1ENTE

X-ray analyses of aspartic proteinases. the three-dimensional structure at 2.1 angstroms resolution of endothiapepsin
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title X-ray analyses of aspartic proteinases. The three-dimensional structure at 2.1 A resolution of endothiapepsin.
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 83
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1992-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1entE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1entE01
2PH8A 5P6FA 5P78A 4FRJA 1C6YA 4Y3YA 1DAZC 4Y57A 3S2OA 5P3WA 4Y4UA 2HAHA 5J25A 5OZJA 4YCKA 2HIZA 2BKTA 5P8HA 3OHHA 3I25A 3OU3A 5AHBA 1FEJC 2B7ZA 4TRZA 1SP5A 1IDAA 5AGZA 5P3QA 4DJWA 3FSMA 4IVTA 5P0IA 1EPQE 4U7VA 5P7BA 1EBZA 3VEUA 4JPCA 3QRSA 2Z54A 1MTBA 3TKGA 5KR8A 1EEDP 2QU2A 1D4SA 5IVRA 2QHYA 4ZSQA 1EBKC 1HTRB 3T3CA 1HPVA 4DQFA 3R4BA 4RVXA 2Z4OA 4YD6A 4FGXA 3PCWA 1T3RA 1HVSA 2CENA 1LYBB 1AVFA 1K6TA 4JECA 5P8DA 3EKQA 4DJXA 1D4HA 5OYVA 3O9IA 3KFNA 1MT7A 5KQXA 3PI5A 5P2KA 5I3XA 3PLDA 2AOIA 2AOGA 5P8VA 3TPLA 1EC0A 3LZSA 5P8UA 2PYNA 5P2OA 2ZJHA 5HE5A 1C6ZA 3PGIA 5OZAA 4DH6A 3NXEA 4RYCA 2ZJLA 4KB9A 2PSUA 5P20A 3R0WA 4U7QA 5TOLA 3OXWA 2VA5A 3PEPA 3KFRA 4TRYA 2G1RA 4OBJA 5JFUA 1IBQA 5P4DA 3C9XA 5P8QA 4ACXA 3IAWA 2PC0A 3QVCA 1F34A 2G20A 5P68A 5P56A 3UDQA 1LYWA 4GJAA 1HHPA 1BBSA 4EJ8A 4Y48A 1HVJA 4CPWA 1HBVA 3AIDA 4H3IA 2WEDA 5P1FA 5JG1A 5P5ZA 3O9CA 3SA8A 1K1TA 3D20A 1MSNA 2QNQA 4U8WA 3QP0A 1OD1A 4J0ZA 3NLSA 3INHA 3PVKA 3U6AA 1ZSFA 4A6CA 3LNKA 1SDUA 3SACA 2NMYA 3QBHA 5P4UA 3G6ZA 4ZE6A 1AIDA 5P73A 1Z8CA 3KYRA 3OTYA 5P05A 5P6CA 1SIVA 2VIJA 1MPPA 2QI3A 5P2SA 5P2MA 4Y35A 4MC6A 5KOQA 3GGVA 4RRNA 1SH9A 1ER8E 3DUYA 5P8FA 1OEXA 3WZ6A 3PWRA 1MVPA 5P2RA 1WBMA 3LIZA 4Y39A 4I0FA 4Y5KA 2P3BA 1HTGA 5P38A 1HXBA 