1E5OE

Endothiapepsin complex with inhibitor db2
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title Refinement of Four Endothiapepsin Inhibitor Complexes. Crystallographic Studies of Cytochrome Ch from Methylobacterium Extorquens and Inhibitor Complexes of Aspartic Proteinases.
rcsb
total genus 84
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2000-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e5oE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e5oE01
4B72A 4ZSMA 1D4YA 4D8CA 5P6XA 1T6EX 5KQFA 5KR1A 3EKQA 5AHBA 1MT8A 3OU1B 3UQWA 4CPWA 2ZGAA 2QZLA 4I10A 3LIVA 2V00A 3OADB 5P82A 1EPQE 2ZHVA 5P0LA 5P6BA 1A8KA 1FQ4A 2WEAA 5P5YA 4F76A 4Y37A 5P8DA 3LIXA 1GNNA 2O4SA 4RROA 5P3NA 2BKSA 3QAAA 4PZWA 2QMDA 5P6ZA 5P19A 1LF3A 2I4XA 3PCZA 3VYEA 1MEUA 1HTGA 4J0VA 3I6OA 4ER1E 3TOGA 2ZJLA 4Y3RA 2SAMA 5P52A 5P6MA 5P2FA 5P1TA 5P8JA 1QS8A 5P1CA 4DFGA 4GYEA 3PHVA 2P3BB 2IQGA 5P05A 6FIVA 3PJ6A 2ER9E 2IGYA 5OYXA 4Y3SA 3O9FA 3L5BA 4B0QA 2BPVA 1RV7A 2PWRA 4CPRA 4DJQA 3RTHA 1PFZA 2B8LA 5OZNA 3HAUA 3IN3A 5P2WA 4Y3NA 5P6NA 5P79A 9HVPA 5P04A 1HVCA 5OYZA 2XFKA 5TOLA 1ODWA 2Q55A 5OZTA 2MIPA 4I1CA 3DM6A 4FIVA 1AZ5A 3FV3A 2PSGA 3NDWA 1BV9A 1EC1A 2EWYA 5P6IA 3OAGA 4Y48A 3VYFA 4FL8A 5P2HA 5P5VA 5P2IA 5P0DA 4I0JA 2BPYA 5P2VA 4U7VA 1QDMA 2FNTA 5P5GA 4DJWA 4DQGA 3BXRA 3QBFA 2QZKA 2R9BA 5P5HA 5P0SA 4OBFA 4ZSPA 2AZ9A 2AOEA 5P73A 1W51A 2I4UA 4DJYA 3ZKXA 1F7AA 3EKYA 3SA5A 3OOTA 1TSUA 1BBSA 3CKPA 3ER3E 1YTJA 5P53A 1FEJC 3H5BA 4GJ8A 5P6JA 1C6XA 1IBQA 4Y5KA 5P4TA 2QP8A 3KFNA 4I0GA 2XFJA 5P2RA 2VIZA 4FRKA 1EPME 3T7PA 1XS7D 2NMZA 3B80A 3LPIA 4Y57A 3TKGA 1FQXA 1QBTA 1D4SA 2V11C 3QBHA 1W5YA 2HPEA 3K4VA 5OZFA 4EJLA 2Z4OA 1B5FA 3PWWA 5P3UA 3L3AA 2V13A 1LV1A 5P13A 4RVXA 3SM1A 1EBYA 1BIMA 5HCOA 5P72A 1SIVA 5P42A 5OZLA 3PMYA 