3Q3TA

Alkyl amine renin inhibitors: filling s1 from s3
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
337
structure length
337
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Biphenyl/diphenyl ether renin inhibitors: Filling the S1 pocket of renin via the S3 pocket.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 337
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3q3tA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3q3tA01
2AIDA 4RYGA 2BPXA 3OOTA 4LC7A 4Y41A 2AOJA 1EC1A 1UH8A 5P7KA 5P5WA 3URJA 5FIVA 4B0QA 5P1FA 5P2AA 5DQCA 4GZFA 4RLDA 6FIVA 3O9FA 2NPHA 1FKNA 5AH6A 1MUIA 1UH7A 4YCKA 5P2UA 3VYEA 3UTLA 3T7PA 5P1OA 1BDRA 2OHKA 5P0IA 3AUPA 5CONA 1K6TA 3SA6A 1HVIA 1PFZA 3BXRA 5P87A 5P1IA 5P28A 4J0VA 5P2OA 1GNNA 5DGUA 4DJYA 1EPPE 2QNPA 1BDQA 4LXMA 4A6CA 3TH9A 5P4KA 2AZ8A 5P2HA 3KMYA 1G2KA 2WF4A 4COEA 3VEUA 5P2IA 4QGIA 4FRIA 1PSOE 1FFFC 4Y4EA 1A8GA 1SGZA 3LIZA 1T7KA 5OYVA 5P1YA 4Y45A 1FMBA 1FQ7A 1DP5A 2Q3KA 8HVPA 2MIPA 5P7OA 3OUDA 3EL0A 4L6BA 5P09A 3VYFA 2EWYA 5KR8A 5P34A 1GVXA 5I3XA 2H6TA 1BVEA 4Y5EA 4AMTA 2WEAA 5P88A 5P0TA 1MTBA 3UFLA 3RTHA 3O9AA 5OYRA 4Y48A 3UCBA 1IDAA 5P0LA 3EC0A 1K6PA 5P0XA 5UPJA 3BUHA 5P1AA 2NXMA 5ER2E 5HDZA 4FM8A 5OZ3A 2HC0A 3FKTA 4H3FA 4J1EA 5P1SA 2VIJA 4Y3YA 3VF7A 5P8OA 4FRKA 2IKUA 1CPIA 3R0YA 5P5DA 3IGBA 1YM4A 5OZ1A 2AODA 3OQ7A 5P0DA 3MSKA 5P1PA 4R8YA 3NSHA 5P00A 3SA5A 2ZJJA 3PGIA 4KE1A 4Y5PA 1EBWA 2P8HA 1VIKA 4BFDA 3NU5A 3I25A 1BWAA 2B60A 5P3EA 2VKMA 1MVPA 5P22A 5P1UA 5P50A 3S43B 3EM3A 2VJ6A 5P57A 5KQYA 5P05A 4DVFA 2JJIA 2QD8A 4FGXA 3OXXA 4K4QA 2OHQA 2P3BA 3APRE 2FGUA 2FXEA 3Q5HA 3DK1A 1BWBA 3T7QA 4L7GA 5P51A 3TPRA 5P8NA 1SDTA 3NDWA 3IA9A 3TLHA 4DJQA 2UPJA 3VV8A 4Y5BA 5P1NA 4FS4A 4EJKA 1FLHA 4M8XA 4NPTA 3M9FA 5P5VA 5P01A 5P2CA 3K5CA 1BXQA 