1E82E

Endothiapepsin complex with renin inhibitor merck-kgaa-emd59601
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title Refinement of Four Endothiapepsin Inhibitor Complexes. Crystallographic Studies of Cytochrome Ch from Methylobacterium Extorquens and Inhibitor Complexes of Aspartic Proteinases.
rcsb
total genus 83
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2000-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e82E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e82E01
5P01A 5P3NA 5IS4A 3CICA 5P32A 8HVPA 5OYUA 1PPME 5P6AA 1LYAA 5P4JA 2XFKA 3S53A 1M4HA 2ZJKA 4FRJA 5P8HA 2WF4A 2XFJA 5FIVA 4Y4BA 3URIA 3CMSA 1MT9A 4YD6A 4RRNA 5P5PA 2Q55A 1ODWA 2VA5A 1FQXA 3S8IA 2QK5A 3L3AA 2PQZA 3VYFA 4AZYA 5P5GA 5OYZA 3MXEA 5HDVA 3GGAA 2AIDA 4YCKA 4PHVA 5P4EA 5P7OA 5P6GA 5P3YA 4Q5MA 4YHQA 1PFZA 3VLBA 4ZSRA 3U7SA 2ANLA 4Y4TA 5P5VA 1AXAA 2P3AA 1APTE 1IDBA 2I1AA 5P0TA 5P7IA 4COEA 4WY1A 1BV7A 5P3KA 5P8UA 5P8VA 5P02A 1LF4A 3L38A 4DQEA 2I0DA 1XL2A 3KMYA 2PSVA 3EKWA 5P7JA 1HEGE 1KJ7A 2A4FA 4I0EA 1YTJA 1EPQE 4I8ZA 3KN0A 3L58A 1HSGA 1KZKA 3LITA 2ZJLA 5P5EA 5P1HA 1EAGA 1C70A 3O9HA 2O4SA 3VG1A 1C6ZA 1ODYA 3ECGA 9HVPA 2VA7A 5P6IA 2F3FA 5P67A 3BUGA 4BFBA 3UQWA 5OZEA 4FAEA 1ZTZA 5P0MA 5P7GA 4Y3SA 1K1UA 3B80A 5P6CA 5P39A 4H3IA 3OAGB 1OEXA 3Q6YA 5P3SA 5OZVA 5SZ9A 4CPXA 5P46A 3SA9A 3N4LA 5P4RA 4J0ZA 1HXBA 2XYFA 1TQFA 2FDPA 2VIEA 5P6WA 1DPJA 5P8TA 5P5BA 4Z2ZA 3KFNA 3NSHA 1HVKA 2Q5KA 5P35A 3KA2A 3TOGA 1D4IA 3LINA 4Y45A 1MEUA 5P7TA 3TOHA 4GMIA 2JJJA 5P00A 4U7VA 1W5VA 5P5WA 3OAGA 4B1DA 5P28A 2HIZA 5P7UA 3CIBA 1KJGA 2P3CA 5I70A 2QU2A 4HZTA 2V16C 1IZHA 2QMDA 2Q64A 2VIZA 3LHGA 2QI5A 4YBIA 4NJSA 2V11C 3PMYA 5I3YA 2PK5A 5OZPA 5P3QA 1FGCC 3EM6A 2R9BA 2JJIA 5P10A 4GJ5A 1EPME 4RCDA 1EEDP 4ZLSA 3LZVA 3PM4A 4B77A 2HAHA 4UPJA 3NU6A 1JLDA 5P19A 5OZWA 4F75A 4AA8A 2BBBA 2ZJIA 2P83A 3G6ZA 2FXEA 5P7DA 3VLAA 4Y6MA 2RMPA 5DR3A 3NDTA 4TRZA 4DJYA 4Y43A 3ZKXA 5P76A 5P3UA 1AM5A 4Y3YA 4ZSPA 2JYSA 3INDA 5DR1A 3MXDA 2ZJMA 3C9XA 1IZDA 2NPHA 