5KOQA

Discovery of tak-272: a novel, potent and orally active renin in-hibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
336
structure length
335
Chain Sequence
NTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Structure-based design of a new series of N-(piperidin-3-yl)pyrimidine-5-carboxamides as renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 335
sequence length 336
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2016-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5koqA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5koqA01
1LYWA 5P0SA 5P3GA 2QMGA 4ZSQA 5P6JA 1BXQA 4GZFA 4NPUA 1YG9A 1FFFC 4KE0A 4R95A 1IZHA 3KT2A 2PYNA 3TPPA 2F8GA 2HIZA 3B7VA 5P7BA 5P2QA 3CKRA 2R8NA 2VKMA 2QHCA 1TSUA 5COOA 5P1MA 3N3IA 2I4QA 3OADB 2RSPA 3HD8A 2F80A 1M43A 3S7LA 3PCZA 4PHVA 2WEBA 2HS1A 5P5ZA 1MESA 2ANLA 5P1FA 3OU4A 3Q5HA 4MC6A 5P0OA 3CIBA 5P0WA 5P6FA 5BWYA 2QCIA 1DMPA 2RMPA 3EKVA 3PMUA 3S43A 3PBDA 4Y48A 5P17A 3S54A 3QPJA 5P79A 2B8LA 2ER6E 2NXLA 2V00A 5IVQA 5P4JA 4Y58A 4FRKA 5IVTA 4PEPA 5P2IA 5P3OA 4R91A 5P1YA 3VG1A 4ER4E 1HHPA 1ZPKA 5P70A 3RU1A 5P7NA 1SDUA 8HVPA 3Q4BA 3VF5A 5IVSA 3SACA 2OHUA 3QI1A 1QBSA 5P62A 1T7KA 4Y36A 4Y3HA 2Q15A 3DCRA 5SY3A 2CEJA 1C6XA 2HPEA 1K6CA 4GJ9A 3KDBA 4YOBA 5P31A 5P50A 3L3AA 3OGPA 3FX5A 5OZ7A 4EXHA 5P6GA 4RVJA 1ZP8A 3PM4A 3T3CA 4YE3A 4AA8A 5AH8A 2R5QA 2WF2A 3UFLA 1D4IA 4ER2E 3K5DA 3VYFA 4U7QA 2Q5KA 3QRVA 5OZWA 1HVKA 2J9JA 3BXRA 1LEEA 1DW6C 4QJ6A 5JFPA 2NMZA 3HVGA 3D1YA 3H5BA 4EJKA 1E82E 1APUE 4JPCA 2VA6A 3UDKA 3PSUA 4X7IA 4Y4UA 4B70A 3WSJA 5P6XA 2AOIA 5P8LA 3T7QA 1HVLA 1W5YA 1LYWB 1U8GA 4K9HA 3DV1A 3S45A 5P4BA 3VF7A 1FLHA 1LV1A 4J0TA 5P8TA 5OZMA 1SGUA 1SIPA 4DJVA 2IENA 4Y56A 3MXDA 3QRMA 5P41A 5OYRA 2G21A 1EPLE 1FQ5A 2AZBA 5P4MA 3LZUA 5P5QA 3AIDA 3VFAA 4YCKA 4J17A 