5P58A 3LNKA 2QNNA 5P5UA 4Y58A 2NTRA 2ANLA 1HVIA 1XDHA 5P0IA 4Y35A 5CONA 4CP7A 3UDRA 2QI7A 5P6EA 5HDXA 5C9FA 1LF4A 3SQFA 3CICA 2Q63A 3NSHA 2G21A 2ZJKA 4RRSA 5P3TA 4Y5MA 4L6BA 5E5JA 1FB7A 2UPJA 5HCTA 4KE0A 3CYXA 3K1WA 3LHGA 4ACUA 3RSVA 5P6GA 5P2OA 5P1PA 3C9XA 2G20A 5P5TA 2QHYA 4MC6A 5P11A 1MRWA 5P3RA 4TRYA 5P2ZA 2WF1A 1VIJA 3ER5E 1SBGA 3PBDA 5P2SA 2HB4A 4M8XA 4YE3A 2I0DA 5P3KA 2HB3A 3S7MA 2UY0A 4Y3MA 5P5OA 1FQ5A 3OUCA 2VS2A 1BV7A 1D4LA 3UQUA 2P3DA 1K6TA 4R91A 4RCDA 1LEEA 3SKFA 5DGWA 1GVVA 1J71A 3EL0A 4D88A 4YCKA 3VFBA 5P5DA 5P3AA 5P8QA 2FIVA 4Z4XA 2BKTA 2AZ8A 2QU3A 3L59A 5HDUA 5KQZA 1HTEA 3NYGA 5P12A 3NWQA 3KDDA 3UDQA 1WBKA 2RMPA 2BPWA 5P8TA 5P57A 4AA8A 3ZKSA 5IVTA 2G24A 4APEA 4Q1WA 3PLLA 1PSNA 3OAGB 5P7LA 3VF5A 3ZKQA 5DR4A 5P7GA 5P37A 4ZSQA 2ZHSA 5KR0A 3O99A 5P2EA 4Y4ZA 2FGUA 3TL9A 2QNPA 1HXBA 5P6FA 4YOBA 1GNOA 3RSXA 2AQUA 2IRZA 2NXLA 2ER6E 1DPJA 1HVLA 5P4BA 2WEZA 3ZL7A 3PCWA 1LYWA 3L38A 3VLBA 5DQCA 4PYVA 1HSIA 1YG9A 3DUYA 2I4VA 1EPLE 5P3ZA 3DK1A 5P6DA 3SA4A 5CLMA 5P3LA 2AOFA 4Y9WA 3O9AA 1MPPA 3EKWA 2UXZA 3ST5A 4D85A 3O9DA 5IVRA 1MIQA 4I0DA 1D4KA 3GGVA 5JFPA 1AVFA 3Q70A 2Q64A 1B5FB 1SH9A 3UQRA 1B11A 5P34A 5P2YA 2O4PA 5P0EA 5P00A 5P67A 1TQFA 1K2CA 1ZP8A 5P51A 2WF3A 1HTFA 2R43A 5P0WA 5DGUA 1HHPA 1FMBA 3URJA 5OYRA 4EJ8A 5I3XA 2QI1A 3UDPA 3OQFA 5P3MA 5P46A 1IDAA 5P75A 2QZXA 5P4SA 5KOSA 1QBRA 4J54A 2HIZA 5P7MA 2O40A 5P43A 5OZGA 4EP3A 4A6BA 5I70A 4JOOA 5OZOA 2F3KA 5P71A 3GGAA 1B6MA 4OC6A 3BGCA 4JECA 5P81A 1ZSRA 3NU4A 1BVEA 2PWCA 3FSMA 5P8UA 4DH6A 4Y3YA 5P45A 2B60A 3HLOA 5OYWA 2VNMA 1ZLFA 2IKUA 1FQ7A 2QHZA 5P64A 5P4ZA 2WF2A 5P7RA 1DP5A 3S85A 3PEPA 3EM6A 5P5MA 5P0VA 4Y4WA 1DAZC 2WEBA 5EZZA 5OZ4A 3EL1A 3INFA 3SA7A 4CMSA 1YX9A 1BVGA 4COEA 3UFLA 1YT9A 5P4OA 3TOHA 5P7FA 5P4QA 1FKNA 7UPJA 5P7WA 1MERA 1AM5A 