5FPDA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand pyrazine-2-carboxamide (at513) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
378
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 378
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpdA04
2ZWHA 2E2OA 1H1VA 5AQFA 1NGJA 5AQXA 4YDUC 1KXPA 2HOEA 1U2VB 3U9DA 3MN6A 2Q0RA 1MDUB 1ATSA 4BR2A 5EX5A 3CETA 3BUZB 3EL2A 3QB0A 3A5LC 4JHDA 4HWIA 2P9SA 3LDQA 3VEWA 5AQYA 1GLAG 4AM6A 2ITMA 2AA4A 5KPRA 4DB3A 2YJEA 3C0BA 2FF6A 4HTLA 1NGBA 1RFQA 4JNEA 5AZIA 1QQNA 3HBTA 2HF4A 3VESA 5FPMA 2E20A 2J4RA 3HM8A 4BGBA 4I6MB 1P8ZA 3LM9A 5KPZA 2W40A 5ELZA 4B1VA 4CZJA 3MN5A 4ISGA 4CZKA 1GLCG 4CZFA 2GEMA 3W0LA 4H0VB 3U9ZA 4CZMA 3J8AA 3D2FA 3D7EO 4FSVA 1NGDA 2AP1A 3WUHA 1ZBSA 5AFUA 3WXJA 1V4SA 3QBXA 1HLUA 4WYBA 5AQTA 3L4IA 2Q36A 1JCFA 3SMPA 4XH5A 5I9EB 3VEYA 4BVOA 4B1UB 4MLEA 3EZWA 4K41A 1SQKA 3FR0A 1DKGD 5LY3A 3I33A 2FSKA 2P9KA 3KZBA 4DCHA 3U8XA 5AQUA 4A61A 1HUXA 4EHTA 5AQRA 1LCUA 3JS6A 1BOTO 4MO5A 4BREA 3CJ1A 3D2FB 2D0OA 4FOEA 3O08A 4F9OA 4WQ5C 5JLHA 4EAHD 3SLCA 3VF6A 2QM1A 2P9NA 3JXUA 4CI6A 2P9LA 3L0QA 3O6WA 5KQDA 4XEIA 3DXKA 5ADXH 1BA0A 3CIPA 2ZF5O 5JMVA 1E4FT 1XC3A 1NGIA 1ZXOA 2P9KB 5JLFA 5AQSA 1ESVA 1NGFA 1HJOA 3M6GA 4B1YB 3LDLA 1BUPA 1S3XA 3U4LA 4M63C 3WXKA 2FSNA 5AQVA 3FFKB 3FZHA 4QS7A 4CJ7A 4BRQA 4J8FA 3WT0A 1DEJA 3H1VX 1YAGA 5AQGA 4BR5A 5FPNA 1Y64A 4FWLA 5LJVA 4BRGA 2D0PA 3DXKB 4NB4A 1YXQA 2EWSA 2CH6A 4BR9A 3CHWA 5AQOA 3EKUA 1OKJA 3FLCO 1GLEG 3LDNA 3BF1A 5KPTA 1D4XA 3CJCA 3AAPA 3M3ZA 4RWTA 3O1WA 3ULEA 2Q31A 3VEVA 1HPMA 3QFPA 4FL9A 1TYQB 3CJ9A 3ZEUA 4CD1A 2V52B 1C0FA 5KQ8A 4BRHA 5AQMA 1Z05A 4BQLA 3ZETA 1QQMA 4A62A 2Q1NA 4BQZA 5AZJA 3QBWA 3VGMA 3C7NA 5JICA 1KAXA 5FPDA 1RGIA 2YHWA 3OHRA 1JCEA 3DWLA 4IZ9A 3VENA 4BG9A 3R6MA 1E4GT 