1G0VA

The structure of proteinase a complexed with a ia3 mutant, mvv
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
GGHDVPLTNYLNAQYYTDITLGTPPQNFKVILDTGSSNLWVPSNECGSLACFLHSKYDHEASSSYKANGTEFAIQYGTGSLEGYISQDTLSIGDLTIPKQDFAEATSEPGLTFAFGKFDGILGLGYDTISVDKVVPPFYNAIQQDLLDEKRFAFYLGDTSKDTENGGEATFGGIDESKFKGDITWLPVRRKAYWEVKFEGIGLGDEYAELESHGAAIDTGTSLITLPSGLAEMINAEIGAKKGSTGQYTLDCNTRDNLPDLIFNFNGYNFTIGPYDYTLEVSGSCISAITPMDFPEPVGPLAIVGDAFLRKYYSIYDLGNNAVGLAKAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords PROTEINASE A
publication title The potency and specificity of the interaction between the IA3 inhibitor and its target aspartic proteinase from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 91
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 3.4.23.25: Saccharopepsin.
pdb deposition date 2000-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1g0vA01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1g0vA02
5P8QA 3SACA 5P4WA 4I0GA 4NJSA 3S53A 3TLHA 5ER2E 5AGZA 4F73A 3LZSA 4KUPA 3OQKA 5P70A 5P0BA 5P4TA 5OZUA 3O9GA 1K6VA 3KDBA 5P3KA 5ISKA 5P0UA 3KMYA 4MC1A 3DV5A 5P4UA 1QBTA 5OZ0A 4H3GA 2OHTA 2FS4A 2BPXA 3EKVA 5P2HA 1PSNA 2H6TA 2SAMA 1VIJA 3DUYA 3CKPA 1MTBA 1N49A 4Y3NA 2NNPA 1Q9PA 5J25A 1HSIA 1MVPA 3PBDA 5P7YA 1KJGA 4YOBA 3SA6A 1NPAA 4H3JA 5OZNA 2FMBA 2G1NA 1LF3A 5ENKA 5P8JA 3NWXA 1HIHA 5DPZA 2AVMA 5AHCA 5DQ2A 4WY1A 3PWRA 4I0JA 5P3GA 5P5KA 5P8DA 4F75A 3S85A 1KZKA 5P2JA 1BBSA 1DMPA 3INEA 1B6LA 4HZTA 5HDZA 5P1IA 5P4IA 4D8CA 3PB5A 4YDFA 5P5CA 4CP7A 2P3DA 4JPCA 1BILA 4MC6A 5HU0A 5P6TA 2ZJHA 2R5QA 5P1KA 1JLDA 4EJKA 4DJYA 4Y51A 3R4BA 4DV9A 3PGIA 2AVSA 3KFNA 4GYEA 5P5XA 3S45A 1A8GA 2AZ9A 1BDLA 5OYZA 2NR6A 4WTUA 5APRE 1LZQA 1MT9A 2ANLA 5P5UA 2BQVA 5P3OA 2F8GA 5IS4A 3I8WA 5P1HA 2QHZA 4Y3TA 3OQ7A 5P3WA 2NPHA 4J0TA 3QBFA 4DJUA 4CPXA 2BPYA 3ST5A 5P1BA 3VUCA 5P4AA 3ZKXA 5KOQA 5P28A 5AH7A 5P8FA 5OZ9A 4FAEA 3DCKA 5P6JA 2FNSA 2FDEA 3QS1A 4Y3PA 4NPUA 4I0EA 3ZKGA 2PYMA 5P10A 4EWOA 1HVRA 4UPJA 2QD8A 5P2KA 4LXAA 3QVCA 2ZE1A 5P13A 5P4GA 3R1GB 5KQYA 5HE7A 2VJ7A 1APUE 5P5SA 5P85A 5OYQA 3T7QA 4HDBA 