 2ASPA 3D2FA 1J6ZA 4H5RA 2W40A 2YHYA 4H5VA 3AY9A 1BOTO 3VF6A 2Q1NA 3A8YA 3BEXA 5FPDA 2P9UA 3QDKA 1GLBG 4K25A 2A42A 2BTFA 1ATRA 4ISGA 2ZF5O 2Q0UA 3DXKB 3CETA 4PL8A 2GTDA 4BREA 4BC2A 3CJ1A 1G99A 5AQFA 3WXIA 3CIPA 2FF3B 3QBXA 1MDUB 1NGAA 2A41A 1IJJA 4BRNA 2KHOA 3ZEUA 3FGUA 4MO4A 1NGJA 2QWLA 1HKBA 2HF3A 3FZKA 4MO5A 4CBUA 3MN9A 2P9IA 4K42A 3VF2A 1NGBA 3ZX3A 4H5WA 3FLCO 4PKHA 4BQLA 3KVGA 4CZLA 3UB5A 3CJ7A 4CI6A 3O8MA 4YDUA 4XH1A 3CERA 5LJVA 3SK3A 3AAQA 2VCPA 1QHAA 4B1UB 1GLLO 4XH5A 4J8FA 1NWKA 3A0IX 4BRHA 2OANA 1E4FT 5E84A 3QICA 3HSCA 1HPMA 2VWBA 1RGIA 3O1WA 4BC3A 3H46O 1P8ZA 1S3XA 3MN5A 4JAXA 4WQ5C 4IZ9A 5AQVA 2QWOA 2D1KA 2Q97A 4MLHA 3O4WA 3JXUA 3DXMB 1BA1A 2E88A 3FZHA 1NGDA 1DGKN 2V52B 1BO5O 2P9NB 4MLEA 5AQSA 4B9QA 3RSEA 1XC3A 2D0OA 3SMSA 2QWMA 4CZJA 2E2OA 4CD3A 1MWMA 3L0QA 4KBOA 2I7NA 1GLFO 1EQYA 2E2NA 2QWPA 1NGFA 3CHWA 5F0XA 2P9SB 3UKRA 4K41A 1QQMA 5AZJB 3M6GA 3D2EB 3LDOA 2CGLA 2PBDA 4EHTA 5JMVA 1NBWA 5CE3A 4WYBA 4WQ4A 4XEIA 5F2RA 2CGKA 3TPQA 4HWIA 2GWKA 1QQNA 2Q31A 3KHYA 3C0BA 5AQUA 3GG4A 4BRCA 3EO3A 3ENOA 1WUAA 4BVPA 3SJHA 1YAGA 4Y0WA 1ATSA 1XQSC 1DKGD 1ATNA 3VEZA 3QB0A 3R6MA 2QWQA 2ZGZA 2W41A 1RFQA 4BC5A 1BWFO 4FWLA 2A3ZA 3TU5A 2FSJA 4CZHA 1BA0A 5F1XA 3DXKA 4XH4A 2F9TA 5EX5A 5BRDA 2FF6A 4FWNA 2A40A 3LDNA 3O5BA 4CZGA 2NLXA 3FFKB 4FWMA 4C23A 2NZTA 4BRDA 1Z05A 3QFPA 4BVOA 5BPNA 3FE1A 4RCHA 4BRPA 4BR9A 4ISEA 1HUXA 3BF1A 1U2VB 3O6WA 3U4LA 4BR0A 3VEOA 5AFUH 1OKJA 1V4TA 1YXQA 4A2AA 5BN9A 3M1FA 2YCHA 3ENHA 2IVNA 3MN6A 4JD2B 3WXJA 3A5LC 2FSKA 5AQXA 1HLUA 4JN4A 3C7NB 2A5XA 5KQDA 2YI1A 4AM6A 3HTVA 4BR7A 1NGIA 3U8XA 3UE5A 1JCFA 4FWKA 3ZX2A 3ZETB 2E20A 4HTLA 3WEEB 2E1YA 5BPMA 1GLDG 1T44A 3A5MC 2QWRA 2CH5A 3DXMA 4EHUA 4B1VA 