2G1RA

Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the c ring
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors: Optimization of the "C" Ring
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2006-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g1rA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g1rA01
4LBTA 3UDNA 1W5XA 2QI0A 5EZZA 1GVUA 4R92A 1PPME 4Y3AA 5HDZA 3ST5A 5SY3A 3BGCA 5P5AA 3IXOA 3VLBA 1HVSA 2F81A 5P3MA 4DJYA 4H3JA 3INFA 4XX4A 5P5YA 4D88A 5P5RA 1D4JA 5P2BA 3OTSA 2HB3A 1SH9A 3SO9A 5HU1A 3OQDA 2AQUA 1XS7D 5P5WA 3GI4A 3L58A 4Y38A 4FRSA 2CEMA 4PEPA 2P8HA 3CYWA 3TNEA 1ZSRA 1D4IA 1LYBB 5P5EA 5P6KA 1K6CA 4OBZB 3SA4A 1YTJA 3IVHA 5P6XA 1LYBA 4DJRA 3EL5A 5BS4A 3UDPA 1FQ6A 3BRAA 3VV7A 5HCOA 4OBZA 4DPIA 5P1NA 4Y39A 5P44A 3D91A 4GJDA 4R8YA 2FNSA 5P77A 5P0XA 4D89A 1A30A 1GKTA 4RRSA 2VIYA 2OHNA 4DQGA 5P07A 1NH0A 5OZZA 1YTHA 4B1CA 1PPKE 2R3WA 5P26A 5F00A 4Y3ZA 4Y45A 5P5VA 4TRYA 3VF7A 1HSGA 1KJFA 2FS4A 4J0ZA 4WY6A 1B5FB 3TPJA 1QBUA 2AZCA 3PJ6A 2Q11A 4QJ7A 4E43A 1B5FA 5P01A 1QBRA 5P58A 3URIA 3O9AA 1XE5A 2F8GA 2QD7A 1BAIA 5KOSA 2QI7A 4FCOA 4Y3MA 5AH9A 2RKGA 5P2XA 1A8KA 5P2IA 3PBDA 5P3DA 5P4VA 4Y36A 5P2GA 3NDWA 5JG1A 3KDDA 3K5CA 3IN3A 3TLHA 5P2CA 1AXAA 3WZ7A 2PK5A 4YD6A 5P41A 3KT5A 3QRVA 3SKFA 5P0LA 3DOXA 1YTIA 4EPJA 3JVWA 2QNQA 5P17A 1QBTA 3WB4A 1ZJ7A 4F73A 1LYWB 3HD8A 5KQXA 2ZJJA 5P8AA 1A94A 4OBHA 4KE0A 3GGUA 3NDUA 1AJVA 1LYWA 5P61A 4GJ6A 2ER9E 4TVGA 4ACUA 3IVIA 5IVRA 2WF1A 3EL1A 4ER2E 3VFBA 1HVKA 1Z1HA 4OD9A 4YDGA 2VJ6A 5P6IA 5HTZA 1LYAB 5I3YA 4J1KA 1MT8A 5P7EA 3T7PA 1FQ5A 1YM4A 2ZGAA 5P1HA 5P52A 3TKGA 4B05A 5P4FA 5P4HA 5P5ZA 1FGCC 1LYAA 5P6JA 3AIDA 1MERA 5OZNA 2IGXA 3OGQA 2FIVA 3LINA 2WECA 2PSUA 3I6OA 5P80A 2J9KA 4R91A 5OZFA 3WZ8A 2IKUA 4EJDA 