3Q4BA

Clinically useful alkyl amine renin inhibitors
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
337
structure length
337
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Discovery of VTP-27999, an Alkyl Amine Renin Inhibitor with Potential for Clinical Utility.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 337
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3q4bA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3q4bA01
3KFNA 4DQEA 2IDWA 3Q70A 3HDKA 4Y47A 1HTRB 5KOQA 2XYFA 2R3WA 5P7PA 5P38A 2HB3A 3VLBA 1AAQA 2F80A 5P00A 5P5GA 5DR8A 1HSHA 4YDFA 2B60A 5P1ZA 4L7JA 5P5RA 5P3FA 3EL0A 5P0FA 3ZKXA 2PK6A 4FSLA 4ZPEA 5P7OA 3LZSA 5DQ1A 5P3WA 1UH8A 4I0HA 5HDVA 4TRZA 4GJ6A 1M4HA 2VKMA 3TOGA 4J17A 2WECA 3TKGA 5OZQA 5P57A 1FFFC 3EKPA 4Y3QA 5P01A 4D89A 4JOOA 3EL1A 1ZAPA 5OZZA 5P3PA 3SM1A 1YM2A 3VV8A 5P20A 3OK9A 5P8UA 2BPWA 2ASIA 5P4HA 4R92A 4Y36A 5P7MA 3VUCA 3NUOA 1IVQA 5P7RA 4Y56A 2ANLA 1LF3A 3IXJA 4YD5A 3SA6A 1GVVA 5OZLA 5OZUA 5P30A 4D88A 1NPVA 1FQ7A 3A2OA 1CPIA 3BRAA 2NNKA 5P2UA 1B6MA 5P4AA 3UDHA 5P8AA 3UQXA 5AGZA 5P8JA 1FGCC 3L5BA 3N3IA 2QI6A 2G21A 3LIXA 1EBYA 5OYRA 5P7XA 3GW5A 1XN2A 3R0YA 1HXBA 2QZWA 5OZCA 3OUAA 1HPXA 2I4VA 3LITA 2AOJA 4LL3A 4CPRA 1AXAA 5P43A 5P56A 5KAOA 3VLAA 5P7KA 3GGUA 1HRNA 5P8LA 5DR3A 1LF2A 5P2ZA 2AVQA 5P0GA 1B6KA 4DQGA 2OHUA 4HDBA 4PYVA 5P5LA 2I0DA 1BVGA 3DCKA 4Y4EA 1LYWA 3RTMA 5P6YA 3OUBA 5OYQA 1MT9A 4FLGA 2QD7A 4Y44A 4Y3RA 1XL5A 5P87A 4ZSRA 4KE0A 4ZEAA 4Y4GA 1RQ9A 1XE6A 5HCTA 5P40A 5OZNA 5P0YA 4LXAA 2NNPA 4U7QA 5P24A 1MRWA 5P2DA 4ACUA 3U71A 1LYWB 5P27A 3D20A 3UDYA 4Y5LA 2JJIA 4J1CA 1MIQA 4CPTA 5OYTA 2VNNA 4EQ0A 1K6CA 1Q9PA 5P7VA 3LZYA 3T11A 4Q1WA 2VA7A 2IGXA 3TTPA 4FAFA 3BXRA 4CPSA 1HVIA 3FNTA 2FIVA 4DPIA 1XE5A 1G6LA 4GZFA 5P8HA 1SP5A 5DR4A 