1EPRE

Endothia aspartic proteinase (endothiapepsin) complexed with pd-135,040
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
330
structure length
329
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title A structural comparison of 21 inhibitor complexes of the aspartic proteinase from Endothia parasitica.
pubmed rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 76
structure length 329
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eprE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eprE01
2VNMA 5P0AA 1FIVA 1NPWA 3PSUA 3UDMA 5P7RA 3PWRA 3FNSA 5P1CA 3LPJA 5P2MA 2PYMA 1BVGA 5P44A 1IZIA 1ZAPA 2AOFA 5P1NA 1C70A 1LF4A 3LIZA 3K5GA 3SLZA 4LBTA 3HAWA 1A30A 5DQ1A 1YM2A 5P53A 5P2NA 3S85A 1TCXA 5OZAA 1W6HA 3DK1A 5BRYA 5P5TA 2HS1A 5P55A 4R93A 3N3IA 2BJUA 4KE1A 4EWOA 4FAFA 2UY0A 5P6LA 3LZSA 4AUCA 5EZXA 4MC1A 2IKUA 5P2HA 4AZYA 3T3CA 4XX4A 1ENTE 1XN3A 1SDUA 5TOLA 1HVRA 5P8HA 4I0IA 4HEGA 5P3YA 3NWXA 3APRE 2QI0A 1OEWA 2SAMA 5P10A 1G35A 4ZPGA 5P5NA 4PZWA 1G0VA 4I0ZA 1MTBA 3A2OA 5P2IA 4KE0A 1LYWB 4YDFA 4GJBA 1AZ5A 2VIZA 1GNMA 1OD1A 3VSXA 5P5JA 4FLGA 2B8VA 2PK6A 4Y3PA 5P5WA 5T4SA 1J71A 4Y51A 4B77A 3LZVA 4Y4UA 5P3WA 5P8QA 1JLDA 3OQAA 4RGHA 5P69A 1FQ4A 4Y56A 4FM7A 1ZTZA 2XFJA 1EC3A 4S1GA 4YD6A 3KMYA 4F73A 1A8KA 1U8GA 2WF1A 2R5PA 4J1CA 2NXDA 3EL1A 5P6WA 3PLDA 2VS2A 2OF0A 2P4JA 4I0HA 3NSHA 3HAUA 3PJ6A 3UFNA 4YBFA 4Y39A 5JODA 5P4QA 1HPSA 1AXAA 5P3GA 5P4BA 5DPZA 3PCZA 5P5HA 4DUSA 4J55A 3S2OA 1EC0A 3GGVA 3S43A 5P5SA 5OYZA 2FGVA 4LAPA 5HCOA 4APRE 2I0DA 4I0DA 5P7DA 3UF3A 3ER5E 3HVGA 2QD7A 1UH8A 5OZKA 3HZCA 5COOA 4A4QA 4FCOA 3VV7A 4HZTA 1FB7A 4N00A 5KR1A 5P87A 3RTNA 1D4JA 5P1YA 2QNPA 2NNPA 1HVSA 4CKUA 1W51A 2QI5A 4U7VA 5P3AA 5P84A 4K4RA 4Y41A 3QBHA 4J0TA 3JW2A 2A1EA 4ZE6A 1HSGA 2QU2A 2QU3A 4Y43A 4GJ7A 