1J71A

Structure of the extracellular aspartic proteinase from candida tropicalis yeast.
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
334
structure length
334
Chain Sequence
SDVPTTLINEGPSYAADIVVGSNQQKQTVVIDTGSSDLWVVDTDAECQVTYSGQTNNFCKQEGTFDPSSSSSAQNLNQDFSIEYGDLTSSQGSFYKDTVGFGGISIKNQQFADVTTTSVDQGIMGIGFTADEAGYNLYDNVPVTLKKQGIINKNAYSLYLNSEDASTGKIIFGGVDNAKYTGTLTALPVTSSVELRVHLGSINFDGTSVSTNADVVLDSGTTITYFSQSTADKFARIVGATWDSRNEIYRLPSCDLSGDAVFNFDQGVKITVPLSELILKDSDSSICYFGISRNDANILGDNFLRRAYIVYDLDDKTISLAQVKYTSSSDISAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Aspartic proteinase
publication title High-resolution structure of the extracellular aspartic proteinase from Candida tropicalis yeast.
pubmed doi rcsb
total genus 98
structure length 334
sequence length 334
ec nomenclature ec 3.4.23.24: Candidapepsin.
pdb deposition date 2001-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1j71A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1j71A01
5P80A 3O9DA 3LZSA 5P0NA 5P03A 1HBVA 4Y4GA 3BVBA 3PEPA 5P64A 1QBTA 4Y3PA 4EHCA 2VNNA 4LC7A 4DQHA 4GJ6A 3NSHA 3OXVA 4AZYA 2V11C 1GVTA 3KA2A 5P8BA 1GNNA 5P11A 3UCBA 3MSLA 2PK5A 1MERA 5HE7A 3LZYA 4B1DA 1C6XA 1QRPE 1SGZA 3R0YA 4YD7A 4DJRA 2WF4A 1HOSA 3WZ6A 5P3QA 2NNPA 1D4SA 5P7CA 1VIKA 5P1MA 1MVPA 5OZ3A 3VFBA 2SAMA 4Q1YA 1T7JA 4FRSA 4K8SA 3OQAA 5DQ4A 5P37A 4D88A 5P5RA 5OYVA 3TLHA 1LYBB 3OQDA 1GNMA 1BDQA 5DR8A 1MEUA 1XE6A 3O9LB 1BIMA 3OTYA 4YOBA 1D4LA 1TCXA 3VV6A 5P4BA 5OZEA 1K6TA 1SP5A 5P54A 3TKWA 2HPEA 4FCOA 1G6LA 5P51A 4DFGA 3VV8A 5P6VA 2XFIA 4Y3XA 5ISKA 4HA5A 5KR0A 5P87A 1KJ4A 5I70A 4RROA 3Q70A 5P39A 3RU1A 4Y3WA 2AOJA 5P31A 5OZHA 2WEDA 4FRKA 3IGBA 3BGBA 3SA3A 4B1CA 3VYFA 2MIPA 5P79A 3SA8A 3OQFA 2AZBA 3O9CA 2Z54A 2B7FA 3VSWA 4U8WA 2R3TA 3MXDA 1LZQA 2NPHA 3G6ZA 3PI0A 1FFFC 5DQ1A 4DV9A 3CYXA 1KZKA 5P4UA 2I4UA 5P2FA 5DQ2A 1EPQE 2O4PA 3LZVA 2Q63A 