4Y3RA 3PSGA 5OYZA 5SZ9A 3LIQA 4IVSA 5KR0A 3I25A 5P83A 2G27A 3K5GA 3FNTA 5P8CA 5P2FA 3M9FA 3OU4B 4NJTA 3QBHA 3UCBA 4RROA 2IKUA 4FRJA 5ENKA 5P7HA 5OYTA 3DOXA 5P0PA 4S1GA 3S43B 1RPIA 2FS4A 3LPIA 5P2DA 3VYDA 5P63A 5P4RA 3LITA 3FKTA 3NR6A 5P8UA 2H6TA 4R93A 5P61A 4YD3A 5KQYA 1YM4A 3UPJA 1E80E 2O4KA 1QDMA 4HDPA 3NLSA 3LIYA 3S56A 1A94A 5P4OA 1PPLE 4Y3DA 1K1UA 3LPKA 5OZGA 4Y45A 1B6KA 5ER1E 3OY4A 5P56A 4DQFA 3KYRA 5CONA 4ZPGA 2WF1A 5P88A 5P0DA 1M4HA 4D89A 3TOHA 1TQFA 4Y5EA 2JJJA 5P1IA 3OUAA 5P27A 5P1ZA 3UDPA 3NUOA 3NU4A 3GI0A 2NXDA 5JFUA 1BDQA 5P24A 5P8EA 3ZOVA 2QZWA 1BAIA 5KR2A 5P20A 3UF3A 3ZL7A 3HW1A 2Z4OA 3WB4A 3PWMA 5P5DA 5P85A 4XX4A 3NDUA 5P3BA 2J9JB 2QMDA 3VEUA 5P1AA 2WF4A 2WF3A 1APVE 2VS2A 2PH8A 3SA3A 5P6WA 5P42A 5P5CA 3VLAA 1BVGA 5P0YA 3URLA 5P82A 4OBZB 5P1UA 5HE5A 3EBZA 5KAOA 2O4PA 2OHMA 3Q70A 2VIYA 3EL5A 2QP8A 5DGUA 3O9BA 5DR7A 2RENA 3KMYA 2AOGA 4DFGA 2FXEA 1GNOA 1APWE 2ZE1A 4DQGA 4FGXA 5P36A 2WKZA 4Z22A 4QJAA 1ODXA 5P35A 4D85A 3NDWA 2QI7A 1HTFA 4OBJA 5OZQA 4YD5A 5P8SA 3UDRA 1META 5I70A 1FEJC 2I0DA 2OHKA 4HZTA 5P7IA 3INDA 5JG1A 1TW7A 5AH6A 3FIVA 1PPKE 1QBRA 3CYXA 1SH9A 5OZRA 3B80A 1EPPE 4ER1E 1EPME 5P4FA 1CPIA 5P01A 1D4HA 3HAUA 1LYAB 4BFBA 3L58A 4JP9A 3NWXA 2VJ7A 4Y3AA 2FIVA 5P30A 4GJBA 5KOQA 1HWRA 1GNMA 5P4GA 3IXOA 9HVPA 2R38A 5P59A 3L59A 5P4VA 5TOLA 1GVUA 4DJUA 4B1CA 2ZJKA 5DR8A 4ZSPA 4DPIA 5P2UA 4HVPA 3SA8A 4Y3QA 2O4NA 2QU2A 1HSHA 2VA5A 5P6LA 2V12C 5P2SA 2AOFA 4FLGA 3CICA 3KFSA 5OZVA 1FQ4A 3A2OA 4LAPA 4J1KA 5EZZA 5P6QA 4APRE 5HD0A 3GGUA 5AHAA 3EL4A 2AIDA 5I3XA 2F3FA 2ER7E 2IGXA 5DQ5A 3DM6A 5P2TA 3CKPA 5P3SA 5P8QA 4J0ZA 4TVGA 5P72A 1A8KA 1Z8CA 2QK5A 5P4CA 2BB9A 5P7XA 1C6YA 2A4FA 1T7IA 5P6YA 2R43A 4Y5BA 4J0YA 5HE4A 5P84A 4A6CA 1K6PA 4DQBA 5P0VA 4DQCA 2PWRA 3LIVA 3BUHA 4WY6A 2NXMA 5P6TA 2JJIA 1GNNA 4ZEAA 5OYVA 