The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
327
|
sequence length |
1454
|
structure length |
1416
|
Chain Sequence |
VGQQYSSAPLRTVKEVQFGLFSPEEVRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGSIDRNLKCQTCQEGMNECPGHFGHIDLAKPVFHVGFIAKIKKVCECVCMHCGKLLLDEHNELMRQALAIKDSKKRFAAIWTLCKTKMVCETDVPSEDDPTQLVSRGGCGNTQPTIRKDGLKLVGSWKDEPELRVLSTEEILNIFKHISVKDFTSLGFNEVFSRPEWMILTCLPVPPPPVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGVPKSIAKTLTYPEVVTPYNIDRLTQLVRNGPNEHPGAKYVIRDSGDRIDLRYSKRAGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVIPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVSPQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDTFIELDQVLNMLYWVPDWDGVIPTPAIIKPKPLWSGKQILSVAIPNGIHLQRFDEGTTLLSPKDNGMLIIDGQIIFGVVEKKTVGSSNGGLIHVVTREKGPQVCAKLFGNIQKVVNFWLLHNGFSTGIGDTIADGPTMREITETIAEAKKKVLDVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVRFLNEARDKAGRLAEVNLKDLNNVKQMVMAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFVDRTLPHFSKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDNTTRNSLGNVIQFIYGEDGMDAAHIEKQSLDTIGGSDAAFEKRYRVDLLNTDHTLDPSLLESGSEILGDLKLQVLLDEEYKQLVKDRKFLREVFVDGEANWPLPVNIRRIIQNAQQTFHIDHTKPSDLTIKDIVLGVKDLQENLLVLRGKNEIIQNAQRDAVTLFCCLLRSRLATRRVLQEYRLTKQAFDWVLSNIEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMTLKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKTPSLTVYLEPGHAADQEQAKLIRSAIEHTTLKSVTIASEIYYDPDPRSTVIPEDEEIIQLHFSLQQSPWLLRLELDRAAMNDKDLTMGQVGERIKQTFKNDLFVIWSEDNDEKLIIRCRVVAEEDHMLKKIENTMLENITLRGVENIERVVMMKYDRKVPSPTGEYVKEPEWVLETDGVNLSEVMTVPGIDPTRIYTNSFIDIMEVLGIEAGRAALYKEVYNVIASDGSYVNYRHMALLVDVMTTQGGLTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGAFDVMIDEESLVKYMP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of Complete RNA Polymerase II and its Subcomplex,Rpb4/7
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II LARGEST SUBUNIT
|
| molecule tags |
Transcription
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
327
|
| structure length |
1416
|
| sequence length |
1454
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.7.6: DNA-directed RNA polymerase. |
| pdb deposition date | 2004-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00623 | RNA_pol_Rpb1_2 | RNA polymerase Rpb1, domain 2 |
| A | PF04983 | RNA_pol_Rpb1_3 | RNA polymerase Rpb1, domain 3 |
| A | PF04990 | RNA_pol_Rpb1_7 | RNA polymerase Rpb1, domain 7 |
| A | PF04992 | RNA_pol_Rpb1_6 | RNA polymerase Rpb1, domain 6 |
| A | PF04997 | RNA_pol_Rpb1_1 | RNA polymerase Rpb1, domain 1 |
| A | PF04998 | RNA_pol_Rpb1_5 | RNA polymerase Rpb1, domain 5 |
| A | PF05000 | RNA_pol_Rpb1_4 | RNA polymerase Rpb1, domain 4 |
| A | PF05001 | RNA_pol_Rpb1_R | RNA polymerase Rpb1 C-terminal repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Topoisomerase I; Chain A, domain 4 | Topoisomerase I; Chain A, domain 4 | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Enzyme I; Chain A, domain 2 | Enzyme I; Chain A, domain 2 | ||
