4GJCA

Crystal structure of renin in complex with nvp-bch965 (compound 9)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
340
structure length
337
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title A novel class of oral direct Renin inhibitors: highly potent 3,5-disubstituted piperidines bearing a tricyclic p3-p1 pharmacophore.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 337
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gjcA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gjcA01
2AZ9A 2QNNA 2EWYA 3B7VA 4RVIA 3BRAA 3SKFA 4PYVA 3URLA 1EPQE 5P23A 4DJUA 1FG8C 3EM3A 4QJAA 3PB5A 1LYBB 4M8XA 2IKUA 1T7JA 3GGVA 4Y3FA 3O9LB 2G1OA 4NPUA 4HDBA 4RCEA 3OOZA 4J0ZA 4Y4AA 3ST5A 4ZSRA 3URJA 1A9MA 2AODA 5P4XA 5P12A 4Y3MA 5HVPA 4FSEA 3PGIA 5P1EA 4DPIA 1QS8A 4ZE6A 4Y39A 4J55A 3EM4A 5P0SA 5P77A 1HTGA 4KE1A 4EP2A 4YDFA 3L58A 3ZPTA 3TNEA 5P2TA 3DOXA 3HW1A 2NMZA 1HPXA 3SQFA 2QI7A 5P8VA 4COEA 3SABA 3BUHA 2PC0A 1B6MA 1FGCC 5P36A 5P4VA 2BKTA 3LZSA 4EP3A 1K1UA 2I1AA 2AZBA 5P25A 3KFPA 3HVPA 4L7JA 2WKZA 3SA7A 3G6ZA 1EPLE 4Y3SA 2BBBA 5P2IA 4B1CA 5P1HA 3OAGB 4EJ8A 4I0DA 4CPRA 5P0FA 3I25A 5DR4A 5P3EA 4L7HA 2WECA 1VIKA 1HPSA 5P5JA 5P2LA 5P61A 5P8RA 5P8CA 2PWCA 3F9QA 2WHHA 5OZWA 5OZ7A 5P6EA 1EPME 2VIJA 1HSGA 5P2BA 5OZRA 1Z8CA 5EZZA 4X7IA 2OHLA 4HVPA 4BFBA 1RL8A 4A6CA 4RRNA 2XYEA 4KB9A 3K5FA 1LYAA 2ER7E 2XFIA 1YTGA 3NDWA 3PVKA 2PK5A 1HWRA 4FGXA 1AVFA 4GMIA 3VYFA 3TPJA 3ZMGA 3CKPA 2IS0A 5APRE 5P3AA 1OHRA 2IRZA 2P4JA 3O9HA 2HPFA 4Y5NA 1TCWA 1MT7A 3PCWA 4I0ZA 5P6MA 5COPA 4EWOA 5OZTA 5OZBA 1UH7A 1W5WA 4DJQA 3OUDB 1SGZA 1PSAA 2QI3A 4I0FA 4Y56A 4OBKA 5P69A 5P1OA 4YOAA 4Y4XA 3QRVA 3T7QA 4CKUA 3JVYA 3S8IA 3ZKGA 2Q63A 3PSUA 4GIDA 2F8GA 5HDZA 3OTSA 3Q3TA 3WZ7A 5P32A 3K1WA 1E82E 3KFSA 3SM2A 2A4FA 2J9JA 5KR8A 1FB7A 