5P63A 1E81E 4DJUA 3O9IA 1GNOA 5OZ4A 5P2QA 4GJ8A 2OHRA 5UPJA 1GVWA 1ZLFA 3FV3A 5I3VA 1HTEA 1Z1RA 1J71A 1ER8E 4OBZA 1BXQA 5OZOA 1YTJA 5P3VA 4I0IA 3VYDA 2VA5A 1HXWA 3M9FA 5P8CA 4PPHA 1BILA 3URIA 4D85A 1SDVA 5P52A 3ER3E 4RCFA 3OQFA 2ZE1A 4YCTA 4I0ZA 1HVSA 4Y3SA 3BUGA 5SXNA 5KR8A 1K6PA 4DI2A 4OBZB 3PWMA 1HIVA 5P4RA 3HBOA 3DK1A 4Z50A 4R91A 3WB5A 5P11A 2FDPA 5HDUA 3K4VA 4R93A 5P33A 2OHKA 5OZPA 5P48A 5P22A 4MC2A 2OHPA 5P74A 5P7BA 3K4VC 5P8MA 2QI1A 1EPPE 1EBWA 3QRSA 1WBMA 3NDXA 3SKFA 1HSGA 1HVCA 4J5JA 3QROA 5P13A 3IA9A 5OZTA 5P1FA 3ZLQA 1TSQA 1BV9A 1RNEA 5P5KA 4Y57A 4B00A 5P5UA 4DJXA 4ZIPA 1KJFA 4U8WA 3L38A 3LIVA 1LYAA 2ZGAA 4FM6A 5P09A 5P84A 4OBGA 4Y58A 3VYFA 5P6SA 4M8XA 1FQ4A 3HLOA 5P8VA 2F81A 3DOXA 5COPA 4I0DA 1D4HA 4CP7A 5OZGA 3O9DA 5P58A 4J0ZA 4J55A 4DVFA 4J1KA 5DQ5A 4PEPA 2BPXA 8HVPA 3BUFA 5P50A 4Y53A 5P0XA 5P28A 1AM5A 5P1EA 1MT7A 5P1XA 2F8GA 6APRE 1GVXA 1XS7D 3EL5A 4TVGA 5ENMA 5P7LA 3QBHA 2QMDA 2PWCA 1W6HA 3KA2A 5HCOA 2IGYA 5P5FA 4EWOA 5P6GA 4OBKA 4RZ1A 5JFUA 4A6CA 3OU1A 5P65A 4Y3WA 5P0TA 1HWRA 1OEWA 3WB4A 4H3IA 5HVPA 2I4DA 5P5QA 2VIJA 5P6QA 3PMYA 4EYRA 1B11A 1GKTA 2VA6A 1UPJA 4GJAA 5P2EA 3DV1A 5P5HA 2WF0A 1HVHA 3S7LA 2VJ9A 5P2NA 4APRE 4Q1NA 4YBIA 5OZ5A 3MXDA 5P07A 5P6KA 1EPQE 3WSJA 1QBUA 3O99A 2P3BB 1EC1A 2V16C 2XFJA 4Y9WA 4OBFA 3ZKGA 4MC6A 4WY6A 5P7NA 2J9KA 5P5MA 3QRVA 1OHRA 3OOZA 3FX5A 5P3KA 3UDPA 5P5IA 3OGQA 3VF7A 1PSNA 3CKRA 4LC7A 3RU1A 4EXGA 3GGXA 3UDJA 2ZJJA 3BUHA 5P04A 5P51A 5P47A 2Q54A 4RCEA 4UPJA 1HIHA 4YBFA 5OZYA 4DJWA 1HVRA 5FIVA 4Y5EA 4H1EA 1ODWA 3PI5A 2QK5A 3SKGA 2VNMA 1D4LA 3L3AA 5P8IA 2FDDA 5P1PA 1SH9A 1FLHA 2FS4A 1TCXA 2Z4OA 2P3DA 4BFBA 1FMBA 4GIDA 1ENTE 2CEJA 3C9XA 3URLA 1MTRA 2G27A 4EHCA 2BKSA 3S43A 4Y39A 2WEDA 2ER6E 5HDZA 2AOFA 2VIYA 1CMSA 4J0PA 5OZIA 2B7ZA 3QAAA 5P61A 2WHHA 