4OBHA 2JJJA 5P2HA 4AMTA 3NXEA 4QJAA 3APRE 5P2QA 5OZCA 3OAGB 3K4VA 3QBHA 3EKQA 5P2EA 1DPJA 1E80E 2ZHSA 3SA7A 3SKFA 2F8GA 3OADB 1W5YA 3NWQA 5P4WA 3KN0A 4Y5PA 4B00A 1W51A 3HDKA 3D1ZA 3LPIA 5P5DA 5P8SA 2OF0A 3TPRA 3FIVA 5P7AA 4AA8A 3TPLA 5P8QA 3KDDA 2RMPA 5KQFA 1MSNA 5P5UA 3OUAA 3D20A 4Y39A 4I8ZA 4Y3YA 1HVKA 3OQKA 2XFJA 4Y4BA 4YD3A 5P6ZA 5P75A 5P3FA 1HVIA 5P09A 3BHEA 3OU4B 3PB5A 4A4QA 5ER1E 3OUDB 4GJDA 3DJKA 4JECA 4Y3FA 4J1KA 4Y4AA 3SM2A 4Y4JA 5P7BA 4Q1NA 3OUCA 4RCFA 2UPJA 1BWBA 2WF1A 5P7MA 2QMGA 1BVGA 5P5GA 3CKPA 3FNUA 3K5CA 2QNPA 3ZKMA 4LAPA 5P0PA 5P6PA 2V16C 5P4TA 2IKOA 2PK6A 1NH0A 4K4RA 5HDUA 2QMPA 1B6MA 2JXRA 5OZTA 2QZLA 5P6OA 3M9FA 3T7XA 5P4VA 4D8CA 4H1EA 3PSGA 4GZFA 3L5DA 3T3CA 3T11A 5P1YA 3HW1A 4J1CA 3O9EA 3I8WA 4B77A 3SFCA 5P6LA 2FMBA 1EPME 1FMUA 1A30A 5P8RA 2PSVA 3QVIA 4Y4EA 2OHLA 1QBSA 3UQWA 4NJTA 4YOAA 3APPA 4NPTA 2WF2A 4Y3DA 1GVVA 1PROA 3L59A 3HVGA 3SAAA 5P2MA 1U8GA 1MTRA 4CPSA 5AH9A 4Y5AA 1AIDA 3Q4BA 4Y45A 1ZLFA 2OHQA 4RRNA 1IDAA 4DPFA 5HCTA 4CPXA 5P58A 1BDLA 1RL8A 4RLDA 5P3AA 1ODXA 3SA4A 5P38A 5P68A 4ACUA 4FAEA 5HU0A 5I3YA 5JODA 3Q5HA 5P8LA 3BXRA 2ZHUA 3TNEA 5P2NA 3ZPSA 2I0DA 5P2YA 1LF2A 1K6CA 2ZJHA 5P1GA 1LEEA 1GVXA 3BRAA 3DV5A 2AOGA 5P3YA 4OBGA 4Y5MA 5KOSA 2VA5A 3NDTA 2F3EA 5P7XA 5P1UA 2QI7A 2FDDA 5OZSA 5P01A 5P50A 3INFA 4UPJA 4CPRA 5ENMA 3URJA 5P7UA 5P5TA 1ODWA 4GMIA 1IDBA 2Q15A 4LHHA 4FSEA 4KB9A 1AM5A 5P55A 4FRJA 1GVUA 4EWOA 1PSAA 3PMUA 1A94A 1PSOE 4GJ7A 4Y44A 1ZAPA 2PYMA 2ZHTA 4DI2A 1FFIC 3OK9A 4PPHA 3VEUA 2QI5A 3S56A 4CP7A 5P74A 4ZSQA 1HHPA 1ME6A 5P2GA 1EBKC 5P05A 5P65A 1E81E 5P2UA 5P4KA 5OZGA 2G20A 5P8KA 2P3BA 5P3CA 2F3KA 4NJVA 3O99A 5OZRA 5KQZA 1ZTZA 4ZPEA 4M8YA 5P0BA 5P7FA 3G72A 4Y51A 4BELA 5P67A 2QZKA 3VCMA 3NUOA 5P2AA 5HCOA 5P85A 3ZLQA 5P6XA 1SH9A 2QU2A 1HVSA 4PZXA 1PSNA 2OAHA 2ZHVA 1TW7A 4OD9A 5P17A 5P0ZA 4IVSA 3O9GA 3EMYA 5P0GA 1TSQA 4J54A 3ZKGA 5P0KA 5P28A 4Y3GA 5P2WA 