| Mainly Beta | Beta Barrel | Barwin-like endoglucanases | Barwin-like endoglucanases | ||
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Gyrase A; domain 2 | Gyrase A; domain 2 | ||
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Dna Ligase; domain 1 | RNA polymerase ii |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4KDI A; 2Y0S A; 4QIW A; 3FKI A; 2PJH B; 1PYU B; 3CQZ A; 4CRZ A; 2VPY A; 1YNJ D; 3QC8 A; 2R7Z A; 3IR5 A; 1ZYR D; 2A6H D; 5FTK A; 2CW0 D; 1E61 A; 1UHE A; 2JA7 A; 3HKZ A; 3GTQ A; 1FDI A; 4AOK B; 2R92 A; 1UHD A; 3PLX B; 4AON B; 5DYG A; 5C1B A; 1H5N A; 1CZ5 A; 1Y5I A; 2B63 A; 2E7Z A; 5FTJ A; 3OUG A; 3O5A A; 1PYQ A; 2PMZ A; 1TWG A; 3GTM A; 1PQH A; 1G8K A; 1TWF A; 3DMR A; 2NAP A; 1PT1 A; 4KDL A; 4GA6 A; 2WAQ A; 1QCS A; 3TM7 B; 2NVX A; 3GTK A; 2VPW A; 1KQF A; 4D7Z B; 4AAY A; 1SFO A; 4KOD A; 2JIP A; 1PQF A; 3IR7 A; 1YLE A; 2V45 A; 2JIO A; 2E2H A; 4KO8 A; 1WCM A; 5EPP A; 1YNN D; 2KI8 A; 1TWC A; 1E32 A; 4KLN A; 1DMS A; 5B6C A; 2BE5 D; 2VPZ A; 1Y4Z A; 3CF2 A; 2A69 D; 1TWH A; 3H0G A; 4CS0 A; 4CRY G; 2DMR A; 2JA6 A; 3GTP A; 2A6E D; 1QDN A; 5DYI A; 3GTG A; 5FTN A; 2IV2 X; 3GTL A; 1R27 A; 1CZ4 A; 1E5V A; 1Y1W A; 1R9T A; 3QWZ A; 2NVY A; 1CR5 A; 1SIW A; 2A68 D; 2JA5 A; 1G8J A; 1S3S A; 1IW7 D; 3HU1 A; 1HQM D; 2YU9 A; 1Q16 A; 1K83 A; 2VUM A; 3HU2 A; 1E60 A; 1DMR A; 1H0H A; 3QQ7 A; 5T5M D; 1PQE A; 1PPY A; 4DMR A; 3TIW A; 4AZD A; 5FTL A; 5GLF A; 4AYB A; 2C45 A; 5FTM A; 4GA5 A; 1WLF A; 2R93 A; 1TWA A; 2JIM A; 1PT0 A; 3GTO A; 1KQG A; 1Y1V A; 1VC3 B; 2V3V A; 3QQ8 A; 1FDO A; 1I50 A; 2NYA A; 5C18 A; 2JIR A; 1EU1 A; 4C2M A; 1TMO A; 3IR6 A; 1AA6 A; 4RV0 A; 2WB1 A; 3GTJ A; 1E18 A; 2E2I A; 1R7R A; 1OGY A; 2O5J D; 2VPX A; 3ML1 A; 1AW8 B; 5T5I D; 1SMY D; 2EEO B; 2JIQ A; 1I6V D; 3HU3 A; 1I3Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3M3G A; 1EZ1 A; 5KFI A; 4JV0 A; 1W27 A; 4GC6 A; 2JEF A; 1DCH A; 2R7Z A; 4A2B A; 4ZHQ F; 4BWS C; 5D4D A; 1UHE A; 2F5J A; 4B3T H; 4AON B; 4KB4 A; 2GSN A; 5EOY A; 2PMZ A; 1B4A A; 4C3I K; 2LYI A; 1S0N A; 4XCH A; 1PT1 A; 1RJP A; 3MML B; 2JIP A; 4YFK A; 1F7V A; 3RF2 A; 4JYA H; 1HQM A; 1S68 A; 1YCL A; 2C28 A; 2ENG A; 2QYZ A; 2E2H A; 3H4D A; 4LH7 A; 1YNN D; 2ASD A; 2MQA A; 3RJ0 A; 2R7Z K; 4LLG A; 3I12 A; 4KAS A; 4FG2 A; 2DMR A; 3M4A A; 3GTG A; 1R27 A; 4ZH4 A; 4A3K C; 1I50 C; 1F7U A; 3GV5 B; 1GE9 A; 1TWH K; 5C1O A; 3H0G K; 3QWZ A; 4UCU A; 2AE0 X; 3PO2 K; 3H20 A; 1KQ4 A; 1L8F A; 1IW7 A; 4OIN A; 1K83 A; 1WR2 A; 4YR2 A; 4RAY A; 5L1I A; 4JLR C; 1TWA C; 3SE7 A; 5C3E G; 2J6S A; 3RBD A; 2VUM K; 2E2H K; 5LXT F; 4AZD A; 2O5J A; 3S2D C; 5FTM A; 5CHP A; 2R7N A; 3M4I A; 2F4V H; 2NU7 B; 5KG4 A; 5IP7 G; 4OIR A; 4R8U B; 4C5S A; 1EFW A; 4LF9 H; 3GTJ C; 1IBL H; 2E2I C; 1DV1 A; 3RZO C; 1HI9 A; 3IR6 A; 4A3D K; 2UVV A; 1EH1 A; 4GTF A; 2MX9 A; 2FQO A; 1S03 G; 1I3Q A; 2PJH B; 1PYU