3FNUA

Crystal structure of kni-10006 bound histo-aspartic protease (hap) from plasmodium falciparum
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
EFDNVELKDLANVLSFGEAKLGDNGQKFNFLFHTASSNVWVPSIKCTSESCESKNHYDSSKSKTYEKDDTPVKLTSKAGTISGIFSKDLVTIGKLSVPYKFIEMTEIVGFEPFYSESDVDGVFGLGWKDLSIGSIDPYIVELKTQNKIEQAVYSIYLPPENKNKGYLTIGGIEERFFDGPLNYEKLNHDLMWQVDLDVHFGNVSSKKANVILDSATSVITVPTEFFNQFVESASVFKVPFLSLYVTTCGNTKLPTLEYRSPNKVYTLEPKQYLEPLENIFSALCMLNIVPIDLEKNTFVLGDPFMRKYFTVYDYDNHTVGFALAKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords HAP protein
publication title Crystal structures of the histo-aspartic protease (HAP) from Plasmodium falciparum.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 79
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3fnuA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3fnuA01
2Q64A 1HIIA 5P8DA 4DPIA 5DQ5A 2QZWA 3VYDA 2F8GA 3BHEA 1SH9A 4D8CA 3K1WA 1GNNA 3KM4A 4R8YA 3ZL7A 4Y3DA 4MC6A 1W50A 1MT7A 5HDZA 1DIFA 3INHA 5P3QA 3BGBA 5P34A 2O4KA 1IDBA 1ODYA 2QI4A 5P5EA 3FV3A 3UDMA 3Q6YA 2G22A 5P1QA 5IVSA 1K6VA 2HB3A 3UQXA 2OHQA 4I11A 2AVSA 2AVQA 5P0LA 4J17A 4Y37A 4A6CA 1QDMA 3VUCA 5DR3A 3OQ7A 1HVIA 7HVPA 2ER9E 2FNSA 5P0VA 4H3FA 5HU1A 5P6DA 5P1IA 3APPA 5BS4A 4Y3MA 1RNEA 3TKWA 3IXOA 2AVVA 1SP5A 3GGUA 2OHUA 5P8OA 3LITA 2G26A 1LYBB 3BC4A 3G72A 5P3VA 2ZYEA 5P31A 3GGXA 4EJKA 3UQPA 5P2DA 3O9BA 2NR6A 2P3AA 3EL0A 1RL8A 4RROA 5P4XA 2XYFA 5P50A 3OQAA 1HWRA 2PH8A 5P27A 5P42A 4YDGA 5P73A 4ER4E 5P0GA 5OZGA 2AZ9A 2WF0A 5OZFA 5P8HA 5P1TA 1MUIA 5OZCA 1EPOE 5P8NA 5P5VA 5P4VA 5OZYA 1DP5A 4FL8A 5OZJA 2HIZA 5P5HA 5P5NA 3LINA 5P6TA 5AHBA 4R5NA 1MEUA 4GYEA 3RTNA 4FAEA 5P0OA 1A94A 5J25A 5ER1E 2ZJLA 3GI6A 4RYGA 2P3CA 1W5YA 4YBIA 2VKMA 2ZDZA 1AVFA 3OY4A 3H5BA 1KJ4A 2IDWA 5P3OA 3PLDA 3G6ZA 2IS0A 3R2FA 4FM8A 2AIDA 3MSJA 4Z50A 3OUAA 4Y3QA 5P47A 4N00A 1B5FB 4I12A 4Y3JA 3T6IA 1MRWA 2ZHVA 2CENA 4FCOA 4QJ6A 5IS4A 3EMYA 4PZWA 5P0HA 1LF4A 5P2QA 1IIQA 4DQFA 1META 5P04A 1EC3A 4IVSA 1K1TA 5P8AA 3FNSA 2HC0A 3BUHA 2P3BB 3EKWA 5P4BA 4J0PA 4M8XA 1IZHA 1G35A 3D20A 2JE4A 1B6JA 4YOBA 