2NXDA 3OHFA 4RCFA 2I1AA 3TOFA 4Y4JA 4RZ1A 4HDBA 3UPJA 1EPRE 4YCTA 5P40A 1APTE 4QLHA 3UQXA 2QU2A 4CPUA 5ER1E 5P4UA 5OZUA 3R2FA 5P54A 1B6JA 3EL4A 3QN8A 3U7SA 3PRSA 5IS4A 1SIPA 2R5PA 1KJ4A 3EM4A 3QP0A 5E5KA 1PPLE 3RTNA 2PK6A 3OQDA 3HW1A 1HTRB 5KQYA 4YD5A 3VEUA 5OZBA 1IVPA 4LXKA 3EL5A 3F9QA 2ASIA 1TCXA 5P1BA 5P33A 3HD8A 3ZMGA 3QI1A 2RSPA 1LYWB 2R3WA 4DVFA 1XE6A 4YOAA 3R1GB 3INHA 2QD6A 5P60A 3UHLA 1FQ6A 4H3FA 3PWMA 3T7XA 1EBWA 3UDJA 4MC1A 3GI6A 2F3FA 2OHUA 1T7KA 5P69A 5P4NA 4I8ZA 4EP2A 5P7OA 4QJ9A 4PZXA 5P2NA 3DCKA 5P5QA 4L7HA 4FM6A 3VV8A 4NKKA 3OQAA 4BELA 2OHQA 4K8SA 3IXJA 3G72A 4GJ5A 5P1LA 5P6OA 2Q3KA 4Y5PA 4Y5LA 5P7NA 5P1AA 5P15A 5P8RA 4PEPA 3PM4A 5DR0A 5P08A 3VV7A 3S7LA 4M8YA 1SMEA 4TVHA 4DJPA 1C6YA 4B1CA 4FGXA 3UDHA 5P49A 1DMPA 3KFSA 1HVRA 1QRPE 5J25A 5P2TA 1LF2A 2B42A 2PQZA 3DV5A 2G1YA 3OQ7A 2G1RA 4J1FA 1T6GA 5P7BA 3U71A 4ER2E 4OC6B 4Y3ZA 4B00A 5DR8A 3Q3TA 1IZDA 3IN4A 4B78A 5UPJA 1FG8C 5P7SA 4RRNA 5I3WA 4Y3FA 5ENMA 5P35A 5EZXA 1HPOA 4Y36A 4Y4AA 5P1JA 5P8MA 5P0MA 5OZAA 1XN2A 2Q15A 1NPAA 1FMUA 3INDA 5ER2E 5P44A 2Q11A 2WECA 3WZ6A 5OZ3A 3S53A 5OZIA 1ZAPA 5P4FA 5P3HA 4Y3JA 4PHVA 5P2KA 4NJUA 1SDUA 2FDPA 5P8CA 3APPA 4D83A 2APRA 5P4VA 5IVSA 3GW5A 3PWRA 5P26A 2FDDA 5OZXA 2CEMA 2ZJIA 3SA3A 5P3GA 3WZ8A 5P3BA 2ER0E 4FSLA 4GJCA 4CPQA 2QCIA 2PK5A 2R8NA 5P38A 5OZRA 4GJ7A 4Y4GA 3QVIA 4YD6A 3S43A 1NSOA 5P5IA 3FIVA 1GNMA 4FRJA 4K4RA 3VV6A 5OZDA 4EXHA 3Q5HA 1B6PA 1WBMA 2V12C 5P4GA 1MESA 4DJOA 1GVUA 3I25A 1HIVA 1KJ7A 4RCEA 5P5KA 2HPFA 1K1UA 3AUPA 3OK9A 4Y5CA 4K9HA 2OHPA 5AHAA 3TKWA 3DCRA 1MSMA 1EEDP 2I4WA 3NUOA 1YTIA 3OGQA 4CPTA 4KB9A 4Y4EA 5P1GA 5P8FA 3QROA 4Z22A 4HEGA 1EPOE 1BAIA 5P4JA 5P3JA 3DJKA 2OHNA 4KUPA 5P0RA 4J1HA 5P2AA 1AAQA 4DJVA 3N4LA 2AVVA 5APRE 5P3VA 1NPWA 2AVMA 5P74A 2G27A 4L1AA 3SPKA 3LITA 5P5PA 