3OU4B 3ZKNA 2G1OA 3PCWA 4OD9B 2QHYA 4Y4WA 4Y5PA 5DQ5A 5OZCA 4APEA 3PMYA 3DCRA 5P45A 2IDWA 4YDGA 1J71A 2Q63A 1EBKC 4RZ1A 3O99A 1C70A 1GVXA 3MSLA 2ZHTA 5P7SA 5OZ4A 4AZYA 2I4WA 1QBUA 2FIVA 3LIYA 5P1NA 4GJ8A 5KOSA 2NMZA 3I6OA 4L6BA 5P19A 3FNSA 5P0IA 4IVSA 4RGHA 1EC2A 3BHEA 3NDWA 5OYRA 1YTJA 6UPJA 3LIZA 3WB5A 1MEUA 3DJKA 3EM6A 5I70A 4PZWA 4HLAA 3BUGA 4I8ZA 2F3EA 3DOXA 3PBZA 1TCXA 5P4KA 2J9JB 1HXBA 4FM7A 5P32A 5P86A 6FIVA 2QMDA 1ZP8A 3IN4A 3QRSA 3WZ7A 4OD9A 2VIZA 5OZYA 5OZBA 3OQFA 3QPJA 5P5IA 3RSXA 5OZSA 3SA9A 1T6GA 3OQAA 5P0NA 5P2IA 5P3TA 4Y5LA 3UQRA 5OZEA 4Y3EA 5OZQA 3K5FA 1NPVA 4K4RA 1FMUA 4Y5BA 5P53A 1KJ4A 4ZSQA 2BPVA 4R95A 4RCDA 2ER9E 2EWYA 3HD8A 2PWRA 1OD1A 5DR3A 4LAPA 5P8EA 3IN3A 2AIDA 1SMEA 3LZUA 3TNEA 5KQZA 2F3FA 3IXOA 5OZOA 4PHVA 4EQ0A 1MESA 2ZGAA 3BUFA 1BXQA 2HPFA 4Y5GA 3L5EA 4Y56A 4QGIA 1IZDA 5P2ZA 1HPOA 5OZ8A 1UH8A 2J9JA 3BGBA 4HVPA 2V10C 3TOHA 3U71A 3ZKMA 4F76A 4Y3LA 4Y3MA 2A1EA 1K6TA 5P1OA 1ENTE 5P5RA 5P7QA 3D1ZA 4Y45A 4Y3ZA 1LYAB 5B18A 5P1ZA 2O40A 3HDKA 4KE1A 5P1MA 5P44A 2PSVA 5P7LA 5P54A 4GJ7A 5HCTA 2QI3A 2IRZA 5P47A 4FRJA 4E43A 4IVTA 5P8NA 4PEPA 4FLGA 1NH0A 5P5ZA 2CENA 8HVPA 3JVYA 3KFRA 3EKQA 4L1AB 2OHQA 5E5KA 1EPPE 3LZYA 1LV1A 1FIVA 5OZJA 4B78A 1XL5A 2R43A 5P65A 5HCOA 5P4HA 5P2EA 4A4QA 1KJ7A 3LINA 4YA8A 5AHAA 1TW7A 5P6QA 4ZSMA 1T7KA 2IGYA 5P4CA 4OC6B 1T7JA 4ZIPA 3URJA 2CEMA 3LIQA 1BAIA 5P41A 3S2OA 1D4YA 5P8SA 1LYAA 5P0PA 5P20A 2QZKA 2RKFA 4J1KA 4X2LA 3NWQA 3VCMA 2V11C 4BEKA 3UDYA 5JODA 4FRIA 2JYSA 1MPPA 1MT8A 2RSPA 2OAHA 5P7TA 4AMTA 1PPKE 1E5OE 1HRNA 2I4VA 5P76A 3VF7A 1T7IA 5P04A 3DV1A 3UCBA 2XFIA 2PH6A 3SPKA 4DH6A 4DJPA 1M4HA 2QMFA 5P4RA 1FQ7A 2HPEA 2PH8A 5P3RA 1FQ6A 4LL3A 4L1AA 3O9FA 2QP8A 2QU2A 3TTPA 3IGBA 3L5CA 2G27A 1G2KA 1EBWA 3L58A 4KE0A 4DFGA 1HVSA 2WECA 1D4JA 4Y4ZA 2I4UA 3D1YA 4K4QA 3LHGA 4EYRA 5I3WA 4OC6A 5P5PA 3L5FA 1ODXA 1F7AA 3UHLA 5P1JA 3M9FA 4B0QA 5P7EA 5P0EA 2QI0A 3PSUA 4BELA 3QP0A 2QMGA 1HXWA 1EPOE 3S7LA 1EBYA 3VYDA 5P02A 1W6IA 3LPJA 5KR0A 5P48A 4FAFA 5P1RA 5P7AA 5P0XA 1MUIA 5CLMA 5SZ9A 1VIKA 3SA4A 5P42A 2AZ8A 3L38A 2VA5A 4Y4JA 1RQ9A 5P7GA 3OAGB 4PYVA 4GZFA 4L7JA 