1DP5A

The structure of proteinase a complexed with a ia3 mutant inhibitor
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
GGHDVPLTNYLNAQYYTDITLGTPPQNFKVILDTGSSNLWVPSNECGSLACFLHSKYDHEASSSYKANGTEFAIQYGTGSLEGYISQDTLSIGDLTIPKQDFAEATSEPGLTFAFGKFDGILGLGYDTISVDKVVPPFYNAIQQDLLDEKRFAFYLGDTSKDTENGGEATFGGIDESKFKGDITWLPVRRKAYWEVKFEGIGLGDEYAELESHGAAIDTGTSLITLPSGLAEMINAEIGAKKGWTGQYTLDCNTRDNLPDLIFNFNGYNFTIGPYDYTLEVSGSCISAITPMDFPEPVGPLAIVGDAFLRKYYSIYDLGNNAVGLAKAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords PROTEINASE A
publication title The aspartic proteinase from Saccharomyces cerevisiae folds its own inhibitor into a helix.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 91
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 3.4.23.25: Saccharopepsin.
pdb deposition date 1999-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1dp5A01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1dp5A02
3FX5A 3UPJA 4QJ7A 2OAHA 3SKGA 5P5VA 4COEA 4ZSMA 2O4PA 3BGCA 3D91A 2QD6A 5P72A 5AHAA 2QMFA 3BRAA 3JVYA 5P40A 5P0BA 1E80E 3SQFA 5P5JA 2Q15A 1A30A 5P39A 3UDYA 3TKGA 3L58A 5KR2A 1FKNA 5HCTA 5P4RA 2PWCA 5P7GA 2VIZA 4I0GA 1FF0C 1IZEA 5P7WA 4IVTA 2F3KA 4Y50A 5P7AA 5P89A 3SA9A 5P34A 1EBWA 5P25A 4K4RA 5P13A 5JODA 5HE5A 4CPRA 1NH0A 3D1YA 5P81A 2FNTA 4OD9A 3OUAA 1G0VA 1LZQA 5P69A 3NU5A 3DV1A 5P6FA 4DJOA 4DJQA 1HVCA 4CPSA 3LITA 1QRPE 3AUPA 3AIDA 2VJ6A 2JE4A 5DQ1A 4PHVA 1KJHA 4FE6A 2BPXA 3HLOA 5P30A 5P77A 4YBFA 6UPJA 3S45A 5P5QA 2B8VA 4MC6A 5OZ2A 5P4AA 5P5TA 5IE1A 4GMIA 2QI4A 5P83A 4QJ8A 5HTZA 5P85A 3VYFA 4K4PA 2HIZA 1YM4A 2I1AA 4Y4WA 3VF3A 4Y4EA 1EBYA 2J9JB 1T7KA 3DM6A 4LXAA 3WB5A 3M9FA 3I6OA 1XL5A 3KDCA 5OZ4A 4H3GA 1SMEA 5KR1A 3SM1A 3IXJA 5DGUA 1LYBB 5P76A 3VLBA 3KFPA 1SIPA 1PROA 3L5DA 5P6PA 4DH6A 3OU3A 2NR6A 5P4IA 1YX9A 5P8RA 4J54A 5P8FA 5P4NA 4NJVA 1LF4A 4GJ8A 2BKSA 3O9IA 3PLDA 1FIVA 