5EY4A

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with 2'-deoxy-atp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
382
structure length
378
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDITKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Probing the ATP Site of GRP78 with Nucleotide Triphosphate Analogs.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 118
structure length 378
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2015-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5ey4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ey4A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ey4A04
4JN4A 3ZX0A 4E1JA 1YAGA 5ADXH 3VGLA 3LL3A 3FZKA 4XEIA 4CZJA 3QBXA 2E1YA 1U6ZA 5KPZA 3EKUA 3UKUA 3H1QA 4FSVA 4MO4A 4HTLA 1DKGD 3FZHA 1Y64A 4J8FA 3VF4A 1QZ5A 1V4SA 5AQPA 3L0QA 3S41A 2A6AA 4B9QA 4BVOA 5AQHA 4KBOA 4M7XA 4JD2A 3ZEUB 4Y0WA 3CQYA 3VPZA 3SLCA 4CZFA 4FWLA 3QFPA 3CIPA 4FO0A 4JHDA 1MA9B 4K43A 3LDOA 3A5OC 5AQMA 2A41A 5LY3A 4QS9A 2YI1A 4BVPA 3SMSA 1NGJA 4H5WA 3DXMB 4H03B 3D2FB 3QB0A 2F9TA 4BC5A 1HX1A 1BU6O 3WXKA 1ZBSA 5BPLA 3M3ZA 1YUWA 2GWJA 2HF3A 4H0OA 3C7NA 2IVPA 4RTFD 5BRFA 2P9NB 1WUAA 3LM2A 3CQXA 3C0BA 4RCHA 4BR4A 2VWBA 3ATVA 4K25A 1K8KB 4BRFA 4ISEA 2ZF5O 4B1YB 3AY9A 4PL7A 1NGDA 5ELZA 3VEWA 3CJBA 1R59O 4CD1A 1RFQA 4L3QA 3FZMA 3W0LA 1TUYA 2FF3B 3UB5A 3M6GA 3L6QA 3O4WA 4H0TB 4CZHA 3VEYA 3BF3A 2E8AA 3WT0A 3WUHA 3MN6A 4BRDA 3L4IA 1C0GA 4IXCA 2QW9A 4CD3A 5AZJA 2E2QA 2F9WA 3SK3A 3O1BA 2H3GX 1QZ6A 4LC9B 4NO7A 4MLHA 3QDKA 3AAPA 2P9LA 3MCPA 4CBUA 5KPTA 4BG8A 5FPDA 1Q18A 2P9IA 3EZWA 2FSKA 3WXIA 3FZFA 1NGHA 4BQLA 3ENOA 2Q0RA 4C23A 2WUSA 3FR0A 1TYQB 4I6MA 3WEEA 3UKUB 5F0XA 3LDLA 4FWPA 4F9OA 3WQUA 4PKGA 4CZLA 2W40A 4DB3A 4IO8A 5AR0A 5EVZA 2NZTA 4NB4A 3AAQA 5AQFA 2YJFA 4WYBA 2QWPA 2QM1A 4BR5A 4K41A 4PL8A 3GDQA 4H0VB 2IVNA 