5FPNA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 3,5-dimethyl-1h-pyrazole-4-carboxylic acid (at9084) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpnA04
3VPZA 2A41A 1U2VB 4QS7A 4H5WA 5AQZA 3UE5A 2ASPA 3HI0A 1JCEA 1ATNA 2IVNA 4FWLA 2CGJA 5KPZA 3O08A 3L6QA 3A0IX 1QQMA 4B1WB 1DKGD 3ID8A 3H6EA 2E1ZA 5JLFA 3MN6A 4F9OA 3O1BA 4J8FA 3VESA 1SAZA 1WUAA 4FWPA 1ZXOA 3BUZB 1RDWX 1NGDA 3H45C 5AQHA 3QFPA 4A61A 1ATRA 3FZFA 3EKSA 4BRAA 3LDOA 3LDPA 2I7PA 2P9KB 2Q0RA 3I33A 3UKUA 1NGEA 4BR0A 3D2FA 2FSNA 3SJHA 4H5VA 1XQSC 1X9JA 4EAHD 1NWKA 5F1XA 2Q31A 4IZ9A 2CH5A 3VOVA 3DJCA 1YVNA 1BA0A 3MN7A 3TPQA 4BRMA 5BRFA 1ZBSA 2E2NA 3HZ6A 1CZAN 3O6WA 2P9NB 4IO8A 2NZTA 4PKHA 1HKBA 3C7NA 2ITMA 1TUYA 2E8AA 3OHRA 4H0PA 1X3NA 2VWBA 1U6ZA 3BEXA 4AM7A 1KAYA 3WEEA 3I8BA 4M63C 4BC3A 4FWKA 4FWRA 3CJAA 5F0XA 4FWQA 3HSCA 3A8YA 3M3ZA 2P9LA 2D0OA 4WQ5C 5AQYA 3D2FB 3AAPA 3QBXA 4CZJA 1ZC6A 4FOIA 2P9IA 3GL1A 1GLJO 2FF6A 5LJWA 5BPLA 3VF4A 3ZEUA 3S41A 5EXWA 3AAQA 4CBUA 4GY2B 2E20A 1NGGA 1NGBA 4BR2A 4K41A 3ZX0A 2V7ZA 3C7NB 2FSKA 3WUHA 1U2VA 3QB0A 2HMPA 4RCHA 2V51B 1V4TA 1G99A 1OKJA 4FPAA 4BGAA 3FZMA 4ISGA 4BRDA 4IJAA 3CJ1A 3WEEB 4NB4A 2QWPA 4QS8A 2YHYA 5AQJA 2W41A 4XH5A 1RGIA 2Q0UA 4CBXA 4MO5A 1P8ZA 2QWQA 4BRKA 4M7XA 1S22A 1NGCA 3AY9A 2QM1A 2P9IB 3CI5A 2AP1A 1GLFO 2BTFA 1BWFO 1NGIA 5F2RA 4A2BA 4H0OA 2HF4A 2ZGZA 1Y64A 3ZEUB 2A6AA 2D0PA 5BPMA 3GDQA 4GNIA 2E2PA 1HKCA 4FWNA 3O1WA 3MN9A 2QXLA 1HKGA 2D4WA 1X3MA 3SK3A 3A5LC 5BPNA 3WXLA 3L0QA 3ENOA 1DEJA 2P9NA 1HJOA 1QZ5A 3CERA 1EQYA 4PL7A 5KQ8A 4B1UB 3G25A 3EZWA 3QDKA 4XH4A 4WQ4A 3GG4A 4BQLA 4ISEA 3VEYA 3D7EO 3EL2A 3IDHA 3A5NC 5AQGA 3CJ7A 4JD2A 1GLLO 1V4SA 4A62A 3BF3A 3HM8A 5FPEA 5AZJB 1S3XA 5EX5A 3VENA 2DPNA 4B9QA 1DGKN 4CZIA 4C23A 2IVOA 4BRHA 