2ER0E

X-ray studies of aspartic proteinase-statine inhibitor complexes
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title X-ray studies of aspartic proteinase-statine inhibitor complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 77
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1990-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er0E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er0E01
5OZEA 4EXHA 5B18A 3S8IA 2QI1A 1GVVA 1EPOE 5AH8A 1KJ7A 2AODA 1LZQA 5P4CA 1BDQA 5P34A 5I3YA 5P67A 3EL4A 5P6VA 1MTRA 1DW6C 2HM1A 1C6XA 4GJAA 3SM1A 4Y39A 1T7JA 4Y3SA 2FDPA 1AIDA 2ER6E 4ZPGA 1IIQA 1MT7A 4CPTA 1EPME 2IGYA 2J9JA 3OOTA 4EP2A 6UPJA 3L5CA 1FKNA 2EWYA 3URIA 5DQ5A 1Q9PA 5P2VA 5P72A 4J0YA 1MPPA 3BUFA 3OQDA 3BUGA 1APVE 1W5YA 1BVEA 2APRA 3ZLQA 1K6TA 2AVQA 4DQGA 3NDWA 3MXEA 4M8XA 5P8TA 1T6EX 1RPIA 3BVAA 5P3VA 3RU1A 3DM6A 4GZFA 5P3WA 5P8SA 4X7IA 3EKQA 3OQFA 5P8UA 5OZUA 5P81A 3DCKA 3AUPA 2FGUA 5T4SA 5P2EA 1G6LA 3M9FA 1RQ9A 3PSUA 4D89A 1ZAPA 2ZJIA 2ANLA 2RSPA 3OU3A 5P3NA 1CMSA 5P3MA 4Y5GA 1HBVA 1K1UA 5P4QA 1LF4A 5P5FA 1UH7A 4RGHA 5OYSA 5P8QA 2B60A 2HPEA 5P46A 3PCZA 5OZ0A 4L7GA 4Y4JA 3NU5A 2WEZA 4RVXA 1MEUA 2ZE1A 5P0PA 3OU4B 5P7GA 2CENA 2F80A 4Q1NA 3PWRA 4EJLA 1HEFE 5P4PA 1BXOA 2ER9E 5OZ8A 2V10C 4R93A 3KFNA 4Y5NA 4RZ1A 5P3QA 3S54A 3UDRA 3QRMA 5P15A 5P5JA 1D4KA 1XL5A 5P88A 5P8KA 3BRAA 4K9HA 3O9LA 3EL9A 1FMXA 1FMUA 5P33A 5P3GA 1LYBA 2IRZA 3KM4A 4HZTA 3MSJA 1HIVA 5HDVA 5P6HA 3SLZA 5P6RA 4RCEA 3PRSA 4DPFA 3JVWA 1W51A 3EKTA 4Z50A 1HVLA 5OZIA 2AOCA 5OZZA 4EP3A 5COOA 2F8GA 1D4LA 3CICA 3L5BA 3FX5A 4Y3JA 5P7EA 2Z54A 4APEA 3FSMA 2H6TA 4IVSA 3MSLA 5P0SA 3NU6A 5P4FA 1EBYA 4Y3XA 5P18A 5P7MA 5DPZA 2BKSA 4HDPA 2FGVA 5P8BA 2QCIA 5P17A 2FDEA 2V16C 4LXKA 5P6BA 5PEPA 3INEA 4K8SA 3S53A 1QBTA 