3UQWA 5P6KA 5BS4A 2Q54A 3HBOA 3SA3A 5AH8A 2FDPA 1YTIA 4GJ5A 5DQ1A 1D4IA 5OZGA 4IVTA 3AIDA 3VF3A 5KQYA 1MEUA 4FRJA 5P60A 5P0BA 5P0PA 2G1NA 3DUYA 1C6YA 3PI0A 3Q70A 2ZJHA 3NUJA 2HAHA 3OUBA 4GJCA 4GJBA 3BGBA 2Q64A 3CYWA 2AOEA 4AA8A 5P3NA 1BBSA 2ZJJA 3OU1A 3QIHA 1EAGA 3UF3A 3VLBA 1GVWA 5P6ZA 4I1CA 1SH9A 3ZPSA 1PSNA 1TCXA 4YHQA 2JYSA 4OBZB 1EBKC 1PFZA 1FMUA 4GJ8A 3S56A 2P3AA 1UH8A 1LEEA 5P5YA 5OZ8A 3QVCA 4S1GA 4XKXA 4YBIA 2IGXA 3R4BA 5IVSA 5P2AA 1FQ5A 1HEFE 3BVBA 2ER0E 3BVAA 3EBZA 1IZHA 5P8SA 4OD9A 5P10A 4NPTA 3FNUA 5F01A 3OADA 3KN0A 5P38A 2ASIA 5P6QA 1B6LA 5DR8A 5P4EA 3QBFA 4PHVA 5P4CA 3TPLA 1JLDA 2VS2A 4ZEAA 5OZJA 4I10A 4J1HA 5DGUA 5E5KA 1MSMA 5C9BA 5P4PA 5P6HA 1MPPA 5P0LA 2QMFA 1FQXA 5P1YA 3K4VA 4YE3A 1RV7A 3L5FA 5P5VA 2G21A 5OZ6A 4E43A 1YT9A 2P8HA 4RYGA 1F7AA 3KT2A 4Y4JA 1HIHA 2P3BA 5P6LA 3NWXA 3IA9A 5P4YA 3FIVA 4RRSA 4LAPA 8HVPA 5P7GA 1ODXA 5P2DA 3PBDA 5P4IA 5ISJA 4Y3YA 3TLHA 5P8BA 5P7AA 1QBSA 5AHAA 2HC0A 1B5FA 2VIEA 4AMTA 2HB4A 4PPHA 3HD8A 5P62A 3VF7A 3RSXA 4B78A 3Q4BA 1G35A 2XYFA 2Q55A 1ZAPA 5OZDA 4YOBA 2NNKA 2APRA 1B6JA 5P0KA 1RNEA 3OQFA 3VSWA 5P19A 2G1SA 4QLHA 5OYXA 3DM6A 5P8PA 1A8GA 5KOSA 5P4SA 2WEAA 5P6JA 5OZEA 4Y43A 7UPJA 5P5SA 2ZJNA 3L5CA 4RYCA 4F75A 5OYVA 1KJ4A 5P0XA 1DW6C 5P1DA 5P4TA 3AUPA 1W5XA 3I6OA 3TTPA 1UPJA 4DQHA 1DAZC 2QU2A 4J0TA 3QAAA 4RZ1A 3TOGA 1META 1EBYA 5ER1E 5P7ZA 5P1TA 4Y5AA 5JG1A 5DR7A 5P4OA 4Y3DA 1ZLFA 4H1EA 5P7WA 4D85A 3WZ8A 4FSLA 2WJOA 2NXMA 1AIDA 2WEBA 4MC1A 5P2HA 5DPZA 5IVQA 5J25A 5COKA 4D88A 4D89A 5P2MA 5P37A 4GB2A 5P6NA 3O9LA 5OZCA 3CIDA 1G0VA 5P3DA 5P3GA 1LF4A 5HDVA 4ZPEA 1IZDA 3R2FA 3ECGA 2QZWA 3UDQA 5P72A 5P45A 5P0TA 2VJ6A 2JXRA 5DQ2A 4R92A 3PWRA 1M0BA 1XN3A 4AZYA 2JE4A 4HDPA 2B7ZA 4LBTA 1BILA 5P0RA 3KFNA 4WY1A 5P5BA 2QK5A 4U7VA 4LXAA 3KF0A 5I3VA 5CONA 3K4VC 3FSMA 