5FPMA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 5-phenyl-1,3,4-oxadiazole-2-thiol (at809) in an alternate binding site.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpmA04
4I6MA 3ZX3A 4BC2A 3ZX2A 1NLVA 2P9NA 1MDUB 2A41A 1ATNA 3ID8A 2Q36A 3L6QA 3TU5A 4BQLA 3WUHA 3FZLA 4IO8A 5BN9A 1XUPO 1ESVA 2FLOA 4IJNA 2PAVA 1GLEG 2NRHA 5AQFA 4CZLA 1NGDA 3QMLA 3ENHA 4QS7A 1QZ5A 4HTLA 3H3NO 2CGJA 4BVOA 5AQYA 4DQ8A 4FWLA 4FPAA 4M7XA 1BG3A 1KAYA 5AFUH 2CGLA 4JHDA 5TKYA 3QFPA 3DXMB 2CH5A 2FSJA 2NLXA 3LDPA 1T44A 2ITMA 3HI0A 4B1ZA 4B9QA 1NGCA 2Q2RA 4FPBA 5AZJB 4CBXA 3IUCA 3CERA 4AM7A 3SMSA 3UKRB 2E20A 2AP1A 1TUYA 1YXQA 4FWMA 2A6AA 1SAZA 4BRLA 3FE1A 5AQJA 3KVGA 2P9KB 5AQQA 3OHRA 1Q18A 3A5LC 3J8AA 4BRFA 2QWOA 4A2AA 1ZXOA 4H5RA 1NGGA 3D2EA 5EVZA 2E2NA 4BREA 2CGKA 3HZ6A 1S3XA 3EN9A 3EO3A 1SZ2A 3VEVA 5BPLA 3BF3A 4BROA 3QICA 3ENOA 4KBOA 4RWTA 3GG4A 2HF4A 1BDGA 2ZF5O 2ASPA 3AY9A 5F1XA 3GDQA 5LY3A 3SLCA 4BRAA 4CZMA 1D4XA 1C0GA 3WEEB 4DB3A 3S41A 5EXWA 1QQOA 3VEZA 4PL7A 3L0QA 1QZ6A 4B1VA 1U2VA 2NZTA 4Y0WA 2I7PA 5I9EB 4BR4A 4CZGA 3UKUB 2IVOA 4RCHA 4MO4A 3QBWA 4MO5A 4QS9A 3VENA 3EZWA 5ADXH 3VPZA 4JN4A 4BC4A 1TYQA 4E1JA 3GE1A 5JLHA 3BEXA 4B1XB 3DAWA 3CI5A 4WQ4A 2Q97A 3U9DA 2GWJA 3ZETB 3FZHA 2CH6A 3MN5A 3MN6A 4BR7A 1RFQA 2ZGYA 2E8AA 3G25A 3LM2A 1GLAG 2YCHA 1KAZA 3H45C 4WQ5A 1RGIA 3LDLA 4IWVA 2BUPA 4BC5A 2HMPA 4H0YB 1BWFO 5EY4A 2Q0RA 1BA0A 5F2RA 4CZHA 4PKGA 3B8AX 2YHWA 1GLJO 1NGIA 4O8KA 1ZBSA 4H5VA 3MMVA 3O1WA 4H0VB 4BR2A 4IZ9A 4FSVA 1NGJA 1U6ZA 3HBTA 5KPTA 4EHTA 4K42A 4K41A 4QS8A 2ZGZA 4DCHA 1BU6O 3U8XA 2E2OA 3D7EO 4BRDA 5LJVA 5KPRA 2V52B 2ASOA 4M63C 1R59O 2PBDA 1EQYA 5AQNA 5FPNA 3ZEUA 2W40A 3I33A 3LDQA 3LDOA 4FOIA 2W41A 1Z6RA 4CZKA 4Z94A 2QWNA 1S22A 5BRDA 1C0FA 3ZETA 3LM9A 