3W3DA 1LCUA 3ZX2A 1NGFA 1LOTB 4BC5A 3U9ZA 3ULEA 3CJ9A 4CZKA 1YXQA 3B8AX 4FPBA 5KPRA 4BC4A 5TKYA 2Q2RA 4M7YA 2EWSA 4Z94A 3MMVA 4YDUC 2VYPA 4JHDB 2YJEA 1IG8A 3FFKB 1QQOA 4K25A 3GOIA 1MWMA 2QWRA 4JNEA 5EOYA 4PKIA 3WT0A 1GLEG 2QWNA 2CGKA 1NM1A 2GTDA 5AQSA 3M1FA 5EVZA 5BRHA 1GLAG 4JD2B 2Q97A 4BRQA 1Z05A 3MCPA 4BQZA 3VGLA 4H5RA 3EN9A 1MDUB 3ATUA 5AFUH 5FPDA 5FPMA 2PAVA 1IJJA 3ULEB 2E2OA 3O4WA 1K8KB 1T6DA 5B8HA 5AQWA 1H1VA 2YCHA 2YHXA 3WQTA 3BP8A 4O5FA 1QZ6A 4H5NA 3UKRB 3F9MA 2YI1A 2CH6A 4CJ7A 3A5OC 3GE1A 3H3OB 2ZGYA 4BRPA 4KBOA 3LDQA 3FGUA 4K42A 1JCGA 4K43A 3DAWA 4EHTA 4PL8A 5AQTA 2Q1NA 2P9PB 3MK6A 5AQLA 2D1KA 4H03B 3CETA 4BRCA 4BREA 3WQUA 2PBDA 2UYTA 2V52B 1QQNA 1E4GT 2HOEA 1ESVA 2ASMA 3QBWA 4BRFA 2FLOA 2ZWHA 4CZFA 3CIPA 1QHAA 4BR4A 4CD1A 3FLCO 2J4RA 1GLCG 4AM6A 1BG3A 5AQNA 3SMSA 4WQ5A 4B1XB 1E4FT 3R6MA 4H0XB 4EFHA 5BRDA 1Z6RA 3R8EA 5AZJA 3CHWA 1R59O 4O8KA 4EHUA 4CI6A 3IMXA 4PKGA 2P9UA 3EO3A 1T44A 3VERA 5AQFA 3O80A 4Y0WA 2YHWA 2GWKA 5AQOA 2IIRA 4A2AA 4CZLA 1KAXA 4DHYA 2FF3B 4FO0A 1Q18A 4BGBA 5CE3A 4EIAA 1HUXA 5JLHA 4BRNA 3R9PA 4JHDA 3HTVA 5BN8A 4H0TB 4BROA 2GEMA 5AQPA 5AQRA 3CQXA 1T6CA 4IJNA 4MO4A 4FSVA 2AA4A 4CBWA 5AFUA 2FXUA 2WUSA 5LJVA 5AQKA 5BN9A 3FZHA 2IVPA 3CJCA 3U8XA 3KHYA 4MLEA 5FPNA 1TYQB 4BG9A 2E2QA 3W0LA 4RWTA 2GELA 3DXMA 3DWLA 1ATSA 3AARA 4IWVA 2FSJA 2GUPA 3QMLA 2P9UB 3HBTA 4MLHA 3ZX3A 4BVPA 4NO7A 4CZGA 3H1QA 2E1YA 3H3NO 2BUPA 1K8KA 3GBTA 4IXCA 4JAXA 4B1YB 5JICA 3VGKA 5BREA 4BR7A 4JN4A 3L4IA 3VGMA 4FL9A 2HF3A 3D2EB 1RFQA 1TUUA 3FZLA 3LM9A 3VEVA 5KPTA 3TU5A 3UKRA 4CZEA 5KQDA 3UB5A 4BR5A 1KAZA 5AQXA 1MWKA 3EKUA 1C0FA 5ADXA 1BA1A 1SZ2A 3VF2A 5ELZA 3MDQA 4RTFD 4L3QA 3IUCA 5AQVA 3VEWA 1GLDG 4BG8A 5BR9A 4HTLA 4BR9A 2P9PA 1XC3A 3KZBA 4FWOA 3RSEA 4BC2A 