2V12C

Crystal structure of renin with inhibitor 8
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
337
structure length
333
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords RENIN
publication title Structure-Based Drug Design: The Discovery of Novel Nonpeptide Orally Active Inhibitors of Human Renin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 333
sequence length 337
chains with identical sequence O
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2007-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v12C02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v12C01
1W5YA 4YCYA 2IDWA 4ZPGA 4GZFA 4U7QA 2P3CA 3B7VA 2G21A 4DJPA 3L58A 1HHPA 1B5FB 2QZLA 2QMPA 5P53A 1AJXA 3WZ7A 2OAHA 2HIZA 2P3BA 5P4UA 3VF7A 2G1YA 3UQWA 4Y5AA 5OZLA 2V10C 5P8MA 3FSMA 2PYNA 1IZEA 5P8BA 4EXGA 3RVIA 3MWSA 2ZE1A 2APRA 4RRSA 3PHVA 4PHVA 4DQFA 5JFUA 6APRE 3UDMA 5APRE 1BXOA 1FIVA 5KR0A 1C6YA 4OBZA 4AA8A 4J1FA 4D85A 5ENKA 3TPJA 5P87A 4BELA 5P09A 5P38A 3D20A 2AZCA 1IDBA 4Y36A 5P7IA 1FB7A 2I4UA 5P78A 3LIYA 1ODWA 2PQZA 2BPXA 3TOHA 4NKKA 5P32A 4I0EA 3K5DA 1T7KA 4Y3ZA 3T11A 5COKA 1J71A 4Q1WA 1LYWA 4XX4A 4Q1YA 2Z4OA 1ZPKA 5P25A 2HS2A 5P0OA 1YTGA 5P8UA 5HDUA 4Y3EA 3HAWA 1D4HA 3NU9A 4B78A 5P0WA 5TOLA 1DW6C 4R8YA 4CPUA 5P0CA 1QDMA 3L5CA 3QBHA 4Y54A 4Y5MA 3EL9A 3BXSA 3S56A 1KJGA 5P1QA 5P3AA 2CEMA 3K1WA 5P56A 2QI1A 2R5PA 5OZ0A 3N3IA 5OZEA 5OZTA 5P8SA 4ZPFA 4Y3PA 3TPRA 4EWOA 4ZPEA 5KR2A 3O9GA 5P1DA 3BVAA 5P49A 3OUDB 5P3NA 5P2AA 3CKTA 4E43A 5OYWA 3OY4A 4Y4XA 1SH9A 3TNEA 3LIQA 5HU0A 3LZUA 4FCOA 4U7VA 3D1ZA 2QMFA 2Z54A 1XN3A 5P35A 5IE1A 3LITA 3KDBA 4LXKA 1ODYA 5P3ZA 1BWAA 4GJ5A 1ZSFA 1DP5A 1KJ4A 3QIHA 1XE6A 2O4KA 2QI3A 4Y3WA 2AODA 2ER6E 5P7CA 2IKOA 3VFAA 1FMXA 1K6TA 3O9DA 5P3XA 3OQKA 4Q5MA 4ZE6A 4JECA 5DQ5A 2BB9A 3K4VC 5P8CA 5P6MA 3SKFA 