4RYGA

Renin in complexed with n-({(3s,4s)-4-[(benzylsulfonyl)amino]pyrrolidin-3-yl}methyl)-4-methoxy-3-(3-methoxypropoxy)-n-(propan-2-yl)benzamide inhibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
339
structure length
336
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title trans-(3S,4S)-Disubstituted pyrrolidines as inhibitors of the human aspartyl protease renin. Part I: Prime site exploration using an amino linker.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 336
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2014-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rygA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rygA01
2WF3A 5OZVA 5P35A 4A6CA 4OBDA 4B78A 3OOZA 4DQCA 4Y56A 5P7SA 2Q55A 4Y53A 5P8AA 2O40A 4H1EA 4GJ6A 1GKTA 5AGZA 4B70A 4JECA 5P51A 3QP0A 3FX5A 4FL8A 5OYWA 3I6OA 4A4QA 3PSGA 5P6SA 4RVXA 1XE6A 4K4PA 5JFPA 3VYFA 2BKTA 2J9JB 2F80A 4Y38A 3B7VA 5KQFA 3O9BA 2PH8A 1MSMA 5P0KA 2QHCA 5P4BA 5P7XA 5P6RA 5OZKA 1NSOA 2PH6A 2VIZA 5DQ1A 4Y3NA 1ME6A 3GI4A 4B00A 5P43A 2ZHTA 2JXRA 3OXWA 5P25A 1Q9PA 5P48A 2V0ZC 2CEJA 4FIVA 3OU4A 3TPLA 1KJGA 3UDMA 5P1CA 4Y4ZA 3VLBA 3NWXA 5P7AA 5P1BA 5SZ9A 3T11A 1DPJA 3INEA 5P7MA 3KFSA 5P7GA 2P83A 2NXMA 5P4GA 3KMYA 3O9EA 2ZJIA 5OYVA 5P8PA 2ZJMA 4Y47A 5IVQA 3OU1B 3VFBA 4COEA 2O4PA 5P5XA 4Y5BA 5P6QA 5P04A 5T4SA 2JJIA 4EQ0A 4Y3FA 1MTBA 4RYCA 5P7OA 5P55A 2AOEA 5AH7A 3UF3A 5KAOA 4J17A 4Y4BA 4YD5A 3KA2A 3UDNA 1FB7A 1FMXA 3WB5A 5P14A 4KE1A 5P3GA 3IN3A 4U7QA 2QI7A 4D89A 5P75A 2BPWA 3SA9A 2QHYA 1MTRA 4ACXA 4ER1E 5P74A 2P4JA 4YCKA 1EPLE 4F75A 5P2KA 3NUJA 1QDMA 3HAWA 3OUDA 3TOHA 3IXKA 3ZPSA 4WY1A 3DJKA 2R38A 3VV7A 3ZPUA 4Y5AA 2G21A 4TVGA 4M8XA 3ZKIA 4APEA 5P8FA 5P1DA 2H6SA 1LF3A 4R93A 1FQ4A 5P4FA 1HTRB 1B5FA 2AOIA 5P2UA 1G6LA 1FFIC 3WZ6A 3HDKA 4KUPA 1BXQA 5BWYA 4XXSA 3VG1A 3KN0A 