B; 1B33 N; 2ZFZ A; 4FM9 A; 4HQ6 A; 3WO1 A; 2R6F A; 4O3Q A; 1Y2M A; 4ED0 A; 2B63 A; 1SFO C; 4KB2 A; 3PR4 A; 2XCO A; 2VA2 A; 3IAY A; 4X6A C; 1G8K A; 2UVR A; 3R5H A; 4KDL A; 1N48 A; 1I6U A; 2FPG B; 1VKZ A; 1JLL B; 3GTM K; 1WOO A; 3K59 A; 3KXY T; 2V45 A; 1I3Q K; 3K7A K; 2ASL A; 5KFU A; 5J2T F; 3V4S A; 4A3G G; 3VA7 A; 4GTD A; 5KG0 A; 4CRY G; 2PMZ E; 4A93 G; 4LF8 H; 1E5V A; 2NVT K; 1Z2P X; 2OH2 A; 1I7L A; 2FB9 A; 2R85 A; 2O5I A; 1TGO A; 3SUL A; 1S3S A; 5TJ3 A; 4BLA A; 2CZG A; 1Y14 B; 2PN1 A; 4QWE A; 4ECR A; 2PIC A; 4A3M C; 2PBZ A; 4GFQ A; 3FOE A; 4A3K K; 5KFX A; 5DQH A; 4GZY A; 4AYB A; 4RU9 A; 2PNW A; 3JRW A; 4BY7 C; 5GON F; 4EGJ A; 2JIM A; 1WOR A; 4C2M C; 3LR2 A; 1TWA K; 2V3V A; 3AQP A; 4JCW A; 4MV3 A; 5DG7 A; 1GYF A; 1TMO A; 1A36 A; 2MCT A; 2IP4 A; 4K0K H; 5EWG A; 4X65 H; 4YFX A; 3S1Q C; 3FKI C; 3S1N C; 2ZJT A; 2YL2 A; 1EUC B; 3BA9 A; 4G0V A; 4G0U A; 5DLF A; 1HR0 H; 3GTJ K; 3VPB A; 4JI1 H; 3VMM A; 2E2I K; 3E5N A; 5E68 A; 4BBS G; 4A3L C; 3RZO K; 4JI3 H; 3M9M B; 5DGA A; 1S10 A; 4EEQ A; 3H4B A; 2HWG A; 2K3N A; 3GTQ A; 2N3E A; 5HV6 A; 4BXX C; 4JP6 A; 3O5A A; 2RH6 A; 4P9S A; 4QWD A; 4WJ4 A; 4XYM B; 1WCM C; 1TL8 A; 4QIW D; 2V9W A; 1IE0 A; 1PQF A; 1EQR A; 4FS1 A; 2LTH A; 4MA5 A; 5F9L A; 1SFO K; 2W6M A; 3LWB A; 5J2U F; 1O2B A; 5B6C A; 1Q8I A; 4J9O A; 1R9T C; 3CF2 A; 2UVW A; 1INN A; 1JQW A; 2VQF H; 4IZO A; 5C5J A; 3U9S A; 3GTL A; 3GTQ K; 3PO3 K; 2W9B A; 2W8K A; 1JDE A; 4J9L A; 4BKW A; 5CAE B; 5KFV A; 5CQG A; 3RBE A; 1C3O A; 4KHP H; 2FMA A; 1S9F A; 4GT9 A; 2XIG A; 5KT5 A; 1Z2O X; 3HOY C; 3U9T A; 5C44 G; 3IG0 A; 4WBN F; 1VH2 A; 4KMH A; 4DR1 H; 4F50 A; 3A8J A; 2NU8 B; 3Q2O A; 1VBG A; 4XSZ A; 4YJ3 F; 4LF5 H; 3S1R C; 4YJ2 F; 2FIO A; 3MR3 A; 3RAQ A; 3OSN A; 1M0T A; 2V59 A; 1T6P A; 3GII A; 4A3M G; 3X2J A; 4JUZ A; 1N32 H; 2NYA A; 1XXB A; 2R7L A; 4MA0 A; 3ORE A; 4BY7 G; 4O3O A; 1R49 A; 2X0Q A; 2JA8 C; 4LF4 H; 4C2M K; 1UC9 A; 5LMN H; 2EZA A; 4AYB E; 4UCT A; 4AHC A; 4O4I F; 1WOP A; 2Y0S D; 1C30 A; 2RDJ A; 4G7O A; 4QIW A; 5L46 A; 5KG3 A; 1ZC1 A; 1V5V A; 3S2H C; 2VPS A; 1YNJ D; 4JI5 H; 3S1Q K; 5KFG A; 2JEG A; 2NU6 B; 3FKI G; 3HKZ D; 1E61 A; 2JA7 A; 4IAJ A; 1UNN C; 2IA6 A; 2WYO A; 4MV4 A; 1RYS A; 3GTK C; 4EFE A; 4A3L K; 4O2A F; 2UXD H; 1TWF A; 1L0W A; 2J6U A; 1T36 A; 1R5Z A; 2X0P A; 1BW4 A; 4LF7 H; 1HNW H; 4KO8 A; 1O27 A; 4BXX G; 5FLM C; 5JVD F; 4QW8 A; 4RZQ A; 3G6Y A; 4RNO A; 1WCM K; 3AD9 C; 2W9B B; 2VUG A; 5GLX A; 5KG1 A; 4C5B A; 2MP0 A; 4UCR A; 3LRD A; 1YX2 A; 1R9T K; 1EK8 A; 2NVY K; 2JA5 K; 2HRO A; 4V2Q A; 1ZQ1 C; 5IYD G; 4A3J K; 5CA0 F; 2W6N A; 3WO0 A; 5IOS A; 1XXA A; 2SCU B; 3S17 C; 1VRQ C; 2FK2 A; 1V4Y A; 3HOY G; 4ED3 A; 1YNJ A; 5FJ8 K; 5LOV F; 2IBK A; 5DQI A; 3OUU A; 1Y1V K; 1O2F B; 1SEI A; 3RB6 A; 2ZDQ A; 5DG8 A; 3T5L A; 3HOW G; 3K57 A; 1KJ9 A; 4P5A A; 5KFO A; 4EBD A; 3U4Q A; 3MR6 A; 4A3F C; 3QZ7 A; 4RB2 C; 2BQR A; 3ADA C; 4GTE A; 4YBZ B; 4DV3 H; 5M5X K; 3UFX B; 3C0F B; 2EZB A; 4LK1 A; 2JA8 