4S1GA

Renin in complex with (s)-1-(3-fluoro-5-(((s)-1-phenylethyl)carbamoyl)benzyl)-4-isopropyl-4-methyl-6-oxotetrahydropyrimidin-2(1h)-iminium
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Iminopyrimidinones: A novel pharmacophore for the development of orally active renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2015-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4s1gA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4s1gA01
2AVOA 5KR8A 5P07A 3NR6A 3HAUA 3D91A 5P33A 2PMAA 4B00A 1SGUA 3DM6A 2RMPA 4QLHA 3ZKIA 3NDUA 4ACUA 2OHNA 5P40A 2VJ9A 4ZPFA 3EL9A 5P6UA 1EC3A 3OQKA 4R92A 5P5AA 3OGPA 3DK1A 4Y4AA 4Y5LA 2PSGA 5P7PA 3B80A 3HW1A 4ZPEA 3MXEA 2AZCA 2O4NA 4Y51A 1SGZA 5DQ2A 4EP3A 1Z8CA 5P5FA 2QI6A 4BFBA 2VA7A 2WF4A 4HDFA 5P7QA 1MEUA 3T6IA 4RLDA 2WHHA 3INFA 3TPPA 5P1CA 3DJKA 1AXAA 5P8QA 2NMZA 4NJSA 5P3NA 2IGXA 1HPVA 3UHLA 3NDWA 3PWMA 3G72A 3OADA 2ER0E 5P44A 5AHCA 2VA5A 1QBUA 5OZIA 2NPHA 5P27A 4AA8A 5P8FA 4LHHA 3Q6YA 5P6TA 4GJDA 3IXOA 1APUE 2FDEA 4TRZA 4GMIA 5P06A 4DQGA 4NJTA 3DCRA 4EPJA 5P4CA 3NU6A 2QI4A 4DJVA 5P8KA 5P26A 1QS8A 1EPQE 4K4RA 5HDUA 4LXAA 3TLHA 1ZP8A 1MT8A 1K6VA 5AH8A 4GJ5A 1B6LA 1NPAA 5P7MA 3UDKA 1BAIA 5KAOA 3S54A 5OZDA 4CPQA 5OYUA 4J1HA 1BVGA 3OU4B 4APRE 3SQFA 2AZ8A 5P7IA 5HU1A 4CMSA 3S8IA 4OBZB 3UDJA 1HXBA 5P13A 2G26A 1MTBA 2NR6A 5P8LA 1TCXA 5P3UA 4RCDA 3OWNA 1XE5A 4EQ0A 1RV7A 3KT2A 1Z1RA 4I12A 2Q63A 5P15A 3BUFA 3PWRA 5P55A 1HIHA 2AVVA 2G22A 4GJAA 4YCYA 5P84A 1HXWA 3CKTA 1SDVA 3OXVA 5OYYA 5SY2A 4I10A 2P8HA 2CENA 3NXNA 1B6MA 5KR1A 2I4VA 2UPJA 2F8GA 3CKPA 5P1FA 3R4BA 4YCTA 4Y35A 4E43A 4U7QA 4ZEAA 1LYWA 4LAPA 4GZFA 3PJ6A 5P6YA 3KMXA 3O9DA 5P8RA 2NNKA 1D4YA 1XL2A 2BPYA 1BDQA 4J17A 5P65A 7UPJA 4LC7A 1DAZC 3EKQA 2JE4A 5P67A 2H6TA 1SMRA 1EPPE 4HLAA 5P2XA 3L59A 5P7RA 3PCWA 4DVFA 5F00A 1RQ9A 5P7NA 3VSXA 2P3AA 2QAKA 3LITA 3O9HA 3HVGA 1K1TA 3O9AA 4EJ8A 4FGXA 2VIZA 5P85A 3HZCA 1GNOA 5P8DA 4ER2E 4RCFA 2RKGA 1KJFA 5OZ8A 3EL0A 4HE9A 4PZWA 3NWXA 2UY0A 5P6PA 2I0DA 2OHMA 