2QZWA

Secreted aspartic proteinase (sap) 1 from candida albicans
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
341
structure length
341
Chain Sequence
QAIPVTLNNEHVSYAADITIGSNKQKFNVIVDTGSSDLWVPDASVTCDKPRPGQSADFCKGKGIYTPKSSTTSQNLGTPFYIGYGDGSSSQGTLYKDTVGFGGASITKQVFADITKTSIPQGILGIGYKTNEAAGDYDNVPVTLKNQGVIAKNAYSLYLNSPNAATGQIIFGGVDKAKYSGSLIAVPVTSDRELRITLNSLKAVGKNINGNIDVLLDSGTTITYLQQDVAQDIIDAFQAELKSDGQGHTFYVTDCQTSGTVDFNFDNNAKISVPASEFTAPLSYANGQPYPKCQLLLGISDANILGDNFLRSAYLVYDLDDDKISLAQVKYTSASNIAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Candidapepsin-1
publication title X-ray structures of Sap1 and Sap5: Structural comparison of the secreted aspartic proteinases from Candida albicans.
pubmed doi rcsb
source organism Candida albicans
total genus 94
structure length 341
sequence length 341
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.24: Candidapepsin.
pdb deposition date 2007-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2qzwA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2qzwA01
5OZPA 3VCMA 3FNSA 1IVQA 3OUCA 5P84A 5P0XA 5I3XA 5DQ2A 5P4MA 1QDMA 5P2JA 3DV5A 2FGUA 1WBKA 4QJ8A 3MSKA 3OOTA 3CICA 5P3WA 2FS4A 2ZE1A 4HDFA 5C9FA 1GNOA 3NU6A 5OZVA 5P4ZA 5P38A 4B1EA 2QZLA 2NTRA 4Y35A 2QI5A 2QP8A 4A4QA 3NSHA 5P68A 5P52A 2ANLA 4OBGA 2Q5KA 3RU1A 3NDXA 1W51A 3CKRA 5B18A 4WY6A 5COPA 5P50A 2BPYA 3DJKA 4YOAA 3L3AA 2FDPA 3D1ZA 3NDUA 1KJFA 2HS2A 3SA5A 3OQ7A 2SAMA 1TW7A 4L6BA 5P86A 4FRSA 5JG1A 4I0ZA 4DI2A 3BVAA 3NWQA 3IXKA 1RL8A 5P5QA 2IGXA 4OBJA 4I0GA 5P65A 4B70A 3OU4A 4GJCA 1G6LA 1EC3A 1YM2A 5P0KA 5P4YA 3EKVA 5P0FA 5P5UA 5KQFA 2NXDA 5P18A 1MUIA 5P8JA 4DJVA 4LL3A 3JW2A 1W5YA 5P2XA 3VYFA 1D4LA 4DPFA 4MC6A 3H0BA 2QNQA 3I25A 5OYZA 5HE7A 4GJAA 2Q63A 5P7XA 1FMXA 3KFNA 5P37A 4DUSA 1NPAA 1B5FA 4Y3NA 3D1YA 4H3FA 2BBBA 1Z1RA 4ZSQA 3QVIA 3MSLA 3RSVA 4FAEA 3L38A 2VJ6A 1IZHA 3D20A 3FSMA 4MC2A 1CPIA 3PI5A 