1FQ6A 2I4XA 4EP3A 4J1IA 3DCKA 5OZXA 3OQ7A 3S53A 1LZQA 1Q9PA 1QBUA 5P02A 2ZHSA 4Y3EA 2P3CA 5HDUA 4CPSA 2BKSA 3DJKA 2ZJNA 1D4SA 3GI4A 3ZKMA 1QS8A 3I2LA 4Y9WA 4AUCA 5P0TA 1K1TA 2IS0A 3OUDA 3NYGA 3TH9A 2UPJA 3GW5A 2HB4A 1KZKA 2ZJLA 3O9EA 2G22A 4Y47A 4QJ7A 3U71A 4FM7A 4Y43A 1B11A 2Z54A 4Y39A 1RQ9A 5P4HA 1XL5A 3ZPSA 4HE9A 3LHGA 3PSYA 1W5XA 3VV8A 1FMXA 3VCMA 3QS1A 3IVHA 2HC0A 5P2AA 4B05A 5P3RA 2WEZA 1MSMA 1HTEA 3R1GB 2ZHRA 5P5EA 5PEPA 3EKWA 1FMBA 3INHA 4YBFA 5P22A 5FIVA 5OZLA 5P53A 1ZJ7A 1MRWA 3UDHA 2I4DA 2I4WA 1XL2A 4LXMA 1DIFA 2OF0A 5P23A 3ZPUA 5P7QA 1FMUA 5P5SA 3HBOA 4I8WA 5P76A 4DJYA 1HVIA 3ZPTA 5P0EA 3O9HA 3PWWA 3ER3E 4QGIA 5P3NA 2R3TA 5P44A 5DR3A 5P54A 5P2KA 1YTHA 4Y3ZA 5P0JA 1ZLFA 4WY1A 2MIPA 2ZJMA 4CPXA 4Y5CA 1HVJA 1HXWA 2HS2A 2HB3A 4APEA 3I8WA 5P5OA 2PMAA 5P7AA 4DJXA 3TKWA 5P6MA 4FRSA 1JLDA 4GJ6A 4J0PA 2P3DA 3CYWA 5P1RA 5P4ZA 4Y4WA 5P6DA 5P6SA 4B00A 4Y50A 1EPRE 5P7GA 3KN0A 3QN8A 1IDBA 3VSWA 5P1EA 5ISJA 3HVPA 3RVIA 3BXSA 3OQDA 2PK6A 5P1VA 3ZKQA 4FSLA 4I12A 3O9GA 3VYEA 3EM6A 3D1XA 3VV7A 2G1SA 2PYMA 1FKNA 5P0GA 3TPLA 5I3VA 1IVPA 3JVYA 4YCYA 3O9CA 3INEA 2B60A 5OYYA 1TCWA 3OUDB 3D20A 5KQZA 3MSJA 2BPVA 4CPRA 1B6MA 3UQUA 1EPNE 1CMSA 4OD9A 5HTZA 3UDYA 5OZSA 1C6ZA 4A6BA 5I3WA 3UFNA 5P2JA 5P38A 4Q1NA 3MXEA 4OBFA 5P0FA 1XE5A 3U7SA 5P0XA 4YD6A 5IVRA 2BPZA 4Y54A 4F75A 5DR4A 4YD4A 5KR8A 4ZSMA 1ZSFA 3PI0A 1MVPA 5P7DA 5P5FA 5P7TA 2HB2A 3O9AA 3ZMGA 2G24A 4Y4DA 5P8HA 5P8GA 4B78A 3D1ZA 3OU1A 2P83A 2FGVA 2O4LA 5DQ2A 5P19A 1IZIA 5P7ZA 5P8NA 4I1CA 4RVXA 2VIJA 1W5WA 4M8YA 5P09A 5P29A 3OOTA 2J9KA 4YBIA 4GJ7A 5P08A 2Q64A 2V0ZC 2IEOA 2PQZA 5OZBA 3NSHA 5P37A 1KJFA 3FNUA 3NXNA 4J54A 5P0MA 5IE1A 4Y53A 5P87A 4RYGA 2FGUA 4TRYA 3UQWA 4GYEA 5P3PA 2QI4A 3RTMA 4Y6MA 1HRNA 5P6AA 5P8DA 4Y38A 5E5JA 4OBZA 3VUCA 3K4VC 5P5PA 3QIHA 1BBSA 2P8HA 5P11A 