4BR7A 5AQLA 3VEXA 2F9WA 3A0IX 2NRHA 3ZEUB 4BRMA 3KHYA 4PKGA 3ZX2A 1C0GA 1Q18A 5F1XA 3H1QA 3MK6A 2ASMA 3LL3A 3VETA 3I8BA 1GLFO 1WOQA 1NGAA 4FWPA 2IVPA 5AZJB 3ENOA 4B9QA 2P9UA 4H5TA 3C7NB 5BREA 4GY2B 3VOVA 1YUWA 3O4WA 1BA1A 4BGAA 1NLVA 2I7NA 4JHDB 3GE1A 1ATRA 2ZGYA 2P9SB 3IUCA 3BF3A 5AQNA 2HMPA 2ZGZA 4H0XB 1G99A 4CZLA 1K8KA 2P9PA 4H03B 2CGLA 4H0TB 5AZIB 4CZEA 5BRHA 4ISFA 3R9PA 4H5WA 3W3DA 1IG8A 3UB5A 3DXMA 4PL8A 5EVZA 2P9IA 1NMDA 3ZX0A 3WQUA 2Q97A 5BRDA 1JCGA 1QHAA 4ISEA 1MWMA 4NO7A 3ATVA 4BR4A 2PBDA 2QXLA 5EY4A 2HF3A 4FWMA 4CZHA 4A2AA 2A3ZA 1NWKA 3CQYA 5E84A 5EXWA 1XUPO 3FZMA 2V7ZA 1X3NA 2P9PB 1T6DA 2Q0UA 2W41A 4FWRA 5LJWA 1TUYA 4BRLA 2CH5A 4B1ZA 5AR0A 4WQ4A 4BRFA 4FPAA 4A2BA 4H5RA 3SJHA 4XH1A 4FWNA 3A8YA 4BRNA 1SAZA 1Z6RA 3M1FA 3CJBA 5AQZA 1ZC6A 1NGGA 4IO8A 2A41A 5F2RA 4BRCA 3ATUA 2A40A 3L6QA 4DHYA 3CERA 3GL1A 2D4WA 4BR0A 2A6AA 3HI0A 3VEOA 3WXIA 4K42A 5BN8A 1QZ5A 4B1WB 4YDUA 1KAYA 3GG4A 3GDQA 5BN9A 3QDKA 4JN4A 3SMSA 1HX1A 2YJFA 3FE1A 2P9NB 4PKHA 3VERA 3VF2A 4PL7A 4BRKA 2BTFA 4FWQA 2NZTA 2P9LB 1S22A 3ID8A 3CI5A 3CJAA 5AQKA 3VPZA 2PAVA 3A5OC 2UYTA 4H0PA 2VYPA 3BEXA 3WEEA 3DAWA 2GELA 5AFUH 4JD2A 1NGHA 2E88A 2A42A 1WUAA 4BC2A 1GLDG 4RCHA 4CD3A 3IMXA 2V51B 2E1ZA 3QICA 3GBTA 1HKBA 4LC9B 2IVNA 4CZGA 3VF4A 4BC5A 4BC3A 2QWLA 5BPNA 3VEZA 2KHOA 4H5NA 1GLLO 3VGKA 1QQOA 3VGLA 3MDQA 3A5MC 1DGKN 3CJ7A 1BWFO 2H3GX 4FPBA 2QWNA 3TU5A 4BRAA 2YHXA 4FO0A 3F9MA 2VCPA 4PKIA 3EO3A 4JD2B 4CBWA 3ULEB 3H45C 3EKSA 2FLOA 4CBUA 4BG8A 2YHYA 5TKYA 2BUPA 4RTFD 2IVOA 5BPLA 1BU6O 3ZETB 2GTDA 1T44A 4BVPA 4FWKA 4B1XB 3P4IA 4I6MA 2QWQA 1QZ6A 2ASOA 4QS8A 4K25A 4M7XA 5EOYA 5AQPA 4Y0WA 1BG3A 3LDPA 5ADXA 4H5VA 2CGJA 3WXLA 1LOTB 1YVNA 2F9TA 3A5NC 3LDOA 4WQ5A 3O5BA 2QW9A 3FZKA 2VWBA 3S41A 5BRFA 3H3NO 3ZX3A 5AQJA 4AM7A 2YCHA 