3CKRA 2OAHA 1FG6C 1E81E 3G70A 1B6LA 5P6AA 3EKXA 4Y37A 1EPPE 5DGWA 5P63A 5P28A 5KR1A 4ZSRA 3OADA 3SA3A 4Z50A 4HDFA 4M8YA 3UDQA 5P6ZA 3EBZA 4JPCA 1AJVA 3PBDA 5P4PA 1HVRA 1B6JA 5OZOA 1HIIA 3D1XA 5OZJA 1IVQA 3G6ZA 3R2FA 1K2CA 5P8RA 3D20A 3SPKA 5P15A 3SA4A 2PWCA 2ZHVA 5P7QA 3L38A 1LZQA 4GJAA 3KFNA 1D4SA 3O9DA 3TPRA 5OZLA 1MESA 1PPKE 3Q3TA 1C70A 2OHLA 4NJSA 5P6TA 1A30A 1FQXA 4YOAA 5P16A 4IVTA 1NPVA 4J0TA 3LIQA 4CKUA 2B60A 5P5FA 5P76A 2FLEA 2I0AA 1D4JA 2ZHRA 4XX3A 4B1CA 2G26A 3ER5E 3I8WA 4BFBA 4OBGA 5IVTA 4LC7A 5HVPA 3JVWA 2VNMA 1QBTA 5KQXA 4JP9A 5P3ZA 5P6HA 1HXWA 1W5VA 4DJYA 5P09A 2FDDA 4RZ1A 3H0BA 1F34A 3VF5A 5OZRA 4AA8A 2R3TA 3TOGA 3ZPTA 3TTPA 5P5CA 1HSHA 1EPOE 2P3BB 2SAMA 5P83A 5P3MA 2XYEA 1ODXA 1UH7A 5P0QA 3ZKXA 5P2SA 3NDTA 2OHPA 4HE9A 1Z1RA 2QNNA 1YX9A 5OZ5A 2QI3A 3IXJA 1MRWA 2I1AA 3D91A 1LS5A 3DCKA 2QCIA 5P6OA 1BWAA 2MIPA 5P6IA 4Q1XA 3UTLA 3K5DA 1DAZC 1HIHA 2FXDA 5P7IA 3TL9A 1C6ZA 4ZPEA 5P1JA 4RCDA 3WZ8A 2BPYA 4YA8A 5P0ZA 3F9QA 3KF0A 4OD9B 4Y5PA 5I70A 2APRA 5P3LA 3EC0A 4Y3AA 4NJVA 5ER2E 5P2MA 5KOQA 2G1NA 2O4NA 2NR6A 5P23A 5P4VA 3S56A 3PVKA 4AA9A 4OC6B 2VS2A 1HSGA 5C9DA 3INHA 1QS8A 4DQBA 4Y51A 3SABA 2PSVA 4EQJA 4Y4GA 3SA5A 4CP7A 2HIZA 4GZFA 4UPJA 1TQFA 2VIYA 3TKWA 1BV9A 4Q1NA 5AH6A 5P8HA 1TCWA 3TH9A 4YDFA 3DOXA 3R1GB 3EKYA 5B18A 4TRWA 3EKWA 5P37A 5OZCA 5P1FA 5DQ5A 4LBTA 2VA6A 5P6UA 5P5MA 1CPIA 2VA5A 1FQ7A 2QMPA 5P19A 2NMZA 2NNPA 5P2EA 5P7CA 4I0ZA 4Y54A 5ENKA 4OBZB 5OZHA 4DJUA 2ER6E 3ECGA 5HU0A 5P39A 5ENMA 4CPRA 2R3WA 5P07A 4YD7A 1HVSA 5P3IA 4Q5MA 5DQCA 1PSNA 4J0YA 1F7AA 5P65A 3UDKA 3HBOA 5P72A 3HW1A 3OY4A 5APRE 5AHAA 1MUIA 5P3BA 3UFNA 4Q1WA 1MERA 5P24A 1DMPA 5P4OA 5OZ1A 2QU2A 3H5BA 1W5WA 5COOA 2AOHA 4Y3SA 3MXEA 5OZMA 5P2AA 2FDPA 5P86A 3VSWA 5P69A 2OHMA 3M9FA 1AXAA 5P1NA 3Q6YA 3K5GA 2R9BA 2AOFA 5P4HA 4Y3RA 1N49A 3S8IA 3PWWA 3PCWA 