2G27A

Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the "c" ring
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
333
structure length
328
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors: Optimization of the "C" Ring
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 328
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2006-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g27A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g27A01
4OBFA 5P3BA 3UPJA 1UH9A 5P7LA 1ZPAA 2ASIA 2XYFA 2QNNA 5P36A 5P1DA 4AZYA 3UQWA 2VNMA 2IEOA 5P51A 4QJ8A 4A6BA 3CICA 4RCFA 2QMPA 5HDVA 3QBHA 3NSHA 1G6LA 5JG1A 4DJUA 5P4CA 5DQCA 2WEDA 3UDQA 2QI5A 4FL8A 4I8ZA 3IXOA 3S53A 2QAKA 5P1JA 3NDXA 2OHSA 3EKYA 2HS1A 4ZPEA 2AIDA 3MSLA 4OBDA 4X2LA 5P4OA 5OZGA 4H1EA 3LIYA 3LPKA 3L5CA 2AZ9A 4FS4A 3EM4A 5P16A 3D3TA 5P5NA 3LZVA 1NPAA 1K1UA 3VCMA 5IVQA 3R0YA 5P1VA 2VA5A 3TLHA 5EZXA 5P57A 1HVHA 3GGUA 3TTPA 3QN8A 1W50A 4DQCA 5P00A 4ZLSA 2AOGA 2O4PA 1HPSA 1FQ7A 2I0DA 2FIVA 5ISJA 5P76A 5IS4A 1HHPA 1ZP8A 1FQ5A 2J9JB 5UPJA 2FXEA 1UPJA 1XN2A 2I1AA 4CMSA 5P8VA 1TSQA 1XE5A 5P8KA 5OZ6A 1K2BA 5P0CA 3BVAA 5DR3A 5P3FA 2ZJHA 3KFNA 3OUDB 3PMYA 5OZ0A 5P1PA 4Y3SA 5BRYA 3O9BA 5P3JA 5P3YA 5P4GA 1UH8A 4D85A 3ZOVA 4FCOA 1N49A 4HDBA 5OYZA 2XFIA 5HTZA 4D89A 5J25A 3ECGA 4ZSQA 5P8AA 3UQUA 4DQEA 2G1OA 3O9DA 2XFJA 1D4IA 5P66A 2NXMA 1FFFC 5ENKA 5IVRA 1F34A 2F81A 2HB4A 2IKUA 4Y54A 4Q1YA 3RTNA 2H6TA 5P6EA 1LYWB 4FM6A 4Y4AA 5P60A 3VLAA 2ZJMA 4LXKA 2WJOA 3GI5A 5P02A 5P73A 2WF3A 3U6AA 2AQUA 3KN0A 3O9IA 4Y3RA 2R9BA 2G27A 3ZKQA 1TW7A 3VUCA 3L3AA 5P0TA 4Y5EA 3O9HA 4J54A 1W6IA 1VIKA 2VJ6A 4Y4ZA 5OZ2A 1PPLE 4DJWA 2QI6A 3PSUA 2CEJA 2AOCA 2Q55A 5TOLA 2QMFA 5KR2A 4CPSA 2O40A 1HSIA 5P5IA 3ZKGA 1KJHA 5P14A 3RTMA 3I8WA 3L59A 3ZKIA 5P2EA 5P87A 