5EVZA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5evzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5evzA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5evzA04
2A41A 4FWKA 5AZIB 5KQ8A 2FSJA 5JICA 3ZX0A 4B1VA 5AQGA 2CGKA 2D0PA 3QB0A 4FPAA 2E8AA 1TUUA 4EIAA 4QS8A 1NGBA 1NGGA 4FWSA 3FLCO 3HBTA 3U9DA 3CJAA 3WXIA 5AQVA 4CD1A 2FSNA 2F9WA 2CGLA 1T6CA 4NO7A 3VGKA 1HUXA 2I7PA 2VWBA 3QFUA 1NGIA 4BROA 2BTFA 3U9ZA 1DGKN 1KXPA 3FFKB 3FR0A 4BR0A 2E2OA 2HF4A 3DXMB 4MLHA 2QW9A 5BN9A 4BRCA 4BGAA 1DEJA 2P9IB 3QICA 3VEYA 4BG9A 5BR9A 2Q97A 4FWLA 3GOIA 4BRFA 5BRDA 4JNEA 3VERA 3QDKA 4M63C 4BRNA 2IIRA 4FOEA 2QM1A 1K8KB 3D2FB 3AY9A 1IJJA 5LY3A 4CZJA 1ZBSA 4JN4A 4BRPA 4AM7A 2GELA 4CZIA 2YHWA 2NLXA 5E26A 1IG8A 1QZ6A 5AQRA 3C0BA 3O5BA 3WQUA 1RFQA 1TYQB 3DXKA 3SK3A 1T44A 2YJFA 3VEZA 4AM6A 3DJCA 3TU5A 4PKGA 3KZBA 3OHRA 4L3QA 2HMPA 2E2PA 2CGJA 4CI6A 3RSEA 3AARA 1D4XA 3HM8A 4B9QA 2FXUA 2CH6A 2E2NA 2I7NA 2E2QA 3O1WA 4K41A 3ID8A 1YUWA 2ASMA 1U6ZA 4XH5A 3F9MA 4Z94A 2EWSA 4YDUC 3VF4A 1X9JA 4BVPA 1GLDG 1YAGA 4FWRA 3S41A 1RDWX 1V4TA 1GLFO 2AP1A 3DAWA 5AQIA 4JHDB 1C0FA 2YHXA 3O4WA 4IWVA 3O6WA 1X3MA 1BWFO 2YHYA 5BPNA 4BVOA 4FWPA 1U2VA 5AQPA 2E20A 2J4RA 3CQYA 3IMXA 4CZHA 3SMSA 1HJOA 1RGIA 5ELZA 5AR0A 3LM9A 4MLEA 3FZHA 3ZX3A 3VGMA 3H3NO 3R9PA 1JCFA 5AQXA 4BR2A 2VYPA 4B1XB 3IUCA 4RCHA 2YI1A 1KAZA 4H0OA 2QWNA 5BRHA 3BEXA 3W0LA 1TUYA 2QXLA 2HF3A 3I8BA 5BN8A 5AQWA 1Y64A 3VESA 4BR5A 4IXCA 1MDUB 5EY4A 4IO8A 4H0YB 5AQMA 3WUHA 4IJAA 1HKBA 3UB5A 3MDQA 3KVGA 3CJ1A 2ASPA 3QBWA 1QQOA 4EAHD 1NM1A 4E1JA 3VEXA 5EXWA 5AFUH 2E1YA 1MA9B 4BRMA 1Q18A 4M7XA 4PL8A 4I6MA 4BRHA 4CBUA 2GWKA 5AZJA 1BUPA 2Q36A 3G25A 4GY2B 4JAXA 3VEVA 4BRGA 1NGEA 3U4LA 4BRLA 3FZKA 1E4GT 1ATSA 2ZWHA 4FWNA 2GWJA 3HSCA 2V51B 3DXKB 4LC9B 4ISFA 1R59O 4HTLA 2PAVA 1NWKA 5JMVA 4BQLA 2P9SA 3I33A 3RSEB 3ZETA 4QS9A 1HKCA 1BU6O 3KHYA 3MN9A 5ADXA 4BC5A 3LDPA 4HWIA 5FPNA 5AQZA 4BC2A 2P9PA 1SQKA 5AQNA 5F1XA 3CQXA 3MCPA 3VPZA 1YVNA 1X3NA 