1BBSA

X-ray analyses of peptide inhibitor complexes define the structural basis of specificity for human and mouse renins
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
335
structure length
331
Chain Sequence
TTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSELGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray analyses of peptide-inhibitor complexes define the structural basis of specificity for human and mouse renins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RENIN
molecule tags Aspartic proteinase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 331
sequence length 335
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 1992-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1bbsA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1bbsA01
1MSNA 2FIVA 2B8LA 5P1EA 2QD8A 1HSIA 3PI5A 2BBBA 3WB4A 4NJTA 5P2OA 3IGBA 3H5BA 5P7WA 2JE4A 1D4HA 1APWE 4MC6A 5P4NA 2NXDA 5P3QA 3S7LA 4S1GA 1HBVA 3K5CA 5P2CA 5P5IA 3INEA 4I10A 2IRZA 5P7AA 2NXMA 4YCKA 5P6HA 3IXOA 2PK5A 2G1OA 4J1EA 3K1WA 1FQ6A 4KE0A 4DPIA 1FB7A 5P88A 5P5UA 5IVQA 4R92A 4LP9A 4HLAA 5OZYA 3VF5A 4N00A 1C6ZA 5P8JA 5BWYA 4Y3ZA 4PZWA 1OD1A 4DQFA 1TQFA 1MESA 2G1NA 1FF0C 2AZ9A 2FMBA 1ZLFA 5P7QA 4YD7A 4U7VA 4TVHA 3L59A 1M0BA 2P3AA 5P6GA 1C6YA 5I70A 2G20A 4Y5BA 5P83A 1MVPA 5P6EA 5P5LA 4OBHA 3ZKIA 5COOA 2QNNA 3SLZA 2XFIA 4Y4TA 4CPWA 2B7FA 2AIDA 5P1UA 5OZ1A 5ENMA 2QP8A 2V11C 2ZJJA 1K6TA 1A8KA 1YTJA 1FQ5A 5FIVA 1KZKA 1ZP8A 4BFDA 1BWBA 5OYYA 1HVLA 5P3SA 3L5FA 3EL4A 5P2RA 1B6LA 5KQXA 4GJAA 3ER3E 5P04A 1EPRE 2R3TA 3S43B 2A1EA 4J54A 4Y39A 1KJGA 3PCZA 5P01A 3MWSA 5P7IA 2VJ7A 1XN3A 3NWQA 5P70A 3R1GB 2QZXA 5P6VA 4J0PA 2O4KA 3QRMA 2JJJA 3EXOA 3KF0A 4Y3RA 2G21A 4I0FA 3U7SA 4M8YA 1LYAB 5P6FA 4R93A 5P50A 5P8PA 2QZLA 2IGXA 3APRE 1PSAA 3GGUA 5HE7A 5P08A 5P1MA 4EP3A 5C9FA 3OQFA 3HAWA 4F75A 5P2JA 