3DV5A 5P6QA 5P8CA 4AA8A 2BPVA 3O9HA 5P4TA 4RVXA 4YDFA 5F00A 3LIYA 2QU3A 3OQFA 4ZLSA 5P1SA 4Y3TA 5DQCA 2OHTA 4B78A 5P33A 5P3XA 3SA8A 3EC0A 5P67A 1HOSA 2VKMA 4TVHA 4Y5BA 3D3TA 4RRSA 1META 5P32A 4DUSA 2AOJA 1KZKA 1OHRA 4L1AB 3PWMA 1TSUA 1W5VA 1NPWA 4LC7A 2I0AA 3PVKA 4MC2A 4EJDA 4R95A 2J9KA 1C6XA 5IS4A 2I4DA 2I4UA 5P38A 3ZKXA 2ASIA 2V10C 5ISJA 4DJPA 3R0WA 1HPSA 1APUE 5OZPA 3INEA 5KQXA 2B42A 1BDQA 3NUOA 3CMSA 4R93A 4GJCA 1FMXA 2OHLA 2PK5A 5P4QA 2AOHA 4J1KA 4Y5PA 1BWAA 2Q64A 3SA7A 4LXKA 1VIJA 2AVOA 3RSXA 4CP7A 3LHGA 4I0EA 3BHEA 5ENMA 1D4JA 5P6XA 2IKOA 2OHNA 4Y53A 4CPTA 4M8XA 4Y5MA 2PK6A 3K5FA 6APRE 3R1GB 3VF5A 5P0RA 1EEDP 3EL0A 3BGBA 4RYGA 1K1TA 3DCRA 5P1FA 4FRSA 4FL8A 1APVE 3OWNA 3I7EA 5P6ZA 1ENTE 1LYAA 1HVLA 2HS2A 4ACXA 5P35A 4Y45A 4JPCA 5P1JA 3UHLA 2OHUA 4Y5LA 5OZYA 1BVEA 3VV6A 1YT9A 1PPME 5P2RA 3MXDA 3PJ6A 2FDEA 3UQPA 4Y4ZA 5P3PA 2ZHVA 3KFNA 1SIVA 2V16C 2AVQA 2R5QA 4I8ZA 5P6YA 1BXQA 5P8NA 1SP5A 3UDKA 2PWRA 5OYQA 5P0KA 2HPFA 3S7LA 5P68A 4D8CA 1PPKE 3EM6A 2P4JA 5P1IA 1GVXA 5OZSA 3OXXA 1G6LA 4LL3A 4RCDA 4YE3A 4Z50A 5ER1E 5P5CA 1J71A 2AIDA 1EBZA 5P0AA 2RKGA 5P1OA 3T7XA 2ZE1A 3GI4A 5DR4A 5P31A 5P42A 2JXRA 3TPLA 5P2BA 4YD4A 4DQFA 5P3IA 3NDUA 5T4SA 2ZGAA 4Y36A 2NMZA 4L7HA 1A9MA 4KE1A 5P5FA 3HD8A 5OZ1A 4TVGA 2I4VA 3O9BA 3NU4A 1D4SA 4Y35A 2V0ZC 3O9DA 3QN8A 4J1HA 5P7CA 4U7QA 5C9DA 4B05A 3GI6A 3UDQA 3LZYA 2NMYA 5P0XA 2QK5A 4NJUA 5P0TA 4Y51A 3BXSA 3LPJA 1XDHA 4Y6MA 4I0FA 1UH7A 2G1OA 5P8UA 5OZ9A 5P7FA 4Y3LA 1BV7A 1GNMA 3PCZA 3G70A 1MRWA 4AZYA 3IN4A 4Y5NA 1HIHA 1E81E 5P1BA 3URJA 5HDUA 5P46A 5ENKA 3K4VC 2P83A 5P29A 4BEKA 3OADB 2HB3A 2VJ9A 3NU9A 2FXDA 1AXAA 5P4UA 3OOZA 5P5IA 2ER0E 4DJUA 3PBZA 4K4QA 2QI5A 3H0BA 5SY3A 5P1UA 4ER1E 5P3DA 2V13A 3OOTA 4FLGA 4FRJA 3OQ7A 3KMYA 1E82E 3ZOVA 5P5OA 5P3LA 5P4SA 4APRE 5AH7A 3OUCA 5C9BA 2QZKA 4J0TA 3TLHA 3U71A 1MVPA 1HPVA 3QBFA 3QPJA 3RVIA 2WF4A 4RRNA 1IBQA 3LZSA 