5P41A 4F76A 5P0RA 1BDLA 4GIDA 4Y3JA 2I4VA 3ER3E 5P3HA 4R95A 5OZHA 2BPYA 2QI7A 3QRSA 1SIVA 2ZHUA 3D1XA 5OZ5A 1EAGA 2RENA 1T7IA 4ZSRA 3UQUA 4B78A 3GI6A 5P6ZA 4B05A 4Y3PA 2P3DA 2QI3A 3ZKMA 1OEXA 1FQ6A 3O9CA 3QIHA 2NNKA 5AGZA 4CPTA 1EBKC 4TVHA 4Y4JA 2WF1A 5JG1A 3OUDB 4FRSA 5P1BA 1E82E 5KQFA 5P8PA 2V12C 3PMYA 3ZKXA 4LAPA 2HPEA 3DJKA 5P0ZA 3EL4A 1D4LA 5OZYA 4A6BA 2BPWA 2IEOA 1GNOA 1Z1HA 3EKXA 2G94A 4OBZA 5P82A 1QBRA 1HVHA 5P3WA 5P3ZA 4Y5AA 4RVIA 2BPZA 2OHTA 2ER6E 2I4UA 3Q4BA 4F74A 3IN4A 4KE0A 5DQ2A 5P43A 5P0KA 5P2JA 4DFGA 1FQ5A 1SMRA 1W5WA 3UFNA 2QAKA 5HU1A 4EJDA 5P7GA 3FSMA 1B5FA 4J5JA 1T7JA 3S54A 1XDHA 3OAGB 3ZKIA 3ECGA 4YA8A 5OZ7A 5KQXA 3HVPA 3S7LA 3PHVA 5P0PA 4OBKA 4Y3SA 1KJGA 2VNMA 1TSUA 5P8VA 3CICA 4Y5LA 3A2OA 5OZZA 1RPIA 4FIVA 4ER2E 1XN3A 4ZPGA 3BVBA 5P7LA 3QBFA 5IVTA 4HLAA 1RQ9A 5P74A 2PYNA 2G1YA 5OZEA 4D85A 5P1EA 4J1KA 4DQGA 4DJVA 3LIYA 2UY0A 3O9HA 3HAWA 5P37A 5P1QA 3ER5E 3UHLA 4Y5GA 3HLOA 5P7ZA 3GI5A 4L7HA 3TPLA 3D20A 3OU1A 4NJSA 2QI5A 5P0WA 2G1OA 3OHFA 4RVJA 4LP9A 2PWRA 1LZQA 2I0DA 4CPWA 5OZ0A 2XFKA 3G72A 2B42A 3RSVA 1APWE 1IZEA 2V0ZC 4Y5MA 3L59A 3OTYA 3HW1A 5OYTA 5P1WA 4RYCA 5P8HA 1SIPA 2ZGAA 2VA5A 3SABA 5P7RA 5P61A 3BVAA 3PSUA 3TKWA 4Y4UA 2Q54A 2ZHRA 4ER1E 3TKGA 4YE3A 5IVSA 5P7JA 1EEDP 3IN3A 3KDCA 5P2GA 2AOEA 1LS5A 4OBDA 4Z2ZA 4Y3FA 3D3TA 4RRSA 4N00A 3TPPA 2NXLA 1LYBA 2PSUA 4Y3QA 1G35A 1K6CA 5I3WA 1BILA 4QJ6A 1W5VA 2AOFA 3B7VA 5P0QA 2B8LA 1IZDA 1E81E 3PVKA 4YDGA 3ZPUA 2PMAA 5P6XA 3PI0A 5P0JA 5P39A 4BEKA 4DQFA 2I0AA 4Q1WA 4EQJA 4DI2A 1FMXA 3NR6A 3FV3A 5P4MA 5P77A 5P7DA 3SO9A 5P1RA 4Y9WA 1YTHA 4EHCA 5AH8A 2OHPA 5P4GA 3SM1A 4NJTA 2F3EA 3IXKA 3T3CA 5P6EA 1FG6C 4K8SA 3ZPSA 4LHHA 4TRYA 4FSEA 4YD4A 4EJLA 2QU3A 2B8VA 3TOHA 1W51A 1EC0A 3OXWA 4HEGA 5P69A 3VSWA 2FNTA 5P6NA 3LIXA 3PB5A 5P8KA 5P8RA 