5FPMA 5BR9A 3ID8A 2ASOA 2P9NA 4ISFA 1H1VA 5AQIA 3R8EA 2FLOA 3VF4A 1JCEA 3MK6A 2IVPA 4CZFA 2IVOA 3EN9A 3FR0A 1U6ZA 1JCGA 2VYPA 4BG9A 1X9JA 3VEXA 2P9SA 5AZIB 5AZJA 3D2EA 2P9PB 2E1ZA 2CGJA 3AAPA 4WQ5A 2P9KB 3B8AX 3ULEB 4IXCA 2QW9A 1HKCA 4K43A 3CQXA 3WQTA 1QQOA 3FZFA 5KPZA 5AQMA 5BRHA 4H0XB 4BRQA 5ELZA 5AQQA 2YJEA 3CJCA 4BR5A 5JLHA 3DJCA 2J4RA 4E1JA 4BR4A 3LDLA 3JS6A 5FPNA 4IO8A 1RDWX 2I7PA 2ZGYA 5AQHA 2EWSA 4L3QA 5AQTA 4CBXA 2YHWA 3WT0A 1GLJO 3VEWA 3OHRA 2ITMA 2YHXA 3AARA 3J8AA 4IWVA 3D7EO 5AQZA 2Q0RA 1MWKA 4FWOA 4FPAA 4DCHA 5LJWA 2UYTA 3H3OB 1KAZA 4A62A 4BGAA 2CH6A 3H1VX 3QBWA 3ZX0A 3R9PA 3ATVA 1U2VA 4AM7A 4FOIA 3U9ZA 4EFHA 5EOYA 2E2PA 4LC9B 3IMXA 5AQOA 5JICA 3H45C 4PKGA 3BUZB 2PAVA 4JD2A 2QXLA 5AR0A 5AQWA 1ZXOA 3UKUB 3VGMA 4DHYA 5AQGA 5BPLA 1SAZA 4BROA 1C0GA 3C7NA 1MA9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CZKA 4KH5A 1ZBUA 2FSNA 3WXKA 1S1VA 4E19A 2V7YA 2ZWHA 3AA2A 1OH5A 2G8HA 3OYGA 2GBZA 4F2RA 2YJFA 2RE2A 4JNEA 3EYZA 5E26A 1E4GT 4AHCA 1P0AA 2IGIA 2WUSA 2ASMA 1J53A 3DWLA 5KRTA 1LQHA 3OYJA 1VQKN 2O8CB 1TI5A 1I6GA 4I6MB 4BWJA 3GL1A 3QEXA 3QIPA 1EKEA 4BG8A 4E7IA 3VEYA 4YOVA 3A5OC 4DQIA 1R0AA 4KH6A 3DLRA 2ZM6K 2HOEA 4FO0A 3GBTA 4WFAL 3O80A 3CCQN 4AHUA 5KGWA 4H5NA 4RW7A 3C95A 1HX1A 2RPIA 4JHDB 2UXDK 1ZUTA 4HUGA 3C6UA 3N4QA 4AH9A 3BDPA 2MZ0A 4IBNA 1VRTA 5LY3A 3EE9A 2O8FA 4OGEA 3KHWA 3V9ZA 4KKOA 1L3VA 4RW9A 1TL1A 4FL9A 2N2QA 1N34K 3PV8A 4EZ9A 3KOZA 2E3FA 2ETJA 3WQUA 2E8AA 3O4QA 3VQQA 3SAHA 2I5JA 1DT9A 3DRPA 1XMQK 1KFSA 5C12A 2UUAK 3AO4A 1LAVA 2YIPA 4G9ZA 1HKGA 3CJAA 3IUCA 3VQ4A 1EWQA 4BRFA 3MDQA 4M42A 4FJHA 1BIZA 3DI6A 3DAWA 4YDUC 3BK3C 4QS9A 3FZMA 2NRZA 1TL3A 2RF2A 2AA4A 5AQYA 3QINA 1W0HA 3UKUA 4HUFA 4FWQA 4DV1K 