3NU4A 3KDDA 1A8GA 4RVXA 2G21A 1HVSA 4L6BA 2V11C 5P3CA 1LYAB 1PSNA 2G26A 2PSUA 2ER9E 1YTJA 3L5BA 5P0XA 5P3WA 3SABA 5P0LA 4YBFA 5P77A 5DQ1A 1AJVA 5P6LA 3CMSA 5HDZA 5OZFA 5P68A 1W6HA 4Y3HA 2JJJA 3N4LA 4R95A 3SA8A 2FXDA 5P63A 3NDUA 5P70A 2BPWA 5P84A 5OZXA 1XL5A 4Y45A 5P32A 3IN3A 3JW2A 4R93A 2BKTA 5I70A 3OXCA 4YHQA 1MTBA 5KOQA 2JJIA 3QI1A 4PZXA 4J0ZA 5C9DA 7HVPA 5P6AA 4OBKA 5P3PA 1M43A 5P2OA 5P6WA 5P3QA 5P2FA 3ZKXA 5P74A 5P7JA 5P0FA 2Q11A 4EYRA 3O9FA 3I7EA 2ZJJA 5DGWA 4K9HA 5COOA 4DUSA 5DR1A 4EXGA 4K4RA 4XKXA 4I0EA 5P6IA 1UH7A 4CPWA 4DVFA 2WF1A 3MXDA 5P67A 2VJ9A 1AXAA 4B1DA 4LBTA 4Y48A 4H3GA 4LAPA 5P7SA 5P6FA 5P4MA 5P80A 1FF0C 1KZKA 3SO9A 2QK5A 1DP5A 3EL1A 5DQ5A 3S43A 1Z1RA 1EBWA 2IRZA 2H6SA 5P42A 5P8JA 2B7FA 5OZTA 1JLDA 4Q1WA 2P3BB 3S56A 3TOGA 4AUCA 3BUHA 3INDA 4Y5NA 3UHLA 5P5DA 5OZ3A 1ODXA 5OYYA 5P6BA 3VF5A 1HIIA 3NWXA 5SY2A 3OADB 3EL5A 2A1EA 5FIVA 2FGUA 3O9LB 3QRSA 2HAHA 2QNPA 3OQAA 5AGZA 4K8SA 1CZIE 3UFLA 4JECA 3BRAA 1GNMA 5E5JA 5P4RA 4B70A 2V16C 1OEXA 4TRZA 4DI2A 2OHUA 5P1NA 5P46A 1A94A 2Q3KA 2WEZA 3DV5A 5P6UA 4JPEA 3CIDA 5P0OA 1M0BA 3IVHA 5OZSA 5P27A 5P6PA 3OY4A 5P4DA 2VIYA 4ZSRA 2ZHTA 3OUCA 3AUPA 2UPJA 2OHLA 3WB5A 3VYDA 2AVOA 5P7CA 4RROA 3EL4A 5P3TA 5P0ZA 5P39A 1IIQA 2ZHUA 5P5TA 3VYEA 4TRWA 3KFSA 3PLDA 5OYWA 2ER6E 4NJVA 2EWYA 4U7QA 1GVTA 1SGUA 4XX4A 1PROA 5P2YA 2QMGA 5P4BA 4OBJA 2I0AA 4Y56A 4M8YA 5P2WA 1HRNA 2AVVA 5OZUA 4GJCA 1B6MA 3LIZA 4Y5MA 3TH9A 4D83A 1HTRB 3UF3A 3APRE 5HVPA 5KAOA 3DV1A 1EPPE 5P1BA 3Q4BA 4HZTA 1GVXA 2O4SA 1ER8E 4RLDA 3LZSA 5P7NA 5ER2E 4I10A 4CPTA 5P8FA 2WL0A 3Q70A 5P0VA 2ZHVA 4OBHA 3VYFA 1FMUA 3VV6A 2WF4A 1MESA 5P83A 5P3HA 4I0JA 2R8NA 4FM8A 3QP0A 5P4VA 5EZZA 3NDTA 3CIBA 5P40A 2QP8A 5AHAA 4COEA 3ZLQA 3ZPUA 5P72A 5P59A 2HIZA 1KJFA 4PYVA 1FLHA 3DOXA 3SM1A 5DQ2A 3DJKA 4J1EA 