1MSNA 3KM4A 3LNKA 4Q1XA 5P4JA 3ER3E 2V11C 3CYXA 3PCWA 5P6QA 4JOOA 5P2XA 4B05A 5P73A 3O9AA 4J54A 5P8EA 5P6WA 4OD9B 2ZHSA 3ZMGA 3DV5A 1T7JA 3EMYA 1JLDA 4YOAA 5P7OA 5P5LA 5P5ZA 1FEJC 4B0QA 5P43A 1HVLA 3SPKA 5P62A 1META 4Y58A 3T7PA 1MT8A 5F00A 1FKNA 3ZKSA 3GI0A 3O9EA 4N00A 4Y3AA 4ZEAA 5HVPA 1LYAA 1OEXA 5P4MA 5P5CA 2ZHVA 1A8GA 1T7IA 5P84A 4QLHA 5P48A 4R93A 3BC4A 2F3EA 3NDTA 2ZJJA 5OYVA 1ZPAA 5P5OA 5P7XA 1PSNA 3QPJA 5P6KA 3APRE 1GVWA 2HB4A 3S53A 1B6JA 4DQBA 4Y57A 5P3MA 5P0EA 3PI5A 3SKGA 4DJWA 3VV8A 5KOQA 5P03A 5P5DA 4Y3TA 1YT9A 2V13A 5DR0A 4ZSPA 5P4PA 1ODXA 5P60A 1CMSA 4RYGA 1AJVA 5P5HA 1TZSA 1EBZA 4K9HA 5F01A 2O40A 5HCOA 3UDNA 4DQHA 5P0LA 5OZ1A 3C9XA 2QU3A 4PEPA 2PYMA 3OADB 5AH8A 5P0YA 1FFFC 3L5EA 3PJ6A 5HDXA 5P08A 4DJYA 5P3UA 5I70A 5P5XA 1MRXA 2OHLA 1A9MA 1MT7A 4EYRA 5P41A 1APWE 5P3VA 3SA6A 5UPJA 1LF4A 3OGQA 4LXMA 5OYYA 3FV3A 5P6TA 3F9QA 5P0JA 4J0PA 1DPJA 1GNNA 1LV1A 1W6HA 4FAEA 5P46A 1AZ5A 3GGXA 2V12C 4H3IA 4Y47A 3PSGA 5P7MA 5CLMA 2PSUA 2JJJA 5P1FA 3M9FA 3NU3A 3OUBA 5P42A 3NUOA 5P4CA 4HE9A 3DK1A 3VV6A 5JODA 2VIZA 5OZKA 5OZ7A 4Y38A 4AA9A 3QROA 1BV7A 3OQFA 5P4QA 1FG6C 3UFLA 1FMUA 4DPIA 2QD8A 2HC0A 5T4SA 3INFA 2QHYA 4B77A 4Y3HA 1FLHA 3KMXA 3OAGB 2OHKA 4R5NA 3UDRA 1GVTA 5P3DA 5SY3A 1NPVA 3QRMA 2PSVA 4QJ8A 2WEBA 4J0VA 1BDQA 3SA3A 4B1EA 4FGXA 2I0DA 1HXBA 1WBKA 4F73A 3S43A 4J55A 1HPVA 3HBOA 7UPJA 2ZJLA 5OYTA 1W51A 3HLOA 1SIPA 1UH8A 5OZ5A 5OZNA 2J9KA 5P6YA 5OZ9A 4L6BA 5P81A 1TSQA 5P7TA 4EJKA 2P4JA 1SP5A 1CPIA 5I3WA 5P4AA 2IEOA 4H3GA 4H1EA 4Y3NA 2G22A 3O9BA 2F8GA 3CICA 4FSEA 3URLA 1MIQA 1B6PA 2PWRA 5P7LA 3OXCA 4R95A 5P1VA 1YG9A 1GVUA 5COPA 5P15A 2UPJA 3SM1A 1BVGA 3FNSA 5P06A 5P71A 3QRVA 4LBTA 3OU4A 4RCEA 5AH7A 3DUYA 5P8PA 4U8WA 5AHAA 5P8DA 2WF4A 3KDCA 1HVHA 1K2CA 1AIDA 2NXMA 5OYQA 3DCRA 4XKXA 2QD7A 2IGXA 3UPJA 4Y5KA 2OHPA 3L59A 