3UKRA 2E8AA 1SZ2A 4QS9A 1V4TA 4BC4A 3FGUA 2P9UB 4L3QA 2Q2RA 3KVGA 2E2NA 5CE3A 3O1BA 3IDHA 1BO5O 3RSEA 5AQQA 3H46O 2E2QA 4KBOA 2GWKA 1HKGA 3AY9A 3BP8A 5E26A 2QWRA 2GWJA 2CGKA 1KAZA 1XQSC 2FF3B 1K8KB 2WUSA 3UKRB 5BR9A 3HSCA 5F0XA 1GLJO 1MA9B 3DJCA 4BRIA 2QWMA 4Z94A 3DXMB 1BDGA 3EN9A 4EHUA 4MLHA 3R8EA 2P9IB 3WQTA 5FPEA 3UKUA 2V7YA 4IJNA 4IWVA 1NBWA 2D1KA 3TPQA 3MN7A 1GLBG 4O8KA 2QWOA 3GOIA 4JAXA 5BPMA 3RSEB 5B8HA 2OANA 3FZFA 3AARA 3MN9A 4CBXA 3HTVA 1TUUA 3CQXA 4H0YB 2DPNA 3LM2A 5AQIA 3H3OB 3UE5A 1X9JA 2YI1A 1X3MA 2E1YA 4EFHA 4E1JA 4EIAA 3O80A 1RDWX 1U6ZA 3UKUB 3D2EA 2NLXA 4C23A 1T6CA 1NGCA 1J6ZA 1CZAN 3AAQA 3IFRA 5AQHA 3FZLA 4FOIA 3QMLA 4MO4A 4BROA 1EQYA 1TYQA 1NGEA 4K43A 2A5XA 4DQ8A 3G25A 2GUPA 3H6EA 1ATNA 3MMVA 2FSJA 4GNIA 4O5FA 1U2VA 3ENHA 4CZIA 3HZ6A 3O8MA 4BRDA 4IXCA 2IIRA 3SK3A 1IJJA 3D2EB 4WQ4C 1MWKA 2QWPA 1NM1A 1R59O 4FWSA 4M7YA 4BRPA 5AQWA 4H0OA 4IJAA 3MCPA 2FXUA 2I7PA 3WEEB 1HKCA 2E2PA 4FWOA 2ASPA 3B8AX 4XH4A 3QFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZWHA 3VQ4A 1TL3A 1Q9YA 4DF8A 2XO7A 2KTQA 4YDUC 3DLLL 3MN6A 2BE2A 1P90A 2G8IA 3AVAA 4NYNA 2GBZA 2ITGA 3QB0A 4YORA 4M3TA 4EZ6A 4DLEA 4UAEF 4ZHRA 3IRXA 1BCOA 4IDHA 1QVGM 3AGKA 5HRRA 2AA4A 3E9OA 4CJRA 3C0BA 5SZTA 2FF6A 1VQKN 1S5JA 1QQNA 3DLEA 2O8EB 3C94A 3WNHA 3VESA 4K8XA 4BDYA 4E7HA 3KKRA 1YITN 1KLMA 4CFBA 4FM0A 4DFMA 3LM9A 5ELZA 3SV3A 3CM5A 4ISGA 1RT3A 1GLCG 3DMJA 3CCRN 3W0LA 3QINA 3EE9A 2KBHA 1T3VA 4JI4K 3U9ZA 4X65K 4CZMA 3J8AA 2ATQA 5GADP 3D7EO 4FSVA 3ULDA 1NNEA 1ZBSA 1JXBA 3WXJA 1V4SA 1EWQA 3QBXA 4FM2A 1HLUA 4WYBA 5AQTA 3OBYA 4KV8A 4CJTA 1SKRA 3K9KA 5BR8K 2DTUA 3VEYA 4H4OA 3ZSWA 2JWKA 3THXA 2NUBA 2K35A 3KLIA 4FW1A 4KH5A 2OTJN 3N4PA 3SPYA 3I33A 2P9KA 1CHZA 4DCHA 4M3ZA 5JS2A 2P51A 3O9TA 2MBKA 5AQRA 3JS6A 1BOTO 4MO5A 