K; 2YS7 A; 4EGQ A; 2A6H A; 5IOR A; 4ED6 A; 2R92 A; 4I7H A; 4BAB A; 1Y5I A; 4IR1 A; 1B04 A; 3OUG A; 5KFR A; 3R5X A; 3DMR A; 3PW5 A; 3BUE A; 4BBR G; 5KFJ A; 4QIW E; 5HL8 A; 4MEY A; 3IR7 A; 1Y1W G; 1N33 H; 4FXD A; 4OIQ A; 3M3Y C; 4FZB A; 4KM8 A; 2CFA A; 3GTK K; 4NLG A; 1F93 A; 2BE5 D; 3GIL A; 3AQO A; 2FK3 A; 3X2P A; 3LR8 A; 1KEE A; 3HOU K; 2E2J K; 2PA8 D; 3VPD A; 2Y3P A; 2KWA A; 4MV8 A; 4V2R A; 2YU9 C; 5D8D A; 1ZHS A; 2JA6 K; 5FLM K; 5EGE A; 5I47 A; 4G3I A; 5FD5 A; 2R93 G; 1BNC A; 2C35 B; 2JH3 A; 3S15 C; 4YR0 A; 2Y0N A; 1DMR A; 1PJ7 A; 3HOZ C; 2R8H A; 4F4W A; 4KM9 A; 5IT9 W; 2Y0S L; 2RF4 A; 3N3Y A; 3G6X A; 1V51 A; 2R8I A; 4O4H F; 3K5L A; 3T01 A; 3S0X A; 4JI6 H; 3HKZ L; 1FDO A; 1J6V A; 1DGS A; 1ZXO A; 4WIL A; 5GLY A; 4C5R A; 3DF7 A; 4IRD A; 3GDZ A; 3OUZ A; 3GSI A; 4RV0 A; 3TFI A; 4YAK B; 2E5L H; 2RGV A; 3S17 K; 3CQZ C; 3M9O B; 4BAA A; 2GSU A; 1IOW A; 4DR5 H; 1DCP A; 2XC9 A; 2FE3 A; 2B9S B; 5IP9 C; 1ZYM A; 4MTD A; 5KFT A; 2CQY A; 3L2P A; 2YRW A; 2V6T A; 2YW2 A; 2KSW A; 1UHD A; 5EZY F; 5KFY A; 3OHB A; 1CZ5 A; 4A3F G; 4IP9 A; 3GIR A; 4TUY F; 1NH3 A; 3RB3 A; 1J98 A; 4D3Z A; 4ENG A; 2O03 A; 2PPB A; 2CFA B; 3Q8S B; 3TQ1 A; 1ZVU A; 2NUA B; 3H40 A; 3RB4 A; 2W70 A; 4X66 H; 5EPP A; 1VGX A; 1DMS A; 1K1Q A; 4ECQ A; 4IHJ F; 1TWH A; 3H0G A; 4A3G C; 1TWC K; 4RNM A; 3T5K A; 3RV3 A; 3M3Y K; 3GTP K; 3GIP A; 1M0W A; 4A93 C; 4PAA A; 5L1L A; 5CJ9 A; 3MWE A; 2R8K A; 4OX9 H; 2VUM A; 3KHH A; 1M6V A; 1PQE A; 5JVL A; 1PPY A; 2UUB H; 3GTO C; 5GLF A; 3SJR A; 4RZR A; 3S15 K; 3K5H A; 2M05 A; 4IRK A; 1KQG A; 1I6H C; 2B63 C; 3HOZ G; 1Z2N X; 4XZ3 B; 3G8C A; 3PZP A; 5C3E K; 4QWA A; 2R7Z G; 4A3I C; 1E18 A; 2DLN A; 4F4Y A; 2ZDG A; 3X2I A; 4P5B A; 4MEX A; 5IP7 K; 3Q3Q A; 2PJJ A; 2ZUE A; 3PO2 G; 4FG4 A; 5FPR A; 2HVS A; 3KTM A; 2W71 A; 4BBS C; 3I4N G; 3ERE D; 4TV8 F; 4OIP A; 4A3E G; 1CQI B; 2LPI A; 5C1B A; 2PA8 L; 2QK4 A; 2NVX C; 3X2G A; 4ECY A; 3A8K A; 5IP9 G; 4UCO A; 3GTM A; 4ECV A; 2R8G A; 4CC5 A; 4GA6 A; 1XZP A; 1KQF A; 2FKL A; 2W7O A; 1GGO A; 4Q43 A; 1DV2 A; 2FQT A; 1YLE A; 3OHA A; 3RV4 A; 4QW9 A; 4KLN A; 1WQG A; 1YNN A; 2CW8 A; 3EPI A; 4ECX A; 4DL4 A; 2R86 A; 5KFC A; 1CZ4 A; 4LR2 A; 4JP7 A; 2ZDH A; 3RFC A; 4C3H C; 1XNQ H; 5HBR B; 4DV4 H; 2W6O A; 3GQC A; 2F4Q A; 4CEH A; 4A3G K; 5T5M D; 3EPG A; 3G4C A; 3F8N A; 5C44 C; 1EYZ A; 1ISE A; 5CA1 F; 1TWA A; 3I4M C; 4QJF A; 3N0C A; 3VPC A; 2W6Q A; 1JKJ B; 3GEI A; 2KQA A; 4DR4 H; 1K4T A; 3GTO K; 1WH2 A; 1HNX H; 2UUA H; 4NXM H; 4G7H A; 5KG6 A; 1T3N A; 3RAX A; 1I50 K; 3GTJ A; 4B3S H; 2E2I A; 4O26 A; 1OGY A; 2Q2T A; 1I6H K; 1S0M A; 2EEO B; 4BY1 C; 3HU3 A; 2B63 G; 4GTC A; 2V6U A; 1OWT A; 4C5C A; 2CW7 A; 4A3I G; 3S2D K; 2V5A A; 1WOS A; 5DYG A; 4AH6 A; 1EI6 A; 4QWC A; 2V58 A; 1XZP B; 4NOM A; 2YYA A; 2DPJ A; 4IWY A; 4DUZ H; 1SCU B; 1QCS A; 4ILD A; 4BBS K; 5KT2 A; 2BQ3 A; 1SFO A; 3M4O C; 3X2N A; 5A2Q W; 4MAM A; 4Y52 C; 2NVX K; 3N41 B; 3RZD C; 3R23 A; 4DDQ A; 1XXC A; 3Q8R B; 