3VETA 4CZHA 4I6MA 4H0YB 5AR0A 2NLXA 3DXMB 4H5TA 3J8AA 2KHOA 3VEOA 3JS6A 4CZMA 2F9TA 2QWLA 3O5BA 5E84A 2CGLA 1GLBG 2QWOA 3H1VX 4ISFA 3LDLA 4YDUA 4DQ8A 4XEIA 3H46O 2P9SA 3CJBA 5AZIA 3P4IA 3U4LA 2OANA 3BF1A 2H3GX 1JCFA 2QWMA 3DXKA 2ASOA 3QFUA 3O8MA 1NMDA 5AQUA 2YJFA 3ENHA 3VF6A 3ATVA 3LL3A 1BDGA 4XH1A 3UKUB 3WXKA 1C0GA 1BUPA 3IFRA 4QS9A 3LM2A 3RSEB 3SLCA 4DCHA 4I6MB 5EY4A 2ZF5O 4E1JA 4FWMA 3VEXA 4DB3A 5JMVA 3ZETA 1WOQA 2Q36A 4CD3A 1TYQA 4B1VA 5ADXH 4HWIA 1SQKA 2W40A 3WXJA 1HLUA 3VEZA 1D4XA 3WXIA 5AQIA 1NLVA 4BRGA 3SMPA 3FE1A 3KVGA 4BVOA 1YUWA 5AQQA 2A40A 3U9DA 5LY3A 2I7NA 3MN5A 4B1ZA 2P9SB 5I9EB 5AZIB 1BU6O 2A3ZA 1NBWA 1BO5O 1BOTO 3DXKB 1YAGA 2NRHA 3QICA 4LC9B 4WYBA 4FWSA 3CQYA 3LDNA 4WQ4C 3D2EA 5E26A 1HPMA 2P9LB 2V7YA 4BRIA 2F9WA 4H0VB 3A5MC 1HX1A 3M6GA 2GWJA 2P9KA 4BRLA 3C0BA 2A5XA 3JXUA 1XUPO 3FZKA 1KXPA 1MA9B 4FOEA 5AQMA 2VCPA 1NGJA 1NGAA 1NGHA 3FR0A 3ZETB 2E88A 2QW9A 1J6ZA 2A42A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MECA 3E1YA 1ILYA 3OYMA 4QS7A 4H5WA 1HNIA 2ASPA 3HI0A 2PYJA 1KV0A 1RT3A 4JKBA 3OYNA 4E1MA 1ATNA 1TKXA 2IVNA 4JKFA 4DV7K 4NXMK 3L6QA 4B1WB 4R5PA 4KHNA 3ID8A 3DRSA 4HTUA 3K9KA 4I7FA 2JWLA 3HL8A 2MZ0A 3VESA 2WFBA 1ZXOA 4EZ6A 2W42A 2XY7A 1T3VA 3TSPA 1BISA 3MXMA 4CHNA 4I9LA 3ZT0A 2P9KB 3KLEA 3NHGA 3S9HA 3CYMA 3UKUA 3D2FA 4LSLA 4DTXA 4H5VA 4CGHA 4ZHRA 1NWKA 3ZT4A 3SF4D 1LQQA 5J2QA 3VOVA 3VTHA 1S1TA 3DJCA 4JI1K 1BA0A 3MN7A 3TPQA 3D45A 5AJ3K 2HHSA 2YNFA 4DG1A 4IO8A 1TKZA 1CXUA 1RT2A 3NGIA 5GAEP 1S6PA 1XNRK 4FW1A 3D6RA 4CFAA 1NRAA 4WFBL 1X3NA 3QNNA 2O8CA 1JLGA 1CHZA 4JKEA 2YKMA 3T1YK 5HRNA 3BEXA 1KAYA 1WSHA 1J53A 3L2RA 3K5LA 1VQ5N 4DV1K 3C95A 4E7LA 4B8AB 4BDYA 4FWRA 2QK9A 1IKXA 4KB1A 4JKCA 3IRXA 4DTNA 3A8YA 2D0OA 3AVNA 3KC6A 4CK3A 1EX4A 