3UE5A 5AQNA 4JHDB 3RSEA 2QWLA 3HBTA 3VESA 4H0XB 1LCUA 5BREA 1GLDG 2P9KB 3F9MA 3GOIA 4BRMA 3FZLA 1G99A 5AQGA 3CI5A 1KAZA 4BRQA 4BGBA 3BP8A 4FWKA 1HKBA 4BRCA 4YDUC 3CJ9A 4H5NA 1XQSC 4XH1A 5AFUA 3VENA 3IFRA 4FWSA 2CGJA 3D7EO 2ASMA 1Z05A 4BRLA 4O8KA 1LOTB 4FWRA 1U2VA 2FSNA 3GL1A 4CJ7A 3FGUA 2GTDA 3TPQA 3MN5A 1X3NA 3EL2A 1X9JA 3DXKA 1MWMA 3HM8A 1XUPO 5AZIB 3SMPA 4H5VA 2GWKA 4EHUA 3VF2A 1S3XA 2FLOA 3H3NO 1V4TA 2E2OA 3R8EA 5FPMA 3JS6A 4BR0A 2OANA 3FFKB 4WQ5C 2GUPA 5EX5A 2CH6A 2V51B 1ATSA 3EO3A 4AM7A 2P9LB 3BUZB 3LDPA 2A3ZA 1GLJO 3DAWA 3HTVA 4FPBA 4BQZA 3H6EA 5CE3A 4FPAA 1IJJA 2P9SB 1GLFO 4ISFA 4XH4A 1NGFA 4H0PA 4A2BA 2A40A 4BGAA 1NM1A 1NGEA 3R6MA 3D2EA 4ISGA 3QFUA 3FLCO 3VOVA 4BC4A 2CGLA 2FSJA 4I6MB 3WEEB 3ZEUA 3G25A 2KHOA 2EWSA 2Q31A 4BRIA 3O08A 5AQXA 1KAXA 2Q0UA 1YVNA 3CJAA 2NRHA 4BRNA 2YCHA 2DPNA 3WXLA 1SQKA 1NGIA 3ULEA 4Z94A 3U9ZA 3I8BA 1J6ZA 3QICA 3D2FA 2P9PB 1ESVA 4A62A 5AQZA 5ADXA 3CJ1A 4B1UB 4BR2A 1KXPA 2HOEA 5BN8A 2P9NA 2ZGZA 2VYPA 2ITMA 3QMLA 3MMVA 3IMXA 2QWNA 3A5MC 3TU5A 3VF6A 4YDUA 1NGBA 4IZ9A 1K8KA 5LJVA 2QWOA 5AQIA 1WOQA 3ENHA 3U9DA 5F2RA 4BRKA 2QWRA 3H45C 3A5LC 1GLBG 5BR9A 2I7NA 1S22A 2W41A 4DHYA 3KZBA 2IVOA 4CZGA 1HUXA 1C0FA 2GELA 2YHYA 4JNEA 4EFHA 5EOYA 2IIRA 4JAXA 1DEJA 1OKJA 4H0YB 5FPNA 4JD2B 4B1ZA 1U2VB 3ZETA 1T6CA 3B8AX 3VEVA 3EKSA 3ZX3A 4BROA 3VEZA 4GY2B 5BN9A 3O80A 3CJCA 4IWVA 4CBXA 2V7ZA 3DXKB 4CZMA 1BOTO 2CH5A 3J8AA 5AQKA 1MWKA 2FXUA 3VEXA 1HKGA 5AQUA 1ZXOA 3C7NB 3CJ7A 4WQ5A 2Q1NA 1ATNA 5I9EB 1GLAG 3BEXA 5KQ8A 2CGKA 2A5XA 4MO5A 5JLFA 4MLEA 3ATUA 3HZ6A 4M7YA 1BA1A 3A0IX 3O5BA 4AM6A 4FL9A 3M1FA 3ID8A 1JCEA 4FOEA 2P9UA 4B1VA 2BUPA 1KAYA 1HLUA 3H3OB 3KVGA 1HJOA 4PKHA 4FWNA 3UKRA 4BRGA 3BF1A 3IDHA 4CZKA 1TYQA 1P8ZA 5B8HA 2VCPA 5F1XA 3D2EB 3WXJA 4BRHA 5JMVA 4QS8A 3KHYA 4A2AA 1SAZA 4PKIA 4CZIA 4IJAA 2QWQA 5EXWA 5JICA 2UYTA 4H5TA 5AZJB 