5FPEA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 1h-1,2,4-triazol-3-amine (at485) in an alternate binding site.
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
381
structure length
377
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 377
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpeA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpeA04
3M6GA 4CI6A 4BC3A 4I6MA 2P9IA 3JXUA 4RWTA 5BRDA 4BRHA 5BRHA 4FWNA 3QB0A 4B1ZA 2FF3B 4BQZA 4DHYA 2BUPA 2FSKA 2I7NA 2P9PB 2A40A 4NB4A 5F1XA 4MO4A 4CBXA 4E1JA 1SAZA 3D7EO 2P9KA 2P9UA 2FXUA 1QQNA 2W40A 3O1WA 2D1KA 1BU6O 4K43A 1BG3A 3ZEUA 4J8FA 1YVNA 3GDQA 4FWKA 1U6ZA 4H0TB 5BN9A 1NBWA 3MK6A 3L0QA 3H1VX 3M1FA 1GLCG 2YHWA 2IIRA 3LM9A 5AFUA 1MA9B 1Z05A 5KPZA 3CJBA 3AAQA 3U8XA 4B1YB 5AQYA 1NLVA 1QHAA 1TUYA 2P9LB 3QBXA 4JHDB 4JNEA 4YDUC 3DJCA 1Y64A 3ZETB 3ZX3A 5KPTA 4Y0WA 4BC2A 3RSEA 3W3DA 5AQRA 4O5FA 3WUHA 1HPMA 4EAHD 1QQOA 5ELZA 2YHXA 2VWBA 4FPAA 2D0OA 1DKGD 2E2NA 2P9NA 2IVOA 1ATRA 4WYBA 5E26A 3DXKB 3TU5A 3FZHA 1TYQB 3F9MA 4L3QA 2QWQA 3HSCA 3MN5A 2ZWHA 1KAYA 5EOYA 5E84A 5JLHA 2QM1A 3CI5A 5AFUH 3H3NO 2V7ZA 4K25A 4DCHA 3VEZA 3D2FB 3ATVA 1XC3A 4H0XB 3W0LA 5ADXH 3GL1A 4KBOA 4PKGA 1NGJA 3BUZB 1QZ5A 4CZJA 4CBWA 1DEJA 2GTDA 4WQ4C 1X3MA 2P9PA 3GE1A 4H0VB 4C23A 2QWMA 3AAPA 1U2VB 2YJEA 3QMLA 5AQMA 4ISEA 1QZ6A 1T6CA 2GUPA 5AQNA 3AY9A 1X9JA 3DAWA 5FPMA 5F2RA 1LCUA 4EHUA 4M7YA 2H3GX 1NGBA 4XH1A 2ITMA 3FZLA 3G25A 4JD2A 5LJWA 4IWVA 3GBTA 1RGIA 3UKUA 5AQSA 3BP8A 5JICA 5BN8A 2NLXA 3A5NC 3WXJA 3MN9A 3O6WA 4BRLA 4JHDA 4O8KA 2NZTA 3ZETA 2QXLA 5FPEA 3B8AX 4WQ5C 3FZFA 3IFRA 3WQTA 4BR0A 5BPMA 4MLHA 4FWSA 5BPNA 1NGCA 4XH5A 4BVOA 4CBUA 5EVZA 4HTLA 1KXPA 5EXWA 2KHOA 2A42A 1YUWA 3LDOA 1G99A 3I8BA 4A2BA 4A62A 4FSVA 2IVPA 4H5TA 4H0PA 1DGKN 4H5WA 1CZAN 2Q36A 3D2FA 