4OBZA 3TLHA 5HE4A 5P7KA 2QHZA 2F3KA 2J9JA 2WEBA 4EJ8A 2Q15A 2BKSA 4J54A 3L38A 1TSUA 5P3IA 2PYNA 1LYWA 5AHAA 3UFNA 5IVTA 5P5DA 5HE5A 5P3KA 5P4IA 1ZBGA 1K2BA 3KFSA 1PFZA 4Y3WA 2ER6E 1YX9A 5P08A 5P2WA 5P4PA 2AVMA 4ZSPA 1EPPE 1HIVA 2QI3A 1YM2A 3UDJA 3IA9A 3SM2A 6UPJA 5P6SA 1B6LA 5P49A 1TCXA 5P41A 1OEWA 4DPFA 2ZHSA 4LP9A 4YCTA 2FDDA 5P3PA 4NPTA 4CPRA 5P1CA 5KQXA 1BV7A 4GMIA 4OBJA 2ZJMA 3INDA 3Q3TA 2HS1A 5P2HA 1HVJA 2BKTA 3MSLA 2A4FA 1RPIA 5P0KA 5P06A 3RSXA 2J9JB 3TOFA 5P6QA 3KDDA 2FGUA 4L7GA 3KN0A 5OZVA 1LYWB 5P77A 3BXSA 5OZUA 2RSPA 4XX3A 3L5BA 3TTPA 5BRYA 3EL5A 2F80A 4EP3A 2P8HA 4RVIA 3LIVA 3VLAA 5P6JA 3LIXA 3SQFA 3O9FA 3BXRA 2QMPA 3RU1A 5P5SA 4U7VA 3LIZA 3JVYA 4GZFA 3K4VA 5P1SA 5P0UA 1WKRA 1C70A 5P26A 1EBKC 2MIPA 4YD7A 3EM6A 5DR1A 5OZLA 5P5ZA 5OZZA 4LXKA 1BILA 4IVTA 4HZTA 3GI4A 5OZ0A 4KUPA 3ST5A 4ZE6A 1BWBA 5OZXA 2NXDA 3SLZA 5P0FA 5P4HA 5P8UA 3IN3A 4YOAA 5P2AA 5P3XA 3VV6A 4EPJA 1ZTZA 5P1KA 3M9FA 4F76A 4Y3AA 3C9XA 1GVVA 1MSMA 1QS8A 4WTUA 2Q63A 1F7AA 5P6LA 5EZZA 3OGQA 3PEPA 5P7YA 3TPLA 4Y58A 2G1YA 5P5LA 4CPQA 2FS4A 5P2SA 1BVGA 3NDWA 1T6GA 5OZ8A 1MERA 3FNTA 3VLBA 1HVKA 1UH7A 2WF2A 1W51A 4Y5GA 2VA7A 1AIDA 4PYVA 4DUSA 1ZSRA 4DJXA 3KA2A 2FLEA 1MESA 5P84A 5P19A 1Z8CA 2ZJIA 5P7MA 2Q55A 2QCIA 4K4RA 3ZLQA 5E5JA 2NTRA 1YT9A 4FSEA 5HDXA 4CPTA 3QVIA 1MRXA 3QROA 3ER5E 3OUCA 2IGXA 5P71A 2V10C 1HHPA 3RSVA 5P85A 4Y44A 1IZEA 4CKUA 4EP2A 5P1VA 1M43A 1B6KA 1PROA 5P2VA 2R5QA 4YCKA 1GNOA 3S7LA 3EKVA 2UY0A 3QN8A 1GKTA 5P7UA 5COKA 1D4JA 2WL0A 2ER0E 3PWRA 4DJOA 3SACA 1FKNA 2I4VA 1SDVA 3ZKSA 4Y4EA 3HAUA 2IRZA 3INEA 5P15A 4Z2ZA 2AZCA 3K5FA 1HEGE 1W5XA 2O4SA 3S8IA 5P4CA 4NJUA 4XXSA 3LZSA 2QNPA 5DQ4A 3ZOVA 5P4LA 3WB5A 3UQUA 1C6YA 5P4JA 1EPLE 4B1EA 3VV7A 3GI0A 5F01A 4LBTA 5JFPA 2FIVA 3L59A 4YCYA 3I8WA 4B72A 2QAKA 3D1YA 3NXNA 4EXGA 5P4OA 4Y54A 3BUGA 4Y48A 3GGAA 4Y5AA 1BIMA 2ZHTA 5P23A 5C9BA 3EM3A 3HVGA 3QBHA 3S54A 4LL3A 5P79A 4R92A 3U6AA 1IZDA 2VNNA 5P67A 5P2UA 5AH9A 4MC1A 1YM4A 1ZSFA 5P88A 5SZ9A 5HTZA 5P8VA 3SA6A 4J1CA 4JOOA 1D4SA 1E81E 4FE6A 5P0WA 5P8FA 5OZPA 3GI5A 2VA5A 1EC2A 1IBQA 3URJA 5P3BA 1EBZA 