5OYUA 5P0UA 2QK5A 3VYDA 5P2OA 1BILA 5I3VA 1J71A 5KQYA 4J1EA 1UH7A 4LXMA 3PCZA 1K6PA 1E5OE 4D83A 2A1EA 3K4VC 3IA9A 1FLHA 2NMZA 4OBFA 2OHRA 2HC0A 3CIDA 4J0ZA 1ZBGA 3JW2A 5AH8A 5P7KA 4ZPFA 1W50A 1HPXA 3SLZA 3EL5A 4CPTA 2Q54A 5P5LA 5P2CA 4WTUA 1SMRA 3FSMA 5P0FA 3UQXA 1G2KA 3ZKXA 4ZLSA 1C6ZA 1KJGA 4ZSPA 3KT5A 3IAWA 1HVHA 5KR1A 1LV1A 4GJBA 5P3HA 2AZ9A 5P5QA 1HRNA 1HIHA 3CKRA 5P24A 4L7JA 5P5PA 1SIVA 4RGHA 5P6RA 1TCWA 4HDBA 2I4QA 5P7PA 5P6WA 3I6OA 3OXCA 5BWYA 3CYWA 4L1AB 2PMAA 2G1SA 2QI3A 5P6DA 4Y54A 4J1IA 5P3UA 5P07A 2HS1A 4CKUA 5COKA 4I0IA 3R2FA 5SY2A 5P7LA 5P19A 3NLSA 1K1UA 3CICA 4Y4UA 5OZIA 3S43A 1MT8A 4F76A 3HAWA 3IN3A 5P6JA 5CONA 4NKKA 4Y3SA 3TOHA 4DQBA 2QP8A 3LIVA 1MSMA 5P6TA 1D4IA 2WEZA 4LXAA 3LPKA 5P3GA 3PLLA 3KT2A 1XE5A 4NJUA 5P32A 5JFPA 2I4DA 3PHVA 1B5FA 5DGWA 2BPZA 4Q1WA 4EP2A 4MC6A 3EC0A 5P0HA 2AIDA 3EKTA 3KDCA 2ZDZA 2O4SA 5P2KA 5P6MA 1EC2A 2HS2A 1MUIA 4Y3AA 4JPCA 2BPVA 2WECA 2G1YA 4FSLA 3VF5A 3MSKA 4BFBA 3PRSA 3GI0A 2CEJA 2Z4OA 4EQJA 3SQFA 3NWXA 4Y4XA 4NJSA 2QI6A 1ZSRA 1IIQA 5OYXA 5P4SA 5P7YA 2FS4A 4KE1A 5IVRA 3EXOA 3KMYA 1LF3A 2G21A 3F9QA 2OHTA 5IS4A 3SA5A 3FNSA 2IEOA 5P0YA 3UQRA 3LZUA 2V10C 4Z2ZA 5P3NA 5P5CA 1ZP8A 4ER4E 1HSHA 4DQFA 3VYEA 3ZKIA 4LXKA 4YE3A 3O9HA 4FIVA 2B60A 2VIYA 1HTRB 4X7IA 4DJXA 3NDWA 2O40A 2P4JA 3D91A 3PWWA 2XYEA 3D3TA 5AH6A 1B6JA 3UFLA 5P76A 1W6IA 4XXSA 1GKTA 3QVCA 1BXOA 2P3BB 2UY0A 4F73A 5P29A 5HD0A 4EXHA 1AZ5A 4WY6A 5P52A 3EKPA 4DJWA 3BUFA 1D4KA 1META 5P4JA 1HTFA 2WF0A 2ER6E 1Z8CA 5P1IA 3NR6A 5P8MA 3BUGA 4OD9B 4Y37A 2VJ7A 2NMYA 7HVPA 2A4FA 2RKGA 3JVYA 2J9KA 5P2XA 3UDKA 5P56A 1BVEA 5OYRA 1HVRA 5P3OA 5P8PA 3URLA 3SABA 2PWCA 3OGQA 3OXWA 2XFKA 4RVXA 4QLHA 5P1PA 5P1CA 5OZDA 2QMDA 2BB9A 4E43A 3S54A 5OYQA 5P1RA 1FF0C 4PEPA 4DJQA 1FQXA 4EJ8A 5P6KA 4FM7A 3WB5A 3S2OA 5P5IA 1LYWB 5P49A 1EC3A 1FG8C 1BV9A 1GNOA 5HE4A 3RVIA 5P84A 5P26A 6FIVA 4QJ6A 2P3CA 4GJCA 5P3IA 3R4BA 