5P2VA 1ODXA 4I0HA 5AHBA 3EL1A 5OYSA 3PEPA 5CLMA 5P48A 3MSLA 2ZDZA 5P6RA 4F75A 2Z4OA 5HTZA 3RTMA 1MT8A 4AUCA 1SMEA 3TTPA 3UDQA 4ZLSA 3K4VC 3O9LB 4GJ6A 3Q70A 5AHCA 2V10C 5P5IA 3MSJA 4PPHA 5P7MA 4HDPA 1NPWA 2RMPA 2XYEA 5P3JA 5P46A 3OGQA 1APTE 5P4UA 2OHSA 1MRXA 5P5RA 2ZHTA 4TRZA 3NU6A 4RROA 3BGBA 5DQ1A 3CKPA 4DPFA 4Y3DA 1MPPA 4EYRA 2WHHA 4I12A 4I11A 3PI5A 4LXAA 3L5CA 5HDVA 4Y5CA 3UDHA 4Y54A 3NDXA 3TOGA 1HVCA 3PM4A 2CEJA 3S43A 4Y4TA 1META 4J0ZA 2G1NA 5OZ8A 2J9JA 1LYBB 3D1YA 2F80A 2R5PA 3SKFA 2VIEA 7HVPA 4FAEA 3CYXA 4Y43A 1B6PA 3S45A 2FIVA 3SACA 5P7TA 2WF0A 5P0FA 5C9FA 2ZJMA 1EBZA 3K4VA 3EKYA 1APVE 4ER4E 5EZXA 3QS1A 3BUFA 4GJBA 5P42A 5P5QA 6APRE 4OBGA 1HTEA 1BAIA 3PSYA 2ZYEA 5P1ZA 4Y3MA 2QZLA 5P4DA 5P60A 3HDKA 3UQRA 5SXNA 5AH9A 3EKVA 5P3FA 5P6SA 1FEJC 1EC2A 4Y3TA 5P1DA 4AA9A 2F8GA 5AHAA 2QD6A 3I7EA 3OQDA 5OZUA 4XX4A 1HVRA 5EZZA 3QN8A 3T6IA 1FQXA 1WBKA 4LXKA 1B6JA 4R91A 5F00A 5P0AA 4L7JA 3EKWA 3QP0A 2QMPA 5P63A 5I3YA 2NMYA 5P4JA 2IDWA 4Y3XA 5OZQA 5E5KA 4B72A 3SA8A 3G70A 2WF2A 1HEFE 2QHYA 1Z8CA 4YD7A 5OZJA 3T7XA 5HE4A 4Y3AA 5P64A 3VF5A 5OZCA 5P4VA 5P53A 5P56A 3APPA 5P4IA 3CYWA 1HTGA 2VIZA 4Y3RA 5P3YA 1BV9A 4FSLA 5P8TA 1FIVA 5P8BA 1TSQA 6UPJA 1FFIC 2HM1A 5DQ5A 5P5JA 3NDUA 3GI0A 5P26A 1DW6C 5P8EA 3LINA 5P2WA 1YX9A 5P0EA 5P08A 1EBYA 3NU9A 2PH6A 3OK9A 1D4IA 5P7PA 3HZCA 2PSVA 4Y53A 1LF2A 5P0GA 3UDJA 5OZWA 3NUJA 3OAGA 5P7WA 2J9JB 4B1CA 5JODA 3ZKQA 4KB9A 5P4SA 5P6FA 4J17A 5OZOA 1IVPA 5P0HA 1K2CA 5P72A 1ZJ7A 4OBFA 4NPUA 1SDUA 2QZWA 2HS2A 3WB5A 1GVTA 3HVGA 5KR2A 4GJAA 1K1TA 4DQBA 5JFUA 4NJUA 4Y50A 3OXCA 5HD0A 5P8DA 3WZ6A 3OU4A 4H3JA 5P3QA 3DUYA 5OZ4A 1HSHA 3KM4A 3ZKNA 1BVGA 4ZPFA 5P2EA 3UDPA 1AAQA 5P8AA 4OC6A 4QJ9A 2Z54A 5P65A 5COOA 5P5UA 2VJ7A 5P66A 5OYZA 4YDFA 4YD5A 2I4WA 5DQ4A 5P1MA 3NWXA 5P18A 1U8GA 