3S43B 5P5YA 1C6YA 3PGIA 4FLGA 2QI0A 3VFAA 4J0ZA 5P3TA 1B6MA 2HS2A 4OBHA 1A94A 5P1UA 5HU1A 2AQUA 4YOBA 1LF4A 2RSPA 1SIVA 3OQAA 3R4BA 4FM6A 3OXXA 4HZTA 1KJFA 5P8BA 4YBFA 2IL2A 5P1SA 1E82E 1U8GA 5P5TA 3FKTA 2EWYA 4LAPA 3URIA 2AZCA 5OZ0A 5I3WA 1K6PA 4B1EA 2ZHUA 4L1AA 3TOFA 3ZL7A 3OQ7A 5P1XA 3ZKMA 3EL4A 3PBZA 4YD6A 1MRXA 4N00A 4PZWA 3O9GA 5P5KA 4DQGA 1VIJA 1B6PA 1ZP8A 4FRIA 5P2HA 5HDXA 5KR0A 4Y50A 4I8ZA 2WF0A 5P3EA 5F00A 5P2DA 3L58A 3ZKNA 1BDRA 5P3HA 2ZJJA 1XN2A 3LZYA 1HIVA 1HTGA 5P08A 3LHGA 3NLSA 3GGVA 2G22A 2FMBA 2WKZA 2QZLA 3UPJA 1SBGA 1RL8A 5P8QA 1Z1HA 5P81A 3GGXA 3NDWA 1HVJA 3TPPA 2R8NA 1T7IA 3EL9A 2XFIA 3BXSA 4DJOA 3HLOA 2OHTA 2NXLA 3APPA 3NU6A 5P5ZA 8HVPA 4WY6A 2WEBA 2QHZA 2QD7A 4CPTA 3KMXA 2BKSA 5P2FA 2OHQA 4ZPFA 5P3DA 4Y39A 1UH8A 5P71A 1LYAA 1HPSA 5P3AA 4FSEA 1TW7A 5P31A 1GNNA 5E5JA 5P30A 3BHEA 1B11A 5P80A 2IENA 3A2OA 4I0JA 4PEPA 1SDVA 3CIDA 5IS4A 5P0DA 1EAGA 1BVGA 1M43A 2IGXA 1LEEA 1ER8E 1J71A 3O99A 5P1ZA 1IBQA 5P5QA 4Y3DA 4Y6MA 2B8LA 7UPJA 1K1UA 3LPKA 1MVPA 3OK9A 1FGCC 5HCTA 1ZAPA 2FNSA 5P1EA 4YD4A 1EBWA 1EPQE 4CPUA 5ISKA 5P0WA 1BBSA 2OHNA 5P6XA 4K9HA 5P70A 5P06A 4I0DA 3SA7A 1D4YA 4Y3TA 3QBFA 3WZ7A 2OHRA 5P0IA 4Y9WA 5P3NA 5P3YA 5OYQA 3CKTA 1GVUA 3EKTA 5P0RA 3I2LA 3DM6A 5P0AA 3B80A 4RVJA 4H3FA 5P5HA 3CICA 5E5KA 1WBMA 1BVEA 2V11C 1AM5A 5P42A 3SKGA 5P3PA 1MT7A 3OUAA 3QPJA 2R43A 5P8SA 5P5SA 3T6IA 4EXGA 5P1RA 1ODYA 4R95A 3UDPA 4FAFA 4Y3MA 5P8OA 2HB2A 1HXBA 5P02A 2VIJA 5P7HA 3U71A 5P85A 3SA6A 1YM2A 4MC9A 3PI0A 5OZ8A 2ZJLA 5P0PA 5P5LA 5SY3A 3NXEA 4ZEAA 3T3CA 3HZCA 3RSXA 2WEZA 2J9JA 4J1CA 1BAIA 1QBSA 1CMSA 5P8JA 2AZ8A 2HS1A 5P1IA 4Y3QA 4Y35A 3LIVA 5P1OA 5P7LA 3UDJA 2VJ7A 4B72A 1ZBGA 4I8WA 5KQYA 3LIYA 5OZAA 7HVPA 5P64A 4CPXA 4HDPA 3JVYA 3PJ6A 2RENA 5P4IA 5HE4A 2H6TA 1ZLFA 2JJJA 5P62A 3LNKA 1C6XA 5P6DA 1D4IA 4NJTA 5P6FA 2ZGAA 4OBJA 