2QD6A 1KJHA 4K4PA 3MWSA 4EHCA 3OU1B 5P2MA 1YTGA 1AAQA 5OZWA 5P6CA 1GNMA 1ZPAA 3GI0A 5P4MA 1GVVA 5P7UA 4Y3QA 5P2BA 4YCYA 1YT9A 5P2WA 5P23A 3SA5A 5P2VA 1XL2A 3UF3A 4A6CA 1HBVA 5P35A 5P79A 5P8IA 3QBHA 4QJAA 4FRSA 2JE4A 5OZ2A 5P64A 3T11A 3EC0A 1IVPA 4CMSA 2OHSA 3FX5A 3OOZA 3CKTA 5P82A 5DGWA 5P12A 1SIPA 4DQEA 2NNKA 3OQDA 3MSKA 4FE6A 3EL1A 7HVPA 5P0SA 5P80A 3U7SA 4OBKA 2OHRA 3S43B 3EKTA 5P0RA 4GJ9A 3HW1A 1MERA 3OAGA 5P1DA 5EZXA 4CPUA 1EC1A 3O9IA 3KM4A 4QJ7A 4FM8A 5P3EA 2QI5A 4F74A 5P2UA 2PQZA 1AM5A 5P75A 5OZ3A 5P3DA 3TOGA 2AVOA 5P2QA 5OZDA 2WF1A 1CZIE 3SA7A 5ER1E 2ZJJA 3R0YA 5DGUA 5P4NA 4B05A 1ER8E 5P6OA 2ZHSA 3BXSA 3UDJA 5P0GA 4B00A 2WKZA 2IEOA 4YD4A 1IDBA 2O4NA 2WJOA 2XFJA 2WEBA 3OY4A 4J1IA 3ER5E 5OZ7A 4I0IA 5P4XA 3NXEA 4R8YA 5OZLA 5P6RA 3SKFA 3HVGA 5P52A 4DQFA 3IVIA 3PHVA 5P17A 5P0LA 5P6KA 1FQ4A 2J9KA 1IIQA 2VIJA 5OYYA 5P4EA 3FKTA 5P62A 3EL9A 1MRWA 2VKMA 4J17A 3F9QA 4Y6MA 2HIZA 3RTHA 3S43A 1DPJA 1UH7A 3NLSA 5P8CA 1FB7A 1BXOA 3KT2A 3R0WA 1D4HA 5P30A 5P8AA 2I4XA 3NU9A 4JPEA 5P1XA 1WBKA 2Z4OA 2ZHVA 2P3BB 3HZCA 1YTIA 3INDA 5P4ZA 3OXVA 4GJDA 3WB4A 2AOCA 5P8GA 4MC9A 1SDUA 5OZMA 4FM6A 4DPIA 1YX9A 4EJ8A 4CKUA 3BXRA 4JP9A 4K8SA 1GVWA 1Z1RA 1HEFE 3DM6A 2Q15A 5P00A 3S56A 3VF3A 4HDPA 3TPPA 4Y3RA 3OUAA 2IENA 5P34A 5P3BA 4DPFA 5IVTA 5P3HA 2P4JA 3VYEA 5P0YA 5P5OA 3VV8A 4D83A 3CMSA 5P5VA 1BV9A 5SY3A 4FCOA 2P3AA 5P55A 3OUDB 4Z4XA 1FQ8A 1B6MA 2IKOA 2ZJIA 4Y4GA 5P4JA 1FKNA 4EJLA 1Z1HA 2G24A 4ZLSA 1FEJC 3UQPA 5OZKA 1E82E 4FSEA 1B6JA 5P8TA 3QI1A 5P0MA 4GB2A 3CIBA 4Y3DA 5P3IA 4QJ6A 3T6IA 3OK9A 4Z50A 2P3BA 5P8UA 3EL0A 4FS4A 2QAKA 4NJUA 2VIYA 4OBHA 5OZXA 1FMBA 3NDXA 4B1CA 1OHRA 1SDVA 4ACUA 5AH9A 5P66A 5P4SA 2PWCA 3CIDA 4APRE 1MTRA 4B72A 3OXXA 4I10A 4K9HA 2BKSA 3MSJA 2QNQA 5P73A 2HS2A 3WZ8A 1QDMA 3LIVA 3BUHA 5HD0A 3KFSA 3D1XA 5DR7A 5P7ZA 5P6NA 3VYFA 5P4FA 3IXKA 1CPIA 2QK5A 4Y5EA 3OUDA 4ER4E 3O9HA 1BVGA 2CEJA 2B8VA 5HE5A 4EJDA 4CPRA 2R9BA 3PLLA 4Y9WA 2RKGA 5DQ4A 5P3ZA 2QNNA 1DIFA 5KAOA 2VIEA 2BB9A 5IVSA 1RL8A 5HE4A 2BPZA 3PI0A 4GJ6A 1OEXA 5BRYA 3LNKA 3L5BA 1BV7A 3APRE 5I3YA 2WEAA 2FLEA 4J55A 4YD5A 3QN8A 5P1WA 1ZBGA 