4R79A 4V19S 3AVIA 4KH4A 3D2FB 5FRMA 1A5WA 3O08A 1L3SA 3SLCA 3BZKA 3O9UA 1JL1A 4NXMK 3PO5A 3V9XA 3LWMA 3DXKA 3LDSA 4OKEA 2OPPA 3CIPA 3QEPA 1E3MA 4OX9K 2N66A 3F5TA 5GIPA 5AQSA 2AJQA 1BUPA 3CG7A 3U4LA 4M63C 3ZSZA 3FFKB 3G71N 4E7IA 3G4SN 3FZHA 4ID1A 4CJ7A 4BRQA 1U45A 4J8FA 4DU1A 2MZ0A 1WSGA 3H1VX 4H4MA 1XMQK 3CW4A 3ZT3A 5AQGA 1VQ7N 4FWLA 4BRGA 4DV7K 2LJ7A 3P31A 1J5OA 3K59A 4TSXA 4NB4A 4DQQA 4BR9A 4M3WA 5AQOA 3EKUA 1OKJA 3SPZA 4J2AA 1YTAA 3BF1A 1D4XA 1P0AA 3ZSYA 4UAFE 3ULEA 3VEVA 1HPMA 2YEOA 3O4NA 4BRHA 3ZT2A 4MDAA 3VA0A 3LAKA 4CHYA 4EP4A 2NY9X 2O4GA 5K14A 4BQZA 3NF6A 4B8CA 4FLXA 3P83D 1XC9A 1KAXA 5FPDA 4DSIA 2KYQA 4PWDA 3DWLA 3VENA 1W9HA 4JI8K 1KSPA 3A0IX 1VRTA 4B9VA 4CF2A 1VSFA 1HPZA 5M1QA 2LY5A 2DFEA 4DQRA 1Q18A 3H1QA 3MK6A 1VQLN 4DR5K 2ASMA 3VETA 3I8BA 4FWPA 5LMUK 2HSTA 3SUNA 2IVPA 1HJRA 2A7TA 2X74A 5BREA 4JS5A 4GY2B 3VOVA 2YX6A 3O4WA 4M3RA 3V9WA 1BA1A 2E3GA 3OYLA 1ATRA 4IKFA 3I56N 1JKHA 5AQNA 1EP4A 4OPAA 1TI5A 2X6SA 4H5WA 2O4IA 3W3DA 1QTMA 5IT9O 3THYA 4CIEA 3V9UA 5EVZA 3ITHA 4GKJK 1A5VA 1QHAA 2GL1A 3B6PA 4ISEA 4NO7A 1I39A 3ZCMA 1TKDA 4A5BA 1ASWA 4AB0A 2PBDA 3PSFA 4JI7K 4FWMA 4OKKA 4CZHA 3AVMA 1C55A 2ASCA 1G15A 3L2VA 5EXWA 4Z4EA 2V7ZA 1T6DA 2W41A 4CHQA 3QI7A 3CXCM 1TK5A 2CH5A 4N41A 3U6FA 1WBBA 3QIOA 2YNIA 4A2BA 1Z26A 4JKGB 3CC2N 3HT3A 2KFZA 2UXCK 3M1FA 1HQEA 3CJBA 4RW6A 4XIUA 4DV4K 2DFHA 2PYJA 1IKWA 1IKVA 1WSIA 3ATUA 2NRWA 1NKCA 3CERA 4BE0A 4BR0A 1NOYA 4B1WB 4YDUA 3GDQA 1U48A 1BRZA 4JN4A 3QDKA 4B9LA 1T7AA 3VF2A 2PZSA 2GX9A 4JS4A 2BTFA 4FWQA 2NZTA 1J5EK 2NRZA 2KJAA 3KK3A 3ID8A 3ISNC 3OYMA 2PAVA 1NKEA 1B92A 2UUAK 1SV5A 4IEEA 2LKBA 1QHTA 2E88A 2FBTA 1GLDG 4FLUA 4CD3A 3IMXA 4KTQA 1XMOK 4LC9B 3K0SA 4IFVA 3NF8A 3VF4A 2F8SA 2QWLA 3ASMA 3HPGA 3VGLA 3CMEN 3K2PA 3CJ7A 3V6DA 3NH2A 2HNYA 4HHFA 