5EXWA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 7-deaza-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
VGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5exwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5exwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5exwA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5exwA04
2PAVA 4QS7A 1NM1A 3EZWA 2FSKA 5AQOA 1SAZA 4XH1A 3BUZB 3CIPA 2HF3A 4BRMA 4BROA 2I7NA 3WT0A 5AQVA 1BDGA 3HTVA 4BREA 4FWRA 2V7YA 4Z94A 2Q2RA 3GDQA 5BPMA 4EAHD 4WYBA 3ZETA 4K41A 3WXLA 1HPMA 1QQOA 4JNEA 1RGIA 2P9IB 4WQ4C 2QXLA 3EKUA 4BR2A 1BA0A 5FPMA 1BWFO 3QDKA 4FPBA 4FPAA 5AQXA 3LM2A 5FPDA 3AY9A 1X3NA 4WQ4A 3CJBA 5BRHA 4BRQA 1ZXOA 3U9ZA 5ADXA 5E26A 2E2QA 3A5LC 5JLFA 4JHDB 3R9PA 1NLVA 5JLHA 2P9IA 2Q0RA 2W40A 1KAYA 1JCFA 4FWOA 1IG8A 3IMXA 5F1XA 3FZFA 2ITMA 2E2OA 4H5RA 1TUYA 4JHDA 3S41A 2BTFA 3FE1A 3D7EO 4RWTA 4ISGA 4NO7A 4BGAA 5TKYA 4DB3A 2NLXA 1KAZA 4ISFA 3HZ6A 4FWSA 3ZX3A 4B1VA 1ESVA 3VGLA 1GLFO 4BRHA 4DCHA 2D0OA 3MN7A 2AP1A 5I9EB 3MMVA 4MLHA 2FSJA 4H0OA 4BC5A 5BRDA 4FWKA 4WQ5C 1YVNA 3BP8A 4HWIA 3CJCA 4XH4A 4Y0WA 2ASOA 3O80A 3D2EB 2HF4A 2QWNA 5FPEA 4FWMA 3VEOA 1QZ5A 3VF2A 1X9JA 1TYQB 3FZKA 2DPNA 3FFKB 3QFPA 4BQZA 3WXIA 3GBTA 3MK6A 2GELA 3EN9A 2QWOA 4MLEA 3O6WA 4BRNA 2YHWA 5B8HA 4CZEA 5BREA 3D2EA 5KPRA 3SJHA 4AM6A 1TYQA 4GNIA 4IJAA 4PL7A 2YJFA 4BRCA 3I33A 3O1WA 1MWMA 2FLOA 4H0VB 3EO3A 1GLCG 2GWKA 1RFQA 2H3GX 1WOQA 4CZFA 3H3OB 2P9SB 2HMPA 1Y64A 3ZEUB 3W0LA 3WXJA 2A40A 3DXKB 2V52B 3CJ7A 4KBOA 3HBTA 4AM7A 1ATRA 5KQDA 5E84A 2WUSA 4IO8A 1HUXA 2OANA 3EL2A 1NGJA 3WEEB 3F9MA 1BG3A 1P8ZA 2P9SA 3MN5A 1BOTO 2D4WA 3R6MA 1E4FT 2E1YA 3ZEUA 4BR4A 2P9PB 5EOYA 3VEZA 4CBWA 4CZLA 4BRKA 1T6CA 5EVZA 4A62A 3DXKA 1D4XA 4PKIA 5ELZA 4BC2A 3O8MA 3CJAA 3JS6A 3SMPA 3WEEA 