5CLMA 5P46A 3INDA 5T4SA 1YT9A 3GGXA 4RVIA 1TQFA 5P1WA 3L38A 4CPWA 1ODYA 2ER7E 2R3WA 4U7QA 5P8UA 1RV7A 3L5BA 4D85A 1YTGA 4APEA 3PWRA 2QHCA 1BV7A 4EJKA 2ZJMA 4J17A 4YBIA 1MPPA 3L58A 4R92A 4EPJA 3S8IA 2QZWA 2NXDA 1Q9PA 5P06A 5P3LA 2HB2A 4Y4DA 1ZSFA 5P43A 2IDWA 3EL9A 1B6LA 5BRYA 5P7EA 3OU1B 3OHHA 1KJHA 5P45A 1WBMA 3O9FA 4JOOA 3DV1A 3ECGA 3FKTA 1MIQA 3GGVA 4CPQA 3ZOVA 2IGXA 4J0VA 2G22A 1UH9A 3KFSA 5P5SA 2QHYA 5P62A 3O9AA 2QD7A 5IVQA 1NPWA 3N3IA 1ER8E 4FM8A 5KR8A 3KFNA 3U6AA 2WL0A 3O9IA 3UDHA 5P53A 5P0SA 4DQCA 3KDBA 3UQPA 5SZ9A 2BPXA 4KE0A 4I8WA 2J9JA 3K5FA 1NSOA 1FMBA 2P8HA 3I2LA 3S7MA 2F81A 5P7DA 3AUPA 4XX4A 3S45A 1RNEA 3HLOA 1IBQA 4I0HA 4F74A 3EM6A 1N49A 5P4EA 3ER3E 1A8KA 3WZ8A 4JPEA 3UF3A 2QZXA 2AOCA 2OHNA 5P2VA 5KAOA 1CMSA 5P61A 4OBDA 4EXGA 1W5XA 2NXLA 5SY3A 1BBSA 5P4YA 1SDVA 2Q5KA 4HLAA 5P3EA 3I7EA 3INHA 2P3DA 5DQCA 1M43A 3UDMA 3O9BA 5P48A 3H0BA 1CZIE 4YBFA 2RKFA 1IZIA 2IKUA 4Y57A 3ST5A 2RSPA 4OC6A 1AXAA 1QBUA 2P83A 5P13A 2BPYA 5P3TA 2OHMA 5P4OA 3OGPA 4GJ8A 5P2SA 5P6YA 2BKTA 1SDTA 4Y3TA 2FXDA 3TOGA 4QJ7A 4YDGA 4Y56A 1RQ9A 5P00A 5IE1A 4K4PA 5P4XA 3OXXA 4DUSA 5P5BA 3QBFA 5P1LA 5P4RA 5P0EA 3KF0A 1LF4A 5P5AA 4Y5GA 2ZJJA 5AHAA 3EKXA 3SM1A 1FQ7A 1UH8A 5P6QA 5P0OA 2OHKA 1APTE 1EC0A 5P40A 3URIA 3GI4A 3NDXA 3MSJA 5P8NA 1SMEA 4DH6A 3PMYA 4J0PA 1XDHA 3NXNA 3S85A 1YM4A 4Y4ZA 5P4FA 1FG6C 3BC4A 3FNTA 4MC2A 5P36A 1FQ4A 2WKZA 1B6KA 2AVSA 1FGCC 3B80A 3H5BA 2ER0E 3ER5E 1EEDP 2AZCA 2VA7A 5P1DA 4I0FA 2PSUA 5ER2E 5P4MA 1HIVA 3HD8A 1M4HA 5HE5A 3K1WA 5OZ7A 4RCEA 7UPJA 5ISJA 1HVLA 4B0QA 5P82A 3PSYA 5P1HA 5P20A 1G0VA 1C6YA 4R91A 2IS0A 5P33A 5P44A 4JP9A 5P3VA 5P1OA 3NU9A 5OZ0A 5P0JA 2AVQA 5P25A 5PEPA 2G1RA 1TZSA 1FQ8A 3LPJA 1WKRA 5P0TA 4OBZA 4XX3A 3OHFA 2NXMA 5P6UA 4X2LA 2ZGAA 5P6HA 5P7IA 1Z1RA 5P1SA 1HTGA 5C9DA 2NNKA 3UPJA 5OZAA 1LYBA 2AOEA 3RTHA 2HB4A 5OYZA 2QNQA 2CENA 4H3IA 3FV3A 1QDMA 2AVMA 4ER1E 1FKNA 3O9LA 