2OAHA 2G94A 2RKGA 2QZKA 2QZXA 3PVKA 4L7JA 4CPUA 5P4WA 3UDKA 5OYRA 4B77A 1YG9A 3R2FA 4ER2E 5P0YA 5COPA 4B72A 4Q1XA 3UDHA 3PI5A 5P7WA 5P8EA 5P2QA 5KR8A 3QRMA 1BDRA 1SMEA 5P2LA 4J5JA 3DM6A 3K1WA 2IGYA 5P0RA 2OHTA 1FIVA 5OZLA 1HVJA 2FDEA 3IA9A 5P5UA 4Y4WA 3WZ7A 4QJ2A 3PJ6A 1TCXA 5P1HA 3AIDA 3VFBA 5P8QA 3R0WA 1MRWA 5P3AA 5P55A 1NH0A 5P1SA 5P6SA 5P2XA 1PFZA 1Z1HA 5P3IA 1DPJA 3SKGA 1LYBA 5P2RA 5P3LA 3OADA 5P79A 5OZZA 5P7KA 5OZQA 3HBOA 5OZOA 4LHHA 4R92A 4QLHA 4RCEA 2PWCA 2V00A 4D8CA 2QI7A 3K4VA 4Y53A 1EC1A 1IDAA 1TSUA 4HDFA 3T7PA 2I4QA 4L7GA 3OXVA 3D1ZA 5OZ4A 2I4VA 5HU0A 4GIDA 4A4QA 1SMRA 4LXMA 3T6IA 3FIVA 2WF0A 3EMYA 5P2CA 5SZ9A 4HDPA 4FRSA 4J1CA 5OZIA 3OOZA 2BPXA 2NNPA 3KT5A 4YOBA 4Y35A 5P4SA 5P2TA 3OXWA 5P1EA 4GZFA 4UPJA 3WSJA 5OZ9A 1RV7A 3KMYA 5P2HA 3NR6A 3EXOA 2PYMA 4GJBA 2PC0A 5P4NA 5P5EA 5P78A 2PWRA 1BWBA 4QGIA 4PHVA 4I0HA 4Y4UA 5P0UA 1YM2A 5P1LA 1U8GA 4I8WA 5P1UA 5HD0A 3O9CA 1AM5A 5P12A 5P1ZA 1W5XA 3S2OA 2G24A 2SAMA 5P01A 4K4PA 5F00A 3SQFA 4APEA 4Y5CA 5P5FA 5P7HA 2ER0E 3SA4A 3PSYA 5P6KA 5AHBA 5P28A 1YM4A 1D4LA 5P26A 3CYWA 4I0ZA 5SXNA 3QROA 3LPJA 5P5GA 5P7YA 9HVPA 3LZUA 1XL2A 3DUYA 4LP9A 1ME6A 5P37A 1SBGA 3U7SA 5P0AA 2B60A 2OHPA 1LEEA 3RSVA 2G69A 5OZWA 2R3TA 3C9XA 4B78A 2PYNA 3MSJA 5P48A 2PMAA 1MTRA 4DJQA 1AVFA 5KQZA 4RZ1A 3KF0A 3FKTA 1T7KA 4Y58A 1FFIC 3FSMA 4Y39A 4L1AA 1BXQA 2R38A 1B6PA 1HPVA 4EQ0A 1ZLFA 2ZJKA 4RCDA 1EBZA 3OUBA 5OYVA 2VA7A 5P82A 3S43B 4ZPFA 4DFGA 2AOEA 5I3VA 3R1GB 3S54A 5P5LA 4GYEA 4I0DA 5P0EA 5KQFA 5P8CA 2NMZA 4J0VA 2QD6A 5HDUA 3UFNA 2ZYEA 5BWYA 5P10A 2QI0A 2UY0A 1ENTE 1HVLA 3PWMA 1SIVA 3CYXA 3FNUA 1RL8A 5OZNA 5OZVA 3EKPA 2QZWA 3JVWA 1T6EX 3EKQA 3IAWA 4BEKA 3NDWA 1SH9A 2NXLA 3WZ8A 4FRKA 1ODWA 5HCOA 5P5BA 4XX3A 3T7XA 2Q5KA 3FX5A 4F75A 4DQFA 4EP3A 3NWQA 1PPME 3CKRA 5P6NA 1WBMA 