4O5FA 4XH5A 2QM1A 3CJAA 2GELA 3BP8A 1NGFA 1OKJA 1HLUA 1WOQA 4FWOA 2EWSA 3VF6A 1NGAA 3ZX0A 3WXKA 3WXIA 1MA9B 5AFUA 1HX1A 4CBWA 5BRHA 3VOVA 3A8YA 3CQYA 5ELZA 3SJHA 4BRQA 2D4WA 1JCGA 3CJ1A 4FWKA 2YHXA 4B1WB 2E2QA 2D0OA 3CJ7A 1DKGD 2P9LB 4M7YA 3O5BA 5AQOA 3A5MC 3FR0A 1HUXA 5AZIB 4BR9A 3DXKB 1HJOA 1RDWX 3CJBA 4YDUC 3MK6A 3ULEB 5FPMA 4BGAA 4JNEA 5AQKA 3CJ9A 3HM8A 2QWPA 3FZFA 1E4GT 4H0XB 4DHYA 3M3ZA 1Y64A 4H03B 5E84A 1HPMA 1QQMA 4BGBA 5KPZA 3WT0A 3UE5A 3O1BA 4H5TA 5AQGA 1WUAA 3L4IA 2P9PB 2ASMA 1K8KB 3DWLA 4IXCA 3FZMA 4K25A 4H0PA 1YUWA 1YVNA 3D2FB 3W3DA 5CE3A 5AQRA 1NGHA 3DXMA 3MDQA 4XH4A 2I7NA 4A2BA 4CZIA 3SMPA 1P8ZA 3UB5A 2E2PA 5AQSA 4K43A 3RSEB 3C0BA 3U9ZA 1BO5O 3MN7A 5AZJA 5AQHA 3SK3A 1LCUA 3TPQA 1TUUA 2WUSA 2P9NB 2UYTA 3ATUA 3UKRA 3KZBA 4CBUA 4BRNA 3A5NC 4B1UB 3WXJA 4WYBA 4F9OA 4LC9B 5LJWA 3DJCA 2P9KA 4CD1A 2ZWHA 5ADXA 4BVPA 2P9LA 1IJJA 5AQTA 5JMVA 3MN9A 4XH1A 2BTFA 4A62A 3O8MA 5AZIA 4CZFA 3DXKA 1HKGA 2GTDA 1Z05A 5JLFA 3O08A 1BA1A 2Q1NA 2E88A 3BUZB 3M1FA 5EOYA 3MCPA 5KQ8A 1BOTO 3CETA 2FXUA 3LDNA 4PL8A 4HWIA 1DEJA 4JD2B 4FL9A 4H0TB 1KAXA 2A40A 4EAHD 2P9PA 5JICA 2IVNA 3EL2A 1K8KA 3WEEA 3AAQA 4BR0A 2V51B 3VEYA 3KHYA 4BRKA 1V4TA 1NBWA 3A0IX 2A5XA 2QWMA 2D0PA 2FSKA 5F0XA 4NO7A 4EHUA 3CJCA 3IFRA 3UKUA 3W0LA 4MLEA 5AQUA 3H3OB 3CQXA 2Q0UA 2VYPA 4JAXA 3VGMA 5BR9A 1JCFA 4BRIA 2E1YA 2P9IB 4XEIA 2E1ZA 4J8FA 1NGBA 2A3ZA 3GOIA 1GLLO 4AM6A 4CD3A 3JS6A 2DPNA 2GEMA 3VF2A 5AQVA 2VCPA 3WQTA 3IMXA 2V7ZA 3ATVA 3QFUA 4NB4A 2QXLA 3VERA 3C7NB 4BG9A 1CZAN 3H46O 4FOEA 5E26A 3F9MA 4L3QA 1XC3A 1NGEA 1U2VB 5AQIA 2YI1A 4B1YB 2VWBA 1HKBA 3VGLA 1DGKN 5BPNA 3FFKB 3VESA 4BRPA 3H1VX 1JCEA 3QBXA 3WXLA 4FWNA 3O80A 4CZJA 1ATSA 1NWKA 5AQXA 1TYQB 4FO0A 5FPEA 1E4FT 1GLBG 4JD2A 3JXUA 5AQMA 3U4LA 3M6GA 