2F81A 5P0EA 3D1YA 2AVVA 4BFDA 1MIQA 2Q54A 5P0OA 1BDRA 5P70A 4H3GA 4Y4JA 5P5CA 4GJCA 4K9HA 5DGWA 1A8GA 4J0PA 5P80A 1Z1RA 5P6FA 3K4VA 4QJ2A 5P2IA 5OYRA 1DW6C 1SGZA 5OZHA 5P2HA 5HE7A 2WKZA 5P74A 5P5FA 3VEUA 2VS2A 5P0NA 4Y5AA 5P6KA 3O9CA 4FRKA 5P4AA 1F7AA 3QRVA 5OZTA 1EPOE 1HXWA 3S56A 3NWXA 4CMSA 5P6QA 5P3VA 3LIXA 1PPKE 1K1TA 1SDVA 3RTMA 4Y4ZA 3TPPA 3PBZA 1BIMA 4S1GA 3AIDA 3D91A 4GB2A 5P24A 4A6CA 5IVTA 3SKFA 1HPOA 3EC0A 1YTHA 4KE0A 5P18A 2WF3A 1SIVA 2O4PA 2BPYA 5ER2E 4I0ZA 5P0UA 5P0ZA 4DJUA 1E81E 5P4CA 3CKTA 3ZPUA 2WF2A 2ZYEA 3BGCA 3KYRA 5P1TA 4ZPGA 3LZSA 4LXMA 5I3WA 4H3JA 1EPNE 3OXXA 5P1VA 5P6OA 1T7KA 2Q15A 2G1SA 5P7CA 2FGUA 5P6HA 3BVAA 4ER1E 1META 3RSVA 4D89A 1GVTA 5P7QA 3SO9A 3ST5A 3VUCA 2G21A 6UPJA 5OYTA 1BAIA 5P3DA 4R8YA 2VKMA 1B6PA 4H3FA 1MTBA 2FNTA 1XS7D 2Q11A 3L5EA 1E5OE 5OZAA 1HTRB 3ZPTA 4EJKA 1SMRA 1DAZC 2RENA 1HSHA 5CONA 1CZIE 5P22A 1ZP8A 1MUIA 1LF3A 1FB7A 4Y3XA 5P47A 3UF3A 2AOFA 4MC1A 1HTEA 1BXOA 3ZPSA 4NJVA 3TOFA 4RGHA 2AVOA 3S7MA 4FSLA 5P56A 1XL5A 5P7ZA 1QBSA 2VJ9A 3O99A 4L6BA 5P06A 3OQKA 5AH9A 5AGZA 5P8QA 1BVEA 5DR7A 4TVHA 7HVPA 3TLHA 3OGPA 5P6LA 5P1FA 4XKXA 4GJBA 5P44A 4Y5EA 2QI6A 5P41A 3TPRA 3SM1A 1QBRA 2MIPA 3INEA 3QAAA 5HDUA 5P5HA 3SACA 5P17A 4R92A 5P85A 5P5IA 5HD0A 5P0BA 1BVGA 3UDKA 1C6XA 4Y41A 2OHTA 4HDPA 5P7AA 4ER2E 1B6MA 3EM3A 5P31A 5P3PA 5P37A 2IL2A 3GGXA 5P4YA 5P5LA 3PBDA 2G1RA 2FDDA 2VIYA 3UDHA 4YDFA 5P2EA 3OGQA 3LIYA 1MERA 5OZYA 5P4SA 3IGBA 4XX3A 2UY0A 4DFGA 4Y38A 1W6HA 3OQDA 5DGUA 4Y3FA 5P2YA 3GI5A 2AQUA 1YT9A 5P87A 3UQXA 1TZSA 5P2QA 3FNSA 5P7EA 5ER1E 4EQJA 5ENMA 5P23A 4GJ7A 5BRYA 2FMBA 5P3WA 5P6DA 3OOZA 2WECA 5JFUA 2G22A 2ZGAA 3NDXA 4OBFA 4FL8A 2WEBA 5P8NA 1FQ6A 5P16A 4J1HA 3SLZA 1FIVA 5EZZA 1HEFE 5P5QA 3KDCA 3IVIA 4Y9WA 3WZ7A 1W5YA 4FRIA 2AOGA 5P4MA 5P0SA 4DQCA 4B78A 5P1JA 1BBSA 5P88A 5P2CA 2EWYA 5P75A 4B70A 3PI5A 4NJUA 1D4JA 4Y4EA 1PSAA 4I0DA 5P8RA 2NXLA 4Y3MA 1MSNA 2QI7A 3FNUA 4K4QA 5P2GA 5P7KA 3OHFA 3BXSA 3QIHA 5IVQA 1T7IA 4WTUA 5P8FA 5P7RA 4NPUA 3Q3TA 5P4DA 3EMYA 5P6UA 5OZ8A 