4BG8A 4MO4A 2A6AA 4A2BA 1S22A 3KVGA 3HI0A 3VPZA 3UE5A 3FZHA 3WQUA 1GLDG 2P9PA 4YDUC 1NWKA 3ATVA 1GLBG 5BPLA 2FSNA 3SK3A 4MO5A 1MDUB 5KQ8A 3QFUA 3VGMA 3BEXA 3CJ9A 3IFRA 4BR7A 3MN9A 1NGGA 4YDUA 3TU5A 4H0TB 3UKRB 1DGKN 3AARA 4PL8A 2V51B 4H5NA 4FOIA 3HSCA 2IVNA 3HM8A 1GLLO 4BQLA 3O1BA 4XEIA 4A61A 3O5BA 5AQMA 2ASMA 4H0YB 3CQXA 2W41A 4QS8A 1OKJA 1DEJA 3H3NO 3CJ1A 3L0QA 5AFUA 2A42A 2P9UB 3UKRA 3VEVA 4NB4A 2Q36A 4B1WB 4BRFA 3U9DA 5LJVA 1XQSC 2QWLA 2FF6A 4O5FA 5AQRA 3EKSA 3VEYA 1T6DA 4BR5A 4B9QA 4FSVA 2YHYA 3WUHA 2A5XA 3GG4A 1WUAA 2P9UA 3LDLA 1QQMA 3CQYA 4C23A 2BUPA 5AQHA 2Q1NA 3FZLA 3I8BA 3H1VX 4BGBA 2FF3B 3VF4A 2P9KB 3A0IX 4DHYA 1HJOA 1SQKA 3KZBA 3ZX2A 1DKGD 3H45C 2E2NA 3VEWA 4B1YB 4BR9A 3ATUA 1BA1A 3C7NB 2J4RA 4QS9A 1GLJO 1ZC6A 1NGEA 1NGAA 4J8FA 4A2AA 5JMVA 4B1ZA 1Z05A 2I7PA 1JCGA 3FR0A 2P9KA 4WQ5A 3DJCA 1EQYA 4BRGA 3B8AX 3BF1A 3CERA 3CHWA 4H0XB 4CZMA 2CGJA 3MDQA 3C7NA 3P4IA 1NGBA 5AQQA 3VF6A 2F9TA 1NGIA 5AQJA 1YUWA 4XH5A 3L6QA 4B1UB 2E1ZA 5ADXH 3ENHA 5BN8A 3RSEB 3D2FB 3MCPA 5AZIB 3ENOA 2GUPA 2CH6A 3DWLA 1V4SA 2E2PA 4CZJA 4FWNA 5KPZA 4H5TA 4EIAA 5LJWA 4CZKA 4BRIA 5F0XA 4ISEA 1ATNA 4M7YA 2EWSA 3RSEA 3D2FA 4BRDA 2D0PA 3SLCA 4FWPA 4I6MB 1ATSA 5AZIA 5AQNA 4BC4A 3H1QA 5AQPA 3AAQA 1CZAN 5LY3A 1G99A 5EY4A 5AQSA 2CGKA 3A5NC 4BRPA 4CD3A 2NRHA 2QW9A 3O4WA 4H5WA 1HKCA 3QB0A 4EHUA 4CJ7A 3R8EA 2HOEA 3CETA 4CD1A 1YXQA 3FZMA 1NGDA 3DXMB 3QICA 4I6MA 1LOTB 2P9LB 4F9OA 3GOIA 5EXWA 2KHOA 5KPTA 2YI1A 3A5OC 2FXUA 2ZGYA 4JAXA 2CGLA 3DXMA 4FOEA 3C0BA 2V7ZA 4IZ9A 4RCHA 3ULEB 2P9LA 1XC3A 2GWJA 3QBWA 3OHRA 1NGCA 4CBUA 4M63C 4PKHA 3A8YA 3O08A 1KXPA 3H46O 4JD2B 4BG9A 2AA4A 3ULEA 1XUPO 4IJNA 2UYTA 5AQIA 1BO5O 2E20A 1E4GT 3ID8A 3UB5A 4M7XA 1BU6O 2QWPA 3LDQA 3FGUA 4K42A 2GEMA 4BVOA 4IXCA 2D1KA 4CZGA 1IJJA 5F2RA 3IDHA 4JD2A 