3UDMA 1XN2A 5P1GA 1FB7A 3HBOA 5P3XA 4NKKA 5P23A 4Y5EA 5P3DA 2UPJA 3VV6A 5P5PA 2FDDA 3VCMA 9HVPA 1FMUA 2IEOA 1YM2A 2Q64A 5P25A 2B8LA 5P2CA 1RL8A 3UQXA 3HAWA 5P0MA 2PMAA 3QS1A 5P2LA 4DQGA 2IKUA 5P2TA 5P54A 5P8CA 5SY3A 5P3LA 3NDWA 3DK1A 2BPZA 2FS4A 3PLLA 3EL1A 2G69A 5P65A 2UY0A 4CP7A 5P29A 3BVBA 5KQYA 3KMYA 5OYZA 1QDMA 5P6PA 4GZFA 3ZLQA 4LP9A 3PI0A 3URJA 5DR7A 5C9DA 3KT5A 3N4LA 5P86A 3D1XA 5OZWA 4R93A 2AZBA 4Y3NA 3DJKA 1YTGA 3VSXA 5P1CA 5P8EA 4Y38A 2F80A 3RSVA 2QZLA 2J9JB 1HRNA 4GJ6A 3BXSA 5HDVA 2QZXA 5OYUA 1HTEA 2P4JA 5P3EA 4DQEA 1FQ5A 5P6OA 1HPOA 3U7SA 3ZKXA 3HAUA 2WEBA 4RROA 5P6UA 4LXMA 1Z1HA 2ZHTA 2V11C 2F3KA 5P2NA 1QBUA 5P3HA 5I3WA 5P5LA 3SPKA 5P0QA 5P4ZA 3S85A 1HVLA 3RU1A 5OZFA 1VIKA 1APWE 4ZIPA 2AVVA 4R91A 3L5CA 4JPEA 4Q1YA 5P4NA 1PPME 4L7GA 4Y5PA 3T7PA 3T11A 5P7TA 4L6BA 3OADA 3EKXA 5P3UA 2WHHA 8HVPA 4R92A 4RZ1A 1EPOE 4DI2A 1EPPE 5IVTA 1HIIA 4J1KA 3FIVA 2QHCA 5P01A 5P18A 4Y3GA 3CYWA 1OEWA 5OZ9A 2FIVA 4J17A 2JJIA 4H3JA 5FIVA 4GJBA 5P4LA 2G1SA 1EBYA 4RCFA 2BKSA 4I8WA 3B7VA 5P83A 3LIVA 3UDRA 3JVWA 5P3RA 2WF3A 3VF5A 3OXVA 5P1MA 5OZPA 4Q1NA 5AH9A 5ISJA 5OZSA 5HTZA 4OBHA 4Y3AA 3ZKSA 2B7FA 1NPAA 2WF2A 5DGUA 3VUCA 3QIHA 4I0JA 5P6ZA 1HTFA 4DJOA 2I4WA 3OUDA 4EJDA 1YT9A 4Y3XA 2OHTA 5P41A 2O4PA 4K4RA 1T7JA 1BILA 1LYAB 1M43A 5P3FA 1MEUA 4HEGA 4TVHA 4TVGA 5SY2A 2V13A 5P4AA 3KF0A 4YDGA 5P4WA 1APVE 2G22A 5P76A 4CPXA 1GNNA 5P00A 2R8NA 1HPSA 2P3CA 1IZHA 1FQ6A 4HA5A 2BPWA 4A6BA 5P3CA 5DQ1A 1PSOE 2VNNA 4D8CA 3PMYA 2AOFA 5P4SA 1K6CA 1GKTA 3INEA 1GVXA 3TOGA 4BFDA 1W50A 3EL4A 3A2OA 4OC6A 2JJJA 4PYVA 4EJKA 4YD4A 1GNOA 5SZ9A 5DGWA 2QMPA 5P2IA 1A30A 4I1CA 4K8SA 4Y50A 5COKA 1EPRE 1FQ4A 1HSHA 4FSLA 5HCOA 5P8RA 3OHFA 1ZPKA 3L5DA 1W5YA 5ER1E 4Q1WA 2H6TA 1J71A 5P3VA 1A8GA 3NYGA 3OK9A 4EXGA 1ZSRA 5P8OA 1NPWA 5P1RA 4HDFA 2PSGA 