1ER8E

The active site of aspartic proteinases
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endothiapepsin
publication title The Active Site of Aspartic Proteinases
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 79
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1989-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1er8E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1er8E01
5P7YA 3PHVA 3OY4A 4OD9B 1LZQA 3O9IA 4ER2E 3ZKMA 4DJPA 5P4MA 5P31A 2IGXA 1ZAPA 3UDMA 1CPIA 3NR6A 3VYFA 5P8VA 2WEZA 3T6IA 5P38A 2PC0A 2WF0A 4D88A 5P5KA 4Y58A 4Y48A 1E80E 4GZFA 3UQWA 2Q3KA 5P2HA 3G72A 4Z2ZA 2A1EA 4DJUA 1LYAA 3UDJA 3NDTA 3O9EA 3NLSA 3K1WA 5HTZA 1YT9A 1FFIC 2WKZA 3OQAA 4D83A 2WEAA 2JXRA 2QHCA 3OU1A 5P8IA 2PSVA 3I6OA 5P5TA 4LHHA 5P2IA 1XE5A 1ME6A 4ACUA 5KR2A 5P8DA 1HVSA 1YTIA 5P4ZA 5P1PA 2I4DA 4R93A 2XFJA 4GJ6A 3IGBA 1SGUA 3OTSA 4Q1YA 5P2UA 2G1NA 2FMBA 5P0CA 2VA5A 1HPVA 1APTE 3LIVA 4QJ6A 2R3TA 1YG9A 3OK9A 1YTGA 3IN3A 5AH6A 4HLAA 3CKTA 4RRSA 5COOA 1AAQA 4DFGA 3DK1A 1EC0A 1SMEA 5OZOA 5P0HA 3VLAA 5P1HA 2AZ9A 1A8KA 2VNNA 3KDBA 4Y5CA 5P5QA 2Z54A 5P7GA 4EYRA 2G1SA 2JJIA 5AH8A 2QHYA 3UFLA 2HS1A 1FG6C 1Z1HA 3L59A 2VNMA 4Y36A 5AH9A 4CPRA 4FRIA 2QI0A 5P5EA 1EPNE 5IS4A 1E81E 1GVVA 5OZSA 5P5VA 3KFPA 3OXVA 2OHNA 3PRSA 3BVBA 2O4KA 3PI5A 1ZLFA 3NU9A 3OQFA 5P7UA 2ZJHA 5P81A 4HDBA 5P0LA 5OZUA 5P1RA 5P1VA 5P6VA 5P7TA 5OZQA 3SPKA 4YCYA 2QCIA 3SM2A 1BDQA 5P3LA 3CMSA 2ZJNA 2OHRA 3KA2A 4FL8A 5P4XA 2RMPA 1TCWA 4WY6A 4Z22A 3ZMGA 5DPZA 5P4YA 4Y4JA 5P37A 3T7PA 1MTRA 1B6PA 3CKPA 3VYDA 5P7SA 5P7FA 4NJUA 2VA7A 5P61A 3KMYA 4J1FA 5OYVA 3QP0A 5P25A 3UDKA 5P8KA 5P7IA 3SKFA 1ER8E 3GI6A 4EJDA 4TRZA 2AOFA 5P7RA 5I3XA 3PEPA 2B7ZA 3GGAA 1HPOA 4B1EA 3LIQA 4H3FA 1FQXA 2QI7A 1W6IA 3SA6A 5P55A 2V12C 2AOIA 1XN2A 