5P10A 3UDQA 2QI7A 4XKXA 1A8KA 1E80E 5ISJA 5DR8A 5DR7A 4YA8A 3WZ6A 3CKPA 1XN2A 4RVXA 4Y5PA 4I0GA 4EWOA 5P8EA 5P1NA 4DJYA 5DQ2A 4ZPFA 3HW1A 1BDQA 5P0YA 3CICA 1HTEA 3EC0A 4JPCA 1YTGA 5P24A 5P3JA 3OHFA 2QZLA 5P6OA 3SKGA 4DJQA 8HVPA 5P3FA 1HPSA 2NPHA 1HIHA 3CYXA 5P5AA 5OZ1A 1LZQA 4YD3A 3UDNA 1XDHA 4ZIPA 1TSQA 2RENA 4YD5A 2R9BA 1QBUA 3ZKMA 5BWYA 3PVKA 2R43A 3OK9A 3NU5A 3CKTA 3NSHA 5HDVA 2G27A 1SMEA 5P53A 1BBSA 5P7ZA 3VSWA 3OTSA 1DAZC 1FMBA 1SMRA 4HLAA 1HTGA 3SA4A 4CMSA 1UPJA 4K4PA 2R8NA 2OHRA 4Y3SA 4J0TA 2HAHA 1ZPKA 3PMUA 5P4WA 2A1EA 2OHLA 5P3MA 1AZ5A 1TQFA 3N3IA 3VYEA 5P1DA 1JLDA 5P32A 2QI0A 4EQ0A 2I4WA 5P28A 5P0AA 2HB2A 3D1ZA 5OZDA 3ZKIA 2V0ZC 5P18A 5ER2E 4RLDA 4BELA 3KT2A 5P09A 4DFGA 5DQCA 4HVPA 3TH9A 5DPZA 4FGXA 4ZSMA 1B5FA 4TRWA 2PSGA 5P5TA 5SY2A 4Y3XA 3NWQA 5P2IA 5OZ4A 3B80A 3NU6A 3EBZA 5P22A 5P72A 5P8GA 1K6TA 3ZKNA 4Y4TA 3OQFA 4D85A 5P7CA 1HSGA 3CIDA 3GW5A 2AOEA 4Y50A 2P3BA 4GJAA 1M4HA 3QRMA 2VS2A 1IZIA 4DQEA 2APRA 2VIEA 3KYRA 4FM7A 3EM4A 4RCDA 5P7OA 5HCTA 3SFCA 4X7IA 3O9LA 2ZHRA 3LIQA 4GJ8A 2HM1A 4M8YA 3KFRA 3IGBA 3OUBA 1C6ZA 3JW2A 3TPPA 2IKUA 1MT8A 3LHGA 4DQGA 2AZ8A 5P86A 5P1XA 5P6RA 3R0WA 3RTHA 3TNEA 4CPUA 1D4HA 5KOQA 1B6MA 4I0IA 5P62A 5CLMA 2QD7A 1CPIA 5P80A 5P3CA 4I1CA 1SIVA 5C9DA 1APWE 5P0SA 3OU4A 1AJXA 4OBGA 2G21A 4Y5NA 1FGCC 2IL2A 5P0IA 1UH9A 3OXVA 4B05A 2O4NA 5P35A 5P2OA 5P2YA 5IVQA 4AA8A 5P8MA 4K4QA 1EBWA 5COPA 1MTBA 4Y5MA 4HEGA 2PQZA 3BGCA 1QBSA 3NUJA 1ZPAA 4AA9A 1IVQA 1XL5A 5P7VA 2HS2A 3OOZA 3DV5A 3HDKA 5P4ZA 4Y41A 1HEFE 4HDPA 5P1ZA 5P7BA 2WKZA 3Q70A 4DI2A 4WY6A 5P3RA 1QBTA 2CEMA 4YHQA 3O9LB 5AHCA 5P14A 4EXHA 3UDHA 1FFFC 3URLA 5P7RA 5P8LA 2G1NA 5APRE 1MTRA 1HVSA 1FLHA 2B7FA 4GIDA 1KZKA 4J55A 1NH0A 2NMZA 3R4BA 5P7NA 5P5GA 3AIDA 5P4AA 3WZ8A 4RVJA 3NWXA 1IVPA 4UPJA 3OADA 2WEZA 5P0BA 2QK5A 4GJ6A 3Q4BA 3LZYA 5P1PA 3NUOA 5P4KA 5P4QA 3SKFA 3DUYA 4Y3NA 5AH6A 4Y51A 3ER3E 4FAFA 3OXXA 2Z54A 9HVPA 3OU4B 3PM4A 3K5CA 4Y4WA 1BDRA 3NU3A 4OBKA 4B70A 5CONA 1HPXA 1T7KA 5P4TA 5P3GA 2NNKA 4Y4ZA 3KFNA 4ZEAA 1EEDP 1LF2A 2G1OA 2JJIA 4R95A 3SABA 5P83A 5OZOA 5P3UA 4H3GA 1EAGA 1FQ7A 