3X2M A; 1DCO A; 5M3M K; 1CQJ B; 2A6E D; 1O25 A; 1SEU A; 3EYY A; 1WSR A; 5JVO A; 5EWE A; 1SIW A; 1G8J A; 3EQL A; 5KFF A; 2R4G A; 3RB0 A; 4XX0 B; 4X6A K; 3X2O A; 4I55 F; 1BS2 A; 4C3H K; 2P0A A; 2W8L A; 1O2A A; 1V9M A; 5IYD C; 5KFN A; 3N42 B; 3J7A K; 1FJG H; 3GV7 B; 4KAR A; 4F4Z A; 5KT6 A; 1JOE A; 3L4J A; 2NVQ C; 4MV1 A; 3ORR A; 5KFK A; 1JXL A; 5C44 K; 1KJ8 A; 1EU1 A; 4C2M A; 1XZQ A; 4C6G A; 2AQL A; 2FPI B; 4EG0 A; 3PW2 A; 4CEI A; 3I4M G; 3DU6 A; 5KG7 A; 3BG5 A; 1WQF A; 3HOW C; 3MWM A; 3KAL A; 3FKI A; 3FDS A; 2CKZ B; 4O3P A; 4A3M K; 4HYK A; 4ED1 A; 1TWG C; 1VJE A; 4BY7 K; 4LFA H; 4EEY A; 4UFZ A; 4BY1 G; 3HOV C; 3T5J A; 3H3V L; 1WQH A; 1I7N A; 1PQH A; 3KAJ A; 2GLT A; 1N10 A; 2NAP A; 4H3T A; 4O2D A; 3BA8 A; 2GAH C; 4BBR C; 4J9R A; 1WCM A; 3LHP S; 2BH0 A; 3FKI K; 2KI8 A; 3S1N K; 5D1P A; 4A3C C; 1J6W A; 1Y1W C; 2VPZ A; 1Y4Z A; 3QX3 A; 3X2H A; 4JV1 A; 1O24 A; 5IYC C; 5FTN A; 4UCV A; 1MZB A; 4U7C A; 1R9T A; 4Y52 K; 1T6J A; 1OA9 A; 2NVY A; 1J5E H; 2JA5 A; 1J6X A; 3RZD K; 1GSO A; 1RU0 A; 1F9N A; 4BXX K; 2WB1 L; 1FKA H; 5C4X C; 5TMF A; 2R93 C; 2GAE A; 4EBC A; 3H3V H; 4QWB A; 1RYR A; 1V9P A; 5TMC A; 3D30 A; 3V4G A; 4A2A A; 4WD3 A; 1JDB B; 1P8L A; 5KG5 A; 5JUM A; 2XCQ A; 1MIU A; 5FPO A; 1Y1V A; 3QQ8 A; 4O3S A; 1XZQ B; 2JIR A; 5IYD K; 3NGD A; 1AA6 A; 4J9M A; 5KFW A; 3PN1 A; 3S16 C; 4RUA A; 2JA7 G; 3N40 P; 2NVQ K; 4FU0 A; 4M9U A; 1WSC A; 3X2L A; 2Y0S A; 2W7V A; 3HOY K; 2P8T A; 4C5U A; 3SZZ A; 2W7P A; 4DV6 H; 1C0A A; 5GM9 A; 2VOB A; 5FLX W; 3K5M A; 3IR5 A; 4RB3 C; 1B6S A; 5IYB C; 5T14 A; 3RTX A; 3PR5 B; 3HKZ A; 3RIZ A; 3OPF A; 4AOK B; 3S1R K; 1A35 A; 3HOW K; 4DL5 A; 4PWQ A; 2I87 A; 3QFF A; 3KHL A; 3KHG A; 4RUC A; 4JS7 A; 3PW0 A; 4KDD A; 1TWG K; 3GTK A; 4Q44 A; 4NXN H; 4DV0 H; 1KJQ A; 4JV2 A; 3HOV G; 3SUM A; 2FLP A; 5KFB A; 4EJ3 A; 3SUJ A; 4B3M H; 5BPF A; 4A3B C; 3HOX G; 4O4L F; 3MFI A; 2JA6 A; 1W93 A; 4UCS A; 5CB4 F; 4BBR K; 3S2H K; 1AN7 A; 2IMW P; 1CR5 A; 2A68 D; 1RR8 C; 2OLS A; 3SUK A; 4JI8 H; 4LSA A; 1Y1W K; 3BJY A; 4A3C G; 2OWO A; 4FBS A; 1ULZ A; 2FPP B; 1IBA A; 5L1K A; 5IYC G; 1WC2 A; 1JIH A; 2AGO A; 3T5H A; 2YZN A; 2XCP A; 2UXC H; 4Q5V A; 4LK0 A; 1OA7 A; 4ED8 A; 4C3I C; 5C4X G; 4PDB A; 1AUX A; 1X31 C; 2LPJ A; 3V6K A; 5IWA H; 3WOD A; 4DLK A; 3HOU G; 4J9S A; 4BLB A; 4DL3 A; 2R92 G; 1I6V D; 2R7Z C; 2WTF A; 2AGP A; 4CRZ A; 2VPY A; 1TA8 A; 5C8Y F; 3H0G C; 3G6V A; 3PO2 C; 4KC6 A; 1A31 A; 5F9N A; 3GLK A; 3Q1K A; 5DLG A; 5LL6 b; 4DR2 H; 1X9N A; 3I4N C; 2DPI A; 5FTJ A; 2R7K A; 4A3E C; 1AB4 A; 3EZE A; 3P9A A; 4QJV A; 3T00 A; 2E2H C; 3BQ2 A; 3TM7 B; 4E4T A; 1UC8 A; 2G6G A; 2A68 A; 4AAY A; 2Y0S E; 5IYZ F; 4M7E A; 2V4Q A; 5IYB G; 3MFH A; 2JEJ A; 4DR6 H; 4YG2 A; 5LYJ F; 3S1M C; 2WE6 A; 2HGS A; 4ECS A; 4ME6 A; 3GTG C; 1TWC A; 1E32 A; 4ETS A; 4FBU A; 3HKZ E; 3AYH B; 2BE5 A; 4A3F K; 4YB8 B; 4Y8V B; 2C00 A; 4CS0 A; 3GTP A; 4A3D C; 1HD5 A; 3KAK A; 4MTE A; 1K83 C; 5M3F K; 2VPQ A; 3DU5 A; 2XCL A; 1BXR A; 