4JP9A 5P1KA 2R5QA 4TVHA 2G24A 5P85A 4I1CA 5P01A 4EXGA 3OUAA 4COEA 3KMYA 4Y51A 1QS8A 5P1ZA 4FL8A 1W5VA 2ASIA 1AAQA 1CPIA 4Y5KA 5P3XA 4DI2A 5P2YA 3PWWA 5P6JA 4Y6MA 5P6IA 1FQXA 2OHUA 2WEAA 5I70A 3PM4A 5P4VA 2BPZA 4PHVA 2WF4A 2AZ9A 3VYDA 1EBKC 5P7OA 1YTIA 5P0IA 4Y47A 3T7XA 3OWNA 4Y56A 3KT2A 3SA8A 3T3CA 3UQWA 1XS7D 1PPKE 5P0ZA 5HDXA 1SDVA 2QZXA 5P66A 3U6AA 4YD5A 3LNKA 3INDA 5P2FA 5P3FA 4I0FA 4DQEA 4FS4A 3UF3A 4Q5MA 5P45A 3UQUA 4F75A 5P1UA 5P7AA 5OZJA 1HRNA 5P50A 1W50A 3UQRA 3KMXA 3NUJA 5DQ1A 4Z2ZA 5P6TA 5F01A 4Q1WA 1EC3A 2QMFA 2SAMA 2JE4A 3K1WA 5P5BA 3SA3A 5DR1A 3RSXA 2VJ6A 2B7ZA 4LAPA 5P2DA 3VLBA 3CIBA 1FQ6A 2ZJKA 5P5PA 3L5EA 4EQJA 4Y58A 4R95A 1M4HA 5P44A 4J1IA 1AM5A 3VCMA 2R38A 3UPJA 5P8JA 5C9DA 5E5KA 5P89A 2IKUA 2ZGAA 4CPQA 5P2OA 1A94A 2IL2A 2WKZA 5P1BA 1NPVA 3OHFA 3VLAA 3Q6YA 4DJYA 3Q4BA 3I6OA 3HD8A 5P4LA 4B1DA 5P1LA 4Y3DA 4Q1XA 5HU0A 1Z8CA 1ZPKA 4JPEA 4A6BA 2ZHTA 5P77A 2CEMA 5KR8A 2IS0A 4Z22A 4EJDA 5P5QA 5HCTA 2R5PA 2PSUA 1AZ5A 5P5AA 4DVFA 2V00A 3WZ8A 1HVIA 4EJ8A 1HVHA 3JVYA 2CEJA 1EBZA 1IZEA 4CKUA 4YD3A 3TOFA 5P6PA 4Y3NA 5OZKA 4H3IA 4R92A 3K5CA 3UQPA 2O40A 3S45A 4ER4E 1HEGE 3NLSA 4FM8A 4I0ZA 1HPXA 5P2CA 3TPLA 1FG8C 5BRYA 3K4VA 3ER5E 1ZSRA 5P08A 4X2LA 2A1EA 5OYWA 1FFFC 5P0JA 5P4SA 1BBSA 5OZOA 1LYWA 4DPIA 2BPWA 2I4XA 4R91A 4Y4TA 4CMSA 5P7RA 1DP5A 5P6MA 4CPSA 1A9MA 5P0DA 4QJAA 4Y53A 5P5SA 4ZIPA 5COKA 2HIZA 4CPXA 3VUCA 3IA9A 5P0MA 4OBFA 3TPRA 4RCFA 2Q15A 3VFBA 4H1EA 1PPME 5KOSA 5OZTA 4D8CA 1E81E 4FM6A 5P3DA 2HAHA 4Y37A 1HTRB 5OZXA 4I0IA 5P22A 1YT9A 3C9XA 5ENMA 5P3UA 5P1QA 7HVPA 1TZSA 5P8CA 2PK5A 1U8GA 4GIDA 3KFSA 2NPHA 5P59A 5P5DA 3O9CA 4B05A 2G1NA 3OTYA 3UHLA 3UDHA 2NNPA 3ZKSA 1XL2A 3QI1A 1HVKA 5P42A 1MSNA 5P1VA 3PB5A 2G1SA 2OHRA 4LC7A 4OC6B 3DJKA 5ISKA 1PSNA 1D4SA 1HXWA 1HVCA 5OZ7A 