3QPJA 5P6EA 2G24A 3NU4A 2ASIA 3L5CA 5P89A 1E82E 2AQUA 2AOHA 1Z1HA 3QS1A 2V0ZC 3QAAA 2ZJKA 2R9BA 3ZMGA 5BS4A 4KUPA 5P41A 4EQ0A 5OZ4A 1ZPKA 5HDVA 3VSXA 5DR3A 5IVTA 3VG1A 1ZPAA 4B78A 3ZKQA 2QMFA 5OZ1A 5AH7A 5P1JA 2WEBA 1FEJC 2J9JB 2QD6A 5P30A 4FE6A 2V12C 2PH8A 3PVKA 3QP0A 4QJ9A 4L7GA 4QJ8A 3EKYA 3EL0A 4A6BA 5P5OA 5P6GA 1HPVA 4OBKA 4GJ9A 1FB7A 3TL9A 2IL2A 3JVWA 4GIDA 2VJ6A 1D4YA 3DOXA 4I12A 2FNSA 5P0CA 4IVTA 1OD1A 4J5JA 1PPME 5P3WA 3KM4A 1BAIA 5P35A 3RSXA 5P2ZA 2HB3A 5P16A 3PSUA 4Y5CA 3OY4A 2AZ8A 3OWNA 5P5KA 3OADA 1EPNE 3S7LA 1IZDA 1OHRA 3C9XA 2Q11A 3PBDA 2IQGA 5P8EA 4I0EA 1IVQA 4YCKA 5HTZA 1HVJA 4YD6A 1AAQA 5JFUA 2VJ9A 3MWSA 3HAUA 3CIBA 4DJVA 5P8VA 1K6VA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P80 A;  3O9D A;  3LZS A;  5P0N A;  5P03 A;  1HBV A;  4Y4G A;  3BVB A;  3PEP A;  5P64 A;  1QBT A;  4Y3P A;  4EHC A;  2VNN A;  4LC7 A;  4DQH A;  4GJ6 A;  3NSH A;  3OXV A;  4AZY A;  2V11 C;  1GVT A;  3KA2 A;  5P8B A;  1GNN A;  5P11 A;  3UCB A;  3MSL A;  2PK5 A;  1MER A;  5HE7 A;  3LZY A;  4B1D A;  1C6X A;  1QRP E;  1SGZ A;  3R0Y A;  4YD7 A;  4DJR A;  2WF4 A;  1HOS A;  3WZ6 A;  5P3Q A;  2NNP A;  1D4S A;  5P7C A;  1VIK A;  5P1M A;  1MVP A;  5OZ3 A;  3VFB A;  2SAM A;  4Q1Y A;  1T7J A;  4FRS A;  4K8S A;  3OQA A;  5DQ4 A;  5P37 A;  4D88 A;  5P5R A;  5OYV A;  3TLH A;  1LYB B;  3OQD A;  1GNM A;  1BDQ A;  5DR8 A;  1MEU A;  1XE6 A;  3O9L B;  1BIM A;  3OTY A;  4YOB A;  1D4L A;  1TCX A;  3VV6 A;  5P4B A;  5OZE A;  1K6T A;  1SP5 A;  5P54 A;  3TKW A;  2HPE A;  4FCO A;  1G6L A;  5P51 A;  4DFG A;  3VV8 A;  5P6V A;  2XFI A;  4Y3X A;  5ISK A;  4HA5 A;  5KR0 A;  5P87 A;  1KJ4 A;  5I70 A;  4RRO A;  3Q70 A;  5P39 A;  3RU1 A;  4Y3W A;  2AOJ A;  5P31 A;  5OZH A;  2WED A;  4FRK A;  3IGB A;  3BGB A;  3SA3 A;  4B1C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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