4APM A; 1IW7 D; 4QCL A; 2ASJ A; 4JJO A; 4R8U A; 2YU9 A; 1Y69 8; 4A3B G; 1XPP A; 5C4J C; 4J3N A; 3IPJ A; 2PVP A; 2EBB A; 1S97 A; 4CQ5 A; 4I50 F; 1I6V A; 1L2Z A; 2AQ4 A; 1AUV A; 1E4F T; 2HHH H; 4FS2 A; 3TFJ A; 4DV2 H; 1O28 A; 1TAE A; 1ZHQ A; 4ECT A; 2VR1 A; 5JFE A; 5C18 A; 3GTM C; 3V6H A; 4TV9 F; 4ZOL F; 3S14 C; 2XCR B; 1I3Q C; 4X62 H; 2YU9 K; 3K7A C; 3RUP A; 4X64 H; 3ML1 A; 4LQY A; 4IRC A; 3TQT A; 3X2K A; 1I94 H; 5KKN B; 3JAM W; 2XGP A; 4IP8 A; 3CQZ A; 4Q0Y A; 2VK9 A; 2NVT C; 4LMY A; 3HOZ K; 4JI4 H; 1ZBS A; 2GPW A; 3FMA A; 5K2M A; 3V4Z A; 2YUJ A; 1H5N A; 4Q8F A; 4QJV B; 4GLX A; 1IS1 A; 4KN4 A; 4FER A; 3BAA A; 1EJ9 A; 1B6R A; 5C1P A; 4MV7 A; 4RB1 A; 4L1K A; 2LKM B; 3H0G G; 2VPW A; 5IOQ A; 4JI7 H; 2MX8 A; 1EZB A; 3I4N K; 4Q5G A; 3HBL A; 3CQZ K; 4A3E K; 4L8I A; 4YY3 H; 5EWF A; 4MQ9 A; 2V6S A; 3AD8 C; 1RRJ A; 1A9X A; 2FP4 B; 2VUM G; 4AVR A; 4J0M A; 4Q5S A; 5IP9 K; 1E4G T; 5L9X A; 3V6J A; 3K3P A; 3S1M K; 3TIG A; 2UUC H; 5JQW A; 1RK5 A; 3GTG K; 4IWX A; 2R87 A; 5LA6 F; 2N1D B; 4C3J C; 4LFC H; 5KT4 A; 3IN5 A; 4A3D G; 2AGQ A; 4DMR A; 1K83 K; 3MJF A; 4J9K A; 4GKJ H; 5KFE A; 4AYB D; 1WLF A; 3H3V D; 3GTO A; 5LMU H; 4ECW A; 5C4J K; 3CAG A; 4KN7 A; 1I50 A; 2FLL A; 2X0S A; 1DD5 A; 3LAJ A; 1RJR A; 3K5I A; 5KG2 A; 4LOW A; 1BJT A; 2PMZ L; 1ZQ7 A; 3CZB A; 3TIN A; 5M5W K; 3Q8P B; 1R7R A; 3N44 B; 4PAB A; 4J9P A; 1KC7 A; 1AW8 B; 4A93 K; 1VBH A; 4ECU A; 1GO3 E; 2K3O A; 4EYH B; 2XCA A; 2C2D A; 5DGB A; 3WVO A; 3GTQ C; 3PO3 C; 1RK6 A; 3S14 K; 2GPS A; 4LSX A; 1PJ6 A; 2WB1 D; 3N6X A; 2ZM6 H; 2R84 A; 2E7Z A; 4DV7 H; 5M5Y K; 1IQ0 A; 2R82 A; 3PVX A; 1GSA A; 2B63 K; 2NVX A; 3TII A; 2RGR A; 5KFH A; 4XSX A; 4RMF A; 3FOF A; 4DV1 H; 3LML A; 4A3I K; 5BPH A; 3GTL C; 4ZI7 F; 4A3K G; 4XLN A; 3BP3 A; 3LPX A; 3EZB A; 4TQS A; 2HVR A; 2I80 A; 1VLO A; 2ATL A; 1E4E A; 5DG9 A; 5DQG A; 5KFQ A; 1IBM H; 3K5O A; 5L1J A; 1IBK H; 3KHR A; 4JI2 H; 1H0H A; 4Y7N C; 3FHZ A; 3TIW A; 5LP6 F; 2FJZ A; 5KT3 A; 1BDF A; 1G51 A; 4FFT A; 2R7M A; 4NOK A; 4C3J K; 1PJ5 A; 1JX4 A; 4OYD B; 4L48 A; 2ZUF A; 4FYD A; 3NZ4 A; 4YR3 A; 3JST A; 4O3N A; 2YCH A; 2NU9 B; 2C22 A; 1W96 A; 4JI0 H; 2WB1 A; 3N8D A; 4OIO A; 1XMO H; 3HXA A; 5T5I D; 3AD7 C; 5MLC 9; 2W6P A; 2K3Q A; 3QZ8 A; 4KDI A; 2FLN A; 4MV9 A; 3TFH A; 1ZET A; 2JA7 C; 4O2B F; 2UU9 H; 3CVZ A; 3MAQ A; 3RGX A; 3T1H H; 3LF9 A; 2FK1 A; 1WIH A; 1TWF C; 1FDI A; 2G5D A; 3PLX B; 3LR6 A; 2NVY C; 1RJQ A; 3I4M K; 2YZG A; 2JA5 C; 1S0O A; 4LMO A; 4CEJ A; 2P5M A; 4A3J C; 3PO3 G; 4JV5 H; 2BQU A; 4ED7 A; 3BQ1 A; 4ZQI A; 3JSN A; 4D7Z B; 2JEI A; 5KFD A; 3A8I A; 4U6P A; 4KOD A; 4YFN A; 2AU0 A; 1M7J A; 3ETJ A; 2DZD A; 2JIO A; 1K4S A; 5KX5 F; 4AQY H; 2PI8 A; 2J6T A; 4AYB L; 4DL7 A; 2A69 D; 4KMD A; 4BY1 K; 5H4U A; 4MV6 A; 1Y1V C; 1QDN A; 3MR2 A; 3G4A A; 2A6E A; 1E4E B; 4HNT A; 3HOX C; 1N36 H; 2GAG C; 2WAQ D; 4YQW A; 1BGW A; 4I4T F; 3GTL K; 3GEH A; 5KFS A; 5EGH A; 1XMQ H; 1JVI A; 3EZA A; 2V4R A; 2X0O A; 4KAT A; 3BP8 