1ZC6A 4FK2A 4B3OA 4X64K 4DR7K 3ID6A 4DWIA 1RT5A 3HPHA 5MLCQ 1F21A 2OTLN 1OH8A 2E20A 2EX3A 1D9DA 4BR2A 4K41A 4CJUA 3C7NB 1FKPA 2E2FA 2HMPA 2XY8A 1SL2A 1W9HA 4DS4A 4YHHK 1V4TA 1G99A 2WOMA 2BGGA 4IJAA 3T1AA 3WEEB 3HOTA 4OGEA 3AA2A 5C42A 3O3FA 4XH5A 1RBTA 3CCSN 3AVIA 3NH2A 1RTHA 2N69A 2QWQA 3TTDA 1NGCA 3F9KA 3AY9A 4CGFA 4C8LA 3R3LA 5F2RA 4XIUA 1NK6A 2JGUA 2G8IA 3JSMA 2D0PA 3GDQA 5C25A 5T7BA 3O3GA 4JKDA 2UU9K 4FWNA 3L4QA 4FLZA 3SK3A 3L0QA 3E9LA 3BY5A 1DQ7A 1EQYA 3NF9A 3AVMA 1FJGK 3QEPA 5M1PA 3L2WA 1BQNA 2YBRC 3GG4A 4J2EA 3VEYA 4M3XA 1VSDA 4JD2A 3HVRA 2UUBK 4A62A 3LZIA 5FPEA 1RDCA 5EX5A 3K5NA 4B9QA 1UA0A 4CZIA 3VQ5A 2FBXA 4BRHA 3I0RA 4JS4A 5GAHP 4Z4EA 4LFBK 1KFDA 3AO1A 4UJ0A 1C1AA 2EWSA 1TK8A 4CK2A 1K8AO 4Z94A 3AVHA 2VYPA 4JHDB 4CECA 4PUOA 1Q86O 1QQOA 3TAQA 3K9JA 3GOIA 4H4MA 2O8BB 2YIPA 4CJKA 5EOYA 4PKIA 2NRZA 1VQ6N 1PTXA 2N2QA 4O0JA 1HMVA 3GKUA 4Y1DA 4IOCL 4HVJA 1JZAA 1JKHA 2NRVA 2GMOA 5HOOA 1DTTA 5BRHA 2ZD1A 4FJNA 1GLAG 1OVYA 5SZTA 2Q97A 1C0MA 3M8SA 3KD5E 4DU1A 3VGLA 3K59A 4DTUA 3EN9A 2OZMA 1S1XA 2QA4N 4FZZA 1IBKK 4KRFA 4DF8A 2E5LK 4NYNA 4CJPA 4FLXA 2PAVA 1IJJA 5CZ1A 4LSNA 2E2OA 3O4WA 4IEEA 1K8KB 1XMOK 4KTZA 3BP8A 1WAFA 4O5FA 1WBBA 3UKRB 2ZJQL 3MEGA 2GX9A 4CJ7A 4KI4A 2ZGYA 4JI0K 4LF5K 1JCGA 4FM0A 4E7IA 2G8KA 2D5RA 2LR3A 3NH0A 4BREA 3CETA 3NGYA 2HOEA 1ESVA 2ASMA 2HHUA 2FLOA 5A2QO 2ZWHA 3CIPA 1I94K 2QKBA 1QHAA 3U3GA 4MDBA 4CD1A 1MYNA 1GLCG 3MWPA 1AHOA 1HYZA 1E4FT 1T0ZA 3O3HA 2KZMA 5BRDA 3L2UA 5AZJA 4CJLA 4W5NA 1U45A 3EY1A 4Y1CA 4GVEA 2P9UA 3ZSRA 4CHQA 3AA4A 1T44A 3VERA 5AQFA 3O80A 1VSEA 1JLFA 2HHXA 2F4VK 4LF8K 1UA1A 4X65K 2IIRA 4CZLA 3KD1E 4F2SA 3ZSQA 4IOXA 2KSKA 4CEFA 4DS5A 4CJ3A 3CC4N 3KLHA 5AQPA 4OKEA 3CQXA 4IJNA 4CBWA 4ID5A 5AFUA 1W97L 2VG7A 4YFUA 4E1NA 