5E5KA 5P06A 3QRMA 2Q11A 1EAGA 5P4HA 1HVHA 2WKZA 3QRSA 4Y5KA 5E5JA 4Y3HA 2FDPA 2HPEA 4KB9A 3OGPA 5P3RA 4YA8A 1AM5A 2FXEA 1PPLE 4JP9A 1FLHA 5OZJA 5P3YA 1BILA 4Y54A 2IEOA 5P4JA 5P2SA 5P4PA 4FIVA 2V00A 1HTRB 5P5KA 4B70A 3PSUA 2Z4OA 3LIQA 3PBDA 4J1CA 5P11A 1RPIA 4Y4XA 3DK1A 1RQ9A 3DUYA 3APRE 5OYUA 4DI2A 1DW6C 5P3OA 1ZSFA 2QI3A 4Y4AA 5P07A 3TOFA 2P3AA 3UCBA 1K2CA 3OADA 2FLEA 5P54A 4H3FA 5P56A 5P58A 5P6KA 2AVSA 3OTYA 4Y4JA 2I0DA 2NTRA 4Y3RA 4ZEAA 1K6CA 2JYSA 2CEJA 3K1WA 5P6GA 5P7LA 5HDZA 5P0UA 1W50A 1HEGE 3UTLA 3EKXA 5P0EA 3BUGA 4Y47A 3EKYA 1APTE 3PI0A 1AJVA 5P10A 5OZLA 5P3SA 4FS4A 3GI0A 1FG6C 1NPAA 1SDTA 3IAWA 4HDBA 2IGYA 3T6IA 3KF0A 4D85A 3OAGB 4CMSA 4I12A 5DR7A 3OXVA 3KT2A 4S1GA 4HDFA 1UH8A 1W5XA 2BQVA 5P45A 3OU1A 3HZCA 5P41A 1SDVA 1QBUA 5SZ9A 5P1NA 3T3CA 1E5OE 1RV7A 4YOAA 2SAMA 4ZSRA 5OZHA 4X7IA 2G27A 3EL1A 5P3MA 2QU2A 3S43B 4EJLA 4OD9B 4DJRA 2FS4A 5P6VA 2ZJIA 2QNQA 5P4YA 2FIVA 3FNTA 5P2HA 5DPZA 1Q9PA 3GGUA 2G1NA 2I4QA 4Y5CA 5KQFA 3L5CA 2BJUA 3PRSA 3VFAA 1W5WA 3VV7A 4E43A 4QJ6A 3CYWA 3KA2A 3ZPTA 5C9FA 2O4LA 5OYXA 2G26A 2WF3A 2PSUA 4B77A 1VIKA 4L6BA 3L3AA 3SA6A 5P3AA 5OYWA 4ZIPA 3EKPA 2UXZA 2WL0A 4WY6A 1QBTA 4Y5GA 2G69A 2QHYA 5OZOA 5P01A 5P4MA 1BWBA 2QAKA 3H5BA 1M43A 3SO9A 3Q70A 2XFJA 5P3FA 5FIVA 1KJGA 2NNKA 4Y4TA 1ZPKA 1TQFA 5P2JA 1ZAPA 1EPPE 3NYGA 4Q1NA 4HLAA 1HSIA 3NXNA 4J0YA 5ISKA 2HC0A 3R0YA 4Y3YA 5P18A 4EJ8A 3R2FA 3KYRA 4X2LA 2QD7A 3OAGA 2QHZA 3NXEA 2PYNA 4XX4A 3S8IA 1OEWA 3VFBA 4Q1WA 1TZSA 4GJ7A 1PSOE 2QZWA 4Y3WA 3VSWA 8HVPA 4Y41A 2ZHRA 3OQAA 3CIDA 3K4VA 2JJIA 3O9EA 1YG9A 3S43A 1XE5A 1GVVA 5P1KA 4L7JA 3KFSA 3OHFA 2PH6A 5P4CA 4I10A 1BBSA 5J25A 5P7XA 5OZCA 4U8WA 5P7HA 2Q63A 5P7JA 4EXHA 4JOOA 1QBSA 1PSNA 2BBBA 4JPEA 5P6MA 3UDHA 2NXLA 5P5BA 1EC2A 5HE7A 2QI6A 4JECA 3PEPA 2P3CA 5P3BA 4Y3MA 4I8WA 3QRVA 3SM2A 5P82A 4EP3A 2QMDA 5CONA 1MSNA 4DQBA 5P1WA 4J1EA 3S53A 1UPJA 3GW5A 1HTEA 2PQZA 