3R6MA 4CZEA 4MLHA 1X3NA 2FSNA 1T6CA 2AA4A 3EKUA 3I8BA 1LOTB 3FLCO 2F9TA 2YJEA 4GY2B 3IDHA 1ATRA 3H1QA 2V7YA 1SQKA 3P4IA 4ISEA 2HOEA 1QHAA 2P9SB 2Q31A 2YJFA 2A42A 5BRFA 2QWQA 2P9UB 1MWKA 5AQWA 1GLCG 2P9IA 2D1KA 3QB0A 3VEWA 3GL1A 1GLFO 5AR0A 1GLDG 4WQ4C 3AAPA 2QWRA 2QWLA 5AQZA 1J6ZA 4FWRA 5B8HA 3CHWA 1IG8A 4YDUA 1X9JA 4I6MB 4H5NA 2GWKA 5BN8A 3VF4A 3C7NA 2H3GX 4PKHA 4CJ7A 3VETA 1NMDA 3QDKA 3R8EA 5KQDA 2IIRA 2OANA 1ZC6A 3O6WA 4WQ5C 2GUPA 1HKCA 4CI6A 2J4RA 2KHOA 4EFHA 2YHYA 4FWQA 4BRCA 2IVPA 4H0OA 1BUPA 5EX5A 5BPMA 3ZEUB 1YAGA 4BG8A 4FWPA 1H1VA 3A5OC 3EKSA 3HTVA 5AQPA 4ISFA 1T6DA 4JHDB 1KXPA 3H6EA 4H5WA 4BC3A 1MWMA 3ULEA 1V4SA 3LL3A 2F9WA 3VEXA 4FWSA 3R9PA 2FF6A 4A61A 4BRMA 4PKIA 3O4WA 4BRGA 5FPDA 2FF3B 4RTFD 3WQUA 4EIAA 3VGKA 1X3MA 4GNIA 1QQNA 4BRHA 1XQSC 4BQZA 2P9SA 2HF3A 3CIPA 4BR5A 2P9UA 3D2FA 3FGUA 3HSCA 1NM1A 4IJAA 3FZKA 5BREA 4C23A 3GBTA 4ISGA 2QW9A 3BF1A 3RSEA 3D2EB 1G99A 3VEOA 5AQLA 3AARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PUFA 1PTXA 3SQ1A 2P9NA 3WXMB 4E7JA 4B08A 3SUOA 2LI7A 4DV2K 3C95A 2HVHA 1XMQK 3U3GA 3WUHA 4BWMA 1JLAA 3TAMA 2FLOA 1RTJA 2PAVA 3VQ6A 1GLEG 1OH7A 3RWUA 4CZLA 4BE7B 3LWLA 2XHBA 3O9RA 5TKWA 3QNOA 3DOKA 3PSFA 1KFSA 4I9QA 1LAVA 4BEBA 4YY3K 4CK2A 4JKCA 4NXMK 3CQ8A 4WCEL 4YOYA 2CGLA 4JHDA 5TKYA 3OYKA 4FM0A 2CH5A 4KRFA 4CEAA 3QEVA 3AV9A 4KHPK 1Q9XA 4B1ZA 4B9QA 5GIOA 2G2KA 2YC1C 3C6AA 1VRTA 1VSFA 4AM7A 5H1SQ 4LY7A 1QVFM 1VSIA 4NLBA 3UKRB 3E9OA 1U4BA 2AP1A 1TAUA 1VSJA 1YVUA 1J5EK 2KFZA 1YTAA 1PX9A 1SAZA 1DLOA 4BE2A 4N56A 5AQJA 3KVGA 2P9KB 5AQQA 1Q18A 3L2UA 1REVA 1RDDA 4BRFA 1SNBA 4FW2A 2O8CB 1MYNA 3N4PA 1J9AA 3DI6A 5EVZA 3J81O 4YNQA 1ZU3A 2KKZA 1S3XA 1RDUA 3EO3A 3VMFB 1RTIA 1TL1A 5HRRA 3QNNA 1T7PA 4CVNE 3ENOA 3GG4A 4DQSA 2HF4A 2ASPA 