1K1TA 1B6KA 1MTBA 1RL8A 5OZ7A 4ZPGA 2A4FA 5HDZA 1K6CA 2QK5A 2NXDA 1OEXA 4GJAA 1FQ4A 3HW1A 3ZKXA 3HLOA 3SA8A 5P3KA 5OZJA 5P6BA 5IVRA 2VJ9A 2OHSA 1FEJC 2P3BA 2IEOA 1SIPA 4F74A 4NPTA 3T11A 1HIVA 5OZCA 5BWYA 4A6BA 1C70A 1PPKE 1DIFA 1B6JA 1HPXA 2BJUA 2V0ZC 2ZHTA 1DP5A 1MT7A 1META 3URIA 4Y4AA 5P5PA 5OZ3A 2Q64A 5P68A 1HWRA 4I11A 5I3YA 3HAWA 4ZPFA 5P8AA 1TSUA 5P00A 5P54A 4GMIA 1T6GA 2PMAA 5P8PA 2P3CA 3O9LA 5P4DA 2VIZA 4R5NA 4GJ5A 3I25A 3ZPTA 4APRE 5P8EA 3NU4A 2NTRA 2O4SA 3UF3A 2JYSA 5P1QA 3OUDB 3LZSA 3I7EA 1T7IA 4OBDA 5P4QA 4ZSQA 1TZSA 5P32A 2V10C 5P6ZA 3WZ6A 3ER3E 2Z4OA 4B05A 3KDDA 4I0HA 4FAFA 2RKGA 3OWNA 1ZP8A 5OZAA 2QD6A 4OBGA 1FG8C 5P20A 2QZXA 5P11A 2NNKA 4RGHA 4L7JA 3INFA 5IE1A 1LYWA 3GI0A 2Q5KA 1HTGA 2R9BA 5P3FA 4J1EA 3UPJA 5FIVA 3OAGB 5P0QA 4YDGA 1M43A 1XL5A 4Y3EA 5P26A 2G69A 2PH8A 1MSNA 4OBHA 5HDUA 5P5BA 2FXEA 1FMBA 2NPHA 1RV7A 5P6YA 4J54A 4D8CA 1MRWA 4Y3XA 2XYFA 1HVJA 2FNSA 2VIJA 1LYAB 5P6TA 1RQ9A 4RCFA 3LPKA 3K4VC 1HVRA 4B1CA 5P1GA 3TTPA 5P39A 5OZZA 3EL9A 4DPFA 5P13A 5AHBA 2FDDA 4AA8A 3DOXA 3OU1B 4DJVA 3MXDA 5JG1A 2OHKA 5P70A 2XFIA 1CMSA 2FDPA 1LV1A 1IDBA 3OOZA 5KQYA 5P16A 3S54A 4Y5MA 3T7QA 3CIDA 2WJOA 6UPJA 4GYEA 4Q1NA 3ECGA 3Q3TA 3UHLA 4YHQA 3UQRA 5BRYA 1IZEA 4DUSA 1FMXA 2XFKA 3KFRA 4MC9A 1BV7A 4LXKA 3L5FA 2B8LA 5P5HA 4J0TA 5P56A 3ZKIA 2HIZA 4XKXA 2VJ7A 2HB2A 3JVWA 3VSXA 4K4QA 4R91A 2QZKA 5P46A 5P8BA 3KFNA 3Q6YA 3OOTA 1DAZC 5P65A 5P5CA 3DCKA 3I8WA 5P06A 2AVQA 4ER1E 1AVFA 5P3EA 5P7DA 5P64A 5P1EA 4EP3A 1AZ5A 3OHHA 5OZ8A 1B6LA 1IZHA 4Z4XA 5P0IA 3ST5A 2AIDA 4RYCA 1C6YA 4YA8A 2ZHUA 1VIJA 2O4PA 5P3PA 4J0VA 1BWAA 6APRE 1B6MA 5P0EA 1APVE 2F80A 5JFPA 1HVKA 5P28A 5E5KA 4HVPA 4E43A 2F8GA 1SP5A 4J1IA 1MPPA 4J1HA 4ER4E 5P30A 5P1XA 1Z8CA 1EPQE 2QP8A 3H0BA 1D4KA 5P2CA 2ER7E 2FLEA 5P1FA 