1E4FT 1CZAN 3HZ6A 4BRAA 1ESVA 4IZ9A 2GUPA 3C7NB 3ZX2A 4NB4A 3LDOA 4B1WB 3UKUA 4JD2A 3A5MC 1DKGD 4H5WA 4MO4A 5EOYA 4CJ7A 4WQ5A 2ASOA 4CBXA 3FZFA 2NZTA 4BR4A 4RWTA 2GTDA 3FE1A 3GBTA 3CERA 4C23A 3D2EB 1QQNA 5F0XA 2P9NB 4CZKA 2KHOA 2YJEA 4FWMA 2Q0UA 4ISGA 3W3DA 5LJVA 1U2VB 5AQYA 1QQMA 4BR9A 3FGUA 2PBDA 3H3OB 1MWMA 2FLOA 2H3GX 2IVNA 4H0XB 4O5FA 4DB3A 1GLEG 3A5NC 3MMVA 5KPTA 3MK6A 3JS6A 4CD3A 5JLHA 1BG3A 2UYTA 4CZEA 4BQZA 5FPEA 5LJWA 5BPMA 3ENHA 3WQTA 4KBOA 3BUZB 3MN7A 4K43A 3MN5A 4BRQA 3ZEUA 4BC4A 4WQ4A 3CHWA 4A2AA 1HKGA 3CJBA 1QZ5A 2V7YA 1ATRA 4PL7A 3UKRA 2D1KA 1NLVA 3VF2A 5FPMA 5AQOA 1NBWA 3A5LC 3R6MA 3J8AA 4IJNA 5BPLA 3GG4A 2W40A 4ISEA 3LDLA 4PKIA 1BOTO 4J8FA 3GDQA 2IVOA 2GEMA 3WT0A 4I6MB 3B8AX 1NGAA 4FO0A 5AZJB 3UE5A 3HTVA 4BG8A 4BR7A 3EO3A 5AQUA 4H0TB 4QS7A 3L4IA 2FSKA 3IFRA 2NRHA 3WXLA 3SJHA 2BUPA 2E88A 2P9SB 4DHYA 5KPZA 3ZETB 2P9KA 3VOVA 5FPDA 1GLBG 3TPQA 4FPBA 2VCPA 3CETA 3CI5A 1C0GA 4H0VB 3EKSA 4BGBA 3WEEA 5EX5A 3GL1A 2AA4A 1LCUA 4CZFA 3QMLA 1NMDA 1QHAA 3O80A 4FL9A 1XUPO 3D7EO 1SZ2A 1J6ZA 1NGDA 3LDNA 3UKUB 3LDQA 3R8EA 2DPNA 1G99A 4JD2B 4FSVA 2P9UA 2QWRA 3SLCA 4JHDA 3WXKA 2CH5A 3MN6A 3BF1A 3FZLA 3AAPA 2P9LA 3H46O 4XH4A 1OKJA 4Y0WA 4BRIA 1NGHA 2A42A 4XEIA 4B1UB 3ULEA 3M6GA 1XC3A 2QWMA 2V52B 1WUAA 3L0QA 4M7YA 4PKHA 1JCEA 1YXQA 3ENOA 5TKYA 5KQDA 4DCHA 4H03B 4CZLA 5KPRA 4WQ5C 1JCGA 1GLLO 4FWOA 3CIPA 3VF6A 3H6EA 4A61A 4BRKA 2Q31A 4BRDA 5CE3A 1HPMA 2FF6A 4FWQA 2QWLA 2IVPA 4DQ8A 3EN9A 3GE1A 2QWPA 1Z6RA 3BP8A 3H1VX 3HI0A 3EKUA 4A2BA 1NGCA 5AQLA 2QWQA 2YCHA 3ZEUB 4B1ZA 3VETA 4A62A 3A8YA 1H1VA 5AZIA 4H0PA 4FOIA 3UKRB 5BRFA 1LOTB 4H5VA 3ATUA 4EHUA 3P4IA 1S22A 3CJ7A 2WUSA 2A3ZA 2Q2RA 2QWOA 4EHTA 4WQ4C 3ATVA 4MO5A 5E84A 2OANA 1ATNA 3M3ZA 4H5RA 1EQYA 1NGJA 2ZGZA 5EVZA 5ADXH 1BDGA 3U8XA 3O1BA 2ITMA 1ZC6A 1ZXOA 3H1QA 3WXJA 5AQQA 5AQHA 3L6QA 4BREA 2F9TA 3A0IX 3O08A 2W41A 3DXMA 3JXUA 1GLCG 2P9KB 3EL2A 2P9IA 2FF3B 2HOEA 3A5OC 4F9OA 2A5XA 1KAYA 3SMPA 3VEWA 3WEEB 5BREA 3FZMA 3VENA 