4M8YA 3ZPUA 5P46A 4N00A 1IZEA 5P7BA 4RVXA 5P50A 5SY2A 5JFUA 3OXWA 1A8KA 5HVPA 3B80A 5COOA 4PZXA 1OEWA 4YBFA 2B7FA 2BBBA 3VLBA 2FDPA 4HDFA 3RU1A 4BFBA 1HIIA 4B1DA 2I1AA 4AUCA 3OU4A 1HVCA 5P56A 4RYCA 3KDDA 4Y5NA 3QRMA 2PK6A 5P5TA 4FSLA 3ZMGA 3CYWA 1HPVA 4Y4XA 1W6HA 5P3CA 4I0HA 3IAWA 1EBZA 3OUBA 1HVKA 5P8PA 4I11A 9HVPA 5P3AA 3H5BA 3GGUA 5EZZA 3SM2A 3FIVA 5P6EA 3VEUA 2XFKA 1WKRA 1T6EX 5CONA 5P6GA 1FFFC 1T3RA 5P29A 5P01A 2AOEA 3NU3A 5P2NA 5T4SA 1SBGA 5P8VA 4HE9A 1MT7A 2Z54A 3OADB 3D3TA 3TKWA 4ZPFA 1SP5A 3RTMA 3UQXA 4Q1WA 5P18A 5DR8A 1PSAA 1M43A 5DQ1A 1IBQA 3R2FA 4YD3A 4EXGA 3SQFA 3GGVA 7UPJA 3NDUA 2ZJMA 5OYWA 4LP9A 3OXCA 3OOTA 5P3SA 5P3JA 2IKUA 2R3TA 3EBZA 4I1CA 1YG9A 4KB9A 4HEGA 4Y39A 5P38A 4YBIA 5P3FA 5COKA 3BVAA 4DJVA 3O9DA 2PK5A 2QMPA 2AOGA 2QZWA 2P8HA 3EMYA 5P1LA 2WEDA 5OYVA 1C6XA 5P15A 1EEDP 3Q70A 2RENA 4Y57A 4L7GA 4NKKA 3GI4A 3S8IA 3GI6A 5P6HA 1HTGA 3LITA 4Y4AA 1HVLA 4QJ8A 2VS2A 1XE6A 1G6LA 3GGXA 1GVTA 3OADA 4X7IA 3FSMA 5OYSA 1GNOA 2NTRA 2QD7A 2AOIA 2R3WA 5P2GA 4M8XA 1PPLE 1SGZA 3FV3A 4J1CA 3EKWA 3KT5A 5P4DA 1FF0C 5P5FA 3N3IA 5OZHA 3OHHA 3NU4A 2I4QA 1MIQA 2OHNA 2V13A 4DJOA 1BDRA 3KFPA 4YCTA 3IXJA 4RVIA 4I0DA 3IA9A 2Q55A 3INHA 4Y4DA 4YD6A 3O9LB 3UDPA 3Q4BA 4FGXA 3EKYA 1HVJA 2VA6A 2XYFA 5P6DA 2ZJNA 4GJ5A 2BPWA 5KQFA 1RPIA 1SIVA 4J54A 4DQCA 3OGPA 5F01A 5P87A 4ZSRA 1ME6A 3TPJA 5E5JA 5P3QA 3HAWA 4RROA 3PRSA 2WEZA 3S7MA 4ACXA 2RMPA 3JVWA 4QJ9A 1G35A 2MIPA 3KN0A 3UTLA 2AVQA 4Y5AA 5OZVA 4AA9A 1ZTZA 2R38A 5I3XA 1EC3A 5P7XA 5P09A 4RYGA 1B11A 5P0WA 1W5WA 2PMAA 4RLDA 5P77A 3SAAA 5P25A 5P6ZA 3O9LA 3IVHA 2WF2A 5HDVA 5P7RA 2NMYA 4QLHA 5P6UA 5P4OA 5P24A 2G1YA 3PCZA 5P1FA 4OBDA 5P40A 1HOSA 1FMXA 2UPJA 5KR1A 3VV6A 3VF5A 2O4KA 5P72A 5P37A 3OTYA 3TOFA 1K1UA 4DQGA 1SMRA 3UFNA 2F81A 4H1EA 4J0YA 3T3CA 5P0AA 4GJBA 3HBOA 5P2DA 3PM4A 2QU3A 3L59A 2BKTA 5P7IA 3N4LA 3KYRA 5P7JA 2WL0A 3ZKQA 3KDCA 4Y35A 4Y54A 2G26A 3NXNA 1W50A 1B6PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P8Q A;  3SAC A;  5P4W A;  4I0G A;  4NJS A;  3S53 A;  3TLH A;  5ER2 E;  5AGZ A;  4F73 A;  3LZS A;  4KUP A;  3OQK A;  5P70 A;  5P0B A;  5P4T