5P5IA 3SA5A 4RLDA 2AQUA 2QU2A 1T3RA 1MEUA 4YD6A 3WZ7A 2OF0A 5P7LA 4Y3YA 4B00A 4K9HA 4COEA 5IVTA 5P4SA 4OBJA 3OUBA 2VIEA 2I0DA 3HZCA 3CYWA 5P3MA 4RVXA 3QRVA 3TPJA 1PROA 1MSMA 5UPJA 1TSQA 2AOCA 3SKGA 1Z1RA 5P7JA 5P2YA 4APEA 3PWMA 1FQ6A 5P7WA 4Y3FA 4CPXA 5P5UA 5AHAA 3QRSA 5DR7A 3QIHA 5P7XA 1EPOE 3BGBA 1XN3A 1HBVA 5P63A 4MC1A 1MUIA 1OHRA 1BBSA 3S2OA 1E82E 3WB5A 5P0NA 1NPWA 5P71A 3GGUA 3L38A 1BIMA 3R0WA 2I1AA 3CIBA 3LNKA 3S43A 3QS1A 1W50A 3PSUA 4DJOA 5BS4A 4Y4BA 5P4NA 1MERA 3EM3A 1K2CA 3NDXA 5P4IA 1B5FA 4A4QA 5SXNA 4J0PA 1IDAA 3OXWA 3PI0A 4ZPEA 1GVUA 5KR8A 5OZTA 3ZLQA 1BDRA 4LBTA 4MC6A 4H3GA 5P8GA 2IDWA 2ZDZA 4XXSA 4PEPA 3PB5A 3EBZA 1A9MA 2MIPA 5P7ZA 3VLBA 1KJ4A 4GJDA 5P3RA 3D1ZA 3WSJA 5P10A 2I4WA 4I0EA 3O9LB 5P52A 2HC0A 5P6EA 3RTMA 4PHVA 4I0FA 5OYRA 5P53A 3AUPA 2V16C 2H6SA 5P6JA 5T4SA 2BKSA 3VFBA 3ZKNA 3QRMA 5P4LA 3TL9A 3QBHA 3KT5A 2HAHA 3HAUA 4M8XA 5OYXA 3L5CA 5P57A 3MSKA 1LF4A 4Y47A 3HVPA 4BEKA 4JPEA 2CEJA 5OZ1A 4XX4A 3S53A 1XDHA 1WBMA 5P79A 5OZRA 2UY0A 4Y45A 3RSVA 3NUOA 3OU4B 5P2AA 5P3DA 5P05A 5HE4A 5P5GA 1EPPE 2AODA 4DI2A 5P3ZA 3TLHA 4Y3PA 4QJ7A 5P2DA 5OYYA 2J9JA 4K4PA 3DCRA 5JODA 2OHUA 5CLMA 5P0KA 4R92A 1GNMA 4ZE6A 4WY1A 2HPEA 5DR4A 3VV7A 1K2BA 3APRE 5P8JA 1K6TA 4UPJA 4FRJA 5P1TA 5P6FA 2WF4A 4L6BA 1FFFC 2ZHRA 4DPIA 5P4FA 4Y56A 1C6ZA 1A30A 1KJ7A 2I4QA 4U8WA 1M0BA 1Q9PA 4FS4A 4PZXA 5P5SA 2ZGAA 4L1AA 1LS5A 1D4SA 5P4CA 5P50A 5OZVA 4OC6B 5DGUA 2HM1A 3PSGA 4H3IA 5P14A 5P84A 3JW2A 4IVSA 3OADA 3IA9A 1BAIA 5P6NA 3OXXA 4EJ8A 3QVIA 3LIZA 1PPLE 3VCMA 5P2SA 3VV6A 1FB7A 4Y4GA 4Y3QA 2ASIA 5C9FA 3HBOA 5P0OA 3WZ8A 3NDUA 4I8WA 1J71A 1ZPAA 1FGCC 2IENA 2QMDA 3DM6A 5P8QA 2HB4A 5DGWA 4F75A 3Q70A 1HRNA 3LZYA 1BVGA 1NPVA 3L5DA 3LPIA 1ZSFA 3PMUA 2ER9E 3O9CA 4Y3JA 3URJA 2JE4A 2IRZA 4ZSPA 3EL4A 3VF5A 3ZKQA 