1KAXA 1S3XA 4XH1A 1HX1A 2D4WA 1GLJO 4H5NA 2ZGYA 5AQSA 2ZF5O 3C7NA 1HLUA 1MWKA 5AQFA 1T6DA 1BA0A 3LL3A 1Z05A 1K8KA 3D2FA 4BC3A 2A40A 3CJ9A 2P9UB 1GLAG 4B1YB 4GNIA 4CBWA 2E1ZA 4K42A 5F2RA 3M1FA 5AFUA 3VEOA 2P9LB 3DWLA 5AQJA 5I9EB 4WYBA 3D2EA 1TYQA 1BO5O 2P9NA 5AQTA 4RTFD 3CJCA 4K25A 3ULEB 1XQSC 2D0OA 4EFHA 1SAZA 1V4SA 3QFPA 1NGFA 4YDUA 4CZMA 4O8KA 4CZGA 3H45C 3IDHA 3O8MA 3VGLA 2P9PB 2Q1NA 2V7ZA 3QBXA 3EZWA 5B8HA 2Q0RA 3BF3A 3LM2A 1BA1A 5JLFA 5AQKA 3AAQA 1WOQA 2A6AA 4H5TA 1P8ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T3VA 3AVBA 4FWKA 5KQ8A 1WSFA 4CEDA 1HPZA 3TANA 2CGKA 2YNFA 3CCSN 3QB0A 3CYGA 2NRVA 4NCBA 2E8AA 1FKPA 1RBRA 5J2QA 3VA3A 4FJ5A 3HBTA 4E7JA 5J2NA 3VQ8A 3QIPA 3G10A 3E9PA 2FSNA 4CVNE 2F9WA 1TKXA 1C55A 3DM2A 2W6LA 3VGKA 1HUXA 2VWBA 4BROA 3AO4A 2BTFA 4HCBA 2KZZA 3U9ZA 3FFKB 3MXMA 1ASUA 4BRCA 4V19S 2E0HA 4HHFA 3O3HA 2YILA 4UQGA 3ALYA 1DTQA 3C6UA 2ATBA 1KCFA 1SL2A 2C1IA 1L3TA 1BQNA 3HXMA 4DV5K 4YOTA 4O55A 4KHWA 3QDKA 2PY5A 4FOEA 2QM1A 4M45A 3AVLA 3D2FB 1ZBSA 1VSHA 4DTJA 5J2MA 1U45A 2LJ7A 2VGMA 3O5BA 5D3GA 1RFQA 4FJXA 1TYQB 3SK3A 2YJFA 4UAEF 4H4OA 4CF0A 3DJCA 3KZBA 1U04A 4L3QA 3PO5A 3SI6A 2CGJA 4JKGA 1I6GA 1YT3A 2F4VK 1N34K 3QETA 2ASMA 1PE4A 4F3TA 1KVAA 3VMFB 1SKRA 2KPYA 4OPKA 1GLDG 1YAGA 3OYLA 3E66A 4FZXC 1RDWX 2AP1A 3DAWA 4FJ9A 3I8DA 5AQIA 4UJ0A 4JHDB 1M1KO 4ILHA 4IWVA 4JI2K 1RTJA 4CEQA 3O6WA 1K6YA 4HVJA 4BACA 1X3MA 1BWFO 4CF9A 1SN4A 4X62K 4FXDA 2HHVA 2RPIA 5GIOA 2BH1A 4W5RA 5AQPA 2HB5A 2E20A 3CQYA 3SMSA 3THYA 1RGIA 4MLEA 3FZHA 4PA1A 3ZT4A 4GV6A 3H3NO 2O4IA 1GOCA 4B9TA 5AQXA 4BR2A 4CGIA 4C1NK 4KH6A 4JV5K 2YI1A 2VWKA 3TWHA 1ZBIA 1TUYA 2HF3A 1JL2A 3I0SA 2KLAA 3DMJA 1WBDA 1JLCA 2OPSA 3QEVA 4KB1A 2O4GA 1VQ7N 4DFJA 2WONA 4HE7A 1KC8O 2HVHA 1J9AA 4B08A 5HOOA 4O4GA 1DLOA 3QNNA 1NM1A 3QIOA 1WSIA 3N4QA 4KPYA 3RMCA 4TSXA 4PL8A 4I6MA 1LW2A 4E7HA 5AZJA 1IV0A 3TTFA 1VSEA 1NK0A 1K73O 2GWJA 3HO1A 2V51B 4W5NA 2PAVA 4CK3A 4BQLA 1QE1A 3DLGA 2XY7A 1OZZA 3I33A 2UUCK 