1IBQA 5ENKA 5P6GA 3CYXA 5P3LA 5P8KA 2FDDA 3T7XA 5P75A 1T3RA 5P7NA 2I4XA 4Y3WA 1E80E 1APUE 4QLHA 2Q54A 5P0DA 4Y3MA 4PHVA 4DH6A 3TPJA 1HTRB 3B7VA 3EM6A 5P34A 1W5VA 4OD9B 3L5DA 5P2TA 2XYEA 5P19A 1HSHA 2I4WA 3KDCA 3OQDA 4FM8A 3GI6A 5P29A 3VV6A 4PYVA 5P4XA 5P1GA 3QPJA 2ZHRA 3PBDA 2HB2A 4J1FA 1W5YA 3PMUA 3EKXA 2OHQA 3HDKA 2AOJA 1IVQA 5P45A 1EPQE 3MXDA 5P7AA 4Z22A 1B5FB 4Y35A 3Q6YA 5P2YA 3BHEA 5OZOA 5P60A 5COKA 5OZRA 5P7YA 2AZBA 4Y6MA 4YOBA 5OZEA 5P22A 1YTIA 4BFBA 3OXXA 5P2LA 4FM6A 4CPXA 3BVBA 5E5KA 2H6SA 3IXKA 2ZHVA 5P0NA 4J1IA 4OBZB 5OZLA 5P7WA 3G70A 3L5FA 2I4UA 3AIDA 3VV8A 4K4PA 2VIYA 5P81A 3QRSA 5P04A 1BIMA 5P5VA 2HPFA 5AHBA 2F81A 5P88A 1FEJC 5OZMA 5P73A 3UCBA 3GGUA 1B6KA 3UQWA 1LYWA 1EPOE 2R5QA 5OZYA 5P8CA 3OXWA 5KOSA 4Y5GA 2I1AA 4Y4DA 5P3NA 1IIQA 3VF3A 1ODYA 3L5BA 5P2ZA 4YA8A 4OBHA 5OZ6A 5IVTA 3LIQA 2PMAA 4Y3JA 3PMYA 2QZKA 1SMRA 2AQUA 5P85A 1K2CA 1DPJA 3LIXA 4I0FA 3LNKA 1EPPE 3T6IA 6FIVA 5P4OA 5P7UA 4Y3ZA 3D3TA 3OUBA 3UDKA 2FIVA 1GVWA 5IVRA 1XDHA 1D4YA 4B1DA 4R91A 1ZBGA 1TCWA 3K5CA 4B72A 1IVPA 4ZSMA 5P8RA 1E5OE 5AH9A 5P3IA 4ZLSA 1MVPA 5EZZA 1HIVA 4Y4BA 3DUYA 5OZ3A 5P5YA 4EPJA 2AVQA 1KJHA 5P5ZA 2B7FA 4RVIA 2PK5A 5P09A 4CPSA 5P2OA 5P4UA 1UPJA 3FIVA 1GNNA 1KJFA 5P01A 2ER9E 1RNEA 3FNUA 3L5CA 3WZ8A 5P24A 4MC6A 5P5QA 4HVPA 1MUIA 4EP3A 3K5DA 4OBKA 5P42A 5P6QA 3TPRA 5OYSA 5P5MA 5P49A 4OBJA 2PWCA 4ZSPA 2WF3A 1AIDA 4DJVA 1LEEA 3S7MA 1D4HA 4XXSA 1QDMA 5DQCA 4NJVA 1NSOA 2G27A 3R0WA 1LYAB 3EKPA 1T7JA 3PSGA 5P80A 2P3BB 3S8IA 5OZJA 4DQFA 2P3AA 4CPTA 5P41A 5P6DA 3NUJA 5P7LA 5P51A 4COEA 1SP5A 2QI1A 4OD9A 3PWWA 3O9LB 4Y3LA 1FMUA 1ODWA 5OZQA 2IDWA 5F01A 2HPEA 3CKRA 1TSUA 3U6AA 4YBIA 4YCYA 3DOXA 4ZPEA 1Q9PA 3NU6A 2XFKA 2WEZA 3GGXA 4Y5AA 3PVKA 4RYCA 2ER0E 5P86A 1B5FA 2B60A 4J0VA 4Y5EA 2O4NA 5P0TA 5P4DA 3NDTA 2ZJHA 5CLMA 5P31A 