1IDBA 4Y4EA 2Q55A 2JJIA 3BVAA 1K2CA 5P64A 4ER1E 1CMSA 5P41A 5P1VA 1BV7A 1GNMA 3VF3A 1ODYA 4RCDA 5OZ3A 1OEWA 4CMSA 5P0IA 1EC1A 1CPIA 4PPHA 3SM2A 3LITA 2P3CA 3AUPA 3QRVA 4F76A 5HDVA 5DR8A 5HDUA 5P44A 4HA5A 5OYWA 2Q64A 2BPYA 3KN0A 4RGHA 1HHPA 5P81A 5UPJA 4Q1XA 5OZ6A 1MT9A 2NR6A 4Y4XA 3S54A 2F3EA 3CYWA 2OHSA 3N4LA 5P0MA 3SAAA 1MTBA 4Y5AA 3SQFA 5P67A 5P4QA 1IVPA 3CIBA 5P3BA 3OU4B 5P0NA 5P42A 4B1DA 4I0EA 3EKQA 2WECA 1HOSA 3OGPA 5OZ8A 3VG1A 3CKTA 3GGAA 2G26A 3NDTA 1APVE 3UDJA 2WEZA 2HPEA 4I8ZA 1FFFC 5P18A 2BQVA 3BXSA 1EPNE 5P6TA 5P11A 3EMYA 2VA7A 5P5RA 4QJ7A 2FGVA 5P3HA 5DQ2A 4Y5MA 1AIDA 3VLAA 3OHFA 4YD3A 1HSGA 3VYDA 5P5EA 5P8FA 1FQXA 1J71A 3PRSA 2AOHA 5E5JA 2P4JA 4OBJA 5P8KA 2I1AA 3PLLA 3TH9A 1YX9A 1UH7A 5P6BA 5P5AA 3ECGA 1FG6C 4I8WA 3NDWA 4QJ8A 5HE5A 2IGYA 4J0VA 2RSPA 4Y3HA 1XE6A 1EPOE 1AXAA 3VFAA 2ANLA 4GMIA 2G22A 5P4SA 4LL3A 1IZEA 2P3BB 3SA4A 2AOEA 2CEMA 3PGIA 2QK5A 1NH0A 4L7GA 4YOBA 3OXWA 5P0LA 5P47A 4ZSRA 4D88A 5HDZA 5OZ5A 5P2BA 2UY0A 1KJ7A 2P8HA 4B0QA 5KOQA 3NU3A 4CP7A 4LBTA 1SGUA 5P71A 4Y4WA 1FMXA 4DH6A 5SY2A 3O9LA 1EEDP 4GJ8A 3FNTA 5OYZA 5P2EA 5P4MA 3EL0A 1NSOA 2V00A 3RTHA 1QDMA 4GJ5A 5P7UA 3I7EA 4Y47A 3KMXA 4YHQA 5P53A 3OUCA 1IVQA 2APRA 1BILA 2R5PA 1SIPA 5OZMA 4OC6A 1AM5A 1U8GA 2H6SA 2IQGA 3QROA 5AGZA 4Y54A 3CICA 5P60A 2QHYA 4FIVA 4AMTA 2QD7A 2PSGA 3EM4A 5CLMA 5P36A 2OHRA 5OYRA 3UDMA 5KQFA 2P3DA 4K9HA 3UDYA 1A30A 4OBZB 1W5XA 2PYMA 4EQJA 5P14A 5DQ4A 5P1OA 2CEJA 3NLSA 5HCTA 5P5ZA 4FAFA 2ZHSA 3PWWA 5P09A 5P5JA 5P8IA 3NU6A 4RVXA 3S2OA 4B77A 5P55A 2HIZA 2PWRA 4ZLSA 5P0WA 4TRZA 3T11A 1FMBA 5P4TA 5P8MA 4CKUA 1DMPA 2QU3A 5E5KA 2IEOA 3SABA 4Y3GA 5OZZA 1W50A 2OF0A 5P8SA 4H3JA 3GGXA 1HVKA 2ZJNA 1EBKC 3CKRA 1TSUA 2VIZA 1B5FA 2I0DA 5P8BA 5P6WA 3QS1A 1W5VA 5P8RA 2ZJLA 1LYBB 5KR8A 5HVPA 3PVKA 3R2FA 4DV9A 5OZFA 2AVVA 4LXKA 2QI5A 4Y4DA 3HAUA 5P6LA 2WF0A 5P10A 4Y5CA 