2BPYA 1C6XA 1BDQA 3BUGA 3G6ZA 1MSNA 4YCYA 3LPKA 4B0QA 2OHTA 5OZDA 5P2RA 2HAHA 2QNNA 1C6YA 3O9CA 5P0DA 4PZXA 2V11C 5P6SA 5DQ4A 1GVXA 5CONA 2ER7E 5P8MA 3GGVA 2WEBA 5P8HA 2R3TA 3QAAA 5OZ8A 1EEDP 4OBJA 5P3PA 5P7AA 1KJ4A 4DJQA 1SIVA 5P8CA 2QD6A 2BPVA 4EJ8A 5P85A 5P84A 4ZPFA 3KYRA 5P8SA 3UTLA 2F3KA 2ZYEA 5HE7A 1MPPA 5P54A 1IZHA 1HOSA 1M4HA 2I4WA 3Q3TA 1LEEA 5P1IA 5P4JA 2BKTA 5P1ZA 4FM8A 1TSQA 1HPXA 4DQBA 2VIJA 4J0PA 4I0DA 4BFBA 1HSIA 4GMIA 1XL5A 4Y4DA 1SP5A 4Z4XA 3SFCA 5P1DA 3PRSA 5P27A 3I7EA 3K4VC 3BXSA 3UPJA 3O9HA 5P1PA 4Y3HA 5P63A 3SA9A 2NMZA 3ZKIA 3FNSA 5P6PA 3R2FA 3UDQA 5P1XA 3QI1A 4J1EA 5P68A 1FQ7A 2I4XA 3TOFA 2G1RA 2AVVA 2OHSA 2AZBA 4PYVA 3IA9A 4AMTA 5P2FA 5P7NA 2G21A 4LXKA 5P34A 5P6AA 5P8FA 1RV7A 2B7ZA 4OBKA 3R4BA 3B80A 5OZ5A 4EQJA 5C9DA 2PYMA 5OZ1A 5P0OA 4Y41A 1FG6C 2QMGA 2FXDA 3UQXA 4YD4A 3K5GA 4X7IA 4APRE 1BBSA 3N4LA 2PC0A 2V16C 4NPTA 4NJSA 3VYEA 3UQPA 5JFPA 5P6RA 5P8NA 5OZBA 4QJ6A 3LITA 2QMPA 4CPUA 4Z22A 1NPVA 2G20A 2ZHSA 1ZSFA 4UPJA 2SAMA 3I25A 1AVFA 3VEUA 4Y5PA 4RVXA 4JOOA 4I8ZA 5P7OA 2G1OA 4DQFA 1NSOA 1ZAPA 2IEOA 3NU5A 2ER0E 4QGIA 5P5BA 5P3YA 1J71A 4GZFA 3ZKSA 3O9FA 5P2QA 5P3JA 5P8DA 3R0WA 3IAWA 5P5MA 5P2ZA 5P4UA 2PSGA 5P83A 3SA5A 2ZHTA 2Q54A 1T3RA 5DR0A 2XFJA 2Q3KA 4Y4UA 2WEZA 5P5IA 2PMAA 4Y4TA 1HHPA 1APVE 4Y3SA 5DR1A 5P4DA 5P7XA 5P30A 1MT9A 2BKSA 3NU9A 4HDPA 5P8UA 4U7VA 3NR6A 3JVYA 3PCZA 5HE4A 3Q4BA 4Y5GA 5DQ5A 2QAKA 3ZMGA 3SA6A 2QMDA 5P88A 3RTMA 5P75A 3UCBA 2OHQA 2O4NA 2P4JA 5P3NA 2OHKA 3UDKA 2B8LA 4GJ7A 5P45A 5P5UA 2J9JB 1HVJA 2VKMA 4GJBA 5P6EA 4Y47A 5J25A 3INHA 5P5LA 3NDTA 5P4KA 2J9JA 3NU3A 5P8TA 1ME6A 2BQVA 2VIEA 1IDBA 1HXBA 1GNMA 2P3CA 4TRZA 5IVQA 2I4QA 2VNMA 4QJ9A 1F34A 4EXHA 5P7RA 4B78A 5P6YA 5AGZA 1ZTZA 5AH6A 4CPRA 4J55A 4HEGA 2IENA 5P87A 5P73A 