5OZPA 4GJ6A 3D20A 5P83A 5C9FA 1A9MA 3WZ7A 1QBSA 1HTEA 1K6CA 3SPKA 2OHTA 3EKVA 4Y37A 5P08A 3UDHA 4Y5BA 4XKXA 1F7AA 3KFPA 3PI5A 4OBZA 2PQZA 5BWYA 1MSNA 5P74A 1VIJA 4DQCA 5AH8A 1SDVA 2QD8A 4DJUA 2B8LA 4I12A 1EC1A 5P8LA 2ZHUA 3DV5A 9HVPA 3PRSA 2ZDZA 3PBZA 1XS7D 3OGPA 5OYWA 2O40A 2JXRA 5DR1A 5DQ2A 1KZKA 5P8EA 3TPPA 4Y4GA 1APVE 5P6CA 4CPQA 5P30A 1W5XA 5KR8A 2H6TA 3GI4A 3KFNA 4HDBA 4J0PA 5P6PA 6UPJA 3OHFA 1FFIC 3ZKGA 5I70A 4Y38A 1MT9A 4R8YA 1K6TA 4Y4ZA 3TKWA 2V12C 3S43B 5ISKA 1PSOE 4ZEAA 1SIPA 3TH9A 4D88A 5P1EA 2AIDA 3SA5A 2R3TA 5P25A 4NJTA 5P1RA 2RKFA 2IEOA 5CONA 5AHAA 1EPRE 3VF7A 1T7IA 3QROA 4TRZA 2QMFA 2G20A 2OAHA 2QI6A 3OGQA 1YG9A 2OHRA 2OHPA 4ZSRA 5P3BA 4Y3TA 1UH7A 3T11A 3UQRA 3R4BA 4R92A 4NPUA 1MEUA 3BUGA 1HVIA 5P54A 5J25A 2AOIA 3I25A 4EJKA 1HVKA 5HCTA 2Z4OA 5P67A 1RL8A 1MIQA 2OHKA 2QCIA 4Y47A 5P4MA 5OZ2A 1GKTA 2WECA 5P8IA 4MC9A 1ME6A 2AVSA 5P6VA 4FE6A 2R43A 5KQZA 1HBVA 2PSUA 3OADA 5DR7A 2Q15A 2CENA 3PI0A 2ER6E 5P64A 1QBTA 5P1OA 1C6XA 1KJGA 5P1TA 5P63A 1LV1A 1LYAA 2QI3A 3OUAA 3CIDA 4B78A 5HE5A 1FF0C 5P58A 4JECA 2G1SA 2P3BA 2VJ7A 1E81E 5FIVA 3PCWA 4A6BA 5P0BA 3O9HA 5P05A 3O9LA 4FRJA 5P7SA 1LF3A 4I8WA 5P7QA 5IVQA 2Z54A 1GVUA 4Y5MA 5P23A 4EJDA 5P3KA 4Q5MA 5OZ9A 5P0VA 2I4QA 1HTGA 4K4QA 2Q5KA 4I10A 3BXSA 4YE3A 3IAWA 2JJIA 5I3YA 3Q5HA 1HVCA 3OUDB 5P02A 5P6UA 1MSMA 5P3MA 5P4HA 5P7TA 3OQFA 4QJ2A 5HU1A 4J1KA 4Q1NA 1T6EX 1K1UA 3NDUA 3KMXA 5P6NA 2G1NA 1EBZA 3O9GA 4FS4A 2ZJIA 4EXHA 5P27A 4JPCA 5P7OA 2QI7A 2WJOA 5P3TA 5P4EA 2V10C 2V16C 5P2RA 4EHCA 4I8ZA 5P35A 5P3CA 5SZ9A 3SKGA 4I1CA 5P5FA 5P00A 2IL2A 5P61A 4Q1XA 5OZVA 1EEDP 4ER1E 2VIJA 3S45A 4Y4JA 5P6IA 5KR2A 3ZPTA 5JFPA 2IGYA 4EXGA 3QI1A 1NPAA 4APEA 5OYXA 2B42A 1K1TA 3S53A 2G26A 2G1OA 3HD8A 1WBKA 5P0ZA 2R8NA 1YX9A 3BXRA 2NR6A 1MRWA 1XE6A 5P1PA 1A8GA 5P4IA 5C9DA 