3CIBA 5P1AA 3NLSA 3QPJA 4QJAA 1ZAPA 1FG6C 2QHYA 5P61A 3OOTA 5OZEA 3BRAA 3PBDA 1C6XA 1CZIE 3UQWA 2FDEA 3R0YA 1LV1A 4YD6A 4Y5BA 5P29A 4Y3TA 5P4SA 5P3DA 5P7FA 4R93A 3PWMA 4Y53A 4ACUA 5P1OA 5EZXA 3OADB 2VA6A 2I4XA 4FRSA 3OQDA 3OAGA 5T4SA 5P82A 4B78A 4H3IA 1HVCA 2WF4A 1NPWA 3OU3A 5P2XA 5P4NA 3PRSA 3KFPA 5P5PA 4YD4A 5P7WA 1LEEA 4J0YA 3PHVA 2VJ6A 5P78A 1FIVA 3L5CA 3DCKA 2OHKA 2QMGA 3GGVA 5P7AA 5P11A 2AOGA 3LPJA 2PWRA 4I0EA 5C9FA 2O4LA 3L5FA 4D88A 3PLLA 5HDUA 3SPKA 5P66A 3SAAA 5P36A 2HB4A 3O9HA 5OYYA 4Y57A 2NXLA 4EJLA 3INFA 4NKKA 3BVAA 4EYRA 1NPAA 4YBFA 4KB9A 4Y4AA 5P1UA 2V16C 3DJKA 2RMPA 4H1EA 3KT5A 3UPJA 2H6SA 5HVPA 3QRSA 4LAPA 4Y3RA 3IN4A 2WECA 5OYSA 1G2KA 1HTFA 3D91A 4Y3PA 3UDYA 3I6OA 2IENA 5P3ZA 3S53A 3UCBA 5AGZA 4I8ZA 3PSYA 2JYSA 2ZJJA 3WZ7A 2V00A 4OD9A 2AOFA 2I4QA 3KDCA 3OAGB 5OZ5A 5P87A 3FIVA 4RRNA 5OYRA 5I3VA 2IKOA 2SAMA 4EJDA 4KE1A 4QJ2A 3T7QA 4RZ1A 5P3EA 5P81A 5P1JA 1K6PA 1EPME 4APEA 3NYGA 1FB7A 3O99A 3ZPSA 1TW7A 1HVHA 3I25A 4H3JA 3UTLA 5P7HA 4YE3A 1HRNA 3VFBA 4PPHA 1ZLFA 1FQ8A 5P1BA 3A2OA 5OYVA 1AXAA 2NXMA 3RVIA 5P8KA 5KR2A 4I0FA 2WEDA 4K8SA 5P03A 5ISKA 1G6LA 4RCFA 4Q1XA 3IVHA 4FRIA 4JP9A 4BFDA 2BJUA 2QI1A 4PEPA 4OC6B 4QLHA 2BPYA 5P0JA 5P43A 2R3TA 4Y4GA 5P16A 4Y4JA 5ENMA 5OZ3A 5P6IA 2FGVA 4DJUA 4AUCA 1XS7D 2VNMA 2V13A 5OYXA 1HSIA 5P6ZA 1FQ5A 2XFIA 1MSNA 4Y3LA 2Q5KA 3QI1A 5P44A 4DV9A 2QMFA 3T11A 5P6BA 4OD9B 3MWSA 4AMTA 4AZYA 5P5JA 5P5KA 3PCWA 4OBFA 5OZHA 3OHHA 4BFBA 4RYCA 5P63A 1PSAA 2CEJA 4B00A 1APUE 1CMSA 5DR0A 2OHTA 5P8RA 3TKGA 3O9CA 3ZKXA 2JXRA 2B8LA 4D83A 4Q5MA 5P0NA 1HBVA 2G24A 4ACXA 7UPJA 5P1HA 3VEUA 2XYEA 5KAOA 2WJOA 5TOLA 4Q1YA 1YTIA 5P6XA 3WB4A 5P30A 3WSJA 1NPVA 4L7JA 5P6PA 3PI5A 5I70A 4I0HA 5P2FA 1VIJA 5P89A 5P46A 4U8WA 5P51A 4TRYA 1SDUA 5P5WA 3LZUA 4B77A 3DM6A 2BPVA 2ZJHA 3KDBA 4ZSQA 1XN3A 4S1GA 3ZKGA 2AOCA 5P7QA 2NNPA 2VIYA 3HAWA 5P8BA 2FNTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2Q64 A;  1HII A;  5P8D A;  4DPI A;  5DQ5 A;  2QZW A;  3VYD A;  2F8G A;  3BHE A;  1SH9 A;  4D8C A;  3K1W A;  1GNN A;  3KM4 A;  4R8Y A;  3ZL7 A;  4Y3D A;  4MC6 A;  