5P78A 1E5OE 1BBSA 5P7LA 4ZSMA 1B6KA 5P4LA 1EC2A 3WB4A 5P4FA 5P5DA 1FMBA 5P71A 5P6LA 3MXEA 2AOIA 3SO9A 3EM6A 3BGCA 3HVGA 1GVXA 5P40A 4YBIA 4RYCA 1HTRB 4FL8A 5I3VA 5P7YA 4AA9A 2VKMA 4ZSPA 1ZBGA 3PBDA 4QJ9A 2QK5A 5TOLA 1EEDP 3BHEA 1HTEA 1BIMA 5P8LA 3QBHA 1A30A 4RCEA 5P6HA 5P36A 1WKRA 3S45A 3HBOA 2AOCA 3RTMA 2O4LA 3GGVA 5ISJA 2PMAA 3VF3A 3ZKIA 4DJOA 4Y58A 1TCXA 4Y5GA 5OZCA 2ZYEA 1NH0A 3PMYA 1GNMA 5P8KA 2O40A 5P15A 4Y4WA 5P7GA 3BRAA 5P02A 4NJTA 1HIVA 3LNKA 4Y3SA 4Y9WA 2QZWA 3APRE 4YDGA 5KOSA 4I1CA 5OZ3A 4DJPA 1GVTA 1DIFA 5P2VA 2HPEA 2G27A 5P5MA 1G2KA 4B72A 5OZEA 3T6IA 5ENMA 5P4WA 1GVVA 3BUGA 4YD6A 5KR1A 4ACXA 2Q11A 4CP7A 4GYEA 3PLLA 3OADB 3UDMA 3OU3A 4D89A 3UDQA 3AIDA 1Z8CA 3QI1A 1OEXA 3NXEA 4DJQA 3ZL7A 5P1XA 4Y3ZA 2FIVA 3EKPA 5DQ5A 3S7LA 4GJ5A 1D4SA 2PK6A 5P2QA 1HRNA 3SAAA 1K6CA 5P3UA 3OWNA 4FM7A 4FSLA 4DQHA 3I7EA 3PCZA 5P6WA 4DQBA 5ER2E 5P5OA 3VUCA 2G22A 4HVPA 5P0BA 3ER3E 2AZCA 1RQ9A 2IKUA 3G72A 2R3TA 2ER6E 1FKNA 4J1KA 5OZNA 4I8ZA 5P4KA 5P83A 4PYVA 5P2IA 1FEJC 5P2OA 3PMUA 5OZLA 5P4DA 4Y3DA 5P5TA 1PPLE 5P0GA 5P5JA 1F34A 4NJUA 5OYXA 1BDLA 2XFKA 5P0NA 5P6TA 1TSUA 4DJWA 5P04A 3EL0A 4Y3YA 3S43A 5ISKA 3WZ8A 5P6AA 5OZFA 5SY3A 2PSGA 5AH7A 5P3OA 4YCYA 3TKGA 3NYGA 1HVLA 3PWMA 1EPQE 5P72A 2IDWA 2OAHA 5P1UA 1APWE 2P83A 1HVKA 5P8BA 2VIJA 4KUPA 5DR4A 5P5LA 3O9AA 4H1EA 3QROA 1OD1A 2P3BA 5P74A 5P3NA 4EYRA 2WEBA 2O4SA 1MERA 2I4UA 1HIHA 2Q64A 1ZPKA 1WBMA 5P7TA 5HDZA 5P5ZA 1PFZA 2I1AA 3IXOA 4A6BA 1D4YA 5P77A 3Q70A 3TPJA 5P1AA 1HSGA 4Y5EA 4QJ7A 3TPRA 5P3HA 5P8MA 5P87A 1CMSA 1AJXA 4L7JA 4K8SA 3CMSA 3O9LB 2VA7A 3PSUA 3O99A 5BWYA 1T6GA 3ZKXA 3NDTA 2ZHRA 4K4PA 4FSEA 4FIVA 2V11C 5P33A 5P35A 5P2EA 3VLBA 4ACUA 3FNUA 4Y5AA 3O9EA 1CZIE 5P0AA 5P5RA 4HA5A 2B7ZA 3RSXA 4B05A 2WHHA 3UDRA 4ZE6A 2Z4OA 1VIKA 5P5PA 4R5NA 5P7WA 3U71A 4R8YA 2QMPA 5EZZA 2G1SA 4M8XA 4EJDA 5P1BA 5KQYA 1MRWA 4NJVA 2ZHTA 2PWCA 3S53A 1K6VA 3U7SA 5OZTA 4CPXA 1LZQA 