2R5QA 3EKVA 3RTHA 1XN3A 4J55A 3OTYA 5P88A 2O4SA 3NXNA 2QI5A 4GB2A 2QP8A 4DI2A 3FV3A 4Y48A 1CZIE 4Y5NA 5P4WA 3AIDA 2P3CA 5P41A 5P79A 1YM4A 3ZOVA 3OUBA 3NU4A 3KDDA 3UDRA 4DJWA 1HWRA 3OU1A 5P38A 4H3IA 4EJDA 5P5EA 6UPJA 1A8KA 5COPA 2BPZA 1W5YA 2BBBA 3S7LA 3PEPA 4RCFA 2HC0A 5P7UA 1YG9A 4CPWA 5P8GA 3OTSA 4Z4XA 3HVGA 4RLDA 4CPQA 2ER7E 4ZE6A 4A6BA 5P4NA 3URLA 2HPEA 1AAQA 3KFPA 5COKA 5P2ZA 3VF3A 5P4ZA 3HD8A 5C9BA 5P0NA 4GYEA 3OAGB 5HE5A 1ZJ7A 1B6KA 3NYGA 4YHQA 4WTUA 3GI6A 2XYFA 3IVIA 3PLDA 4YD3A 3T7PA 2AOGA 5P58A 5P5PA 1APUE 3DUYA 3OWNA 2IGYA 1E5OE 4GJ8A 5ER1E 5P4XA 2WJOA 2QI6A 2QNQA 4RCEA 1GVVA 5P7JA 3S85A 4QGIA 5P1PA 4Y57A 2FXEA 2QU3A 4Y44A 4Y5KA 4TRZA 4Y4AA 4ER2E 5P0VA 2HPFA 2I0DA 5EZXA 1PSAA 3UFLA 5P3QA 4U7VA 2Q15A 5OZSA 4Y5MA 1A8GA 2WL0A 4I0FA 2PSUA 4EXHA 3Q70A 3BUGA 2QMGA 1ZSFA 1APTE 2PYMA 3OXCA 1D4HA 2QAKA 4LXMA 1BV7A 1XL5A 2B42A 2I4WA 5OZGA 4FM7A 1LYWB 3OQFA 4Z22A 1SIPA 3PSYA 4KB9A 1K6CA 2CENA 5AHCA 3OXVA 5OZ6A 1FG8C 3D1YA 4R5NA 2ZJHA 4I10A 5OZNA 3PM4A 4FS4A 5P2NA 1TZSA 5I3VA 3VCMA 5P18A 4D83A 4ACUA 2NNKA 1FF0C 1OEWA 3Q5HA 4LXKA 3DK1A 4Y45A 5P87A 3K4VC 1AJXA 4EWOA 5P33A 2QD8A 5P4TA 3PMYA 4DJPA 3BGBA 1XL2A 5P3OA 3K5FA 1XE5A 1TSQA 1XDHA 1G0VA 2ZE1A 5P0UA 3IAWA 4Y3JA 2JYSA 3QRVA 5P60A 4FRJA 1MEUA 4QJAA 3RTMA 1PFZA 5OYRA 4CPSA 5P78A 5P61A 5P01A 4MC1A 2UXZA 5IVSA 4YCYA 5DR8A 2ZJNA 3GGUA 4RROA 1ZPKA 4J0VA 4XX4A 5P67A 3BUFA 1NH0A 5P0FA 3EL0A 5P6NA 3VV8A 5P2GA 4EJLA 5ISJA 5PEPA 4ZSPA 4HVPA 2AVQA 2P3BA 5P6CA 3S7MA 5OZZA 2F81A 4Y4TA 3L5CA 4J1HA 5P3UA 2XFKA 3BC4A 3CKPA 5P17A 1FQ5A 2XFJA 1FFFC 2ASIA 4J54A 3O9CA 3OUCA 4DPFA 3ZKQA 2I4UA 1DIFA 1HSIA 2ER0E 5P6WA 1VIKA 5P13A 3LINA 3EM6A 5P2OA 5P45A 4B77A 1EPNE 5OZTA 3TNEA 3KM4A 5P5OA 2OF0A 4Y3PA 4I12A 5JODA 4NPTA 3JW2A 4F74A 2VJ6A 4OD9A 5P7VA 3HAUA 5P5AA 1IIQA 1K2BA 1BIMA 3CIBA 1MT8A 4R91A 5P84A 4AZYA 