3HOTA 4A57A 5HRPA 3GDQA 1S1XA 3SLCA 1RT1A 1VNBA 3SJJA 1D4XA 4GW6A 1C0GA 3BK3C 4DB3A 4B3MK 3S41A 1QZ6A 3DYAA 4ZTFA 2I7PA 5I9EB 3K2PA 1AHOA 3NVMA 3OYFA 3BY5A 2VY6A 4MO5A 4QS9A 1RDAA 3H08A 1SL0A 4E1JA 4DTUA 1OH8A 3DAWA 4EP5A 5C15A 2XY7A 3LAKA 3KOWA 4KHNA 3S5TA 3ZETB 2YHAA 2CH6A 1UA1A 1FXXA 4BR7A 4FJKA 3L8BA 4O55A 2Y1IA 5FLXO 1KAZA 3VQ4A 3TABA 2ATBA 4CK1A 3TTCA 3CCLN 4BDPA 4KYPA 1WB9A 4AHSA 4H0YB 4M42A 1K8BA 4FJLA 3J7YP 4CFCA 3CMAN 1POIA 4ELUA 5F2RA 4CZHA 1K73O 4EZ6A 3O1WA 3SPYA 4DKWA 4CJLA 3T69A 1BQMA 1N33K 4LF4K 1WLJA 1LWEA 1BU6O 4C8LA 4FCYA 3AVBA 4KREA 3C6TA 1EQYA 1F21A 3LZJA 3WNGA 2HBLA 1QVGM 3I33A 4KHYA 5FRMA 4DLGA 1EWQA 4Z94A 3SAFA 4FLXA 4CFBA 4LSNA 3ZETA 4O5FA 4XH5A 2QXFA 2JWKA 2NY9X 1XHXA 4B8CA 1G15A 4IOAL 2XY5A 1WOQA 2AJQA 4CHOA 4PQUA 2EWSA 3JSMA 1MA9B 3HO1A 3LP3A 3M8PA 1HX1A 5BRHA 2LR3A 4DTSA 5ELZA 3NH0A 1DKGD 3TTFA 1KC8O 3ULDA 3MWTA 3FR0A 4O5BA 1IBMK 1I2UA 3M8SA 2VGMA 4OO1J 1RDWX 1JJ2M 1BCOA 4NCBA 5AQKA 3HM8A 3VQEA 1YHQN 1VK0A 1RBSA 4C8KA 2XY8A 1Y64A 4H03B 1NK4A 1VQ7N 3UE5A 3KP0A 1WBDA 5M1QA 4KB0A 2ASMA 2FBVA 2YV0X 4ID1A 1YUWA 3D2FB 2YIOA 3LWMA 2I7NA 1I6GA 4DTNA 4CEBA 3ZSXA 4JYAK 3UB5A 1KVBA 4K43A 3C0BA 3RSEB 3U9ZA 4CJTA 4IOXA 3OJUA 4Z4FA 1LCUA 3TPQA 4M3RA 4I7FA 3KP1A 1QHTA 2UYTA 1VAZA 3ATUA 4Y1CA 4OLBA 2D56A 3AO3A 3OYJA 3KZBA 3RVCA 3NCIA 1FK9A 5K14A 4LFCK 4WYBA 2IOCA 1JL2A 5LJWA 3SQ2A 3TARA 3O9QA 4ICLA 1IKVA 1S1VA 3MCAB 4A62A 2IS3A 4CZFA 4IEIA 2GTDA 1K9MO 5KGXA 1RT5A 1BA1A 4LD0A 2C1IA 3MCPA 5KQ8A 3G0ZA 4LF5K 1DEJA 3E66A 1B9FA 3CCRN 3AA5X 3WEEA 3EL2A 3KKSA 3AAQA 3DRRA 3G71N 3MXMA 2Z1GA 1NBWA 3A0IX 2QWMA 2FSKA 5F0XA 5JENA 3OY9A 3L2QA 2C1GA 3CJCA 4OPAA 3UKUA 4EP4A 5J2MA 5HROA 1VSEA 3OVNA 1KCFA 2Q0UA 4IFVA 3SYZA 5BR9A 1JCFA 4BRIA 5KK4A 1JL1A 2A3ZA 3S3OA 