1MVPA 1LF3A 3AIDA 4M8YA 3KF0A 5P4BA 3UTLA 3MXEA 5DQCA 3EM6A 3OQKA 5P44A 5P0YA 2G1OA 5P3BA 3IVHA 1RPIA 4I8ZA 1BILA 5OYTA 3U6AA 4LL3A 2P8HA 5P7NA 2ZJMA 1MRXA 5P5LA 5DQ5A 4OBZA 3GGXA 5OZFA 5COPA 5P2JA 5OZPA 4KE0A 1HIIA 5P2RA 5P1NA 5P4VA 4GJ7A 5P0RA 4B0QA 1G2KA 4EHCA 5P5RA 1LEEA 4EQJA 4JPCA 4LC7A 5APRE 5P29A 4Y5PA 1KJHA 4QJAA 2HB3A 1HEFE 4R8YA 5P7QA 5P3GA 1YX9A 2BPYA 4ZEAA 4EJLA 3R4BA 3QVCA 5P89A 1GVTA 4RCDA 3KM4A 4Y9WA 5P1SA 3Q4BA 3IXKA 3N3IA 5HCOA 4Y4DA 4YD4A 1FF0C 2WF2A 1KJGA 2QZLA 3JVYA 4EQ0A 2ER6E 4I0DA 5P67A 5P35A 1EC3A 3BVAA 3PBDA 5HDVA 4FRSA 3PM4A 1SIVA 2V11C 3BXRA 3BUFA 5P5FA 3LIYA 1K6VA 3B7VA 5I3VA 8HVPA 3Q5HA 1ENTE 3VF7A 2G24A 2AVVA 3SA3A 2OHMA 1HHPA 5P07A 1QDMA 2NMZA 5P22A 3N4LA 1TW7A 5DQ1A 5P6OA 5P8NA 1MT9A 1IBQA 2PK5A 5P41A 3SO9A 5P2GA 4YCKA 2NR6A 3D1YA 5P5YA 5P18A 2I4XA 3TPLA 3NXEA 1HXWA 2I4UA 3D91A 5P1UA 2G94A 3KMXA 5HU0A 5P60A 2ER0E 5P2KA 4Y4TA 5P43A 3OQDA 1D4IA 3FX5A 4YD3A 3LZUA 1HSGA 5KR0A 3PCWA 5P8UA 1ODXA 2QMGA 1IZDA 2PYNA 1RNEA 5DQ4A 4YBIA 3O9DA 5P4GA 4HEGA 5P8HA 5F00A 4Z50A 2PSGA 3WB4A 1TCXA 2G21A 2OHTA 2B7FA 5P7VA 5P7BA 5TOLA 3OUCA 5P76A 4D85A 5OZNA 3VG1A 1D4JA 1ZBGA 2B8VA 1AJVA 2R5QA 4Y5LA 3SA7A 3NWQA 3OU3A 1IVPA 3B80A 5P74A 4JECA 1NH0A 2JJJA 4GJBA 4YD5A 5P4JA 3PCZA 1EC2A 1FMUA 4DQHA 4Y51A 1DPJA 2IQGA 5P6QA 4B78A 4YCTA 1JLDA 5P5AA 1A8GA 5P2VA 4BFDA 4OBKA 5P0ZA 1ODWA 2QNQA 5AHCA 2ZJIA 3RTNA 5F01A 4RVIA 5P2TA 1T6EX 5P51A 2ZHSA 5P02A 5P7HA 5IVSA 4HZTA 5P6KA 3S7MA 4LXMA 3TPRA 3LINA 3NYGA 3H5BA 4Y3TA 5P2NA 1K1UA 5SY2A 4GIDA 2G1RA 4RCEA 5P0FA 5P3CA 2B42A 5P85A 5KQZA 1W5WA 3O9AA 1GNOA 3LHGA 4Y57A 4DQGA 4EXGA 5P1JA 1UH8A 5P1MA 1UH9A 2V13A 1HEGE 3GI4A 2BKTA 5OYQA 2ZE1A 5B18A 4J1CA 2F3KA 3D3TA 3INEA 5P5OA 2AVOA 5OZ4A 5SZ9A 3QBFA 3DJKA 2FNTA 5P80A 4RRNA 5P0GA 5OZWA 4Y6MA 