2WEAA 5P5KA 2FLEA 5OZ2A 4J54A 5OZRA 4YD3A 5HE5A 2G26A 5OYVA 1PPME 1MT7A 3NDWA 5BRYA 3SQFA 3O9CA 3L59A 1IDBA 5P0LA 1HHPA 2R5QA 5DQ4A 4Y36A 4CPWA 2Z54A 3UDJA 2WKZA 1KJ7A 3KF0A 1EBWA 5CONA 4XX3A 3OAGA 1ER8E 5KR0A 4AUCA 1A8GA 5JFUA 4OBZB 4Y5NA 2I0DA 5P7VA 1IBQA 1EPNE 1BDQA 2QHCA 5P32A 2PYNA 5P3SA 5P69A 3TNEA 5P24A 5P00A 5ENKA 1DAZC 1M0BA 3ECGA 5P6NA 3IA9A 1KJHA 3SKFA 1W6IA 5P1EA 2P8HA 2PWRA 4B1DA 3T7QA 2IL2A 5KQXA 4LXMA 4CPRA 4K9HA 5OZUA 3SA9A 2CENA 4RRNA 3UDNA 3EL5A 3HZCA 3BC4A 5P0VA 4DJRA 1OHRA 2ER9E 4R93A 4B00A 1XS7D 5P4NA 1FQ7A 4AZYA 1HSIA 2V13A 3NUOA 4U7QA 5P1ZA 3VF5A 2RENA 4Y5BA 1XL2A 3TL9A 3UTLA 2HS1A 4CPTA 1VIJA 3EKXA 3SACA 3ZKGA 3GW5A 4L1AA 1FIVA 1HPSA 1RNEA 5P1FA 3KA2A 3PWWA 2QZXA 2NXMA 5P4SA 2QI0A 3FIVA 4GJBA 5P3TA 3Q5HA 3O9FA 5P2NA 5AH8A 3CIDA 2V0ZC 5P4CA 4EJKA 3KDBA 5P47A 1XN3A 5P6DA 2VA6A 3IN4A 1XL5A 1W5VA 1TCWA 2B8LA 5P7FA 4TRZA 3LIVA 5AH9A 3K5CA 2O4KA 1G35A 5P3RA 3DOXA 3O9GA 5P4EA 3G70A 5P3BA 5P3AA 5P6SA 2Q55A 5P5EA 4EP2A 1AZ5A 3EKQA 4WY1A 4HZTA 2OHTA 4S1GA 4RGHA 3IGBA 5P2HA 5P1VA 4NKKA 3VSWA 3B80A 1LV1A 3SA6A 2HM1A 5DQCA 1HVSA 2I4DA 1FLHA 1HEFE 3GI4A 4FRJA 3OGQA 2QMFA 1HTFA 1MTBA 3DCKA 2G24A 4GJ6A 5P1GA 2MIPA 3PLDA 3KFPA 3NU3A 5DR0A 1HTGA 1ODYA 1D4HA 4B78A 2G1NA 1MT8A 2ZHVA 3TKWA 5P7OA 1C6XA 3PRSA 5P1MA 1FFFC 5P1KA 4NJSA 5HCOA 5P2YA 1A8KA 4RVIA 3SM2A 2O4PA 1ZP8A 3QAAA 1EPPE 5P3QA 1HOSA 3GI6A 6UPJA 5P6EA 3GI0A 4YCTA 1AM5A 4DJXA 1HEGE 4Y45A 5P6ZA 2R5PA 4JOOA 5P63A 3HAWA 5P60A 5P8DA 3HAUA 1KZKA 5P4JA 4X7IA 5P11A 1EPRE 3IN3A 3QRVA 1EC1A 1T7IA 5DR7A 2XYEA 3SA7A 5HDUA 1SH9A 5P73A 5E5JA 5P3XA 2P3CA 2BB9A 2IQGA 3DCRA 4PEPA 3LIXA 3UFLA 4GJ9A 4XKXA 1QS8A 4MC9A 3FNTA 4BEKA 3APPA 1HVIA 4IVTA 1MSNA 3EBZA 5P1IA 5KR8A 5P46A 1DMPA 3LIYA 5P0MA 4Y43A 2ZJMA 3OQKA 5P8GA 2QI1A 5P25A 5P62A 2ZJLA 3O9BA 5P1YA 3G6ZA 2JYSA 3GGAA 5P7DA 5P5YA 5P2ZA 1BDRA 5P8NA 4Q1WA 3DUYA 4E43A 1RPIA 2VIYA 1QBUA 5HDXA 1K2CA 5P53A 