2KJAA 3JS6A 4JKFA 2YNIA 3IMXA 1JLBA 4FM2A 3TR8A 3F73A 1JZAA 3AVCA 2DTUA 1RILA 1Q9YA 3CF5L 3AGRA 4DFMA 4JI2K 3K5NA 2N2QA 4JLHA 1VQPN 2VWBA 1UOCA 5BPNA 1KVCA 3VESA 1T0ZA 3WXLA 4M41A 1ATSA 3K0SA 1BHLA 4JKDA 4LH5A 1NRBA 4U67L 1YTUA 4CZEA 1X3NA 1EKEA 2LY5A 1XRSB 4KH5A 4TSXA 1BCMA 1I94K 5CY0A 5AJ3K 3FLCO 2YJEA 4GY2B 2PZSA 3QLHA 4E7LA 3H1QA 4CERA 2ITGA 4ISEA 2Q31A 3KLIA 1MWKA 4CJ5A 3ASMA 4WFNL 1GLDG 1GOCA 5AQZA 3E9LA 2RN2A 4V19S 2IC3A 3HXMA 4H5NA 3VF4A 2H3GX 4HUGA 3THYB 1LW0A 1NOZA 3R8EA 2OANA 2RF2A 4CI6A 2YHYA 4H0OA 1BUPA 5EX5A 1KQSM 2KSKA 3K57A 1ZVEA 1H1VA 2HNYA 1VQ4N 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3PUF A;  1PTX A;  3SQ1 A;  2P9N A;  3WXM B;  4E7J A;  4B08 A;  3SUO A;  2LI7 A;  4DV2 K;  3C95 A;  2HVH A;  1XMQ K;  3U3G A;  3WUH A;  4BWM A;  1JLA A;  3TAM A;  2FLO A;  1RTJ A;  2PAV A;  3VQ6 A;  1GLE G;  1OH7 A;  3RWU A;  4CZL A;  4BE7 B;  3LWL A;  2XHB A;  3O9R A;  5TKW A;  3QNO A;  3DOK A;  3PSF A;  1KFS A;  4I9Q A;  1LAV A;  4BEB A;  4YY3 K;  4CK2 A;  4JKC A;  4NXM K;  3CQ8 A;  4WCE L;  4YOY A;  2CGL A;  4JHD A;  5TKY A;  3OYK A;  4FM0 A;  2CH5 A;  4KRF A;  4CEA A;  3QEV A;  3AV9 A;  4KHP K;  1Q9X A;  4B1Z A;  4B9Q A;  5GIO A;  2G2K A;  2YC1 C;  3C6A A;  1VRT A;  1VSF A;  4AM7 A;  5H1S Q;  4LY7 A;  1QVF M;  1VSI A;  4NLB A;  3UKR B;  3E9O A;  1U4B A;  2AP1 A;  1TAU A;  1VSJ A;  1YVU A;  1J5E K;  2KFZ A;  1YTA A;  1PX9 A;  1SAZ A;  1DLO A;  4BE2 A;  4N56 A;  5AQJ A;  3KVG A;  2P9K B;  5AQQ A;  1Q18 A;  3L2U A;  1REV A;  1RDD A;  4BRF A;  1SNB A;  4FW2 A;  2O8C B;  1MYN A;  3N4P A;  1J9A A;  3DI6 A;  5EVZ A;  3J81 O;  4YNQ A;  1ZU3 A;  2KKZ A;  1S3X A;  1RDU A;  3EO3 A;  3VMF B;  1RTI A; 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