5P3AA 5EZZA 4I10A 5P09A 2R3TA 5P5OA 4FE6A 5P5YA 3ZMGA 4D88A 6FIVA 5P07A 4WY6A 2BPYA 5P2TA 3MWSA 5OZQA 1UH9A 3OXVA 5IVSA 4CPWA 3IXKA 4WTUA 2V13A 2PWRA 5P32A 1B6LA 3PSGA 3ZPSA 5BS4A 5P16A 4APRE 5SZ9A 4GMIA 2WF0A 2R8NA 2ZHVA 4AA9A 4B77A 2NXDA 5P2SA 4J0VA 4Y3AA 5P5UA 5F00A 4D83A 4OBZB 4GJ7A 3OOZA 2B7FA 3LZUA 3VYFA 2OHLA 2P3BB 2F81A 3FNTA 5OZ6A 5P31A 1UPJA 3GI6A 4DQBA 2AOEA 5P4RA 2QD8A 4YD4A 3KDDA 1A30A 1BVGA 2G20A 4HE9A 5HE5A 2JJIA 3WZ7A 3GGAA 4I0JA 5OZ9A 5TOLA 3S2OA 4DJRA 3T11A 5P0KA 1GNNA 5C9FA 1HTEA 4M8YA 3RTHA 3OU4A 3QS1A 1FG6C 2XFKA 1HWRA 1OHRA 3D1XA 3BUHA 2VIYA 5P0FA 1C70A 4PYVA 2IENA 4QJ2A 3O9HA 1XE5A 2ZJJA 4DJUA 4KE1A 4EPJA 3TKGA 4ZE6A 4RROA 5P8LA 1K6CA 5P1AA 3NU4A 3QBFA 5P4UA 2WEDA 1LV1A 5DR0A 5HCOA 5P0VA 3R4BA 5JODA 2HB4A 4RRNA 3LIYA 3PHVA 3RVIA 2HC0A 3EM3A 4QJ7A 1NH0A 4DJWA 2OF0A 1BILA 1EAGA 5P10A 3L5DA 5P0AA 2ZYEA 5P5WA 3SM2A 1DPJA 4ZLSA 4Y3LA 3PVKA 5P70A 4XX3A 2FNTA 3NDXA 3NYGA 5P4AA 5P06A 3CMSA 3URLA 1MERA 8HVPA 4FRKA 5P3IA 5P7JA 3ZKMA 1D4JA 2AOIA 3NWQA 5OZ1A 5P14A 5P24A 3VF7A 1QBUA 1IZDA 5CLMA 4MC2A 5BWYA 5J25A 3L3AA 4GJ6A 4NJVA 4YBIA 4FRJA 4GB2A 5P1PA 1EC0A 3UDNA 1FEJC 3QP0A 2QI7A 5I3XA 4Y50A 2AVOA 2OHQA 2QI6A 4FSEA 2O4NA 2PYMA 4H3JA 4Y3ZA 4YOBA 5P0HA 4DJQA 5P5TA 3L38A 3K5FA 5OZ2A 5P63A 2I0DA 3QBHA 5P2ZA 4H3FA 5P36A 1HPVA 2HB3A 5P6EA 3SQFA 2VIEA 4AA8A 4EJKA 5P68A 3QROA 1YTGA 5P7BA 1GVXA 4I8ZA 1ZSFA 5OZHA 3PBZA 3D20A 5P7TA 5P3TA 6APRE 5P8AA 3LPJA 5P8GA 4HLAA 5P5LA 2P8HA 5OZWA 4J1FA 1FQ7A 3FIVA 9HVPA 5P12A 5P62A 3TTPA 1HPOA 5P1JA 5P54A 4J0PA 2PQZA 3HVGA 3HBOA 5I3VA 3ZOVA 4Y5PA 2IQGA 5P4TA 1FB7A 4QJ6A 5OYXA 3S85A 3BVBA 1FQ5A 5P2XA 5P5RA 3SKGA 1QDMA 2PYNA 1GNOA 5P7UA 5P25A 1D4IA 3OK9A 2A4FA 4FAFA 4Y4UA 4F73A 4I0HA 3R0YA 3GI0A 4PPHA 2XFJA 2BKTA 4FCOA 2QD6A 1Z1RA 1M43A 1VIJA 