3D3TA 4KE1A 2FDEA 3SKGA 1TSQA 3OTSA 3NDWA 4Y57A 4Y3JA 4F73A 2HS1A 3DK1A 2OHKA 5OZZA 5OZ2A 5P5YA 2FGVA 3K5DA 5P3GA 3IVHA 2FS4A 4J1FA 3DCKA 4CKUA 2I0AA 4Y3AA 5P3HA 1A94A 3L5DA 4DJPA 4Y39A 2ZHUA 4Y5GA 1MRWA 1T6GA 4RROA 3TNEA 5COKA 4XXSA 4APRE 2QZKA 1G2KA 5KAOA 3KMXA 3KDBA 2QNPA 5AHCA 5P72A 5P3AA 4HLAA 2HPFA 2AOIA 2OAHA 1W5WA 1K6VA 3OXWA 1TCXA 4QJ7A 1W50A 1MESA 4R5NA 4OBKA 3HVGA 5P1BA 5P45A 5P7VA 2Q3KA 1EC0A 5JG1A 5P8DA 1EC3A 2J9JA 3UPJA 5P1PA 5P1IA 4Y5CA 4EJ8A 2ZDZA 5P60A 1A30A 3QPJA 4GJ9A 2OHQA 3FNTA 5P4VA 4DJVA 5P1GA 4QLHA 4K8SA 2HC0A 5P3TA 3NU4A 1D4HA 5P0YA 2B8VA 1RNEA 4I1CA 3I7EA 5P6ZA 1J71A 1W51A 2QHZA 3KFSA 3VFBA 5P4UA 1EPLE 1IZIA 5P6PA 3CKPA 3PWMA 2OHNA 4X7IA 2AVSA 2ER9E 4FM6A 3DV1A 1ZSRA 3JW2A 3GGVA 3R0YA 5P13A 3R2FA 1BWAA 1FMUA 1RPIA 3EKTA 2VJ7A 5KR0A 3UDQA 4Y4AA 3EM4A 3O9BA 3O9LB 5P4ZA 3SA6A 5HDXA 1HVRA 2V12C 5P36A 1PROA 1HOSA 2IRZA 5P64A 5HU1A 2RSPA 1KJHA 2QNNA 5P6TA 5OZ4A 3PCZA 4JOOA 4H1EA 3VF5A 5KR1A 4B00A 5P1QA 4EPJA 5P52A 3S43B 1NPVA 2ER7E 3MSKA 1YX9A 5P0XA 5JODA 1XN3A 5P7MA 5IE1A 5DQ2A 1RV7A 4OD9B 4LXAA 2VIJA 5P7LA 2F3EA 1NPAA 2QD7A 4FM8A 4I0FA 4ZPFA 5PEPA 5OZNA 5P61A 1W5XA 4Y3ZA 4J0VA 3LPIA 3O9LA 3OU3A 4Y3WA 4PZXA 1AIDA 4Y3RA 3HAWA 3NWQA 4Y5LA 4RYGA 1FF0C 1HVHA 4FLGA 2NXMA 1LZQA 3L5BA 4FAFA 3APPA 4PYVA 4DH6A 3AUPA 1GVVA 4RVJA 5OZ3A 5P89A 5ISJA 3UQRA 3S43A 4DJRA 1PSNA 4TRWA 1QS8A 4JP9A 5DPZA 4KUPA 2B7FA 1KJ4A 5P11A 4DPFA 4LAPA 2HB2A 1M43A 2BPVA 5P54A 5P0DA 4DQGA 1D4LA 4B1EA 2BKSA 4CPSA 5P14A 2WHHA 5P26A 2H6SA 5P77A 4DJXA 2FXDA 4Y53A 3BUHA 1HPXA 5P4OA 1DMPA 5AH6A 5P1MA 4Y5PA 3IXOA 4J5JA 2AZ9A 3R1GB 2QP8A 4OBGA 1HVJA 5SY2A 3OQAA 3BUFA 4AA9A 5SY3A 4YOAA 3UDJA 1MTRA 1LF2A 5T4SA 3SA8A 3RVIA 5P04A 1BWBA 2O40A 2O4LA 3EL0A 5OZSA 4I10A 1TW7A 3K4VC 3VSWA 5P84A 3B7VA 3OADB 3TH9A 4R95A 1ENTE 3DCRA 5KQYA 5P2WA 1FMXA 5HTZA 4Y3EA 2H6TA 5B18A 5P7HA 1K6CA 2A1EA 5OZGA 2FNSA 5P4TA 2QMGA 1QBUA 5P4LA 1ZJ7A 4Y4DA 5OYSA 4CPRA 5P3MA 5P5AA 1ODXA 2PH6A 5P3EA 5P0RA 1ZSFA 3NYGA 4Y36A 5J25A 3OADA 3PCWA 5EZXA 3NUOA 5OZ5A 3WB4A 