3ER5E

The active site of aspartic proteinases
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title X-ray-crystallographic studies of complexes of pepstatin A and a statine-containing human renin inhibitor with endothiapepsin.
pubmed rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 78
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1991-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3er5E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3er5E01
5P4PA 2AVVA 2AOIA 1D4HA 2QI5A 3TPRA 4Y56A 1ZLFA 4BEKA 2XYFA 4XX3A 3VYEA 4GIDA 4J1KA 2G24A 3JW2A 1LF3A 3L5CA 5P5XA 4FAEA 5OZLA 3SO9A 3K4VC 3T7QA 5P05A 5OYXA 3HVPA 5ENMA 3IXOA 3R2FA 4CPSA 4R5NA 2I4XA 1EPME 4DUSA 2FDPA 1IZDA 3INDA 5P4EA 3S54A 1QRPE 5P5GA 5P2FA 3ZKMA 5P08A 2QMFA 5P4SA 3TL9A 3AIDA 4Z4XA 3I2LA 1TQFA 5SXNA 1D4LA 3PSYA 4N00A 5P8AA 3GI6A 2XYEA 5HU0A 5P45A 3GI0A 3O9BA 5P50A 2P4JA 3APPA 2QZLA 2BBBA 5HCOA 3VUCA 2ZJJA 3QIHA 4YD4A 3UDPA 3MXEA 4EJ8A 2FGVA 5OZKA 1BILA 5P2RA 2A1EA 5P5MA 4DVFA 1HTEA 4H1EA 1FFFC 1XE5A 3OOZA 5C9BA 4ZPFA 5P4WA 3MWSA 4Y3EA 5OZ6A 1A9MA 1MTRA 1QDMA 4GJDA 5OYUA 3HVGA 5P7YA 1A94A 5PEPA 3OQKA 3L38A 5P8CA 5P5UA 1CPIA 5CONA 5OZNA 4H3IA 5P7BA 5P34A 1T6GA 1IZIA 5P0YA 3ER5E 2AVQA 4B1EA 4DPIA 1ER8E 3D1ZA 2PQZA 5OZQA 1E81E 5P6TA 4RYGA 3LNKA 5C9FA 5P70A 2P3BA 3OUCA 1WBKA 3NDXA 5P8PA 3Q5HA 2HB4A 1EC0A 3PMYA 4DJQA 5IVRA 5P79A 5HDZA 1K1UA 2G1SA 5DR3A 2AZBA 2R9BA 2ANLA 2RMPA 3WSJA 5P7PA 4Y9WA 2PC0A 4FE6A 4QJ7A 4F74A 4I11A 5P8LA 3FIVA 3ZKIA 1MRWA 5P8RA 3D1XA 2G1OA 2P83A 5P6XA 5P8JA 4YBFA 5P6CA 5P5CA 3ZPTA 5P75A 3K5DA 2CEMA 1FFIC 4B0QA 1W50A 4EWOA 1EBZA 5P8NA 5P2IA 4ZSRA 5P5HA 3B80A 2VA7A 1HIHA 5P0IA 1WKRA 3S8IA 2R5PA 3L5FA 4Y48A 2ER0E 4J0YA 2QZKA 4HA5A 5HD0A 4YDGA 4Y3WA 4Y3FA 4I12A 4RYCA 5P4UA 4Q1NA 3OU4B 5P49A 1DMPA 