1NGHA 5AQKA 4CZIA 4L3QA 1U2VB 3IUCA 1K8KB 4EHTA 3FLCO 3M6GA 3VGKA 5EX5A 1NGFA 2VYPA 1S3XA 2QM1A 3DAWA 3J8AA 3L4IA 3QMLA 1TUUA 1GLAG 2CH5A 2YCHA 3CI5A 3JXUA 3LDPA 1NMDA 1KAXA 4K43A 2VWBA 1U2VA 4H0PA 5BPNA 5AQWA 1K8KA 2ASPA 4BC3A 1X3MA 1R59O 4RTFD 3VERA 1QHAA 4LC9B 5AQFA 1C0FA 3AAPA 1RDWX 5AQTA 4CZHA 3GL1A 3LM9A 1QQNA 2E88A 1ZBSA 3LL3A 2Q31A 2YHXA 3GE1A 5BN9A 1NBWA 4HTLA 1MWKA 4PKGA 4E1JA 2NZTA 4O8KA 1C0GA 4IWVA 5AFUH 3LDOA 3M1FA 3KHYA 5AQYA 3WXKA 3A5MC 4BRAA 4H5VA 1JCEA 2QWQA 3ZX0A 5AQUA 3VETA 1U6ZA 3BF3A 2E8AA 5FPNA 2YJEA 3TPQA 1J6ZA 3UKUB 3VESA 1HX1A 2IIRA 1YAGA 2PBDA 1Q18A 2A41A 3MN6A 2P9NB 4DQ8A 3LDNA 5AQLA 1MA9B 4BR0A 2QWMA 1LCUA 4FL9A 2IVPA 2Q0UA 5CE3A 1Z6RA 3VENA 2QWRA 2ZWHA 2IVOA 3U8XA 3UKUA 3M3ZA 2ZGZA 1T44A 2Q97A 4K25A 3G25A 4FWQA 2P9NA 3VEXA 1GLEG 2A3ZA 5AZJB 1BUPA 5JICA 2VCPA 2ZF5O 5BRFA 4JN4A 5AR0A 1HLUA 1HKBA 5AQZA 5BR9A 4EFHA 1H1VA 4BVPA 4FO0A 1HKGA 4BRLA 4CI6A 4GY2B 3U4LA 5AQGA 3H6EA 1V4TA 4H03B 1QZ6A 3SMSA 4FWLA 4CBXA 5AZJA 2F9WA 3VOVA 3W3DA 3WQTA 3QBXA 1SZ2A 4B1XB 3ZETB 2GTDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JVGL 1NKCA 1NM1A 3EZWA 4DF8A 2HHIA 4FLUA 3BUZB 2HF3A 3DI6A 3K9JA 2YKNA 5CZ1A 4BROA 5M1QA 2X74A 3THVA 3MEDA 3WT0A 2G8IA 2O8CA 3CCLN 3KWIA 3AA5X 3BDPA 1EP4A 2RHKA 3HTVA 4CGDA 2N69A 2Q2RA 5BPMA 4EZ6A 4M3TA 3ZETA 2GBZA 4CJRA 1HPMA 2X6NA 2Z1HA 2P9IB 4CFAA 1QVGM 3M8SA 1NK9A 3ZSRA 1Z26A 1U47A 3ZCMA 4KHYA 3UIQA 1KVBA 4U7BA 1ZXOA 4DR6K 2E2QA 3A5LC 5JLFA 3R9PA 4I2PA 2LN8A 5JLHA 4DQSA 5IT9O 3THYB 5KRSA 5KTQA 2HHVA 1KAYA 3PSIA 1JCFA 2KPYA 4CEDA 1Q8IA 2D0CA 3ID6A 2F7TA 1ZBIA 2QTDA 2YEOA 4CK2A 4JHDA 4FYDA 3FE1A 4NO7A 1T7AA 4GVMA 4DB3A 3LZIA 2NLXA 3HJFA 4BE2A 4FJLA 3L3VA 3V4IA 2BRZA 1WBDA 1ESVA 3MWTA 5I9EB 2A1SA 3C6AA 3J7AP 2FSJA 2Z1GA 3O9SA 3R3LA 4CJQA 4J2EA 2JGUA 2O8FB 