2OHLA 3EC0A 4LHHA 5P22A 2WEDA 3RVIA 3KT2A 2AOFA 1YG9A 5HD0A 1FF0C 1GVUA 4EXHA 3NLSA 3LPIA 2HB3A 3VFAA 4H3JA 3UDYA 2VS2A 5BS4A 3TPLA 5P2MA 3WZ7A 1HSHA 5P0HA 1TZSA 3FKTA 5SY2A 3R4BA 5P5AA 4FS4A 4DV9A 4R91A 2B60A 3OUBA 5P1DA 5C9DA 5KR2A 4D88A 3RTNA 2V10C 3EKYA 5P7ZA 3NR6A 3EKWA 2ZJHA 1SGZA 4Z4XA 3VV8A 2HPFA 5DR1A 2BKTA 2FNTA 4Y3MA 5P5HA 4ZLSA 2F3EA 4RVXA 3VYDA 4Y3EA 5IS4A 2NMZA 3EM3A 4GJ7A 4GJ8A 1PSAA 4L7GA 3EL9A 5P09A 4OBHA 3URJA 5P6GA 5IE1A 4M8YA 4OC6B 1K2BA 4Y5PA 4K4QA 4DH6A 5OZ4A 4Q1NA 5P2KA 3LZSA 3NWXA 1SDTA 4Y5KA 3GI5A 5P3VA 5HVPA 5APRE 4A6CA 4Y47A 5P3ZA 5HDVA 1AVFA 3T7PA 2JE4A 4TVGA 4DJUA 1HVRA 3INEA 3UQUA 5P6FA 1AXAA 3ZKNA 4Y4DA 4Y51A 4I0FA 4PZXA 4Y4UA 5P6IA 4Y4JA 1LYBB 5P8QA 2F81A 3GGUA 1QBSA 2OF0A 3OADA 5P55A 3KM4A 5I3YA 4Q1YA 3OTSA 5P7NA 5PEPA 5P1PA 1NSOA 5P4OA 2OHKA 2EWYA 3MSJA 3T3CA 2CEJA 4Y44A 5P3GA 5OZQA 3BXRA 2AOEA 2NNPA 3Q6YA 4Y4XA 4CMSA 3SPKA 4ZEAA 1BWBA 2G1OA 5P23A 1IZIA 3LZYA 5P4AA 3OGPA 5P1OA 4H3IA 4YBFA 5P85A 2I4VA 1HPVA 3BXSA 3OTYA 5P75A 4RROA 5P1JA 2APRA 2VIEA 4YOBA 3L5BA 2PH6A 1UH9A 4Y3GA 4JECA 5P76A 4D83A 2Q3KA 4ER4E 1YM4A 1RV7A 1HPOA 4PPHA 5P2AA 2G94A 3ST5A 3SKGA 3NU5A 4Y4TA 2AOHA 2WF1A 4YD5A 2OHQA 2QMDA 3QBFA 4ER1E 1BVEA 4J0PA 3VYEA 2OHMA 1LYWB 5P80A 1ZLFA 3OHFA 3UQRA 5P79A 5DPZA 4Y5CA 5P0WA 3SA3A 5KOQA 1A9MA 3Q4BA 3OQDA 2ZGAA 2PSUA 3VLAA 5IVQA 4LAPA 5EZXA 3F9QA 4LP9A 3MXDA 1MRXA 3SFCA 4Y3WA 3TTPA 2BKSA 4GJDA 5JODA 4Y4BA 5P6YA 2UPJA 2OHNA 5OZ5A 2VA5A 1W5WA 4Y3RA 4QGIA 3AUPA 3OU1B 3PWRA 4EHCA 3O9LA 3OUDB 3SA4A 3CKTA 3S54A 2OHUA 3CKPA 2V16C 2VIZA 3VV6A 5OYRA 5P7UA 5P6BA 4GIDA 1SMEA 1T7KA 4F76A 1BWAA 3PBZA 3OK9A 2QNPA 5P4TA 1SBGA 5OZDA 2XFIA 4RYGA 5OYSA 2VJ7A 3PVKA 5P0TA 5OYTA 1GVWA 2FGVA 5F00A 2WF4A 1ZSFA 1Z1HA 5P08A 2QHYA 5P6RA 3VEUA 1XDHA 1W5XA 2QHZA 4RCFA 3S56A 1APTE 2B8VA 5OYYA 5P7CA 5P0CA 1HVHA 2QI3A 3URLA 1DW6C 1D4JA 4YDFA 5OZWA 3PB5A 5P8EA 3EXOA 4QJAA 3OAGB 2WL0A 4RLDA 