3MSJA 1A94A 3EKVA 3O9LB 1FFFC 5P0IA 5HCOA 2PSGA 4H3IA 5P5SA 1FFIC 1RNEA 2VA5A 2PMAA 5P55A 1FMBA 3VLAA 2MIPA 4TRYA 5P51A 5P8DA 5OYRA 5EZXA 5P7NA 1ZLFA 1A8KA 3UQRA 3VUCA 3UDRA 4DJVA 5OZEA 4PZWA 5P4XA 3ER5E 1LYAB 3KFRA 5P8KA 3MWSA 5P05A 2F3FA 5P0OA 4YD3A 4YBIA 3BUHA 4RVIA 1BIMA 4BELA 5I3YA 2V12C 5P28A 4Y3EA 3DOXA 1ZSRA 3O9AA 4LP9A 5AH6A 1SMRA 3OUDB 1BV9A 3QVCA 5ER2E 3R4BA 1W5YA 1XL2A 3S7MA 5P4VA 5P86A 3D1ZA 5P3NA 5OZ8A 2VIJA 5P09A 2VNNA 5JFPA 5P70A 3FNUA 5P8JA 4FM8A 5P6EA 2VA7A 1SGUA 3L38A 5P44A 5P60A 5P88A 3LIVA 2BPZA 3PMUA 3MSLA 5OZKA 3QROA 1ZTZA 5P03A 2PSVA 5P2UA 4GJBA 3EKQA 1MPPA 3FV3A 4M8YA 1HSHA 1MRXA 1WKRA 4EQJA 5P22A 3OU4B 3NSHA 3O9LA 3JW2A 2PC0A 3LIXA 5P2VA 5P6WA 2XFIA 1W6HA 3CKRA 4H3JA 4Y4BA 5P4BA 4RROA 1YM2A 5P5UA 2AOFA 4Y3XA 1KJ7A 2IDWA 4HVPA 2HS1A 2G94A 4Q1XA 5P65A 2ZJNA 1YTGA 5P7OA 1K6PA 4Y3SA 5OZVA 5P2GA 4MC9A 2AZ9A 3MXEA 1W6IA 5P0GA 5P8QA 3ECGA 4DJXA 1PFZA 2BKTA 1F7AA 1HTFA 5P1DA 5P8OA 3OUDA 1T6EX 3NDTA 2ZJMA 4I0IA 3TOHA 5P7UA 5P5YA 2EWYA 5P0NA 4TRZA 3QBHA 1SH9A 5P36A 5P2XA 4HA5A 4EP2A 4NJSA 5P0HA 4Y56A 3Q5HA 2ZJKA 5P3CA 1MUIA 3SA4A 3PCWA 4GB2A 5OZAA 4EHCA 3ZPSA 1BAIA 5F01A 3VCMA 3L5EA 5P8HA 5OZZA 3OQDA 3DCKA 4Q5MA 3HDKA 5HU0A 3I2LA 2NNPA 5P6OA 5P4DA 3ZLQA 4OBFA 3GGAA 1G35A 4EWOA 4ZE6A 5APRE 3S85A 5IVRA 2AZ8A 4RGHA 3K5GA 4RVJA 1SDUA 4YD7A 5P4WA 2ER9E 4LAPA 3OU4A 1M4HA 3LINA 1BDRA 1XN3A 3VF7A 4J0VA 5P1YA 1AVFA 2OHPA 5COPA 1T3RA 4DQGA 1M0BA 1HHPA 2I4XA 5P7BA 2F3EA 4Z4XA 5P0VA 2VIYA 2PYMA 2OHQA 4A6BA 2Q3KA 3NDWA 1HBVA 1WBMA 5P7YA 1KJFA 4EPJA 1HVKA 4YCKA 5P00A 1JLDA 3LZVA 2XYEA 2PH8A 1IVPA 1GNNA 4PEPA 1N49A 1TSQA 3G72A 3UFLA 2H6SA 2WEDA 5P0LA 4DPIA 5P2EA 3WSJA 2IKUA 2R5PA 3F9QA 4J1IA 5COOA 3UQXA 5JG1A 3CKTA 4GJ5A 1FQ7A 4OBZA 4DQCA 4B0QA 5P26A 1MT7A 5P17A 5P8PA 4DPFA 4GIDA 5P1HA 5P4FA 5AH8A 5P20A 5P3VA 3HVPA 5BWYA 5P2TA 1FGCC 3KDDA 3ST5A 2O4NA 4R5NA 3TPJA 5KOQA 3EXOA 4EJKA 