3O9GA 3S85A 1PSNA 5P24A 3ER5E 4PZWA 5P0UA 1N49A 2Q55A 4X2LA 5P34A 3L3AA 5P4WA 5P42A 5OYZA 3TKGA 5CONA 6FIVA 3NU6A 3I2LA 1SBGA 2PK6A 4Y5NA 5P62A 5C9BA 2QZWA 1EPLE 5P3VA 3INDA 4FGXA 2RENA 3K5FA 5P3NA 4RZ1A 5P19A 1APUE 5OZ0A 4QJ8A 2CENA 1IZIA 5KQFA 2F3EA 4I1CA 1ZPKA 4WTUA 2QI1A 4Y50A 3UQXA 4RROA 2ZHVA 3NU5A 4FSLA 5P0TA 5P2BA 2QNPA 3BUGA 2NNPA 1EBKC 4TRYA 2QI3A 3OUAA 3CYXA 3RTHA 3URLA 5P6HA 5P0XA 2AOJA 5P1AA 4OBZB 2Q15A 4QJ9A 2IL2A 3O9BA 4CMSA 1KJFA 1QBTA 2P3DA 2QNNA 2P4JA 5P5JA 3K4VA 5PEPA 1LF2A 3OGQA 1AXAA 1SDTA 5AGZA 3QN8A 1EAGA 3BXSA 3UDQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P7Y A;  3PHV A;  3OY4 A;  4OD9 B;  1LZQ A;  3O9I A;  4ER2 E;  3ZKM A;  4DJP A;  5P4M A;  5P31 A;  2IGX A;  1ZAP A;  3UDM A;  1CPI A;  3NR6 A;  3VYF A;  5P8V A;  2WEZ A;  3T6I A;  5P38 A;  2PC0 A;  2WF0 A;  4D88 A;  5P5K A;  4Y58 A;  4Y48 A;  1E80 E;  4GZF A;  3UQW A;  2Q3K A;  5P2H A;  3G72 A;  4Z2Z A;  2A1E A;  4DJU A;  1LYA A;  3UDJ A;  3NDT A;  3O9E A;  3NLS A;  3K1W A;  5HTZ A;  1YT9 A;  1FFI C;  2WKZ A;  3OQA A;  4D83 A;  2WEA A;  2JXR A;  2QHC A;  3OU1 A;  5P8I A;  2PSV A;  3I6O A;  5P5T A;  4LHH A;  5P2I A;  1XE5 A;  1ME6 A;  4ACU A;  5KR2 A;  5P8D A;  1HVS A;  1YTI A;  5P4Z A;  5P1P A;  2I4D A;  4R93 A;  2XFJ A;  4GJ6 A;  3IGB A;  1SGU A;  3OTS A;  4Q1Y A;  5P2U A;  2G1N A;  2FMB A;  5P0C A;  2VA5 A;  1HPV A;  1APT E;  3LIV A;  4QJ6 A;  2R3T A;  1YG9 A;  3OK9 A;  1YTG A;  3IN3 A;  5AH6 A;  4HLA A;  3CKT A;  4RRS A;  5COO A;  1AAQ A;  4DFG A;  3DK1 A;  1EC0 A;  1SME A;  5OZO A;  5P0H A;  3VLA A;  5P1H A;  2AZ9 A;  1A8K A;  2VNN A;  3KDB A;  4Y5C A;  5P5Q A;  2Z54 A;  5P7G A;  4EYR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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