A;  5OZU A;  3O9G A;  1K6V A;  3KDB A;  5P3K A;  5ISK A;  5P0U A;  3KMY A;  4MC1 A;  3DV5 A;  5P4U A;  1QBT A;  5OZ0 A;  4H3G A;  2OHT A;  2FS4 A;  2BPX A;  3EKV A;  5P2H A;  1PSN A;  2H6T A;  2SAM A;  1VIJ A;  3DUY A;  3CKP A;  1MTB A;  1N49 A;  4Y3N A;  2NNP A;  1Q9P A;  5J25 A;  1HSI A;  1MVP A;  3PBD A;  5P7Y A;  1KJG A;  4YOB A;  3SA6 A;  1NPA A;  4H3J A;  5OZN A;  2FMB A;  2G1N A;  1LF3 A;  5ENK A;  5P8J A;  3NWX A;  1HIH A;  5DPZ A;  2AVM A;  5AHC A;  5DQ2 A;  4WY1 A;  3PWR A;  4I0J A;  5P3G A;  5P5K A;  5P8D A;  4F75 A;  3S85 A;  1KZK A;  5P2J A;  1BBS A;  1DMP A;  3INE A;  1B6L A;  4HZT A;  5HDZ A;  5P1I A;  5P4I A;  4D8C A;  3PB5 A;  4YDF A;  5P5C A;  4CP7 A;  2P3D A;  4JPC A;  1BIL A;  4MC6 A;  5HU0 A;  5P6T A;  2ZJH A;  2R5Q A;  5P1K A;  1JLD A;  4EJK A;  4DJY A;  4Y51 A;  3R4B A;  4DV9 A;  3PGI A;  2AVS A;  3KFN A;  4GYE A;  5P5X A;  3S45 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2AOD A;  3CKR A;  4JOO A;  2IGX A;  3ZPT A;  4FIV A;  4Y4U A;  5P7M A;  1APT E;  4JEC A;  5P0F A;  2V16 C;  5P5J A;  1Z8C A;  2B42 A;  2WHH A;  1APW E;  3HVP A;  1XDH A;  1HWR A;  3FNU A;  5P8B A;  5C9B A;  4Y3S A;  5BWY A;  1XE5 A;  2ZHR A;  5P7P A;  1KJF A;  1FG8 C;  5DR4 A;  3MXD A;  3ZOV A;  2G1S A;  1D4K A;  3I7E A;  5OZI A;  4B1E A;  4H3I A;  4TVG A;  5P8R A;  4LBT A;  4ZE6 A;  2HAH A;  1F34 A;  5IVQ A;  1K1T A;  3UQU A;  4TRW A;  1LS5 A;  2IL2 A;  3TKG A;  4B70 A;  1QRP E;  1ZPK A;  2B60 A;  2I0D A;  2VA7 A;  4Y3J A;  2AOJ A;  1EPQ E;  5P31 A;  5P88 A;  1QBS A;  4LHH A;  3UPJ A;  5P81 A;  2OHP A;  2OHM A;  5OYT A;  2QHC A;  4DQH A;  5P6W A;  5HTZ A;  3G70 A;  3RSV A;  3L5D A;  5SXN A;  5P16 A;  1AJX A;  3OU3 A;  5P1A A;  5P5A A;  2ZDZ A;  3Q5H A;  2HB4 A;  5P3V A;  1XS7 D;  4DJW A;  3PMU A;  4TRY A;  5OZF A;  5DQC A;  1HPX A;  2VJ9 A;  5P0D A;  5P5N A;  3TL9 A;  3K1W A;  5OZA A;  4I0Z A;  5P5Q A;  2Q54 A;  5AH8 A;  1TQF A;  1EPL E;  2OF0 A;  3O9A A;  5P6I A;  2G22 A;  5JFP A;  4RRS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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