1CZAN 3P4IA 3VETA 1SZ2A 4H5RA 3VEOA 3O1WA 4QS7A 3O8MA 2D4WA 1IG8A 3GBTA 5BRHA 4IJNA 5FPEA 1NWKA 3ULEB 4DCHA 2HF4A 1QQMA 3JXUA 2A42A 5TKYA 5AQQA 2P9KA 3H46O 3A8YA 3HSCA 5BPNA 3EN9A 2QWMA 2V52B 1Z6RA 2P9IB 3LDNA 1ZC6A 1QQOA 2ZGYA 2NLXA 2E2PA 3LM9A 3GE1A 1JCGA 1EQYA 5EY4A 2YJEA 3MK6A 5AQRA 5AFUH 2AP1A 1T6DA 3U8XA 1BDGA 2YHXA 1BWFO 2ZWHA 4BR9A 1GLLO 2AA4A 4FWOA 3I33A 4GNIA 5AQJA 1H1VA 4BC2A 2E88A 3O6WA 3A5NC 2E1ZA 2I7PA 4WQ4A 5AQOA 1D4XA 5KQDA 3AARA 4M63C 4EAHD 3DXMA 5LJWA 5AQYA 1YXQA 3ZETB 4FWQA 1NGCA 5AQVA 5AZIA 4HWIA 1GLEG 4B1WB 3RSEB 2BTFA 1X3MA 4B1XB 2Q97A 3VGMA 3ZX2A 5AQLA 2D1KA 2GEMA 4EHTA 2J4RA 4BREA 4CBWA 2E20A 4DQ8A 3FE1A 2PAVA 5AQTA 3MDQA 3WQTA 2E2NA 2D0OA 1RDWX 3CETA 1XC3A 3U4LA 1NGGA 1TUUA 4BG9A 2V7YA 2HMPA 4RWTA 3W3DA 1JCFA 3OHRA 2P9SA 1NLVA 2PBDA 3QBWA 3MN7A 3HI0A 1BO5O 1BUPA 1ATRA 2P9UB 2Q36A 3MN9A 1HPMA 3SJHA 1QHAA 3H1VX 4BRAA 4BR7A 4CZEA 1HKCA 3CHWA 4FOIA 3UKRB 4WQ4C 5KPRA 1BA0A 1NBWA 3DJCA 2D0PA 5BPMA 4XH5A 4EIAA 2QXLA 3GG4A 1BG3A 3VERA 3LDQA 3CERA 4BC3A 2ASOA 2FF6A 5JLHA 4BRPA 1DGKN 1QQNA 4K42A 1T44A 5AQWA 5E26A 1E4GT 1MDUB 3R9PA 3IUCA 3DWLA 1E4FT 2Q2RA 1RGIA 4FWMA 5AQSA 1NMDA 2ASPA 4O5FA 2YHWA 5E84A 2P9PA 3VGKA 4CI6A 5BRDA 1NGAA 1GLCG 4A61A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KBHA 4JN4A 3ZX0A 4B8AB 5ADXH 3ISNC 4XEIA 2B5JA 2VWKA 1G15A 3PX0A 3I56N 3TAPA 1LW2A 3C6HA 3HPGA 1VQON 2PYJA 3NMUA 3N4QA 5KPZA 3UKUA 4DQPA 1BQMA 3HL8A 4MO4A 2LJ7A 3BGRA 5GADP 3KOXA 1XHZA 1QZ5A 4JKEA 3EY1A 1BCMA 4CGGA 3L0QA 1KTQA 2NY8X 5AQHA 1B92A 3AVGA 4JD2A 3TI0A 3VPZA 3PLAA 4FWLA 3QFPA 3NAEA 1TV6A 1MA9B 1XHXA 3LDOA 3A5OC 2KFNA 3TAQA 3V1RA 1NGJA 4H03B 1S1UA 4NXMK 4MFBA 3OYDA 3CPWM 4BC5A 1I2VA 1J54A 1RDBA 4O0IA 3M3ZA 2N2QA 2GWJA 3C7NA 4RTFD 4OPHA 4ILJA 1T7EA 3DLRA 3P38A 3CQXA 4CERA 3S3MA 4RCHA 2VWBA 4IOAL 1BL3A 3SUOA 2UXBK 1VSJA 1VRUA 3VQ9A 