3CYXA 2QHCA 5P1PA 2G26A 2XFJA 1MRWA 4JP9A 3QP0A 4R5NA 5P1BA 1KJGA 5KQXA 2PK6A 1LYWB 3SPKA 3UQPA 3NDXA 4GJAA 3EKXA 1AJXA 4DJRA 3OAGA 4HLAA 3TKGA 2WF1A 4ZPGA 4DJWA 1W6IA 5HE7A 4QJ6A 5P8NA 1D4KA 4MC2A 4DH6A 4YCYA 1T7IA 1ZBGA 1SDUA 5P55A 3KMXA 2IL2A 5P0WA 3SA9A 5P8MA 1B6KA 2VIZA 5P59A 4BELA 5P46A 5P71A 2G1RA 1MRXA 1BV9A 5P4ZA 3UFLA 3BUFA 4Y3XA 5P5TA 5P5XA 3QI1A 4DPFA 4YCKA 1PPME 5P8OA 1YX9A 5P4MA 3OQKA 5KR1A 2QCIA 1B6PA 2R43A 4ACXA 1BXOA 2I0DA 5P39A 6FIVA 2B60A 5F00A 4CPQA 4Y47A 3D1XA 5P65A 2QAKA 3KYRA 5P2QA 5P3FA 1TW7A 2F80A 5P6VA 2QD7A 5AGZA 4Y3NA 1UH9A 3OUDA 4BEKA 3DV1A 1WKRA 3R0WA 1FQ4A 3EKTA 1NPAA 4ER1E 1LV1A 3SA6A 4J0YA 3VF5A 1MTBA 5OZXA 5P4RA 2CEMA 3EC0A 1QBRA 3SA4A 4Y54A 3ZKMA 2ZJKA 5OZ9A 4ER2E 2UY0A 3OHFA 2I4UA 3IVIA 1HIVA 3APRE 3OTYA 3BXRA 3FV3A 2AVOA 5P4GA 2IDWA 3ZL7A 5P0UA 3UQXA 3T3CA 5P0EA 3MSLA 3L5EA 2PYMA 3ZOVA 3N4LA 3R0YA 2QZXA 5P63A 3MXDA 3MSKA 1W51A 1HIIA 5P0GA 5P6GA 4OBGA 1K6TA 2OHTA 5P3MA 2AZCA 2Z54A 2I4VA 5P85A 3OGPA 3O9BA 5P5GA 5P33A 3KA2A 2CENA 5P1JA 3GW5A 3SAAA 2VNMA 3M9FA 1KJHA 5P3RA 3C9XA 2VJ9A 3PLDA 3RU1A 3HAWA 3CKRA 5DR3A 1OEXA 5OZ3A 1BWAA 5HCTA 5P2FA 3LIXA 1Z1RA 3S43B 2PSUA 1J71A 4OBZA 5OYQA 1SIVA 2QU3A 3O9AA 1IZEA 3EL0A 1GVXA 2NTRA 5HD0A 1HOSA 1GNNA 3PMUA 3S53A 1CMSA 2OHPA 5P0OA 1K6VA 3QROA 4FRIA 1F34A 4Y35A 5P2OA 3S7LA 5P0ZA 5HU1A 2PSVA 3O9IA 4I0GA 1BWBA 4RGHA 2WF4A 4Y50A 2F81A 3S2OA 5DQ5A 5P3HA 4Y51A 5P64A 1FQ7A 4J5JA 1SMEA 5P8AA 4OBDA 5P54A 1ZPAA 1BV7A 3I8WA 5P5IA 1XN2A 2QMGA 5OZQA 3UDMA 5P44A 1M4HA 4ZSPA 3UTLA 4H3JA 1ENTE 3NDUA 1PSOE 2RSPA 3PI5A 4Y4WA 5P3XA 3TPRA 5HE4A 4FE6A 4RCDA 5IE1A 3OQDA 5P28A 2AVQA 2F3KA 5P7SA 2ZJLA 5P8LA 2QHZA 5P7CA 2P3CA 5P01A 4Z50A 3WB4A 5OYWA 2F3FA 2I0AA 4ZSQA 4Y9WA 1N49A 4Y4ZA 2ZE1A 4LXKA 5P73A 3NU5A 2ZHSA 3UDKA 4K4PA 3LZUA 3BXSA 5P1QA 1AM5A 3QRMA 