3A5OC 3HZ6A 3U9ZA 3HM8A 2CGLA 4B1UB 3CETA 4BRKA 1BO5O 5AQXA 5AQQA 4LC9B 2CH5A 1BOTO 3CQXA 3U4LA 1WOQA 4FWPA 4FOEA 1GLEG 4EIAA 5AQTA 4BGAA 3SK3A 2PAVA 3KVGA 1ATNA 3VGMA 4HWIA 1JCEA 3EKUA 4AM6A 1BDGA 2Q2RA 1K8KB 5AZIA 2P9SB 1YAGA 1LOTB 5F0XA 1GLDG 4QS9A 1SZ2A 1XUPO 2V7YA 3OHRA 5AQVA 1E4FT 3MDQA 3D2EA 3VETA 2QWOA 3A0IX 2HF3A 4IO8A 1GLLO 5AQIA 3A8YA 2E88A 5AQGA 1ATSA 5ADXA 3QDKA 1JCFA 1T6DA 2VCPA 1BUPA 5AQJA 5FPNA 3CJ7A 2QW9A 4CZHA 5FPDA 3WT0A 3CJAA 4ISGA 5AQLA 4BRAA 3WXKA 3ULEB 4BR9A 1SQKA 4EFHA 4ISFA 2J4RA 3C0BA 1V4SA 4IZ9A 1MWMA 2E1YA 4FWMA 1GLJO 2CGJA 1ZC6A 1J6ZA 3O08A 3C7NA 3DXMB 4CZGA 3I33A 4GNIA 5AQZA 4BRNA 2PBDA 4CD3A 2QWPA 4DB3A 5CE3A 1RFQA 2CGKA 2QWLA 4B9QA 4FPBA 4BR5A 3SJHA 5KQDA 1NWKA 1YXQA 2HOEA 2F9TA 3ENHA 3ATUA 2AA4A 3EN9A 1IJJA 1NGGA 2ZGZA 2P9SA 4BR2A 3CJ1A 4H03B 2FLOA 3FE1A 3L6QA 2YHYA 4QS8A 4JAXA 4F9OA 3O5BA 2E2OA 2Q0UA 4FOIA 5BREA 3SLCA 1HLUA 3ZX0A 5LJVA 2ZGYA 3SMPA 3AARA 4BRDA 1NGFA 3JS6A 2HF4A 3TPQA 1Q18A 2ZF5O 4XH4A 3U9DA 1NGEA 4K41A 4FWOA 2GWJA 4IXCA 1X3NA 2P9LA 4BC5A 3EZWA 4H5NA 3VPZA 3VF4A 3CQYA 1BA0A 3BF3A 3LM2A 1GLAG 5EY4A 2P9UB 1EQYA 1H1VA 2A6AA 2W41A 4CZFA 3ZEUB 1GLBG 3M3ZA 3H3OB 3DXKA 3WXLA 1TYQA 2GELA 3KZBA 5BRFA 3ENOA 3O1BA 3L4IA 3UKRB 4BRMA 3WEEB 2I7PA 4K42A 3VGLA 2FSNA 3UE5A 3DXMA 4JN4A 3MN6A 4YDUA 3GG4A 5AQHA 3CERA 3LDPA 5AQKA 3VOVA 5I9EB 4XEIA 2GWKA 4BROA 4BVPA 2A41A 1NMDA 3HI0A 5EX5A 2V52B 4Z94A 5JLFA 3QBWA 3FGUA 4BGBA 2V51B 4CD1A 1RDWX 2Q0RA 3MMVA 4M63C 5AQWA 3DWLA 3R6MA 4RCHA 1U2VA 1HKBA 3BF1A 3S41A 1MWKA 3ID8A 2P9NB 3ZX2A 3H6EA 3LDNA 2E2PA 5LY3A 4BC4A 4BRGA 3VEWA 4BREA 4FWQA 4BQLA 3H46O 3FFKB 2QWRA 4BRFA 4DQ8A 3VGKA 2VYPA 2ASMA 4WQ4A 4PL7A 4BRPA 3VF2A 4IJNA 1HJOA 1TUUA 4BRCA 5AQOA 3VEXA 1GLFO 1KAZA 3QFPA 4H0OA 1IG8A 4FWRA 4H0YB 4MO5A 2D4WA 1HUXA 2CH6A 4CZEA 