3NDUA 4I10A 5P39A 2G22A 3BUHA 4J1EA 4FCOA 1AJVA 3RTMA 4YE3A 3UFNA 1ODYA 2JJIA 1APVE 5P3JA 5I3XA 4XX4A 3UQRA 1HEFE 3FNUA 1YTJA 5AH6A 3LZSA 1B5FA 1XL2A 2OHQA 1TCXA 2FDEA 4L1AB 5P56A 2IL2A 5P10A 3K5CA 4NPUA 5P44A 4MC9A 5P4FA 5P38A 1FQ5A 3OUDA 2HB2A 5KAOA 3BGCA 3C9XA 2ZYEA 3SM2A 5P1XA 1B6KA 2VIZA 5AH9A 4KB9A 4FL8A 1E80E 4JPEA 5OYRA 5AGZA 1AJXA 5HVPA 5P0BA 5P3QA 4GZFA 5ENKA 5P0MA 5P87A 2QMGA 5P7XA 4EPJA 3LHGA 4J1FA 5P22A 5P2BA 5P88A 4GMIA 1UPJA 3EXOA 3K1WA 4J0VA 1HPOA 5P6QA 5P7SA 3UDYA 3KFPA 4Y3AA 4TVHA 1W5VA 5P5NA 2ZHRA 4CPUA 5OZ5A 2PSUA 3UTLA 3BXRA 5COPA 5P8BA 4Y4JA 2G21A 1K1TA 3TKWA 4Y3RA 4PZXA 1SP5A 1SDVA 1YTHA 5IVSA 5BS4A 4TRWA 4GJBA 1EC1A 2PH8A 3S56A 1ENTE 2B42A 5P41A 4YBIA 5OZJA 3SKGA 2H6TA 3NWXA 5I3YA 4B72A 4B05A 1ZJ7A 3KYRA 1NPWA 3F9QA 2F80A 4L7JA 2ASIA 5SY3A 1BV9A 1MTBA 3Q6YA 3HZCA 4LP9A 3A2OA 1PFZA 3IGBA 3ZKQA 6APRE 4B78A 5P83A 1MEUA 3RSXA 5P20A 3UQWA 3ZLQA 2JE4A 1RPIA 1OEWA 4PYVA 3SA5A 1JLDA 5KQYA 1IZEA 1F34A 2WEDA 5P6IA 3T3CA 5P3MA 2FIVA 3H5BA 3IXKA 5P1GA 4H3GA 3EM4A 5DQCA 4Y4GA 1C6XA 3QRSA 1GVVA 2IS0A 5OZMA 5P1NA 1ZAPA 5P24A 1FF0C 3VV7A 3ER3E 2V12C 4J0PA 4DQEA 1AZ5A 5P6SA 1IBQA 3DJKA 3TNEA 4BFDA 3KF0A 1AAQA 2ZHUA 2Q54A 3S85A 3UDNA 5P74A 3B7VA 4Y5EA 3INEA 4Y4UA 5P7EA 5OZVA 5AHAA 1HVHA 5P1BA 5P2NA 3I6OA 4Y3DA 3BVBA 5P6ZA 3WZ6A 4D85A 5P42A 5P7MA 1APTE 3PBZA 3I7EA 1BDQA 4I0ZA 2AOGA 2HIZA 2PSGA 1FQ8A 1EPOE 2NMYA 7UPJA 5P12A 4Y4XA 1FIVA 1RQ9A 3EBZA 2G27A 5DQ2A 4HDBA 3PWMA 5OYWA 3OHFA 1EBWA 5P2DA 1XS7D 5P37A 4Y47A 5P43A 5P6PA 2R8NA 3KA2A 4Y58A 4EP2A 1U8GA 1LYBA 2R3TA 3ECGA 4FRSA 4YCTA 3KFNA 5P0EA 2NXLA 2G69A 1C70A 2FXDA 1ZBGA 5P3TA 3NUJA 1TSQA 4OBGA 2WF0A 1A30A 3K5FA 4Y4TA 2NR6A 2AZCA 4MC2A 4R91A 2R5QA 3LIQA 3UDMA 4B00A 2QP8A 3SLZA 1HVIA 1GVTA 2QHYA 5P6DA 5P2VA 3KMXA 5P6AA 2O4PA 2Z54A 3QBHA 