3DV1A 5P3MA 1Q9PA 4RZ1A 1SIVA 1K6VA 4Y3NA 2ZJIA 4Y5KA 4Y45A 5P1JA 1AAQA 4I1CA 4CPXA 1ZPAA 3OOTA 2V0ZC 4PYVA 2JYSA 1N49A 3UQXA 4MC1A 5DGUA 2B8VA 1AJVA 2QMGA 3SA9A 4DPFA 1ODWA 4BEKA 4J0YA 3PSUA 5P03A 4J55A 4Y3MA 5P1YA 4JPEA 5P35A 5P6NA 1HXWA 4GJ7A 5P8DA 4J0TA 4XXSA 5P46A 5P12A 1IIQA 1PPLE 4FM8A 3O9IA 2PK6A 3WZ8A 4H3FA 3BXRA 3URIA 3BVBA 2NTRA 3KFSA 3T7QA 4D8CA 1D4LA 5IVTA 5P32A 4FGXA 5P0CA 5C9DA 2FS4A 2QMPA 1WKRA 2FNTA 1K6PA 3IXJA 3DM6A 5P4XA 5P7YA 3T7XA 4QJ9A 3S85A 3OU3A 4LXAA 1WBMA 3QRSA 5P1LA 3UDPA 2OHMA 3EKXA 5P54A 4GYEA 5OZRA 3LZYA 4ZPFA 3UDNA 4IVSA 4YD5A 3SACA 5P29A 3VV8A 4Y3YA 4Y5EA 3T7PA 3MSJA 2ER0E 3BUGA 3KDCA 5P4FA 3QVIA 4Y5GA 3TPJA 3K5FA 3PEPA 5P3FA 1UH8A 4QJ2A 3G72A 5P38A 4EYRA 1PROA 1W6IA 3G70A 5P4HA 4DJPA 4OBGA 3SA7A 5P0OA 2ZYEA 3AIDA 2A4FA 3WZ7A 1IDAA 1EAGA 4L7JA 4B78A 4GIDA 4Y3LA 1YT9A 5P7PA 5P68A 5P2TA 4R95A 1FIVA 2UPJA 1YG9A 2RKGA 4NKKA 5P6PA 5I3XA 4ZSMA 4J0ZA 3PMUA 3HVPA 1XN2A 5P1CA 5P78A 3JVWA 5P31A 3O9FA 4DQCA 5P33A 1WBKA 4Y3PA 3GI6A 1T3RA 5P28A 4YOAA 1T6EX 5P2UA 5T4SA 2QI3A 1AZ5A 2G94A 5P2LA 5P6UA 2MIPA 4K4PA 4APRE 1CZIE 5OZWA 4COEA 4B72A 2I4QA 2AVMA 3QVCA 1SDVA 2G1SA 5P45A 3VSWA 5HU0A 1FLHA 3SKGA 2FLEA 5DR0A 5APRE 5OZQA 1IZHA 2VA5A 5P7LA 3SPKA 3OUDA 5OYVA 5P7HA 1YTGA 1E5OE 6UPJA 3EL9A 2Q63A 2QHZA 3RVIA 2IKUA 3MSKA 4J1KA 1EBYA 5P3EA 5HD0A 2QAKA 2QZWA 5P0GA 4APEA 5OZ9A 3I2LA 3L5BA 2WEDA 4Y37A 4Y3FA 5P2SA 5P82A 4DQEA 4PHVA 3IVHA 5AH9A 1HPSA 3T6IA 1W5WA 5P1SA 3PSYA 4EXHA 5P1BA 5P5FA 3OTSA 3VV7A 1HPXA 4D85A 2VIJA 3UFNA 3KT2A 4Y3SA 1E80E 2ER9E 5P3CA 4Z50A 3UQPA 2G24A 5P0QA 2PH6A 2PSUA 4U7QA 3FSMA 3DJKA 5P59A 1E82E 4YA8A 4R91A 1HSHA 3OAGB 2IKOA 2XFKA 2ZHUA 3UDQA 3VUCA 5F01A 4KUPA 5P75A 4Z22A 3OQKA 4B1EA 5P2AA 3ZPSA 5OZPA 3SA5A 3I6OA 3EKTA 4Y3AA 5P8HA 3S7MA 3D1ZA 3DCRA 5P8UA 1HTEA 2O4NA 4QLHA 5P76A 1HIIA 5P3KA 5PEPA 5P7RA 2Q11A 3FKTA 4OBDA 4Q1YA 