2ZJHA 4I0DA 1PROA 5P6GA 1F7AA 5KOQA 2WECA 4X7IA 4DFGA 4PHVA 4ZSRA 2G94A 4EWOA 4A6CA 4GJ8A 3TPJA 3ZKNA 3PHVA 4I1CA 3EL1A 2ZJNA 3PVKA 3L38A 4B1CA 1OD1A 1BILA 1EBZA 5P70A 5BS4A 3RU1A 4AUCA 5OZ9A 5P0EA 3APPA 1T7KA 2VJ7A 4S1GA 5P1NA 5P82A 3RVIA 5P8HA 1OEXA 3QROA 5EZZA 3S7LA 3G70A 5P2JA 1HVJA 1DP5A 5JFPA 5P4PA 2F3EA 2Q11A 1UH8A 5P00A 2QZXA 3URLA 5P5HA 5ISJA 3OGQA 3UFLA 2Z54A 5AH7A 5OZRA 4YDFA 4I0IA 2V00A 2OF0A 1LF4A 2QZWA 1LZQA 3LPIA 3SPKA 4B77A 5P1EA 3GI4A 5P4SA 3O99A 1D4JA 4Y41A 4NKKA 5P2OA 4YBFA 5P20A 5P17A 4YE3A 1META 2Q15A 3KFPA 1GVVA 4Y3SA 4Y54A 4D88A 5P23A 2QCIA 5E5KA 5P34A 3QAAA 3VFBA 5P57A 4R91A 5P3EA 4UPJA 2HS1A 5P78A 5P1SA 3GGUA 1BBSA 4PEPA 3SA7A 5P1JA 4LP9A 1PPKE 4Y36A 4LXMA 5P54A 3TOHA 4RYCA 5P1RA 5P19A 5P3PA 3OXCA 2QK5A 3UDPA 4Y3HA 3HVPA 3VCMA 4FAFA 4GJ9A 5P79A 4Y39A 1LS5A 4FE6A 5P6XA 5P60A 5P4RA 3Q5HA 3BXRA 3S43B 1PSNA 4J5JA 5P5CA 1XL5A 3AUPA 3SA4A 5P3LA 5P8TA 2OHLA 1Z1HA 1APTE 4QGIA 4Y3DA 3QRMA 5DR7A 5OZKA 3OQDA 3R0YA 1IBQA 4RGHA 5P29A 2F80A 4DQHA 1ZLFA 5HDXA 2J9KA 1TQFA 3KMYA 4Y4UA 3D1YA 1EC0A 5P68A 3I6OA 4TRWA 1HSHA 1PSAA 5DGWA 1FQ5A 1ODWA 2B60A 5P3BA 5P5MA 5P6MA 3UTLA 2G21A 2QI3A 5OZSA 3EKXA 4HVPA 5P0GA 3EC0A 5P2MA 1HTEA 4I11A 5P39A 5P4YA 1YT9A 4I0EA 5P4TA 5P24A 3U71A 3HBOA 1W5VA 2BBBA 1JLDA 1K6CA 1FQ8A 3OY4A 3EMYA 1K6TA 1BV9A 1HRNA 2QNQA 4H3JA 3ER3E 5ENMA 5CONA 5J25A 4DJOA 1HPXA 1GVWA 1N49A 1HIVA 1HTRB 2Q3KA 5P0XA 3QI1A 2R5QA 3O9BA 4ER1E 2G1SA 3O9FA 4GYEA 2F81A 4Y3JA 4FRIA 1PPME 1PPLE 5P0BA 1C6ZA 4Y4DA 4CPSA 4ZLSA 4YD5A 4Y3QA 2NTRA 2V0ZC 2V10C 3UDNA 3N3IA 5P0QA 5P7FA 5P3AA 1AJVA 2XYFA 5OYSA 5OZ1A 1EC2A 3PLLA 2ANLA 3KDCA 5COPA 4D8CA 2QMFA 4JECA 1G35A 5P2VA 1EBWA 4HZTA 5P6NA 1FG8C 3Q70A 4DJQA 4Q1WA 4RROA 1EBKC 3LZSA 4EXHA 5P74A 5P2NA 3SM1A 2QNNA 3PEPA 5P8CA 4FL8A 3PGIA 5P1MA 1MVPA 4A6BA 3CYWA 2IDWA 5P66A 1G0VA 2MIPA 5P81A 5P5KA 1M43A 3OXXA 3S7MA 3OOZA 3IXJA 5AH9A 5KQFA 5OZ4A 4XXSA 3PCZA 3K1WA 4FS4A 3CICA 4TVHA 4Y5KA 2ER7E 4FSEA 5P3FA 2I4WA 4DJUA 2XYEA 3OU1A 5P5EA 5P1IA 4MC9A 