1W50 A;  1MT7 A;  5HDZ A;  1DIF A;  3INH A;  5P3Q A;  3BGB A;  5P34 A;  2O4K A;  1IDB A;  1ODY A;  2QI4 A;  5P5E A;  3FV3 A;  3UDM A;  3Q6Y A;  2G22 A;  5P1Q A;  5IVS A;  1K6V A;  2HB3 A;  3UQX A;  2OHQ A;  4I11 A;  2AVS A;  2AVQ A;  5P0L A;  4J17 A;  4Y37 A;  4A6C A;  1QDM A;  3VUC A;  5DR3 A;  3OQ7 A;  1HVI A;  7HVP A;  2ER9 E;  2FNS A;  5P0V A;  4H3F A;  5HU1 A;  5P6D A;  5P1I A;  3APP A;  5BS4 A;  4Y3M A;  1RNE A;  3TKW A;  3IXO A;  2AVV A;  1SP5 A;  3GGU A;  2OHU A;  5P8O A;  3LIT A;  2G26 A;  1LYB B;  3BC4 A;  3G72 A;  5P3V A;  2ZYE A;  5P31 A;  3GGX A;  4EJK A;  3UQP A;  5P2D A;  3O9B A;  2NR6 A;  2P3A A;  3EL0 A;  1RL8 A;  4RRO A;  5P4X A;  2XYF A;  5P50 A;  3OQA A;  1HWR A;  2PH8 A;  5P27 A;  5P42 A;  4YDG A;  5P73 A;  4ER4 E;  5P0G A;  5OZG A;  2AZ9 A;  2WF0 A;  5OZF A;  5P8H A;  5P1T A;  1MUI A;  5OZC A;  1EPO E;  5P8N A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2PMA A;  5P6F A;  5P2G A;  1SBG A;  2ZJN A;  4J1I A;  3CYW A;  5P0C A;  2J9K A;  3VFA A;  2I4U A;  5P07 A;  1SGZ A;  3EKT A;  1DPJ A;  3JVW A;  4I0J A;  3T3C A;  1MVP A;  3AUP A;  4R91 A;  4L6B A;  3S85 A;  3I2L A;  5P6K A;  5P6H A;  2FXE A;  2HPE A;  4ZLS A;  5P7E A;  3VF5 A;  1LF3 A;  5P56 A;  3NXE A;  4Y5L A;  5P38 A;  3UDK A;  1U8G A;  3SA7 A;  3OTY A;  1EC1 A;  4QGI A;  3PSU A;  5P6Y A;  5P5I A;  1EPN E;  1HVR A;  4DQC A;  4GJ5 A;  3Q5H A;  1B11 A;  1KJ7 A;  1QBR A;  1APT E;  4NJV A;  3OUD A;  1MIQ A;  3RTM A;  5UPJ A;  1GVU A;  3N4L A;  2PK5 A;  4DQB A;  3HD8 A;  1ER8 E;  5F00 A;  5P2R A;  3K5G A;  3K4V C;  5P7I A;  3NU4 A;  3PJ6 A;  5KQZ A;  1E5O E;  4YDF A;  4Q1N A;  4I0Z A;  1BDL A;  2Q54 A;  3QBF A;  2G69 A;  1G0V A;  2AVO A;  4OBH A;  1FFI C;  6APR E;  2OF0 A;  5P1E A;  3DV1 A;  1ZP8 A;  5P3A A;  1SDT A;  5P2J A;  4XX4 A;  1NSO A;  5P65 A;  3FX5 A;  3LPI A;  2ZJK A;  4MC9 A;  4MC2 A;  4B0Q A;  2OHS A;  5P69 A;  1LS5 A;  2G20 A;  2WF3 A;  4NPU A;  3QAA A;  4Y3F A;  4QJ9 A;  5P75 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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