4PL8A 3IMXA 3QICA 3CJCA 2GEMA 3HBTA 2E1ZA 1D4XA 1Z6RA 3IDHA 3CHWA 2IVNA 3HTVA 3O4WA 3R9PA 3CJ9A 3H1QA 2EWSA 4A2AA 4MLEA 2Q31A 3UKRA 3FR0A 3WEEA 1HKCA 3SMSA 2E8AA 4WQ5A 2WUSA 1NGAA 5B8HA 4JD2B 3UKUB 3P4IA 3VENA 4B1VA 2YJFA 1MDUB 4PKHA 5BR9A 2A5XA 3FZMA 5BPLA 3CIPA 4H5RA 2BTFA 4QS7A 4CZMA 1C0GA 1C0FA 3BEXA 3QFUA 3VERA 3A5LC 1NGIA 4GY2B 1K8KA 2Q97A 4CZKA 1NM1A 3EO3A 5AQUA 2E2QA 2FSJA 5AR0A 4B1WB 3LL3A 2FF6A 3LDQA 5AZJB 2YCHA 1V4TA 1ZXOA 3WXIA 3LDLA 4I6MB 2P9IB 4FWLA 4BR4A 1NGHA 3EL2A 2F9WA 3EKSA 1JCGA 2NRHA 5KPRA 3MCPA 4IJAA 3VF6A 2Q1NA 2DPNA 4EHTA 3WQUA 4A61A 5AZIB 1HKGA 2HMPA 2AP1A 3ULEA 1P8ZA 5AQPA 2P9KB 1NGDA 3KHYA 3MN7A 1R59O 4BRQA 1S3XA 1WUAA 2ASOA 4FO0A 2OANA 3D2EB 3IUCA 4CJ7A 3J8AA 2QWNA 4CZIA 3R8EA 1QQMA 3O80A 3O8MA 3FLCO 3VEYA 4BG9A 1OKJA 1ESVA 3VEOA 1BWFO 1S22A 2A3ZA 2E20A 4M7XA 2ASPA 3RSEB 2UYTA 4NO7A 4RTFD 4B1XB 1BA1A 3VEVA 5AQFA 3GOIA 2D0PA 4BG8A 4CZLA 3FZKA 4FL9A 1ZBSA 5JMVA 1E4GT 3VESA 3C7NB 1KAXA 4BRIA 4BR7A 4PKIA 1T44A 3A5MC 5TKYA 3H45C 3UB5A 4AM7A 5AZJA 5KQ8A 1HX1A 1XQSC 2YI1A 4H5VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B3SK 2YC1C 3IS9A 4BC3A 2P9IA 1N5YA 3J7AP 5M1PA 4FJ5A 5BRHA 2FF3B 2I7NA 1WLJA 3CXCM 4CBXA 3EEQA 3TSQA 4K8XA 3LAKA 4WCEL 3G71N 3OS1A 2P9KA 2P9UA 1QQNA 1JZBA 3AA3A 2D1KA 1NK4A 1BU6O 4OPAA 1HPZA 1AHOA 1RDDA 3DLEA 3LANA 3KLFA 1O1WA 4O8UA 2UUCK 4DU3A 1RT4A 3E1YA 3R1XA 4CGIA 3L0QA 3HSTB 3CF5L 5AFUA 4G9ZA 1Z05A 2OPQA 3V1QA 2KFZA 3CYMA 2YIOA 2UXDK 3E66A 1GOCA 4NCGA 3U8XA 4MFBA 3S3OA 5HROA 5AQYA 3ISNC 1TUYA 3QBXA 4JHDB 4AH9A 1RBVA 3SQ1A 1KLMA 3OYFA 3SPYA 5ELZA 3OYJA 2D0OA 5C2FA 1DKGD 2E6LA 2YHBA 4WYBA 2JDQD 5DMRA 1SN1A 2GL1A 3K9JA 5E26A 3TU5A 3FZHA 2KSKA 3KOXA 4DTUA 4B9LA 3E9PA 5E84A 5JLHA 4Q5VA 2QM1A 3CI5A 5AFUH 1UWBA 4K25A 3EY1A 2W42A 3D2FB 3CC7N 4DQSA 