1D4YA 2ZE1A 4K4PA 2HPEA 5I3VA 5KQFA 5KQZA 2F8GA 5HCTA 5OZOA 4OBHA 2WF1A 4RVIA 5P6JA 3ZKNA 1HSIA 4DQHA 3OWNA 3KM4A 5KR2A 4CPTA 5F01A 5P8OA 1XDHA 2R5QA 3OU1B 1HHPA 3FX5A 3MSLA 3BGBA 1PSOE 4Q1XA 4TRYA 5DR8A 3PSGA 2AZCA 2HB4A 4Y4UA 1K6PA 4CPUA 4F74A 5APRE 5BS4A 5DQ1A 3T3CA 5P4FA 5OYYA 3NXEA 5P1RA 3APRE 4GIDA 1EPRE 4Z22A 1B6KA 2IQGA 3ER5E 4CPQA 2R43A 5P4PA 2V0ZC 3GI4A 2VNMA 6APRE 3O9AA 1ME6A 3IA9A 4HVPA 2BB9A 3NU3A 4FIVA 3ZL7A 5P3ZA 4HDBA 2IS0A 4JPEA 4ZSMA 3SAAA 5P2XA 4JPCA 4L7GA 3OU1A 5COOA 4ZE6A 4YD5A 3T7XA 4Y58A 1VIJA 4EP3A 4LC7A 1SDTA 4Q1WA 1HPSA 4LBTA 5P8JA 2G20A 3LPKA 1T6EX 3PSUA 5P1KA 1FLHA 4NJTA 1FEJC 3QBHA 4EJDA 5P6XA 5P1UA 2NR6A 2ZHSA 3O9EA 4EHCA 3TL9A 1HIIA 2QHYA 4ACXA 5P42A 5OZ9A 4A6BA 3I25A 5P2AA 2PMAA 4N00A 1APUE 3T11A 5P6NA 5OZ1A 3O9GA 2NNKA 4DUSA 4F76A 5P8BA 3NUJA 5P5NA 3T7QA 2BPZA 4J54A 2O4KA 2I4VA 1MVPA 2PH8A 3FSMA 4DVFA 1HRNA 5P4WA 1E82E 2WEZA 3RTHA 4LXKA 1T3RA 2VJ6A 1MRXA 3OU4B 3N3IA 3UDMA 3RU1A 5P3XA 3GW5A 3IXJA 3R4BA 4OBZB 2V10C 3M9FA 5P7FA 2AOHA 2OHRA 5P08A 4WY6A 4FGXA 1ZPKA 2IGXA 3HBOA 3NXNA 5P6YA 4B72A 1K6TA 2OHSA 5P2ZA 5P6SA 4LL3A 2AODA 5OZQA 2ZJHA 5HDZA 2AVQA 2APRA 1YTIA 3OU4A 2QHCA 4R93A 2BPWA 5AHAA 1DP5A 3VF3A 1AAQA 1UH8A 4Y54A 3VYDA 5AH7A 5AHBA 5P2KA 2ASIA 3WSJA 3SA7A 3EL1A 4OBZA 5E5KA 5P4KA 1TCWA 3OQ7A 3A2OA 1EC1A 3S2OA 5P8MA 1E80E 3UQPA 1NH0A 3QVCA 1QDMA 1WBMA 4FS4A 3EKYA 4EXHA 4PPHA 4DJQA 4EQ0A 2R8NA 2B7ZA 2BPXA 3CIDA 5P12A 2HM1A 2ER0E 3GI6A 4ZIPA 2QMFA 3VV6A 5OYQA 5P78A 4I12A 4Q1NA 5P5DA 5P57A 3GI0A 3SM2A 1B11A 4QJAA 4OBDA 2QI0A 3CYXA 2QNQA 3D1ZA 5P62A 2OHLA 1HBVA 2SAMA 5OZ0A 5KOSA 4J1EA 4YDGA 1GNMA 2ZJJA 3QRMA 3KT5A 4GYEA 5P2NA 3LZYA 4Y3QA 5P05A 5P7BA 3TTPA 1LS5A 3VFAA 5OZLA 5P3RA 1WBKA 1CPIA 2QMPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P01 A;  5P3N A;  5IS4 A;  3CIC A;  5P32 A;  8HVP A;  5OYU A;  1PPM E;  5P6A A;  1LYA A;  5P4J A;  2XFK A;  3S53 A;  1M4H A;  2ZJK A;  4FRJ A;  5P8H A;  2WF4 A;  2XFJ A;  5FIV A;  4Y4B A;  3URI A;  3CMS A;  1MT9 A;  4YD6 A;  4RRN