5P8KA 5P8NA 4CPSA 4Y4BA 4J0YA 3I2LA 4LXKA 1A9MA 5OZRA 4ZPGA 1IVPA 5EZZA 2FGVA 3EKWA 5P0UA 1ODYA 7HVPA 1TSUA 4LBTA 4Y4DA 3TH9A 3G72A 3OQAA 2R3WA 5DR1A 5P39A 4Y4ZA 5P28A 3OWNA 3QAAA 3HD8A 5P2BA 5P8IA 4Y3SA 5ENMA 3SLZA 4AZYA 4WY1A 3LIYA 3UF3A 2NNKA 1G2KA 5P5TA 5P6QA 5P27A 5OZ0A 3OAGB 3MSLA 4Y45A 5P0NA 3INFA 5P61A 1W6IA 4EHCA 5P4BA 3UDJA 4NJTA 2HB2A 5P1KA 1MERA 5P3YA 4DJVA 4D88A 4EP2A 2ZHRA 4EQ0A 2ZHVA 5P75A 4GB2A 3K4VC 3LIQA 4K9HA 5KOSA 3QVIA 4J1FA 5HE7A 2F81A 1Z1RA 4LL3A 4NJUA 5EZXA 4YHQA 1DPJA 5P4HA 5P80A 5HU0A 2P8HA 3URIA 7UPJA 4LHHA 2VNMA 4R95A 4YCYA 5BWYA 5COPA 4H3FA 3S8IA 1HWRA 2NPHA 4Y3PA 2AVMA 3SKFA 2WKZA 4J1EA 3CKPA 2XYFA 1MTRA 2VIEA 5DQ2A 5KQFA 1JLDA 5P77A 3IXJA 3VF7A 4OBKA 1W5WA 5OZQA 2OHNA 2HB3A 2QNNA 3EM6A 3LPKA 1BAIA 1IZEA 1MT8A 4A4QA 4Y3TA 1CMSA 5P24A 4H3GA 4YD5A 4PPHA 4AMTA 5DR0A 2JE4A 2O4SA 4L7JA 5P5SA 1T6EX 5P4JA 4I10A 4GJ8A 3HLOA 5P67A 3VG1A 5P06A 5P26A 4MC2A 3KT2A 2VIZA 3DCRA 2EWYA 5P4PA 3GI5A 5P1XA 1UH7A 1T7KA 2R5PA 1GVVA 5P4TA 3EMYA 5IVQA 5P34A 4M8YA 5P2VA 5P3AA 1FQXA 1SGZA 3AUPA 5OZ5A 4FSEA 4FRIA 5P1YA 6FIVA 2AOJA 3VLAA 3O9LB 2AIDA 5P33A 2A4FA 2G94A 1C6XA 2PYMA 5P7XA 4YOAA 5P89A 2ZDZA 2WJOA 3KDCA 3NXNA 5P3MA 4Y3RA 2ZGAA 5BS4A 4EQJA 5SXNA 4FE6A 5P5IA 5P2WA 1FF0C 3I6OA 1KJGA 4N00A 1BWAA 5P64A 2IQGA 1MSMA 5CLMA 1DIFA 3MSKA 1M4HA 4YD3A 3CMSA 1FMBA 3EKYA 5P7SA 2NXDA 5OZTA 5P7GA 2AZCA 5P85A 4CKUA 3PWMA 5E5KA 1YM4A 3IXKA 5P4FA 2V0ZC 2QU3A 2ZJKA 5P5FA 2ZHUA 4J0TA 2SAMA 1GVTA 1HOSA 1IIQA 2FXDA 2RKGA 2VJ6A 2VA7A 2Q5KA 3LHGA 1EPNE 5P4QA 1FG8C 3HW1A 1LEEA 4K4PA 5P6JA 2G1OA 5P3TA 1WKRA 1ODWA 1VIJA 3BGBA 1B6JA 5P3PA 3WZ7A 3I7EA 1DW6C 1RNEA 1D4JA 5P7JA 3VFAA 5KQZA 3T7XA 3U71A 1HIVA 1UH8A 1KJ4A 1U8GA 2G26A 4Z22A 5OZLA 4OD9B 3ZPTA 4Y4XA 5P8AA 4KE0A 1E82E 5P5GA 1D4IA 3VYEA 1B6LA 5P0EA 1HSGA 5HDZA 3QRVA 