4CHOA 3ZEUB 4FJNA 1NMDA 1WB9A 3VOVA 2UUCK 3U9DA 3QNOA 2UUBK 5ADXH 3CG7A 4DTUA 1VQPN 4BRLA 1M90O 3NF9A 1NK4A 1KAYA 2QI2A 4N56A 4F9OA 3O9RA 2BRZA 2Y1IA 2ZJRL 1IKXA 1QS4A 2DFFA 3AA3A 2YHBA 3T69A 5JS1A 2E5LK 1BUPA 3B6OA 1HJOA 2O8CA 1KLMA 3OYLA 4Z4EA 1GLCG 1OH6A 4CHPA 4I6MA 1QZ5A 1NK0A 4FK4A 1QVGM 5BRFA 1LCUA 1GLAG 3TAMA 3ID6A 1TKXA 3J7YP 2QKBA 4KPYA 1XRSB 4AQYK 2HMPA 3RWUA 1ZVGA 3HO1A 4FOEA 2BH1A 3SAGA 1WN7A 4FWSA 3LP1A 3KJVA 3L6QA 4IG0A 5J2PA 4JHDA 3FFIA 3S41A 4CJVA 1NK6A 4OPJA 4RTFD 4F4KA 3NVKA 4RW4A 1FKPA 2AP1A 3PSFA 3O1BA 1DTQA 2D0PA 5SZTA 3G0ZA 1U48A 4DLEA 4BRIA 4FVMA 4IEIA 3H6EA 1CZ9A 2HHXA 4CFDA 3EKUA 3CYGA 3QI7A 3SF4D 4H0PA 4DQQA 4GY2B 4EP5A 3L4QA 5LMUK 2ASPA 1JZBA 2DY4A 3TTCA 2YHYA 4DS5A 3OW2M 4JKDA 5FPDA 3IRXA 3ZYYX 1ATRA 3AVGA 1QQCA 2QK9A 2N66A 3CETA 3DLGA 3QETA 4KI6A 1KD1O 1NK7A 4LFCK 1NH5A 1G99A 3RMDA 5AQFA 3DLKA 2G8UA 4GV9A 2E6LA 3V9UA 1L3TA 1RTJA 3T7ZA 3PLAA 3ZEUA 4YOUA 1JLFA 4K42A 2EHGA 3ZX3A 3CCVN 3OYHA 1EP4A 4CEOA 1SV5A 3R3LA 5HBMA 1NNEA 4XH1A 1N5YA 4DSKA 1BCMA 3O9TA 4CHZA 5E41A 4F8RA 1WWNA 4ID5A 2AJQA 1SKWA 2HW3A 2OANA 1UWBA 3HSCA 1K9MO 3VTHA 4QCLA 4DTNA 3ZSZA 1REVA 4CJWA 3MXJA 4UJ0A 4CEEA 1T1TA 3NF6A 2LJMA 4DV5K 3H46O 1P8ZA 1S3XA 4CJKA 2ASCA 3CCUN 1SL1A 4MLHA 2D1KA 3U6FA 2RKIA 3QIOA 2YNHA 2NRTA 1RBRA 3JAMO 4I2QA 3FZHA 1Q82O 2V52B 1XHXA 1TK0A 5AQSA 1WT7A 1HQUA 3CM6A 2FBYA 1YTUA 4EZ6A 2D0OA 2WONA 2QWMA 2OZSA 1MWMA 4B3RK 1VSDA 1D9DA 2E2NA 2O8BB 3AV9A 3VQ5A 3QEVA 2XY7A 4CJ4A 1QQMA 4CF2A 2CGLA 5EU7A 4EHTA 3A2FA 2XY8A 4WYBA 1T8EA 4N5SA 4FJ7A 1NJIO 2KFZA 3ZT3A 3TPQA 1CXQA 2IS3A 4FM2A 3KHYA 2E3GA 3C0BA 1RDUA 3GG4A 4YOYA 5KTQA 1FH3A 4BVPA 2ZE2A 2BE2A 3I0RA 3ZSYA 4PQUA 1J5EK 1DKGD 3DMJA 3QB0A 3K58A 1NE5A 