3ZKMA 3EL4A 3IAWA 4S1GA 5P6RA 3INHA 5P0HA 2QZKA 4Y48A 3LPJA 1XE5A 5P31A 4NPUA 2NXLA 4I11A 3OOZA 3UDPA 1A94A 4YD7A 1B11A 4H3JA 3PBZA 4FRKA 1MT9A 5P26A 3S54A 5AH9A 3QAAA 3L5FA 4I0IA 5P39A 1Z1RA 5P20A 1AM5A 3PBDA 3UF3A 2HM1A 2PK6A 2OF0A 1SGUA 3O99A 3OQDA 4I1CA 5P4BA 1MVPA 5ER1E 3LHGA 4RVIA 2P3BB 5P51A 4FAFA 5P6IA 5HDVA 3EM3A 5P16A 2ANLA 5KR1A 3Q3TA 5P6NA 5KR8A 4AZYA 3OXWA 1TW7A 1HIIA 4Y5GA 5P76A 3VYEA 5P4EA 3I6OA 3EC0A 4OBZB 2BJUA 2G94A 3RTHA 4M8XA 1UH9A 2O4PA 1XS7D 4TRYA 4Y6MA 1EC2A 2AOHA 3UDJA 3GGAA 4APRE 5P0QA 5P2TA 4M8YA 4CPWA 2H6TA 3L5BA 5P4DA 2B7FA 3I25A 5P5BA 5P8KA 1IVQA 1PPLE 4I12A 5P5AA 5P8TA 1EBWA 4DJUA 5OZOA 5BRYA 3K5FA 2AQUA 2HPEA 5OZYA 1SMEA 3JVYA 5SXNA 3GGUA 1LYWB 5P0XA 3TOFA 4CPSA 5P3JA 1HRNA 5P1GA 5P8OA 3I2LA 5P70A 3EBZA 3OU3A 2XYFA 2O4NA 5P2QA 3ST5A 4Y51A 5P0TA 3UQUA 3CIBA 4B00A 4Y4JA 2BPVA 4ER1E 3SO9A 5P1LA 4DI2A 3EKVA 3NU4A 3Q6YA 5P1JA 2RKFA 3I7EA 4NJTA 5OZPA 3ZKGA 1IIQA 1EPNE 3KFSA 4APEA 3PMYA 1QBSA 4HA5A 5P72A 5IS4A 4Y43A 4FLGA 1PPKE 4RGHA 5P4LA 3UHLA 3CKPA 5P2RA 3NSHA 2P8HA 4Y35A 5P5QA 3VSXA 3EL1A 2CENA 1TSUA 2ZHUA 5P2MA 4RYCA 1WKRA 3HDKA 5P50A 3KFRA 3OGPA 5KQYA 5P67A 4D83A 1YTJA 1PFZA 2ZYEA 3EKTA 4DJVA 1FMBA 5AH6A 5P5NA 2Q63A 4B1CA 2B60A 3WZ8A 5P2UA 1HEFE 4K4PA 3OXXA 2WEZA 1C6XA 1DAZC 3NR6A 5P7YA 1BXQA 5KOSA 1AVFA 3ZKIA 5P1CA 3OQ7A 4PYVA 1VIKA 1BDLA 1FQ6A 3IVHA 5P1TA 2G20A 1EPME 1QBTA 3MSLA 4DJRA 3UDQA 4Y5CA 5P2WA 2AZ9A 5P0KA 5P8LA 2NXDA 2VIJA 3S7MA 4Y3RA 5P6ZA 1NSOA 7HVPA 3DJKA 5OZVA 4TVGA 2I0AA 4X7IA 4FM6A 5P3RA 5I3VA 3VLBA 5P5IA 2MIPA 4I8ZA 1CZIE 5BS4A 4JPEA 5P7JA 5P4RA 2HPFA 3EKPA 1K1TA 1SIVA 5DQ1A 5P5UA 2ZJKA 1BV9A 1WBMA 5KQZA 2BBBA 5P07A 1MRWA 2IS0A 5HD0A 4OBGA 2ZDZA 4RCFA 2WEAA 4NJSA 5P40A 5P69A 1LYAB 5OZUA 4YE3A 2B42A 5B18A 5AHBA 1FQ7A 3O9FA 4IVSA 4WY1A 4FL8A 5P5PA 4Y5NA 1MTBA 5C9BA 1GVXA 