5P47A 5P6SA 4DQHA 1AZ5A 5P2QA 1ZAPA 5HE4A 5OZNA 4EXHA 5AH6A 5P36A 5P3ZA 4Y5AA 4FAEA 5P1LA 2PSVA 4IVSA 3ZPUA 3HZCA 1PROA 5P52A 4MC9A 1E80E 3HVPA 3DM6A 4Y3ZA 3MXDA 4XX4A 1FFFC 2HB4A 4L1AA 3N3IA 5DQCA 5P6NA 1BVEA 3ZOVA 4F75A 3UDPA 1HXWA 3GI6A 2QI1A 2Q63A 3CYXA 3NUOA 3VV7A 4PZWA 3EL5A 2R9BA 2V12C 1AJXA 1RQ9A 4COEA 1QRPE 2FDPA 3OY4A 2IL2A 4B1CA 1GNMA 4CPTA 5JFPA 1SMRA 1LF3A 3Q5HA 5KR0A 5IS4A 5P7OA 4Y3FA 3ZKIA 4DPFA 5P1TA 2JYSA 3NU9A 2O4LA 2XFJA 2B42A 4YBFA 2RSPA 2ER0E 3VV8A 2OHKA 5P44A 2HM1A 1HVKA 2OF0A 1BDLA 5OZGA 5P0AA 5P5HA 2OHPA 3NWXA 5OZZA 4YBIA 4J0VA 1YG9A 1BIMA 1ZJ7A 5P6LA 1K6PA 5P3OA 5P71A 4CMSA 3UDYA 3H0BA 3K5FA 3FX5A 4RVIA 4YE3A 3D3TA 2ANLA 5P0SA 2HPEA 4Y3QA 1LYWB 4Z50A 3OU1A 1BWBA 1META 3CICA 5P5CA 5P7MA 4ZSPA 5P7AA 5P1JA 4J55A 1D4LA 5OYTA 1RV7A 3NR6A 2ZYEA 5OYXA 3NWQA 4KUPA 3TKWA 5P5RA 4F76A 5P4XA 2MIPA 2NXMA 1DP5A 3GI4A 1TQFA 2AQUA 2G1YA 2IDWA 5OYWA 5P08A 5P7YA 4B1DA 4Y3HA 1YTIA 2G27A 5C9FA 3G70A 3QPJA 5COOA 4BEKA 2RMPA 5P1BA 3KFSA 5P53A 1SBGA 4QJ9A 2QMDA 5DR3A 3GI0A 3L3AA 4PZXA 3IVHA 1GVWA 5P5KA 2Q11A 4FL8A 4Y3WA 2FGUA 4RLDA 4OBZA 5AH8A 5P7DA 5AHAA 3BRAA 5P0WA 4GJ7A 5P07A 5P2EA 3PCZA 4Y4WA 2AOEA 2QMFA 3PSGA 5P59A 3BUGA 3FKTA 2QI0A 3UFNA 4RCEA 3T7QA 4QGIA 1LF2A 3KA2A 2P3BB 3HVGA 3S7MA 5AH7A 3OGQA 4B1EA 1XN3A 4AUCA 1EPLE 1SMEA 5P2JA 5P58A 4HDBA 4J0PA 1ENTE 3EKVA 4JOOA 5P2GA 4B72A 2IGXA 2XYEA 1XL5A 1BDQA 2WEAA 4FIVA 5P0RA 1B6PA 4H1EA 1MT9A 3S43A 3S54A 3PSUA 3GW5A 2ZHSA 4OBGA 5ER2E 3IA9A 5DR4A 5P5MA 6UPJA 1SIPA 2R38A 5P8MA 3GGAA 4CPRA 4E43A 3CIBA 4KE1A 3PBDA 4J1CA 3ER5E 5P1ZA 4ZSRA 1B5FA 4OBFA 3LITA 2FXEA 5P4KA 2QAKA 1LS5A 3LIXA 5P8BA 1FQ7A 5OZKA 4RRSA 5OZ7A 5P7HA 3EM4A 3EC0A 4BFBA 1EC1A 1A94A 3PWWA 3TTPA 3ZKNA 5CONA 5P7LA 1KJ7A 1TSQA 4Y9WA 3L5EA 4DPIA 2PQZA 5P1EA 3FNSA 2QP8A 5P62A 5P81A 2NXLA 5P3SA 