4RRNA 2I4DA 5OZ1A 4Y4XA 5P6OA 5P5KA 5P6TA 3OXVA 5P3JA 5P5DA 1AJXA 5KQYA 3L3AA 4ACUA 2WF0A 5P1FA 2G24A 2VIEA 4GJCA 5HU0A 3EXOA 4PEPA 4U7QA 5P5BA 3CIBA 3QAAA 1M43A 5P3OA 2Q64A 1C6YA 3MSLA 2QD6A 2F8GA 3K1WA 4YDGA 2HIZA 5P2SA 3UDQA 5P4AA 5P7KA 6APRE 3KT5A 3SM1A 3LHGA 5HTZA 3FKTA 3K5FA 5P1LA 2QNQA 2RSPA 5P4VA 5SY2A 3EM4A 5HDVA 4FSEA 5P4WA 3QBFA 7UPJA 3EL0A 4Y3FA 1TQFA 4ZPFA 1E82E 4X7IA 5HD0A 5P4FA 2QHYA 3NYGA 2RENA 3VYDA 5ENMA 1FFFC 3CYWA 3SA8A 4DJXA 3UDRA 2ER7E 2WEBA 2AVVA 1TZSA 3U71A 4RCFA 5P8UA 3KYRA 1AVFA 2CEJA 3QVCA 4Y5CA 4EJ8A 3NUOA 5P0SA 1HEFE 5DGUA 4CPWA 5P82A 2Q55A 5P1JA 5P8OA 3PWMA 4YD3A 5P7ZA 1BDLA 3HW1A 2R9BA 3EM3A 2AODA 4HE9A 3OQ7A 4YCTA 2R3WA 2J9KA 4K9HA 3FSMA 3OUDA 1RV7A 2BPYA 3O9IA 5OZNA 1FG6C 4DJQA 4DV9A 5P1QA 1HIIA 4Y4WA 4B1EA 2UXZA 5P76A 5P77A 4L1AA 5P46A 3BUFA 5P5XA 1D4SA 5P57A 5P1HA 4K8SA 2QI4A 5P4ZA 3O9DA 1EPLE 2G69A 5P7VA 3SA3A 5KQXA 4RRSA 4OBGA 4IVTA 3QS1A 4ZSQA 2FDPA 3Q3TA 5P8MA 4QJ6A 3RTHA 5P4CA 2WEDA 4YHQA 4YOAA 5P48A 5P3QA 2FXDA 5ER2E 2ZJLA 3DJKA 3OOTA 3INDA 2AZ9A 2F3KA 3L59A 5P5GA 4Q1WA 1PROA 1QS8A 5P4PA 4QGIA 1XL2A 4RLDA 3GI5A 3APPA 1OHRA 2P83A 4H3FA 3MSKA 1TSQA 4Y3QA 4RCDA 5P0MA 3Q70A 3ZKXA 4YCKA 2F80A 5P8FA 5P2GA 1EPME 1B6LA 3QRVA 2V13A 3OHHA 5P13A 2V11C 1DAZC 5P7IA 3SO9A 4Y3RA 1HEGE 3IXJA 1SBGA 1HXWA 3VYFA 3OU4B 2G94A 1QBUA 3QIHA 4BFDA 5PEPA 3TLHA 3AUPA 4J1EA 4ER2E 4DQBA 3RSVA 1KJ7A 5P2VA 3GW5A 1HVHA 3EC0A 2R38A 5P4GA 4Y57A 4Y3SA 3TPLA 1HHPA 1SIVA 5P1VA 3O9FA 1LYBB 4JPEA 3LIYA 2HM1A 5AH7A 3OADB 5P5EA 5OZBA 5OZIA 1FQ7A 5SXNA 1FQXA 3OTSA 4B1CA 4TVGA 2WHHA 5P6RA 1XN2A 5P0FA 2QZWA 4CMSA 4Y3XA 4EQJA 2AVOA 1AM5A 3D1XA 1PPME 3SA4A 2QZLA 5P0XA 2PWRA 1GVXA 2QAKA 4RCEA 5P66A 4DQEA 1PPLE 3S7LA 4Y4AA 1QRPE 3UQXA 5E5JA 3CKPA 1MPPA 1NH0A 3TOFA 1T6GA 2CEMA 4CP7A 5P2BA 4DJWA 5OZXA 4D83A 4GIDA 