3OGQA 1LYBB 5P0JA 5P8LA 5P0SA 2G94A 4OC6A 2VIEA 3RVIA 4DQHA 3O9LB 4R92A 5P6LA 1FMUA 1SMRA 4K4RA 1RPIA 4K8SA 4Y4XA 3EXOA 3NR6A 5DR4A 4H3JA 4FAEA 1G35A 3O9AA 2PMAA 4Y5CA 2FIVA 4EP2A 4Y3YA 4Y4JA 4KE0A 1DP5A 3KDCA 2IQGA 2B7FA 5DQ2A 4FRKA 4Y5GA 2IDWA 5IVRA 5DR3A 2AOJA 5P8DA 5P66A 3SLZA 2IEOA 5P1AA 1FQ8A 2I4XA 5P8VA 1UPJA 2AODA 2QI1A 5P82A 5UPJA 2O4KA 2OHUA 4Y3WA 5OZIA 3CYWA 5OYYA 3NU3A 4YE3A 4OBZA 2HB3A 1FIVA 5P5DA 4Z2ZA 2BQVA 3SAAA 3RU1A 5OYUA 3VF7A 4J0PA 2V00A 2RMPA 5P6JA 5P6BA 4RRSA 3BVBA 3LITA 4ZIPA 4DQFA 3Q4BA 4GMIA 3QAAA 4LHHA 1KJ7A 2WHHA 4BELA 1HPXA 1PROA 3FNUA 5P8TA 1GNOA 1MIQA 1UH9A 5P1MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WF3 A;  5OZV A;  5P35 A;  4A6C A;  4OBD A;  4B78 A;  3OOZ A;  4DQC A;  4Y56 A;  5P7S A;  2Q55 A;  4Y53 A;  5P8A A;  2O40 A;  4H1E A;  4GJ6 A;  1GKT A;  5AGZ A;  4B70 A;  4JEC A;  5P51 A;  3QP0 A;  3FX5 A;  4FL8 A;  5OYW A;  3I6O A;  4A4Q A;  3PSG A;  5P6S A;  4RVX A;  1XE6 A;  4K4P A;  5JFP A;  3VYF A;  2BKT A;  2J9J B;  2F80 A;  4Y38 A;  3B7V A;  5KQF A;  3O9B A;  2PH8 A;  1MSM A;  5P0K A;  2QHC A;  5P4B A;  5P7X A;  5P6R A;  5OZK A;  1NSO A;  2PH6 A;  2VIZ A;  5DQ1 A;  4Y3N A;  1ME6 A;  3GI4 A;  4B00 A;  5P43 A;  2ZHT A;  2JXR A;  3OXW A;  5P25 A;  1Q9P A;  5P48 A;  2V0Z C;  2CEJ A;  4FIV A;  3OU4 A;  3TPL A;  1KJG A;  3UDM A;  5P1C A;  4Y4Z A;  3VLB A;  3NWX A;  5P7A A;  5P1B A;  5SZ9 A;  3T11 A;  1DPJ A;  3INE A;  5P7M A;  3KFS A;  5P7G A;  2P83 A;  2NXM A;  5P4G A;  3KMY A;  3O9E A;  2ZJI A;  5OYV A;  5P8P A;  2ZJM A;  4Y47 A;  5IVQ A;  3OU1 B;  3VFB A;  4COE A;  2O4P A;  5P5X A;  4Y5B A;  5P6Q A;  5P04 A;  5T4S A;  2JJI A;  4EQ0 A;  4Y3F A;  1MTB A;  4RYC A;  5P7O A;  5P55 A;  2AOE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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