4Y4WA 3KF0A 4F73A 4NPUA 4Y35A 5P4UA 1ZPKA 4EP2A 4WY1A 2G20A 5P0NA 4DQCA 1FQ6A 3S43B 3CYXA 1SIVA 3QPJA 4GB2A 3G72A 2I4QA 2ZDZA 3QS1A 4GJ5A 3EM6A 3L5CA 3R4BA 5P2FA 5P8BA 5DPZA 3UQUA 2XYEA 1A8GA 3UPJA 2QZLA 3NSHA 4Y51A 3B7VA 1VIKA 5P4MA 5P0QA 5P4DA 3OGPA 5ISJA 3RSXA 5P1QA 4QLHA 5P05A 5P2AA 5P5TA 5P4CA 2HAHA 2HM1A 3GI5A 5OYXA 5P1LA 3SPKA 1WKRA 2OF0A 4FIVA 3EKWA 3T7QA 1YTHA 5P7TA 3OQAA 5OZKA 1C6XA 2IEOA 4Y5BA 5ER1E 1PSOE 4EPJA 5P8DA 5P6HA 1LS5A 3INFA 3JW2A 2BQVA 5P0VA 2ZJLA 2A4FA 2HS2A 1DW6C 3IGBA 3PCWA 3KM4A 5P02A 5HU1A 2IKUA 1YTIA 4Y5KA 4JP9A 1B6PA 2QI0A 5P39A 2B42A 1HBVA 3D91A 3S7MA 1SDTA 4EQJA 1T3RA 5P37A 2VJ7A 1XN3A 3QBFA 2O4PA 3O9GA 4CPWA 4F76A 3PSUA 2AOIA 5P6ZA 4Y3PA 4YD3A 3CKPA 4H3JA 2AIDA 5P0SA 1B6JA 2BPYA 5OZ1A 2J9JB 1ZPAA 1BBSA 3F9QA 3EKTA 2IRZA 4YD4A 5P53A 3EKXA 3L59A 2R9BA 2WEZA 1A94A 2JJJA 5P3NA 2PC0A 1W5WA 4Y3DA 1AJVA 1IZHA 3SACA 1XDHA 4MC1A 1ZP8A 2R5PA 5P3BA 3EMYA 3R0WA 5P3DA 3G70A 5P2VA 3PHVA 4Y3AA 4GJDA 1QRPE 3B80A 4GJCA 2HB4A 2ZHRA 3KMXA 4Y5CA 3MSKA 5AHBA 3PRSA 3TPRA 4R8YA 1MPPA 5P4EA 3HW1A 2F3EA 4QJ6A 4I10A 3O9BA 1LF4A 4J0VA 3LIZA 3ZKMA 5P7SA 2AVMA 5P3AA 3EM4A 1D4JA 5HTZA 3S45A 3ZL7A 2V00A 1YG9A 4IVSA 4XKXA 4I1CA 1HEGE 4ZSMA 3SA4A 2P8HA 2P83A 5P70A 3NU9A 2F3FA 4Y3LA 3PLLA 2FXEA 1G35A 2FNTA 3L5EA 2G94A 5P5ZA 5P6XA 2QMPA 2ZHUA 2PK5A 5P1SA 5BS4A 5AH7A 4Y48A 2RENA 2AZBA 1OD1A 5P1WA 5P0LA 3FSMA 3BHEA 1ZSRA 5P7JA 3KT5A 1BIMA 1JLDA 3SABA 1EBKC 5HE7A 5APRE 2ZHTA 2V0ZC 3OADA 5P5VA 1FEJC 3TOHA 2Q11A 5P3TA 5KR0A 5HU0A 5KR2A 1A30A 5P2WA 3OAGA 3NYGA 5SY2A 5ER2E 5TOLA 4RCDA 2H6TA 1E80E 5HE5A 1W51A 4L6BA 3EXOA 4TRWA 5P1MA 3Q6YA 5P8EA 1EPRE 1YM4A 3NXEA 4J1FA 2FGUA 2HPFA 2NXLA 5EZZA 4Z2ZA 3OAGB 4I12A 2ER0E 4Y3ZA 1KZKA 5P2SA 3FNUA 4DJQA 4YOAA 4OC6A 4QJ9A 5COOA 2RMPA 3O9CA 1K1UA 2ZHSA 1IIQA 