3KMYA 5P4UA 5HTZA 3K5DA 5P06A 2RMPA 2I4XA 3LINA 5OZMA 4F74A 1LYAB 2ER0E 4ER2E 3I6OA 4YA8A 3LIZA 1PSOE 3OXXA 5P28A 2JXRA 1M4HA 4BFBA 5E5KA 3PCWA 4OBZA 3EMYA 2QI4A 2PQZA 3UQXA 2O4NA 2ZJJA 5P64A 3INDA 3QP0A 4Q5MA 4J1CA 4Y57A 5DQ1A 5OZXA 4Y3TA 4EXGA 2H6TA 2R9BA 4DVFA 2FXEA 2QZKA 2HAHA 5SZ9A 4Y5MA 9HVPA 3QIHA 2V12C 4OBKA 4DFGA 3ZKSA 3UCBA 3BUHA 4CKUA 5P6JA 3SM1A 1ZAPA 1HWRA 1IDAA 1YTHA 3R1GB 4Y37A 4J0YA 4DQEA 2J9JB 3BVBA 3IXJA 5P19A 4Z50A 4LXAA 5P3JA 4COEA 3DK1A 5P0OA 1FFIC 3OY4A 5HE4A 5P17A 2WEZA 5P8HA 4ZSRA 4EQJA 2G20A 4FAFA 3PEPA 5P0IA 5P6UA 1N49A 4TRWA 3VG1A 1E81E 5HCTA 3ZKQA 4J1EA 4X2LA 5P2DA 5IVSA 4Y4EA 5AHAA 5P51A 2Q15A 3LPJA 5P7HA 4OD9B 4EPJA 4F73A 4FM8A 4KE0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5OZP A;  3VCM A;  3FNS A;  1IVQ A;  3OUC A;  5P84 A;  5P0X A;  5I3X A;  5DQ2 A;  5P4M A;  1QDM A;  5P2J A;  3DV5 A;  2FGU A;  1WBK A;  4QJ8 A;  3MSK A;  3OOT A;  3CIC A;  5P3W A;  2FS4 A;  2ZE1 A;  4HDF A;  5C9F A;  1GNO A;  3NU6 A;  5OZV A;  5P4Z A;  5P38 A;  4B1E A;  2QZL A;  2NTR A;  4Y35 A;  2QI5 A;  2QP8 A;  4A4Q A;  3NSH A;  5P68 A;  5P52 A;  2ANL A;  4OBG A;  2Q5K A;  3RU1 A;  3NDX A;  1W51 A;  3CKR A;  5B18 A;  4WY6 A;  5COP A;  5P50 A;  2BPY A;  3DJK A;  4YOA A;  3L3A A;  2FDP A;  3D1Z A;  3NDU A;  1KJF A;  2HS2 A;  3SA5 A;  3OQ7 A;  2SAM A;  1TW7 A;  4L6B A;  5P86 A;  4FRS A;  5JG1 A;  4I0Z A;  4DI2 A;  3BVA A;  3NWQ A;  3IXK A;  1RL8 A;  5P5Q A;  2IGX A;  4OBJ A;  4I0G A;  5P65 A;  4B70 A;  3OU4 A;  4GJC A;  1G6L A;  1EC3 A;  1YM2 A;  5P0K A;  5P4Y A;  3EKV A;  5P0F A;  5P5U A;  5KQF A;  2NXD A;  5P18 A;  1MUI A;  5P8J A;  4DJV A;  4LL3 A;  3JW2 A;  1W5Y A;  5P2X A;  3VYF A;  1D4L A;  4DPF A;  4MC6 A;  3H0B A;  2QNQ A;  3I25 A;  5OYZ A;  5HE7 A;  4GJA A;  2Q63 A;  5P7X A;  1FMX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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