4J1HA 2ZHUA 5UPJA 1FFIC 5HU1A 4I0HA 5P8MA 2QMPA 4MC2A 5P3XA 1MTBA 1T3RA 1OEXA 5KOSA 4TRZA 3EKPA 5P0BA 3ZLQA 4JPEA 4Z4XA 3SAAA 1BWBA 2IL2A 4NPTA 3IGBA 1TSQA 2ZJHA 4JOOA 3ZKNA 4FSEA 4Y5MA 4H3JA 1D4KA 3IAWA 3O9DA 1T7JA 4Y5GA 1AIDA 3OXXA 4Y5PA 3RTNA 4LHHA 2NMYA 5P2GA 5P33A 3QVIA 1WKRA 5P3CA 5P0NA 5P4AA 1AJVA 1F7AA 4H3IA 5P6NA 1XS7D 2AOEA 2H6SA 5P6PA 4OD9B 4FIVA 1HSGA 1MIQA 2QD7A 1UH8A 3OWNA 5P2MA 5P49A 4Q1XA 1FIVA 2WEAA 5P6BA 4DUSA 2WF0A 4Y3GA 1LYAA 4I0ZA 1HIVA 3QAAA 4U8WA 1SIVA 5P3KA 4EYRA 1W6IA 4ZLSA 1HPVA 1HSIA 3QVCA 4DJPA 4K8SA 2ZHTA 5P58A 1N49A 5CLMA 5P5YA 5P4SA 1IIQA 1VIJA 2AVVA 4DJWA 2WL0A 5P3DA 4CPUA 5OZ1A 2IQGA 5C9FA 5P5HA 1MT9A 4KB9A 1XN3A 2IKOA 4LP9A 1B6JA 2AVMA 4Y41A 5HCOA 3PGIA 3OU1B 1EBZA 4Y4XA 4EXGA 1SBGA 3EKTA 4COEA 3PJ6A 4ZSRA 3T7XA 2PH6A 5P5XA 1FQ7A 3PBZA 4L7JA 3OTSA 5P2WA 4FCOA 5KQFA 2NPHA 4Y4AA 3ZKXA 1HEFE 3RSVA 1HEGE 3WZ7A 1HIIA 4GJCA 2AVOA 3OXVA 1KJHA 3OTYA 5P06A 2OHNA 2RKFA 5P8VA 2BKTA 3CIDA 3NXEA 4YD7A 5P15A 5P8KA 4I10A 2A1EA 5P7UA 3HAWA 5P78A 4I0IA 3O9FA 4LBTA 4MC1A 1UH7A 5OZKA 4Z50A 4ZPFA 3SA6A 1HXBA 1UH9A 3OU3A 4Y4GA 5I3YA 3PB5A 1IDAA 4BFDA 3L5EA 5P2CA 4K4PA 4OBKA 3SM2A 5HE7A 5P6UA 1HOSA 4KUPA 4AZYA 1PPME 4J55A 4RLDA 5P47A 1HTRB 4L6BA 3WZ8A 4BEKA 5HVPA 4FRIA 1EC1A 1BIMA 5P4LA 4FM8A 3BUFA 5P18A 4EJDA 4GJAA 3IVIA 4ACUA 4DQEA 4K4RA 3F9QA 5P5KA 1NPVA 5P3YA 5P4DA 1BWAA 3QRSA 1AZ5A 5P7FA 2WJOA 2P4JA 4J5JA 3I6OA 1MEUA 4RRSA 1K6TA 2BPYA 5P73A 3T11A 1G2KA 4LXAA 3S8IA 2OHLA 5P8AA 3HLOA 5P5RA 2QZXA 4Y37A 5T4SA 4OBGA 3EKXA 3PLDA 3EXOA 4HDBA 2QZKA 5OYXA 4Y4ZA 5P1QA 2FXDA 1EC3A 4I8ZA 5P3ZA 5P28A 1KJ4A 5P3LA 3WB5A 2R5PA 3LZVA 1RNEA 5P0LA 3GGXA 3RTHA 5P75A 3CKTA 1B5FA 3PI5A 5P5NA 5P52A 3LPJA 5P5WA 2NNPA 4ZE6A 5P46A 2AZ8A 3IXJA 3VSXA 2AODA 1SP5A 5P7EA 1RL8A 3IXKA 3H0BA 3L5CA 5P86A 1BXOA 4OBHA 4Q5MA 1WBKA 