4QLHA 5P14A 3BUHA 3TPPA 2AVQA 3O99A 5P43A 3R2FA 3BXRA 3VF3A 2IGYA 2RKFA 2WF0A 3ZKMA 1YTHA 5P45A 3S45A 2ZJNA 3NDTA 3FNUA 5P37A 3PRSA 4HZTA 5P1WA 3O9HA 3OADB 4BELA 4I0ZA 4QJ2A 5OZ3A 1LYBA 4OBDA 5OZHA 1PPLE 5P3IA 4Y37A 3NDXA 3MXEA 3QROA 2VS2A 5P5NA 1G0VA 2F3FA 2ZJIA 4ER1E 3QRMA 4GIDA 3OTSA 1CPIA 4Y53A 5P19A 3KMXA 4I0DA 1IVQA 5P46A 5OZBA 1HSIA 4Y6MA 3OUBA 4OBZB 4Q5MA 5P7QA 4LAPA 1AM5A 5P60A 3K4VA 1PPKE 3B80A 4YCTA 5P2AA 5P74A 3VYFA 4B78A 4EPJA 1B6KA 3GGUA 3ECGA 3BHEA 2QI5A 1W51A 1EBWA 3ZKQA 4XKXA 1LF4A 3K5DA 4Y51A 5DQ5A 2WL0A 3OUDB 5P5UA 2I4VA 2R3TA 4GYEA 1E5OE 2ZE1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2PH8 A;  5P6F A;  5P78 A;  4FRJ A;  1C6Y A;  4Y3Y A;  1DAZ C;  4Y57 A;  3S2O A;  5P3W A;  4Y4U A;  2HAH A;  5J25 A;  5OZJ A;  4YCK A;  2HIZ A;  2BKT A;  5P8H A;  3OHH A;  3I25 A;  3OU3 A;  5AHB A;  1FEJ C;  2B7Z A;  4TRZ A;  1SP5 A;  1IDA A;  5AGZ A;  5P3Q A;  4DJW A;  3FSM A;  4IVT A;  5P0I A;  1EPQ E;  4U7V A;  5P7B A;  1EBZ A;  3VEU A;  4JPC A;  3QRS A;  2Z54 A;  1MTB A;  3TKG A;  5KR8 A;  1EED P;  2QU2 A;  1D4S A;  5IVR A;  2QHY A;  4ZSQ A;  1EBK C;  1HTR B;  3T3C A;  1HPV A;  4DQF A;  3R4B A;  4RVX A;  2Z4O A;  4YD6 A;  4FGX A;  3PCW A;  1T3R A;  1HVS A;  2CEN A;  1LYB B;  1AVF A;  1K6T A;  4JEC A;  5P8D A;  3EKQ A;  4DJX A;  1D4H A;  5OYV A;  3O9I A;  3KFN A;  1MT7 A;  5KQX A;  3PI5 A;  5P2K A;  5I3X A;  3PLD A;  2AOI A;  2AOG A;  5P8V A;  3TPL A;  1EC0 A;  3LZS A;  5P8U A;  2PYN A;  5P2O A;  2ZJH A;  5HE5 A;  1C6Z A;  3PGI A;  5OZA A;  4DH6 A;  3NXE A;  4RYC A;  2ZJL A;  4KB9 A;  2PSU A;  5P20 A;  3R0W A;  4U7Q A;  5TOL A;  3OXW A;  2VA5 A;  3PEP A;  3KFR A;  4TRY A;  2G1R A;  4OBJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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