1HVRA 5P5XA 2QCIA 3OU1B 5KR8A 3EBZA 1D4KA 3QAAA 4K8SA 5I3VA 2OHSA 5DR3A 3T7PA 4YDGA 4QJ2A 4F74A 3L59A 7UPJA 2VS2A 4EQ0A 2BB9A 1C6ZA 1LF2A 3UQUA 4AMTA 5P4EA 4Y3JA 5DQ4A 1W51A 5P7DA 4D88A 1CZIE 1HXWA 5P3GA 5P3WA 3I25A 5P0DA 5P8TA 1EPRE 1GVUA 4AUCA 5P6BA 4EYRA 5IVQA 5P47A 1DMPA 5P8GA 4NPUA 3TPPA 5P1ZA 3PI5A 2FNSA 4NJTA 1YTHA 3EKWA 5P3JA 1B6JA 4R92A 5P7IA 1EC1A 1HVIA 5P84A 5SY2A 1EPLE 3ER3E 5P8VA 5P7KA 5DR1A 4J1FA 4QJ9A 3O9CA 3ZMGA 5P6RA 4RCEA 4FAFA 5KAOA 5OYSA 4DVFA 4CPXA 3A2OA 2VJ7A 5P62A 1HXBA 2WEZA 4WY1A 5P2AA 5P79A 2OHKA 1C70A 3WB4A 4YD5A 4TRWA 2WECA 1FQ5A 4PYVA 2JJJA 3OXCA 5P5EA 4CPQA 2QNPA 3ZKNA 2ANLA 2FGVA 2OHRA 4Y3QA 5KQYA 5P1EA 4Y37A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FX5 A;  3UPJ A;  4QJ7 A;  2OAH A;  3SKG A;  5P5V A;  4COE A;  4ZSM A;  2O4P A;  3BGC A;  3D91 A;  2QD6 A;  5P72 A;  5AHA A;  2QMF A;  3BRA A;  3JVY A;  5P40 A;  5P0B A;  1E80 E;  3SQF A;  5P5J A;  2Q15 A;  1A30 A;  5P39 A;  3UDY A;  3TKG A;  3L58 A;  5KR2 A;  1FKN A;  5HCT A;  5P4R A;  2PWC A;  5P7G A;  2VIZ A;  4I0G A;  1FF0 C;  1IZE A;  5P7W A;  4IVT A;  2F3K A;  4Y50 A;  5P7A A;  5P89 A;  3SA9 A;  5P34 A;  1EBW A;  5P25 A;  4K4R A;  5P13 A;  5JOD A;  5HE5 A;  4CPR A;  1NH0 A;  3D1Y A;  5P81 A;  2FNT A;  4OD9 A;  3OUA A;  1G0V A;  1LZQ A;  5P69 A;  3NU5 A;  3DV1 A;  5P6F A;  4DJO A;  4DJQ A;  1HVC A;  4CPS A;  3LIT A;  1QRP E;  3AUP A;  3AID A;  2VJ6 A;  2JE4 A;  5DQ1 A;  4PHV A;  1KJH A;  4FE6 A;  2BPX A;  3HLO A;  5P30 A;  5P77 A;  4YBF A;  6UPJ A;  3S45 A;  5P5Q A;  2B8V A;  4MC6 A;  5OZ2 A;  5P4A A;  5P5T A;  5IE1 A;  4GMI A;  2QI4 A;  5P83 A;  4QJ8 A;  5HTZ A;  5P85 A;  3VYF A;  4K4P A;  2HIZ A;  1YM4 A;  2I1A A;  4Y4W A;  3VF3 A;  4Y4E A;  1EBY A;  2J9J B;  1T7K A;  3DM6 A;  4LXA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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