3D1XA 5P7BA 5P69A 2G22A 5P2KA 1ZP8A 3PVKA 4RCEA 5HD0A 1E81E 1D4HA 1RPIA 1HEFE 3I8WA 4GYEA 2OHUA 5P00A 2O4LA 3T3CA 5P2UA 1EBKC 4YD5A 3SPKA 1EPLE 1UH7A 5P0PA 4GB2A 4ZPEA 1D4KA 1HEGE 5P6FA 5P28A 3LIZA 2JJJA 3SABA 5P2MA 3IGBA 4GJCA 5P7CA 5P4NA 2FLEA 2AOHA 3QBFA 5P3IA 5P06A 2R8NA 2A4FA 5P0HA 4YOAA 5P8RA 1MIQA 1FMUA 3KMYA 3NSHA 4DVFA 5HE5A 4H1EA 3MSJA 1VIJA 3RSVA 4MC2A 5P1SA 1UPJA 1D4YA 1TCWA 3LPIA 1FQXA 4Y37A 4A6BA 5P15A 4F74A 1GNOA 5APRE 1FFFC 5P1GA 5P3SA 5P59A 2WF0A 3OHHA 1BIMA 3PB5A 2V0ZC 5P2EA 5OZ7A 5OZXA 4FSLA 1MVPA 3D1YA 4J17A 4Y3FA 4DJOA 5OYTA 3KFRA 5OZ0A 3K5FA 1ER8E 1LZQA 2I1AA 5P3ZA 3KT2A 1EC1A 4IVTA 5P0KA 2F3FA 5ISKA 3T7QA 4LXMA 5EZXA 2I0AA 5P0IA 5P5DA 5P7WA 2B60A 1DAZC 3CICA 2G26A 1IVPA 2JYSA 4YBIA 5P0SA 2NMYA 3KFSA 3QRSA 1EPME 5COKA 3MSKA 2ER6E 5P8EA 2ZJMA 5P23A 2WF3A 3CMSA 5P70A 1ODYA 2F80A 2QHZA 4B1EA 3ZKQA 4GJ8A 3VSWA 5ER2E 1NPWA 2IKOA 5P51A 3DUYA 4Y6MA 3OQFA 4RYGA 4YD7A 3AUPA 2BB9A 4FS4A 1ODXA 3PSYA 5P0JA 3L5EA 3HAWA 2MIPA 3NWXA 2V10C 4EJKA 2FGUA 5P7MA 2OF0A 3L38A 2RMPA 3D20A 3APPA 1HTEA 2EWYA 1WKRA 4YOBA 5OYZA 5P38A 3PLDA 5ER1E 3CKPA 1W5VA 2XFKA 4F76A 5P0EA 4I0IA 5P0RA 2QCIA 3SAAA 4BFDA 2AOEA 5P6HA 2QI6A 4GJ5A 2JJIA 2I4DA 3EL9A 4AA8A 4J1CA 4NKKA 3OU3A 4J0TA 2P3AA 4YCKA 5P8JA 3VYDA 4NJUA 5COPA 3QROA 1B6LA 3RU1A 5OZOA 5P1FA 3OAGB 3TOHA 4I12A 3QS1A 1W5YA 5P8OA 1EC2A 5P1QA 4R93A 1W6HA 5AHCA 3F9QA 2R9BA 3QRMA 4MC6A 4Y3LA 5OZVA 1T7JA 3OAGA 5P1JA 1FFIC 1HPSA 1W5WA 3EKWA 4Q1NA 4FL8A 3Q6YA 5P1MA 5P0NA 5ENMA 5PEPA 5KQYA 4GIDA 4K4QA 2XYFA 3BUFA 4HDFA 2AVMA 3LHGA 2CENA 5OYWA 2AOFA 2WKZA 3PWRA 3S45A 2AOIA 5P0UA 6UPJA 2ZE1A 3OADB 2VIZA 3OUCA 5HDVA 5OZJA 1HVIA 3OADA 1PSOE 5P7DA 3EM6A 5IS4A 5P20A 4M8XA 3UQRA 5P11A 3TOGA 2IL2A 5P4XA 2ZJLA 2H6SA 4FE6A 3U6AA 4EQ0A 3SLZA 