2RENA 1APUE 3O9HA 4JPEA 5P1RA 2G94A 1IZIA 1UH7A 1LYAA 3KYRA 1PPME 1A30A 3UFNA 2H6TA 3FNUA 3CKRA 3OUBA 1E5OE 2QAKA 4R95A 1KJFA 1K6PA 3BRAA 3ZKGA 3TPRA 3KT2A 3KFPA 4TVGA 1G35A 5P3XA 4LC7A 3FNSA 5P5BA 5SY3A 5P5NA 4EJKA 4OBDA 2FNSA 2A1EA 2ZDZA 2HC0A 3Q6YA 4Y3GA 4HDPA 3SO9A 3LPKA 3IXKA 4FM8A 4QJ7A 4Z50A 5P0YA 4Q1XA 5P09A 3S54A 2J9KA 3HAWA 3DV1A 2PH6A 3K4VC 1PSOE 3UDNA 4HDFA 5P0BA 4EWOA 1TW7A 5P6HA 5OZ6A 4H1EA 1AIDA 4J1KA 5P3YA 3PGIA 5AH6A 4MC9A 1LYBA 5P6AA 5PEPA 2V10C 5BWYA 4RGHA 3L5FA 1TCWA 4RYCA 1TZSA 5P0QA 1FF0C 5P6WA 2VJ9A 5P32A 3SABA 3EKPA 5P78A 5P8LA 3RVIA 5DQ1A 3L5EA 3TH9A 2HM1A 3WSJA 5OZEA 3TPJA 1FFIC 5DQ5A 3K5CA 3CIBA 1YTHA 5P66A 4EHCA 5DR7A 4RYGA 3ZPSA 4Y3TA 4NJVA 4YA8A 2ER7E 2QD7A 1W5VA 2G26A 5P1SA 5P4PA 4YBFA 2XYEA 1EPPE 4EQJA 1BDLA 3D1ZA 3R0YA 4Y4DA 5P5WA 3S43B 4Y5EA 4DPFA 5OZPA 2OHMA 4XXSA 1A8GA 5OZWA 5P4HA 5OZ5A 1NPVA 5P7PA 4B77A 6UPJA 4Y5BA 4FE6A 5P3EA 5P6YA 2XFIA 3URIA 1PSAA 1SDVA 3OQKA 2IENA 1APVE 3ZOVA 2I4QA 4B1DA 1IZHA 5P23A 4EXGA 3SFCA 2FXEA 3IA9A 5P01A 4I0IA 3NR6A 3GI0A 3Q4BA 1Z1RA 3K5DA 3BVAA 5P55A 2O4KA 4Y5GA 5P8IA 2FLEA 2QI4A 4Z2ZA 3S45A 3O9LA 3NWXA 2I0AA 2R38A 1ZPAA 1K1TA 2QMPA 4FAEA 4EYRA 3A2OA 2QZWA 4L1AB 5P84A 2J9JA 4H3GA 3SA9A 5P6UA 1HBVA 3CIDA 4GMIA 5AH9A 4DQFA 4MC2A 4H3IA 4J1IA 4FRSA 2AIDA 5ISJA 4AMTA 2R5QA 3UDYA 2NPHA 1LYAB 1W50A 2JYSA 3NDTA 5P0GA 5P8OA 3EKTA 4L7GA 2OHRA 2P4JA 3VF7A 3KMYA 3URLA 4GIDA 5P0HA 4Y6MA 5OZ7A 4LL3A 5P4WA 2NMYA 3PVKA 2H6SA 5P1QA 4UPJA 4NPTA 3EMYA 5P7XA 5P62A 1APWE 2AODA 5KR8A 4F74A 4FS4A 5P77A 3LIZA 1HSGA 1IDBA 2ZJHA 1W6IA 4DQHA 1GKTA 4EJDA 5P5FA 1FFFC 2IDWA 3LPJA 3D91A 4CPSA 1A9MA 3FKTA 1BXOA 5DR1A 1NH0A 2JE4A 3BUHA 1K2BA 4Y3LA 1AJXA 5P7TA 4L7JA 2AVQA 5P4YA 5P3QA 1RNEA 3S2OA 3M9FA 4WY1A 1G0VA 1EAGA 3D20A 2VKMA 3LZYA 4DQBA 5P1IA 2FDEA 1LYBB 