1YVNA 3CJCA 1XC9A 1VSIA 3O80A 3D2EB 2QWNA 1T3VA 1QZ5A 4PUOA 4KHQA 2DPNA 4Y1DA 1JKHA 2O4GA 3P1GA 3T7ZA 1C0MA 3WXIA 3MK6A 2GELA 4HUEA 2HBLA 3O6WA 1VQ8N 3TAGA 2YHWA 1KFDA 1NK8A 1RT5A 5KPRA 3RTVA 4DSJA 3HP6A 2YJFA 3I33A 4DSKA 4B3TK 1XHZA 4GV6A 1NU0A 4W5NA 3KOZA 1TK0A 1HNZK 3H3OB 2F8SA 2HMPA 4WFBL 1BCOA 1Y64A 2OPSA 3O3HA 3T1AA 4EZ9A 2QXFA 1A5XA 1DQ7A 4DV3K 2B5JA 4A5BA 3THWA 4CQKA 1LW2A 1P8ZA 1VQNN 3JYTA 2D4WA 2E1YA 5CR4A 1ZVGA 4BR4A 1EETA 4IDKA 3THXA 4CIFA 1VQON 4KTQA 3O8MA 3HM9A 4J2BA 2ZE2A 4MO4A 1S22A 4KB1A 3VPZA 3FZHA 3WQUA 3SAHA 1GLDG 2DTUA 3LALA 2W6LA 4YDUC 2OPQA 3L8BA 1GLBG 1IO2A 3QFUA 1VNBA 3AO2A 3AGRA 3SV4A 3IFRA 3TWHA 4NYNA 4BE7B 4YDUA 3UKRB 4H0TB 5MLCQ 2E2FA 1DGKN 2D0AA 3V6DA 3LWLA 4GKJK 2V51B 2NY8X 2NRRA 4JKCA 1GLLO 3O1BA 3NH0A 1T03A 1SEGA 4A61A 1FXXA 2ASMA 4DTRA 4BE0A 3AO1A 2KGQA 4JK7A 4ILGB 4NXNK 3E7RL 3VEVA 2WC9A 1JLQA 4F8RA 4DV2K 4Z4GA 4B1WB 4EP4A 1XQSC 4YOTA 4FJMA 2FF6A 2B3CA 4B9QA 2YHYA 3WUHA 4LSLA 3L56A 2A5XA 4DFKA 1W2BM 2P9UA 4M3RA 5D3GA 3E66A 4KI6A 1QQMA 4OLAA 5AQHA 3FZLA 5M1OA 1Q9YA 1L3TA 3JSMA 2P9KB 3A0IX 4KI4A 3RRHA 2B4JA 3ZX2A 4E72A 2VGNA 3VEWA 4JKBA 1S9EA 1BA1A 3C7NB 4QS9A 4IDHA 1WAJA 1WSEA 3I0SA 4WFAL 1VSJA 3K57A 4J8FA 4K8ZA 1A5WA 2I7PA 3KLHA 3CCSN 4IOXA 4DR5K 4BRGA 1KVCA 3BF1A 3CHWA 3SPZA 4GV3A 4CHZA 4H0XB 2CGJA 3NF7A 1B9FA 1T1TA 3MDQA 1NGBA 2LJMA 3HOSA 2PY5A 5AQJA 1TI5A 3AVGA 2OZMA 1C55A 1FH3A 4BDPA 4RW8A 2PZSA 4LH5A 3CCRN 1QSLA 1KC8O 1XNRK 4NXMK 1L4VA 2RN2A 3KD5E 4FWNA 5KPZA 4DS5A 1K8BA 3O4NA 2YNFA 3QNOA 4QAGA 1SUQA 3K58A 2HMIA 1ILYA 3RSEA 1JZAA 3D2FA 5DM7L 1QTMA 2D0PA 3LDSA 1C1CA 3WXMB 1ATSA 2B6AA 2NRWA 1RT6A 5AQPA 4LF4K 4CF9A 3MXMA 3FFIA 4CD3A 2QA4N 4MDAA 1N5YA 2RKIA 5HBMA 4IG0A 3CM5A 3O4WA 4H5WA 1HKCA 3R8EA 4CD1A 1YXQA 3FZMA 5CYMA 1RNHA 2B68A 1MU2A 1IH7A 4BWMA 