2G94A 4XKXA 2OHSA 4ZSPA 4BELA 4J0ZA 5P8HA 5DQ4A 3T7QA 4Q1YA 1SDUA 2FS4A 2R3WA 2PWCA 3RTNA 2QZLA 3OUDB 4GJCA 5P3RA 3SA9A 3PMUA 5IE1A 1PROA 5HTZA 3Q3TA 5P04A 2UY0A 1HTGA 1FQ4A 5P1DA 3HW1A 2WL0A 3KT5A 1WBMA 5P35A 2ER7E 4GYEA 5P0NA 1XN3A 3DV1A 5P3KA 3OADB 3LZYA 2NXMA 3INHA 1QRPE 1HHPA 2IDWA 4ZPFA 4WY1A 1NSOA 5OZYA 2QNPA 1A8GA 2QI3A 5P84A 1GNMA 4YCYA 1BXQA 1TSQA 1ZP8A 4FRIA 2ZHRA 5P4EA 2F3KA 2ER0E 5AH6A 2BQVA 2QP8A 5P5KA 2AOJA 3HDKA 4L7JA 3JW2A 4DH6A 4GJBA 4Y48A 3TPPA 3SA4A 3EC0A 5P23A 5P6UA 5JG1A 5P3OA 5OZVA 4L6BA 3D3TA 3ER3E 2G1YA 3TOHA 3IVIA 2P3AA 5P3HA 1PPLE 1IBQA 5P73A 4I12A 5OYUA 3IGBA 2PSGA 3NDUA 5P69A 4NJUA 4U7QA 3UFLA 4FLGA 1T7KA 5IS4A 3WZ6A 1ZPAA 4R8YA 5P0UA 4F76A 4HA5A 1HPSA 1BV7A 2VJ7A 3F9QA 4Y43A 5P0EA 4Y4DA 3APPA 1IDAA 3OUCA 5P4MA 1FIVA 3BGCA 3DUYA 3OGQA 2OHPA 1YTHA 4AMTA 2QMPA 1EPPE 3IXJA 3NU3A 4AZYA 5P3SA 3UTLA 4A6CA 2OHNA 4I0EA 3CKRA 3OUBA 4J1KA 5P1NA 5P26A 5DGUA 1W6IA 5P6XA 5APRE 3R1GB 3LHGA 3O9IA 5OZ5A 4LP9A 2G21A 1W5XA 1Z1HA 2AZ8A 4B1CA 1HVRA 4I8WA 2JYSA 5E5JA 1VIKA 5P2GA 2B42A 4Y3QA 4GJ5A 2BPVA 3ZKIA 4OC6A 3NXEA 3NWXA 2J9KA 2OAHA 4GJDA 5P19A 2NTRA 3O9DA 2XFIA 2PSVA 3LPKA 2QZKA 4CPRA 1MESA 3OAGB 4J1HA 3KA2A 4DJVA 4RYCA 1F7AA 5OZMA 3R0WA 5AH9A 5OYTA 4DQFA 3QAAA 5P1IA 1F34A 4XXSA 5P76A 3SACA 3EKXA 5P65A 1SIPA 2HB2A 5P7NA 1RNEA 1GVUA 1OEXA 2AQUA 5P0RA 5OZBA 3ST5A 3LZVA 4OBZA 2WF1A 5P43A 1D4YA 2VA7A 5HE7A 5OZ3A 3OXCA 5SY2A 4HDBA 2P3BA 2V12C 2VIJA 1KZKA 2RKGA 1WBKA 1META 3LITA 5P1MA 3EL1A 1SGZA 5P79A 3DCRA 3O9GA 4EHCA 4U8WA 3SA7A 5P41A 3K4VC 3PLLA 4QJ9A 5OZ4A 4S1GA 1OEWA 2NR6A 2AVMA 3CKPA 4ZPEA 4YDGA 5P4HA 2PMAA 1A8KA 4YD7A 5P75A 1AXAA 5P5IA 3CYXA 5P0WA 5P2RA 2PK6A 5P0LA 3GGXA 3NSHA 2WHHA 5P2KA 4HVPA 4B72A 4NJSA 1LEEA 2QU2A 4EQ0A 2BJUA 1T6GA 3PGIA 1MT8A 3LPIA 1MUIA 4DV9A 