A;  5P5P A;  2Q55 A;  1ODW A;  2VA5 A;  1FQX A;  3S8I A;  2QK5 A;  3L3A A;  2PQZ A;  3VYF A;  4AZY A;  5P5G A;  5OYZ A;  3MXE A;  5HDV A;  3GGA A;  2AID A;  4YCK A;  4PHV A;  5P4E A;  5P7O A;  5P6G A;  5P3Y A;  4Q5M A;  4YHQ A;  1PFZ A;  3VLB A;  4ZSR A;  3U7S A;  2ANL A;  4Y4T A;  5P5V A;  1AXA A;  2P3A A;  1APT E;  1IDB A;  2I1A A;  5P0T A;  5P7I A;  4COE A;  4WY1 A;  1BV7 A;  5P3K A;  5P8U A;  5P8V A;  5P02 A;  1LF4 A;  3L38 A;  4DQE A;  2I0D A;  1XL2 A;  3KMY A;  2PSV A;  3EKW A;  5P7J A;  1HEG E;  1KJ7 A;  2A4F A;  4I0E A;  1YTJ A;  1EPQ E;  4I8Z A;  3KN0 A;  3L58 A;  1HSG A;  1KZK A;  3LIT A;  2ZJL A;  5P5E A;  5P1H A;  1EAG A;  1C70 A;  3O9H A;  2O4S A;  3VG1 A;  1C6Z A;  1ODY A;  3ECG A;  9HVP A;  2VA7 A;  5P6I A;  2F3F A;  5P67 A;  3BUG A;  4BFB A;  3UQW A; 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 2OHN A;  4X7I A;  2AVS A;  2ER9 E;  4FM6 A;  3DV1 A;  1ZSR A;  3JW2 A;  3GGV A;  3R0Y A;  5P13 A;  3R2F A;  1BWA A;  1FMU A;  1RPI A;  3EKT A;  2VJ7 A;  5KR0 A;  3UDQ A;  4Y4A A;  3EM4 A;  3O9B A;  3O9L B;  5P4Z A;  3SA6 A;  5HDX A;  1HVR A;  2V12 C;  5P36 A;  1PRO A;  1HOS A;  2IRZ A;  5P64 A;  5HU1 A;  2RSP A;  1KJH A;  2QNN A;  5P6T A;  5OZ4 A;  3PCZ A;  4JOO A;  4H1E A;  3VF5 A;  5KR1 A;  4B00 A;  5P1Q A;  4EPJ A;  5P52 A;  3S43 B;  1NPV A;  2ER7 E;  3MSK A;  1YX9 A;  5P0X A;  5JOD A;  1XN3 A;  5P7M A;  5IE1 A;  5DQ2 A;  1RV7 A;  4OD9 B;  4LXA A;  2VIJ A;  5P7L A;  2F3E A;  1NPA A;  2QD7 A;  4FM8 A;  4I0F A;  4ZPF A;  5PEP A;  5OZN A;  5P61 A;  1W5X A;  4Y3Z A;  4J0V A;  3LPI A;  3O9L A;  3OU3 A;  4Y3W A;  4PZX A;  1AID A;  4Y3R A;  3HAW A;  3NWQ A;  4Y5L A;  4RYG A;  1FF0 C;  1HVH A;  4FLG A;  2NXM A;  1LZQ A;  3L5B A;  4FAF A;  3APP A;  4PYV A;  4DH6 A;  3AUP A;  1GVV A;  4RVJ A;  5OZ3 A;  5P89 A;  5ISJ A;  3UQR A;  3S43 A;  4DJR A;  1PSN A;  4TRW A;  1QS8 A;  4JP9 A;  5DPZ A;  4KUP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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