C; 5FTL A; 4HR7 A; 2C45 A; 5JSN B; 4RB0 A; 1PK8 A; 5KT7 A; 4F3E A; 5KFL A; 3M4O K; 3N0B A; 1O75 A; 1N56 A; 4WJ3 M; 2HCZ X; 4GTL A; 1GLV A; 4Y7N K; 4LH6 A; 5IZ2 A; 3JZI A; 3J81 W; 2VQD A; 4HNV A; 4KMU A; 3M9N B; 4LJZ A; 3MWD A; 2VPX A; 2HVQ A; 4A3L G; 1SMY D; 5KFM A; 3OSP A; 1SYX B; 1IOV A; 4AN8 A; 3HOU C; 1PX2 A; 2E2J C; 1O29 A; 5EDW A; 4Q8E A; 4CC6 A; 2R92 C; 5D1O A; 2C2E A; 3QC8 A; 2VQE H; 2JA6 C; 5KFP A; 2GSO A; 2W9C A; 2A6H D; 2YRX A; 4Q4Z A; 1O26 A; 2A69 A; 2DIK A; 2WB1 E; 3Q8Q B; 1EZA A; 1WCM G; 4GKK H; 4NOL A; 1USO A; 1A0I A; 1TWG A; 3SZY A; 2JA7 K; 3GIJ A; 2PHC B; 4ZM7 A; 4YAJ B; 4GC7 A; 3ENG A; 5C9H A; 5JH7 F; 2WAQ A; 4RNN A; 4TQR A; 1TWF K; 3KYL A; 1T8I A; 1KBL A; 1B4B A; 2JA5 G; 1BW3 A; 4A3J G; 3TTG A; 2BR0 A; 4NOH A; 5DYI A; 1EUD B; 2YZM A; 1Y1W A; 1SC7 A; 3HXL A; 4LF6 H; 4J9N A; 1VAJ A; 3HU1 A; 3GID A; 1CE8 A; 1XNR H; 1LPQ A; 1IL2 A; 5FJ8 G; 3J80 W; 3HU2 A; 2RDI A; 1E60 A; 3MR5 A; 3HOV K; 2J9G A; 1Y1V G; 2DWC A; 3HOX K; 4LFB H; 3JRX A; 5KFZ A; 2YS6 A; 4QIW L; 4YP3 A; 4GA5 A; 1SMY A; 2R93 A; 2YII A; 3WNZ A; 4C5A A; 2UVU A; 4JK1 A; 1VC3 B; 4A3C K; 2VA3 A; 2W6Z A; 3GEE A; 2JA8 G; 4G7Z A; 5IYC K; 3PW7 A; 4EBE A; 4O3R A; 3ORQ A; 4XLP A; 4EYI B; 1N34 H; 2UXB H; 4ED2 A; 3HB9 A; 2JIQ A; 3T02 A; 5D1O B; 2IV2 X; 1T94 A; 1TWC C; 1K1S A; 5FD6 A; 5C4X K; 4KMA A; 4R7R A; 2W9C B; 3AH5 A; 2R93 K; 3K3V A; 3GTP C; 3K58 A; 1ZYR D; 5FTK A; 2CW0 D; 4EFB A; 4GTB A; 3BQ0 A; 3ETH A; 3OEP A; 1PYQ A; 3RGZ A; 2WAQ L; 2R92 K; 3T1Y H; 3U44 A; 1HNZ H; 2JA6 G; 3GIK A; 4DL2 A; 5FLM G; 4M1X A; 2R8J A; 3UQ8 A; 3NUH A; 2W9A A; 1UV7 A; 1TWH C; 2D6F C; 2XD4 A; 1EHI A; 3K5N A; 3BAB A; 4IR9 A; 5KFA A; 5H80 A; 4G0W A; 3S16 K; 2ALZ A; 1VS0 A; 4DR7 H; 4HNU A; 1USM A; 4XYL B; 3LP8 A; 3OTO H; 1DIK A; 3DXJ A; 2PMZ D; 5C3E C; 4J9Q A; 4RAZ A; 4C45 A; 2VUM C; 1WSV A; 2WAQ E; 1KJI A; 3SI8 A; 5IYB K; 4F4X A; 2Q2U A; 5IP7 C; 1HQM D; 1Q16 A; 4ECZ A; 4NOI A; 2HJW A; 5JSB B; 3LAP A; 3JSL A; 2FIP A; 3QQ7 A; 3PW4 A; 3R5F A; 1CS0 A; 3GIM A; 4GTA A; 2C2R A; 4KAW X; 4FBT A; 4DL6 A; 4D3Y A; 4YHH H; 5BR8 H; 1GSH A; 2XGQ A; 3GIQ A; 2WDT A; 1PT0 A; 3N43 B; 3L4K A; 4B3R H; 2I8C A; 4A3B K; 3GV8 B; 5IOT A; 1ZYR A; 2CW0 A; 4FGU A; 4DUY H; 4DV5 H; 2W57 A; 4DR3 H; 2O5J D; 1XDN A; 1FVI A; 4Q45 A; 1KJJ A; 2EZC A; 5BMV F; #chains in the Genus database with same CATH homology 2K3O A; 3FKI A; 4GTE A; 3WVO A; 2R7Z A; 1UHE A; 5IOR A; 2F5J A; 2R92 A; 4AON B; 4KB4 A; 1Y5I A; 2E7Z A; 2GSN A; 3OUG A; 2PMZ A; 1B4A A; 1WQH A; 2LYI A; 1PQH A; 3DMR A; 2NAP A; 1PT1 A; 3BUE A; 3MML B; 2NVX A; 2RGR A; 4H3T A; 2JIP A; 3IR7 A; 3FOF A; 4FXD A; 4FZB A; 4KM8 A; 2CFA A; 2E2H A; 1WCM A; 3LHP S; 1YNN D; 2KI8 A; 2MQA A; 2BE5 D; 2VPZ A; 3AQO A; 1Y4Z A; 3QX3 A; 3LR8 A; 4KAS A; 3LPX A; 1O24 A; 2DMR A; 3M4A A; 3GTG A; 5FTN A; 1R27 A; 2Y3P A; 2KWA A; 1GE9 A; 1R9T A; 3QWZ A; 2NVY A; 5EGE A; 2AE0 X; 2JA5 A; 1KQ4 A; 3K5O A; 1F9N A; 2JH3 A; 1K83 A; 2Y0N A; 1DMR