2XFKA 1Q9PA 4D83A 4DQEA 3OAGA 5P7HA 2PWCA 2FDDA 5P48A 1XDHA 5OZZA 2ZE1A 2QMDA 4JOOA 1QBSA 4Y4TA 1C6YA 1GNMA 1OEWA 3QVIA 1KZKA 5BRYA 3OADB 2QMGA 1G6LA 1FQ4A 4NJVA 2ZJKA 3UPJA 4XX3A 2QI1A 5P6ZA 3NU5A 1C70A 4OBDA 4CKUA 3GGAA 1LYBA 5P4HA 5P5OA 3VEUA 4Y3NA 5P02A 3TH9A 2P83A 5P1QA 5P8IA 3G6ZA 5OZVA 5P7SA 3SLZA 3KT5A 4DV9A 3D20A 3K5CA 1RL8A 6UPJA 2VKMA 4F76A 5CLMA 1HBVA 1BXOA 4APEA 3QIHA 5P0WA 1T6EX 4D85A 3KFRA 1YG9A 4MC2A 5P18A 4ER4E 3L5BA 5P7YA 5OZMA 3SA3A 4I8WA 3OUCA 4Y5PA 5SZ9A 5OZAA 1KJ4A 4Y3GA 5P5IA 3I8WA 4DJXA 2JXRA 2R38A 3EXOA 2FNSA 3RTMA 2G1RA 3MXDA 1QBTA 1XE6A 3Q3TA 5P76A 4Y48A 3EM3A 5P87A 3OHHA 5JODA 3VFAA 3EL4A 1FMUA 1HPSA 5P3YA 2J9JA 3DCKA 5ER1E 2B8VA 5P4WA 5P7JA 4Y5EA 2BB9A 1EAGA 3ZL7A 1YTJA 5SY3A 4A4QA 3TL9A 4YDGA 3MSLA 5P4MA 5P2HA 4CPUA 5P4LA 5I3YA 2ZJIA 5P63A 3K5FA 2Q64A 3VYDA 3WB5A 5P8GA 5BWYA 4J0ZA 3TPLA 2WEBA 2NXLA 4ZE6A 5P8OA 2NXMA 9HVPA 3T3CA 1B5FA 1GKTA 3BXSA 1IZHA 3LZVA 5P1TA 2IGYA 1LF2A 3WSJA 5SXNA 1MUIA 4QJ2A 1UH9A 2I0AA 1BWAA 3JVWA 3IXKA 3TKGA 2R5PA 3SKGA 1D4HA 1FG6C 4B1DA 1IVPA 3O9LB 2IEOA 4KUPA 2BKSA 2WJOA 3TOFA 1BDLA 2WKZA 2ZYEA 3GGVA 5P7BA 4Q1NA 2O4SA 2B7ZA 4Y3PA 4ZSPA 5P53A 5P4GA 4DUSA 3VYFA 2QU2A 4BFDA 2G20A 1ZPKA 3TNEA 2QI7A 3M9FA 2CEJA 6APRE 3VG1A 1FQ7A 3L5EA 5P7CA 4Y4XA 3S85A 5P0JA 3GI0A 2XFJA 2HB3A 1VIJA 4XX4A 4Q5MA 4Y3RA 1APVE 1D4LA 1KJ7A 3GI6A 3KM4A 5P0VA 4L7GA 2ZDZA 5P3OA 2IL2A 4GJCA 1FMXA 4N00A 5P36A 5P64A 5I3VA 1F34A 2VNMA 4Y44A 3UF3A 5P4EA 5P31A 5P7OA 2WF1A 4Y47A 5DGUA 3IN3A 5P4OA 1LYAB 2Q55A 3PI5A 2QI5A 5OZEA 3ZKQA 2VIEA 4H3GA 3TTPA 5ISKA 5HVPA 1K2BA 2AVQA 2O4LA 4LBTA 3ER5E 3UQWA 3VYEA 2AOCA 4L6BA 5P32A 5P6VA 3UCBA 5P2CA 2OHUA 5P6BA 3EM6A 5P0MA 5KQYA 4R8YA 2A1EA 4NPTA 3FNSA 5P0DA 3OU4A 1AVFA 1PFZA 3NYGA 2Q5KA 4FRSA 3F9QA 2VNNA 3PMYA 5COKA 5P30A 4Z22A 4EHCA 5P5WA 1GVUA 5IVQA 3RSXA 3QS1A 4Y5CA 5T4SA 5P7WA 3LNKA 1C6XA 4J1IA 1CPIA 2VIYA 3PM4A 3S56A 5E5JA 5P3WA 4L1AA 3JVYA 5P72A 1FF0C 1FGCC 5OZQA 5DQ4A 2FMBA 2IKUA 3BVAA 5P10A 2I1AA 5P6QA 2WL0A 5P0ZA 2ZHRA 