3TPPA 4DPFA 1SDVA 1HIIA 4JPEA 2Q5KA 5OZHA 2WEDA 2P3BB 4F75A 2FXEA 5P33A 3O9LB 1T6GA 7HVPA 2P3BA 1YM2A 1D4LA 2HPEA 3NUJA 5OYRA 4OBDA 3O9LA 5P7UA 3QN8A 4RZ1A 1B6KA 5P74A 1HPOA 1FG8C 4Y3JA 2XFIA 2PWRA 5P7JA 2HS1A 1C70A 3KA2A 1CZIE 5P7VA 3DCRA 3VUCA 2UY0A 3EKQA 1B6PA 4RVIA 5P65A 4J54A 4EYRA 5P6ZA 5P1YA 5OZ6A 2FDEA 2RSPA 3LIQA 3L5DA 1APUE 5P3BA 3QP0A 4A6CA 5OZCA 1MRWA 3OHFA 2AIDA 3OOZA 5P53A 2IGYA 1DPJA 4NPUA 4N00A 4YA8A 4CPXA 5P3RA 1HTRB 3L5CA 4FSEA 4LC7A 5COOA 4ZSQA 5DPZA 4B72A 5P4SA 3OXWA 5P4BA 5P35A 2WEAA 1FEJC 3S54A 1IZEA 5P8PA 4DV9A 3D1ZA 3FKTA 1OD1A 2G1SA 3VV8A 2NXMA 4L7GA 4Y3DA 3UDMA 2R43A 2Q15A 3L5BA 5P37A 4I0HA 2CEJA 2V13A 4QJAA 4Y54A 4Y3TA 3KF0A 5P2OA 4Y4WA 4DJVA 2IS0A 1GVWA 4Y43A 5JFUA 3ZOVA 3EBZA 5P3CA 1BXOA 2AZ9A 2AVOA 3OK9A 5OYUA 1IBQA 5P78A 5T4SA 2PYNA 1T6EX 4HZTA 2A1EA 1HIHA 1HXWA 2NNPA 5P67A 6APRE 4I0GA 2WF4A 1ZBGA 4Y5CA 4Y56A 2BBBA 4H3IA 4A4QA 4Z50A 5P25A 2QK5A 5P24A 3DK1A 3DV5A 1LV1A 5P7PA 3VYFA 3WZ6A 3C9XA 3GGXA 4Y53A 3PWWA 3K1WA 3LIXA 5OZEA 3ZPTA 4LP9A 3UQWA 3IXJA 5P3TA 1LF2A 1KJGA 1FKNA 4LXAA 1PPLE 5P6LA 4FRJA 4YBFA 3DJKA 1EPOE 5P7IA 4J5JA 1PROA 3UDJA 1LS5A 3UQUA 1META 5P5NA 2OHRA 1BV9A 3MSLA 1AM5A 5P3LA 1A9MA 1IDAA 4LHHA 1HVHA 1B6JA 1BWAA 1DIFA 3S7MA 5P3VA 5OYQA 4OBGA 5I70A 1EC0A 1A8GA 2R5QA 3VV6A 5SZ9A 5P6BA 1YX9A 4XXSA 4AUCA 1EAGA 3URLA 5P60A 1G35A 1EBZA 3SM1A 3BC4A 5P5XA 1EC3A 2AODA 5AH8A 3INDA 3OTYA 4MC9A 1SDUA 5ISJA 4RRNA 3RTHA 4Y50A 3PMYA 4Y5AA 3TH9A 1TSUA 3NLSA 1UH9A 5P7YA 2G1YA 5OZKA 5I3WA 2I4VA 3BHEA 5P89A 3VF3A 4PHVA 3N3IA 2AOGA 4Y51A 5P7SA 5AHBA 3G72A 3PBZA 1FQ8A 5SXNA 4S1GA 3CKRA 2ZJHA 5FIVA 2P3DA 1XE6A 4J1FA 5P7KA 1E82E 4B70A 4Z2ZA 4IVSA 1GVTA 2HC0A 4B1DA 5P3AA 3U71A 4K4PA 2HM1A 5P36A 3HVGA 2WJOA 1RL8A 3VSXA 3QIHA 5P1CA 4ZPGA 5P5SA 