A; 1H0H A; 4JLR C; 2GAE A; 3FHZ A; 3TIW A; 4KM9 A; 4AZD A; 3V4G A; 5FTM A; 5CHP A; 3N3Y A; 2XCQ A; 1MIU A; 4NOK A; 3K5L A; 3S0X A; 1Y1V A; 4OYD B; 4FYD A; 3QQ8 A; 1FDO A; 1ZXO A; 2JIR A; 3IR6 A; 1AA6 A; 4RV0 A; 2WB1 A; 5T5I D; 1EH1 A; 2GSU A; 2MX9 A; 4GTF A; 5MLC 9; 2K3Q A; 1I3Q A; 4KDI A; 2B9S B; 2Y0S A; 2PJH B; 1PYU B; 2ZFZ A; 3MAQ A; 4FM9 A; 3K5M A; 3IR5 A; 3LF9 A; 1WIH A; 3HKZ A; 3OPF A; 1FDI A; 4AOK B; 2G5D A; 1UHD A; 3LR6 A; 1A35 A; 3PLX B; 1CZ5 A; 2B63 A; 4KB2 A; 4LMO A; 4CEJ A; 2P5M A; 4IP9 A; 2XCO A; 3IAY A; 1G8K A; 1NH3 A; 4KDD A; 4D3Z A; 4KDL A; 3GTK A; 4D7Z B; 2CFA B; 4KOD A; 1ZVU A; 3K59 A; 2V45 A; 2JIO A; 1K4S A; 5EPP A; 2PI8 A; 1DMS A; 4EJ3 A; 3VA7 A; 4GTD A; 2A69 D; 4KMD A; 1TWH A; 3H0G A; 4CRY G; 2JA6 A; 1QDN A; 3G4A A; 1E5V A; 1CR5 A; 1BGW A; 2A68 D; 1TGO A; 1RR8 C; 1S3S A; 5TJ3 A; 5CJ9 A; 5EGH A; 4BLA A; 4FBS A; 2VUM A; 2PIC A; 1PQE A; 4GFQ A; 3FOE A; 1PPY A; 2X0O A; 4KAT A; 5FTL A; 5GLF A; 3SJR A; 4AYB A; 2C45 A; 2PNW A; 5JSN B; 2JIM A; 4F3E A; 4Q5V A; 3N0B A; 4C3I C; 4C2M C; 3LR2 A; 1KQG A; 4GTL A; 2V3V A; 3AQP A; 5IZ2 A; 1TMO A; 1A36 A; 2LPJ A; 1E18 A; 2VPX A; 4BLB A; 4G0V A; 4G0U A; 1SMY D; 4P5B A; 1I6V D; 3Q3Q A; 4AN8 A; 2PJJ A; 1O29 A; 4CRZ A; 2VPY A; 3QC8 A; 2GSO A; 2A6H D; 4KC6 A; 1A31 A; 3ERE D; 2K3N A; 1O26 A; 3GTQ A; 2N3E A; 2LPI A; 5C1B A; 5FTJ A; 4NOL A; 3O5A A; 1TWG A; 2RH6 A; 1AB4 A; 3P9A A; 2PHC B; 3GTM A; 5C9H A; 3TM7 B; 4GA6 A; 2WAQ A; 1TL8 A; 1KQF A; 2G6G A; 4AAY A; 1PQF A; 3KYL A; 1T8I A; 2LTH A; 1YLE A; 1B4B A; 1TWC A; 1E32 A; 1WQG A; 4KLN A; 1O2B A; 5B6C A; 1Q8I A; 3CF2 A; 4NOH A; 4CS0 A; 3GTP A; 5DYI A; 3GTL A; 1CZ4 A; 4LR2 A; 1Y1W A; 1SC7 A; 4BKW A; 5CQG A; 4C3H C; 3DU5 A; 1IW7 D; 3HU1 A; 4QCL A; 1LPQ A; 4GT9 A; 2YU9 A; 2F4Q A; 1Y69 8; 3HU2 A; 4CEH A; 1E60 A; 5T5M D; 4KMH A; 4J3N A; 3G4C A; 4GA5 A; 1ISE A; 2R93 A; 1TWA A; 2FIO A; 3N0C A; 1VC3 B; 1O28 A; 1K4T A; 5JFE A; 2NYA A; 1XXB A; 5C18 A; 3ORE A; 2XCR B; 1R49 A; 3GTJ A; 2X0Q A; 2E2I A; 4O26 A; 1OGY A; 3ML1 A; 4LQY A; 4AHC A; 2EEO B; 2JIQ A; 3HU3 A; 2IV2 X; 4IP8 A; 4QIW A; 3CQZ A; 1ZC1 A; 4GTC A; 4KMA A; 2VK9 A; 3AH5 A; 1YNJ D; 1ZBS A; 3K58 A; 1ZYR D; 5FTK A; 2CW0 D; 1E61 A; 2JA7 A; 4GTB A; 2YUJ A; 5DYG A; 1H5N A; 3OEP A; 1PYQ A; 1IS1 A; 3U44 A; 1TWF A; 4NOM A; 1EJ9 A; 1QCS A; 2LKM B; 4ILD A; 2VPW A; 1R5Z A; 5IOQ A; 1SFO A; 2MX8 A; 2X0P A; 4M1X A; 3NUH A; 4KO8 A; 3K5N A; 1O27 A; 4Q5G A; 4G0W A; 4L8I A; 4DDQ A; 1XXC A; 1RRJ A; 2A6E D; 1O25 A; 1SEU A; 5JVO A; 1SIW A; 1G8J A; 3LRD A; 1HQM D; 1EK8 A; 2R4G A; 2N1D B; 1Q16 A; 5JSB B; 4C3J C; 3LAP A; 2FIP A; 3QQ7 A; 4DMR A; 4GTA A; 4KAW X; 1O2A A; 1V9M A; 1WLF A; 4D3Y A; 5IOS A; 1XXA A; 1PT0 A; 4KAR A; 3GTO A; 3L4K A; 3L4J A; 3CAG A; 1I50 A; 1DD5 A; 5IOT A; 3LAJ A; 1EU1 A; 1BJT A; 4C2M A; 2AQL A; 3CZB A; 4FGU A; 3K57 A; 4P5A A; 4CEI A; 3DU6 A; 1R7R A; 2O5J D; 1AW8 B; 3U4Q A; 1WQF A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