1B6KA 2QMGA 4Y3NA 5P58A 2PQZA 1AM5A 3GW5A 4GJ8A 5P5YA 3KF0A 3O99A 2G20A 4J1HA 3UQXA 2O4NA 4B1DA 3OUAA 4K4RA 4M8YA 3OOZA 4MC9A 2R38A 3PMUA 5P7XA 2NR6A 2V13A 4NJVA 5P0UA 5P5MA 2QP8A 1MSMA 4Y6MA 2OAHA 5P45A 3EKPA 5OYWA 3QROA 3SA9A 2A1EA 2QK5A 1SDVA 5P2YA 5APRE 5P4BA 5P3SA 4GYEA 3TOFA 3UF3A 4Q1XA 3INHA 5P2XA 5P25A 3INDA 3H0BA 4B77A 2QCIA 3LNKA 5P79A 5P3GA 1QBUA 5P32A 5P6DA 2AOIA 4I0FA 1HTFA 1Z1RA 4XKXA 2P4JA 2AQUA 1AJXA 4HDBA 5P8MA 5OZDA 5P4ZA 3VV7A 5ENMA 5KOSA 1LYWA 2XYFA 1DMPA 5P36A 2V11C 2NMZA 3LIVA 2BJUA 3FNSA 2P3CA 1GVUA 5P70A 2QZKA 2OHLA 3U6AA 4APEA 1K2BA 2VNNA 3OGPA 1W6IA 3VFBA 3O9DA 1F34A 4B1EA 3WB4A 3EKTA 3QVIA 3KT2A 5P0NA 1VIJA 4L1AB 5P8GA 4J0TA 5P2QA 2HS1A 3ZKGA 1UH9A 1YG9A 3GGAA 1ZSRA 3ST5A 3UPJA 4HA5A 5OYQA 4RGHA 4ZE6A 2QNQA 3INEA 5COPA 1PSNA 3N3IA 1HXBA 1HIVA 3CIBA 5P1LA 5P7YA 3NUOA 5P6LA 4ZEAA 4D83A 3OU4B 4Z50A 4Y39A 5ER1E 1DPJA 3KA2A 5OZLA 5P2MA 5DR1A 2WL0A 3SA3A 4Q5MA 4QJ2A 5P3XA 5OZGA 3LHGA 5P4LA 1G6LA 1BBSA 4D8CA 3L5BA 2J9KA 2IQGA 4F73A 5P3TA 3SQFA 1BV7A 2ZJNA 4OC6B 4Y4DA 3SFCA 5BRYA 5P6JA 5P7IA 1HPVA 2JXRA 5BS4A 5P1XA 3OXVA 2ZJIA 3IAWA 3EL9A 2HB4A 3IXJA 1EPNE 4Y3HA 4K9HA 3O9LA 2G26A 2VA7A 5P3CA 3R0WA 4OBJA 2WJOA 5P59A 4J0YA 1MERA 1HVJA 1FF0C 3WZ7A 2R43A 4RZ1A 4CPRA 5P2SA 4D88A 1IBQA 4YD6A 4AZYA 5P76A 5IE1A 4PHVA 5P2LA 5P7UA 1HRNA 5P6IA 5P40A 5P4HA 4DJPA 3PCZA 1D4KA 2PYMA 3ZPTA 3H5BA 1HBVA 1ENTE 4BELA 1ODWA 2WKZA 1LYAA 5OZMA 5P0CA 5OZIA 1GVWA 4A4QA 3FNUA 5P30A 5P6UA 1E5OE 4DH6A 1QRPE 2QI6A 1TCWA 5P29A 3SKGA 1HPOA 3VLAA 3R2FA 5P3VA 1EPOE 5P20A 1EPLE 2HAHA 4GJCA 4Y44A 1J71A 4HVPA 1D4HA 5SZ9A 2R8NA 1MT9A 1LYWB 2IENA 4PYVA 1SP5A 5KQZA 4Y57A 1HXWA 1ZAPA 5IVRA 1HIIA 2Q55A 4Y3ZA 5HCOA 5P55A 2PWCA 5P19A 2QZXA 4Y4XA 1LF4A 3VF3A 2VA6A 1PSAA 2ASIA 5P4WA 4I0IA 2VIYA 5P3IA 4FRJA 4CPSA 