2KFZA 5LJVA 1JLCA 1KD1O 3FZHA 4F4KA 3CMEN 4JS5A 4ZTFA 3B6OA 3M8QA 1RT4A 1TYQB 4BG9A 3SBTA 4RWTA 2FBYA 4CEOA 3P39A 4I2QA 1P00A 1UGLA 2FSJA 3QMLA 4NCAA 3T19A 4UAEF 4MLHA 4FJGA 1BCMA 2E1YA 3K58A 4DLGA 1E3MA 3VGKA 4QAGA 1KVBA 3PUFA 3D2EB 1K73O 1X1PA 3TU5A 3P83D 4CZEA 1KAZA 2HHQA 4PHTX 1QE1A 3VF2A 5ADXA 4BG8A 1GLDG 3RMAA 4KPYA 3ZCMA 4A5BA 1ZUTA 3ZT2A 2P9PA 4UADE 3THWB 1XC3A 3KZBA 3I0SA 4IFYA 1Q9XA 4BC2A 4YOXA 3VETA 4CZHA 1VQNN 4B3TK 4RW8A 2G8VA 2ATBA 1KVAA 3QEIA 4IO9L 2NLXA 4KHWA 4OPKA 2GV9A 1HQUA 2YX6A 4E72A 4CZMA 3OYBA 2VG6A 3O5BA 4HE7A 5J1EA 1SN4A 1S1UA 3H1VX 4AF1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MEC A;  3E1Y A;  1ILY A;  3OYM A;  4QS7 A;  4H5W A;  1HNI A;  2ASP A;  3HI0 A;  2PYJ A;  1KV0 A;  1RT3 A;  4JKB A;  3OYN A;  4E1M A;  1ATN A;  1TKX A;  2IVN A;  4JKF A;  4DV7 K;  4NXM K;  3L6Q A;  4B1W B;  4R5P A;  4KHN A;  3ID8 A;  3DRS A;  4HTU A;  3K9K A;  4I7F A;  2JWL A;  3HL8 A;  2MZ0 A;  3VES A;  2WFB A;  1ZXO A;  4EZ6 A;  2W42 A;  2XY7 A;  1T3V A;  3TSP A;  1BIS A;  3MXM A;  4CHN A;  4I9L A;  3ZT0 A;  2P9K B;  3KLE A;  3NHG A;  3S9H A;  3CYM A;  3UKU A;  3D2F A;  4LSL A;  4DTX A;  4H5V A;  4CGH A;  4ZHR A;  1NWK A;  3ZT4 A;  3SF4 D;  1LQQ A;  5J2Q A;  3VOV A;  3VTH A;  1S1T A;  3DJC A;  4JI1 K;  1BA0 A;  3MN7 A;  3TPQ A;  3D45 A;  5AJ3 K;  2HHS A;  2YNF A;  4DG1 A;  4IO8 A;  1TKZ A;  1CXU A;  1RT2 A;  3NGI A;  5GAE P;  1S6P A;  1XNR K;  4FW1 A;  3D6R A;  4CFA A;  1NRA A;  4WFB L;  1X3N A;  3QNN A;  2O8C A;  1JLG A;  1CHZ A;  4JKE A;  2YKM A;  3T1Y K;  5HRN A;  3BEX A;  1KAY A;  1WSH A;  1J53 A;  3L2R A;  3K5L A;  1VQ5 N;  4DV1 K;  3C95 A;  4E7L A;  4B8A B;  4BDY A;  4FWR A;  2QK9 A; 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