5P3OA 2XFJA 1T6GA 5P7NA 4YE3A 3R0WA 4UPJA 4PEPA 4OBKA 1AJXA 2PH8A 5P3LA 3UDRA 4F74A 1HVRA 3BUFA 3JW2A 5P7ZA 3UFLA 5P3UA 1EC3A 2Q5KA 3OU1A 5P0XA 2AOIA 5P6OA 2HM1A 3OHHA 5JFUA 1D4IA 3ZKNA 4J1IA 2VS2A 5OZLA 3D3TA 4Y4ZA 4YCTA 3PLDA 5P0TA 4GJ6A 2ZGAA 2WJOA 3QIHA 1TCXA 5P6JA 3ZKGA 5P5HA 5P8GA 4Y3DA 5P2XA 2FDPA 3SA8A 1EC0A 5P6MA 1QS8A 5P2GA 3PBZA 5P63A 4A4QA 5OZTA 4CPQA 1HVSA 3OXCA 3NU5A 2FXEA 1G35A 3KA2A 3PHVA 3LHGA 2EWYA 4KB9A 5P2WA 3NUOA 1D4YA 3KDDA 4CPUA 4Y43A 3K4VC 4L7HA 4Q1WA 4RRSA 2QD6A 4LAPA 5P3JA 1B6JA 3RTNA 4Y4GA 3L5EA 2HB3A 3URJA 5P5WA 3TPLA 3ZPUA 5I3YA 3LPKA 3ZMGA 2I4VA 3EM6A 2OHNA 4FLGA 3S45A 2IENA 3SM1A 3HVGA 3U71A 5DPZA 5OZ0A 1HWRA 4ACUA 4JPCA 1FQ7A 3HD8A 1HVJA 4BELA 3TPRA 2OHTA 5SXNA 3LPIA 1IBQA 6FIVA 3OOZA 2ZHRA 5P4OA 5P02A 3OXVA 5P5TA 5P1GA 1FEJC 3OK9A 2Q3KA 4Y57A 3O9LB 3ZKMA 4CPSA 1RQ9A 2ZHTA 2OAHA 1BXQA 1META 5P0RA 1MT7A 3IXKA 5P84A 1ZJ7A 5P62A 2G1YA 3RTMA 3L38A 1IZDA 4FRKA 4OC6B 5P0DA 3SFCA 4ACXA 1UPJA 1RV7A 2ASIA 1BVGA 4JOOA 5P57A 4AZYA 3EKVA 4EXGA 1GVTA 1SDTA 3KT5A 3KFPA 3K5DA 1GNOA 4D83A 3DUYA 3INHA 2O4PA 2QI6A 3Q3TA 3D1XA 4RROA 5P65A 1FMUA 3Q70A 1YM2A 5P7JA 2RKFA 4K4RA 3VFBA 3Q6YA 5P5OA 4TRWA 5P0AA 1HTGA 3EKWA 1TSQA 3GGVA 1W51A 3OTYA 2QMDA 4B00A 5IVSA 3NR6A 4WY1A 1HPOA 4I12A 2QHCA 3PWMA 5P2ZA 3NU9A 1PSOE 5P07A 2O4SA 1K2BA 3O9GA 3OY4A 1EPLE 2NNPA 5P8LA 3EKYA 3QAAA 1AVFA 2PYNA 4RRNA 4L6BA 1D4SA 2Z4OA 1GVVA 2VJ9A 1HIVA 3NSHA 4Q5MA 4MC2A 2VA6A 1ENTE 1QBRA 3DOXA 3FNSA 4B1CA 4Y53A 5P1KA 2BPXA 2HC0A 3K5GA 3ZLQA 5P5BA 4GJBA 4DQBA 1MTRA 5P66A 1G6LA 3OQ7A 1MRWA 3A2OA 2VIYA 5P3VA 4FRJA 4U8WA 5P2YA 3B80A 5P74A 3PCWA 5P3TA 4LHHA 3OXXA 5ENKA 1ZBGA 2R3WA 3LZUA 4YD4A 2BJUA 1LEEA 4A6BA 5JG1A 1GVXA 1HTRB 4YDFA 1RPIA 3I8WA 3WZ6A 1NPWA 2P3BA 4TVGA 4Y41A 1FQ8A 5P15A 1M43A 2HPFA 3EKPA 4Y4BA 3LIQA 4Y6MA 1DP5A 5P0FA 1MT8A 1C70A 3VCMA 3BHEA 1HTFA 4Y4JA 3WB5A 