4I0HA 5KR0A 4CPXA 3VYDA 4Q1YA 4RZ1A 2PWCA 1LYWB 3PWRA 2PK6A 3O9EA 1SGUA 3CKRA 1NPAA 5P72A 1AXAA 4E43A 3VF7A 1FQXA 4QJ8A 3FSMA 1EBKC 3S2OA 3BRAA 3K4VA 3UDHA 5OZEA 3LIVA 5OZ3A 1MIQA 3HBOA 4Y5KA 1EEDP 3CYXA 3L59A 3UDJA 1MT7A 3INFA 5OZSA 5P4RA 5P68A 4WTUA 5P78A 1KJ4A 4Y3LA 1SIPA 1QS8A 4Y53A 4HE9A 1YTIA 2HS2A 5P7TA 3PB5A 3ZMGA 2WJOA 5OZTA 3EKYA 3QP0A 2ZJKA 5P2JA 3OU1A 5P8IA 3R0WA 2F81A 5SY2A 4QLHA 5P7JA 4GJ6A 4D83A 5DQ1A 1YT9A 5P4QA 5P0LA 1MPPA 1PSOE 3RTNA 5P4VA 5P4YA 1APWE 5P6EA 1EPRE 2AOHA 1HPVA 5P53A 4CMSA 1IVPA 5P1YA 2WF4A 3WZ8A 4FGXA 3LPKA 4DJUA 1MERA 2OAHA 5P5TA 4OD9A 5P5PA 2NTRA 4DH6A 4YHQA 2RSPA 3QI1A 3VCMA 3EKXA 3VLBA 4A6CA 1LZQA 3OADB 5P0PA 4S1GA 4J5JA 3NDTA 3SPKA 4HEGA 2AQUA 1T6EX 4YOAA 2I4VA 2IDWA 1ODXA 3BUFA 4GB2A 5P2XA 1BBSA 1CMSA 2OHPA 1PPLE 5P35A 2QI1A 2VJ9A 2QI7A 4EP3A 1HTGA 3LZUA 3WB4A 5P4KA 5P6FA 4ZSMA 4RVIA 5P7VA 5ISKA 3O9LB 1FLHA 5DR8A 4OBKA 3EC0A 4OC6B 2PSVA 3IVHA 5P5IA 2QNQA 3EM3A 5P4LA 2FS4A 2NNPA 1HBVA 3T7PA 5SZ9A 2B8LA 5P4JA 3VLAA 4YD6A 5P04A 4IVTA 3DCRA 4KE1A 3PLLA 4CPQA 2ZJNA 5P00A 4DJVA 2QNPA 3ZKXA 3SA7A 4RRSA 4GJCA 3S43A 1DIFA 3ZOVA 2IENA 3DUYA 1GVWA 1W5WA 4J1IA 4ZSQA 2HAHA 3CMSA 8HVPA 2NXDA 4FSEA 1EBYA 1T7IA 2V00A 5P7UA 2IKOA 2FXEA 3T6IA 1Z1HA 1C6YA 1Q9PA 1HIVA 5P8VA 4TRZA 5P0GA 2BKSA 1MT9A 1B11A 4RRNA 5P5BA 1BVEA 3RU1A 1M4HA 3EL4A 5P7NA 3GI4A 2XFKA 3IA9A 2QU2A 5P2TA 5P52A 2VIJA 3NU4A 6UPJA 5P3CA 3PM4A 5P3SA 5P5QA 5P2CA 3PGIA 5P2WA 2R38A 3VFAA 4K9HA 5P67A 5P3HA 1KJGA 5P6MA 2RENA 5DR1A 3U6AA 5OZ0A 3PSUA 4FRKA 5AH7A 5B18A 5P4BA 1UH9A 4RCEA 3TPJA 5P62A 1ODWA 3S45A 3QRVA 1FMUA 1YM4A 2VIEA 4K4QA 5P14A 4RCFA 5OZDA 2BPWA 5P28A 1LYAB 4Y4ZA 5OZAA 1MUIA 4DJXA 4EXHA 1IDBA 5P29A 4FM6A 1BWAA 4Y3QA 4OBFA 1ZP8A 3EKQA 2OHLA 3G6ZA 2B7ZA 4YA8A 3PEPA 5HCTA 4RROA 1VIJA 3SA8A 3LIZA 1RNEA 