1K9MO 3MN9A 5ADXA 4K8XA 4BC5A 2VWJA 5CYQA 4FJLA 4DV3K 2P9PA 5F1XA 1M90O 3I0RA 3VQDA 3G6EN 3P1GA 3MCPA 3Q7BA 3ZT2A 4AHRA 1E4FT 1I6FA 3LPTA 1NJXA 3CC2N 4LF9K 4DR3K 2GUPA 3ZX2A 3OJUA 4B1WB 1ILYA 3AGRA 3HOSA 4WFNL 1TVRA 3OYKA 5IT9O 1KSPA 1DKGD 4H5WA 1QVGM 4CJ7A 4WQ5A 4BR4A 4RWTA 1NK9A 2GTDA 1RT5A 4CZKA 1HQEA 1VSJA 2Q0UA 3HYFA 5LJVA 3IRXA 1U2VB 1VSMA 3PSMA 2BE2A 3FGUA 1J5OA 2FLOA 2H3GX 3C6HA 4H0XB 4W5TA 4IO9L 1TAQA 4O5FA 1T7AA 2E2FA 3V9WA 2ETJA 2FC0A 4ID1A 3JS6A 2WOMA 5FRNA 4JKAA 2LY5A 1K8BA 4BQZA 5FPEA 5LJWA 5BPMA 3HM9A 3KK1A 2UXDK 3SV3A 2HBLA 4DUYK 1UAXA 3O4QA 4MQ3A 4NCGA 4A2AA 2NRZA 1XMOK 1ATRA 4PL7A 4E89A 4LFAK 4FK2A 3A5LC 4JKDA 4WFBL 5BPLA 3FFIA 1J53A 1I2UA 4ISEA 2IVOA 2GEMA 2X6SA 2UUBK 3KLHA 3J80O 3KK2A 4FO0A 3HVRA 4BG8A 2GUIA 1P0AA 5AQUA 1LWEA 3TAFA 1VQ5N 4JK8A 1VQ6N 1TKZA 4I7FA 3IFRA 2D0AA 3WXLA 3RRGA 4E19A 1VQKN 3OYMA 1QSSA 4ILJA 1O13A 2E88A 2P9SB 2LSNA 2P9KA 4IG3A 3S3NA 1GLBG 4KKOA 2A7TA 1LW0A 4FPBA 3TPQA 3TSUA 1IKWA 3CETA 1WNSA 4JI0K 4CJLA 3OYDA 2DTUA 4DV2K 2P5OA 5KRSA 1WT7A 4CZFA 5C10A 1XUPO 4QAGA 1SZ2A 1J6ZA 1NGDA 2YHAA 1TL3A 1TK8A 2QEXN 3SAHA 3LDQA 2DPNA 2P9UA 2F96A 1C0UA 4JHDA 4OX9K 3N4PA 4M3TA 1VRTA 4DSIA 2F7TA 3DRRA 4Q0BA 4Y0WA 1JLBA 3NE6A 3V9UA 1KQSM 3ENBA 1YHQN 1ZYWA 1XC3A 2HBJA 5LMUK 4FJHA 4DCHA 4KHQA 1LWFA 5CY4A 1IKXA 4CK1A 4HTUA 3SPYA 1ZVGA 4F2RA 4CE9A 3H6EA 3J7YP 2LN8A 2E6MA 4E3SA 1HPMA 3HVTA 2QWLA 4DV0K 4EP5A 3K5LA 3GE1A 2HW3A 5DM6L 5I42A 3BP8A 4KB0A 1WWNA 3ASMA 2F8SA 2LKBA 3OBYA 2YCHA 3ZEUB 4A62A 3NF8A 5AZIA 1REVA 4JLHA 4V1DC 1ICAA 1ZU3A 3ATUA 4EHUA 2XY5A 3P4IA 1S22A 5K14A 1D5AA 4Z0UA 3CJ7A 2A3ZA 2QWOA 3V9SA 4N5SA 1G15A 2OANA 3KWGA 1C0MA 4JRQA 2ZGZA 4CEBA 2ZJRL 1BMRA 1BDGA 3U8XA 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3J81O 3VERA 1OVQA 1NKCA 4NCAA 1NK7A 4M63C 3L2WA 1NH5A 4BRNA 2BRZA 2B6AA 1ASVA 5LY3A 4CZJA 4CZIA 3EZ5A 4B3OA 4DSKA 3OTOK 1Q81O 4Z4GA 3CMEN 1RBTA 3TU5A 2O8CB 3ZLJA 2P51A 5GADP 3V1OA 2NRTA 3CPEA 4YHHK 4I2QA 3VN5A 3U3YA 