5P5EA 2WHHA 4EXHA 3ZPTA 5P77A 5P3OA 4Y5BA 3GI5A 3TH9A 2A1EA 2NTRA 4RRNA 4J1IA 4F76A 4DVFA 3NLSA 1BWBA 5P2DA 4F75A 2VJ7A 3PWMA 4KB9A 1PROA 2PSGA 3EXOA 5KAOA 4RCDA 3B80A 1IVPA 4Y39A 1HIVA 1LS5A 5P58A 5P6GA 1OD1A 3QRSA 1TQFA 1D4IA 5P2OA 1G0VA 1BILA 2I4XA 3D3TA 5P0MA 2VS2A 4Y3GA 1ZAPA 3EL5A 3HD8A 5P8RA 5P6CA 3PSUA 2R3WA 5P7UA 3IN4A 1A8KA 4Z22A 2HAHA 3ZOVA 3ECGA 3HW1A 2QZXA 5P4OA 3DCKA 1T3RA 2R43A 5P0ZA 5P1MA 4L1AA 1EPRE 4EQJA 3EM4A 5P2CA 2QAKA 5SZ9A 4TRWA 5OYUA 5P04A 3T3CA 2XFIA 3PVKA 5DQ2A 2G24A 4GB2A 5P0PA 1EPPE 1LF2A 5P6BA 2XYEA 4FE6A 5P80A 3WSJA 3QI1A 3JVWA 4DQGA 1ZBGA 2ZJNA 1ME6A 4OC6A 5P05A 3UDKA 4EP3A 3TPLA 1EC0A 2Q11A 4X2LA 4CPRA 4CPXA 2P3AA 3IXJA 5OZZA 4GJ8A 1MSMA 1M43A 2NNKA 4QJ7A 5P2KA 5P1ZA 3VLAA 1SDVA 5P14A 5P00A 5OZQA 4Y3QA 2B7ZA 2G26A 6FIVA 3ZL7A 1GNOA 3SA7A 3PLDA 4CMSA 4CPQA 2O4SA 4LHHA 4DPFA 4B1DA 5P5GA 5OZ2A 5P74A 2B8VA 3OTSA 1TCWA 4Y4BA 5P5TA 4LP9A 2QU2A 3S43B 2AZBA 5P4WA 3TL9A 1UPJA 3INEA 5DR1A 4PPHA 2ASIA 3PLLA 4Y5LA 2QZWA 2AIDA 2QMGA 3KYRA 2NNPA 1DIFA 1GKTA 2QHZA 4Z50A 2QP8A 2G1OA 4Y4DA 1T6EX 1MERA 1FQXA 3LZVA 4J1CA 5P0VA 4NJUA 3WB5A 3S8IA 4FS4A 3BVBA 1IZIA 4Y45A 5OYXA 3VFBA 1EC1A 2QI7A 4RZ1A 1HVJA 5P02A 4B70A 4D88A 3ZKNA 3NXEA 5P7SA 3UQXA 4RVJA 3OU4B 3INDA 5P0IA 1Z1HA 5P88A 2WF3A 1APVE 5KQXA 5P1OA 5P0GA 2HB2A 4Y4ZA 4EJ8A 8HVPA 3AIDA 3KFPA 3S7LA 5DR7A 2UXZA 2WF0A 4GMIA 4IVTA 1NH0A 1SDTA 5P3QA 3RTMA 2RKGA 3ZPUA 2PH6A 1D4JA 4MC6A 1XL5A 3EKYA 4HDFA 4F74A 1BDRA 2FDDA 1LYBA 1AXAA 4Y4GA 5P0RA 1BVEA 4I0FA 5P5JA 3LZSA 1HWRA 4L7GA 5P7FA 1W5VA 5IVSA 3QN8A 1D4LA 5P1HA 5P36A 2OHQA 3QBFA 4Y4WA 5P54A 5P5KA 3QP0A 1F34A 3DV1A 3L3AA 5P1IA 1OEWA 1ZP8A 5J25A 3G6ZA 4DQEA 4COEA 4YD4A 5P1XA 4OBHA 4J1KA 3MXDA 5P5VA 5E5KA 2ZHTA 3OU1A 5P5SA 2G1SA 2FDEA 4YD6A 1LZQA 1RNEA 5P1YA 1K6CA 3GGVA 5P2JA 5HE7A 1F7AA 1AAQA 5P6HA 3PCZA 