4RCEA 5P4LA 2I4WA 3LIXA 3S53A 2WL0A 5P3XA 4L1AA 2QU2A 5P4EA 5P4JA 4NJVA 4R5NA 4YD6A 5OZ2A 3VV6A 3UQUA 1MIQA 5P13A 5P4UA 3LIVA 3UF3A 4Y3EA 4LXMA 3KFRA 1SH9A 2R8NA 1KJFA 2HS2A 1EC2A 2HAHA 4KE1A 1KJHA 5AH7A 1BWAA 3TNEA 2ER6E 4HDFA 4DFGA 5P0SA 3LZVA 3GI5A 5P5KA 1LF2A 3INFA 4YDGA 5P7BA 4OD9A 4JECA 4RYCA 5P1NA 3OUAA 4ZIPA 3O9AA 3INDA 2ZJMA 2ZJKA 5DQ5A 5P4IA 4QGIA 4EHCA 2BKTA 5ISKA 5P2NA 2BPWA 5KOSA 3O9EA 4I0IA 4Y4UA 5P1DA 1LS5A 5P7CA 4QJAA 4Z4XA 5P0EA 5P05A 2OHLA 5OZHA 4ER4E 5P25A 5P2IA 3KMYA 2CENA 2B60A 2ER7E 2BKSA 1GVWA 5P5MA 5P0HA 4HDPA 1SMRA 3GW5A 3QPJA 5P77A 4NJSA 1LYWA 3OUDB 5DR4A 3LNKA 3NU4A 4Q1NA 5P2DA 3PSGA 4I0JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1MSN A;  2FIV A;  2B8L A;  5P1E A;  2QD8 A;  1HSI A;  3PI5 A;  2BBB A;  3WB4 A;  4NJT A;  5P2O A;  3IGB A;  3H5B A;  5P7W A;  2JE4 A;  1D4H A;  1APW E;  4MC6 A;  5P4N A;  2NXD A;  5P3Q A;  3S7L A;  4S1G A;  1HBV A;  3K5C A;  5P2C A;  5P5I A;  3INE A;  4I10 A;  2IRZ A;  5P7A A;  2NXM A;  4YCK A;  5P6H A;  3IXO A;  2PK5 A;  2G1O A;  4J1E A;  3K1W A;  1FQ6 A;  4KE0 A;  4DPI A;  1FB7 A;  5P88 A;  5P5U A;  5IVQ A;  4R92 A;  4LP9 A;  4HLA A;  5OZY A;  3VF5 A;  4N00 A;  1C6Z A;  5P8J A;  5BWY A;  4Y3Z A;  4PZW A;  1OD1 A;  4DQF A;  1TQF A;  1MES A;  2G1N A;  1FF0 C;  2AZ9 A;  2FMB A;  1ZLF A;  5P7Q A;  4YD7 A;  4U7V A;  4TVH A;  3L59 A;  1M0B A;  2P3A A;  5P6G A;  1C6Y A;  5I70 A;  2G20 A;  4Y5B A;  5P83 A;  1MVP A;  5P6E A;  5P5L A;  4OBH A;  3ZKI A;  5COO A;  2QNN A;  3SLZ A;  2XFI A;  4Y4T A;  4CPW A;  2B7F A;  2AID A;  5P1U A;  5OZ1 A;  5ENM A;  2QP8 A;  2V11 C;  2ZJJ A;  1K6T A;  1A8K A;  1YTJ A;  1FQ5 A;  5FIV A;  1KZK A;  1ZP8 A;  4BFD A;  1BWB A;  5OYY A;  1HVL A;  5P3S A;  3L5F A;  3EL4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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