4YHQA 4Y35A 3SQFA 1UPJA 1G6LA 5P1KA 1YX9A 3SFCA 2WECA 3BGBA 3BUGA 3TPJA 5P5AA 3K5CA 5P69A 4FE6A 2XFIA 3TLHA 4DJRA 3EL1A 4QJ8A 3EC0A 4RCFA 1LYBB 4YDFA 3UTLA 3LIZA 2QHZA 2XFKA 4XX3A 3BC4A 2BBBA 3PMYA 3IN3A 2IRZA 2FLEA 4Q1YA 2P3AA 4PPHA 2AOJA 4K4QA 4A4QA 4Y4TA 5P34A 5OZYA 1MSNA 5OZCA 3MWSA 4J1CA 3U6AA 3UQXA 1RV7A 5P66A 5BS4A 2Q55A 4TVHA 4Y44A 1B6LA 4CPTA 3CMSA 3FV3A 5P6RA 4UPJA 4R92A 3KA2A 5OZUA 5OZ3A 1BILA 2RKGA 5HU0A 3KM4A 3HZCA 5P5LA 5AH9A 5P5UA 1MT7A 5ER2E 3R2FA 4I11A 2JYSA 2XYFA 4Y5KA 1QBTA 2BPXA 4DJQA 1Z1HA 4HA5A 3T6IA 4DPFA 4HLAA 1K2CA 4B1DA 5P0UA 5P4TA 3NU3A 3SA5A 3R0YA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LYW A;  5P0S A;  5P3G A;  2QMG A;  4ZSQ A;  5P6J A;  1BXQ A;  4GZF A;  4NPU A;  1YG9 A;  1FFF C;  4KE0 A;  4R95 A;  1IZH A;  3KT2 A;  2PYN A;  3TPP A;  2F8G A;  2HIZ A;  3B7V A;  5P7B A;  5P2Q A;  3CKR A;  2R8N A;  2VKM A;  2QHC A;  1TSU A;  5COO A;  5P1M A;  3N3I A;  2I4Q A;  3OAD B;  2RSP A;  3HD8 A;  2F80 A;  1M43 A;  3S7L A;  3PCZ A;  4PHV A;  2WEB A;  2HS1 A;  5P5Z A;  1MES A;  2ANL A;  5P1F A;  3OU4 A;  3Q5H A;  4MC6 A;  5P0O A;  3CIB A;  5P0W A;  5P6F A;  5BWY A;  2QCI A;  1DMP A;  2RMP A;  3EKV A;  3PMU A;  3S43 A;  3PBD A;  4Y48 A;  5P17 A;  3S54 A;  3QPJ A;  5P79 A;  2B8L A;  2ER6 E;  2NXL A;  2V00 A;  5IVQ A;  5P4J A;  4Y58 A;  4FRK A;  5IVT A;  4PEP A;  5P2I A;  5P3O A;  4R91 A;  5P1Y A;  3VG1 A;  4ER4 E;  1HHP A;  1ZPK A;  5P70 A;  3RU1 A;  5P7N A;  1SDU A;  8HVP A;  3Q4B A;  3VF5 A;  5IVS A;  3SAC A;  2OHU A;  3QI1 A;  1QBS A;  5P62 A;  1T7K A;  4Y36 A;  4Y3H A;  2Q15 A;  3DCR A;  5SY3 A;  2CEJ A;  1C6X A;  2HPE A;  1K6C A;  4GJ9 A;  3KDB A;  4YOB A;  5P31 A;  5P50 A;  3L3A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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