1BAIA 1FQ5A 4LXMA 3D1ZA 3OTYA 4RRNA 3UFLA 3DM6A 3WZ8A 2AZ9A 4EJDA 3DCRA 2O40A 4I0GA 3UQPA 3GGAA 2G26A 4I0EA 1FIVA 2ZYEA 3Q4BA 3LIYA 4WTUA 1MT8A 4Y50A 2NR6A 3VFBA 1AJXA 1HOSA 3O9EA 3INHA 3NXNA 4Y5NA 2B8VA 1TW7A 3KT2A 4B05A 1YX9A 2HIZA 3MSJA 2UPJA 5OZVA 5P3ZA 2PSUA 5P7UA 1K2BA 3UDQA 4Y3XA 5JG1A 3FNSA 5AHCA 4Y4TA 3HAWA 3VSWA 2G1OA 3I2LA 1GNMA 4FCOA 1CZIE 5DQ4A 4NJTA 5P5CA 3VFAA 1SDUA 1SMEA 4ER2E 1HVLA 4RVJA 3PSYA 5IE1A 5P06A 2WF1A 5DR1A 2FXDA 2JYSA 4Y6MA 7HVPA 5P16A 1T6EX 4K4RA 1TSUA 4S1GA 4Y4AA 2P3CA 3K5FA 2FMBA 2WEAA 5OZ6A 5P7FA 4AZYA 1EC2A 1HVKA 3SA7A 1LYBA 3L5FA 5P81A 4YHQA 3OXCA 2PSVA 5P1KA 5P88A 3ZKNA 1DIFA 5P7EA 3R1GB 1T7KA 5P2RA 4DJRA 5OZSA 2V13A 4ER4E 4AA9A 2NXMA 3KDCA 4Y3JA 4GJ7A 3UQRA 1E5OE 3O9AA 2PQZA 2PH6A 3PSGA 4RLDA 4HDPA 2ZJNA 1LYBB 2AOGA 1META 4FM7A 5P64A 4EJKA 4DJOA 3OXXA 3IXKA 1SMRA 1EPNE 4TRYA 4J1HA 3KYRA 2Q15A 3I8WA 4K4QA 4FE6A 5P1UA 4Y3EA 5P32A 5P1HA 1LYAB 4YDGA 5DQCA 5P83A 3RTNA 5HE4A 2R5QA 2SAMA 5OZXA 4COEA 3TNEA 2QD6A 3ER5E 3NU5A 1BDRA 4Q5MA 5P6TA 4A6BA 5OZJA 5P82A 4KUPA 1EPME 3TPLA 4GJBA 2Q5KA 4ZPGA 4ZSPA 5P3YA 5P2MA 3ZKSA 3OQDA 5P1YA 4A4QA 2VIZA 1W5XA 4Y41A 4I11A 1PPME 5ISKA 5P78A 1EAGA 2RKFA 5OYSA 4CPUA 5P4TA 1A8KA 2Q64A 4HDFA 5P0MA 4DQBA 3OU1B 2PH8A 2QNNA 3PCZA 5P3CA 3EL9A 5P8NA 5OZEA 4FRJA 5OZFA 3RTHA 2FGVA 3LPIA 4JPCA 5P5JA 4FRSA 2AOCA 4PZWA 5P3MA 3VEUA 5P2TA 3CKTA 4J1IA 1IDBA 3S56A 5P35A 4HE9A 5E5JA 5P6RA 5OZ8A 5P6FA 3SQFA 4LAPA 1NH0A 1DP5A 2G22A 2QMFA 4ZLSA 4RYGA 3BGCA 5P7GA 1PPKE 3UDMA 2JE4A 3D1YA 3O9LA 2PYNA 2XFIA 3Q3TA 3PB5A 4Y4UA 3Q5HA 4XX3A 2I4WA 3HAUA 2OHTA 3CIDA 1BV7A 3T6IA 3QIHA 1IVPA 3DV5A 4K9HA 5OZ7A 2QI3A 5P3LA 2QNQA 5P4KA 5P3QA 5P6MA 3RVIA 4EJ8A 2AODA 1DAZC 2O4NA 4NJVA 3S85A 1T6GA 1EC0A 1W5VA 3S53A 4LP9A 3UF3A 1BXOA 5AH9A 4Y4XA 1VIJA 5C9DA 6FIVA 