2ER9E 5DQ1A 3IVIA 2AVMA 5P1WA 5P46A 5B18A 5P1GA 3EL5A 2FXDA 2R8NA 4YA8A 3VV7A 4Y43A 1MT9A 4CPRA 4CPTA 4NJUA 1D4KA 5OYQA 2AZBA 5P3XA 4RYGA 4Y38A 2QHCA 4DJYA 1W5YA 3CKRA 2AOFA 4CP7A 5P4VA 3IAWA 4RRSA 5HDVA 5P7EA 3EKVA 2G1YA 4B70A 5OZ0A 3BUGA 3OOTA 4I0HA 3B7VA 1NPWA 3BGCA 3KDDA 3IA9A 5P2QA 5P2EA 4J1CA 2QI0A 1QDMA 5DPZA 2FXEA 5P42A 1HSIA 4OD9A 4WTUA 5P56A 5OZTA 2HB4A 5P0IA 5P52A 3NXEA 4JP9A 1AJXA 2Z4OA 5IVSA 1FQXA 4R93A 1IIQA 1NPVA 4QJ6A 3AIDA 1NSOA 1WBMA 3NSHA 1IZEA 1MRXA 4Q1YA 4IVTA 3SACA 4Y6MA 5P43A 2PH6A 3PMUA 2V12C 4DJRA 2G24A 5P8VA 3PRSA 2BPXA 4Y3ZA 1YM4A 3L58A 3RTHA 3T7PA 5P5VA 2VIJA 2PK5A 3KA2A 4F74A 5P4QA 2G1NA 5P28A 1MSMA 2WEDA 5P16A 3ZMGA 1BIMA 5HDZA 1W5XA 2ASIA 3UDYA 3VF7A 5P35A 4DPFA 3KYRA 2FIVA 2QNPA 4ZPGA 4K8SA 5P08A 3QBFA 1UH7A 2QZLA 1TSUA 4AZYA 2V13A 5AGZA 3CMSA 1A30A 2XFIA 2HM1A 5P11A 4RCEA 5DR8A 5P2SA 4FM8A 3OQFA 5OZOA 3APRE 4Y4JA 4FM6A 3FV3A 5P69A 1FEJC 5P4UA 5P01A 4YOAA 1HVCA 2A4FA 3QVCA 1A8KA 5OZNA 4J0YA 5OYXA 2OHKA 2R3TA 4Y3WA 5P7GA 5P05A 5P2TA 5P3CA 3SFCA 2WEAA 4Y4GA 1B11A 4K4PA 1E81E 3K5DA 1SDTA 4LL3A 6FIVA 2B8LA 4J1FA 4QJ8A 5JG1A 7HVPA 3NDXA 5P2YA 1AIDA 2JJJA 5P3KA 4JPCA 3EKPA 5P4KA 3OU1B 1RNEA 5OZUA 5P4XA 4L7JA 5P09A 1FQ6A 5P3ZA 3QP0A 5P4AA 3GGXA 5P61A 3PSUA 5P7TA 3PWWA 5P58A 4HDBA 4JPEA 5P80A 5P49A 4Y4BA 1HVHA 1HEGE 1SP5A 4H3FA 3UQUA 2IRZA 3I2LA 3LPJA 1T7IA 5P37A 1A9MA 4EJLA 5P5UA 1LYBB 1ZSFA 2HIZA 3HLOA 3TOGA 4ZSQA 2IS0A 5P1BA 4Y50A 5OZ6A 5P8JA 2JYSA 2B42A 5P8PA 4B78A 5P3GA 5OYVA 1HOSA 5P5YA 5P5TA 5P22A 1J71A 3SA6A 2H6SA 3VF5A 2P3BA 5P12A 4KE1A 3O9CA 2BJUA 1BXQA 3T7XA 1ME6A 5P4FA 1B6PA 4Y5BA 5P4DA 1W50A 4RVXA 4F73A 3EKYA 4CPWA 5P8SA 5P2ZA 2FLEA 1ZTZA 3HAWA 3FX5A 3O9GA 1KJHA 3ZPSA 1XN2A 1HPOA 2B7FA 1RPIA 3SO9A 3L3AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2AVO A;  5KR8 A;  5P07 A;  3NR6 A;  3HAU A;  3D91 A;  5P33 A;  2PMA A;  4B00 A;  1SGU A;  3DM6 A;  2RMP A;  4QLH A;  3ZKI A;  3NDU A;  4ACU A;  2OHN A;  5P40 A;  2VJ9 A;  4ZPF A;  3EL9 A;  5P6U A;  