3GL1A 4ZTFA 1OZZA 1OH7A 4PKGA 4EP5A 4NXMK 1QZ5A 3NHGA 1PTXA 4W5RA 2GV9A 1DEJA 3LALA 3SJJA 4CEBA 3F73A 1X3MA 4C23A 1YHQN 2QWMA 4Y1DA 1JLFA 5KGXA 4YOUA 1T6CA 2GUPA 3J80O 3OBWA 3G4SN 4JKEA 3NMUA 5AQNA 3AY9A 1RDBA 3DAWA 1L5UA 4CK3A 3C65A 4OKJA 5AJ3K 3KLHA 1J9AA 3FZLA 3G25A 4JD2A 4H4OA 1KVBA 4IWVA 2Y1IA 5AQSA 3BP8A 3MN9A 1U45A 4JHDA 2NZTA 4BR0A 4WQ5C 3B8AX 4DQPA 3KP1A 4DR6K 2K35A 4MLHA 4FWSA 4UADE 2Z1IA 3DMJA 1ILYA 4CBUA 1REVA 3O4QA 3M8RA 3S3MA 1YUWA 3GKUA 3HK2A 1G99A 3NF9A 4AHSA 4LSLA 4M3WA 3HJFA 3VN5A 4DFPA 1DGKN 2IGIA 1SNBA 3D2FA 3A5OC 3NF7A 3QEXA 4B1UB 4C8OA 4FLVA 1WSHA 3O9TA 2LJ7A 2JWLA 5HP1A 1BOTO 1NU0A 3CQXA 3SAGA 4FWPA 4FOEA 1GLEG 3KK7A 3SK3A 2FBYA 2B4JA 2PAVA 3JSMA 4DTOA 4OLAA 4IOCL 3NCIA 3I56N 4E7HA 4V19S 2Q2RA 3SCXA 3M5RA 3VMFB 4KRFA 4E1MA 1NNEA 1B3CA 1YVUA 5GAGP 4NYNA 1L4VA 1I2UA 4BACA 5SWMA 3D2EA 1JLCA 2HF3A 4DLEA 4IO8A 4J2DA 3A8YA 3IG1A 3P31A 3JAMO 1TKDA 1VHXA 5AQGA 3QO9A 3KWGA 4LF5K 1BUPA 1JKHA 4CGHA 3HOTA 4ISGA 5AQLA 3CQ8A 1OH6A 1SQKA 2GX9A 3C0BA 1V4SA 1OMYA 2PFUA 3ULDA 1ZC6A 4BE1A 1J6ZA 4FJMA 3P5JA 3OYLA 1B9FA 3ZT2A 4GNIA 4CF9A 1BQMA 3WNEA 1K8AO 5CE3A 3CMAN 3RRHA 1RFQA 3DLGA 4FPBA 1J5EK 1A5VA 1NK5A 4DV4K 1YXQA 1SS6A 2HOEA 3DLHA 2KJAA 1VQ4N 3G6EN 4ZHRA 1IJJA 1QE1A 2KKZA 1TGOA 1SEGA 3SNNA 1TAUA 3OW2M 4GKKK 4FLZA 5M1OA 1QSSA 1KC8O 2YHYA 4QS8A 1NJZA 1NH5A 4JAXA 1LW2A 1WN7A 2Q0UA 5BREA 1HLUA 2ZGYA 3SMPA 3TPQA 4WF9L 1WNSA 1FW6A 4K41A 1SL0A 1X3NA 2X6NA 4OGEA 2G8WA 3VPZA 1VQKN 1VQ6N 3VF4A 1BA0A 3BF3A 4M3UA 3LM2A 4MDBA 2ZJQL 1XC9A 2A6AA 2W41A 4DUZK 4CJ3A 3IKMA 3H3OB 1C0UA 2Y1JA 3NF6A 5JS1A 3ENOA 3L4IA 1WSGA 2QI2A 5HRRA 3WEEB 1HYVA 3HRGA 1IG9A 3MN6A 4CERA 3GG4A 4JKAA 5AQKA 3M8QA 4XEIA 2GWKA 2A41A 3HI0A 4JI4K 1HNZK 5KK4A 5JLFA 4LF9K 4BGBA 1VQLN 1RT7A 4M63C 3M8PA 5AQWA 3R6MA 1U2VA 1HKBA 3S41A 