1XHZA 3WNGA 4FWLA 5HRSA 3AVBA 3CMEN 4PHTX 1NMNA 2FSJA 4W5OA 1BA0A 5F1XA 1BCOA 3E1YA 2F9TA 2VQEK 3THYB 3OYNA 2A40A 1IKYA 1VRUA 4DMNA 4FCYA 4HE7A 5J2NA 5M1QA 4CZGA 2B6AA 2NNWA 2G8VA 3SUNA 1C0UA 4C23A 4BRDA 2HSTA 5FDLA 4DV0K 1UGLA 4IDHA 4NYFA 4IG3A 3BF1A 3O6WA 4BR0A 2BGGA 4WFNL 1LV5A 4GKKK 3F2KA 3DLLL 3AA4A 4DV2K 4NXMK 4Z4FA 4KHUA 2FBVA 4DKWA 2IVNA 1N36K 3MN6A 1TKZA 2FSKA 5AQXA 1HLUA 1S6QA 3KLIA 3C7NB 2C1GA 3M8SA 2W6LA 5KQDA 3HTVA 4BR7A 4ZHRA 3PO5A 5CY4A 4ICLA 1FXXA 3UE5A 4JI2K 3P5JA 4R79A 4CJUA 1EWRA 1RT2A 2E20A 4HTLA 4FJGA 4PWDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CZK A;  4KH5 A;  1ZBU A;  2FSN A;  3WXK A;  1S1V A;  4E19 A;  2V7Y A;  2ZWH A;  3AA2 A;  1OH5 A;  2G8H A;  3OYG A;  2GBZ A;  4F2R A;  2YJF A;  2RE2 A;  4JNE A;  3EYZ A;  5E26 A;  1E4G T;  4AHC A;  1P0A A;  2IGI A;  2WUS A;  2ASM A;  1J53 A;  3DWL A;  5KRT A;  1LQH A;  3OYJ A;  1VQK N;  2O8C B;  1TI5 A;  1I6G A;  4I6M B;  4BWJ A;  3GL1 A;  3QEX A;  3QIP A;  1EKE A;  4BG8 A;  4E7I A;  3VEY A;  4YOV A;  3A5O C;  4DQI A;  1R0A A;  4KH6 A;  3DLR A;  2ZM6 K;  2HOE A;  4FO0 A;  3GBT A;  4WFA L;  3O80 A;  3CCQ N;  4AHU A;  5KGW A;  4H5N A;  4RW7 A;  3C95 A;  1HX1 A;  2RPI A;  4JHD B;  2UXD K;  1ZUT A;  4HUG A;  3C6U A;  3N4Q A;  4AH9 A;  3BDP A;  2MZ0 A;  4IBN A;  1VRT A;  5LY3 A;  3EE9 A;  2O8F A;  4OGE A;  3KHW A;  3V9Z A;  4KKO A;  1L3V A;  4RW9 A;  1TL1 A;  4FL9 A;  2N2Q A;  1N34 K;  3PV8 A;  4EZ9 A;  3KOZ A;  2E3F A;  2ETJ A;  3WQU A;  2E8A A;  3O4Q A;  3VQQ A;  3SAH A;  2I5J A;  1DT9 A;  3DRP A;  1XMQ K;  1KFS A;  5C12 A;  2UUA K;  3AO4 A;  1LAV A;  2YIP A;  4G9Z A;  1HKG A;  3CJA A;  3IUC A; 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