3BGCA 3GI4A 2OHNA 4ZLSA 1HTRB 9HVPA 4BFDA 2RMPA 3PM4A 2NR6A 5P11A 1IZHA 4LC7A 1ZJ7A 2FLEA 4CPTA 2AOIA 5DGWA 1EC3A 2WL0A 4XX3A 4QJ6A 3NDWA 1HVCA 3K5GA 2QI0A 5P6FA 2VKMA 5P2NA 1IBQA 5P7PA 3HAUA 4YCTA 5P75A 2FXDA 5P4TA 3NUJA 5DR3A 3MSKA 5OZ4A 2Q64A 1D4SA 2R38A 4Y44A 5OZRA 4EJLA 1A30A 5ENMA 1EBYA 5P17A 1HXWA 2IENA 4GJCA 4EJDA 4MC1A 5P63A 3S45A 3GI6A 5P30A 1Q9PA 5I3XA 1D4KA 3IGBA 4L7JA 3SM2A 5OZ3A 4FIVA 2A4FA 5OZCA 1RV7A 1QS8A 5P6UA 3HVGA 3CMSA 2Q54A 5P6XA 5OZSA 5P52A 2AZ8A 4DFGA 3VF5A 3PWRA 4Y9WA 3UDHA 1FQ5A 4ACUA 1FGCC 2WJOA 3LINA 1NPAA 5P0UA 1B6MA 4L7HA 5P27A 2NMZA 2Q55A 4K4RA 1UH7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1W5Y A;  4YCY A;  2IDW A;  4ZPG A;  4GZF A;  4U7Q A;  2P3C A;  3B7V A;  2G21 A;  4DJP A;  3L58 A;  1HHP A;  1B5F B;  2QZL A;  2QMP A;  5P53 A;  1AJX A;  3WZ7 A;  2OAH A;  2HIZ A;  2P3B A;  5P4U A;  3VF7 A;  2G1Y A;  3UQW A;  4Y5A A;  5OZL A;  2V10 C;  5P8M A;  3FSM A;  2PYN A;  1IZE A;  5P8B A;  4EXG A;  3RVI A;  3MWS A;  2ZE1 A;  2APR A;  4RRS A;  3PHV A;  4PHV A;  4DQF A;  5JFU A;  6APR E;  3UDM A;  5APR E;  1BXO A;  1FIV A;  5KR0 A;  1C6Y A;  4OBZ A;  4AA8 A;  4J1F A;  4D85 A;  5ENK A;  3TPJ A;  5P87 A;  4BEL A;  5P09 A;  5P38 A;  3D20 A;  2AZC A;  1IDB A;  4Y36 A;  5P7I A;  1FB7 A;  2I4U A;  5P78 A;  3LIY A;  1ODW A;  2PQZ A;  2BPX A;  3TOH A;  4NKK A;  5P32 A;  4I0E A;  3K5D A;  1T7K A;  4Y3Z A;  3T11 A;  5COK A;  1J71 A;  4Q1W A;  1LYW A;  4XX4 A;  4Q1Y A;  2Z4O A;  1ZPK A;  5P25 A;  2HS2 A;  5P0O A;  1YTG A;  5P8U A;  5HDU A;  4Y3E A;  3HAW A;  1D4H A;  3NU9 A;  4B78 A;  5P0W A;  5TOL A;  1DW6 C;  4R8Y A;  4CPU A;  5P0C A;  1QDM A;  3L5C A;  3QBH A;  4Y54 A;  4Y5M A;  3EL9 A;  3BXS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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