3NDUA 9HVPA 3NU3A 2IKOA 4L1AA 4HZTA 2G1YA 3EKVA 2ER9E 5P0WA 3ST5A 5OZAA 3TPPA 1PPLE 5P7DA 3ZMGA 1BDLA 5P7AA 4Y38A 5P0HA 5P6WA 4B0QA 3EL4A 5P34A 3APRE 1SBGA 1NPWA 5P19A 5P2HA 5P8QA 5B18A 3OTSA 4XXSA 2G1NA 5P68A 2QHCA 4HEGA 5IVRA 4YCKA 3T3CA 5P42A 5P0EA 5P89A 1NSOA 1K1TA 3KDBA 3INDA 3TH9A 4TVHA 2RSPA 2UXZA 5P4SA 4JECA 5P6IA 4L7GA 5I3XA 1EBZA 2O4LA 3HVGA 4FM8A 5P5WA 4I0FA 2UY0A 1GVTA 2WJOA 5P4GA 3PM4A 2OHMA 3EKQA 1FMXA 5P3SA 4Y5MA 5PEPA 2R8NA 5P5BA 2FNSA 3K5GA 2P4JA 3TL9A 4Y37A 3TKWA 1D4SA 1HTGA 1MUIA 1TQFA 2O4SA 4BFDA 3EBZA 4NJSA 4CMSA 5P2BA 3NU6A 1QBSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3KFN A;  4DQE A;  2IDW A;  3Q70 A;  3HDK A;  4Y47 A;  1HTR B;  5KOQ A;  2XYF A;  2R3W A;  5P7P A;  5P38 A;  2HB3 A;  3VLB A;  1AAQ A;  2F80 A;  5P00 A;  5P5G A;  5DR8 A;  1HSH A;  4YDF A;  2B60 A;  5P1Z A;  4L7J A;  5P5R A;  5P3F A;  3EL0 A;  5P0F A;  3ZKX A;  2PK6 A;  4FSL A;  4ZPE A;  5P7O A;  3LZS A;  5DQ1 A;  5P3W A;  1UH8 A;  4I0H A;  5HDV A;  4TRZ A;  4GJ6 A;  1M4H A;  2VKM A;  3TOG A;  4J17 A;  2WEC A;  3TKG A;  5OZQ A;  5P57 A;  1FFF C;  3EKP A;  4Y3Q A;  5P01 A;  4D89 A;  4JOO A;  3EL1 A;  1ZAP A;  5OZZ A;  5P3P A;  3SM1 A;  1YM2 A;  3VV8 A;  5P20 A;  3OK9 A;  5P8U A;  2BPW A;  2ASI A;  5P4H A;  4R92 A;  4Y36 A;  5P7M A;  3VUC A;  3NUO A;  1IVQ A;  5P7R A;  4Y56 A;  2ANL A;  1LF3 A;  3IXJ A;  4YD5 A;  3SA6 A;  1GVV A;  5OZL A;  5OZU A;  5P30 A;  4D88 A;  1NPV A;  1FQ7 A;  3A2O A;  1CPI A;  3BRA A;  2NNK A;  5P2U A;  1B6M A;  5P4A A;  3UDH A;  5P8A A;  3UQX A;  5AGZ A;  5P8J A;  1FGC C;  3L5B A;  3N3I A;  2QI6 A;  2G21 A;  3LIX A;  1EBY A;  5OYR A;  5P7X A;  3GW5 A;  1XN2 A;  3R0Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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