3TU5A 3HPOA 2KSKA 3SNNA 1JZAA 5KGWA 4AHUA 2XHBA 1VQ9N 3ULEB 1IBMK 2YHYA 1D8YA 4RTFD 3D0PA 4E3SA 1Q7YO 3AO2A 2UUBK 1VSJA 4M7XA 1EKEA 3VQ6A 4Y0WA 1BG3A 1D9DA 4EP5A 1LOTB 4FK0A 4O4GA 4LF7K 1K8BA 3NHGA 1L3TA 1OH5A 2VWJA 3O5BA 5GIOA 3FZKA 5C10A 3E7UX 3VQDA 3ZX3A 4IOCL 2NY8X 3LP3A 4KKOA 4JKAA 3SCXA 2E8AA 4QS9A 2OPQA 2FC0A 4BC4A 3RR7A 3FGUA 4AILC 2HHXA 3KVGA 5JS1A 2LJMA 4E7JA 2ZE2A 2OA8A 1WMTA 1FKOA 3RSEA 2KKZA 2NNWA 3CFPA 3Q7BA 3VA3A 1YI2N 5AQQA 1VQ6N 1CLQA 3H46O 4CGDA 4W5TA 1BK8A 3AO1A 4CJWA 1B7DA 4LFCK 2CGKA 1U49A 2FF3B 3QESA 4JEPA 1NJXA 3K58A 4Z94A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ZWH A;  3VQ4 A;  1TL3 A;  1Q9Y A;  4DF8 A;  2XO7 A;  2KTQ A;  4YDU C;  3DLL L;  3MN6 A;  2BE2 A;  1P90 A;  2G8I A;  3AVA A;  4NYN A;  2GBZ A;  2ITG A;  3QB0 A;  4YOR A;  4M3T A;  4EZ6 A;  4DLE A;  4UAE F;  4ZHR A;  3IRX A;  1BCO A;  4IDH A;  1QVG M;  3AGK A;  5HRR A;  2AA4 A;  3E9O A;  4CJR A;  3C0B A;  5SZT A;  2FF6 A;  1VQK N;  1S5J A;  1QQN A;  3DLE A;  2O8E B;  3C94 A;  3WNH A;  3VES A;  4K8X A;  4BDY A;  4E7H A;  3KKR A;  1YIT N;  1KLM A;  4CFB A;  4FM0 A;  4DFM A;  3LM9 A;  5ELZ A;  3SV3 A;  3CM5 A;  4ISG A;  1RT3 A;  1GLC G;  3DMJ A;  3CCR N;  3W0L A;  3QIN A;  3EE9 A;  2KBH A;  1T3V A;  4JI4 K;  3U9Z A;  4X65 K;  4CZM A;  3J8A A;  2ATQ A;  5GAD P;  3D7E O;  4FSV A;  3ULD A;  1NNE A;  1ZBS A;  1JXB A;  3WXJ A;  1V4S A;  1EWQ A;  3QBX A;  4FM2 A;  1HLU A;  4WYB A;  5AQT A;  3OBY A;  4KV8 A;  4CJT A;  1SKR A;  3K9K A;  5BR8 K;  2DTU A;  3VEY A;  4H4O A;  3ZSW A;  2JWK A;  3THX A;  2NUB A;  2K35 A;  3KLI A;  4FW1 A;  4KH5 A;  2OTJ N;  3N4P A;  3SPY A;  3I33 A;  2P9K A;  1CHZ A;  4DCH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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