4HLAA 2AOIA 4Y5PA 2BKSA 4I0FA 5P5WA 4ZSMA 5P7DA 2QCIA 1HXWA 4CKUA 3NUJA 4NPUA 5P6JA 5P8UA 1KJ7A 4QJ6A 3SA7A 4MC2A 5DR0A 5HCTA 2JYSA 2FS4A 4RRNA 5P2DA 5P1FA 3QIHA 3RSXA 3RTHA 2ZDZA 4YD5A 5P1AA 5P4TA 3TNEA 1BILA 5JODA 3O9GA 5P75A 5P19A 1OHRA 2WECA 1XN3A 3OQFA 3NU3A 3UQRA 2ZJIA 3S7LA 4OC6A 2I4DA 1HEFE 5P7VA 3OHHA 3PHVA 5P3OA 2NR6A 5P8HA 3OQ7A 4TRYA 4Y43A 2HM1A 3N3IA 4DQGA 4ER4E 3PEPA 2BJUA 5OZCA 2V12C 1QBUA 5P4PA 1HPXA 5OZ1A 2IQGA 3INEA 1E80E 5AH6A 4Y3DA 3NUOA 4DJRA 1FQ4A 4Y3FA 3L5DA 3Q3TA 4KE1A 2QD7A 4YBIA 4ZE6A 5OZPA 4DV9A 2Q54A 1ODYA 5HE4A 5P4KA 4EPJA 3OK9A 5OZ5A 4IVTA 3RVIA 5P5QA 3D1XA 3PBZA 5P3XA 3UDPA 5P0NA 5P22A 4EP2A 1EC2A 3LINA 4Q5MA 1FG6C 1W5YA 1MUIA 4X7IA 2WEBA 5OZ7A 3BGCA 1TQFA 1PPKE 1RNEA 5HDXA 4NPTA 1META 5T4SA 4MC1A 5P0MA 1SDTA 4Y50A 4CPQA 4PEPA 3PM4A 4RVIA 2APRA 3T3CA 5P6OA 3S85A 3PBDA 4J1FA 1IVQA 2QZLA 2BB9A 2BPZA 5P61A 3NYGA 4GJAA 4KE0A 4RVJA 5C9BA 3L5FA 3G70A 4QJ7A 4XXSA 5COKA 2OHRA 3D1YA 4RRSA 1T7IA 4FIVA 4Y4GA 3KT2A 4ACUA 3I25A 4Y37A 4YOAA 1FB7A 4WY6A 1E5OE 1HTEA 4NJTA 4MC6A 4EJ8A 1NSOA 5P47A 4DJPA 1LYBB 3PRSA 5SY3A 1W5VA 2ZJNA 1Q9PA 4Y4JA 2PK6A 3INHA 4Y4BA 2ANLA 5I3YA 3Q5HA 1A9MA 4DJYA 4Y3ZA 3I2LA 3KM4A 4RGHA 4OD9A 5IE1A 3IN4A 1K1TA 4NJSA 3URJA 1LF4A 2VIZA 5OYXA 4APRE 2AZCA 2O4NA 5P69A 3K5FA 2PK5A 5P54A 3TOHA 2O4KA 5OYTA 5AH8A 1C70A 1IBQA 1BIMA 1ZSFA 2MIPA 3PCZA 3VFAA 1HVRA 1K6PA 4L7HA 3H0BA 1EPRE 1B6LA 5P24A 4EWOA 2QMDA 1B6JA 5P3ZA 4YDGA 3VF3A 5P8LA 1XE6A 3R4BA 5P1IA 3FV3A 5P3VA 1FQXA 4NJUA 2OHQA 3CKPA 5OZAA 2NXDA 2IS0A 1HSHA 3KMXA 3TPRA 5P11A 3GGAA 5P1OA 3B7VA 3UQPA 1W5WA 4DQHA 4GJ7A 4TVHA 2VNNA 3VEUA 2FDDA 1EEDP 4YD3A 4GJ5A 5P7GA 1RPIA 4N00A 5DGUA 5P0PA 3RU1A 5P7AA 5PEPA 5P4UA 4Y5GA 5P25A 5P41A 6UPJA 3VSWA 2OHMA 4YCTA 1QBTA 2G1RA 2G22A 5P8GA 5P1CA 3K5GA 1CMSA 2RMPA 