4F76A 3H5BA 3UQRA 3NXNA 3DCKA 3WB5A 5P17A 5P1CA 3SM1A 1D4JA 1A8KA 4K8SA 2ZYEA 4YD7A 3B80A 5OZKA 5P0MA 4Y4EA 5P31A 3VFAA 2V12C 5P1WA 5HE5A 2G24A 3FNTA 1XE5A 4Y45A 1LF2A 3RTMA 1FF0C 3Q5HA 5P5CA 1APTE 3LIVA 2JJIA 5C9FA 4XX4A 3RSVA 5OZAA 5P5NA 5P2XA 3RVIA 1GNOA 2R8NA 3L38A 5P79A 5OZNA 1U8GA 5P7IA 3EKPA 3JVWA 7HVPA 5P3IA 1MESA 4DJOA 4Y4TA 3VUCA 2OHUA 4R8YA 2QZLA 5OZYA 4Y53A 2FS4A 3GGXA 2B8LA 4AUCA 4XXSA 4EXGA 4RCFA 3R1GB 2R3TA 5P08A 5P8HA 2CEJA 2P83A 1EC1A 2OHRA 1C6ZA 3EMYA 3VV7A 2O4KA 5P0YA 3SO9A 2BPXA 4J1FA 3KDDA 2AZ8A 2G1YA 1EPNE 2JJJA 2BKSA 5P3TA 1KJFA 5OZOA 2BQVA 1IZIA 2WEZA 4QJ8A 3TL9A 4J0VA 2NXLA 4DUSA 3GI5A 5P0QA 1T6GA 5P0AA 1HXWA 5P74A 3RTNA 3IN3A 4TRZA 2OHNA 5P1UA 5P3PA 5JFPA 5UPJA 3IXOA 4B77A 2ER6E 4J1KA 3I2LA 3IN4A 1HHPA 5OYZA 1K6CA 4DQGA 2I4QA 1OEWA 4Y3PA 1YTHA 3ZKNA 5P2VA 2V00A 2V13A 2NMYA 4Y3TA 5P2EA 3PWWA 1QBUA 5P0HA 4CP7A 3APPA 5P5QA 1FFFC 3TPPA 4DQCA 5P3KA 5OZLA 4DJYA 5P82A 1BDRA 1WBKA 1YG9A 1LYWA 2OAHA 3VSXA 2AOHA 3S54A 5P2GA 4QJ9A 5P5RA 3VV8A 2PSGA 4CPUA 1AAQA 5P2JA 5P87A 3PRSA 3OXVA 5P84A 1K1TA 3NWQA 5P58A 1EBZA 1NPWA 3KM4A 5OZSA 3K5CA 1IDAA 2MIPA 2VKMA 4B1DA 1LZQA 2QI6A 3EL1A 3LZYA 2QI0A 1EPRE 5P1MA 3ZKXA 2H6TA 4YD4A 4J1EA 5P1KA 1LYAB 5P7PA 4QJ2A 5P1IA 3ER3E 4DQFA 4EQ0A 1XS7D 1MT8A 2HPEA 2FIVA 5P5ZA 1KZKA 1D4HA 2AQUA 1BDQA 3LHGA 3IAWA 5P6XA 5ER2E 5P0CA 4EQJA 4FRSA 4YD5A 1NSOA 2ZJIA 4DJPA 1D4YA 3INDA 4Y3HA 4YA8A 5P4NA 2AOCA 4LC7A 1FQ8A 1PPKE 3NR6A 1E5OE 1APWE 2AVMA 5P06A 5HU0A 5P3CA 5OZ0A 1AXAA 1HVJA 5P07A 5P7JA 3UDJA 1HVKA 5P8EA 3TOFA 4Y5KA 4Y3LA 2V0ZC 2QI4A 3INHA 1M43A 5P22A 4Y37A 4PEPA 5P6RA 1YM4A 5I3WA 5IVTA 3LINA 5P27A 3VEUA 4FAFA 5P3YA 3D3TA 5TOLA 5P7YA 5P05A 4DJXA 5P7MA 3ZKSA 4LXMA 1LYBA 1EC2A 2R5QA 2HB3A 4Y5MA 5DQCA 3OU1B 1IVPA 2PH6A 2PMAA 4JOOA 4K4RA 1TQFA 3SKGA 1HSIA 3T7XA 