3AARA 4HUFA 1EETA 2HHQA 2I7NA 4DTOA 3O1WA 4ELVA 4DV7K 3DLRA 1P90A 4M3YA 3P39A 3VF4A 1ITGA 3S41A 4AHVA 1C56A 4DR7K 1C0FA 1O1WA 3O4WA 2D56A 5T7BA 3VQ6A 1XNRK 2IGIA 1ZYVA 4B9MA 4JKCA 3C6AA 5J2PA 3L2UA 3LDSA 1W7AA 1B7DA 4IEEA 4B3TK 4IOCL 1RDBA 1YJ9N 1TL1A 3KKSA 4G9ZA 3OS2A 1HJOA 5AR0A 3LM9A 3ZX3A 1SV5A 4IG0A 1EWQA 4M3WA 1IH7A 2VYPA 4B1XB 2ATQA 3IUCA 1KAZA 2YIPA 4H0OA 2QWNA 1BIUA 2ZD1A 4DV4K 3LWLA 3RR7A 3PX0A 1XWLA 3K59A 1EWRA 5AQWA 3SQ1A 3I55N 3T19A 4BR5A 1OH6A 1WAFA 5EY4A 4OVLA 3AVFA 1KLMA 4DSFA 2P1JA 4IJAA 3L3VA 3THXB 3TAQA 2X74A 3EE9A 3MWTA 3VTIA 2D0CA 3QBWA 5FROA 1L3UA 5C2DA 4E1JA 5EXWA 2DFFA 4BRMA 5HL7L 1Q18A 3T69A 1IG9A 3PO4A 3GKUA 4BRHA 1BISA 3BZCA 4EP4A 4JAXA 3VEVA 1IKYA 1S6PA 1T1TA 1E4GT 1ATSA 4HCCA 4FWNA 3HSCA 1OMYA 3DXKB 4Y1DA 1P00A 4HTLA 3CCEN 4CJKA 4FLTA 1NG9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1T3V A;  3AVB A;  4FWK A;  5KQ8 A;  1WSF A;  4CED A;  1HPZ A;  3TAN A;  2CGK A;  2YNF A;  3CCS N;  3QB0 A;  3CYG A;  2NRV A;  4NCB A;  2E8A A;  1FKP A;  1RBR A;  5J2Q A;  3VA3 A;  4FJ5 A;  3HBT A;  4E7J A;  5J2N A;  3VQ8 A;  3QIP A;  3G10 A;  3E9P A;  2FSN A;  4CVN E;  2F9W A;  1TKX A;  1C55 A;  3DM2 A;  2W6L A;  3VGK A;  1HUX A;  2VWB A;  4BRO A;  3AO4 A;  2BTF A;  4HCB A;  2KZZ A;  3U9Z A;  3FFK B;  3MXM A;  1ASU A;  4BRC A;  4V19 S;  2E0H A;  4HHF A;  3O3H A;  2YIL A;  4UQG A;  3ALY A;  1DTQ A;  3C6U A;  2ATB A;  1KCF A;  1SL2 A;  2C1I A;  1L3T A;  1BQN A;  3HXM A;  4DV5 K;  4YOT A;  4O55 A;  4KHW A;  3QDK A;  2PY5 A;  4FOE A;  2QM1 A;  4M45 A;  3AVL A;  3D2F B;  1ZBS A;  1VSH A;  4DTJ A;  5J2M A;  1U45 A;  2LJ7 A;  2VGM A;  3O5B A;  5D3G A;  1RFQ A;  4FJX A;  1TYQ B;  3SK3 A;  2YJF A;  4UAE F;  4H4O A;  4CF0 A;  3DJC A;  3KZB A;  1U04 A;  4L3Q A;  3PO5 A;  3SI6 A;  2CGJ A;  4JKG A;  1I6G A;  1YT3 A;  2F4V K;  1N34 K;  3QET A;  2ASM A;  1PE4 A;  4F3T A;  1KVA A;  3VMF B;  1SKR A;  2KPY A; 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