1GVXA 5P30A 2QMFA 4RVJA 5OZZA 1XN3A 2QI0A 5P8PA 1ER8E 5P2UA 2QHCA 5P4XA 2F81A 3NXNA 5P1VA 5P20A 4HVPA 1RL8A 5P0AA 4FCOA 5OZHA 3BGBA 2BB9A 3UTLA 4DUSA 4AA9A 3PI5A 5P7IA 1ME6A 5DR3A 1DIFA 3KDCA 4KE1A 4K4PA 5IE1A 4EQ0A 1MRXA 3OHHA 4X7IA 4LAPA 4Y54A 4DJRA 3K5FA 5P1FA 1FG6C 2VA6A 4LHHA 1N49A 5P5JA 4GB2A 1MVPA 4YDGA 2B7FA 3QPJA 1FMXA 5P8HA 2ZJJA 8HVPA 5P6CA 2WF0A 2AOHA 1MT7A 3EBZA 1HIIA 3EKXA 2IEOA 3EKVA 4Y4BA 3UF3A 1FQ8A 4F73A 4J5JA 5P6TA 3R4BA 3VSWA 5P6QA 3VFAA 3VYDA 1IZEA 3O9GA 4Y4UA 5P6LA 3BUGA 2CENA 3TNEA 4BEKA 2Q5KA 4DJXA 4J17A 4Y4XA 3SM2A 2B7ZA 1E81E 2AOGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4B72 A;  4ZSM A;  1D4Y A;  4D8C A;  5P6X A;  1T6E X;  5KQF A;  5KR1 A;  3EKQ A;  5AHB A;  1MT8 A;  3OU1 B;  3UQW A;  4CPW A;  2ZGA A;  2QZL A;  4I10 A;  3LIV A;  2V00 A;  3OAD B;  5P82 A;  1EPQ E;  2ZHV A;  5P0L A;  5P6B A;  1A8K A;  1FQ4 A;  2WEA A;  5P5Y A;  4F76 A;  4Y37 A;  5P8D A;  3LIX A;  1GNN A;  2O4S A;  4RRO A;  5P3N A;  2BKS A;  3QAA A;  4PZW A;  2QMD A;  5P6Z A;  5P19 A;  1LF3 A;  2I4X A;  3PCZ A;  3VYE A;  1MEU A;  1HTG A;  4J0V A;  3I6O A;  4ER1 E;  3TOG A;  2ZJL A;  4Y3R A;  2SAM A;  5P52 A;  5P6M A;  5P2F A;  5P1T A;  5P8J A;  1QS8 A;  5P1C A;  4DFG A;  4GYE A;  3PHV A;  2P3B B;  2IQG A;  5P05 A;  6FIV A;  3PJ6 A;  2ER9 E;  2IGY A;  5OYX A;  4Y3S A;  3O9F A;  3L5B A;  4B0Q A;  2BPV A;  1RV7 A;  2PWR A;  4CPR A;  4DJQ A;  3RTH A;  1PFZ A;  2B8L A;  5OZN A;  3HAU A;  3IN3 A;  5P2W A;  4Y3N A;  5P6N A;  5P79 A;  9HVP A;  5P04 A;  1HVC A;  5OYZ A;  2XFK A;  5TOL A;  1ODW A;  2Q55 A;  5OZT A;  2MIP A;  4I1C A;  3DM6 A;  4FIV A;  1AZ5 A;  3FV3 A;  2PSG A;  3NDW A;  1BV9 A;  1EC1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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