5P15A 3NDWA 5ER1E 2ER9E 1MVPA 5P58A 4Y5AA 4F73A 5P2SA 5P7CA 2HB3A 3U7SA 3HD8A 4KUPA 3KT5A 2VNNA 5P80A 5P5LA 4J54A 4Y3HA 4NJUA 5P3PA 1YG9A 4I0FA 2ZHTA 5OYZA 5P8OA 4Y3PA 4Y4BA 3O99A 5OYYA 4QJAA 2BQVA 2PK5A 3Q4BA 1D4IA 1RV7A 3IN4A 3LZVA 4FM8A 4ZLSA 1ZSFA 4NKKA 4DJRA 3CKTA 3DV1A 3CIBA 3SA6A 3URLA 3KN0A 2UPJA 2QK5A 5P1MA 1G35A 3FKTA 2PH6A 5HTZA 4EQJA 4L7HA 3EL5A 3OTSA 4Y54A 5P4ZA 3SM1A 2I4WA 3Q3TA 3KDDA 5P3EA 5P6YA 3D20A 3INHA 5DGUA 5DGWA 5P81A 5P13A 3ZPUA 5P2GA 4R93A 5P06A 2WEBA 4DJWA 4GJ9A 4Y3GA 2J9JB 2QD6A 3GGVA 1HXWA 2OHUA 5P4NA 4QGIA 1MSNA 3MSJA 2QCIA 3OAGB 1FMBA 5P86A 5P51A 4K8SA 3O9HA 1TW7A 5P6JA 4DJYA 1HHPA 3HW1A 4AA9A 1DP5A 5OYSA 5P33A 4I0JA 1LV1A 3G70A 4FIVA 1MT8A 4ZEAA 5P7DA 5P2UA 5P6BA 2I4DA 4J17A 3OXVA 4D89A 3NLSA 2G94A 3EKWA 1AVFA 5OYQA 1HSGA 3SQFA 4Y5LA 1NSOA 4MC1A 4PZWA 5P8GA 3CYWA 5P5YA 5P3IA 4Y5GA 1K6VA 5P8HA 2ZJHA 5OZUA 1ZPKA 4L6BA 2QNNA 2G26A 3LPIA 5OYTA 3EL9A 3HAUA 4OBDA 3SA3A 3T11A 4K4PA 5DQ4A 5DR4A 5P0NA 5P1UA 4CPTA 1LF2A 4Y3TA 3LPJA 4Y44A 3QVCA 4J0ZA 5P54A 2AOCA 2I4QA 4YCYA 5P2EA 7HVPA 3NU3A 5P0RA 1EPPE 2V11C 4X2LA 2ZJMA 5P4IA 5P4OA 5IE1A 5P7LA 5P61A 2MIPA 1QBRA 5AH8A 5P8TA 4Q1WA 4Y36A 4NJTA 4GJ8A 2O4LA 5EZZA 5P1WA 2AZ8A 4DQHA 2B8VA 4U7VA 4I8WA 4CP7A 1ZPAA 3KDCA 4EXGA 1YM2A 1KJ7A 1SDTA 4YDFA 4KE0A 1FKNA 2SAMA 5P1RA 1XDHA 5P27A 4QJ9A 2UXZA 3PVKA 1XN2A 2I0DA 5AHCA 5P4GA 5FIVA 3VEUA 2WF2A 3UPJA 5P2AA 4OBJA 5OZZA 1M43A 3EKPA 4HVPA 4LC7A 1FQ6A 3I8WA 5P6RA 5P7QA 1HSHA 3LIYA 1LS5A 2QI3A 4LXMA 4L7GA 4LL3A 1OD1A 5IVTA 1T7KA 2B7FA 3KM4A 5P8FA 3LITA 4LXKA 4FS4A 5P3GA 2O4NA 3UDKA 5KQZA 5P3YA 3O9IA 5KOSA 5HDVA 5P3ZA 2ZGAA 2AVSA 4DQBA 1BV7A 4ACXA 5KOQA 4Y41A 2FDDA 3EMYA 3PWWA 4K4RA 2IQGA 1A8GA 3PRSA 5P6KA 2VA5A 5HE4A 1SIVA 2VA6A 5P71A 5P0KA 1HWRA 2WL0A 3FNSA 2VS2A 5P2HA 5P0QA 4OBHA 