3UIQA 4JRPA 4OKKA 2G8UA 4CIEA 3VEWA 3CJBA 3LPUA 3OYEA 4CIGA 2P5OA 2G8IA 1BHLA 3W0LA 3VQPA 1BRZA 1K8AO 4LSNA 1ITGA 2QKKA 2BANA 1KQSM 4KHNA 3VA3A 3O4WA 3L2WA 3VEYA 3BF3A 3QLHA 2E8AA 4IXCA 4A5BA 1QSYA 4ELVA 3OYAA 3ZSVA 4CHPA 1QZ6A 3IRXA 5DMRA 4OVLA 4CQKA 1JLAA 3O9TA 1FKOA 4LF8K 1HR0K 4BG8A 4JKGB 3ASMA 5FPDA 1YITN 2P9IA 2HVIA 2LY5A 2FSKA 3E01A 1RT4A 1TL1A 1DTTA 3DYAA 1I6FA 1SKRA 2WOMA 3E66A 3FR0A 4RW4A 4I6MA 4FWPA 1VSDA 2O8BB 4PKGA 4UADE 2A7TA 3RMBA 1RTHA 1MU2A 5AR0A 3NGZA 1X1PA 2FBYA 4O0JA 2B3CA 3AVIA 2MZ0A 5AQFA 1HYZA 4BR5A 4IEIA 2DTUA 2IVNA 3DLEA 3K9JA 5AQNA 3HOTA 2QWLA 2WBNA 1VHXA 3DRRA 4H0XB 3VESA 4C1NK 1VRTA 3QETA 1L4VA 3PSMA 4OLBA 3FZLA 1G99A 4BRQA 4CEQA 1NKEA 1W9HA 1S6PA 1BI4A 3AVLA 5LL6Z 1IKYA 1T7AA 4XH1A 2XY5A 3IS9A 1JKHA 3K58A 1HQUA 4B9TA 3SNNA 3D7EO 2ASMA 3SF4D 4HUGA 1T1TA 4KKOA 5C12A 3TAEA 4O8KA 2HHUA 5K14A 3KWGA 1L3UA 2O8CA 3FGUA 1RT3A 1JJ2M 1CZ9A 5I42A 2OZSA 3SPZA 3EL2A 1X9JA 4W5TA 1LQIA 4DS4A 2B68A 5M1OA 5AZIB 2EHGA 4DR3K 4H5VA 4EHUA 2HHHK 3VTIA 5TKWA 3TARA 1NE5A 4JK9A 1SNBA 1NK0A 4DV3K 4E1MA 4F8RA 3T19A 3FFKB 4LH5A 2GUPA 1OH6A 3LPTA 3NF6A 4E7HA 3O9UA 4GW6A 2O4GA 4CK1A 1ATSA 4AM7A 4KREA 1GLJO 3HTVA 4EP5A 5CE3A 3U3GA 4M3XA 3L2RA 1IJJA 3CFOA 1RDUA 3TAGA 3HPHA 2P9SB 1NOZA 4E7JA 4XH4A 1NGFA 4KHUA 3TSPA 4BGAA 4FJLA 4HHFA 1VQLN 1VNAA 4JI8K 1RTJA 3QFUA 4GKJK 4FXDA 4KHSA 2OPQA 5HRNA 2CGLA 1T05A 1VSMA 4J2EA 4JKBA 1SKSA 2YIPA 5I3UA 1HMVA 1C1AA 3O08A 3WNFA 2VQEK 1YVNA 3DLKA 4JKFA 3RRHA 2DPNA 4FJJA 2VWJA 4DU4A 2HBKA 3ULEA 4DTRA 2P51A 1FH3A 2HB5A 1J6ZA 3VQCA 3L3UA 3D2FA 4AILC 3SQ4A 1MR4A 1RBUA 3LP3A 3LZJA 5AQZA 3SYZA 5ADXA 4JRQA 4TSXA 5JS2A 3V9WA 4FVUA 2P9NA 2QWNA 1N34K 3O4NA 4XJXA 3AVJA 3DOLA 4IZ9A 4LY7A 1N36K 5AQIA 5JENA 4F2SA 3U9DA 2QA4N 4E19A 4DG1A 3G71N 3A5LC 5BR9A 4HHTA 3QNOA 2VGMA 1J5EK 1RT2A 2IVOA 3HO1A 4CZGA 3WNGA 1C0FA 2GELA 3G6EN 4EFHA 