3D0PA 4BEBA 1YITN 1C1AA 3F9KA 3CFOA 2HBLA 3AVBA 3FFKB 4LD0A 1DT9A 2WTUA 2HHXA 3Q7CA 4DS5A 1X9WA 4JKGB 4PHTX 1EWQA 1TUUA 1RT6A 3OBYA 2HHUA 1GLFO 4FZXC 1KAZA 3C6TA 4H0OA 4H0YB 3V1OA 1ZBHA 5KRSA 1WBDA 1HYSA 3CCSN 2BH1A 2N2RA 4FJIA 4I7FA 1D4XA 1IH7A 3VQBA 3HTVA 3R9PA 3O4WA 4B8AB 4CW7B 3NH1A 4QOZB 2E4LA 3TAQA 1FK9A 3NFAA 3C6HA 3WEEA 1JZAA 3SMSA 4Y1CA 4IFEA 1TL1A 1NGAA 2XY5A 5B8HA 4W5TA 4JI2K 4DQQA 4DU4A 4M3XA 4E7JA 4JEPA 4OJRA 3VENA 4I2PA 5BR9A 3T19A 1LQQA 1LW0A 3NGZA 1C0FA 3NAEA 3BEXA 1HJRA 3DLRA 3KTQA 1EO1A 1IKXA 1MU2A 1DJTA 4HE7A 1NRBA 2Q97A 3EO3A 1NKEA 3O3HA 1RDAA 4C1NI 4RW9A 5K14A 3CCVN 4B1WB 4JKGA 1S9EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4B3S K;  2YC1 C;  3IS9 A;  4BC3 A;  2P9I A;  1N5Y A;  3J7A P;  5M1P A;  4FJ5 A;  5BRH A;  2FF3 B;  2I7N A;  1WLJ A;  3CXC M;  4CBX A;  3EEQ A;  3TSQ A;  4K8X A;  3LAK A;  4WCE L;  3G71 N;  3OS1 A;  2P9K A;  2P9U A;  1QQN A;  1JZB A;  3AA3 A;  2D1K A;  1NK4 A;  1BU6 O;  4OPA A;  1HPZ A;  1AHO A;  1RDD A;  3DLE A;  3LAN A;  3KLF A;  1O1W A;  4O8U A;  2UUC K;  4DU3 A;  1RT4 A;  3E1Y A;  3R1X A;  4CGI A;  3L0Q A;  3HST B;  3CF5 L;  5AFU A;  4G9Z A;  1Z05 A;  2OPQ A;  3V1Q A;  2KFZ A;  3CYM A;  2YIO A;  2UXD K;  3E66 A;  1GOC A;  4NCG A;  3U8X A;  4MFB A;  3S3O A;  5HRO A;  5AQY A;  3ISN C;  1TUY A;  3QBX A;  4JHD B;  4AH9 A;  1RBV A;  3SQ1 A;  1KLM A;  3OYF A;  3SPY A;  5ELZ A;  3OYJ A;  2D0O A;  5C2F A;  1DKG D;  2E6L A;  2YHB A;  4WYB A;  2JDQ D;  5DMR A;  1SN1 A;  2GL1 A;  3K9J A;  5E26 A;  3TU5 A;  3FZH A;  2KSK A;  3KOX A;  4DTU A;  4B9L A;  3E9P A;  5E84 A;  5JLH A;  4Q5V A;  2QM1 A;  3CI5 A;  5AFU H;  1UWB A;  4K25 A;  3EY1 A;  2W42 A;  3D2F B;  3CC7 N;  4DQS A;  3GL1 A;  4ZTF A;  1OZZ A; 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