2QU3A 4Y57A 1G2KA 1T7IA 2Z4OA 2I4WA 2BPXA 1NPAA 3VG1A 4YCTA 5P6SA 1HSHA 4FIVA 1GVTA 1QBRA 4Y54A 4H3GA 5OYYA 1AJVA 2QK5A 1HOSA 1QBSA 3QRVA 5P4ZA 2BBBA 2RMPA 2FMBA 2G22A 2G27A 2IEOA 5P7WA 4RRSA 3FNSA 2FNSA 4HDFA 5KAOA 1IVPA 5P56A 5P4WA 4Z4XA 5AHAA 1FGCC 5P8OA 3HAWA 3U7SA 1SDTA 1PFZA 1KJFA 4B0QA 3FKTA 5P3PA 4PZXA 4YE3A 5P11A 5P2UA 4OBHA 4YCKA 4JECA 3Q5HA 1CZIE 3FNUA 5P53A 1MVPA 1K6PA 5P4BA 3CKTA 5P4GA 5P1OA 4Y5AA 1APUE 5P7VA 2G69A 5P4YA 3O9FA 5HVPA 5IVRA 3GI5A 3IN3A 4A4QA 3L5FA 4Y5CA 5P87A 1K2CA 2G26A 1KJGA 4EWOA 2RENA 1XE6A 3VYEA 4Y3WA 5P40A 3OQ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5OZE A;  4EXH A;  5B18 A;  3S8I A;  2QI1 A;  1GVV A;  1EPO E;  5AH8 A;  1KJ7 A;  2AOD A;  1LZQ A;  5P4C A;  1BDQ A;  5P34 A;  5I3Y A;  5P67 A;  3EL4 A;  5P6V A;  1MTR A;  1DW6 C;  2HM1 A;  1C6X A;  4GJA A;  3SM1 A;  4Y39 A;  1T7J A;  4Y3S A;  2FDP A;  1AID A;  2ER6 E;  4ZPG A;  1IIQ A;  1MT7 A;  4CPT A;  1EPM E;  2IGY A;  2J9J A;  3OOT A;  4EP2 A;  6UPJ A;  3L5C A;  1FKN A;  2EWY A;  3URI A;  5DQ5 A;  1Q9P A;  5P2V A;  5P72 A;  4J0Y A;  1MPP A;  3BUF A;  3OQD A;  3BUG A;  1APV E;  1W5Y A;  1BVE A;  2APR A;  3ZLQ A;  1K6T A;  2AVQ A;  4DQG A;  3NDW A;  3MXE A;  4M8X A;  5P8T A;  1T6E X;  1RPI A;  3BVA A;  5P3V A;  3RU1 A;  3DM6 A;  4GZF A;  5P3W A;  5P8S A;  4X7I A;  3EKQ A;  3OQF A;  5P8U A;  5OZU A;  5P81 A;  3DCK A;  3AUP A;  2FGU A;  5T4S A;  5P2E A;  1G6L A;  3M9F A;  1RQ9 A;  3PSU A;  4D89 A;  1ZAP A;  2ZJI A;  2ANL A;  2RSP A;  3OU3 A;  5P3N A;  1CMS A;  5P3M A;  4Y5G A;  1HBV A;  1K1U A;  5P4Q A;  1LF4 A;  5P5F A;  1UH7 A;  4RGH A;  5OYS A;  5P8Q A;  2B60 A;  2HPE A;  5P46 A;  3PCZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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