5P7EA 1DIFA 2FNSA 4PEPA 1E80E 1LF3A 5P27A 3FX5A 1EPQE 5DR8A 5OZPA 2Q63A 2WECA 5P83A 4Y47A 2OHRA 5P10A 4B70A 1FG8C 5AH7A 2AOHA 5P68A 1TQFA 3SA7A 2FMBA 2HB2A 2OHNA 4TRWA 4J55A 5P52A 2FGVA 4MC6A 3IVHA 3KFSA 1FQ8A 3LZUA 1WBMA 5P2BA 5DR3A 3EL5A 5P4QA 1HIHA 2O40A 2OHUA 3GGXA 4YCYA 4Y38A 5P8UA 3RSXA 5P5OA 3PWRA 3O9IA 1MT7A 5P4EA 4OBHA 3S2OA 1TCXA 2RSPA 3IXOA 4Y4ZA 4I8WA 5DR4A 5C9BA 1YT9A 5JFPA 3FIVA 1T6EX 3VSXA 5OZFA 5P12A 5KR0A 4FM7A 5P5KA 5I70A 5P06A 1A9MA 1QBTA 4ZSQA 5DPZA 1F7AA 3OQKA 4Y3GA 5P5GA 5P4RA 1ZTZA 5P5BA 2RKGA 4RRNA 3LPIA 5P6TA 3O9BA 5T4SA 4MC2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2AID A;  4RYG A;  2BPX A;  3OOT A;  4LC7 A;  4Y41 A;  2AOJ A;  1EC1 A;  1UH8 A;  5P7K A;  5P5W A;  3URJ A;  5FIV A;  4B0Q A;  5P1F A;  5P2A A;  5DQC A;  4GZF A;  4RLD A;  6FIV A;  3O9F A;  2NPH A;  1FKN A;  5AH6 A;  1MUI A;  1UH7 A;  4YCK A;  5P2U A;  3VYE A;  3UTL A;  3T7P A;  5P1O A;  1BDR A;  2OHK A;  5P0I A;  3AUP A;  5CON A;  1K6T A;  3SA6 A;  1HVI A;  1PFZ A;  3BXR A;  5P87 A;  5P1I A;  5P28 A;  4J0V A;  5P2O A;  1GNN A;  5DGU A;  4DJY A;  1EPP E;  2QNP A;  1BDQ A;  4LXM A;  4A6C A;  3TH9 A;  5P4K A;  2AZ8 A;  5P2H A;  3KMY A;  1G2K A;  2WF4 A;  4COE A;  3VEU A;  5P2I A;  4QGI A;  4FRI A;  1PSO E;  1FFF C;  4Y4E A;  1A8G A;  1SGZ A;  3LIZ A;  1T7K A;  5OYV A;  5P1Y A;  4Y45 A;  1FMB A;  1FQ7 A;  1DP5 A;  2Q3K A;  8HVP A;  2MIP A;  5P7O A;  3OUD A;  3EL0 A;  4L6B A;  5P09 A;  3VYF A;  2EWY A;  5KR8 A;  5P34 A;  1GVX A;  5I3X A;  2H6T A;  1BVE A;  4Y5E A;  4AMT A;  2WEA A;  5P88 A;  5P0T A;  1MTB A;  3UFL A;  3RTH A;  3O9A A;  5OYR A;  4Y48 A;  3UCB A;  1IDA A;  5P0L A;  3EC0 A;  1K6P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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