2P3BB 1OHRA 3OQDA 3VV8A 3KFRA 5AHBA 4Y3MA 5P8SA 4JECA 3N3IA 3LINA 4RGHA 4YD3A 4ER1E 2OHKA 3OY4A 5KQXA 4RVXA 2BB9A 4EYRA 4PEPA 3QBFA 4Y3YA 2QMDA 1HRNA 5P07A 2ZDZA 5P30A 5P65A 5OZPA 4ZPEA 1QBUA 4H3FA 1HXBA 1PSAA 4Y5NA 2Q15A 5P6WA 5P7FA 2QI4A 4UPJA 1LEEA 5P3XA 5P4XA 1UH8A 3PHVA 4Z2ZA 3QPJA 4GJ5A 4NJVA 4B1CA 1HVSA 4Y3JA 1META 4ZPGA 4D88A 1FEJC 3D91A 3APRE 4CKUA 4GJAA 1KZKA 1FQ7A 3QN8A 1BAIA 3CICA 2AZ9A 3UFLA 2V16C 1Z1RA 2Q11A 5OZ7A 2BPXA 4ACUA 5HE7A 4Y3SA 4FLGA 4JOOA 2NPHA 4DFGA 4NJSA 2AODA 5P5WA 3NWQA 4CPWA 5J25A 2FLEA 2P3DA 1B5FB 5P4TA 4ZE6A 1HVCA 3LIXA 2H6SA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P4P A;  2AVV A;  2AOI A;  1D4H A;  2QI5 A;  3TPR A;  4Y56 A;  1ZLF A;  4BEK A;  2XYF A;  4XX3 A;  3VYE A;  4GID A;  4J1K A;  2G24 A;  3JW2 A;  1LF3 A;  3L5C A;  5P5X A;  4FAE A;  5OZL A;  3SO9 A;  3K4V C;  3T7Q A;  5P05 A;  5OYX A;  3HVP A;  5ENM A;  3IXO A;  3R2F A;  4CPS A;  4R5N A;  2I4X A;  1EPM E;  4DUS A;  2FDP A;  1IZD A;  3IND A;  5P4E A;  3S54 A;  1QRP E;  5P5G A;  5P2F A;  3ZKM A;  5P08 A;  2QMF A;  5P4S A;  3TL9 A;  3AID A;  4Z4X A;  3I2L A;  1TQF A;  5SXN A;  1D4L A;  3PSY A;  4N00 A;  5P8A A;  3GI6 A;  2XYE A;  5HU0 A;  5P45 A;  3GI0 A;  3O9B A;  5P50 A;  2P4J A;  3APP A;  2QZL A;  2BBB A;  5HCO A;  3VUC A;  2ZJJ A;  3QIH A;  4YD4 A;  3UDP A;  3MXE A;  4EJ8 A;  2FGV A;  5OZK A;  1BIL A;  5P2R A;  2A1E A;  5P5M A;  4DVF A;  1HTE A;  4H1E A;  1FFF C;  1XE5 A;  3OOZ A;  5C9B A;  4ZPF A;  5P4W A;  3MWS A;  4Y3E A;  5OZ6 A;  1A9M A;  1MTR A;  1QDM A;  4GJD A;  5OYU A;  3HVG A;  5P7Y A;  1A94 A;  5PEP A;  3OQK A;  3L38 A;  5P8C A;  5P5U A;  1CPI A;  5CON A;  5OZN A;  4H3I A;  5P7B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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