4FL8A 6APRE 5P4HA 3SFCA 4L1AB 3NDTA 3L3AA 4RROA 1W50A 5P2ZA 3QN8A 5P48A 1EC0A 4LHHA 5P1VA 5P2YA 4Y5BA 2OHSA 5KOQA 3ZPUA 3PCZA 2I4DA 3IXJA 4YD6A 1HPOA 2BPZA 3OU4B 4NJUA 4F73A 3UHLA 1BVGA 2FLEA 1D4LA 5P3WA 5OZZA 4L6BA 3GGAA 2AOJA 3EXOA 5P5HA 5P83A 2VA6A 1ZPKA 3O9DA 4NJSA 5P02A 1TSQA 5P6DA 1GVVA 3PM4A 5P5UA 1XL2A 5P4AA 5EZXA 3NYGA 5P3LA 4L7GA 2RENA 4FS4A 1C70A 1ZSRA 3EKWA 5OYYA 4Y5PA 3GI4A 2XFKA 1DMPA 3BGCA 2BB9A 1RPIA 2QZKA 4Y5GA 5P1LA 2FDDA 5P0VA 4HEGA 1EC3A 4EPJA 4ZLSA 5KAOA 3KMYA 5P76A 5P89A 5P49A 2O40A 5P2KA 2P3BB 3BC4A 4RVXA 3D1ZA 5P5MA 5P7QA 5I3YA 1IIQA 1T6EX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2AZ9 A;  2QNN A;  2EWY A;  3B7V A;  4RVI A;  3BRA A;  3SKF A;  4PYV A;  3URL A;  1EPQ E;  5P23 A;  4DJU A;  1FG8 C;  3EM3 A;  4QJA A;  3PB5 A;  1LYB B;  4M8X A;  2IKU A;  1T7J A;  3GGV A;  4Y3F A;  3O9L B;  2G1O A;  4NPU A;  4HDB A;  4RCE A;  3OOZ A;  4J0Z A;  4Y4A A;  3ST5 A;  4ZSR A;  3URJ A;  1A9M A;  2AOD A;  5P4X A;  5P12 A;  4Y3M A;  5HVP A;  4FSE A;  3PGI A;  5P1E A;  4DPI A;  1QS8 A;  4ZE6 A;  4Y39 A;  4J55 A;  3EM4 A;  5P0S A;  5P77 A;  1HTG A;  4KE1 A;  4EP2 A;  4YDF A;  3L58 A;  3ZPT A;  3TNE A;  5P2T A;  3DOX A;  3HW1 A;  2NMZ A;  1HPX A;  3SQF A;  2QI7 A;  5P8V A;  4COE A;  3SAB A;  3BUH A;  2PC0 A;  1B6M A;  1FGC C;  5P36 A;  5P4V A;  2BKT A;  3LZS A;  4EP3 A;  1K1U A;  2I1A A;  2AZB A;  5P25 A;  3KFP A;  3HVP A;  4L7J A;  2WKZ A;  3SA7 A;  3G6Z A;  1EPL E;  4Y3S A;  2BBB A;  5P2I A;  4B1C A;  5P1H A;  3OAG B;  4EJ8 A;  4I0D A;  4CPR A;  5P0F A;  3I25 A;  5DR4 A;  5P3E A;  4L7H A;  2WEC A;  1VIK A;  1HPS A;  5P5J A;  5P2L A;  5P61 A;  5P8R A;  5P8C A;  2PWC A;  3F9Q A;  2WHH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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