3QBHA 4H3GA 3CIDA 4DQEA 5P4LA 6FIVA 1K2CA 1HVCA 3OQAA 5P6NA 3S53A 3OU1B 1KJHA 1YTGA 3R0YA 1M43A 4RGHA 5P1LA 4Y3PA 1Z8CA 3OU1A 2OHPA 3L59A 5P7LA 5P0TA 2BPXA 4FGXA 5KOQA 5P46A 2JXRA 2IQGA 3NXEA 1MRXA 1FB7A 4DUSA 4LAPA 5P4PA 1HPVA 1ZPAA 2NXDA 2BJUA 2R38A 2IRZA 5OZAA 5P09A 2UPJA 3L3AA 3TPLA 4Y57A 1BDRA 2HS2A 5P5FA 4L7HA 1FMXA 1BV7A 2Z54A 5P2LA 5P4MA 5OZ2A 4YE3A 4I0JA 1RNEA 1FF0C 5TOLA 2B7FA 5P6TA 3VCMA 1M0BA 3OY4A 2IDWA 2NNKA 1G6LA 3PGIA 1DMPA 2VJ7A 1FLHA 2JE4A 3SQFA 4XKXA 1MUIA 2NTRA 3O9GA 5P2VA 5P8GA 3ER5E 5OZWA 5P05A 8HVPA 4RROA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4LBT A;  3UDN A;  1W5X A;  2QI0 A;  5EZZ A;  1GVU A;  4R92 A;  1PPM E;  4Y3A A;  5HDZ A;  3ST5 A;  5SY3 A;  3BGC A;  5P5A A;  3IXO A;  3VLB A;  1HVS A;  2F81 A;  5P3M A;  4DJY A;  4H3J A;  3INF A;  4XX4 A;  5P5Y A;  4D88 A;  5P5R A;  1D4J A;  5P2B A;  3OTS A;  2HB3 A;  1SH9 A;  3SO9 A;  5HU1 A;  3OQD A;  2AQU A;  1XS7 D;  5P5W A;  3GI4 A;  3L58 A;  4Y38 A;  4FRS A;  2CEM A;  4PEP A;  2P8H A;  3CYW A;  3TNE A;  1ZSR A;  1D4I A;  1LYB B;  5P5E A;  5P6K A;  1K6C A;  4OBZ B;  3SA4 A;  1YTJ A;  3IVH A;  5P6X A;  1LYB A;  4DJR A;  3EL5 A;  5BS4 A;  3UDP A;  1FQ6 A;  3BRA A;  3VV7 A;  5HCO A;  4OBZ A;  4DPI A;  5P1N A;  4Y39 A;  5P44 A;  3D91 A;  4GJD A;  4R8Y A;  2FNS A;  5P77 A;  5P0X A;  4D89 A;  1A30 A;  1GKT A;  4RRS A;  2VIY A;  2OHN A;  4DQG A;  5P07 A;  1NH0 A;  5OZZ A;  1YTH A;  4B1C A;  1PPK E;  2R3W A;  5P26 A;  5F00 A;  4Y3Z A;  4Y45 A;  5P5V A;  4TRY A;  3VF7 A;  1HSG A;  1KJF A;  2FS4 A;  4J0Z A;  4WY6 A;  1B5F B;  3TPJ A;  1QBU A;  2AZC A;  3PJ6 A;  2Q11 A;  4QJ7 A;  4E43 A;  1B5F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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