1SKSA 2ATBA 4IFEA 4N5SA 4R79A 3TAPA 4C8OA 4C1NK 2UUAK 5HLFA 4RW9A 2YI1A 4O5BA 4O55A 3A5OC 3VQEA 5GIPA 2QKKA 4DWIA 3C0BA 3R2VA 3ULEB 2P9LA 2LKBA 4Z4FA 1XC3A 4CESA 1Y97A 1S1TA 4CBUA 4B8AB 1QE1A 3SPYA 3OJUA 4LF9K 4OPKA 1OMYA 2E5LK 2P5OA 1JXCA 4JD2B 3NDKA 1ZBHA 2KQ2A 1W0HA 4IJNA 3O3FA 3MXIA 1BO5O 3ZT3A 3ID8A 2GMOA 3VQAA 3NH1A 1UA0A 1N8RO 3LDQA 3FGUA 4K42A 1ASWA 2D5RA 3WNEA 4ID5A 1VQ7N 1TL3A 4CZIA 4M41A 4CVNE 2VG6A 3LP0A 1ASUA 3IUCA 3QI7A 1OVQA 4DR2K 1WLJA 4JV5K 4CJ4A 4ZHRA 1VSDA 1S3XA 3DAWA 3L4IA 3QMLA 2SN3A 1GLAG 4CJUA 1L3SA 3QEIA 4BWJA 4E0DA 5BPNA 3K2PA 1X3MA 3S3OA 4ZTJA 1RBRA 3VERA 1RBTA 1U48A 1HNXK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5JVG L;  1NKC A;  1NM1 A;  3EZW A;  4DF8 A;  2HHI A;  4FLU A;  3BUZ B;  2HF3 A;  3DI6 A;  3K9J A;  2YKN A;  5CZ1 A;  4BRO A;  5M1Q A;  2X74 A;  3THV A;  3MED A;  3WT0 A;  2G8I A;  2O8C A;  3CCL N;  3KWI A;  3AA5 X;  3BDP A;  1EP4 A;  2RHK A;  3HTV A;  4CGD A;  2N69 A;  2Q2R A;  5BPM A;  4EZ6 A;  4M3T A;  3ZET A;  2GBZ A;  4CJR A;  1HPM A;  2X6N A;  2Z1H A;  2P9I B;  4CFA A;  1QVG M;  3M8S A;  1NK9 A;  3ZSR A;  1Z26 A;  1U47 A;  3ZCM A;  4KHY A;  3UIQ A;  1KVB A;  4U7B A;  1ZXO A;  4DR6 K;  2E2Q A;  3A5L C;  5JLF A;  3R9P A;  4I2P A;  2LN8 A;  5JLH A;  4DQS A;  5IT9 O;  3THY B;  5KRS A;  5KTQ A;  2HHV A;  1KAY A;  3PSI A;  1JCF A;  2KPY A;  4CED A;  1Q8I A;  2D0C A;  3ID6 A;  2F7T A;  1ZBI A;  2QTD A;  2YEO A;  4CK2 A;  4JHD A;  4FYD A;  3FE1 A;  4NO7 A;  1T7A A;  4GVM A;  4DB3 A;  3LZI A;  2NLX A;  3HJF A;  4BE2 A;  4FJL A;  3L3V A;  3V4I A;  2BRZ A;  1WBD A;  1ESV A;  3MWT A;  5I9E B;  2A1S A;  3C6A A;  3J7A P;  2FSJ A;  2Z1G A;  3O9S A;  3R3L A;  4CJQ A;  4J2E A;  2JGU A;  2O8F B;  1YVN A; 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