1EC3 A;  3OQK A;  4R92 A;  5P5A A;  3OGP A;  3DK1 A;  4Y4A A;  4Y5L A;  2PSG A;  5P7P A;  3B80 A;  3HW1 A;  4ZPE A;  3MXE A;  2AZC A;  2O4N A;  4Y51 A;  1SGZ A;  5DQ2 A;  4EP3 A;  1Z8C A;  5P5F A;  2QI6 A;  4BFB A;  2VA7 A;  2WF4 A;  4HDF A;  5P7Q A;  1MEU A;  3T6I A;  4RLD A;  2WHH A;  3INF A;  3TPP A;  5P1C A;  3DJK A;  1AXA A;  5P8Q A;  2NMZ A;  4NJS A;  5P3N A;  2IGX A;  1HPV A;  3UHL A;  3NDW A;  3PWM A;  3G72 A;  3OAD A;  2ER0 E;  5P44 A;  5AHC A;  2VA5 A;  1QBU A;  5OZI A;  2NPH A;  5P27 A;  4AA8 A;  5P8F A;  4LHH A;  3Q6Y A;  5P6T A;  4GJD A;  3IXO A;  1APU E;  2FDE A;  4TRZ A;  4GMI A;  5P06 A;  4DQG A;  4NJT A;  3DCR A;  4EPJ A;  5P4C A;  3NU6 A;  2QI4 A;  4DJV A;  5P8K A;  5P26 A;  1QS8 A;  1EPQ E;  4K4R A;  5HDU A;  4LXA A;  3TLH A;  1ZP8 A;  1MT8 A;  1K6V A;  5AH8 A;  4GJ5 A;  1B6L A;  1NPA A;  5P7M A;  3UDK A;  1BAI A;  5KAO A;  3S54 A;  5OZD A;  4CPQ A;  5OYU A;  4J1H A;  1BVG A;  3OU4 B;  4APR E;  3SQF A;  2AZ8 A;  5P7I A;  5HU1 A;  4CMS A;  3S8I A;  4OBZ B;  3UDJ A;  1HXB A;  5P13 A;  2G26 A;  1MTB A;  2NR6 A;  5P8L A;  1TCX A;  5P3U A;  4RCD A;  3OWN A;  1XE5 A;  4EQ0 A;  1RV7 A;  3KT2 A;  1Z1R A;  4I12 A;  2Q63 A;  5P15 A;  3BUF A;  3PWR A;  5P55 A;  1HIH A;  2AVV A;  2G22 A;  4GJA A;  4YCY A;  5P84 A;  1HXW A;  3CKT A;  1SDV A;  3OXV A;  5OYY A;  5SY2 A;  4I10 A;  2P8H A;  2CEN A;  3NXN A;  1B6M A;  5KR1 A;  2I4V A;  2UPJ A;  2F8G A;  3CKP A;  5P1F A;  3R4B A;  4YCT A;  4Y35 A;  4E43 A;  4U7Q A;  4ZEA A;  1LYW A;  4LAP A;  4GZF A;  3PJ6 A;  5P6Y A;  3KMX A;  3O9D A;  5P8R A;  2NNK A;  1D4Y A;  1XL2 A;  2BPY A;  1BDQ A;  4J17 A;  5P65 A;  7UPJ A;  4LC7 A;  1DAZ C;  3EKQ A;  2JE4 A;  5P67 A;  2H6T A;  1SMR A;  1EPP E;  4HLA A;  5P2X A;  3L59 A;  5P7R A;  3PCW A;  4DVF A;  5F00 A;  1RQ9 A;  5P7N A;  3VSX A;  2P3A A;  2QAK A;  3LIT A;  3O9H A;  3HVG A;  1K1T A;  3O9A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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