2WEAA 2I4UA 4J55A 1APUE 3OQKA 4I0IA 3PWWA 5P2UA 3TL9A 2PQZA 3TPJA 3NU9A 3TPPA 5OZBA 5P4ZA 2HPFA 3HVPA 3MSKA 2FNTA 1PSAA 5P52A 1MRXA 1SDVA 1HOSA 4J0PA 1BXOA 3EKTA 4NKKA 3EKWA 1BV7A 1C6YA 4J1IA 5P6VA 5P8DA 5P2IA 5HU1A 4L1AB 1DMPA 5KOSA 5JFUA 2OHKA 3URLA 5P7EA 2B7ZA 1PSOE 2ER7E 3KYRA 3NU6A 3HVGA 4MC9A 5P7OA 5P58A 5P5HA 3ST5A 5OZRA 3KFRA 5DR4A 1HEGE 3BUFA 4YD4A 5P2BA 4Y9WA 2ZHRA 5P5ZA 5APRE 4Y4DA 4YD6A 3QBFA 5P8BA 2AVQA 4KB9A 5P20A 5P7UA 1BBSA 5E5KA 4Z4XA 1GKTA 1ZAPA 3QAAA 1FQ6A 2J9KA 3FNSA 3LPIA 2VIEA 1VIJA 3K5CA 3Q6YA 1IZHA 3I6OA 4Z50A 4J17A 4ZPGA 3OU3A 2HB3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OBF A;  5P3B A;  3UPJ A;  1UH9 A;  5P7L A;  1ZPA A;  2ASI A;  2XYF A;  2QNN A;  5P36 A;  5P1D A;  4AZY A;  3UQW A;  2VNM A;  2IEO A;  5P51 A;  4QJ8 A;  4A6B A;  3CIC A;  4RCF A;  2QMP A;  5HDV A;  3QBH A;  3NSH A;  1G6L A;  5JG1 A;  4DJU A;  5P4C A;  5DQC A;  2WED A;  3UDQ A;  2QI5 A;  4FL8 A;  4I8Z A;  3IXO A;  3S53 A;  2QAK A;  5P1J A;  3NDX A;  2OHS A;  3EKY A;  2HS1 A;  4ZPE A;  2AID A;  3MSL A;  4OBD A;  4X2L A;  5P4O A;  5OZG A;  4H1E A;  3LIY A;  3LPK A;  3L5C A;  2AZ9 A;  4FS4 A;  3EM4 A;  5P16 A;  3D3T A;  5P5N A;  3LZV A;  1NPA A;  1K1U A;  3VCM A;  5IVQ A;  3R0Y A;  5P1V A;  2VA5 A;  3TLH A;  5EZX A;  5P57 A;  1HVH A;  3GGU A;  3TTP A;  3QN8 A;  1W50 A;  4DQC A;  5P00 A;  4ZLS A;  2AOG A;  2O4P A;  1HPS A;  1FQ7 A;  2I0D A;  2FIV A;  5ISJ A;  5P76 A;  5IS4 A;  1HHP A;  1ZP8 A;  1FQ5 A;  2J9J B;  5UPJ A;  2FXE A;  1UPJ A;  1XN2 A;  2I1A A;  4CMS A;  5P8V A;  1TSQ A;  1XE5 A;  5P8K A;  5OZ6 A;  1K2B A;  5P0C A;  3BVA A;  5DR3 A;  5P3F A;  2ZJH A;  3KFN A;  3OUD B;  3PMY A;  5OZ0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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