5P8VA 1IZHA 5OZ5A 3INHA 5OZ8A 5P5LA 3NLSA 5OZ7A 3LZYA 3IVIA 2NMZA 3UPJA 1YTGA 3BGBA 3KN0A 4WY6A 4KUPA 5P5CA 3BRAA 5P0HA 4E43A 1ZJ7A 3BC4A 1RQ9A 2BKSA 5KR0A 5P2EA 1W6IA 2ZJNA 4Y5PA 4M8XA 5P40A 5DQ5A 4Q1YA 3OU3A 1APTE 2UPJA 2EWYA 3VF5A 5OYRA 4GMIA 4JOOA 1M0BA 2V0ZC 3K4VC 1MERA 2ZHSA 5P26A 2AOEA 3EKQA 1XE5A 5I3WA 2IRZA 4D8CA 5P8PA 3R1GB 2PH6A 1M4HA 5DR8A 5P71A 4Z4XA 1B6PA 5P52A 3LPKA 3IVHA 4LC7A 5P79A 4B00A 5P6BA 1ZSRA 1PFZA 5OZSA 2XFIA 4Y5LA 1B6MA 1MESA 2RMPA 2JJJA 5P1AA 3NU3A 5P6HA 1BXOA 3CICA 5HDXA 1N49A 1FMBA 2G22A 5P6AA 3ZKQA 2NTRA 3H0BA 3NDWA 5P3EA 5P78A 4I0EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2VNM A;  5P0A A;  1FIV A;  1NPW A;  3PSU A;  3UDM A;  5P7R A;  3PWR A;  3FNS A;  5P1C A;  3LPJ A;  5P2M A;  2PYM A;  1BVG A;  5P44 A;  1IZI A;  1ZAP A;  2AOF A;  5P1N A;  1C70 A;  1LF4 A;  3LIZ A;  3K5G A;  3SLZ A;  4LBT A;  3HAW A;  1A30 A;  5DQ1 A;  1YM2 A;  5P53 A;  5P2N A;  3S85 A;  1TCX A;  5OZA A;  1W6H A;  3DK1 A;  5BRY A;  5P5T A;  2HS1 A;  5P55 A;  4R93 A;  3N3I A;  2BJU A;  4KE1 A;  4EWO A;  4FAF A;  2UY0 A;  5P6L A;  3LZS A;  4AUC A;  5EZX A;  4MC1 A;  2IKU A;  5P2H A;  4AZY A;  3T3C A;  4XX4 A;  1ENT E;  1XN3 A;  1SDU A;  5TOL A;  1HVR A;  5P8H A;  4I0I A;  4HEG A;  5P3Y A;  3NWX A;  3APR E;  2QI0 A;  1OEW A;  2SAM A;  5P10 A;  1G35 A;  4ZPG A;  5P5N A;  4PZW A;  1G0V A;  4I0Z A;  1MTB A;  3A2O A;  5P2I A;  4KE0 A;  1LYW B;  4YDF A;  4GJB A;  1AZ5 A;  2VIZ A;  1GNM A;  1OD1 A;  3VSX A;  5P5J A;  4FLG A;  2B8V A;  2PK6 A;  4Y3P A;  5P5W A;  5T4S A;  1J71 A;  4Y51 A;  4B77 A;  3LZV A;  4Y4U A;  5P3W A;  5P8Q A;  1JLD A;  3OQA A;  4RGH A;  5P69 A;  1FQ4 A;  4Y56 A;  4FM7 A;  1ZTZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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