4DTUA 2IIRA 3M8SA 4JD2B 3ZSWA 3B8AX 4RG8A 3LP0A 2VG5A 3DMJA 3OA9A 4IWVA 1SN4A 2C1GA 1BOTO 3CFPA 1MWKA 2FXUA 1S1XA 3C7NB 4CJPA 2Q1NA 4DWIA 1ATNA 5I9EB 1GLAG 4CHYA 2KBKA 4K8ZA 1NG9A 4IFYA 3HZ6A 4FM0A 5SWMA 1BA1A 2F7TA 4AM6A 1WSGA 1K9MO 3ZT4A 4CGJA 3L8BA 1KCFA 4OPKA 3MEEA 1XRSB 2K35A 4HUEA 3ZT1A 1C1BA 4CGDA 4CZKA 1TYQA 2Y1JA 1NJIO 3O4QA 3NBPA 5F1XA 3D2EB 4AH9A 4KI6A 3E9LA 5JMVA 4FK0A 4RW8A 4QS8A 3TTDA 1SUQA 1RT5A 4A2AA 5C10A 4ELTA 1QS4A 3PSFA 1N5YA 4CZIA 4IJAA 2IAJA 4CHOA 1A5VA 2QWQA 1C0UA 3L3VA 2C1IA 3O1WA 4QS7A 4Q5VA 3O8MA 5J2QA 4C8MA 5FPEA 3CPEA 1NWKA 1FXXA 1YTAA 4HCBA 2V52B 3P5JA 1HNZK 4DFMA 2P9IB 4X66K 4BACA 4BY9C 2DFHA 3OYJA 1NKBA 4KTWA 1JL1A 4R79A 1WSIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2KBH A;  4JN4 A;  3ZX0 A;  4B8A B;  5ADX H;  3ISN C;  4XEI A;  2B5J A;  2VWK A;  1G15 A;  3PX0 A;  3I56 N;  3TAP A;  1LW2 A;  3C6H A;  3HPG A;  1VQO N;  2PYJ A;  3NMU A;  3N4Q A;  5KPZ A;  3UKU A;  4DQP A;  1BQM A;  3HL8 A;  4MO4 A;  2LJ7 A;  3BGR A;  5GAD P;  3KOX A;  1XHZ A;  1QZ5 A;  4JKE A;  3EY1 A;  1BCM A;  4CGG A;  3L0Q A;  1KTQ A;  2NY8 X;  5AQH A;  1B92 A;  3AVG A;  4JD2 A;  3TI0 A;  3VPZ A;  3PLA A;  4FWL A;  3QFP A;  3NAE A;  1TV6 A;  1MA9 B;  1XHX A;  3LDO A;  3A5O C;  2KFN A;  3TAQ A;  3V1R A;  1NGJ A;  4H03 B;  1S1U A;  4NXM K;  4MFB A;  3OYD A;  3CPW M;  4BC5 A;  1I2V A;  1J54 A;  1RDB A;  4O0I A;  3M3Z A;  2N2Q A;  2GWJ A;  3C7N A;  4RTF D;  4OPH A;  4ILJ A;  1T7E A;  3DLR A;  3P38 A;  3CQX A;  4CER A;  3S3M A;  4RCH A;  2VWB A;  4IOA L;  1BL3 A;  3SUO A;  2UXB K;  1VSJ A;  1VRU A;  3VQ9 A;  3UIQ A;  4JRP A;  4OKK A;  2G8U A;  4CIE A;  3VEW A;  3CJB A;  3LPU A;  3OYE A;  4CIG A;  2P5O A;  2G8I A;  1BHL A;  3W0L A;  3VQP A;  1BRZ A;  1K8A O;  4LSN A;  1ITG A;  2QKK A;  2BAN A; 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